5ELVA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l504-n775) in complex with glutamate and bpam-521 at 1.92 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Enthalpy-Entropy Compensation in the Binding of Modulators at Ionotropic Glutamate Receptor GluA2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5elvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5elvA02
4NF5A 2ZXTA 2GRVA 4FEDA 4R9GA 4TLMB 4ZECA 3RQTA 1LFIA 4GIZA 4ZEFA 4R75A 4DCYA 3VLVA 5I84A 2XXPA 1N3XA 2Y7PA 4MH5A 3EHUA 1ZBMA 3FXRA 2UYEA 1H3DA 3N5LA 3TQLA 3PMWA 2I58A 2Y7KA 2A5TB 1EZ9A 3H4ZA 1N7WA 2R6GE 2ZMBA 2HAUA 3TFLA 4IO3A 2OZZA 5TU0A 3IL1B 2OK2A 3TKDA 1IXGA 3MZ9A 2OWSA 4ZEKA 3E3KA 3RT6B 2YLNA 4LVQA 3KBRA 2F8DA 3KEIA 1SVXB 1N7XA 1EH3A 3OO6A 4LA9A 3CG3A 3VXBA 3LSWA 2Z23A 3H6UA 1P1WA 1Y3NA 3K1MA 4PE5B 4ELOA 1NNKA 1B05A 2QS3A 2VD3A 1A55A 1P1UA 3FVNA 2OJTA 5DVFA 4OTEA 2PX1A 4Z7EA 1A7LA 2X7PA 5CMMA 2NOOA 1DTZA 1JVXA 2B3FA 4IY5A 4PETA 3PUVE 2GHBA 4IO4A 5EYFA 5H8FA 4F2OA 1DPPA 1JW5A 1AIVA 4Q5TA 2YPNA 1XT8A 4RPOA 3MZ1A 5HPQA 4YMAA 2Z8FA 3OXNA 1MRPA 4XKQA 1LGBC 3CFLA 5BWJA 3O6GA 4NF8A 3K4UA 4U21A 3AXFA 3VVDA 4EQBA 1LSTA 5I59B 1SW4A 3WAEA 3OO7A 5I57B 4UA8A 2P2AA 5IAIA 1JEVA 3KFMA 5CBRA 5B70A 4O3AA 3R6UA 1O64A 5AA1A 4IO7A 1PB7A 2WKYA 1MG1A 4NF6B 5ICQA 5AA2D 3TUSA 3OENA 2F6PA 4FJPA 4DXUA 5AA2B 4OHNA 3UK4A 3RUMA 4R6YA 1D4NA 3KZGA 4GWOA 4GF8A 1USYE 3KSXA 1QKBA 2ALUA 3T22A 3GXAA 4M4GA 5KZTA 3KN7A 3O2AA 1IIWA 4ND9A 5HM4B 5K2YA 5CC2A 3TMGA 1S50A 4DE8A 4DZ1A 4U1OA 3SESA 2PMSA 1B7ZA 3H06B 3MP6A 3HHFA 3MVWA 1Y9UA 4H67A 4H6DA 4LZ8A 3U92A 5JEIA 1PEBA 4THIA 1A40A 2DE3A 3RT8A 1J1NA 3IX1A 4RYAA 2DSFA 4YKKA 3VFJA 3PD9A 4O3CA 4M1VA 1UQWA 4LZ5A 3HO7A 1H45A 