The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
b'SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Profilin
|
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| molecule tags |
Allergen
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3U4L P; 1YPR A; 1VEU B; 2PBD P; 1Z09 A; 1K0K A; 2JKG A; 3NUL A; 3LEQ A; 5EM1 A; 1VET B; 4X25 A; 1AWI A; 2ACG A; 1FIK A; 1CF0 A; 4ESP A; 3CPT B; 4D60 A; 1PRQ A; 3DAV A; 3D9Y A; 4X1M A; 1F2K A; 3CHW P; 1PFL A; 1Y4O A; 3T12 B; 3L7H A; 2ZL1 B; 1A0K A; 4FTX A; 1HLU P; 1SZV A; 1PNE A; 2JKF A; 1CQA A; 2V8C A; 1ACF A; 3CPT A; 5EM0 A; 2HZ5 A; 5FEF A; 2V8F A; 1VEU A; 5FEG A; 3T1R A; 1CJF A; 1VET A; 1SKO B; 4X1L A; 2PAV P; 1FIL A; 2PRF A; 2B95 A; 1D1J A; 3T1Q B; 3MSH A; 1J3W A; 3L9K A; 3NEC A; 2E8J A; 5EVE A; 4QWO A; 5FDS A; 3T1S A; 3LGO A; 3T1X A; 2ZL1 A; 3KYE A; 2BTF P; 3UB5 P; 3MS6 A; 5EV0 A; 1G5U A; 1SKO A; 2VK3 A; 4FUW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E4D A; 2VGL S; 3A0V A; 5EM1 A; 3BY9 A; 1UWP X; 3GEC A; 3MXQ A; 1RGY A; 1XFQ A; 2XD1 A; 3CPT B; 3SOI A; 3OZH A; 4XUZ A; 1J9M A; 4F94 A; 3MBZ A; 5FQQ A; 1PFL A; 1YLZ A; 2PD7 A; 3OPH A; 2P9V B; 5AVF A; 2ZL1 B; 2JKF A; 5CER A; 4EBP A; 1PZP A; 4ETZ A; 5DFY A; 4B4X A; 4A5R A; 5DTS A; 5GLB A; 1L3L A; 4E3M A; 1XA1 A; 1TS8 A; 5DTT A; 3BFC A; 4GHI B; 4EEU A; 4KG5 A; 2HZ5 A; 1LHY A; 3UE0 A; 5E2E A; 5BOH A; 5EOE A; 2RCX A; 3B47 A; 5FI2 A; 4PKY G; 1JTG A; 1PZO A; 2M7V A; 2WYX A; 3FV7 A; 5CTN A; 3JVU A; 3IF5 A; 3VOZ A; 5HPF A; 2O9A A; 1ERM A; 2HPB A; 2EX2 A; 3S7O A; 1Q2P A; 2R78 A; 2IA2 A; 2C5W B; 4LGW A; 1K25 A; 2ZQD A; 1NYY A; 5J7E A; 3NEC A; 4Y0O A; 3CIT A; 5FDH A; 5EVE A; 5DF8 A; 3GSG A; 5I94 A; 3N6I A; 2WKI A; 4S2N A; 2ZM8 A; 4JF5 A; 1SKF A; 4EUZ A; 4S2I A; 4EW7 A; 3ICY A; 4FH4 A; 4JGQ A; 3T50 A; 4KZ8 A; 3T4Q A; 5KZH A; 3BY8 A; 2O0Y A; 4RX2 A; 2YKF A; 2Y2H A; 5JYO A; 4FUW A; 3F1O A; 5FAO A; 3HLC A; 4P85 A; 5GHZ A; 5KIZ A; 3QP8 A; 3RXW A; 5FI6 A; 4EET B; 1IKG A; 4E6W A; 2KDK A; 4KEN B; 1T1A A; 2X02 A; 4ESP A; 3FZC A; 3ZG0 A; 1OT9 A; 2IWD A; 5CGW A; 2EFX A; 3G30 A; 4I3A A; 1XJ2 A; 4MEZ A; 5FQ9 A; 1G28 A; 4LV2 A; 1Y28 A; 5F1G