5ENMA

Compound 10
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
387
structure length
359
Chain Sequence
FVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFAVGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPHGPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDSLVKQTHVPNLFSLQLCGSVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCNIFPVISLYLMGEVTNQSFRITILPQQYLRPVDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTLDMEDCGYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Beta-secretase 1
publication title Targeting the BACE1 Active Site Flap Leads to a Potent Inhibitor That Elicits Robust Brain A beta Reduction in Rodents.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 359
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.4.23.46: Memapsin 2.
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5enmA01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5enmA02
5P1HA 1FGCC 2BJUA 4I8WA 1B6KA 2CENA 5UPJA 3T11A 4Y4JA 2FLEA 3EMYA 5OYZA 4TRZA 5P2RA 5P0PA 5OYXA 1PPLE 4EP2A 2V11C 4FM8A 1DAZC 2QZKA 3QN8A 2B7ZA 1HXBA 5P3WA 1QBSA 2WF0A 2NR6A 3OADB 4H3JA 4J0TA 3CKRA 1AJXA 5P1MA 3R0YA 4ZSRA 5P3UA 4OBKA 3VV7A 1FMBA 5P5OA 2F3EA 2O4NA 4J55A 5P2AA 5P60A 3ZKSA 5DR3A 2ZJMA 2R38A 5P0BA 1HVRA 4Y48A 2SAMA 2PH8A 2FIVA 5P68A 5OZNA 5P6PA 5P5HA 2OHLA 5P27A 4L1AA 1T3RA 5P41A 5P2EA 1IZHA 1EPOE 4DQFA 3A2OA 4Y4ZA 3OUDB 4CP7A 1IVQA 4F76A 1EC3A 1PSAA 5AH8A 2JJIA 3BVBA 4Y4XA 5P4HA 3S53A 5P40A 5P2KA 2IGXA 4DJPA 3S54A 5P8GA 4KE1A 4CMSA 5P81A 1HHPA 1CPIA 4KE0A 3CMSA 3OOTA 5P06A 2Z54A 4J0VA 4APEA 5DR0A 5P6AA 5OZWA 1ZBGA 4XX3A 2NMZA 5P20A 1HOSA 3Q6YA 3PWWA 3ZMGA 4Y3EA 5P3DA 3RVIA 2I4DA 2ZJIA 5BS4A 3ZKNA 5P6QA 1TSUA 1C6ZA 4Y5EA 2I4QA 3LZVA 1HPXA 5JODA 2WEAA 5P82A 4H1EA 3LIQA 3NU6A 4FAFA 3L3AA 3OHFA 2I4WA 5P51A 5P08A 4Z4XA 2HPFA 4EJLA 3K4VA 3KYRA 1META 5P43A 4LAPA 1ENTE 2AOIA 