The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| molecule tags |
Allergen
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| molecule keywords |
Profilin
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ACG A; 3MSH A; 2B95 A; 3T1S A; 3NEC A; 1FIK A; 2VK3 A; 2PRF A; 1VEU A; 3T1R A; 2ZL1 B; 2HZ5 A; 3UB5 P; 2PBD P; 3KYE A; 5EV0 A; 4QWO A; 1SZV A; 4D60 A; 1PNE A; 1Y4O A; 2BTF P; 1CJF A; 1HLU P; 3L7H A; 2ZL1 A; 3NUL A; 3T12 B; 2PAV P; 3T1Q B; 1K0K A; 3U4L P; 2JKF A; 5FEG A; 1VET B; 3CPT B; 4FTX A; 2V8F A; 1Z09 A; 5EM1 A; 3T1X A; 4FUW A; 4X25 A; 1CF0 A; 1CQA A; 1F2K A; 1PRQ A; 3LGO A; 4X1M A; 5EVE A; 3MS6 A; 1VET A; 3CPT A; 1SKO B; 1PFL A; 1ACF A; 4X1L A; 1D1J A; 3LEQ A; 5EM0 A; 5FDS A; 2V8C A; 2JKG A; 1YPR A; 1AWI A; 2E8J A; 1FIL A; 1A0K A; 3CHW P; 5FEF A; 4ESP A; 3DAV A; 1VEU B; 1G5U A; 3D9Y A; 1SKO A; 1J3W A; 3L9K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VP0 A; 4KZB A; 3C38 A; 1X0O A; 3LY3 A; 3UB6 A; 3HBR A; 1S4S A; 4RYE A; 1NWZ A; 2OSU A; 3Q1F A; 1MXO A; 2JKR M; 2KX6 A; 2ZBB A; 1W63 M; 4GB7 A; 3IX8 A; 2VA0 A; 3V67 A; 1BLC A; 2Q9N A; 5DTK A; 5HWT A; 3W4P A; 4WEJ A; 1CI9 A; 5M18 A; 4WUJ A; 1H8Z A; 1RP5 A; 3MFX A; 4WLA A; 2ZL1 B; 1PW1 A; 1L0F A; 1ZG6 A; 3TOI A; 2CMN A; 5HAP A; 1LHY A; 2QJ7 A; 5DKK A; 3A3F A; 3GTC A; 4R3A A; 2PD7 A; 2O9A A; 3CG5 A; 1ESU A; 3KYZ A; 1K56 A; 4MBH A; 2Y2H A; 1VEU A; 1K4E A; 1UWN X; 3E2K A; 2FFF B; 1BUL A; 2UV0 E; 1I2W A; 1K55 A; 1SDE A; 4GDN A; 5DF7 A; 3SH7 A; 3HLD A; 5FAT A; 2PHY A; 5F69 A; 2WAD A; 1IYS A; 1P0Z A; 4IUK A; 5AQA A; 1G5U A; 1SKO A; 2A3U A; 4ARZ B; 3PBT A; 4FCF A; 4WM9 A; 4WEK A; 3ZG9 B; 2WYX A; 4BBV A; 3T4K A; 4ZBE A; 3WS5 A; 3GVB A; 3VOY A; 2Z6C A; 1IFQ A; 5GHX A; 3VFF A; 2FZ0 A; 3IT9 A; 4QU3 A; 1YLP A; 3QNB A; 4OOY A; 3WS0 A; 3HVF A; 4N1H A; 2UWX A; 4E6W A; 3TG9 A; 2ZL1 A; 3ZG8 B; 4QJG A; 4LEN A; 1MWT A; 3N8L A; 3BYD A; 3BLS A; 3AGD A; 3PBN A; 3SW1 A; 1XA7 A; 2ZQD A; 4WZ5 A; 3L9K A; 4U3T A; 5CGX A; 4NKP A; 1HVB A; 5KSC A; 3P09 A; 4PAU A; 5HD5 A; 3MZF A; 4DJ3 A; 1EW0 A; 5FI7 A; 3C5A A; 3ISG A; 1PFL A; 4S2O A; 3CAX A; 3N8S A; 4XT2 A; 2PD8 A; 2GX5 A; 3WS4 A; 1WYC A; 