5ENJA

Crystal structure of the second bromodomain of pleckstrin homology domain interacting protein (phip) in complex with compound-14 n11530 (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
b'SMSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A poised fragment library enables rapid synthetic expansion yielding the first reported inhibitors of PHIP(2), an atypical bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PH-interacting protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 46
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5enjA00
5HEMA 4A9KA 5HENA 3U5LA 3P1DA 4N3WA 4J3IA 5F63A 2DVVA 4O7FA 4QZSA 5H85A 2FSAA 3U5KA 4NYWA 4QC1A 4UYHA 3JVMA 4HXOA 4UYFA 5IGMA 5DYCA 5LKUA 3D7CA 4QSVA 5A5QA 4NRBA 2KTBB 3DAIA 5CPEA 4MENA 2YW5A 4IR3A 5DYAA 4QR3A 2YELA 4J0SA 4QSRA 3ONIA 5EV9A 5ACYA 4Z6IA 4HXSA 3Q2FA 5KO4A 5EVAA 4UITA 3S91A 4PY6A 4A9OA 3O37A 5G4RA 4LYSA 4O71A 5CQ6A 4A9LA 4O70A 5FFWA 4XUAA 4X2IA 4WHWA 4YYDA 3TLPA 2DVQA 4UIZA 4XYAA 3P5OA 4Q0OA 5DY7A 4QR5A 5F36A 5AD2A 4IOQA 5FFVA 4YYIA 5DYUA 5AD3A 5DYXA 2WP2A 4Z1QA 5FE9A 5F3AA 5CQ7A 2E7NA 5DFCA 5A82A 5KTUA 5JI8A 3MULA 5DKHA 4TU6A 5I7XA 5I1QA 4OGIA 4KV1A 2DATA 5EPSA 2I8NA 2R0YA 4PS5A 4YYNA 4BW2A 5F1HA 3SVFA 4CL9A 5FE5A 3HMEA 5A5NA 4MR5A 4ZW1A 4HXRA 5L8TA 5ENEA 4CUUA 4OUFA 4UIUA 4PKLA 4BW4A 5DLZA 3DWYA 4NYVA 5TB6A 5CQ4A 5DW2A 4OGJA 4CFLA 5C87A 5FE3A 2WP1A 5D3SA 2RI7A 4AKNA 2F6JA 2NXBA 3QZTA 2D82A 3RCWA 1X0JA 3MB3A 4O75A 5II1A 4QYLA 5FB0A 4YADA 2YQDA 5IGKA 4TU4A 5CUGA 4NUDA 5I88A 2YDWA 4UYFB 3O33A 4DONA 5HRXA 4TZ2A 5CS8A 4HXLA 4ZC9A 2YYNA 4NR6A 4YYKA 4BHWA 5F2PA 3HMFA 4NR7A 3P1CA 4QBMA 5E9LA 5CQTA 4C66A 2E3KA 3IU6A 4A9FA 4LZRA 2YEMA 5E73A 5EWCA 3LXJA 5FE1A 4O7EA 4Q0NA 5EGUA 4UIVA 4IR5A 5D3PA 4MEOA 3LQIA 4PTBA 1WUMA 5KU3A 2RNXA 4TTEA 3UV5A 4E96A 5LJ2A 4N4FA 1ZS5A 5HQ7A 5FH8A 5E9VA 5E9YA 2DVSA 4O7CA 4QSUA 5E9KA 1JM4B 5FE0A 4NR8A 5LVRA 5C85A 4MEQA 5HQ5A 5FH7A 3Q2EA 4UIXA 5CUCA 4RVRA 5D7XA 5CRZA 5F25A 3JVJA 2G4AA 5COIA 4GPJA 5EM3A 