3M3KA 4GL0A 1TT1A 3RN8A 3CIJA 3TCGA 4BLAA 2I6EA 4NF4A 4JDFA 3VXCA 3SEVA 5ICTA 2CZLA 1MQHA 2P1SA 2DE2A 5DEXA 1B46A 2I3VA 5DYHA 3OO8A 2Z8EA 1B5IA 1DOTA 1MDP1 1A8FA 2H4IA 5H8QB 3HN0A 3PUXE 1I6QA 1NNTA 4X1BA 4N07A 3Q29A 1Y3QA 3FVKA 3EPEA 4POXA 1D9VA 3KJ7A 3K01A 2REGA 4XKRA 3BKIB 2HEUA 3DP6A 4UACA 4OEVA 1MY2A 1LAXA 3H3GA 2Y7RA 1JVYA 3D4CA 2I0CA 2VHAA 4OENA 2F7CA 3UA8A 3TDJA 3BBRA 4XTCQ 1MM7A 1ZMGA 1RKMA 4RNSA 4U1ZA 4OVJA 1Y1MA 3S9LC 3FJMA 3A09A 1P99A 1Y4CA 4H5GA 1Q1KA 2NWJA 2O84X 3ILUB 1LBCA 5I56B 2PBWA 1YTVA 3QSLA 2O7UA 4DDDA 4F19A 4EUOA 2DXYA 5H8NA 2VGQA 4KFQA 5FTHA 4ECFA 3O97A 5DT6A 4PFYA 2D3IA 1MQGA 3TTLA 1AMFA 1BIYA 1CB6A 2GFEA 5I2KB 2DWAA 1N84A 4JWOA 5K2XA 3I6VA 5FHMA 4NWCA 3MUQA 5AA4A 1HSJA 3KGCA 2QPQA 2F5XA 4ZE8A 4EQ9A 4R6KA 3FIRA 5I58A 3KG2A 4RY1A 3S4UA 4KR5A 2ESNA 2QMWA 3MPLA 1M5CA 4P0GA 1R6ZA 2DWJA 5KCJA 4C0RA 1TXFA 3DELB 3GBAA 3PPOA 3FXUA 4GXAA 4LQ5A 1O63A 2Q88A 4F1UA 2RC8A 1FTMA 5TPAA 1SI1A 1XVYA 2UYFA 4WXJA 4YB5A 5ITPA 1N3WA 3JYRA 3IOVA 4WEDA 1MXVA 3GLBA 4IGTA 2UVHA 2VP1A 3K6WA 3W15C 1B4ZA 5F1QA 3IAZA 1M5FA 3PPNA 3MPKA 3SEYA 4BDMA 5TP9B 3G3KA 3C32A 4OESA 1OQHA 3H6TA 1II5A 5L9OA 2F36A 4HTGA 3PD8A 3PMVA 2XX7A 2E1SA 3QYTA 2F6GA 4GLIA 4IO5A 4YB7A 4MBPA 4EF2A 1JEUA 3EN3A 4ZEBA 3FGSA 4NF4B 5H8HA 3T9HB 3B6TA 2DWIA 3EF7A 5EHMA 3BFUA 5M2VA 2X26A 3MW0A 5CI5A 4GD5A 1GV8A 4F39A 3MQ9A 4F2QA 3QUFA 2QSXA 2REJA 3TZAA 3ZSFA 3IOTA 3HV1A 1MM6A 3LBSA 3M8UA 1QKAA 3PGFA 3FUZA 4G8NA 1I6BA 1ZTYA 4KQPA 1GR2A 4N13A 4I62A 1VE4A 3RLFE 1F9BA 3W9WA 3IOUA 1FTOA 4OZ9A 1PBQA 3D4GA 4H5FA 3RTWB 1FQEA 5CM6A 2I4CA 1N0TA 4XKNA 4F29A 1BLFA 2ZYMA 3ZKLA 2O6AA 2F35A 3WAFA 4QSDA 3C4MA 2QS4A 3K2DA 1NNPA 1ZKBA 5H8SA 4KYSA 1OVBA 4H8IA 3C31A 