The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
134
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structure length |
133
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Chain Sequence |
SGSWQTYVDDHLMDIEGTGQHLTSAAIFGTDGTVWAKSASFPEFKPNEIDAIIKEFNEAGQLAPTGLFLGGAKYMVIQGEAGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYDEPVAPGQCNMVVERLGDYLLDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Artemisia vulgaris
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| molecule keywords |
Pollen allergen Art v 4.01
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| total genus |
35
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| structure length |
133
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| sequence length |
134
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LGO A; 4X1M A; 3CPT A; 2PBD P; 1SZV A; 2PRF A; 5FDS A; 3MSH A; 1FIL A; 3LEQ A; 1A0K A; 3MS6 A; 3CHW P; 1F2K A; 3U4L P; 2ZL1 B; 2E8J A; 1G5U A; 1Z09 A; 2BTF P; 5EM0 A; 3NEC A; 3T1R A; 2JKF A; 2B95 A; 1VET B; 2V8F A; 3L9K A; 2V8C A; 5FEG A; 3KYE A; 1K0K A; 3NUL A; 3T12 B; 4D60 A; 1CJF A; 4ESP A; 3T1X A; 3T1S A; 2HZ5 A; 1AWI A; 3D9Y A; 4X25 A; 3L7H A; 2PAV P; 1PRQ A; 5FEF A; 5EV0 A; 1PFL A; 2VK3 A; 4X1L A; 4FTX A; 2ZL1 A; 1SKO B; 1VEU B; 4FUW A; 3UB5 P; 1PNE A; 4QWO A; 1YPR A; 5EM1 A; 3CPT B; 3DAV A; 1D1J A; 1VET A; 1CQA A; 2JKG A; 1SKO A; 1Y4O A; 3T1Q B; 1VEU A; 1FIK A; 1CF0 A; 5EVE A; 1HLU P; 1J3W A; 1ACF A; 2ACG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WAD A; 1KGF A; 3DWZ A; 1V9Z A; 4NG2 A; 2V9A A; 4FH4 A; 1U60 A; 2EWV A; 1FIL A; 1L0D A; 4N1H A; 3KSH A; 4BL3 A; 1PWD A; 1P9W A; 5CX7 A; 1LSW A; 2X01 A; 4YWZ A; 3UE3 A; 5DKK A; 4I3A A; 1MKM A; 3E4O A; 1I5Q A; 4ZJ2 A; 2J8Y A; 3OPP A; 1H8M A; 3G31 A; 3MKF A; 4R23 A; 2ZC5 B; 1IKI A; 4I3I A; 3LUQ A; 5F69 A; 2ZMV A; 3PTE A; 1RP5 A; 1TF1 A; 1NY0 A; 2V8C A; 1DJB A; 3LIF A; 3C4P A; 4A5R A; 5F82 A; 2QPN A; 3ZDJ A; 5EVL A; 4YIN A; 3T4J A; 3UB7 A; 4WBG A; 1CK3 A; 4OKP A; 3FG8 A; 2CC1 A; 2G2U A; 1K54 C; 4L9E A; 4MLL A; 1PW1 A; 4LFU A; 3IBR A; 2ZBB A; 1M6K A; 4RX3 A; 3HLW A; 1F5M A; 1N9B A; 2G2W A; 4BL2 A; 3UDI A; 3MZE A; 2P08 A; 3W4O A; 2DNS A; 2XRO A; 2W1T B; 1NXY A; 1FCN A; 1LL9 A; 1T19 A; 4NK3 A; 2VGL M; 3BEC A; 4L9G A; 4KUK A; 