5EX5A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-adp and inorganic phosphate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ex5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ex5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ex5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ex5A04
3ZX2A 2W41A 3WUHA 3JS6A 1LCUA 4CZKA 5AZIA 2KHOA 4FO0A 5EVZA 5AQPA 3SLCA 1BDGA 1ATRA 1ZBSA 4H0PA 2NLXA 1C0GA 3BF1A 4B1VA 4H5NA 3H1QA 5AQUA 1H1VA 3DAWA 3WQUA 3WXIA 2E88A 1MDUB 1TYQA 3WXKA 4JN4A 1NGHA 2V7ZA 3IDHA 3P4IA 4JHDB 4BRDA 2P9NA 4BRLA 5BPLA 3MN7A 3UKUB 2GELA 3VF2A 1NGFA 1K8KA 5B8HA 5LY3A 4B1YB 3J8AA 1EQYA 2YI1A 2BTFA 4BGBA 1IJJA 5AQYA 4BRIA 4A61A 4H5WA 2CH6A 2ZF5O 4BC4A 4BG9A 4LC9B 2E8AA 5BPNA 4FPAA 1V4SA 4BG8A 3GBTA 3ULEB 4PKHA 4FWMA 4O5FA 4JD2A 3A0IX 2P9LB 5EOYA 1Z05A 4BRKA 3U4LA 2P9IB 3D2FB 1MWKA 1S22A 3O1WA 2Q31A 4MLHA 1LOTB 5AQFA 5AZIB 3HTVA 2HF4A 4BRQA 4GNIA 1HKGA 5AQKA 1GLJO 3SJHA 4GY2B 3VF4A 2D0OA 4CZEA 2WUSA 3LDNA 3TU5A 1TYQB 1E4FT 4J8FA 4DHYA 2E20A 1NGJA 4IXCA 3QDKA 3MN9A 1GLEG 5KQ8A 1BA1A 3FZKA 2P9NB 2ASMA 4B1WB 4BRNA 1HKBA 3TPQA 1R59O 4NO7A 3HSCA 4FL9A 1K8KB 1NGIA 4EAHD 4BQLA 4DCHA 3FZHA 2VCPA 2YHYA 3JXUA 2IVOA 1BO5O 2D4WA 4CZLA 5LJWA 3ZEUA 4C23A 4PL7A 5ADXA 1TUYA 2IIRA 5AQWA 4JAXA 4FWQA 3WEEA 1XQSC 3MN5A 3LM2A 4K43A 3LDQA 5BPMA 5AQQA 5BN8A 3RSEA 5E26A 5JMVA 3I33A 1V4TA 4XH1A 3U9ZA 3GL1A 5F0XA 1WOQA 4BGAA 1NMDA 4BC5A 1QZ6A 1YAGA 4Y0WA 3GOIA 1YVNA 2Q2RA 5LJVA 3FZLA 3G25A 5ELZA 2E1YA 4CD1A 1Q18A 3A5LC 2A42A 3LDOA 2QWRA 2QWNA 4H0OA 3CQXA 1HPMA 5ADXH 4H5TA 4FWLA 2YCHA 1T6DA 3MK6A 4NB4A 5AFUA 3ULEA 4BR2A 2P9UA 3VGLA 3VENA 4L3QA 4BROA 2ZWHA 4QS7A 3CJ7A 4RWTA 2QWOA 1U2VA 3ENHA 4HTLA 2D1KA 4FWOA 1ZXOA 3CJCA 3DXMB 3QFUA 1ESVA 3QFPA 3R9PA 3ZEUB 3ATUA 4M7YA 3CJ1A 3EL2A 