The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Profilin
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1D1J A; 2JKF A; 5FDS A; 2B95 A; 1CQA A; 1K0K A; 2VK3 A; 1PRQ A; 3CPT B; 2E8J A; 1A0K A; 1VEU B; 1VET B; 3LEQ A; 3T1R A; 5FEG A; 3CPT A; 1CF0 A; 1YPR A; 1VEU A; 2V8F A; 1VET A; 2BTF P; 1SKO A; 3MS6 A; 3T1X A; 2ZL1 B; 5EVE A; 3D9Y A; 4D60 A; 1CJF A; 2JKG A; 1Z09 A; 2V8C A; 5EM0 A; 5EV0 A; 3KYE A; 3MSH A; 2PBD P; 1PNE A; 4FUW A; 3LGO A; 1SZV A; 2HZ5 A; 2ACG A; 1ACF A; 4ESP A; 1PFL A; 3L7H A; 2ZL1 A; 2PRF A; 1AWI A; 4X1L A; 4FTX A; 3U4L P; 1J3W A; 3NUL A; 5EM1 A; 1FIK A; 3T1Q B; 3DAV A; 2PAV P; 1F2K A; 1FIL A; 5FEF A; 1G5U A; 1Y4O A; 1HLU P; 3T1S A; 3L9K A; 4X25 A; 3NEC A; 3T12 B; 3UB5 P; 3CHW P; 1SKO B; 4QWO A; 4X1M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3T4L A; 5CHJ A; 5HW3 A; 3BQA A; 5FDS A; 5TGF A; 4JGR A; 3O87 A; 4R4R A; 2XFT A; 4S2N C; 2JCH A; 4OQ0 A; 3NC8 A; 3A0R A; 2Z2L B; 1DY6 A; 2Y2H A; 3MXR A; 5I5L A; 3EWK A; 5CX7 A; 5GHZ A; 3A3D A; 2W0N A; 4WMC D; 4EEU A; 3HJI A; 3MBZ A; 5HSQ A; 2P9V A; 2J3T C; 2JC7 A; 1SDN A; 4DE3 A; 1RGZ A; 3IF6 B; 5EVL A; 4QJG A; 4GW9 A; 1DP6 A; 3EEH A; 4FH2 A; 1BLH A; 3TW8 A; 4Q0J A; 1ZG4 A; 2R9X A; 3LR4 A; 4LLO B; 5GLA A; 1LI0 A; 5HL6 A; 4HI4 A; 1FCM A; 4K08 A; 3OBF A; 1XXM A; 4Y17 A; 3BRM A; 1NLZ A; 5JYP A; 2ZM8 A; 3H7W B; 4L9G A; 1I2W A; 4JGP A; 3MZF A; 3T1Q B; 4MBH A; 4Q0I A; 1LL8 A; 1L3L A; 1FIL A; 3CIT A; 3EGX C; 2RCX A; 3GMW A; 4BLM A; 1RCJ A; 2W3H A; 2WGW B; 3E98 A; 3ZGA B; 2Y2P A; 1G6A A; 2XF3 A; 3LEZ A; 5A91 A; 4RVA A; 3PBT A; 4DN0 A; 4S2O A; 3T4S A; 2DRW A; 3T12 B; 3HBR A; 2KDK A; 1ES2 A; 1F5M A; 4EEP A; 3DTK A; 2PYP A; 2V0U A; 2O9C A; 1D1J A; 1Q2P A; 1KVM A; 5EOE A; 4LV3 A; 1TS6 A; 2I9V A; 3QP6 A; 1N9L A; 2JKT M; 3HCY A; 4UQI M; 4FH4 A; 5LBR A; 4ETZ A; 3D72 A; 1DJC A; 3VE3 A; 2V1Z A; 1XX2 A; 2W1R A; 5CTM A; 1XA1 A; 3LI8 A; 4O7D A; 3MS6 A; 3Q7Z A; 4RX2 A; 5DF8 A; 3OC2 A; 1NWZ A; 4S2K A; 1IYO A; 4EWF A; 2J3W A; 4H8R A; 2XGN A; 1W7F A; 2Y2N A; 1IKG A; 2V2F F; 1S6R A; 2EX9 A; 2VV8 A; 5FA7 A; 2P08 A; 2WGI A; 5GHX A; 5HAQ A; 1MWR A; 2HGV A; 1SZV