5EXWA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 118
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5exwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5exwA04
4FOIA 2BTFA 4BR7A 1IJJA 4DQ8A 4FSVA 5BREA 3DXKB 3WQUA 5ADXH 1NWKA 5AZJA 5EVZA 1LCUA 4CBWA 1U6ZA 4CD3A 5AQHA 3VGKA 3QMLA 3KHYA 4FWLA 4JHDA 3VENA 3VESA 4JNEA 3EL2A 4BRMA 3LDQA 5AQUA 5AFUA 5EX5A 5JMVA 1BG3A 4MO5A 4JD2A 4EHUA 5BN8A 2NRHA 2P9UA 3UE5A 3FR0A 5AQQA 4FWPA 3D7EO 4FPAA 2CGJA 3QDKA 3A5NC 2FSJA 4BVPA 2KHOA 3I33A 5AQWA 5E84A 2Q2RA 2A5XA 5BRFA 4XH1A 2P9LA 1QQOA 3CI5A 3TU5A 4FOEA 2CH5A 1NGFA 4MO4A 2GELA 3DXMA 4IZ9A 5AQRA 5AQKA 4WQ4A 2E2NA 1MA9B 1XC3A 4I6MB 3UB5A 4B1ZA 3JXUA 1NLVA 3MK6A 4H03B 3JS6A 3AARA 4BC2A 3C7NA 3ID8A 3WUHA 3AY9A 2QW9A 1MDUB 3ZEUA 1X3NA 3WXJA 1NGGA 4B1VA 4BRKA 3FLCO 3GOIA 4H0YB 1ATRA 4RCHA 2GWJA 3FZLA 4BREA 1HJOA 5JLHA 3LDPA 4BROA 4ISEA 4CBXA 3UKRB 2D4WA 4H0XB 5BRHA 1WUAA 2IIRA 2W41A 4AM7A 3C0BA 1NM1A 4BG9A 4BRFA 3R9PA 3W3DA 4MLHA 3VEYA 1K8KB 3WXLA 2DPNA 3VEZA 3VOVA 2P9NA 4BRNA 1YVNA 4YDUC 4BRAA 3MN5A 4BRHA 2P9SB 3VGLA 1YXQA 1QZ6A 2A40A 2YJFA 3M3ZA 4BRPA 1Z6RA 4JAXA 1SQKA 1XUPO 4WQ4C 2ASMA 4K25A 3BEXA 4FWOA 4ISFA 4QS8A 3GDQA 4Y0WA 5KQDA 1ZXOA 4L3QA 4QS7A 3GG4A 3MN7A 2W40A 4K41A 1HX1A 5AQOA 4CJ7A 3KVGA 3A5LC 4C23A 1TYQA 2GEMA 1S22A 5BPLA 3O1BA 3IUCA 5ELZA 5AQGA 2FLOA 3BUZB 3CJ9A 2Q0UA 3G25A 1JCFA 5AQIA 4FWSA 3CETA 4PKIA 5LJWA 3WXKA 3VPZA 1NGHA 4FPBA 2H3GX 3M6GA 3MMVA 2P9KB 3IFRA 3FFKB 3QBXA 2FSNA 1DKGD 3WT0A 4GY2B 2EWSA 4FWMA 1TUYA 3VF2A 3ZETB 3UKUB 3D2EA 3EO3A 2D0PA 2FF6A 2E1ZA 5AZIA 5B8HA 5AQJA 3O08A 2VCPA 5AQTA 2NLXA 5ADXA 1QQMA 3RSEB 3EN9A 2A41A 3ULEB 3FZMA 3LM9A 4RTFD 1T44A 4CZJA 1JCEA 5AQZA 2A6AA 2YHXA 2F9WA 3QICA 4B1YB 1KAYA 4H0PA 4IWVA 5FPNA 3A8YA 