5EXWA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5exwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5exwA04
3FZHA 4H5RA 5BPNA 4L3QA 1TYQB 4YDUA 3CJCA 2FLOA 4HTLA 5F2RA 1NGIA 3AY9A 3O6WA 1X3MA 5AFUA 4QS9A 4FWNA 4XH4A 4BC5A 5LJVA 2A6AA 3O1BA 4FWLA 4WQ4C 2HMPA 2A41A 3ULEA 4BVPA 4JAXA 4BR7A 2IVNA 2IIRA 3BP8A 2P9PB 3EKUA 1HKGA 3H3NO 5AQUA 1V4TA 2PAVA 4WQ5A 3A5MC 3WXIA 4LC9B 3SMPA 1NGEA 3VEYA 1JCGA 4BRIA 3CJBA 3VENA 2P9PA 4FWRA 1ATRA 3SLCA 4HWIA 2AA4A 2NLXA 5LJWA 5JLHA 4O5FA 3ZEUA 4CBWA 1G99A 3HBTA 5B8HA 4GY2B 5AQRA 3UKRA 2PBDA 3AAPA 4FO0A 3CETA 4FWOA 5EX5A 2J4RA 3FZKA 2YJFA 1IJJA 4MO5A 5AR0A 2DPNA 2UYTA 4H5NA 3H3OB 3KHYA 4CZMA 4JN4A 3FFKB 2P9KA 1MA9B 2E20A 1HX1A 4BGBA 2P9NB 3DXMB 4IO8A 4BROA 2IVOA 3VEOA 1JCEA 1NLVA 3CHWA 2E2NA 3VEVA 3JXUA 4BRMA 2HF3A 5AFUH 2Q1NA 2FF6A 4RWTA 2W40A 3QFUA 1BA0A 3AAQA 3HTVA 3MN6A 2FXUA 2FSKA 4XH5A 1DKGD 3O1WA 3U9ZA 4BC4A 4BR0A 2YHWA 3U8XA 3LDNA 1NBWA 4DCHA 2GTDA 2E2PA 1HLUA 3P4IA 5BRDA 1NGBA 1S22A 1TUUA 1SZ2A 4H0PA 1RDWX 3VPZA 4B1ZA 4EHUA 3EZWA 3DWLA 3U9DA 4JD2A 2HF4A 3WT0A 4O8KA 3H1VX 3M1FA 3W3DA 2Q0UA 4CZKA 3RSEA 1J6ZA 1NGAA 2E2QA 4FPBA 3O5BA 1Z05A 4WQ4A 5BRHA 2FSNA 2QWLA 2D1KA 3HSCA 3CQXA 2W41A 3FZFA 3GG4A 4CZIA 3A8YA 4AM6A 5F0XA 1BUPA 2IVPA 1QZ5A 2GWKA 4B1UB 3C7NA 3BEXA 4BQLA 3ZX2A 3GL1A 4B1XB 2Q97A 4I6MA 5KPRA 5BREA 4Z94A 1T6CA 4H03B 1GLBG 1NGCA 1GLLO 5EOYA 3D2FA 1DEJA 4A61A 2QWPA 2QM1A 3WEEB 1KAXA 4H0TB 3QMLA 2BTFA 3VESA 4BRPA 2KHOA 5BN9A 5AQWA 4DQ8A 1R59O 3U4LA 1ZC6A 3BF1A 5E26A 3WUHA 3LDOA 4FPAA 4BR9A 4FWKA 2QWNA 1ESVA 2ASMA 3ULEB 1BDGA 5LY3A 4IXCA 2QWOA 1HJOA 1GLFO 3WQTA 4IJAA 4M7YA 1T44A 4BR2A 2CH5A 4XH1A 4CZEA 4JHDA 5FPEA 2I7PA 2Q31A 5ELZA 2VYPA 2D4WA 1XUPO 3O80A 4BG8A 4K25A 3ZEUB 2QXLA 1GLCG 3LDPA 3H6EA 