1D4KA 1IBQA 5P71A 2APRA 3QRVA 2NPHA 5P0LA 1MERA 4YDFA 5P0GA 5HDVA 1MRWA 5P7SA 3IVHA 5P6DA 5IVRA 5P1CA 5P1EA 2VJ6A 5OZUA 2OF0A 3QS1A 2H6TA 1HEFE 1HVIA 3QVIA 3EL1A 3KF0A 1FKNA 5OZJA 1FIVA 5OZVA 4CPXA 2QZXA 5P4ZA 1ZSFA 2EWYA 5KQXA 2R9BA 4Y3DA 5P8EA 5P1QA 5P5JA 4RVJA 5P4IA 2B8LA 2G1NA 4L7JA 3JVYA 4LXAA 2ZHUA 3B80A 4GJCA 4ZSPA 1FEJC 4OC6B 3FNSA 1YM4A 4FM7A 5P4EA 5P3SA 5P45A 5P4SA 1ZTZA 3EKWA 4WY6A 3IA9A 5HU1A 4Y5GA 5P4PA 5P1LA 5P8DA 4R92A 5AGZA 4YDGA 5DQ5A 1B6LA 2AQUA 5KOQA 1EPQE 3VCMA 1SBGA 1XL5A 5P49A 4GYEA 2ZHVA 4J1EA 4HA5A 5P7IA 4Y47A 2WHHA 2AOGA 1W5WA 2ZJHA 4MC1A 2V00A 5AH9A 3EL0A 4OBFA 5P31A 1B5FB 3NR6A 3QPJA 4U7QA 3OUCA 4NJVA 4GJDA 2FNSA 3LZSA 5P0OA 2ER9E 4ZPEA 5DR1A 3KDCA 5P75A 3DCRA 3HVPA 5P7AA 4J17A 4LP9A 1DIFA 2B60A 1W5XA 5P6VA 3LZYA 3UQUA 4HLAA 1F34A 4WY1A 3GGUA 4E43A 5P8NA 4PZXA 4F73A 1TSQA 4RVXA 3I6OA 3GGXA 5SZ9A 5OZKA 1E82E 5P5EA 3UDKA 4K9HA 3D1ZA 5SY3A 1GNNA 1XDHA 4JPEA 4YCKA 5P24A 3G70A 5KR1A 4DVFA 5P2CA 1IVPA 2QAKA 5P7MA 4EJKA 5I70A 2BQVA 3OTSA 4Y3LA 3HAWA 5P2FA 3LINA 1M43A 3S43A 3D91A 5P0WA 2ZJLA 3O9AA 1OHRA 3I7EA 5P1IA 3INHA 2PYMA 5KOSA 2F80A 1FQ4A 5P55A 5AH6A 4L1AB 5P61A 1ER8E 1B6MA 5P7BA 4B05A 2JJJA 3OXVA 2BB9A 4B70A 4B00A 4ZLSA 3VV6A 4Y3GA 5P1SA 5P6BA 5P2SA 1APUE 2AOHA 5HCOA 5P01A 3APPA 1IDBA 1MT7A 5P2DA 3BRAA 5C9DA 2NNKA 5P7WA 5P4MA 1AZ5A 3UDRA 3KM4A 4Q1WA 1NPAA 4QLHA 3IN3A 3INEA 2RMPA 5P5YA 5P0CA 3F9QA 5P5BA 4Y50A 1FF0C 4Y5PA 1APTE 3BUGA 4ZPFA 3C9XA 1HIIA 5P1WA 1W6HA 4RCFA 5P04A 5P23A 5P1VA 3N3IA 2NMYA 1DW6C 4M8YA 5P7YA 4D88A 5OYYA 2FMBA 3EL9A 4B1CA 4DPIA 2F3KA 4QJ2A 5P07A 2QNNA 5P4RA 4GJ6A 5P3KA 4HE9A 1U8GA 5P79A 4B78A 1BWAA 1AJVA 4XXSA 2AZ9A 2MIPA 4Y5AA 5IVTA 3O9CA 1EC2A 5SY2A 4H3FA 4L7GA 1XE6A 4U8WA 4NJSA 5P7KA 1PFZA 3VLAA 3EXOA 1ME6A 5P58A 4DJVA 5IVSA 5P2UA 5P2VA 4D85A 5P7PA 2HAHA 3DK1A 1FB7A 5P00A 2WF4A 5P1TA 5P1NA 5I3VA 3SM2A 3SKFA 3BGCA 3PSYA 4FS4A 4R95A 