A; 4HJ3 A; 1XJ4 A; 5HAR A; 5HSQ A; 4Z1W A; 5G4Y A; 4EES A; 4NXF A; 3G4P A; 1K54 A; 3EOI A; 3FG8 A; 1S6R A; 1ZG6 A; 2HP5 A; 3A3D A; 1MWS A; 4LEN A; 3OCN A; 5FI7 A; 4PKY A; 2WGI A; 2LB9 A; 4JPM A; 4WEJ A; 5K5B A; 1VEU A; 4BBV A; 1L2S A; 3VP4 A; 4E3L A; 3RH8 B; 1O7E A; 5E2G A; 4LCM A; 4I39 A; 1W8Y A; 1ES3 A; 2R9X A; 4R70 A; 3RXX A; 3MQ0 A; 4R38 A; 5DFX A; 2BG1 A; 2VGK A; 2E8I A; 3KYE A; 3GRJ A; 2WGV A; 5F1F A; 3LI8 A; 4BEN A; 2J80 A; 5DTK A; 4OOY A; 1W8Q A; 2P7J A; 3C8C A; 2FZ0 A; 5CGS A; 1V9Y A; 3UB9 A; 4EU0 A; 4RYE A; 2D02 A; 4ZTK A; 4GW9 A; 3AGD A; 1H8Z A; 3FKV A; 4LV0 A; 3VV4 A; 4GDB A; 4JKT A; 2HP6 A; 4ME4 A; 3P98 A; 4ID4 A; 1YMX A; 2A2L A; 3NHQ A; 3ZNY A; 3H82 A; 1IEL A; 1GSX A; 4PM5 A; 1I2W A; 2QPN A; 1T18 A; 4H6J A; 1YLW A; 4WMC D; 3A3F A; 1YSP A; 4PAU A; 1BUL A; 4P87 A; 4DF6 A; 2ZMA A; 3BEB A; 3PBQ A; 4Y2F A; 1E3U D; 5L8M A; 5HPI A; 4KZ6 A; 1OTB A; 4MCW A; 3RJU A; 1KE4 A; 3LCE A; 2HDU A; 3BFE A; 2EXB A; 3DTK A; 2I72 A; 1XJ6 A; 1H8Y A; 4MLL A; 2KX6 A; 3TRC A; 4WZ5 C; 5L09 A; 1ESU A; 3IQA A; 3NIA A; 1FCO A; 3S4X A; 4G3W A; 2W1T B; 5GLA A; 1BLP A; 3EGX C; 2VGJ A; 4OH0 A; 2W27 A; 5DF7 A; 3AGF A; 1GHM A; 2HV1 A; 1GA0 A; 3G34 A; 3UB8 A; 4PMA A; 2JKR I; 1AXB A; 5A92 A; 5KSC A; 3DWK A; 1ES4 A; 5FDS A; 3UO9 A; 1LI0 A; 2WKH A; 1XXM A; 2P9V A; 5HZH A; 1ERO A; 3WS5 A; 2ZL1 A; 3GDI A; 4EWF A; 4U0T A; 1G6A A; 4P6B A; 2NUT C; 5A8B A; 4P0M A; 4OPZ A; 2FFY A; 4BD1 A; 5EOO A; 1DP6 A; 4HHD A; 1KGG A; 2KOI A; 4GHI A; 1FQG A; 1VET B; 3LR5 A; 1DJC A; 1MBL A; 1SDE A; 3HVF A; 2ZMV A; 4OQ0 A; 5FL3 A; 3PHY A; 3Q7V B; 3TE8 A; 4N9K A; 2HDS A; 1N4O A; 2IWC A; 3T4J A; 2VKS A; 5EVI D; 2FFF B; 3NOU C; 3T4T A; 4EUV A; 1A0K A; 3SH7 A; 4U3T A; 4Y3I A; 4GD6 A; 4K91 A; 3NDG A; 3BWL A; 4OLD A; 1K4E A; 3UDI A; 5M19 A; 1W79 A; 2L1M A; 3CLO A; 4WUJ A; 2VJW A; 5CGX A; 3W4Q A; 2JN7 A; 2Z6D A; 4NEE D; 4GCZ A; 2W3E A; 3PYP A; 2Y2K A; 4KZB A; 3TJZ C; 4HJ6 A; 1CJF A; 4ZJ2 A; 4UAA A; 1MZU A; 1JVJ A; 4ARZ A; 3QP1 A; 4UA7 A; 3IWI A; 3HLB A; 4OON A; 4PM7 A; 5HDS A; 1BT5 A; 5EVI A; 1ZHH B; 1G6O A; 4WM9 A; 3A0S A; 3OOV A; 5DJT A; 3OCL A; 5FQM A; 2WKR A; 3V5M A; 4B4Z A; 1SDN