A; 1K54 C; 4JXG A; 3KSI A; 4KZ6 A; 2ACG A; 1XKZ A; 1GSX A; 4WEL A; 3GEC A; 4X55 A; 3ZNT A; 1BSG A; 5DJU A; 3L7H A; 2OWH A; 2Y2M A; 2ZL1 A; 4JBF A; 5JYO A; 2IWB A; 1MKI A; 3OPR A; 3HLE A; 3SS3 A; 5CEC A; 3S7P A; 4BL3 A; 4E6X A; 2Y8H A; 2WYX A; 4F94 A; 3G35 A; 5AQB A; 2D02 A; 1WE4 A; 4S2M A; 2QMI A; 2JBF A; 2Z6D A; 4JPM A; 3BJN A; 3P01 A; 3C2W A; 1T1C A; 2WGV A; 3CLO A; 4U3T A; 1P9R A; 1SKF A; 3V5M A; 5EPH A; 2Y79 A; 2VGJ A; 3QHY A; 1G6O A; 3OZH A; 2HDU A; 3N6I A; 4B9O A; 3LCE A; 3N8L A; 4HJ3 A; 5BOH A; 4GNU A; 4K91 A; 1ERO A; 5F82 A; 4BL2 A; 3LYX A; 2EX2 A; 2GDN A; 1IFQ A; 2ZQC A; 4WM9 A; 3DTM A; 2AVX A; 5DVA A; 4HHD A; 5MC7 A; 4FCF A; 1VEU A; 4PM7 A; 2HDR A; 4KZ5 A; 3OPL A; 5C5K A; 2K7S A; 1XGJ A; 2EX6 A; 2P9V B; 1RP5 A; 1I5Q A; 2BAS A; 4D60 A; 3FYZ A; 3BFE A; 4WEJ A; 1FR6 A; 3HUM A; 3HLF A; 3TJZ C; 1H5X A; 1YLP A; 3MMH A; 4XT2 A; 2A24 A; 3E4O A; 3UPO A; 2GNX A; 3HLG A; 3NY4 A; 2PDR A; 1OTA A; 3N8R A; 4S2P A; 4M4X A; 4LV2 A; 4OVD A; 2M7V A; 5GLD A; 2L0W A; 2X02 A; 2Y2O A; 3MFX A; 4LRY C; 2H0Y A; 3W8K A; 1V9Z A; 5EVI C; 4NK3 A; 4R3J A; 2A2L A; 4IUK A; 3MQQ A; 4ZDX A; 2HDS A; 4UA7 A; 1HLU P; 2Q9M A; 3PBR A; 3C30 A; 3L9K A; 5FAO A; 4P85 A; 1S66 L; 1T1B A; 1PI5 A; 3VE4 A; 2C5W B; 3MXS A; 2V1A A; 3I7J A; 1NRJ A; 5F68 A; 4GDN A; 4KZ9 A; 5IT5 A; 1KE0 A; 1T18 A; 2HDQ A; 4XXR A; 3VP2 A; 2O9B A; 3IT9 A; 2IWC A; 1ZC2 A; 5EVI D; 1ZTU A; 4N1H A; 5HWW A; 3B42 A; 3MQO A; 3GSG A; 4S2J A; 4R38 A; 4HJ4 A; 1YMS A; 4NET A; 3B3X A; 1OTB A; 4BEN A; 1DRM A; 4Y0U A; 5EVE A; 1H8Y A; 3D3O A; 2Y91 A; 3F1O A; 3LIA A; 1K55 A; 1IYQ A; 4X6T A; 3IX4 A; 5CRF A; 2J8Y A; 4YWZ A; 3BY9 A; 4CQH A; 1W5D A; 3BQ8 A; 5G4Y A; 4MDZ A; 5TJJ A; 3P98 A; 3UE3 A; 1YMX A; 4E3I A; 3FZC A; 4KZB A; 4E3L A; 4HJ6 A; 1VB6 A; 3IF6 A; 2JKT I; 2Y59 A; 2ZLY A; 4IVK A; 4G3W A; 3HVF A; 3E4Q A; 1H0M A; 3ZG9 B; 1ONH A; 2XH9 A; 5CGW A; 1IKI A; 2Q0O A; 5IU1 A; 4FSF A; 3M2J A; 4HH2 A; 4MBK A; 1LSX A; 1ZG6 A; 2X01 A; 2VA0 A; 3ZCZ A; 4X69 A; 3BY8 A; 4GKU A; 1FR1 A; 3PAG A; 5HD5 A; 3PBO A; 5CGX A; 1IEM A; 1FCN A; 4Z9Q A; 4JF6 A; 5KMW A; 1SHV A; 4IVI A; 2EXB A; 2EXA A; 2WZZ A; 5EVI B; 3LY3 A; 5GLB A; 1VEU B; 1LSV A; 3NOT C; 1NZU A; 3O88 A; 1N9O A; 4N9L A; 5J3W A; 1Y28 A; 3H82 A; 4KG2 A; 5D3O A; 3MF0 A; 2B5R A; 4E3N A; 4QY6 A; 3CWF A; 4NXE A; 1K25 A; 4OP5 A; 2ZD8 A; 4XT2 B; 1FSY A; 3R4K A; 1XFQ A; 3RH8 B; 3M6B A; 1NJ4 A; 3QP5 A; 3PYP A; 3PTE A; 5AVE A; 2PBD P; 2QYB A; 5F69 A; 4I3J A; 3MKF A; 1PWG A; 3ZHH A; 4E3K A; 4C6Y A; 2EFX A; 2W27 A; 1YAX A; 3NJA A; 1ALQ A; 3FKV A; 2NUT C; 2UV0 E; 2ZMV A; 5HAR A; 4MMN A; 4X1L A; 1FCO A; 1J3W A; 1N9B A; 3QP4 A; 4OOM A; 4I38 A; 1BUL A; 1XP4 A; 1F98 A; 5J4E A; 3CUE C; 4R6L A; 3HLW A; 1GCE A; 3W4O A; 4S2N A; 4JF5 A; 1G5U A; 3VOZ A; 5A92 A; 5KZH A; 3IXB A; 1YKD A; 1UWN X; 2PR6 A; 1MXO A; 2XQZ A; 3BEC A; 2WKE A; 1SKO B; 3IX8 A; 4OOL A; 3O3V A; 4QWO A; 3VP0 A; 5FSR A; 3HL9 A; 4HP9 A; 2J9P A; 3CJM A; 3KO6 A; 1YQS A; 1K0K A; 3SH8 A; 1TVF A; 2VK3 A; 4E3M A; 1MC0 A; 4HH3 A; 2PD7 A; 2GX5 A; 3DTE A; 3LFV A; 4DXB A; 4X56 A; 1YM1 A; 3N8S A; 4LEN A; 1G68 A; 4EUV A; 5HDS A; 2B02 A; 1LLB A; 3FPV A; 3UO9 A; 4GLQ A; 5GL9 A; 3KYQ A; 4HQA A; 5AQ9 A; 3W2Z A; 3BFG A; 4EU0 A; 3F1O B; 2UWX A; 1LHY A; 1EW0 A; 4ZBE A; 5DKL A; 4Y5F A; 3EEA A; 1KVL A; 5EM0 A; 4NXG A; 4OKP A; 4EV4 A; 3KYE A; 1K4E A; 1KGE A; 5FQM A; 1XJ4 A; 3CZD A; 3UDX A; 1OTI A; 1KGG A; 4GDB A; 4R1G A; 1RGY A; 2YKH A; 3PAE A; 3IX3 A; 3C4O A; 3G32 A; 1ACF A; 4UHU A; 4XUZ A; 4L9E A; 2VGL M; 3A3J A; 3IWQ A; 5L10 A; 2PAV P; 2OAP 1; 2P7J A; 3LIB A; 4OOY A; 5M1A A; 5AQ7 A; 2H10 A; 4S2L A; 3NBL A; 3VOL A; 3IS2 B; 4RX3 A; 3RXX A; 3OLO A; 2Y2G A; 5DTS A; 3S7Q A; 4WZ5 C; 4X25 A; 4PM8 A; 3NEC A; 1M6K A; 1K38 A; 5DFX A; 5KSC A; 4CLC C; 4PM6 A; 3G31 A; 3NOU C; 2PBY A; 5EUA A; 3GV9 A; 3CI6 A; 2O0Y A; 2PU2 A; 1ES3 A; 2J3T D; 2B95 A; 5CGS A; 3IBR A; 3SH7 A; 4R4S A; 1S4R A; 4I5S A; 4O8G A; 4DJ2 A; 1K54 A; 3VMA A; 1VET A; 3H82 B; 4C3Q A; 1QMF A; 2ZQD A; 3PBQ A; 4OPR A; 3ZVT A; 2NUP C; 2IWD A; 4QU3 A; 4YNR A; 4Y3I A; 2EA9 A; 1TD5 A; 1XJ3 A; 2W3D A; 3R7W B; 1UWP X; 4WYY A; 5CXW A; 1IOU A; 1YLT A; 2L4R A; 2X71 A; 3T4K A; 4M3K A; 1XJ2 A; 1U60 A; 4KQD A; 4YOF A; 5FQI A; 2W3G A; 3S1Y A; 1T19 A; 4WN5 A; 1P0Z A; 1JWP A; 5HWT A; 