5P65A 1GNMA 3URLA 3MSLA 4JECA 3TPPA 5IVQA 3RU1A 2AOEA 5P59A 4GMIA 1MTBA 5P1OA 3K4VC 3LIVA 2NNPA 3O99A 3KT2A 5HDUA 5P26A 1AAQA 3UCBA 4Y4AA 3NU5A 1PROA 5EZXA 1BVEA 4B77A 5P66A 4Q1YA 2BKSA 2V0ZC 3D1XA 5P6CA 3TTPA 1CMSA 1SGUA 5P5ZA 1FQ7A 1G35A 4R5NA 4Y45A 2IQGA 3UQXA 4TRWA 1C70A 5P16A 5P32A 4YCTA 3TOGA 4I0DA 2BPVA 5P2YA 1K6CA 2BBBA 5P4KA 4EJ8A 5COPA 5P2JA 2G1YA 4LBTA 3T7XA 2R5PA 5ISJA 5P6FA 3KDBA 2XYFA 5OYWA 3GI6A 3LNKA 4BFDA 1APWE 3GI4A 1B11A 4F75A 5OZCA 5HD0A 5P48A 4K8SA 3SQFA 2QHYA 3DM6A 3ZKGA 3S43B 4QJ8A 3ZL7A 4NJUA 2AVVA 3ER5E 2AZ8A 5P7FA 1NPWA 3T7QA 7UPJA 5P3HA 3O9LB 1F7AA 4NKKA 5P6ZA 3UFNA 3S56A 3UQPA 5E5KA 5P72A 2P4JA 2QZLA 1W51A 2PSUA 5P35A 5P8BA 4I0HA 3ER3E 1D4YA 3SO9A 5P2GA 5DQ1A 5P3AA 4MC6A 5P11A 5P4LA 3EKYA 3OQAA 4YA8A 2I4UA 1JLDA 5P1KA 2WL0A 4NPUA 5P19A 1QBUA 2ER6E 3OU4A 3L5BA 4Y3JA 5P15A 5OZXA 3EKXA 2IENA 4X7IA 1YTIA 3IXKA 1FQ8A 5P36A 3FSMA 5P6IA 1C6XA 6UPJA 4I8ZA 4ACUA 3LPJA 5P8QA 3EBZA 1HIHA 5IE1A 1N49A 5P83A 4DJRA 4DJUA 3BXRA 5OZZA 3U6AA 2PK5A 2PWCA 5P0HA 2QMFA 2F81A 3PWMA 3NDXA 5HCTA 4RLDA 4YD3A 2QCIA 4L7HA 4EHCA 3Q5HA 3L59A 2RENA 2XFJA 2UXZA 2BPXA 3RTMA 2G1RA 1MSMA 2PC0A 1HVHA 2Q63A 3O9GA 4RYCA 1PSNA 5P4TA 1EPPE 3FNTA 5P73A 1HRNA 3NDTA 2VA7A 3ZOVA 3URJA 5P50A 1Z8CA 4ZE6A 3MXEA 2G1SA 2HC0A 1EEDP 5P3XA 2FDDA 5OYTA 3TPRA 2VS2A 3URIA 4YCYA 1LF3A 4Y6MA 5P7TA 1HIVA 5P6OA 1EPNE 3S85A 3UPJA 5EZZA 4Y43A 1QRPE 5JFUA 1MVPA 1HXWA 5P5MA 3ZKQA 1BBSA 2VIEA 3HZCA 1HVCA 2QI3A 3QP0A 1LF4A 4Y5LA 1CZIE 3VF3A 1GNOA 3NDUA 5P5GA 1QBRA 5DR7A 3EM3A 5C9FA 5P0EA 5JFPA 2HM1A 3HW1A 3IN4A 3L5DA 2QHZA 2HB2A 1Q9PA 1GKTA 2V10C 3ZPSA 4LHHA 5P44A 5P6KA 3ZKXA 5P8AA 5E5JA 1K1UA 4Y3FA 4K4RA 4Y57A 4DV9A 2ZHSA 1KJGA 5P87A 3TOFA 1TQFA 4J0ZA 3EKPA 4EPJA 4I0EA 5OYSA 3CIDA 4QGIA 4JOOA 2WKZA 3OU1A 5P47A 1XN3A 3NWQA 5P3YA 5P2MA 4Y53A 5P6TA 2B7FA 5P5AA 2WF2A 4DQCA 5T4SA 1D4SA 5HVPA 2FS4A 3Q4BA 5P7OA 3GGAA 