5ER1E

A rational approach to the design of antihypertensives. x-ray studies of complexes between aspartic proteinases and aminoalcohol renin inhibitors
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title A Rational Approach to the Design of Antihypertensives. X-Ray Studies of Complexes between Aspartic Proteinases and Aminoalcohol Renin Inhibitors
rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 73
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E01
1HVKA 5P1MA 3D3TA 3O9LB 5KQYA 5P5NA 1HHPA 3NDUA 4TRZA 1IZDA 3GGAA 4LAPA 3KM4A 3PWRA 5P3OA 1SP5A 3EXOA 5P5JA 1IDBA 2QI0A 5P8BA 3PBZA 2A4FA 5P35A 5P6YA 5DR8A 4ZEAA 2H6TA 5P1SA 4QLHA 4RGHA 3SO9A 3ER5E 5IVQA 5HE5A 4RCDA 5P8OA 2ZYEA 5OZ1A 2QHYA 5P1VA 5P8MA 4YD4A 3BRAA 1OHRA 4ER2E 2V0ZC 3OGQA 5P7MA 5EZXA 1SBGA 2AVSA 2QMDA 1AZ5A 4Y3TA 1C6ZA 1W5YA 3HZCA 4DFGA 5P2NA 2I4VA 3FX5A 4E43A 2G20A 2PYMA 1BXQA 2JJJA 1ZTZA 2WECA 4NPUA 3HAWA 3NWXA 5P4SA 3NXEA 5CLMA 3UPJA 3GI6A 5ENKA 3QN8A 1ODWA 4ZPEA 3B80A 5P16A 5P33A 5P1RA 4GJDA 3INDA 1G0VA 4B1DA 4Z2ZA 5DR1A 1MVPA 1EEDP 3PMYA 4LP9A 2QD6A 1FLHA 2B7ZA 3O9BA 4LXKA 3QI1A 4Y5PA 3G70A 3SM1A 4FS4A 4MC2A 4RVXA 4Y3HA 4PZXA 1UH8A 5P32A 2Q63A 2QZKA 2XYFA 3S54A 3ER3E 3FNTA 1WKRA 1K6PA 5P6TA 2QZWA 5P4EA 3PGIA 3BHEA 5P3VA 4HDBA 3KT2A 3S2OA 3UTLA 3CIDA 4Y41A 2FLEA 2NPHA 3DUYA 1A8GA 2IKUA 3KFSA 5B18A 2FXDA 1UH7A 4FAEA 5P74A 3QROA 5P7IA 1ZLFA 3SAAA 4Y35A 5OZ8A 3NLSA 5JODA 5P3DA 2WF0A 3NU5A 4PZWA 5P0QA 2WL0A 5P7GA 5P7YA 4Y3ZA 3S7LA 3URIA 2Q11A 1APWE 1RQ9A 5ENMA 4Q5MA 2MIPA 3PI0A 4EWOA 5P75A 2AOIA 3KFNA 3LZVA 5P4PA 3RU1A 5OZ0A 4DQGA 3I7EA 1EPLE 3NDWA 1APTE 5P2RA 3FKTA 5EZZA 2IENA 5P47A 2ZDZA 4I0EA 5P2GA 1LF4A 1E80E 1IZHA 5P2TA 5OZ2A 2WF1A 4Y57A 3AUPA 4AUCA 4NJTA 3CYWA 4HE9A 2ER0E 4Y4TA 3I2LA 4DH6A 2QU2A 1HTRB 5P4YA 