2WK0 A; 5HWV A; 1KVL A; 3O5Y A; 4WLA A; 4Y15 A; 2XGN A; 3P01 A; 5E43 A; 1W5D A; 4B9O A; 1CF0 A; 1K4F A; 2HP6 A; 3CUE C; 3K3D A; 3MBZ A; 3O3V A; 4CLC C; 2OWH A; 2H0Y A; 2Z2L B; 4QPR A; 1M40 A; 2XD5 A; 1K56 D; 2WAF A; 1YM1 A; 4KZ7 A; 4O0P A; 4Q0H A; 3AGF A; 4NXB A; 4FH2 A; 1DY6 A; 4RVA A; 3LEQ A; 1BLS A; 5HDS A; 2HJE A; 2WZZ A; 3GR2 A; 1RGY A; 3BFG A; 3M2J A; 5D3O A; 4DE1 A; 1FCM A; 4ZDX A; 3ZCZ A; 3UNW A; 1BT5 A; 1XKZ A; 3CJM A; 3ZFZ A; 1XGI A; 4ZAM A; 1ONG A; 4P0M A; 5DTS A; 2ZC4 B; 4S2L A; 3WS1 A; 1BTL A; 4JGR A; 3E4Q A; 4DKI A; 2BG1 A; 3FYZ A; 5DTK A; 3M6H A; 3DBA A; 3HLC A; 3F1P A; 1MWU A; 1TS7 A; 1BSG A; 3LCE A; 3HLD A; 3IWO A; 5JYO A; 1OPX A; 3IH8 A; 1G28 A; 4WF0 A; 3IX3 A; 4FUW A; 5HAP A; 4GW9 A; 3O86 A; 4R6L A; 4QY6 A; 4DDS A; 3UDF A; 1DP6 A; 4PMA A; 1T1C A; 1SKO A; 4QU3 A; 2ZC6 B; 3NI9 A; 4Y0O A; 1UGU A; 4H6J B; 4ZJ3 A; 2WGV A; 4U0X A; 1NYY A; 3LR3 A; 5A91 A; 1F98 A; 1LSV A; 3BFE A; 3F1P B; 1OT6 A; 1UWN X; 2PT7 A; 2R78 A; 4KG6 A; 3BYD A; 4OPZ A; 3Q7V A; 5FI2 A; 3LY4 A; 5CHJ A; 4M4X A; 4YNR A; 2P9V A; 4GOG A; 4PKY G; 1OTB A; 4OQI A; 3CI6 A; 4WL9 A; 5TFQ A; 2R9W A; 4NXG A; 2W3G A; 2DMW A; 5IS1 A; 4HP4 A; 5FAO A; 3HUO A; 4RQ9 A; 3S7Q A; 3ZVT A; 2GJ3 A; 1WYB A; 3DTI A; 3IHA A; 1XX2 A; 1LL5 A; 1S4R A; 2WAE A; 4X25 A; 4FCF A; 3T4K A; 2J3W A; 3VP3 A; 2H5S A; 5HW3 A; 3QP8 A; 4KG5 A; 5AJG A; 2XQZ A; 4R38 A; 3NY4 A; 2A3U A; 5C5K A; 2QJ5 A; 1H8Z A; 4UQI S; 3A0V A; 5G4Y A; 2HGV A; 2HDQ A; 3Q7V B; 5CTM A; 1VQQ A; 1G6A A; 4E3O A; 2P9V B; 5JYP A; 1BYW A; 2NUP C; 1ODV A; 3DTM A; 4HI4 A; 1PYY A; 2V1A A; 1E4D A; 4X56 A; 3OZH A; 3T4S A; 3ZHH A; 4R3A A; 2HF6 A; 1LL8 A; 2J3T D; 3LGO A; 3G34 A; 3IF6 C; 4DE0 A; 3LEZ A; 4Y5F A; 1K38 A; 2Q9M A; 3VP4 A; 5TGF A; 4UA9 A; 1XPB A; 2Y91 A; 1L0G A; 4NET A; 4WMC D; 2IA2 A; 3UPP A; 3W8K A; 4JF5 A; 1IOU A; 4GN2 A; 5GHY A; 1FR6 A; 4XUZ A; 3PAE A; 1NZU A; 3LY3 A; 1TS6 A; 3UN7 A; 4R3B A; 2Z6C A; 3VOZ A; 5EPH A; 3IHB A; 2J9P A; 2K31 A; 5GLD A; 5FAS A; 1TD5 A; 3QNB A; 1N4O A; 1L2S A; 3N8R A; 2Y55 A; 1MBL A; 1K0K A; 1O7E A; 5IHV A; 4HJ3 A; 2PU4 A; 4FSF A; 4JF6 A; 4YFM A; 5I5L A; 4GD8 A; 1AWI A; 1DRM A; 3P09 A; 3QNC A; 2IWD A; 3MF0 A; 1N9N A; 3GDI A; 3HVF A; 3VFH A; 3OCL A; 5EVI C; 2HJ9 C; 4KZ6 A; 1WYC A; 5U47 A; 4KZ5 A; 2XFT A; 4F3L B; 1ERM A; 4ETX A; 3SS3 A; 