1BU6O 2GUPA 2QWPA 3DXKA 5AZJB 4B1UB 2IVPA 4K43A 4CD1A 3VF6A 1NGBA 2FF3B 3ZX0A 3L6QA 2ZGYA 4EIAA 1H1VA 4JHDB 5TKYA 4CZKA 4YDUA 5CE3A 4BGAA 3H1VX 1BDGA 4FO0A 1KXPA 4WYBA 3ATUA 4JD2B 4PL8A 2P9UB 3R6MA 5F1XA 3WEEB 3J8AA 3SMSA 2ZGZA 5BPNA 1HPMA 4H5WA 2D1KA 2E2PA 1OKJA 4M7XA 3HI0A 5BRDA 2P9LB 2E88A 2J4RA 1HKBA 1GLDG 1NGJA 1GLEG 4BR9A 3TPQA 3SK3A 3SJHA 2QM1A 2YHWA 4BC5A 4O5FA 3IDHA 3MN9A 1KAZA 1RFQA 3BF1A 1T6DA 4GNIA 3H1QA 2WUSA 4H5RA 1SZ2A 3CIPA 2E8AA 3MDQA 3WQTA 3ENOA 4DHYA 3CJ7A 3GBTA 4IJNA 1D4XA 3GL1A 3P4IA 5AQXA 4CZHA 2PBDA 4CZMA 2P9IB 3H6EA 1NGIA 3LM2A 3LDOA 4PKHA 4H5VA 4KBOA 4BR4A 4K42A 1NGAA 4B1XB 5AQVA 4F9OA 3VGMA 2P9PA 4A61A 3VETA 3HZ6A 2CH6A 3AAPA 3CJCA 4A2BA 3EKUA 1BUPA 5F2RA 3H46O 5F0XA 3O5BA 4E1JA 4BR5A 4IO8A 1ZC6A 3LDLA 5BN9A 3IMXA 5BPMA 5JLFA 1ATNA 4B9QA 3BP8A 1U2VB 1BO5O 2FXUA 3WXIA 4CZIA 3HTVA 4BRGA 2QWNA 1E4GT 3QFPA 3FGUA 4BC4A 4MLEA 5AQMA 5JICA 1P8ZA 3LL3A 5LJVA 2QWOA 5FPDA 4A62A 3H45C 2E2OA 1GLFO 3D2FB 2E20A 3MN6A 2Q36A 1E4FT 1QQNA 4H5NA 4M7YA 4EFHA 1TYQB 3DWLA 2D0OA 4BC3A 1EQYA 5EXWA 4BVOA 3A5MC 1DEJA 3KZBA 4HTLA 4WQ5A 3L4IA 1Q18A 2Q31A 1JCGA 4HWIA 3AAQA 2NZTA 5AQLA 2HOEA 2Q0RA 1T6CA 4FWKA 3HM8A 1Z05A 4XH5A 3FE1A 1NGDA 5AR0A 4CBUA 1GLAG 4AM6A 5KPRA 5AQFA 5FPEA 4FL9A 3H3NO 3D2EB 4H0OA 3O8MA 3UKUA 1HKGA 3M1FA 4QS9A 2AP1A 3VF4A 4FWRA 3MCPA 3SLCA 1GLLO 5EY4A 4BGBA 2GTDA 4FWNA 5AQSA 2YJEA 3RSEA 3U9ZA 4CI6A 4H0VB 1HUXA 1X3MA 3O1WA 2QWQA 2E2QA 4PL7A 4PKGA 2AA4A 3VEOA 3DJCA 1XQSC 1ESVA 3CHWA 3QFUA 2HF3A 4EHTA 2FSKA 2YCHA 4DB3A 1CZAN 4LC9B 3FZKA 1NBWA 2QWRA 3QB0A 3S41A 1NGCA 1WOQA 4WQ5C 2Q97A 3CJAA 1KAXA 4J8FA 5AFUH 2PAVA 2BUPA 3WEEA 3VEXA 3BF3A 2QWMA 1BOTO 1ATSA 3CJ1A 2V51B 3DXMB 3CQXA 2V7YA 4ISGA 4BRCA 4CZGA 2GWKA 1V4SA 2F9TA 4I6MA 1R59O 5KPTA 