5ENUA

Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from burkholderia ambifaria
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
b'HHHHMSVEVDRQVPDFTAPATGGDISLSDLKGRKLVLYFYPKDNTPGCTTEGLQFRELYPKFKKAGAEIIGVSRDSLRSHDNFKAKLELPFPLISDADEALCALFDVIKMKKMYGKEVRGIERSTFLIDADGVLRQAWRGIKVPGHVDDVLSAVQAL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from Burkholderia ambifaria
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ M
source organism Burkholderia ambifaria
molecule tags Oxidoreductase
total genus 53
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5enuA00
1LJRA 4TVEA 4TR3A 1CQGA 3BOAA 2L4QA 2RM5A 1BAYA 6GSYA 3UBLA 3JCML 1WJKA 2VIMA 3FZ4A 4I5QA 3DIEA 1JHBA 1JZDA 4OMVA 5GAPD 4D73A 3RHBA 3P90A 4FYCA 2A2SA 2OA7A 3HYPA 2KOKA 2QGVA 4TW5A 2GSQA 1TP9A 1ERTA 3KIJA 1GTUA 4MJAA 4IP6A 4L5LA 3WGDA 1ZZYA 1EP8A 2H6ZA 3TRQA 1EV9A 1E6BA 4ULXA 2R4VA 4YQUA 2H1GA 2H70A 3DWVA 2H71A 4HJ2A 4MMMA 1Z6MA 2VCQA 2V41A 4LA1A 3PH9A 4EXJA 3TJKA 1A0RP 4KW6A 1XWKA 3HHVA 3C1SA 2IIYA 3IAM2 2HLSA 4HS1A 1B8XA 1GSSA 4OCFA 5HFGA 3D5JA 1G0TA 2HFDA 2H0GA 4PURA 2A2RA 2PMTA 1GTIA 2H76A 1K0OA 9GSSA 4FYUA 4OFTA 2IMIA 2WGRA 17GSA 2IMEA 3ZFLA 4WR4A 3GH9A 2HRFA 4KSMA 3QAWA 2NVLA 1K0MA 3WGEA 4GF0A 3K8NA 5CREA 1DUGA 3APQA 1SJ6A 5IO2A 3APOA 3IDVA 3TKPA 4BVYA 4F2IA 4EE0A 2RM6A 2YCDA 3ZMKA 1V40A 10GSA 1TXXA 1A2MA 1M9AA 4IKHA 2XHFA 2K6VA 3FY7A 3LGCA 4POKA 4BPYA 1T4ZA 3M0FA 1K0CA 1TK0B 4L8EA 3DD3A 4LMWA 4X1UA 3EVIA 1TRVA 1ZCPA 3P8WA 4QL9A 3TOUA 3QR6A 2MZCA 4DVCA 4MDCA 4CHSA 4GQCA 3MSZA 2H0HA 4CDOA 3D4TA 4FYBA 2ZUPA 2R37A 4WF4A 3IA1A 3ZZXA 2KP1A 3HXSA 4K7OA 3VWVA 4EDZA 1XPVA 2F3MA 3A2XA 5HR3A 2C80A 3UVHA 3HA9A 4YQVA 3IC4A 3HZ4A 5D9VA 2YP6A 1A24A 4POLA 2O87A 2CVDA 12GSA 3VFIA 3VWXA 3EC3A 4GXZA 1GSYA 4JRRA 2CZ2A 2H30A 5KN0A 2KP2A 3PINA 3FR9A 2YV7A 2AV4A 4IW9A 1YF1A 2ZNMA 3DVXA 1XFLA 4KH7A 4JR4A 3A5WA 4XS6A 2GGTA 1EOGA 3NZNA 2DIYA 1A8YA 5JCGA 7GSSA 2YJHA 4XTSA 1GL8A 2JSYA 2NDOA 5F0GA 2IMFA 5IM9A 2N5BA 2R3XA 5IMZA 4TKYA 3LORA 3BCIA 5COHA 2L6CA 2IN3A 4MA9A 2B5EA 1O8XA 2AJQB 4L0UA 1DE1A 2DJ3A 4IELA 3FR3A 3J7Yk 1MDKA 4XS4B 4BL7A 1EV4A 3C7MA 2C3NA 2HT9A 2WZ9A 1GWCA 3GYKA 1XVQA 2JZSA 4NHZA 3CSHA 1PX7A 1HNBA 5A4VA 2HSYA 3EMPA 2D2ZA 1G6WA 1I9DA 4XS1A 2DMLA 3VI7A 5J5NA 2EIRA 3GL5A 1VF2A 2H0IA 2LV3A 2CAQA 5CRWA 4Z7XA 1PD21 3AY8A 2GQKA 2H72A 4WBRD 5ECMB 2LS5A 1NSWA 5JCUA 1AIUA 4CW9A 2PVOC 2TRXA 4ILFA 2H8LA 3TCOA 4EDYA 3KGKA 1V2AA 3FZAA 3GSTA 2V32A 2TRCP 4HQZA 1BJXA 3KH9A 5G1KA 2DLXA 2ALBA 1HYUA 5KN3A 3ZLPA 4KB3A 4MJEA 3EE2A 5ELGA 4RI6A 2X8HA 3EINA 1JFUA 1G7EA 2REMA 3ZIVA 3RDWA 2VUPA 2JZRA 5DALA 3KTBA 4JZQA 4TXOB 3SWLA 4OWYA 1XOBA 5LNKe 2IMKA 3M8NA 2LRTA 4ZIJA 2YV9A 1FVJA 4GWRA 2AB6A 3L4NA 1XWBA 3U5RE 3UEMA 1AQVA 3KP8A 4MPGA 1XWGA 1GUKA 1C72A 4MF6A 2OE3A 5DQSA 2I9HA 3W6GA 4GSNA 3IE3A 2CAIA 2VD0A 1TJDA 4EUYA 3G7IA 4TR1B 4HZ2A 2DJ1A 3HVVA 2CVBA 4L5OA 1K0DA 3NOFA 4PUAA 2HZFA 2FGXA 4K7NA 5J41A 1OAZA 1K3YA 5GAND 3ME7A 4IS0A 2ES7A 3C71A 4K7IA 5DCGA 3A2WA 5IQYA 2C3TA 2M46A 4IBPA 5AIVA 3GV1A 4XS4A 1UN2A 3TUEA 2PUKC 5D8IA 3TRPA 4HUAA 4O32A 1VRSD 4HOJA 2DJ0A 4EVMA 2G0FA 1Z9HA 4XCSA 1TU7A 3CTFA 2HYXA 3VWUA 3QCPA 2C0DA 2GQLA 5HFKA 3M3MA 5G5FA 3VURA 6GSSA 1EWXA 3GKNA 2RLIA 1JLVA 2CT6A 2NTOA 5IMFA 1F6MC 1J08A 1M7TA 5CRHA 1ILOA 1PA3A 4I6XA 2H74A 2NBSA 5A4UA 5IPGA 3LG6A 3RPPA 2C8UA 3KMOA 2RUFA 2E2MA 2OBIA 3IBHA 6GSXA 2BMXA 2BTOT 4KGIA 3TKQA 1W4VA 3HZ8A 1BQ7A 3H4KA 4K8MA 4JE1A 4WEYA 1NHOA 2VCXA 3LSZA 2MYGA 1G7OA 5ECNB 2K9FA 2E2GA 1XXUA 2CV4A 2V6OA 3F4SA 1THOA 2YWOA 4GTUA 2L5OA 2OBKA 5B6MA 4YQMA 4ZXGA 1SD8A 1R7HA 5H5QA 3DMLA 2C4JA 2OACA 4ZL8A 1YEPA 3US3A 4TR1A 3KEBA 4F03A 4MF7A 4HDEA 2IWTA 3QFBC 2NPBA 5CAXA 4JR6A 4ID0A 5B8AA 4BA7A 3IOSA 2P5RA 3F0IA 5KN1A 2CX4A 3QPMA 3QFAC 3VPQA 3GRXA 5IOXA 1TI1A 1YKCA 3I6AA 4NXIA 4FIWA 2GZPA 1N8JA 1URMA 3H93A 3C73A 2OE1A 1R26A 3CTGA 3F3RA 3RBTA 1WMJA 2OJLA 1V9WA 3H8QA 4EC0A 4KCAA 3D22A 2YNXA 2FLSA 2IFQA 3CSIA 1R5AA 4XIHA 1ZYEA 4OD7A 1DE2A 3CRTA 1IYHA 4KSOA 3FR6A 4DSSB 1M2AA 3ED3A 4ZILA 3NIVA 5GZZB 1KEBA 1OC9A 2HE3A 4I97A 