A; 1CI8 A; 4E3O A; 4L9E A; 4QPR A; 4PHT A; 5M18 A; 1FR6 A; 4N92 A; 2GDN A; 1GHP A; 1K38 A; 3IH8 A; 3WS2 A; 2B5R A; 3HRE A; 2W3D A; 3IXB A; 4GS9 B; 1AWI A; 3MZE A; 5AJG A; 3W8K A; 3DTI A; 3MMH A; 4YOF A; 3VFH A; 3VMA A; 3S1Y A; 4Z9Q A; 3S7P A; 1NLZ A; 4KG6 A; 3NOT C; 2DMW A; 3SZT A; 5HAP A; 4E04 A; 2R9W A; 3A0R A; 2PYP A; 1XFN A; 3FC7 A; 3TG9 A; 5FQJ A; 1PNE A; 3IX8 A; 5GLD A; 4CLC B; 3LR4 A; 5CEC A; 1NZO A; 2ZC3 B; 4JBF A; 2PYR A; 4LLO B; 3WRZ A; 1GCE A; 3M6B A; 4I38 A; 3V3R A; 3N4I A; 1GA9 A; 5HAQ A; 2Z6C A; 2XR0 A; 4E3N A; 2Z2L B; 3ZG8 B; 2OLV A; 4RA7 A; 3P09 A; 5F83 A; 3E4Q A; 1UGU A; 3UB6 A; 5DKK A; 3PBS A; 2WZX A; 2JKR M; 5IHV A; 3IF6 B; 3DBA A; 3O88 A; 2Q9M A; 5EUA A; 1OJ5 A; 1OTI A; 1F9I A; 3T1X A; 3HCY A; 3UPN A; 1IYQ A; 3Q1F A; 1TDG A; 3IXG A; 4E3I A; 1ZC2 A; 3DW0 A; 2Y2J A; 4UHU A; 4QHC A; 3LEQ A; 4LCL A; 1L0G A; 4S2N C; 2J9O A; 2PU2 A; 1TS0 A; 5EFW A; 1O07 A; 4D60 A; 5GL9 A; 5GHY A; 2L4R A; 5AQ7 A; 3WRT A; 4KZ9 A; 1NZU A; 2UV0 E; 2W1T A; 1FSW A; 3G2Z A; 4HP9 A; 3K3C A; 3ZVT A; 5TR7 A; 1RCJ A; 3BRM A; 1CQA A; 3TSG A; 1ZKJ A; 2OWJ A; 4X69 A; 3OBF A; 3SH9 A; 1MC0 A; 3W4O A; 4WF0 A; 4XT2 A; 3E2K A; 1IYO A; 2MJ6 A; 2OAP 1; 1VHM A; 4LFU A; 3BQA A; 3NBL A; 3CUE A; 2Y2P A; 3WWX A; 1IFQ A; 3PBN A; 4KZA A; 1PI5 A; 5AQA A; 3F1N B; 1K54 C; 3GQZ A; 3EGD C; 1VET A; 1JWV A; 2EX6 A; 2PR5 A; 4KUK A; 5EVL A; 3Q07 A; 5F82 A; 3Q7V A; 3B42 A; 5F6A A; 2WK0 A; 1OME A; 4OPR A; 1H3Q A; 3HLE A; 5CXW A; 4UQI S; 1WYC A; 4WYY A; 3LO7 A; 3IS2 B; 3R4K A; 2WZZ A; 1MWR A; 1MPL A; 4Y13 A; 1LI9 A; 3HUO A; 3GVB A; 1DRM A; 4HOI A; 4OPQ A; 4ZRR A; 3HLW A; 5EV0 A; 2GNX A; 1DJB A; 3C4O A; 1LLB A; 2VK3 A; 3IBJ A; 2ZC7 A; 4JF6 A; 3E4P A; 3PBT A; 3O87 A; 3F1P B; 3OC2 A; 3SH8 A; 1TS7 A; 1FIK A; 3KX0 X; 1PRQ A; 1YSQ A; 2JCH A; 3D9Y A; 1ODV A; 3MKF A; 3UPP A; 1F2K A; 4HEF A; 5HD3 A; 5HWW A; 4NXE A; 3ZQ5 A; 3TW8 A; 1CEF A; 4QJG A; 4UEY A; 4CLC D; 5DJU A; 3M6H A; 4I3I A; 4ARZ B; 2V2F F; 3PBR A; 4UA6 A; 2Y2O A; 4IVI A; 4Q0J A; 1XPB A; 4M3K A; 5EVI B; 4NXG A; 2G2U A; 3SW1 A; 4ZBE A; 3LEZ A; 1ZTU A; 4WLA A; 2VV7 A; 4KZ5 A; 1K56 D; 1CK3 A; 2Y79 A; 2HF6 A; 2OAQ 1; 2PU4 