4UYEA 4C67A 3MB4A 4NRAA 4QSTA 3SVHA 5AMEA 4QEUA 5EU1A 3O35A 5DKCA 5CFWA 2OSSA 4ALHA 5JWMA 4YH4A 2OUOA 5CQAA 3UV2A 3NXBA 4CUTA 4YATA 5ETDA 5D3TA 4A9HA 4O74A 5I89A 4CLBA 2R10A 2RNYA 5CUEA 3O34A 4NR9A 3AADA 5DFBA 4PCIA 4TS8A 4O7AA 4YABA 5E74A 4YYMA 5FB1A 2F6NA 3LJWA 5A5OA 5I80A 4QUUA 5IGLA 5ENBA 5CU8A 5H1UA 2I7KA 3O36A 4QB3A 4MR6A 4QSWA 5FG5A 3LQJA 4MEPA 5F5ZA 5EWDA 2R0SA 5KHMA 5G4SA 5HFQA 5L97A 5CQ3A 5L99A 5FDZA 5I29A 4YY4A 5DKDA 5HLSA 4NUCA 3MQMA 5LJ0A 4QC3A 4N4GA 5EA1A 4J0RA 5ENIA 4HBWA 5FBXA 5K29A 4NQMA 5H1TA 4CUQA 4F3IA 4MR3A 2N9GA 5HM0A 4A9EA 3AQAA 4TT6A 5EI4A 4HXNA 4NUEA 4YYJA 4NR4A 2MJVB 4Z1SA 4UIYA 5CZGA 5DX4A 5HCLA 4HXMA 5BT5A 4QSPA 5IBNA 5FE2A 4NQNA 5BT4A 4IR4A 5A5RA 5FG6A 4HBVA 5CQ8A 5DBMA 4BW1A 5D3LA 4LZ2A 5L8UA 5HRWA 4UIWA 4LC2A 5A5PA 2YEKA 5IIDA 3UVYA 1N72A 4YK0A 5A83A 5E0RA 5D24A 2L5EA 3LQHA 5AMFA 3K2JA 5FE4A 5IG6A 5LUUA 5D3JA 5E3DA 4IOOA 4XY9A 5II2A 2R0VA 2GRCA 3P1EA 5LKXA 5LKTA 4ZQLA 4QY4A 4LYWA 5F62A 4TYLA 4NRCA 2L85A 3I3JA 3UVXA 1WUGA 2OO1A 5LKZA 2D9EA 5FH6A 3QZSA 3G0LA 5CP5A 3FKMX 5EPBA 4N4IA 4YBTA 5FE8A 5FG4A 2DVRA 3U5PA 4CURA 3IU5A 4QSQA 5CQ5A 5C89A 3JVLA 4Z6HA 5FE6A 5A5SA 4O76A 1JSPB 4WHUA 5D25A 2H60A 4XY8A 5F61A 4IORA 4QSSA 5EQ1A 4J1PA 5C8GA 5KTXA 4FLPA 2E7OA 4QUTA 3UVWA 5ENFA 5EK9A 5HELA 4LYIA 5EWWA 5ENGA 4NXJA 2RNWA 5CUAA 3U5NA 4CFKA 5EICA 5CUBA 5EISA 4LR6A 4QNSA 1E6IA 3MUKA 1F68A 3UW9A 2RS9B 4HXPA 5A85A 5HQ6A 4BW3A 5LJ1A 5A7CA 4A9JA 5I83A 4ALGA 5F1LA 4QSXA 4A9IA 4TT4A 5KTWA 5C7NA 4LRGA 4QR4A 5I7YA 5J0DA 3JVKA 5D0CA 4HXKA 5CY9A 4PCEA 5E3GA 4BJXA 5BT3A 5DW1A 5DFDA 5HJCA 5I40A 4O78A 4YC9A 5D3RA 3HMHA 4YBMA 5FFYA 5L96A 4NYXA 4QEVA 5EWVA 4WIVA 4YY6A 2DKWA 4KV4A 4LZSA 5CUDA 4NS5A 5EWHA 3S92A 4TT2A 4A9MA 2LSPB 4O72A 3U5MA 5CRMA 3U5JA 4QEWA 5D3HA 3SVGA 5FE7A 3ZYUA 4CUSA 1EQFA 4O7BA 5DLXA 2DWWA 4O77A 4QYDA 4UYDA 5D26A 2L84A 5CTLA 5ENJA 5L98A 5TCMA 5CGPA 5HFRA 4TZ8A 4NR5A 4Y03A 5HRVA 4XUBA 4YYGA 3UV4A 5H1VA 5IGNA 4TQNA 5EP7A 3QZVA 5E9IA 4HBXA 4IR6A 4YYHA 3P1FA 4A9NA 4Z93A 