2MMZA 3ZL5A 3KH7A 2N5AA 2JADA 1VF1A 4GQFA 5ECPB 3GNJA 5ABRA 1PRXA 1UC7A 5ID2A 1XW5A 2GS3A 1F3BA 2LQQA 5CO3A 3TJJA 4XHMA 3E0UA 1RK4A 2V2GA 1F9MA 3GIXA 3F63A 13GSA 2XC2A 1SK0A 2VL3A 5A4WA 3HKRA 4DSQA 1WOUA 1PL1A 1X5DA 3I69A 3BD2A 2JU5A 4POBA 4KDYA 4I2TA 3MAKA 3QOUA 3C1RA 4N30A 2VLVA 1X5EA 1XW6A 3APSA 1YY7A 2B1LA 1YEXA 4MK3A 5LCZA 1WP0A 1PX6A 1W89A 3A3TA 4Q5RA 2JACA 2MMAA 4PNGA 2F51A 2LNSA 2AUVA 4NV5A 1XW9A 5D93A 2FY6A 1BEDA 4GLTA 1PKWA 3L9UA 3LEFA 3P2AA 4J56E 4IHUA 4NHWA 2H1BA 3F9UA 1JZRA 3WYWA 2YANA 5D9XA 2H75A 3OR5A 4P3YB 2B5XA 3P7XA 5A5KA 1ERUA 1OC3A 3GN3A 2GQMA 2GT5A 2BJXA 3D0ZA 4ECCA 1TK8B 1ZMAA 1T00A 4MH3A 3CXGA 4KCEA 3UIWA 3LXZA 2LQOA 5GSTA 3H79A 4G10A 2AAWA 1WRYA 1GSEA 1NM3A 4RUVA 4LLRA 4AGSA 6GSTA 2YOIA 1GTAA 1TTZA 1XZOA 2PGTA 1XIYA 1ML6A 3HJPA 5JWRB 4MP4A 2YZUA 2VCWA 2HZEB 3Q18A 2GVPA 1SYXA 1TI3A 1GSQA 5HFIA 2VL2A 3LJRA 2ON5A 3DYRA 3V1WA 2H1DA 4TR4A 4TRXA 2QC7A 1YKAA 5IMCA 5C00A 2VLTA 3Q19A 1G6YA 5DJLA 3R2QA 3I43A 5IMDA 5IMVA 1QUWA 3CRUA 2DIZA 1M2BA 20GSA 2J9HA 5ELAA 2L5LA 3FZ5A 1HQOA 2XPDA 4FH8A 4V2MA 5CRGA 4AJ8A 1MDIA 4HU9A 1FB6A 5D9WA 2GZZA 2WJUA 2VLUA 3ZMLA 4IN0A 3S9FA 4IP1A 1K0BA 2H1AA 1OKTA 4JEDA 5F05A 4EKZA 1VF4A 2C1YA 5F06A 3J7Yb 16GSA 1X9SB 3BBYA 1FB0A 3TDGA 1E2YA 4MH2A 1S3CA 3L78A 4TXVA 3LYPA 5J9CA 1Z7RA 3IV4A 1UVZA 3F4RA 2RUEA 5DQYA 3G7JA 8GSSA 3IXRA 2I4AA 2V6KA 2HNLA 1HNAA 4OO5A 2AHEA 1V57A 2I81A 3EWLA 1EGOA 2J23A 3ERWA 3E3EA 1QQ2A 11GSA 1H4OA 3HVXA 1S3AA 3WT2A 2A4VA 3UOMA 3UMAA 3ZVJA 5D9TA 4WBJA 4X43A 1ON4A 3D4MA 2EIOA 1JLWA 2WFCA 3O6TA 4MCUA 5G1LA 1J0FA 5H5SA 4DEJA 3QD9A 2P0GA 2DC5A 3FZ9A 1SK2A 1KTEA 2CQ9A 2KLXA 1M9BA 2VM2A 5J4UA 4K1FA 1X5CA 4AF2A 2IMDA 1AAZA 3FK8A 2GZYA 3IK7A 4ISDA 2HI7A 3G7YA 2VAFA 1OVNA 3MWHA 1LU4A 5JWQB 5H5RA 3FKFA 5DAKB 1WIKA 3HDCA 2K8SA 4G19A 2B5YA 1O73A 3ZITA 3GL3A 1O6JA 5J3RA 4QL7A 1GRXA 2LNTA 1B9XC 3IK9A 4HU7A 5F8BA 5IO0A 5ECLB 4QQ7A 1MD4A 2P5QA 2GSSA 3HCZA 4I8BA 2VM1A 1S3DA 5DVBA 4AJ6A 3N5OA 4GCIA 2FCHA 18GSA 1AQWA 4WKWA 3EU3A 2C0FA 2LRNA 4D73B 4K0GA 