3QFPA 2QW9A 4XEIA 3VEZA 3UKRB 3FR0A 1E4FT 5FPNA 4FOIA 3FE1A 1TUYA 3ZX3A 5ADXA 2YHXA 1ATSA 2P9UA 2P9KB 2YCHA 3SK3A 3VEXA 3CERA 1T6DA 1X3NA 4BG9A 4H0YB 5BPMA 5FPMA 4CD3A 1NM1A 4H5TA 2H3GX 3HI0A 2EWSA 3CJ1A 1XC3A 5AQSA 3WQUA 2YI1A 1MWMA 4NB4A 2Q36A 3MMVA 4BRHA 4BQZA 1ATNA 1ZBSA 2ASPA 4FSVA 4BRGA 4BR5A 3DXKA 1S3XA 3UE5A 3IDHA 4BREA 4H0XB 1NGGA 4A62A 3FZMA 2P9SA 1Z6RA 3A5NC 3GOIA 3MN5A 3MDQA 1YVNA 3A0IX 1NGFA 1Y64A 3B8AX 5JLFA 5AQTA 5EY4A 2WUSA 4CZFA 1YAGA 4AM7A 3W0LA 4JD2B 2I7NA 4CZGA 1GLJO 4CZLA 4CZHA 2GUPA 1WUAA 3J8AA 5JMVA 1HPMA 1U6ZA 4ISFA 4IJNA 3RSEB 3VETA 4BR4A 2F9TA 5AQJA 5ADXH 1NGDA 2A3ZA 4EIAA 4MLEA 1U2VA 1YXQA 1QZ6A 3VF6A 3EO3A 5CE3A 4GNIA 4CBUA 4BRNA 5KQDA 5KPZA 4FWSA 2NZTA 4B1YB 1QQNA 4FL9A 5AQKA 4PL8A 3SMSA 2AP1A 2P9LB 3C7NB 2BUPA 3WXLA 4BRAA 4I6MB 1QQOA 2OANA 1K8KB 3D2FB 2CGLA 2P9LA 5JICA 1JCFA 3VERA 3QICA 4CJ7A 3A5OC 1HKBA 2F9WA 1SAZA 4B1WB 5AQMA 4BRDA 1K8KA 1BU6O 2ITMA 1KXPA 4H0OA 2P9IB 3TU5A 5KPTA 1NMDA 3VF2A 5I9EB 4F9OA 2ZGYA 2P9IA 2D0OA 3L0QA 2NRHA 1RGIA 1YUWA 4JHDB 3QB0A 4K43A 3ZETB 4ISGA 5AQZA 2GWJA 2V7ZA 5AQXA 1MWKA 4NO7A 3ZX0A 3IUCA 3ZETA 1DGKN 2E2OA 4K42A 3CQYA 1BG3A 1E4GT 4J8FA 5TKYA 4M63C 4CI6A 4BC2A 5AQVA 4EAHD 5BPLA 3C0BA 4Y0WA 3UKUA 4B1VA 3D7EO 3AARA 1GLDG 4PKIA 4KBOA 2P9UB 1BA1A 4BRKA 4E1JA 5AQNA 5AQGA 3H45C 2GELA 5AQOA 1TYQA 3F9MA 1QHAA 3ATUA 4MLHA 1NWKA 4EHTA 3DJCA 4A2BA 1HUXA 3O08A 2V52B 3ID8A 1ZXOA 1EQYA 1WOQA 3LDLA 1XQSC 3G25A 3VGLA 1BO5O 3EN9A 3HM8A 3FLCO 3OHRA 3VOVA 1LOTB 5BRFA 3ATVA 1QQMA 4EFHA 4DHYA 4FOEA 1V4SA 3H1QA 3MN7A 5AQFA 3DXKB 3LM9A 3EKSA 3QBWA 3I33A 4BRLA 3VF4A 2P9SB 2CGJA 3QBXA 4FWMA 1CZAN 4B9QA 2A42A 2ZGZA 1LCUA 2V51B 3I8BA 3BF3A 3TPQA 2VCPA 3LL3A 5E84A 1BWFO 3A5LC 2E1YA 4PKGA 2ZF5O 3H46O 5AQHA 2FF3B 3D2EB 