3EKTA 2Q11A 4GJBA 5P1FA 1EBWA 5P0TA 5J25A 4H3IA 5P3RA 3NUOA 5P0YA 3EKVA 4FL8A 2QU3A 2QI6A 1DPJA 1SMRA 5P5TA 5KR8A 3NUJA 4FM6A 4IVSA 1XE5A 2FNTA 1W5VA 1A8GA 5OZ9A 5P8TA 5P53A 5P2NA 3OQKA 2AZCA 5P22A 5DQ2A 1MSNA 1AIDA 5OYRA 2AOFA 5P6YA 2AVOA 1NPVA 2Q54A 1RPIA 5P0XA 3PMYA 1K1TA 1BWBA 1T7JA 5OYUA 6FIVA 2IGYA 2HS1A 5BWYA 4J5JA 4ZSQA 1LYAA 3QRMA 1FMXA 5OZSA 2Z4OA 1FFIC 1LYBA 5P80A 8HVPA 2QK5A 1HPOA 2XYEA 4F74A 3T6IA 2ZJNA 5F01A 3OAGA 3UHLA 2AOCA 5DGWA 2AZBA 2QMGA 5APRE 5P42A 4GIDA 4Y3PA 2QNPA 5P5WA 5ER2E 5DQ4A 1UH8A 4KB9A 4J1KA 2AOJA 3TLHA 4DQHA 4EXHA 5CLMA 5I3WA 4M8XA 3OTYA 4DUSA 2AIDA 3K5GA 5P13A 3MXDA 2PWRA 5P3TA 2HS2A 5P4UA 3IXOA 3MSJA 5P3ZA 3L5FA 3MSKA 4DQEA 4EQ0A 3UF3A 4Y9WA 5P3IA 4FSEA 5P6NA 4IVTA 5OYVA 3SKGA 4OBDA 4D83A 3D1YA 5P1GA 2QD6A 4FCOA 3IVIA 4Y54A 4YBIA 5OZ4A 1KJ4A 5P4XA 5P4QA 1BV9A 4QJAA 1MRXA 3UFLA 4Q1XA 3NU4A 4ZEAA 5HDZA 4D8CA 4FRKA 1E81E 2QP8A 5HTZA 2VA6A 5P3LA 5P54A 5P4DA 3OQDA 3EM6A 3NXEA 3BC4A 1M0BA 3EL4A 1OEXA 5P0KA 3PCWA 4R8YA 2V16C 1ZPKA 4YD5A 3H0BA 1D4IA 5P7LA 3VG1A 1HVJA 5DPZA 3I8WA 5DGUA 5P5FA 4CPTA 4A6CA 5P1AA 2ZHRA 1G0VA 5P7GA 2VNMA 5P38A 5P0ZA 5P5PA 1AVFA 1LZQA 1EC1A 3KDDA 3KFNA 4I10A 3L58A 1YM2A 1NH0A 5P2ZA 2OHSA 3SFCA 1QDMA 4EP3A 4ER4E 3PBDA 4OBZA 5P6MA 1ZP8A 4I1CA 2O40A 4Y56A 1LYWA 3O9BA 2IRZA 3MWSA 5P09A 5I3YA 1MT8A 4HVPA 4WTUA 2QU2A 2H6SA 4J54A 5P63A 3OY4A 1YT9A 1LEEA 2G26A 5P8CA 5P39A 5P5UA 4X2LA 3I2LA 1HBVA 1GVVA 2PH6A 3VEUA 3Q70A 3OU1B 1UPJA 2ZGAA 3SA3A 1G6LA 5P52A 2UPJA 2R5QA 3VFBA 2VIJA 3LIZA 3U71A 1LF2A 2AVQA 2I1AA 3GW5A 3LIXA 4PYVA 5OZEA 4I12A 3OGQA 5DQCA 4TVGA 4RROA 2ZDZA 4DFGA 2OHQA 3HD8A 3FKTA 2FGUA 1APVE 3K5CA 3LITA 2G20A 4CPUA 5P62A 5P8UA 3KFRA 4Y5BA 3HDKA 3O9FA 5PEPA 2XFKA 3VSXA 4RZ1A 5F00A 2I0AA 1MESA 5ENMA 3NSHA 3HLOA 1QBTA 5CONA 2B42A 3RSVA 5P2TA 3EM4A 4Y3QA 2P3CA 1BV7A 3OUDA 5P5KA 4B1EA 1LYAB 5HE5A 1EBYA 2AVMA 3ZKIA 5AH7A 3OGPA 5OZ5A 