5D3NA 3UVDA 5E7DA 5A81A 5C4QA 2RFJA 5LVQA 4KCXA 5EPRA 5ETBA 3GG3A 4UYGA 4YH3A 5ENHA 4MR4A 4LDFA 5E9MA 5ENCA 4HBYA 4YAXA 3G0JA 3U5OA 4CUPA 4YBSA 5I86A 3MXFA 5F60A 4N4HA 2RO1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HEMA 3ERRA 4A9KA 5HENA 3U5LA 3P1DA 4N3WA 4J3IA 5F63A 2DVVA 4O7FA 4QZSA 5H85A 3D1BA 2FSAA 3U5KA 4NYWA 4QC1A 4UYHA 3JVMA 4HXOA 4UYFA 5IGMA 5DYCA 5LKUA 3D7CA 4QSVA 5A5QA 4NRBA 2KTBB 3DAIA 5CPEA 4MENA 2YW5A 4IR3A 5DYAA 4QR3A 2YELA 4J0SA 4QSRA 3ONIA 5EV9A 5ACYA 4Z6IA 4HXSA 3Q2FA 5KO4A 5EVAA 4UITA 3S91A 4PY6A 4A9OA 3O37A 5G4RA 4LYSA 4O71A 5CQ6A 4A9LA 4O70A 5FFWA 4XUAA 4X2IA 4WHWA 4YYDA 3TLPA 2DVQA 4UIZA 4XYAA 3P5OA 4Q0OA 5DY7A 4QR5A 5F36A 5AD2A 4IOQA 5FFVA 4YYIA 5DYUA 5AD3A 5DYXA 2WP2A 4Z1QA 5FE9A 5F3AA 5CQ7A 2E7NA 5DFCA 5A82A 5KTUA 5JI8A 3MULA 5DKHA 4TU6A 5I7XA 5I1QA 4OGIA 4KV1A 2DATA 5EPSA 2I8NA 2R0YA 4PS5A 4YYNA 4BW2A 5F1HA 3SVFA 4CL9A 5FE5A 3HMEA 5A5NA 4MR5A 4ZW1A 4HXRA 5L8TA 5ENEA 4CUUA 4OUFA 4UIUA 4PKLA 4BW4A 5DLZA 3DWYA 4NYVA 5TB6A 5CQ4A 5DW2A 4OGJA 4CFLA 5C87A 5FE3A 2WP1A 5D3SA 2RI7A 4AKNA 2F6JA 2NXBA 3QZTA 2D82A 3RCWA 1X0JA 3MB3A 4O75A 5II1A 4QYLA 5FB0A 4YADA 2YQDA 5IGKA 4TU4A 5CUGA 4NUDA 5I88A 2YDWA 4UYFB 3O33A 4DONA 5HRXA 4TZ2A 5CS8A 4HXLA 4ZC9A 2YYNA 2EJNA 4NR6A 4YYKA 4BHWA 5F2PA 3HMFA 4NR7A 3P1CA 4QBMA 5E9LA 5CQTA 4C66A 2E3KA 3IU6A 4A9FA 4LZRA 2YEMA 5E73A 5EWCA 3LXJA 5FE1A 4O7EA 4Q0NA 5EGUA 4UIVA 4IR5A 5D3PA 4MEOA 3LQIA 4PTBA 1WUMA 5KU3A 2RNXA 4TTEA 3UV5A 4E96A 5LJ2A 4N4FA 1ZS5A 5HQ7A 5FH8A 5E9VA 5E9YA 2DVSA 4O7CA 4QSUA 5E9KA 1JM4B 5FE0A 4NR8A 5LVRA 5C85A 4MEQA 5HQ5A 5FH7A 3Q2EA 4UIXA 5CUCA 4RVRA 5D7XA 5CRZA 5F25A 3JVJA 2G4AA 5COIA 4GPJA 3D1DA 5EM3A 4UYEA 4C67A 3MB4A 4NRAA 4QSTA 3SVHA 5AMEA 4QEUA 5EU1A 3O35A 5DKCA 5CFWA 2OSSA 4ALHA 5JWMA 4YH4A 2OUOA 5CQAA 3UV2A 3NXBA 4CUTA 4YATA 5ETDA 5D3TA 4A9HA 4O74A 5I89A 4CLBA 2R10A 2RNYA 5CUEA 3O34A 4NR9A 3AADA 3VKHA 5DFBA 4PCIA 4TS8A 4O7AA 4YABA 5E74A 4YYMA 5FB1A 2F6NA 3LJWA 5A5OA 5I80A 4QUUA 5IGLA 5ENBA 5CU8A 5H1UA 2I7KA 3O36A 