2NMYA 2G1OA 2O40A 1GKTA 3IGBA 5P8QA 4NJSA 4CPSA 4DQCA 4Y39A 5P5UA 5P60A 3GI5A 4J0YA 4PEPA 5P09A 3OTSA 2ZJHA 2FNSA 3NWQA 2Q64A 4CPTA 4RZ1A 4J0TA 5DR3A 4JOOA 1MESA 2CENA 1SH9A 4F75A 2G94A 4XX4A 5P4WA 1W5WA 2ZHTA 5KR2A 3O9DA 5P7HA 2VKMA 5P2KA 5OZNA 4APRE 5P15A 3OTYA 5P73A 3KF0A 5P4GA 4ZLSA 1EC3A 4OC6A 2UXZA 4BFBA 3OOTA 3OHHA 5C9BA 2G69A 1ZJ7A 2ER7E 2PWCA 3KYRA 4PPHA 3QRVA 1D4JA 2PC0A 3G6ZA 4BEKA 5P52A 4I12A 5P2QA 3HAUA 3WZ7A 5AHCA 1A8KA 2OHNA 3PSGA 4EHCA 1A30A 1YM2A 2PSUA 5P7NA 5P78A 3OQKA 3EKPA 4HVPA 1HVLA 5P7QA 1FB7A 5JFUA 4GJCA 4R92A 5P81A 1T7KA 2BQVA 4J54A 3VG1A 5P5WA 2FGVA 5P6IA 2AVVA 1BDRA 3VSXA 1BWAA 3QBFA 1J71A 2V00A 3SQFA 3WSJA 2IKOA 5P4KA 3S53A 1DW6C 2WHHA 1T6EX 4HDFA 3EM6A 1GVXA 1MT7A 4BFDA 1QS8A 4Y43A 4NJVA 3R0YA 5OZOA 4I0HA 5P1OA 4GIDA 3OU4A 5AHAA 5OZJA 3IXKA 4EJDA 5P85A 5AH9A 2QU3A 5P2HA 2AZBA 5F00A 3UF3A 5P7XA 5P7TA 4OBZA 4Y3NA 3R2FA 8HVPA 2HM1A 4HEGA 5P0SA 5P11A 5OYWA 5P7ZA 4FM6A 2IQGA 2RSPA 1MTBA 5P7PA 1YG9A 2Q55A 5P83A 5P53A 5P6UA 3R4BA 4ER4E 1EC0A 1SGZA 5P07A 1A94A 4GJAA 3FNSA 2BPWA 5OYQA 5P80A 5P1YA 3BXRA 3D1XA 3VV7A 3IN3A 1ZSRA 3APPA 3QVCA 3MSKA 4DJXA 5P3AA 3IXOA 3VFAA 3TTPA 4YBFA 2VIJA 4OBFA 3SA6A 2WF2A 4J0PA 4LXAA 4TRYA 1EBKC 4B70A 1IIQA 2AOCA 1YTHA 1MT9A 4WY6A 5P2FA 1FEJC 1KJGA 5P7RA 3UQUA 1JLDA 5P1GA 2R3TA 1W6HA 2IGYA 5P5ZA 2RKGA 4R93A 4HA5A 5JFPA 4J5JA 5P0IA 4NPTA 1HPOA 1DP5A 2P4JA 1RV7A 4OC6B 3UDQA 2VNMA 5P0OA 5OYUA 4AMTA 2O4KA 3BUFA 2J9JA 2OHKA 3CKTA 4Y5GA 1D4HA 4Y37A 3EKXA 4U7QA 1NPWA 1NPVA 3LHGA 3UCBA 5P04A 5OZPA 5P6NA 3M9FA 3PM4A 1PSNA 2QD8A 4Y3XA 3IAWA 3T6IA 3MSJA 3VF5A 5P3RA 2FXEA 6FIVA 2VA7A 4Y36A 2PH6A 1OEXA 3NUOA 4FRIA 4Y48A 3URJA 3VEUA 4ER1E 5P48A 2HS2A 4YA8A 3QP0A 2F3FA 5P8NA 1OEWA 4DPFA 2QHZA 5P2VA 4GJ9A 3KN0A 3EL9A 7HVPA 3BUHA 2I4WA 4Y4XA 4Y51A 4A6CA 4Y3PA 