1PWC A; 5HWW A; 3MF0 A; 1Y4O A; 4OVD A; 2RL3 A; 2XFS A; 5FQJ A; 2XR0 A; 3SS5 A; 5EOE A; 4BEN A; 1MWR A; 4JXG A; 3RFB A; 1OTI A; 2PR5 A; 4DXB A; 2VGL M; 5TJJ A; 1FQG A; 2PBD P; 4II7 A; 4B9O A; 5CTM A; 4UA6 A; 2QWS A; 4FH4 A; 3O87 A; 5D3O A; 4EES A; 3G6O A; 2Z2M B; 5EPH A; 2HP6 A; 1SKO B; 4O01 A; 3MKE A; 4ARZ A; 1NY0 A; 3N4I A; 1FCN A; 1SKF A; 1YSP A; 4PM8 A; 1KVM A; 2L0W A; 1BUE A; 3BEC A; 4RQ9 A; 5KSH A; 3F1N B; 1NRF A; 3O86 A; 4I5S A; 1W8Q A; 1SDN A; 1G28 A; 4Y0U A; 3N8R A; 5FDH A; 3BJN A; 4BBU A; 5TFQ A; 3B47 A; 1JWZ A; 1S0W A; 4IUH A; 2H5S A; 4UAA A; 3S22 A; 4YIN A; 5HAQ A; 4HH3 A; 4CLC B; 5JYP A; 4OKP A; 3H7W A; 3HUN A; 4OQG A; 3T4S A; 3FV7 A; 1MWU A; 4KG5 A; 3IXD A; 1YMX A; 3TE8 A; 4P87 A; 3BLM A; 1OJ5 A; 2I72 A; 2KLI A; 3C7V A; 4C6Y A; 3PHY A; 5IHV A; 4IHQ A; 1PIO A; 3ULF A; 4BL3 A; 1MC0 A; 2HZ5 A; 3LYX A; 4IVI A; 4YWZ A; 3UB5 P; 1ODV A; 4F3L B; 1MBL A; 2Y2G A; 2JN7 A; 4GCZ A; 4LRZ E; 1PYY A; 3UDI A; 1IYQ A; 2HDR A; 3V3S A; 2V8C A; 2VV7 A; 2C6W B; 3WRT A; 4EXO A; 4RX2 A; 2ZMA A; 3ZVT A; 3PBQ A; 4HI4 A; 1C3B A; 1BZA A; 3LIE A; 3SZT A; 3G4P A; 3SS3 A; 4MBF A; 4PM6 A; 3O88 A; 5A90 A; 5FEG A; 1MWS A; 5EVL A; 2JKF A; 1ES2 A; 3CUE A; 1GHP A; 1PRQ A; 4S2P A; 1VET A; 5HL6 A; 1S1Y A; 4R6L A; 3F1N A; 1DRM A; 3NC8 A; 4K08 A; 3LCE A; 4GZB A; 4XUZ A; 5CER A; 1M6K A; 4X55 A; 5DF8 A; 5A93 A; 1OTB A; 3IH8 A; 3ZDJ A; 1TDG A; 1Y54 A; 1CQA A; 3BFD A; 1E3U A; 3BW6 A; 1GCE A; 3T4O A; 4NXE A; 3BFG A; 3GV9 A; 1TF1 A; 2H10 A; 1K4F A; 4UQI S; 1FOF A; 4N9L A; 3F1O A; 3BFE A; 2P9V B; 2ZQ8 A; 3PTE A; 4JGP A; 2VGK A; 1ES3 A; 1JVJ A; 3B33 A; 1HLU P; 2LB5 A; 4ZTK A; 3SH8 A; 3T1Q B; 4F3L A; 3ZNY A; 3Q7V B; 1P97 A; 3NJA A; 1GHI A; 3PR6 A; 4P6Z M; 1N9B A; 2E8I A; 3A0S A; 5F1G A; 5CEB A; 3PBR A; 2JE5 A; 3HL9 A; 2DMW A; 3C4O A; 2JKT I; 2ZD8 A; 3H9W A; 3NBL A; 1S66 L; 2P08 A; 3TJZ C; 5EVE A; 2OV5 A; 4JGQ A; 5GL9 A; 3K2N A; 4KG6 A; 5E2E A; 1GSX A; 1AWI A; 4WMC D; 4LFU A; 1T1A A; 2R78 A; 1S4R A; 2Y59 A; 5F68 A; 4E3K A; 5FSR A; 1EWZ A; 1JTG A; 2Y2K A; 5HPI A; 2HDQ A; 5DTS A; 5EM0 A; 1D7E A; 1FIL A; 5IU1 A; 2QKP A; 1O07 A; 2B5R A; 1IEL A; 5GLB A; 4ZJ3 A; 3T4J A; 1IYP