3O4WA 5AQLA 4YDUC 3CIPA 2E1ZA 1Q18A 3JS6A 2YHYA 3M6GA 2E8AA 4ISEA 5AQYA 1NGHA 3D2EA 2P9NA 2YJEA 3DXMA 5AZIB 1C0GA 1IG8A 5EXWA 3S41A 1RFQA 1U2VB 2V7YA 4FWPA 2D0PA 3SJHA 4QS8A 4DB3A 4WQ5C 1C0FA 3IMXA 5AZIA 3O8MA 2VWBA 3MN9A 2CGKA 3GE1A 3CI5A 4BVOA 3FZLA 3VGMA 3VEWA 4CZJA 5F1XA 5AQPA 4IZ9A 4PKHA 3M3ZA 1HKCA 1X9JA 3R6MA 4QS7A 3GDQA 2ASOA 3DAWA 3WXKA 4BC3A 2E88A 1P8ZA 5AZJB 3WXJA 3QDKA 2FSJA 2A5XA 5AQQA 4M7XA 4BRCA 4RTFD 4BRFA 5AZJA 3HZ6A 4PL7A 3BUZB 3CJ7A 4C23A 2QWQA 4CBXA 3ENHA 5FPDA 4RCHA 4K41A 3KZBA 3UB5A 2ZWHA 3EL2A 3LM2A 4H0VB 4FWQA 4H5VA 1NGJA 1GLEG 2GEMA 3KVGA 1MDUB 5KQ8A 3GBTA 4CD1A 2HOEA 5AQIA 1OKJA 1BOTO 3CJAA 2QWMA 3L4IA 4WYBA 1KAZA 3ENOA 5BN8A 4JNEA 3CJ9A 1GLAG 5EVZA 2CH6A 3IFRA 3MCPA 3R9PA 4A2AA 2A40A 3VGKA 2Q0RA 1KAYA 4MO4A 3MK6A 1D4XA 4BRQA 4H5WA 2QWRA 3LDQA 4BGAA 5BR9A 3UKUB 4IWVA 1SQKA 3L6QA 2Q2RA 3R8EA 3FGUA 3WEEA 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZHA 2VG6A 4L3QA 1J5OA 2FLOA 4HTLA 4DSEA 1NGIA 3AY9A 3O6WA 1BIUA 4AHRA 4FWNA 4XH4A 5LJVA 2HMPA 4BEBA 4BVPA 4JAXA 3CM6A 2IIRA 3MXJA 1V4TA 4JKAA 4WQ5A 1SN1A 4KHUA 3VEYA 1NGEA 1JCGA 2KZMA 4BRIA 2HNYA 4DTSA 4O5FA 4CBWA 4DR1K 3VQDA 3H08A 1UWBA 3HBTA 3OVNA 4E7IA 1JLCA 3UKRA 4AILC 1UOCA 3AAPA 2Y1IA 2OPRA 4JS5A 3ZSWA 3L2RA 2J4RA 4JS4A 2YJFA 3EE9A 5AR0A 1I39A 5GINA 1YHQN 3QEVA 4CEOA 3SAHA 2P9KA 4JKHA 4KB0A 4Y1CA 1C0TA 1T3VA 4BDZA 3RMAA 4LD0A 1IKYA 4BRMA 2D56A 1CXUA 3QIOA 2Q1NA 1QHTA 2FF6A 4RWTA 3K57A 2FBXA 3J7AP 1I6GA 1BA0A 4YOUA 3QEWA 1DKGD 3O1WA 3U9ZA 4BC4A 2BE2A 2OTJN 3U8XA 4DLGA 2GTDA 3KP0A 1VK0A 1NK5A 1NGBA 4W5NA 3CCEN 3AVBA 3P31A 2VG5A 1KCFA 1W9HA 1XC9A 4H0PA 1DTTA 1RDWX 4B1ZA 3EZWA 2HHUA 3DWLA 4IDHA 3L3VA 3LPUA 1Q8IA 4W5RA 1JZBA 1J5EK 4CZKA 1S1XA 3THWB 3RSEA 1KC8O 4DTUA 1XMQK 