2QWMA 3WEEB 3UE5A 1MWMA 1NLVA 1HUXA 5JLFA 3RSEB 2V7YA 4CZMA 1NWKA 4WQ5A 3C7NA 3VEZA 4Z94A 4EFHA 3CHWA 4BRGA 5AFUH 5AZJA 4BRFA 3U8XA 4AM6A 1X3NA 5E84A 4EHUA 3VGKA 1NGAA 4FWPA 4CZGA 4FOIA 3AY9A 4E1JA 2HMPA 1NBWA 2A3ZA 3CETA 3CQYA 3SMPA 1JCGA 4O8KA 3H45C 1NM1A 1KAZA 4WYBA 5AQRA 2GTDA 2CH5A 3DXKA 4B1XB 3LM9A 1HLUA 1HKCA 1GLBG 1ATSA 2P9UB 4FWSA 3R8EA 1U2VB 5I9EB 5EY4A 4BR9A 2W40A 4BRHA 5KPTA 5AQGA 3ENOA 1GLAG 3H3NO 4A2AA 3MDQA 4ISGA 3H46O 3IUCA 1GLDG 3HI0A 2NRHA 4M63C 4BQZA 4PKGA 2VYPA 5BRHA 3BP8A 1KXPA 3BF3A 4DQ8A 2Q0UA 4H0VB 3VEWA 2V52B 3C7NB 2Q36A 3QB0A 5JICA 1Y64A 3IMXA 3QICA 3W0LA 3WT0A 2Q0RA 1IG8A 2FF3B 1WUAA 3A5OC 5AZJB 1U6ZA 2ZGZA 3CJBA 3W3DA 4BR5A 1GLFO 1BUPA 4H0YB 4BRMA 2QWPA 3C0BA 2QM1A 5AR0A 4H03B 4I6MB 3FGUA 3WXLA 3ZETA 4B1ZA 3H3OB 4BR0A 2A5XA 4ISEA 1QQMA 2QWLA 1DGKN 3B8AX 4WQ5C 1E4GT 2YHXA 3DXMA 1MA9B 2QWQA 4BREA 3S41A 3DXKB 3EN9A 3VESA 5AQHA 1HJOA 3BUZB 1RDWX 3M3ZA 3AAQA 3CJAA 3VGMA 2BUPA 3VEXA 4RCHA 4EHTA 3GG4A 2FSJA 1BOTO 2A6AA 4CBUA 1BG3A 2E2QA 4CZJA 3FZMA 3EKUA 1S3XA 4CZHA 4MO5A 3H1VX 4ISFA 4XEIA 5CE3A 2P9KB 1D4XA 4CBXA 4F9OA 4K42A 3ID8A 3GDQA 4CZFA 1GLCG 4CI6A 2YJFA 1NGCA 1JCEA 2P9PA 3VERA 5TKYA 4IZ9A 2NZTA 4BVOA 5F1XA 4FOEA 3ATVA 3EZWA 3QMLA 1JCFA 3LDLA 3VEVA 3A8YA 4CBWA 3CIPA 4XH4A 3LL3A 4AM7A 3H6EA 2E1ZA 3VOVA 4KBOA 3DJCA 5AQZA 3MCPA 1ATNA 2D0PA 4QS9A 3VEOA 3ZETB 5BREA 3M6GA 1X3MA 4H0XB 2ASPA 1BWFO 2HOEA 4MO4A 4B9QA 2P9SB 5AQXA 3L6QA 5AQOA 5AQMA 3CI5A 4A62A 3O8MA 1X9JA 5AQTA 4YDUC 5F2RA 2QXLA 2OANA 2VWBA 2GWJA 4IJNA 2P9PB 3UB5A 4IJAA 3KZBA 4I6MA 5AQLA 2Q97A 3BEXA 3FZFA 2PAVA 2E2NA 3FLCO 4H5RA 5AQIA 1T6CA 3HZ6A 4FWRA 1CZAN 2FXUA 4WQ4C 2F9TA 4A2BA 3VETA 3ZX0A 1QHAA 3O4WA 5EXWA 1NGDA 1GLLO 2PBDA 1SZ2A 2FSNA 3QBXA 1BU6O 3WXJA 5AQJA 4B1UB 5AQSA 1XUPO 5FPEA 2CGKA 3VEYA 