1X9JA 4XEIA 3VERA 1QHAA 3FZFA 3C7NB 2QXLA 1HKCA 4BG8A 3L0QA 3VEWA 3O4WA 3ZEUB 1G99A 3U4LA 4JN4A 3O6WA 1IG8A 5KPZA 4BQZA 5KQ8A 2VYPA 4O8KA 4BQLA 3VEVA 1ZBSA 1MWMA 1DGKN 3LDNA 3HSCA 4RWTA 1YUWA 1NMDA 2E1YA 2IVNA 1BA1A 3UKRA 4NO7A 4CZEA 4H0TB 4Z94A 1GLJO 2ASOA 3ENHA 3FZHA 1J6ZA 1K8KA 3A5OC 4B1WB 3R8EA 2HF4A 5BR9A 4BRQA 2P9NB 2A42A 2P9IA 2QWLA 4CZFA 4A2AA 2ASPA 2P9SA 4DCHA 2ZWHA 1C0FA 3F9MA 2I7NA 4H5TA 2YI1A 5AQNA 3CQYA 1SAZA 1BA0A 2P9PB 3HBTA 4M63C 3GE1A 4FWQA 2IVOA 4BRIA 3SMPA 4EAHD 1BWFO 1V4TA 1U2VA 1LOTB 3ZX3A 5E26A 1QZ5A 4BRLA 3W0LA 4CZLA 1TUUA 1C0GA 2OANA 1GLCG 3H3OB 4NB4A 4BR0A 3ZX2A 2Q1NA 2V7ZA 1HLUA 3OHRA 4BR2A 1RGIA 2I7PA 1S3XA 3D2FA 3EZWA 1Y64A 5FPMA 5EOYA 1GLBG 1NGEA 1RDWX 2P9KA 4BRDA 3B8AX 4IJAA 5AQPA 3I8BA 3U9DA 1YAGA 2UYTA 3CERA 3DAWA 2A3ZA 3QBWA 3A0IX 3ZETA 2CGLA 2HMPA 2ITMA 5LY3A 2ZF5O 5AZIB 5AQYA 1MWKA 3EKSA 3U8XA 4IXCA 3CJBA 5I9EB 2VWBA 3ULEA 3O80A 2CGKA 4XH4A 3ATVA 2YHYA 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR7A 1UWBA 1RTIA 2N66A 5HOOA 3CCRN 1WSIA 1LCUA 4JI0K 3QMLA 4FWLA 2D0BA 3VENA 4JNEA 3EL2A 2NRZA 1C56A 1BCGA 3J7ZO 4B9LA 2P9UA 2NRHA 1O13A 3SZ2A 2XRIA 3D7EO 4MFBA 3LP2A 2FSJA 4BVPA 2KHOA 3PIOL 4Q0BA 2A5XA 3PV8A 1WLJA 3OYMA 3TU5A 5D3GA 3DXMA 1BI4A 4DSEA 4KHYA 2LR3A 2IS3A 5KGWA 2HSTA 3JXUA 1NNEA 3KC6A 2LKBA 4F8RA 3MK6A 4AHSA 4DTNA 2LJ7A 1VAZA 5GINA 1UGLA 3WUHA 1Q9YA 3ZEUA 1B7DA 4DR1K 1NGGA 4CJFA 4DV4K 4LF9K 4H0YB 1D5AA 4CFBA 4CIFA 5JLHA 3OYGA 4ELVA 3NMUA 2D4WA 4H0XB 5BRHA 1WUAA 3KOYA 4AM7A 3MAQA 4W5QA 4FJKA 4CECA 1BIZA 4C8OA 3AO2A 3HSTB 1K9MO 1IH7A 2OPPA 4CHYA 2DPNA 2LSNA 3DM2A 3SUQA 3VOVA 2P9NA 2W00A 5M1NA 1Q8IA 1YVNA 4DS4A 1ZFUA 3OYJA 3MN5A 2P9SB 1I2VA 2I61A 2YHAA 1QZ6A 4IOXA 1VSFA 1WB9A 2G8HA 3M3ZA 4BRPA 2GV9A 4CJ4A 1KFSA 