3Q6YA 5P3WA 3Q4BA 2IDWA 1AJXA 2ZHVA 4Y5KA 3GGXA 3VLBA 3LZSA 4Y3JA 4Y3YA 4QJ6A 4Y5AA 5OZVA 5DR0A 4Y3RA 5OYVA 3SABA 3O9HA 2QI4A 2VA6A 4GJ7A 3OU4B 4Y3AA 1IVQA 4Z50A 2BKTA 5P1JA 1ER8E 4Y4UA 4YHQA 3KA2A 5OYSA 3PBDA 4QJ9A 1SGUA 2I4QA 2NMZA 5P6RA 1MRWA 1VIKA 4IVSA 5OZ9A 3K4VA 3BVBA 4OBZB 5P4NA 1NH0A 2WEZA 4EQ0A 4ACXA 2QI3A 4Y50A 4Y5CA 3UDRA 4DJVA 3EL5A 4YOAA 3LIVA 3OXXA 4OBGA 4DJQA 3BGBA 5P4QA 4XX3A 1EC1A 5P46A 3ZKQA 5P64A 1BV9A 3L59A 2FIVA 3UQPA 5P0KA 4F73A 1GVVA 3NR6A 3ZLQA 3EKTA 3L3AA 1K6TA 4R5NA 2O4LA 3PSYA 3KFRA 5P87A 2QNQA 5I3XA 2JXRA 5P2DA 3UDKA 2AZ9A 4CPRA 1AIDA 1A9MA 1EC2A 5P6HA 1FQ8A 5P01A 5P4AA 1Z8CA 5P6GA 3ZOVA 5P6LA 4EXGA 1AJVA 1BXOA 2O4SA 5P5QA 5P34A 5P18A 5P5GA 1HIIA 4A6BA 3QPJA 3VSWA 3ST5A 4D88A 1TQFA 5P29A 5P1LA 4I10A 2FDEA 2G22A 2J9JB 4GJBA 4FRKA 4QJ7A 3JW2A 2VJ7A 3TPPA 1QBUA 3S45A 3UFNA 4GB2A 2I4UA 2QP8A 2NXLA 5SZ9A 1ME6A 2RENA 5P5DA 5P7WA 5FIVA 5P5OA 3WB5A 1HVCA 4K8SA 4TVHA 4RVJA 5COPA 5P3ZA 4EP3A 5P57A 1EBYA 1BBSA 1GVWA 4Y3GA 5P8FA 1YTJA 3TOGA 2QD7A 2R43A 2B8LA 5AH8A 5KOSA 5P7UA 3S8IA 3OUBA 5P06A 2BPYA 5COOA 2OAHA 2QCIA 1HTFA 3PLDA 4I0DA 3OQAA 3AIDA 3RTHA 1MIQA 3DCKA 2VIYA 3TPJA 2OHUA 4EYRA 2PYNA 4ZSMA 2Q15A 5P45A 5OZUA 2QI6A 1LF2A 3O9EA 5P2JA 1B6PA 2B60A 5P0PA 3OUCA 1FF0C 5P3MA 1SDVA 2ASIA 1ODYA 1EAGA 5HVPA 1BDQA 4ZIPA 3FNUA 4GJ6A 1LV1A 3K5DA 5P8EA 5SY2A 3NU4A 4APEA 4Q1WA 5KR1A 1PPKE 3URLA 1EPQE 1IBQA 2R5PA 5P8RA 5P0DA 4J1EA 3UQXA 2NXMA 5HU1A 5P7AA 2V12C 3UDYA 2UY0A 1F7AA 3QRSA 1KJFA 4Y5BA 3RTMA 3JVYA 3F9QA 5P0JA 3D91A 4EJ8A 4YE3A 3K5GA 3LIXA 4GJ5A 3LZUA 5BS4A 5P2IA 1LYWA 4D83A 5BWYA 5P8KA 5P36A 4Y45A 4M8YA 5P8GA 5P1XA 4U7VA 5P6CA 4QJ2A 3VUCA 5P08A 5P3BA 1XL5A 5P4OA 3OHFA 2AVQA 5P6MA 3SACA 3NDXA 3NU3A 5P7VA 4DJRA 5P6AA 1DMPA 4K4PA 4RYCA 3INEA 4DJWA 5P31A 3EKYA 4Y4AA 3EM3A 3BUGA 