2XXIA 3OD7A 1USYH 4F31B 1SBPA 4BDQA 3RY3A 2V3QA 3RPWA 3DLNA 2GH9A 4XXUA 3K02A 2H98A 1PBPA 4R2BA 4YKPA 1GTKA 4QFLA 1FQBA 3E13X 1DMBA 1FQFA 2F34A 3MVXA 4QRZA 1IXIA 1QVSA 1LB9A 1A54A 4DCXA 4POWA 1MXYA 2QRYA 4FATA 1ZLQA 3KN8A 3A3CA 1IXHA 1SQYA 2I48A 3QUJA 3SEWA 4OFJA 2AYSA 5HBCA 2ONSA 3THIA 3Q28A 3RGYA 1Y3PA 1NMUA 1ZU0A 3IB2A 1YCJA 4PFTA 2D5WA 4G68B 3TTMA 3T93B 4HCYA 3B6QA 4DXBA 1IITA 4QSEA 3KSJA 4IGRA 4ZS9A 1MPCA 1HSEA 1MY4A 1R1NA 1MH4A 4QHQA 4BDNA 5JTYA 1UTHB 3T96B 3Q27A 4LZ7A 3VVEA 4YZZA 4GXSB 4JSOA 2XX8A 3H6WA 4R74A 3L6GA 5CBSA 3SERA 3KN3A 4EXLA 2R71A 1MPBA 4HS7A 4DXCA 4F3BA 3ECRA 4QSCA 5A5XA 2E0SA 3N6UA 1MXZA 1LAFE 2V93A 2X7QA 3O9PA 3G7WA 1EZOA 1OLCA 3LSXA 3HCQA 5CMCA 4R73A 4H0WA 3DP4A 2Q2AA 3VDFA 4OETA 2O69A 1WDNA 3ILTB 3PPPA 4P11A 4NTLA 5AE4A 4R2FA 1Q35A 1T0KA 4F18A 2DYXA 4LONB 4ZZEA 5F7VA 3N6TA 4RK2A 4NF5B 4EQ7A 3H7MA 4OYVA 4F22A 3M3FA 2Y84A 3ZKKA 3N94A 4G4PA 2OWTA 3PU5A 2QL3A 1QULA 4NE4A 4F3SA 1DSNA 5BUUA 2O1LA 1NH7A 1OVTA 4JWXA 1B7UA 1M5BA 5I2NA 3IO6A 4R72A 1B40A 4IB2A 2FNCA 3IR1A 4FE8A 1JNFA 2Q8JA 2ZNUA 2UVJA 3PMXA 4U22A 3KOTA 3USDA 1B5JA 1NL5A 2XXRA 1YPNA 4KCCA 2V3UA 3V89B 1B0LA 4YU0A 1LFGA 1N76A 4ELRA 1XS5A 1H44A 1P1QA 2H9BA 1Y1ZA 3TPAA 4TLLB 1SW2A 2PYYA 2RCBA 3CFXA 4GVOA 3T66A 4JSDA 2DE4A 1SD3A 3TELA 5IKBA 3K6VA 1TWYA 1D3KA 2DWHA 4G8HA 4NWDA 2Z8DA 3TEPA 4G68C 1KWHA 2NXOA 3SDFA 1XC1A 1VFDA 2DP8A 4GRKA 3S9EA 3CSBA 5H8FB 3OOAA 4Z0IA 3BFTA 4C1TA 4DLDA 4N6PA 3QAXA 5AA3A 4AB6A 3U72A 4MFIA 1SI0A 1FCKA 3E9XA 1SDXA 1FTKA 4EXKA 4WEPA 2ANJA 4PFWA 1SW1A 5L9SA 1N04A 2RC7A 2DQVA 4YKJA 4U2RA 3IB0A 4ISUA 4FORA 3CI8A 3GBBA 4NF8B 2ZNTA 1B9JA 1POY1 1LB8A 2Y7WA 3G3JA 1AH5A 3B6WA 4I9DA 1B58A 4ESWA 2RC9A 4YB6A 1B51A 1IQ7A 