4J2DA 3CG7A 4CF0A 4W5QA 3HP9A 4FPBA 3F9KA 1KLNA 3TAPA 3THXB 4CFCA 2N2QA 2QWLA 3DRPA 4E1NA 5F0XA 1D9FA 1QZ5A 2GWKA 3RMDA 2LKBA 2D0AA 4BQLA 3C6TA 1NJWA 2IGIA 3GL1A 3AO4A 4B1XB 2Q97A 1VSIA 4KYPA 1Z25A 5KGWA 1U47A 3C95A 4C8KA 1GLBG 3NDKA 4YOYA 3D2FA 4A61A 4B9UA 2QM1A 4H0TB 4FJNA 3RVCA 2LY5A 5E26A 3WUHA 2VGNA 4Z4CA 1FK9A 4A59A 1ESVA 2ASMA 2HHWA 3MECA 4E0DA 5JS1A 5KK4A 3THYA 1T44A 1NRAA 4IO9L 4CZEA 4B9LA 1WAFA 4JHDA 3QO9A 1IBLK 1XUPO 4K25A 4CQKA 2F96A 1WT7A 4FJIA 3V4IA 2KQ2A 3KLGA 4FJXA 2X74A 1EX4A 1N6QA 2FC0A 2QW9A 3VEZA 5GAGP 1HNIA 1LWEA 3J80O 2A7TA 1ZYQA 4Q5VA 2AJQA 3CCVN 4FOIA 4AHUA 3S9HA 2WBNA 3ZX3A 5ADXA 2YHXA 4AEIA 1ATSA 3F2KA 4OO1J 3P83D 3ITHA 3RTVA 5BPMA 4CGHA 3O3FA 3MXIA 3P5JA 1VQ5N 2KBJA 2H3GX 2KPYA 2EWSA 3WQUA 1NK7A 2YI1A 4JKCA 4NYFA 4BRHA 5FLXO 4N56A 3Q7CA 1FW6A 5M1FA 1ZBSA 3NVMA 1RTJA 1WBBA 2NRWA 4BRGA 5E41A 1SEGA 3E7RL 3L2VA 3UE5A 4BREA 3OYLA 3MXMA 2HNDA 3FZMA 2P9SA 1KLMA 4DR3K 3SV4A 3TTDA 4IEIA 1IKXA 3TAGA 4DWIA 3B8AX 5JLFA 2WUSA 4CZFA 3L56A 1YAGA 4HHTA 3K58A 4OKEA 4CZGA 1B7DA 4CZLA 4OLBA 4FM2A 4IKFA 2Z1GA 3J8AA 5KTQA 4ISFA 4CJKA 1SKSA 1OZZA 4ZHRA 1RT2A 4FM0A 4KHQA 4O0JA 1R0AA 2VG7A 3NF6A 4FZYA 2A3ZA 4KH6A 4EIAA 4MLEA 3OYCA 5DM6L 4CJ4A 2EX3A 1QZ6A 5C12A 2W6KA 1P00A 4GNIA 2KTQA 4CGGA 2BGGA 3V1OA 4FWSA 2NZTA 1OVQA 1XNQK 3SMSA 4Z4FA 2W00A 4KPYA 4C8OA 3AVFA 5KRSA 1YJWN 3WXLA 4JKBA 1ILYA 3NFAA 1WMTA 1K8KB 1SN4A 3M5RA 2FBYA 3K2PA 5JICA 1JCFA 4FJ8A 3AA2A 1BCMA 1W0HA 1VRTA 4BRDA 4HCBA 1UAXA 1F21A 5KPTA 2M8BB 4JI7K 3HSTB 5EU7A 3V9SA 4DTXA 2HSTA 4HE7A 4F9OA 2ZGYA 2P9IA 5M1PA 1EXQA 1Z26A 2BDPA 3VQCA 1WSGA 4K43A 3T1AA 5AQZA 4XIUA 5AQXA 3PX4A 3SF4D 3WNGA 3ZETA 2E2OA 3R3LA 4K42A 2G2KA 1BG3A 4J8FA 4M63C 1XNRK 3CC7N 4GMJB 1JKHA 2HHXA 4EAHD 4CGDA 4E1JA 4DR4K 