A; 2V20 A; 3LR3 A; 3KSG A; 2X01 A; 2WKP A; 5FAS A; 2J3T D; 4FD8 A; 2XD5 A; 4GS9 A; 2AVX A; 3NOP C; 2ZBB A; 1DP9 A; 2QJ5 A; 1S4S A; 2ZJ9 A; 3RFB A; 5FQI A; 3MSH A; 1JNU A; 1LL8 A; 2IWB A; 4HNB A; 4BJP A; 4EXO A; 1NYM A; 2OSU A; 5TFQ A; 1STZ A; 1NRF A; 3T1S A; 1ALQ A; 2EX9 A; 3WS4 A; 3Q7Z A; 2XF3 A; 3IX4 A; 3S7N A; 4CLC A; 1YT4 A; 5HL1 A; 1TF1 A; 3ULF A; 3MS6 A; 4OQG A; 1K6S A; 5FSR A; 3V67 A; 3LY4 A; 1N9B A; 3LY3 A; 4EQI A; 4ZDX A; 3HLG A; 5L2F A; 1Q2Q A; 5G18 A; 1WYB A; 2BLS A; 2ZQ7 A; 2HGV A; 2OLU A; 2K7S A; 3ZG7 B; 2XA7 M; 2P08 A; 4LRZ E; 4GB7 A; 3MXR A; 4RQ9 A; 1VB6 A; 4X1M A; 4S2P A; 5DF9 A; 1Z6F A; 1T1B A; 4N1X A; 2PD8 A; 3QP6 A; 2Y55 A; 3OPL A; 4DJ2 A; 2W0N A; 4DXB A; 2PR6 A; 1OPX A; 1OJG A; 5HFO A; 3NI9 A; 2J9P A; 4WEL A; 3IF6 A; 3MFX A; 3MKE A; 3GR2 A; 2V1Z A; 3S7Q A; 4KQO A; 2XRO A; 1PWG A; 2EWV A; 5KMW A; 4DE2 A; 1U60 A; 4HI4 A; 3BQ8 A; 5HX9 A; 3EWK A; 2WAD A; 3O3V A; 4MMN A; 4EBN A; 3ITA A; 1TS6 A; 1N9O A; 3B33 A; 1NXY A; 3IX3 A; 4CLC E; 3UY6 A; 1CEG A; 4P6Z S; 2ZD8 A; 3OLO A; 5I5L A; 1BZA A; 1KGE A; 5EEC A; 4N1H A; 1KE3 A; 2A24 B; 5HAI A; 3E4O A; 4NK3 A; 1KVL A; 4MN7 A; 3C7U A; 2E8J A; 2V0W A; 2XGN A; 1K55 C; 4DDY A; 4MDZ A; 1L0D A; 3UB5 P; 5FA7 A; 5CHJ A; 4O01 A; 5CHM A; 5EVI C; 2Q0O A; 2HJ9 C; 2Y2L A; 1LT0 A; 4G3K A; 3JPU A; 4E3J A; 4WN5 A; 4H8R A; 5AQB A; 3HJK A; 2V9A A; 2WAE A; 5E2H A; 4XT2 B; 3LFV A; 1D7E A; 4WMC A; 2M1C A; 4JGR A; 4C6Y A; 4JF4 A; 4EBL A; 3LI9 A; 2JE5 A; 3UME A; 3F1N A; 5HDD A; 5C5K A; 3P01 A; 5F68 A; 1E3U A; 1RGZ A; 2EX8 A; 2ZC6 B; 3IH9 A; 4DN0 A; 1H8M A; 3SS3 A; 5EPH A; 4GJ4 A; 3VOL A; 4KQR A; 3T4K A; 1HLU P; 4R23 A; 3V39 A; 3FWL A; 1BLH A; 1W63 Q; 1NJ4 A; 2QMI A; 1CI9 A; 2INW A; 2ZMF A; 4KUO A; 2ZQC A; 3ZFZ A; 2ZLY A; 3KYQ A; 3IS2 A; 3V3S A; 3PAG A; 3VE3 A; 1F98 A; 1NLY A; 4EER A; 5A91 A; 3SS5 A; 4BL2 A; 3Q82 A; 1YKD A; 2O9B A; 3W2Z A; 4QU3 A; 3F1P A; 4FSF A; 1K57 C; 3CI6 A; 3IT9 A; 4R3B A; 4OVD A; 1M40 A; 4R3A A; 3VOY A; 3T4L A; 3T1Q B; 3L9K A; 1PW8 A; 2XSS A; 2ZM2 A; 3LGO A; 4Y17 A; 5D3O A; 4IBX A; 5J3W A; 4KQQ A; 1K55 A; 3ZNT A; 3VP1 A; 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