2I49A 4RXLA 1B2HA 3HPIA 4FECA 2QS1A 1I6AA 3PUYE 3G3FA 4G77A 1P1NA 1D9YA 3EHSA 2ZYNA 4OMBA 1Y4TA 4OFLA 4KYDA 1H43A 3TTKA 5CMKA 2PT2A 3SKPA 4ZDMA 2V25A 5DTBA 2OCUA 1OMPA 3CVGA 3V8XB 2HCAA 2XXQA 1B1HA 3VE1B 4OWDA 3TCHA 1WVJA 2DOJA 1GGGA 4H1XA 3T9UA 1XVXA 2CMOA 1VFEA 5I2NB 1B4HA 1PB8A 2HQ0A 1DPEA 3S9MC 1HSLA 2XX9A 1SYHA 2XXXA 2UVIA 1MQIA 5CRYA 1LCFA 1AOVA 2OLBA 3UGWA 3MP8A 1M5EA 1Z7NE 4FAJA 4ESXA 3M3LA 4IO6A 5DVIA 2UVGA 1B7HA 1US4A 3C33A 4LQ2A 2HXWA 1FW0A 3OSRA 1POTA 1RYXA 4XKPA 3PPQA 2R9JA 2H25A 4OEUA 1JW4A 5DEXB 5JK4A 1LFHA 3EHTA 3O6IA 4GQOA 2HFBA 3H03A 2ABHA 4ZEIA 2I4BA 2YJPA 4KPTA 3K6UA 3QXMA 4RPNA 5I59A 4KYEA 2XXVA 1LCTA 2NVUB 4LATA 4H65A 1JW1A 2P0SA 1AL3A 1B3EA 2V84A 3OMBA 3OELA 3IK6B 4MLVA 2Q89A 2XHDA 1Y20A 3MC2A 3VLUA 4PFUA 1R9QA 3FV1A 4MLQA 4ZZAA 3QK6A 2XD3A 1PC3A 2Y7IA 3EQ1A 1MY3A 5AA2A 1MXWA 4QFKA 4ELPA 5EHSA 3G3GA 5H8NB 1IUDA 4GL8A 3U1OA 1URSA 4LUBA 3QIMA 3CG1A 1MH3A 2QS2A 1RYOA 4X9TA 4G8MA 3R26A 3LR1A 4KHZE 5FTIA 5DVJA 5B7DA 1URGA 4IY6A 3OEMA 3MWBA 2AL5A 1MDQA 1PB9A 3LSFB 1H76A 1QUJA 1S9TA 1B52A 1IZ1A 5AA4B 4JB7A 1M5DA 5I58B 3IO4A 3S2VA 2RF1A 4R6HA 3K1PA 3KJTA 1MXXA 3A3UA 1NH8A 5KCJB 3U8QA 1CE2A 3OO9A 1VR5A 3OEKA 1OIBA 3V83A 1L5TA 5TPAB 2ZYKA 1MQJA 3C35A 2RCAA 5H8QA 2XXWA 1IEJA 1B0HA 1EU8A 3DM0A 1A8EA 3CRBA 3UIFA 4YKIA 4U4SA 1P1OA 1UTBA 2VOZA 5KDTA 3VV5A 4KI0E 3FJ7A 4LP2B 2NUVA 2OBGA 4F1VA 5H8HB 5LOMA 3UP9A 1A99A 2ONKE 5J1DA 2O51A 3R7XA 3K0VA 4JXIA 4BDOA 3TYHA 5I56A 1TFAA 4AB5A 3GZGA 2PT1A 1YAEA 2DXRA 2I0BA 1B5HA 4IO2A 5ITOA 4H8JA 2KLFA 1EZPA 4Q0CA 1JQFA 4RK9A 4R9FA 1DTGA 1GVCA 2HZKA 3FVGA 3V5AA 2F7BA 1B3FA 1R9LA 3K1NA 3TODA 1MQDA 5I2KA 2Z22A 3T9XB 1MXUA 2DS9A 3IJXB 3MVZA 4Q8RA 3OSQA 4AQ4A 5ISUA 1FTLA 