3W4Q A; 1YT4 A; 2XA7 S; 4R0Q A; 4JXW A; 4IED A; 1JTG A; 3T4O A; 2ZC7 A; 5FAQ A; 3VV4 A; 3TSG A; 4GHI A; 2Z2M B; 3VOY A; 3E0Y A; 5CER A; 1ODV A; 3IWI A; 3LIC A; 4LPZ A; 1XGI A; 2BG1 A; 5E43 A; 5L09 A; 1FSW A; 2VV7 A; 2QJ7 A; 3TE8 A; 3T50 A; 1OME A; 1S67 L; 4I3A A; 4MN6 A; 1GSW A; 2VX8 A; 1PIO A; 2ZQ7 A; 4E04 A; 4OQG A; 1VM1 A; 3IWO A; 3FWL A; 1CEG A; 4Y13 A; 5TBM A; 4DKI A; 4Y2F A; 2BTF P; 2HPB A; 2K31 A; 4NXB A; 5F83 A; 1TDG A; 3NCK A; 3WRT A; 1LSW A; 1JNU A; 1PYY A; 2OOL A; 1ERQ A; 4KUK A; 3FG8 A; 1WA9 A; 5EVI A; 3NI9 A; 5FAP A; 3ZVW A; 4NG2 A; 3MFD A; 4WEK A; 3UPP A; 1YSP A; 2Y2I A; 4KQO A; 2HF6 A; 3LO7 A; 3NDG A; 3F1N B; 3FC7 A; 3RTY A; 3AGE A; 5AVF A; 1ONG A; 4HOI A; 5J7E A; 4X53 A; 2G2W A; 3FKW A; 1YLJ A; 2OV5 A; 3EGD C; 2HP9 A; 1F2K A; 4MNR A; 4I3I A; 1W8Q A; 4GJ4 A; 5EE8 A; 5KIZ A; 4PHT A; 1KGF A; 3JYI A; 1Z6F A; 3S7O A; 1KOU A; 3ITA A; 4PM9 A; 3VSL A; 3RJU A; 1LT0 A; 3A3E A; 5EEC A; 2QZ6 A; 3CHW P; 3KYZ A; 2XFS A; 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3CPT A; 1GHM A; 1CK3 A; 5FI7 A; 3MXQ A; 3F1P A; 3GR2 A; 2I72 A; 4ARZ B; 4HNB A; 5DTT A; 1NLY A; 5HAP A; 3UNW A; 1S1Y A; 2R9W A; 3D9Y A; 2DNS A; 5FDH A; 4EES A; 2JKG A; 4NEE D; 4D2O A; 2HJ9 C; 4H6J A; 3HLC A; 5EV0 A; 3CUE A; 1HTZ A; 5HPI A; 3TOI A; 5J8X A; 3JPU A; 3G30 A; 1LL9 A; 1G28 A; 3NIA A; 1YLW A; 3LGO A; 3LY4 A; 2ZC4 B; 2RL3 A; 3LIE A; 3ITB A; 3UE0 A; 1QME A; 2OAQ 1; 1IYP A; 1XJ6 A; 1NYM A; 2VZW A; 4EQ1 A; 3HLD A; 4BD0 A; 1W63 M; 3OCN A; 1OT6 A; 3UB9 A; 2HP6 A; 1FOF A; 1H8Z A; 3R7W A; 3G34 A; 3QNC A; 4DXC A; 3EQV A; 3IHB A; 2H5S A; 2O99 A; 5L8M A; 5G4Z A; 3ULF A; 2EX8 A; 1NZO A; 1Y4O A; 3BFC A; 1K6S A; 1EI5 A; 4B4X A; 4R3B A; 3UE6 A; 3VP1 A; 1ES4 A; 3UB8 A; 4IBX A; 3HRE A; 4PM5 A; 3D4F A; 3ZQ5 A; 3E2K A; 1OTD A; 2VEA A; 1ZHH B; 4OQI A; 4QPR A; 2D01 A; 4RA7 A; 1BUE A; 1CQA A; 3LR3 A; 3V50 A; 4MLL A; 4DE1 A; 4YIN A; 1HVB A; 2G7U A; 2A3U A; 4I39 A; 4LRX C; 2KX6 A; 3HUN A; 2QPN A; 3IH9 A; 3MZE A; 3UB6 A; 3AGF A; 2V8F A; 3V3S A; 4HIA A; 5E2E A; 2JN7 A; 3QP2 A; 3UY6 A; 3ISG A; 1M40 A; 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