1FOF A; 3G30 A; 2KLI A; 3UPN A; 4R4R A; 1XP4 A; 4JF4 A; 1K56 A; 1G6O A; 1H8Y A; 3Q81 A; 3R4K A; 5HPF A; 5DF9 A; 2HV1 A; 2XA7 S; 3MJQ A; 1KOU A; 2Y2P A; 2L4R A; 3B47 A; 1D7E A; 3NOU C; 4EUZ A; 5L07 A; 2D01 A; 2PYP A; 4E3K A; 4ARZ B; 1X0O A; 2Y2Q A; 1XXM A; 1WA9 A; 2XLN A; 2QHK A; 3DW0 A; 3HLF A; 3K2N A; 2WYX A; 5CGW A; 3G4P A; 1ERO A; 3NIA A; 4XT2 B; 3FPW A; 1OJ5 A; 1OME A; 4N9L A; 4MDZ A; 2PHY A; 5AQ7 A; 2OV5 A; 2PYR A; 4QHC A; 5TBM A; 4JXG A; 3CUE A; 1YLZ A; 4GS9 B; 1BZA A; 1YKD A; 3UPO A; 5EOO A; 1ZKJ A; 1C3B A; 3BQ8 A; 2W1R A; 4BEN A; 3CMZ A; 3C4O A; 3MQQ A; 3JYI A; 3PBT A; 1IYQ A; 5EFW A; 3R7W A; 5KIZ A; 4OOY A; 1NRF A; 4PPR A; 4UA6 A; 3UE6 A; 1ZHH B; 1PI5 A; 3TE8 A; 4WZ5 C; 3KYZ A; 3UB5 P; 2XD1 A; 2V1Z A; 5CEC A; 3VP1 A; 1FR1 A; 1JWZ A; 2GX5 A; 3HJK A; 1YLP A; 2DCF A; 5GL9 A; 5AQ9 A; 1S1Y A; 4DJ2 A; 3SOI A; 1TEM A; 5DVA A; 3ITA A; 2M1C A; 2VJW A; 3BY8 A; 4HHD A; 3MFX A; 5A93 A; 4P85 A; 3U2A A; 1JNU A; 1KGE A; 4Y0U A; 5TBM B; 2UWX A; 3LIE A; 3HLE A; 3NOT C; 4IUK A; 4YOF A; 4KQQ A; 2XA7 M; 2OSU A; 3WS4 A; 2Y4A A; 3CZD A; 2ZLY A; 2LB9 A; 4ETZ A; 1NJ4 A; 2ZM0 A; 4GKU A; 3GTC A; 4OH0 A; 1GA0 A; 3NDE A; 2Y2N A; 1GHP A; 1CEG A; 4MN6 A; 5L10 A; 3UO9 A; 4HNB A; 1O07 A; 3WRT A; 3S1Y A; 1VHM A; 3NJA A; 1YSP A; 5KSH A; 2WUQ A; 2PDR A; 3VP2 A; 1TS8 A; 3G6O A; 3AGD A; 4IVI A; 5EEC A; 1PRQ A; 5FEF A; 4EBP A; 5M19 A; 2JN7 A; 3QP4 A; 2HDU A; 3LFV A; 1N9O A; 3PXP A; 5A92 A; 2Q0O A; 4HEF A; 1ESU A; 2L1M A; 3JVU A; 2Y2G A; 1OTE A; 3CAX A; 3C7V A; 4IED A; 1NWZ A; 4EEU A; 1BLP A; 4ZRR A; 5F5Y A; 4OOL A; 2QWS A; 3ZGA B; 1JTD A; 4WMC A; 3UME A; 2O9B A; 1VEU A; 2WGW A; 4OPQ A; 4R1G A; 5EVE A; 3SH8 A; 1IEM A; 4EV4 A; 4LRX C; 3GEC A; 3BQA A; 1P97 A; 4EES A; 5HAR A; 3CPT A; 3BW6 A; 3C38 A; 1PI4 A; 4Q0I A; 4NEE D; 3N8S A; 3BLS A; 2GDN A; 1N9L A; 2PD7 A; 1OTD A; 4DN0 A; 2WGI A; 4PM7 A; 4BD1 A; 1MY8 A; 1SCW A; 4IBR A; 4B4Z A; 1LHY A; 2P7J A; 1L0F A; 3VE3 A; 4MN7 A; 2BTF P; 2IWB A; 4S2K A; 3HUN A; 3VV4 A; 2OAP 1; 3NBL A; 3LYX A; 5HD3 A; 5HDC A; 5G18 A; 3A3J A; 4Y0T A; 3Q1F A; 4Y13 A; 5DFX A; 3NUL A; 1D06 A; 5GLC A; 5HD5 A; 3T12 B; 3O88 A; 3IBJ A; 1K57 C; 3S4X A; 3IF6 A; 1DJC A; 2DRW A; 2KOI A; 1YT4 A; 2HZ5 A; 2VV6 A; 3VE4 A; 5FAT A; 3PBS A; 1ALQ A; 5HL1 A; 4WM9 A; 2O9A A; 3IS2 A; 2XK1 A; 2VX8 A; 4DXC A; 