2PSVA 5P4XA 3VV8A 5P2LA 5P8DA 2F80A 2HB4A 1UPJA 2BJUA 3SA5A 4Y5EA 1ZP8A 5P5HA 1HVSA 5P5PA 5P5LA 3LITA 3OU1A 3TH9A 4R91A 2R5QA 5P5MA 2AVMA 4MC1A 2ZJMA 3HVPA 3U6AA 2Q54A 5P4IA 4FAFA 1FFIC 5P8AA 4I0GA 4Y3QA 5P2ZA 3TPLA 5OZ6A 5P2YA 3ZKMA 5P0XA 4LHHA 2I0DA 1K2CA 5P0BA 5AGZA 3EL0A 4L6BA 5P0TA 2WF4A 3DV1A 2JJIA 2OHPA 4XKXA 4YCYA 2QK5A 7UPJA 2NXDA 1PROA 4FL8A 2OF0A 5OZQA 4F74A 1FIVA 5P8UA 5BRYA 4Y38A 4Y5LA 3ZMGA 1FQXA 2OHRA 5P55A 5P0CA 3ZPTA 4I0IA 4NKKA 5P3IA 4CPWA 1AAQA 1YTGA 5P4BA 5OZFA 5P70A 3PCWA 4YDFA 5P1HA 3HW1A 3Q5HA 5P2AA 5C9DA 5HCTA 5P1DA 5P38A 5P03A 2WEDA 2IEOA 5OZCA 3OU3A 2VIEA 5P5AA 5P0UA 3UQWA 5KQFA 5P6JA 5T4SA 5P4JA 1QDMA 3T3CA 5P8LA 1FQ4A 5P4FA 5P10A 4FGXA 1HRNA 1KZKA 1K6CA 5P3JA 2HC0A 2QMFA 2PMAA 4BELA 5P5FA 4FE6A 2QI7A 5CONA 3LIYA 5OZXA 3EM4A 5DQ1A 5P6KA 3D1ZA 2I1AA 2O4NA 1APUE 1B6LA 3SKFA 4Q1NA 1HTGA 4H3GA 4LL3A 3NXNA 1LYWB 4WTUA 2V13A 5P7LA 4Y4GA 2OHMA 2ZJIA 3APRE 4J1IA 1D4SA 4S1GA 5HE4A 1TSUA 5P4MA 1LF3A 4YCKA 3K5CA 3TL9A 1XL2A 5P3GA 5P2MA 2QZLA 3SLZA 1SIPA 4JECA 5AH6A 2PH8A 5P54A 3O9FA 2OHQA 1TCXA 3TPRA 2V16C 3SM2A 2AQUA 3O99A 5P0ZA 3OU1B 5JG1A 1FQ6A 1FMBA 5P27A 3DK1A 2P3BA 3L38A 5P30A 3RVIA 3KDCA 5DQCA 2QMPA 1K2BA 2VIZA 5HDUA 2G1NA 4Y54A 3VYDA 1MSNA 5P79A 1HIVA 2IGXA 2QHCA 5P02A 1HEGE 4Y3LA 1HVJA 5P76A 4EQJA 3OXCA 1ZAPA 4NJUA 5P5BA 2HPEA 5P56A 5F01A 2AOHA 1AM5A 1PSOE 3Q70A 1XN2A 5P68A 1KJHA 1BVGA 3UDHA 1IDAA 4TRWA 1D4IA 3NU9A 4H3FA 1PFZA 2O4PA 4MC6A 4FM7A 4Y4EA 5KAOA 1M4HA 2OHTA 5P7FA 1MTRA 3OXVA 5P39A 5IS4A 1HIHA 3PMUA 5P00A 2FNTA 5DGWA 5P3FA 2VS2A 3S85A 5OYYA 2WEBA 2SAMA 3LIZA 4FM8A 4Y5NA 5P26A 3CICA 2OHLA 5IVRA 4CKUA 5P1QA 3LNKA 2FDDA 1E82E 4Y4BA 2AVOA 5P0LA 1PPME 3OQFA 3R0WA 4ZE6A 5AHBA 5P1EA 9HVPA 1F34A 2ZHSA 5OZSA 5P0WA 3PSUA 3SA3A 3VYEA 3HLOA 3ZPSA 3GI4A 4DQBA 1GVUA 