3D2EB 3MMVA 4MLEA 2CGLA 2P9KA 3FR0A 3KHYA 3SK3A 5KPZA 2YHWA 4FWKA 4BC3A 2AA4A 3O80A 1G99A 3UKRA 4H5VA 2Q1NA 5BR9A 4CD3A 3EKSA 2QW9A 1Z6RA 5JLHA 1NGBA 5KPRA 2A40A 5AQNA 2J4RA 2GUPA 5EX5A 4HWIA 4QS8A 1QZ5A 4FWNA 5BN9A 2ITMA 4IWVA 4BRPA 2ASOA 2GWKA 3I8BA 3CJ9A 4BC2A 1J6ZA 3WQTA 4YDUA 3F9MA 1SQKA 3VPZA 4IO8A 1RGIA 3HBTA 4CZIA 2I7NA 1OKJA 4EIAA 3L0QA 3GE1A 1DEJA 2P9SA 4BRAA 5FPDA 3U9DA 2GEMA 1HX1A 3ZX3A 3AAPA 4WQ4A 1P8ZA 3IFRA 1NGEA 3L4IA 2V51B 5FPMA 3O1BA 4H0TB 3SMSA 3VF6A 1BA0A 2IVNA 1QQNA 1YXQA 3M1FA 1XC3A 4K41A 3UKRB 4JNEA 5BRDA 3O08A 4RTFD 4BR4A 4BVPA 3FE1A 4JD2B 2FSKA 4FSVA 2UYTA 4CJ7A 4M7XA 3O5BA 2I7PA 1YUWA 3EO3A 5FPNA 3HM8A 1RFQA 1T44A 2F9WA 3KVGA 2CGJA 1C0FA 4PKIA 3A5NC 3R6MA 4JHDA 1QQOA 3DWLA 2A41A 2H3GX 2ZGYA 3CERA 3MN6A 4BR7A 4BRCA 2FF6A 3A5MC 1DKGD 3D7EO 2AP1A 2DPNA 3UKUA 3D2EA 3FFKB 4XH5A 5AQVA 2FLOA 4K25A 2E2PA 5KQDA 4PL8A 3O6WA 2YJEA 2EWSA 4FPBA 5BRFA 1TUUA 2E2OA 1KAXA 3AARA 2HF3A 2IVPA 3OHRA 4DB3A 2P9LA 3QBWA 1SAZA 1NGGA 2P9IA 1KAYA 3D2FA 1ZC6A 3LDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JYTA 3DLEA 1NKBA 3WUHA 5CYMA 3QEVA 1LCUA 4CZKA 5AZIA 4FO0A 3HVRA 4LH5A 3SLCA 3J81O 2JGUA 1GOAA 1ZBSA 2E4LA 3NGZA 3JAMO 4DV3K 3BF1A 2LY5A 1H1VA 3NF9A 1L3TA 3T69A 2GX9A 3Q7CA 3OS0A 3CD6N 4JN4A 3CYGA 4JKGA 4C8MA 1VQON 1P90A 1WB9A 1VSLA 1NGFA 3K2PA 1WSIA 3J8AA 4LF7K 3HXMA 3HPHA 3TR8A 1IJJA 1Q9XA 4O44A 3KLHA 5AQYA 4FJ7A 4H5WA 3BY5A 3HSTB 4BC4A 5J2MA 2OZMA 3RRGA 4AHVA 4FPAA 1V4SA 1LQIA 1JLBA 3ULEB 4PKHA 4YOWA 4O5FA 3HJFA 5CY4A 4LF5K 3C65A 4CK1A 3D2FB 1T03A 3TSQA 4U7BA 2RKIA 5M1FA 4AHSA 1S72N 4FZYA 5AQFA 1BK8A 1U04A 1IBLK 1VNAA 1ZFUA 2VWKA 4FLVA 1FXXA 4C8NA 1QSSA 4GY2B 5GIOA 3L2RA 1RILA 1S1TA 3LDNA 3TU5A 4CERA 5KQ8A 1BA1A 4HHFA 2P9NB 4CHNA 5GIPA 4E3SA 4CJKA 1KFSA 4BE7B 4NO7A 