2UXCK 2E3FA 1XI1A 2ASMA 3BEXA 1A5WA 1WN7A 3E7RL 4QS8A 3B6OA 5KQDA 4DR4K 3QERA 3GG4A 4LH5A 4A59A 2IGIA 4JK9A 2XY5A 2FLOA 3WNEA 3TAPA 1OH8A 3BY5A 5AQIA 1B3CA 4AEIA 3CETA 5LJWA 1NGHA 2H3GX 3MMVA 4W5NA 1ZVEA 2GX9A 3FFKB 1BISA 1VSJA 4CGDA 2EWSA 1JKZA 1TUYA 3VF2A 3ZT0A 3NH1A 4FLTA 3ALYA 2D0PA 3LALA 3CF5L 2FF6A 4MDBA 4DF8A 5AZIA 2KGQA 5ADXA 4CK3A 3T3FA 2KLAA 3LM9A 1JCEA 4B9TA 4DU3A 2OZSA 5J2PA 3M8SA 3JYTA 2UUBK 3KK1A 1NPIA 1QVGM 4K43A 3ZCMA 1HPZA 3VF6A 3L6QA 5M1QA 3DLHA 3VQ7A 2VY6A 3O9QA 1VHXA 2KJAA 5JVHL 4KB1A 4JHDB 5FLXO 3O3GA 3OS0A 1S1XA 2Y1JA 4FO0A 4WYBA 4JD2B 4DTRA 4OLBA 2IC3A 1ZBLA 2VWKA 3HJFA 1VQPN 3L2VA 3VA0A 1A5XA 4Z4FA 1I39A 4CGGA 4U67L 3VTHA 2G8VA 5BPNA 1HPMA 4X65K 2DFHA 3HI0A 4IFEA 1LQHA 2HNZA 2OPSA 1MU2A 3KOZA 4KTZA 3SK3A 2YKMA 3C6TA 2VG6A 4KO0A 3EE8A 4OLAA 4TSXA 3IG1A 4DV1K 1RDBA 4ZHRA 4O5FA 4RW4A 1KAZA 3BF1A 1JXBA 2W42A 2PFUA 2NRWA 3H1QA 2WUSA 1Z26A 3NFAA 1SZ2A 2XY7A 3L3UA 4CFCA 3WNHA 1VNBA 3GBTA 2ZE2A 1VK0A 4DR5K 1ILYA 4G9ZA 4CJUA 4CZMA 2P9IB 4AHUA 4Y1DA 3KLGA 4DTMA 3PSFA 1U45A 1PTXA 1A5VA 3TTCA 4DKWA 4B1XB 2LJMA 2HHVA 2I5JA 3MCAB 3VGMA 2P9PA 4A61A 3VETA 2YV0X 1SKWA 4E1JA 5F0XA 3O5BA 4FJJA 4BR5A 4IO8A 2KYQA 3P31A 5JLFA 3DI6A 3BP8A 4DUYK 1XC9A 4JK8A 3OYLA 1BIUA 3AA2A 4DR7K 3LP0A 4E7JA 1P8ZA 1NKBA 1RTDA 3LL3A 3V1QA 3K5LA 1T3VA 4V1DC 4N41A 1WSFA 5JS1A 1XHZA 4A62A 3M8QA 3HPHA 2E2OA 1GOAA 3EZ5A 3KK7A 4HHFA 3D2FB 1RTHA 2KZZA 1P00A 3CQ8A 4FK4A 4HE7A 3D6RA 4M7YA 5LL6Z 1TYQB 3AVHA 5EXWA 3MXIA 1N6QA 3PY8A 4IEEA 2X74A 4BE2A 4HWIA 2NZTA 5AQLA 2A1RA 3NE6A 2HOEA 1S9EA 3SV4A 4M3TA 3TTDA 1T6CA 1N8RO 4MDAA 5T7BA 4O55A 4XH5A 3OYEA 3EEQA 4R5PA 1S5JA 4FJMA 4CJ3A 5KPRA 5JENA 5FPEA 1NOYA 3HYFA 4YFUA 3O8MA 3UKUA 1Q82O 1I2UA 1FKPA 3M1FA 4QS9A 4FWRA 4DLEA 4YOTA 1GLLO 3NF7A 