1ZIUA 2F78A 1FTJA 3IB1A 3MP1A 2PVUA 4C1UA 4ZEDA 4Q30B 3PUWE 3FJGA 3N26A 3S9NC 3TTNA 3ODBA 2IA4A 1ZJLA 1SW5A 4X1DA 2RKMA 4BDLA 2GHAA 2DVZA 4HW8A 2QJEA 4QFPA 1WODA 4YICA 1Z7ME 4HCWA 4K3FA 1XHYA 2XD2A 2D21A 3SEUA 2FA7A 1VSOA 4EDPA 3O29A 4PP0A 1FQCA 5TP9A 1MY1A 2FYIA 3VLWA 3DP8A 2ONRA 4GFRA 1NFTA 1LBBA 2XXTA 3IOWA 1TFDA 3O28A 3SEXA 1MPDA 2O1MA 4FIMA 1BP5A 2W7YA 3I3VA 4YMBA 4QFNA 3MAMA 4L17A 3TCFA 3G3IA 4JBZA 2Q2CA 3PUZE 1B32A 2A5SA 4F1YA 3E4RA 3UORA 3Q25A 1B3HA 1QW0A 3TQWA 4OERA 2M8CA 3C34A 1URDA 4NMYA 4FEBA 5JTYB 1PDAA 4OFOA 1S7YA 3K00A 3MZBA 1UTBB 3FASA 5KDTB 3PPRA 4G2ZA 4YAHX 3IORA 1LAHE 3LSLA 4I1DA 4QFOA 4U23A 1SYIA 3FV2A 3C9HA 4KCDA 2F7AA 5CMBA 4JWYA 5A5XB 3P7IA 4KD5A 2HAVA 3W9VA 3H6VA 4OXVA 2I3WA 2F97A 3FXQA 2THIA 2HZLA 2O68A 2A5TA 3RTFB 4WKMA 3K6XA 3SETA 2AIXA 2UXAA 1QJMA 3G3HA 3TTRA 2AL4A 1XOCA 2G29A 3FD3A 3FVOA 4ONYA 3F11A 4P0IA 3C36A 2H5YA 2LAOA 1US5A 4ZE9A 3T9VA 2IEEA 5L9MA 1IXCA 3U93A 1OLAA 4OQOA 2G93A 1ELJA 1OQGA 3B7DA 3HHGA 3CR9A 2B65A 2RINA 4F3PA 3CFZA 1MS7A 4MF3A 3I5OA 2ZYOA 3IJOB 1I69A 2BJJX 4GOTA 1BTJA 3PV0E 1FQDA 2O7IA 4TQUQ 5FHNA 2QMXA 4O3BA 2XXHA 3O66A 3U94A 3Q26A 2XXUA 3JZJA 4G68A 3FZVA 2H99A 4RA1A 1FQAA 4XIGQ 4QF9A 3HSTA 1ANFA 2XXYA 3CSGA 3LUYA 1NKXA 4ELQA 4PQJA 3ZS6A 4EF1A 1UTHA 3UN6A 1B3GA 1O7TA 4E0WA 2B3BA 1UIVA 4E0XA 1BKAA 2DVCA 3MBPA 4RJZA 3VVFA 4F3GA 5FHOA 1JETA 1B3LA 4TOZA 3O6HA 1LLSA 2V3TA 3L6HA 1UIUA 3JV9A 1QUIA 3RNNA 1B6HA 5I57A 4U4XA 4X48A 4I8CA 2VD2A 4BDRA 3MJNA 4DIGA 3LC8A 2Q9TA 3ONMA 5L8DA 3TAJA 5ELVA 1QUKA 1MY0A 2ZNSA 3MVYA 3KOSA 3FATA 1ATGA 4NEDA 1LAGE 1NNFA 4NF6A 1B1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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