4CGGA 4FL9A 3NF6A 4FW1A 4CJVA 1YF5L 4DCHA 1Q86O 1CZ9A 1BI4B 3THWA 2YHYA 4M3ZA 5DMRA 2D4WA 5JVGL 4A5BA 1D5AA 3LDQA 1V4TA 3WNGA 1I6FA 4OLAA 4DSJA 3KOXA 3OA9A 2D56A 4CHYA 3S3OA 4KRFA 4PY5A 5ELZA 4CD1A 1Q18A 4HTUA 3A5LC 4B9VA 3SQ1A 1N5YA 2MBKA 5ADXH 2Q3SA 2ITGA 2YCHA 1T6DA 3MK6A 2QK9A 4JI1K 1OH6A 2NRRA 5KGWA 5AFUA 4BR2A 2UUCK 3VA3A 4C1NI 3O9SA 4RWTA 4F2SA 1RTJA 2QWOA 2B4JA 4B3RK 1ZYQA 4HTLA 2JWKA 4PQUA 1YHQN 3QNOA 1W97L 1G15A 3DXMB 3SCXA 3QFPA 1J53A 2GV9A 3ZEUB 3C6HA 3CJ1A 3PO4A 2PZSA 2F7TA 3UE5A 3MX2A 3I0RA 1NLVA 1UOCA 3MXIA 4C8OA 3RSEB 3O4NA 4CZMA 4WQ5A 4Z94A 3QEWA 3KWIA 2VWJA 1TK0A 3CCVN 3PO5A 2LKBA 3ZSQA 4FWPA 5LMUK 4F4KA 3KLEA 4EZ6A 2HMPA 1NBWA 3SMPA 4RW7A 2G8VA 1JCGA 2NRZA 1A5VA 4B1XB 1I6GA 4DQRA 3LM9A 4GMJB 1VSEA 2P9UB 1ATSA 1IKXA 3R8EA 1I94K 1S9EA 2HHUA 4YOYA 2O8FB 2KYQA 5AQGA 1YITN 1BCGA 3E9PA 1VQ6N 5KGXA 3H3NO 3C6TA 2N2QA 3IUCA 1PE4A 3LDSA 2NRHA 1BQMA 3J7ZO 3KKSA 4M3XA 4FYDA 3L2WA 3G71N 1KXPA 3AVNA 1KLNA 1BHLA 3PX0A 3NGYA 2Q36A 1S6QA 3W0LA 5AZJB 1WUAA 4V1DC 3CJBA 2P5GA 4Y1DA 1WWNA 1GLFO 4H0YB 4G1QA 3CCMN 1KTQA 3AA3A 2BE2A 4AILC 2N69A 1HQEA 1KLMA 4I6MB 4FK2A 2LI7A 1IH7A 4B1ZA 4BR0A 3B8AX 4FLZA 2EX3A 3GKUA 2YHXA 3ZSXA 1XHZA 2HNZA 3DXKB 5AQHA 1JXCA 1HJOA 1JL2A 4EHTA 2BH1A 3EY1A 1OH7A 3HRGA 3VQBA 3ZLJA 4MO5A 4ISFA 3OVNA 5CE3A 2P9KB 2E2FA 4F9OA 3AGKA 5HBMA 3CFRA 1WAFA 4DTXA 1REVA 4OGEA 3AO3A 3AA2A 4FOEA 1JLEA 3ATVA 4M45A 4DFKA 4OPAA 3NMUA 3EYZA 4JI2K 3LDLA 2RE2A 2RHKA 3AA5X 2LT8A 4CJPA 1NKCA 1C0UA 3QEPA 1NG9A 1CXUA 4AM7A 1JKHA 3EEQA 2YILA 5IT9O 1VHXA 1X3MA 4H0XB 2ASPA 2W6LA 1BWFO 1UA1A 4C8KA 2HOEA 4O0IA 1B3CA 3IRXA 5AQXA 4LSNA 4OPKA 4JI7K 2M8BB 2O8CB 1I3AA 3TAMA 2E3GA 4ILGB 4IEIA 3DLLL 2UXDK 4YDUC 4DV5K 3SPYA 1Q8IA 1YJNN 2GWJA 4B8CA 3CCLN 2Q97A 4DKWA 3SYZA 3FZFA 1KFDA 3V9UA 2FBXA 