3C2W A; 5FQ9 A; 2Y2J A; 4ZBE A; 4OVD A; 4QB8 A; 1OT9 A; 4GDB A; 1YAX A; 1IYO A; 3E4P A; 5EM1 A; 2ZOH A; 4F94 A; 3RFB A; 1PWC A; 1EI5 A; 1LI0 A; 2WKE A; 4LRZ E; 4JLF A; 1NYM A; 4CLC D; 5CGS A; 4GDN A; 5FQK A; 3BM6 A; 3Q07 A; 4HES A; 3I7J A; 5EE8 A; 2X02 A; 1F9I A; 2ZQC A; 3ZG9 B; 5G4Z A; 3IX8 A; 1HVB A; 4DE3 A; 3BFF A; 5FI6 A; 1T18 A; 3HBR A; 4UA7 A; 2J9O A; 3CHW P; 3IS2 B; 4GLQ A; 4HH2 A; 1XFN A; 3U4L P; 1XA7 A; 3LI8 A; 3UB9 A; 2VGJ A; 1AXB A; 1L0E A; 3PAG A; 3UY6 A; 1GCE A; 5GHX A; 2M7V A; 3OPL A; 3RH8 B; 3S7O A; 3ZVW A; 2B5R A; 3T1R A; 4BBV A; 4JBF A; 2XF3 A; 4MCW A; 4K0X A; 1S4S A; 4K08 A; 2W27 A; 3O87 A; 4MNR A; 4PHT A; 3WS5 A; 4JGO A; 3B42 A; 4Q0J A; 3SH7 A; 1JVJ A; 2J80 A; 3F1N A; 3PBQ A; 5HAI A; 1KGG A; 2YKF A; 3T1X A; 1HZO A; 1GSV A; 2JE5 A; 3HL9 A; 3LIA A; 1H0M A; 4G3K A; 3L7H A; 2V0W A; 4M3K A; 1Z6F A; 3E2L A; 1MWS A; 2A49 A; 5EV0 A; 3KO6 A; 2GNX A; 3B33 A; 2EWW A; 1YLY A; 2ZL1 A; 1SKO B; 4GHI A; 1YLW A; 4ME4 A; 5FSR A; 1SDN A; 4CLC E; 3IX4 A; 5HFO A; 3RJU A; 3HUM A; 4IJG A; 2A24 A; 3EGD C; 4L0L A; 3SZT A; 3C8C A; 4C3Q A; 2OLV A; 4KEN B; 2ZQ7 A; 3TJZ C; 5KSC A; 3ICY A; 2JKG A; 1NZO A; 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3A3I A; 4UQI M; 1KE4 A; 3PR6 A; 2V0U A; 1VB6 A; 1PZO A; 4P6Z S; 2J7V A; 2Y59 A; 1A0K A; 1BUE A; 4RA7 A; 1ES4 A; 1PIO A; 5CGX A; 2I9V A; 1OJG A; 5L8M A; 5FQQ A; 4DDY A; 2Y2M A; 2VGK A; 4QY5 A; 4LCM A; 4EU0 A; 1K54 A; 4BBT A; 2VV8 A; 2CMN A; 3EQU A; 4UEY A; 3FPV A; 1RCJ A; 1OTI A; 2B18 A; 1IFQ A; 3BEB A; 5KMW A; 3IXH A; 4DXB A; 3CLO A; 3H82 B; 4IVK A; 5EVI D; 2QZ6 A; 1VM1 A; 5HZH A; 1ONH A; 2JC7 A; 1T1B A; 4GNU A; 2H28 A; 3EOI A; 2MJ6 A; 4LCL A; 4XUX A; 1QME A; 1CI8 A; 4JXS A; 4CLC A; 4PM8 A; 4BMW A; 1XJ6 A; 5E2H A; 2Z6D A; 4G3V A; 1MWT A; 1D1J A; 3V3R A; 4BD0 A; 2O0Y A; 5I94 A; 3KX0 X; 4I5S A; 1DJA A; 2O99 A; 3V39 A; 3T1Q B; 3OCN A; 1Q2Q A; 3DTE A; 1K57 A; 3Q7Z A; 3NC8 A; 2H0T A; 4Y7P A; 2V2F F; 1WE4 A; 4DRT A; 2YKH A; 3OPR A; 2XEP A; 4X68 A; 3A0R A; 2VEA A; 1KE3 A; 3MXR A; 3ZQ5 A; 2FFY A; 4P6Z M; 5MC7 A; 2QJ7 A; 4I3J A; 3QP2 A; 3V5M A; 2ZJ9 A; 1G68 A; 4XXR A; 4HJ6 A; 3N4I A; 1K6R A; 3D4F A; 3EEH A; 4CLC B; 2EFX A; 2ZC7 A; 4BBU A; 3S7N A; 3A3F A; 3GMW A; 4DF6 A; 4EEP A; 2W3D A; 3R7W B; 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