3ZSOA 4JYAK 1Q86O 3DM2A 3E9LA 2BH1A 2GELA 1C56A 1TYQA 3F9MA 1QHAA 3ZT4A 3ATUA 3AA4A 1IV0A 1EWQA 3PX0A 2QTDA 1ITGA 2QK9A 4KHPK 3CC4N 2YNFA 4A2BA 3HO1A 3OYKA 1S5JA 1ZXOA 3TAFA 3QLHA 3G25A 3HM8A 5KRTA 4FJHA 3VOVA 1LOTB 1QQMA 4FOEA 3AVCA 4DV0K 3V1RA 3OYGA 3I33A 3IS9A 1X9MA 4DTJA 4E7HA 3SBGA 2NY8X 4H4OA 3SQ4A 3K9KA 4PHTX 3PSFA 2WONA 1KTQA 4B08A 2A42A 3C94A 1LCUA 2V51B 5LMUK 4OPAA 3VQ7A 4DV3K 3TANA 4WF9L 1L4VA 1U48A 3A5LC 2ZF5O 1JKZA 3SPYA 3H46O 3O4WA 3D2EB 3LAMA 5AQLA 5C42A 3HOTA 3J7YP 3JS6A 2YHYA 3VTIA 4CJPA 3PO4A 2VQFK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FZH A;  2VG6 A;  4L3Q A;  1J5O A;  2FLO A;  4HTL A;  4DSE A;  1NGI A;  3AY9 A;  3O6W A;  1BIU A;  4AHR A;  4FWN A;  4XH4 A;  5LJV A;  2HMP A;  4BEB A;  4BVP A;  4JAX A;  3CM6 A;  2IIR A;  3MXJ A;  1V4T A;  4JKA A;  4WQ5 A;  1SN1 A;  4KHU A;  3VEY A;  1NGE A;  1JCG A;  2KZM A;  4BRI A;  2HNY A;  4DTS A;  4O5F A;  4CBW A;  4DR1 K;  3VQD A;  3H08 A;  1UWB A;  3HBT A;  3OVN A;  4E7I A;  1JLC A;  3UKR A;  4AIL C;  1UOC A;  3AAP A;  2Y1I A;  2OPR A;  4JS5 A;  3ZSW A;  3L2R A;  2J4R A;  4JS4 A;  2YJF A;  3EE9 A;  5AR0 A;  1I39 A;  5GIN A;  1YHQ N;  3QEV A;  4CEO A;  3SAH A;  2P9K A;  4JKH A;  4KB0 A;  4Y1C A;  1C0T A;  1T3V A;  4BDZ A;  3RMA A;  4LD0 A;  1IKY A;  4BRM A;  2D56 A;  1CXU A;  3QIO A;  2Q1N A;  1QHT A;  2FF6 A;  4RWT A;  3K57 A;  2FBX A;  3J7A P;  1I6G A;  1BA0 A;  4YOU A;  3QEW A;  1DKG D;  3O1W A;  3U9Z A;  4BC4 A;  2BE2 A;  2OTJ N;  3U8X A;  4DLG A;  2GTD A;  3KP0 A;  1VK0 A;  1NK5 A;  1NGB A;  4W5N A;  3CCE N;  3AVB A;  3P31 A;  2VG5 A;  1KCF A;  1W9H A;  1XC9 A;  4H0P A;  1DTT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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