1QSLA 3OYEA 1CZBA 2LJMA 1KVCA 3L2QA 3VETA 4E89A 4B9LA 4OPJA 2Y1JA 4RW9A 1SV5A 3VQAA 4IO9L 2YNGA 2FSNA 1BU6O 1QTMA 5AQJA 2ZE2A 4B1UB 5A2QO 2O8BB 4FM1A 3MMVA 3KLIA 3NH0A 3I8DA 4E0DA 5KPZA 2KBKA 3LP1A 3THYB 3VN5A 3NDKA 1S1XA 4BC3A 4CF8A 4H5VA 2DY4A 2QW9A 1Z6RA 5JLHA 5GINA 4AQYK 4BECA 1QVGM 1SKSA 4F3TA 1RT6A 4Z4CA 3MEDA 2ITMA 4IWVA 3T19A 2ASOA 4BRPA 4GKKK 3M5RA 5SZTA 1RBSA 5C12A 1J6ZA 4YOVA 4LF4K 3I55N 3VPZA 4O5BA 1SN1A 3WXMB 3HBTA 3TAEA 1IKVA 1DEJA 2X6SA 2P9SA 4IFVA 4Z4GA 1OVQA 2GEMA 3NBPA 3CCEN 3L4IA 3THXA 3RMBA 2WTUA 4H0TB 3SMSA 4JLHA 4DV0K 3N4QA 4K41A 3UKRB 2RN2A 3O08A 2JDQD 4RTFD 3IG1A 3O9QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3JYT A;  3DLE A;  1NKB A;  3WUH A;  5CYM A;  3QEV A;  1LCU A;  4CZK A;  5AZI A;  4FO0 A;  3HVR A;  4LH5 A;  3SLC A;  3J81 O;  2JGU A;  1GOA A;  1ZBS A;  2E4L A;  3NGZ A;  3JAM O;  4DV3 K;  3BF1 A;  2LY5 A;  1H1V A;  3NF9 A;  1L3T A;  3T69 A;  2GX9 A;  3Q7C A;  3OS0 A;  3CD6 N;  4JN4 A;  3CYG A;  4JKG A;  4C8M A;  1VQO N;  1P90 A;  1WB9 A;  1VSL A;  1NGF A;  3K2P A;  1WSI A;  3J8A A;  4LF7 K;  3HXM A;  3HPH A;  3TR8 A;  1IJJ A;  1Q9X A;  4O44 A;  3KLH A;  5AQY A;  4FJ7 A;  4H5W A;  3BY5 A;  3HST B;  4BC4 A;  5J2M A;  2OZM A;  3RRG A;  4AHV A;  4FPA A;  1V4S A;  1LQI A;  1JLB A;  3ULE B;  4PKH A;  4YOW A;  4O5F A;  3HJF A;  5CY4 A;  4LF5 K;  3C65 A;  4CK1 A;  3D2F B;  1T03 A;  3TSQ A;  4U7B A;  2RKI A;  5M1F A;  4AHS A;  1S72 N;  4FZY A;  5AQF A;  1BK8 A;  1U04 A;  1IBL K;  1VNA A;  1ZFU A;  2VWK A;  4FLV A;  1FXX A;  4C8N A;  1QSS A;  4GY2 B;  5GIO A;  3L2R A;  1RIL A;  1S1T A;  3LDN A;  3TU5 A;  4CER A;  5KQ8 A;  1BA1 A;  4HHF A;  2P9N B;  4CHN A;  5GIP A;  4E3S A;  4CJK A;  1KFS A;  4BE7 B; 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