1ST9A 4KE3A 1Z6NA 3GX8A 2X8CA 1SL2B 2JZTA 2ON7A 3LXTA 3F6DA 1HD2A 3ZRDA 4N11A 1RW1A 2CX3A 3FHKA 2DMMA 3F8UA 3Q6OA 4YAPA 2MMNA 1EP7A 2YJ7A 2R5GA 4ZB9A 1Z7PA 3HJOA 1I5GA 1CQHA 2B3SA 2CVKA 4IQ1A 1SL1B 3TJFA 2EIQA 5E4WA 2YWNA 2HSHA 4MZBA 1O7UA 4HEA2 1FVKA 3KZQA 2GTUA 1O85A 1WWJA 5ECRB 1PL2A 1USBA 2C0GA 4NV2A 3MNGA 1B4QA 4TXOA 4MLYA 4H86A 3EURA 3U6VA 3VLNA 3M9JA 1TU8A 1A23A 3EU4A 1U87A 2FWEA 3D6IA 3A2VA 1MEKA 1F3AA 4PGTA 4LL4B 1QMVA 1EEMA 2GDRA 3DRNA 2R2JA 2JL4A 3KTLA 4KA0A 4O92A 2R6KA 1HNCA 5B8BA 2YWIA 5HR1A 1SL0B 4ZL7A 3L0HA 2JSZA 1SENA 1V58A 5CP1A 3ZFBA 4YAVA 2EC4A 5DJMA 2VCZA 2PBJA 4WXTA 3FYGA 5GSSA 3RAZA 4TOPA 2OE0A 1GTBA 4WETA 4KUNA 1YDKA 4OO4A 1YZXA 2HRNA 4MJBA 1A2LA 4RI7A 2E7PA 1BG5A 1Y25A 3IR4A 4K6XA 3LYKA 2F8FA 5AIXA 3HVSA 3UAPA 1PN9A 4PQHA 3TOTA 3PGTA 4MF5A 3TJBA 3Q74A 1XWCA 1RQMA 2L59A 3ZYWA 1ACVA 2PN8A 3VI5A 3WGXA 3CSJA 2H66A 4V1Ap 3LFLA 1VGLA 2YZHA 4MZCA 4GSSA 3QMXA 2LJAA 3UBKA 2PWJA 4IJIA 4J57E 1YQ1A 1Y6EA 3GHAA 5G5EA 1XBSA 4F0CA 3KJYA 1AQXA 2PERA 1SJZA 5JWOB 1A8LA 2H6YA 3VWWA 3H1NA 1QK8A 1U88A 1EZKA 4GSTA 1TRSA 1FO5A 2K8VA 5IPHA 2WS2A 1TRUA 3SBCA 1R5PA 2HXKA 4G9HA 5CYYA 3W8JA 1F2EA 1ZOFA 5AN1A 2GT6A 1YF0A 1T1VA 4N10A 4FO5A 1X9WB 3IHQA 1J9BA 5INYA 1OYJA 5EVOA 5J9BA 1ERVA 1GUHA 1TKDB 4L0WA 4F0BA 5FT3A 3GX0A 2WCIA 2LSTA 3MDKA 4EO3A 4E8HA 1BYEA 1OKDA 5D73A 4ML6A 1FOVA 3FW2A 1V98A 1T3BA 2IJYA 2YN1A 2XPEA 1SK1A 2G2QA 2E0QA 4NMUA 1GULA 1N2AA 3KCMA 1XWAA 3DXBA 4MZWA 1TRWA 2H01A 5FWGA 2XBIA 2GSTA 2PPTA 6GSVA 4KNDA 1GLPA 2N5FA 3F3QA 3UVTA 1FW1A 2VCTA 4ZBDA 4KX4A 3GUSA 3TJGA 1PKZA 1EGRA 4K9ZA 1B9YC 1T4YA 2B7KA 1LBKA 3GH6A 1WPIA 3TKSE 4KDXA 3O3TA 2WDUA 2VOCA 1PMTA 1JZOA 2B6MA 5DALB 3GFKA 2H6XA 2MBSA 3GSSA 4ECBA 4F82A 4HQSA 4ZBAA 4DSRA 4DSSA 2K18A 5ECKB 4OCEA 3BJ5A 2X8GA 2LTKA 5EL8A 2FUG2 4ZB8A 2L6DA 1DBYA 5CRDA 1JZWA 2VO4A 2QKEA 3L9VA 4NWYA 3TB2A 3GTUB 4TR0A 1ZYQB 3KD0A 1AC1A 4X0XA 2WULA 3ERFA 4G2EA 2Z9SA 1THXA 14GSA 3HD5A 4OFMA 3GURA 3TKRA 3PR8A 1Q98A 1H75A 1KNGA 1XCCA 2TIRA 2O89A 3BCKA 4K2DA 2CA8A 