A; 2ZC3 B; 4QWO A; 2XA7 S; 4PKY G; 4HP4 A; 3DTI A; 1XJ6 A; 3G2Y A; 3RJU A; 3TRC A; 3QP1 A; 3OPL A; 4E3I A; 2EWW A; 3CJM A; 1FIK A; 1ZTU A; 2OWJ A; 3LID A; 3GDI A; 2ZQ7 A; 3OZH A; 4EET B; 3IXH A; 4P85 A; 5GLD A; 5DFX A; 1L0G A; 4LLO B; 4S2K A; 2WZX A; 4Q0H A; 1K57 C; 1KDS A; 3FWL A; 2P9V A; 1VEU B; 2J80 A; 3ZGA B; 3N6I A; 3VFH A; 3ZVW A; 3IXB A; 4R3B A; 2ZC7 A; 4PPR A; 4IED A; 3UPN A; 4MN6 A; 1CEF A; 5I5L A; 1JTD A; 1XFN A; 3KSF A; 1H5X A; 3OLO A; 2W3G A; 3HJI A; 3ZG5 A; 5FQM A; 4R4R A; 5A92 A; 4DE2 A; 1S6R A; 2A24 A; 2VGJ A; 2Y2J A; 3JVU A; 5HPF A; 1PZO A; 3EQU A; 4WZ5 C; 4DRT A; 2WK0 A; 3RH8 B; 3R7W B; 3G35 A; 3CPT B; 1LI0 A; 4Y17 A; 3MZE A; 5FI2 A; 3E4Q A; 4E6X A; 4GNU A; 2VX8 A; 5GLC A; 1E4D A; 4X68 A; 3IBR A; 4E3L A; 3NIA A; 3MR0 A; 2QYB A; 1ES5 A; 4IBR A; 4XUX A; 3DBA A; 4OLG A; 2XRO A; 1LSW A; 4XXR A; 1VB6 A; 2X02 A; 1XGJ A; 1ESI A; 3SS4 A; 3RXX A; 3VP2 A; 1NRJ A; 4FTX A; 4I3J A; 5CXW A; 1DJA A; 4CLC A; 2PDR A; 4OQI A; 2V9A A; 4KUK A; 3A3J A; 2VK3 A; 4O8G A; 3MXR A; 3UDF A; 2PU2 A; 4AFI A; 4EUZ A; 4GN2 A; 3GR2 A; 3CZD A; 4FOF A; 4X1M A; 1I2S A; 2HJE A; 2XRN A; 2GDN A; 3LY4 A; 4RVA A; 4R70 A; 4Y3I A; 2EX9 A; 1PI5 A; 4GS9 B; 3KX0 X; 1F98 A; 3C2W A; 3UE0 A; 3LEZ A; 3G31 A; 1Z09 A; 4S2L A; 1K6R A; 1DP6 A; 5J3W A; 2B18 A; 2J9O A; 2BLS A; 3CPT A; 3OOV A; 4X6T A; 1L3L A; 4Y13 A; 2ZM2 A; 5CX7 A; 1HZO A; 2PR6 A; 1G6O A; 1BLS A; 3FYZ A; 2JC7 A; 1CI8 A; 2ACG A; 1N4O A; 3PBS A; 3UB9 A; 3ITA A; 2IA2 A; 4B4Z A; 4YOF A; 2O9C A; 5KZH A; 3EEH A; 4D60 A; 2BTF P; 3PAE A; 1GA9 A; 2C5W B; 4Y0O A; 5CGW A; 1H3Q A; 2Y4A A; 1W7F A; 3UY6 A; 3LFV A; 5FAQ A; 1KGG A; 1OME A; 4MCW A; 2Y55 A; 3E4O A; 4JXW A; 5G4Y A; 3A0R A; 1OTE A; 1WYB A; 5G4Z A; 4MBK A; 3BQ8 A; 3UE3 A; 3KYE A; 4BBT A; 4L9E A; 2IWC A; 1LSX A; 3VSL A; 1Y28 A; 4ZDX A; 3OPH A; 2HF6 A; 2MJ6 A; 4WN5 A; 4R1G A; 1KGF A; 4JLF A; 3G30 A; 5EVI D; 1N9L A; 1TD5 A; 1YPR A; 3PXP A; 3BY9 A; 4P6Z S; 3S4X A; 2J3T D; 1G6A A; 2V1Z A; 2WKR A; 4U0X A; 4IBX A; 4OON A; 3C7U A; 4R0Q A; 3Q7Z A; 5M19 A; 2KDK A; 2W3H A; 3T1X A; 3DTM A; 4N9K A; 3WWX A; 1FCO A; 1ERO A; 2GZA A; 1UGU A; 5EFW A; 2EFX A; 3IWQ A; 2OOL A; 