4KE0A 4HDPA 3TOFA 4TVGA 5P5SA 4QJAA 3L5EA 5IE1A 4L7GA 1G6LA 5P4DA 1IZIA 4GJ8A 3UQRA 1T6GA 5P1TA 5OZ3A 3PHVA 1ZBGA 5IVTA 5P28A 4CMSA 3MWSA 3ECGA 1NPAA 4PYVA 1BILA 1META 1HWRA 3BC4A 5HDZA 5ISKA 4J1FA 4RVIA 3WZ6A 2G27A 1B6JA 2I4DA 2QI5A 1LYAA 3O9IA 1YTIA 2APRA 5P1AA 3IN4A 1EPME 4L1AA 4B1CA 5P23A 2G1RA 4EXHA 1G35A 5DR4A 3PEPA 1C70A 3WZ8A 2P3BB 4U8WA 1EBWA 1U8GA 2FGUA 2ZGAA 1GNOA 2WKZA 1DAZC 1PPLE 2BKSA 4Y56A 2AOFA 5P3KA 2VJ9A 5P8VA 4ZPFA 3H0BA 5OYTA 5P42A 5P61A 3H5BA 4RRSA 1TZSA 5P89A 5DR7A 1FMXA 5P88A 3UDPA 1HPXA 4L7JA 3EC0A 5P6PA 4XXSA 1FFFC 3I8WA 3GI0A 1HTEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HVK A;  5P1M A;  3D3T A;  3O9L B;  5KQY A;  5P5N A;  1HHP A;  3NDU A;  4TRZ A;  1IZD A;  3GGA A;  4LAP A;  3KM4 A;  3PWR A;  5P3O A;  1SP5 A;  3EXO A;  5P5J A;  1IDB A;  2QI0 A;  5P8B A;  3PBZ A;  2A4F A;  5P35 A;  5P6Y A;  5DR8 A;  4ZEA A;  2H6T A;  5P1S A;  4QLH A;  4RGH A;  3SO9 A;  3ER5 E;  5IVQ A;  5HE5 A;  4RCD A;  5P8O A;  2ZYE A;  5OZ1 A;  2QHY A;  5P1V A;  5P8M A;  4YD4 A;  3BRA A;  1OHR A;  4ER2 E;  2V0Z C;  3OGQ A;  5P7M A;  5EZX A;  1SBG A;  2AVS A;  2QMD A;  1AZ5 A;  4Y3T A;  1C6Z A;  1W5Y A;  3HZC A;  4DFG A;  5P2N A;  2I4V A;  3FX5 A;  4E43 A;  2G20 A;  2PYM A;  1BXQ A;  2JJJ A;  1ZTZ A;  2WEC A;  4NPU A;  3HAW A;  3NWX A;  5P4S A;  3NXE A;  5CLM A;  3UPJ A;  3GI6 A;  5ENK A;  3QN8 A;  1ODW A;  4ZPE A;  3B80 A;  5P16 A;  5P33 A;  5P1R A;  4GJD A;  3IND A;  1G0V A;  4B1D A;  4Z2Z A;  5DR1 A;  1MVP A;  1EED P;  3PMY A;  4LP9 A;  2QD6 A;  1FLH A;  2B7Z A;  3O9B A;  4LXK A;  3QI1 A;  4Y5P A;  3G70 A;  3SM1 A;  4FS4 A;  4MC2 A;  4RVX A;  4Y3H A;  4PZX A;  1UH8 A;  5P32 A;  2Q63 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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