4GJ7A 4Y51A 1KJ7A 1MTRA 5P0MA 2O4SA 1G2KA 4Y3NA 5B18A 3CYXA 5I3XA 5P3EA 4Z22A 3OAGB 3TPJA 4L6BA 3UDHA 5OZDA 5DR8A 1HVSA 3K1WA 4EXGA 4Z50A 3PSGA 3WZ6A 1OEWA 5P64A 5P0RA 3WSJA 4JP9A 2PYNA 2G69A 4J1CA 5P8PA 4FRSA 3QI1A 5P4WA 5P03A 3SA8A 5P8JA 3KMXA 1MPPA 3PI0A 1UH9A 1C6YA 5OZQA 1KJFA 5P6XA 2VJ9A 5P85A 5P88A 3N4LA 5P6GA 5P0QA 3ZLQA 5P0JA 5P1BA 5P2HA 4B0QA 1KZKA 3S2OA 3NDWA 1J71A 3OU3A 4DI2A 2RSPA 4PZWA 3VSWA 3O9HA 4TRYA 5OZOA 4PEPA 2QNQA 5KAOA 3SM1A 5P14A 3OQFA 2JYSA 5P7RA 1W6IA 3NXNA 2PSGA 1TCXA 3INDA 3DJKA 5P1YA 1SH9A 3NWXA 4DQBA 2BPYA 5P17A 4AMTA 1A94A 5P8RA 4YOAA 4Y5KA 5OZPA 4EWOA 3U7SA 1PPME 1VIKA 5P5IA 2QI4A 3WB4A 2WECA 1HVKA 5P7NA 3ZKMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P1H A;  1FGC C;  2BJU A;  4I8W A;  1B6K A;  2CEN A;  5UPJ A;  3T11 A;  4Y4J A;  2FLE A;  3EMY A;  5OYZ A;  4TRZ A;  5P2R A;  5P0P A;  5OYX A;  1PPL E;  4EP2 A;  2V11 C;  4FM8 A;  1DAZ C;  2QZK A;  3QN8 A;  2B7Z A;  1HXB A;  5P3W A;  1QBS A;  2WF0 A;  2NR6 A;  3OAD B;  4H3J A;  4J0T A;  3CKR A;  1AJX A;  5P1M A;  3R0Y A;  4ZSR A;  5P3U A;  4OBK A;  3VV7 A;  1FMB A;  5P5O A;  2F3E A;  2O4N A;  4J55 A;  5P2A A;  5P60 A;  3ZKS A;  5DR3 A;  2ZJM A;  2R38 A;  5P0B A;  1HVR A;  4Y48 A;  2SAM A;  2PH8 A;  2FIV A;  5P68 A;  5OZN A;  5P6P A;  5P5H A;  2OHL A;  5P27 A;  4L1A A;  1T3R A;  5P41 A;  5P2E A;  1IZH A;  1EPO E;  4DQF A;  3A2O A;  4Y4Z A;  3OUD B;  4CP7 A;  1IVQ A;  4F76 A;  1EC3 A;  1PSA A;  5AH8 A;  2JJI A;  3BVB A;  4Y4X A;  5P4H A;  3S53 A;  5P40 A;  5P2K A;  2IGX A;  4DJP A;  3S54 A;  5P8G A;  4KE1 A;  4CMS A;  5P81 A;  1HHP A;  1CPI A;  4KE0 A;  3CMS A;  3OOT A;  5P06 A;  2Z54 A;  4J0V A;  4APE A;  5DR0 A;  5P6A A;  5OZW A;  1ZBG A;  4XX3 A;  2NMZ A;  5P20 A;  1HOS A;  3Q6Y A;  3PWW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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