4FWNA 4HHTA 1UOCA 3NF6A 2OA8A 2SN3A 1KVBA 2QWQA 1I94K 3NAEA 2AA4A 3SQ0A 1KVAA 2O8EA 2Z1JA 1ESVA 4CCHA 4YY3K 3ZYYX 3CCMN 4O4GA 1X9MA 1IBKK 4CESA 4DB3A 1CZAN 5KTQA 2ASCA 2O8FA 2QWRA 3QNNA 2QEXN 1RNHA 3DLBA 1NGCA 4WQ5C 4DS5A 3RWUA 3MEGA 1OVQA 2Q97A 3CJAA 4IFVA 3V9WA 3M5RA 4RW6A 1IKVA 3C6HA 4CEQA 1WSEA 1BOTO 1ATSA 3CJ1A 4KHUA 1BHLA 3CQXA 2O4GA 3GKUA 1TV6A 4ISGA 3U3GA 4KB0A 3VERA 3G4SN 3SV3A 1WAJA 3C7NB 2QXLA 1CXUA 2MZ0A 3AVIA 3VEWA 1SN4A 1G99A 1D9FA 1IG8A 1NK9A 4BQZA 1UA1A 4O8KA 3V1OA 4BQLA 1YJNN 4CERA 4JI4K 3KP1A 3KTQA 4NLBA 2HHXA 3BK3C 3LZJA 2IVNA 3UKRA 1UAXA 4CE9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BR7 A;  1UWB A;  1RTI A;  2N66 A;  5HOO A;  3CCR N;  1WSI A;  1LCU A;  4JI0 K;  3QML A;  4FWL A;  2D0B A;  3VEN A;  4JNE A;  3EL2 A;  2NRZ A;  1C56 A;  1BCG A;  3J7Z O;  4B9L A;  2P9U A;  2NRH A;  1O13 A;  3SZ2 A;  2XRI A;  3D7E O;  4MFB A;  3LP2 A;  2FSJ A;  4BVP A;  2KHO A;  3PIO L;  4Q0B A;  2A5X A;  3PV8 A;  1WLJ A;  3OYM A;  3TU5 A;  5D3G A;  3DXM A;  1BI4 A;  4DSE A;  4KHY A;  2LR3 A;  2IS3 A;  5KGW A;  2HST A;  3JXU A;  1NNE A;  3KC6 A;  2LKB A;  4F8R A;  3MK6 A;  4AHS A;  4DTN A;  2LJ7 A;  1VAZ A;  5GIN A;  1UGL A;  3WUH A;  1Q9Y A;  3ZEU A;  1B7D A;  4DR1 K;  1NGG A;  4CJF A;  4DV4 K;  4LF9 K;  4H0Y B;  1D5A A;  4CFB A;  4CIF A;  5JLH A;  3OYG A;  4ELV A;  3NMU A;  2D4W A;  4H0X B;  5BRH A;  1WUA A;  3KOY A;  4AM7 A;  3MAQ A;  4W5Q A;  4FJK A;  4CEC A;  1BIZ A;  4C8O A;  3AO2 A;  3HST B;  1K9M O;  1IH7 A;  2OPP A;  4CHY A;  2DPN A;  2LSN A;  3DM2 A;  3SUQ A;  3VOV A;  2P9N A;  2W00 A;  5M1N A;  1Q8I A;  1YVN A;  4DS4 A;  1ZFU A;  3OYJ A;  3MN5 A;  2P9S B;  1I2V A;  2I61 A;  2YHA A; 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