2VL2C 2B1KA 5G30A 4YH2A 2OKAA 2VD1A 1ZGNA 3HY2A 1T8EB 3FEUA 4ZL9A 2IL3A 1A2JA 5EY6A 1DSBA 3M1GA 3TGZA 3GMFA 1B4PA 6GSUA 1TK5B 2O7KA 4XRDA 3KXOA 4XRAA 5L71A 3TKSA 3FRCA 2FHEA 2LEGA 4BWQA 3GA4A 5DCHA 5ECSA 1F37A 3C8EA 3TRXA 1X9MB 1QGVA 3WD6A 3ME8A 3VK9A 2FWFA 4IVFA 1FHEA 4V1Ag 1AUCA 2FA4A 4J2FA 3O76A 1SJIA 1GSFA 1OE8A 1SKRB 1BX9A 4MPFA 1T7PB 4ZBBA 2CZ3A 3UARA 1UA5A 1SYRA 1QXHA 5IIZA 2XBQA 3IRAA 3KM6A 3WT1A 2C0EA 1XVWA 2I3YA 5ECHB 2WB9A 2VCVA 2M72A 3ERGA 3D21A 3ISOA 2MBTA 4O7HA 1QFNA 2O8VB 2DSAA 2L4CA 4BVXA 2LRCA 4KAEA 1AXDA 4ACSA 4KDUA 2YWMA 3TKSC 4F9ZA 5ECQB 3F4TA 4MJCA 1SKSB 3IAS2 2B7JA 2MMOA 4EL1A 4PXOA 3CYNA 4ECIA 2DJJA 3ZREA 1SKWB 2PU9C 5FHIA 2ZCTA 3UL3A 2HZEA 4LL1B 4Q5FA 1NHYA 1R4WA 4N0ZA 3RHCA 5C04A 2DJKA 3VPTA 3M9KA 3HJMA 1YJ6A 2KHPA 5ECOB 4JBBA 2DBCA 5DBQA 2WRTA 1U3IA 5E59A 3E9JB 1K3OA 3GKKA 2I1UA 4HJMA 3GTUA 5ECIB 4RQRA 1GNEA 3I9V2 4E8EA 5JCWA 4Q5QA 1X0RA 4I2UA 4HZ4A 1MTCA 1SD9A 2LUSA 4HI7A 4PQIA 1K0AA 4K0NA 1PSQA 2IPAA 2F9SA 4PQ1A 5IOWA 5F07A 5HR2A 1MDJA 4NPBA 4TN8A 1GLQA 5ENUA 1O81A 4AJ7A 3L9SA 5AISA 1FG4A 2LJRA 1PQNA 5B7CA 4PUFC 1U3AA 1U6TA 4PNFA 3ZIJA 2O85A 4PX1A 1GSDA 1WE0A 5G2ZA 5AGYA 3IPZA 2V1MA 3DGQA 2IFQB 4LMVA 3ZTLA 2FA8A 3QDNA 1K3LA 1GUMA 1KBNA 4V2LA 1Q4JA 5DDLA 2AYTA 3CBUA 5B6NA 6GSWA 1EOHA 2F8AA 2X99A 5KEJA 3QAVA 1B48A 4ZB6A 4JU5A 5KN2A 2RIIA 1ABAA 3LWAA 4Q5NA 2GLRA 2H19A 4WF5A 1OC8A 3RPNA 1M99A 1Z5YE 2LKUA 3G9BA 4IJ3A 4ML1A 4RQXA 1TDIA 3F6FA 1OC9B 1Z3EA 3N9JA 5HR0A 4IQAA 3KP9A 4WR5A 4IGJA 5D96A 3DEXA 1GNWA 2H73A 1NW2A 3UJ1A 3EYTA 4N0VA 19GSA 1K0NA 3CMIA 2PVQA 3LQ7A 4O5RA 5ID2B 1GSUA 1ERWA 4OFNA 1IYIA 5G31A 5LD0A 1TOFA 2FD3A 3GKXA 4EF0A 2GSRA 3QAGA 1GH2A 2M80A 4POMA 4V2NA 3DKSA 1SU9A 1OE7A 5IMAA 2L57A 1M0UA 5EPFA 2FWGA 2KUCA 3W8SA 1MD3A 3EMXA 1GP1A 4BWSA 2FNOA 3KMNA 3ZVJD 2X64A 1TW9A 5CNWA 1M2DA 2VL9A 5HQPA 2YPMA 5DAKA 1VF3A 1AW9A 2DJ2A 1PGTA 1ZL9A 1XOAA 1A0FA 1EEJA 4ECJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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