4QB3A 4MR6A 4QSWA 5FG5A 3LQJA 4MEPA 5F5ZA 5EWDA 2R0SA 5KHMA 5G4SA 5HFQA 5L97A 5CQ3A 5L99A 1PUOA 5FDZA 5I29A 4YY4A 5DKDA 5HLSA 4NUCA 3MQMA 5LJ0A 4QC3A 4N4GA 5EA1A 4J0RA 5ENIA 4HBWA 5FBXA 5K29A 4NQMA 5H1TA 4CUQA 4F3IA 4MR3A 2N9GA 5HM0A 4A9EA 3AQAA 4TT6A 5EI4A 4HXNA 4NUEA 4YYJA 4NR4A 2MJVB 4Z1SA 4UIYA 5CZGA 5DX4A 5HCLA 4HXMA 5BT5A 4QSPA 5IBNA 5FE2A 4NQNA 5BT4A 4IR4A 5A5RA 5FG6A 4HBVA 5CQ8A 5DBMA 4BW1A 5D3LA 4LZ2A 5L8UA 5HRWA 4UIWA 4LC2A 5A5PA 2YEKA 4AKHA 5IIDA 3UVYA 1N72A 4YK0A 5A83A 5E0RA 5D24A 2L5EA 3LQHA 5AMFA 3K2JA 3VKGA 5FE4A 5IG6A 5LUUA 5D3JA 5E3DA 4IOOA 4XY9A 5II2A 2R0VA 2GRCA 3P1EA 5LKXA 5LKTA 4ZQLA 4QY4A 4LYWA 5F62A 4TYLA 4NRCA 2L85A 3I3JA 3UVXA 1WUGA 2OO1A 5LKZA 2D9EA 5FH6A 3QZSA 3G0LA 5CP5A 3FKMX 5EPBA 4N4IA 4YBTA 5FE8A 5FG4A 2DVRA 3U5PA 4CURA 3IU5A 4QSQA 5CQ5A 5C89A 3JVLA 4Z6HA 5FE6A 5A5SA 4O76A 1JSPB 4WHUA 5D25A 2H60A 4XY8A 1ZKRA 5F61A 4IORA 4QSSA 5EQ1A 4J1PA 5C8GA 5KTXA 4FLPA 2E7OA 4QUTA 3UVWA 5ENFA 5EK9A 5HELA 4LYIA 5EWWA 5ENGA 4NXJA 2RNWA 5CUAA 3U5NA 4CFKA 5EICA 5CUBA 5EISA 4LR6A 4QNSA 1E6IA 3MUKA 1F68A 3UW9A 2RS9B 4HXPA 5A85A 5HQ6A 4BW3A 5LJ1A 5A7CA 4A9JA 5I83A 4ALGA 5F1LA 4QSXA 4A9IA 4TT4A 5KTWA 4AKGA 5C7NA 4LRGA 4QR4A 5I7YA 5J0DA 3JVKA 5D0CA 4AI6A 4HXKA 5CY9A 4PCEA 5E3GA 4BJXA 5BT3A 5DW1A 5DFDA 5HJCA 5I40A 4AKIA 4O78A 4YC9A 5D3RA 3HMHA 4YBMA 5FFYA 5L96A 4NYXA 4QEVA 5EWVA 4WIVA 4YY6A 2DKWA 4KV4A 4LZSA 5CUDA 4NS5A 5EWHA 3S92A 4TT2A 4A9MA 2LSPB 4O72A 3U5MA 5CRMA 3U5JA 4QEWA 5D3HA 3SVGA 5FE7A 3ZYUA 4CUSA 1EQFA 4O7BA 5DLXA 2DWWA 4O77A 4QYDA 4UYDA 5D26A 2L84A 5CTLA 5ENJA 5L98A 5TCMA 5CGPA 5HFRA 4TZ8A 4NR5A 4Y03A 5HRVA 4XUBA 4YYGA 3UV4A 5H1VA 5IGNA 4TQNA 5EP7A 3QZVA 5E9IA 4HBXA 4IR6A 4YYHA 3P1FA 4A9NA 4Z93A 5D3NA 3UVDA 5E7DA 5A81A 5C4QA 2RFJA 5LVQA 4KCXA 5EPRA 5ETBA 3GG3A 4UYGA 4YH3A 5ENHA 4MR4A 4LDFA 5E9MA 5ENCA 4HBYA 4YAXA 3G0JA 3U5OA 4CUPA 4YBSA 5I86A 3MXFA 5F60A 4N4HA 2RO1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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