5E43 A; 2JBF A; 3QP2 A; 1KE0 A; 4JBF A; 4OOM A; 1LL8 A; 3UMD A; 2OAP 1; 3FG8 A; 4GW9 A; 1PW8 A; 2Y91 A; 2Y2P A; 4EWF A; 3BFF A; 5F6A A; 1YQS A; 3VOZ A; 1VQQ A; 1CF0 A; 3OBF A; 1KDW A; 3OCL A; 4I38 A; 4EEP A; 2J9P A; 2O9B A; 1EI5 A; 3CMZ A; 4I3I A; 1NJ4 A; 3VSK A; 2ZM8 A; 3P01 A; 4DDS A; 4CLC E; 3BFC A; 3F1P B; 1Q2P A; 5E2G A; 2X01 A; 1SZV A; 4LRX C; 5FQQ A; 1ZC2 A; 1VET B; 4L9F A; 4OPY A; 1K54 C; 5TBM B; 4GOG A; 1ERQ A; 5L8M A; 1K6S A; 4WL9 A; 1QME A; 2E8J A; 2XQZ A; 1ALQ A; 1VHM A; 3M2K A; 4JXV A; 2OAQ 1; 1P9W A; 5AVE A; 3Q81 A; 4NXB A; 3MZD A; 3VE4 A; 3VE3 A; 2XD1 A; 4BMW A; 3M6B A; 1F9I A; 3E4P A; 2EX6 A; 5HZH A; 2O99 A; 3FPV A; 4KZA A; 2Y2I A; 3NOT C; 3EGX C; 2V0U A; 4U0T A; 5HAI A; 3LEQ A; 5GLA A; 5E2F A; 2Y2M A; 4GKU A; 3IX3 A; 4RX3 A; 3DWK A; 3D9Y A; 2B95 A; 2X71 A; 1LT0 A; 4PM5 A; 4H6J B; 1K38 A; 3E98 A; 3NUL A; 4QB8 A; 1KVL A; 3LUQ A; 1F2K A; 1E25 A; 3UB7 A; 1KE4 A; 5DJT A; 4NG2 A; 2JKG A; 4KZ9 A; 4K0W A; 1A0K A; 3CHW P; 3IF6 B; 4D2O A; 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1GSV A; 2VLG A; 4GD8 A; 2Y8H A; 4LV3 A; 3U4L P; 1SHV A; 4B4X A; 1MPL A; 1IEM A; 4X25 A; 4KZ4 A; 4G3W A; 1XJ4 A; 1RGY A; 2BG1 A; 4R3J A; 4KG2 A; 3B3X A; 2XH9 A; 5J7E A; 2ZC5 B; 1JWV A; 3MXS A; 3MQO A; 4YNR A; 1BLP A; 3BRM A; 4DE3 A; 5HAR A; 3UE1 A; 4OP5 A; 4DJ2 A; 1I5Q A; 2W1T A; 3MXQ A; 3E0Y A; 2M7U A; 2NUT C; 3CI6 A; 1T1B A; 5E2H A; 5CHJ A; 1K56 D; 2XK1 A; 3M2J A; 3C8C A; 4X56 A; 5A91 A; 1DP9 A; 2WGW B; 1K0K A; 3A3I A; 1YLY A; 1NYM A; 3UPO A; 2OLU A; 3T4L A; 1PZP A; 2A49 A; 4X1L A; 1D1J A; 5F1F A; 2YKF A; 2JKT M; 1BYW A; 2NUP C; 1MKI A; 4LV1 A; 3IF6 C; 5HDD A; 1XJ2 A; 4DXC A; 4HHD A; 2FH5 A; 3IWO A; 3KO6 A; 4PM9 A; 3SH9 A; 3V50 A; 4KZ8 A; 3TW8 A; 4CQH A; 4XT2 B; 2WKE A; 1YM1 A; 3P98 A; 5HW3 A; 5HSQ A; 2WKP A; 2W3E A; 3MQQ A; 1IYO A; 2FFY A; 1J3W A; 4YFM A; 4H8R A; 4UA7 A; 3HRE A; 3IQA A; 3GEC A; 5CGS A; 4E04 A; 4G3V A; 2G7U A; 2WAE A; 3CLO A; 1NXY A; 2WZZ A; 4PMA A; 5TBM A; 1T1C A; 5FEF A; 3B42 A; 3VV4 A; 2VJW A; 4JF6 A; 2PT7 A; 5C5K A; 1NLY A; 3CWF A; 3IHA A; 2CC1 A; 4IJG A; 2J3W A; 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