5F1XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
380
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 117
structure length 380
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f1xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f1xA04
1G99A 4FPBA 2P9SB 3O4WA 1DEJA 3H3NO 1BWFO 2FSKA 4K25A 3DAWA 2F9TA 1GLLO 2D4WA 3HM8A 4RWTA 1BA0A 1K8KA 5ADXH 3VEWA 1Y64A 1NGIA 3VEVA 3LDOA 3CIPA 2HOEA 3AY9A 3L6QA 2Q0UA 4CBUA 4HWIA 2NRHA 4BC5A 3QICA 4RCHA 3SLCA 3MDQA 1NGBA 3LDLA 1NBWA 3HTVA 1TUYA 3WXIA 4BR0A 4FSVA 3FZKA 2P9KA 1C0FA 4FOEA 3VETA 2P9SA 4FWNA 3S41A 1Z05A 5AQGA 1BUPA 3ATUA 4KBOA 5AQHA 3W3DA 5AQSA 3LM9A 1QQOA 4DCHA 2QWNA 2ZF5O 5AZJA 3BP8A 5EX5A 3H1VX 2E2PA 1NGFA 4RTFD 3VF4A 2E8AA 3AAPA 1SAZA 4H5WA 4BR4A 3ULEB 1XUPO 3QFUA 4FOIA 4QS7A 1X3MA 2Q31A 1ATSA 3WEEB 4JD2B 2DPNA 4BG9A 5AFUA 2PBDA 4EAHD 4NB4A 4IWVA 1KXPA 2V52B 1U2VB 3W0LA 3DXMB 2CGJA 2E20A 1H1VA 1TYQA 4WQ4C 4DHYA 3O80A 5JLFA 3WQUA 3LL3A 3R9PA 1GLEG 1HKBA 2Q1NA 3J8AA 4B9QA 5BR9A 1ESVA 3VF2A 3CI5A 5F1XA 1HKCA 5AQFA 1GLBG 3SMSA 5FPMA 2I7NA 3EKUA 1J6ZA 4WQ5C 1D4XA 4FWQA 2VCPA 2GTDA 4BR5A 3CJBA 5AQUA 3CETA 3TU5A 1ZBSA 4DB3A 5CE3A 2W41A 4B1YB 1BDGA 1RFQA 4JD2A 2A41A 3WT0A 2FSNA 3ZX3A 4EIAA 4H0PA 1SZ2A 3FZHA 3VGMA 2IIRA 4BREA 1KAYA 1MA9B 3DXMA 4BRCA 2E2QA 4FWMA 4H5NA 4H0TB 5KPRA 3VGKA 5AQVA 3B8AX 4O5FA 3O6WA 4BRDA 4F9OA 2IVNA 4BRHA 1NGHA 3VEZA 3CERA 4BRMA 2QWMA 3MN7A 2GWJA 3ZX2A 4CD1A 1SQKA 3EN9A 4IXCA 3BF3A 2FLOA 3UKRB 2A6AA 2UYTA 3CHWA 5EXWA 3FZFA 2E88A 5JLHA 1C0GA 3MCPA 1KAZA 3IUCA 4E1JA 4HTLA 3C7NB 4FL9A 1GLJO 1NM1A 2P9KB 2W40A 5BRHA 5AFUH 3M1FA 3L0QA 4QS8A 1NGEA 1EQYA 4BRIA 4BR9A 3QBXA 3GBTA 5AQZA 1U6ZA 3MN6A 4C23A 3IFRA 4BGAA 1TUUA 2P9PB 4A62A 4FWLA 3HSCA 4EFHA 5AZJB 4YDUA 2CGLA 2QWPA 4FWKA 4J8FA 3RSEB 3WXJA 3L4IA 2CH6A 2ASOA 2V7YA 2AP1A 4H5RA 4CZLA 1QZ6A 4EHUA 1Q18A 1NWKA 4PKHA 2HF3A 3VOVA 4M7XA 5KPZA 3UKRA 5JICA 2A3ZA 4WQ4A 4BRAA 1X3NA 1OKJA 2E2NA 3AAQA 2AA4A 3ZETA 5EY4A 1NLVA 1DKGD 3C7NA 3I8BA 4B1WB 1TYQB 4B1ZA 1BG3A 2QWRA 3LDQA 2P9IA 2FF6A 1HKGA 2GUPA 3ZX0A 2YJEA 2P9PA 4IO8A 4WYBA 3EKSA 3A5NC 2NLXA 4BC3A 1S3XA 3RSEA 4O8KA 4JNEA 4FWPA 3F9MA 2E1YA 5AQOA 1T6CA 4PKIA 1JCGA 3VENA 1NGCA 3D2EB 1CZAN 1GLAG 2FXUA 5AQNA 4BRPA 3WUHA 3UE5A 4BVPA 3QMLA 2D0PA 3VESA 2ZGYA 3LM2A 4CZJA 3OHRA 4BRGA 3LDNA 2HMPA 5B8HA 2YJFA 3H6EA 1QZ5A 2ASMA 3GE1A 4CBWA 5KQDA 4Z94A 1V4TA 3H45C 3HBTA 5E26A 5AQKA 4CZHA 1GLDG 5LJWA 1YXQA 1MDUB 4ISGA 3GL1A 3GDQA 4A2AA 3M3ZA 2F9WA 3LDPA 5FPDA 4B1XB 4XH1A 4CJ7A 4H03B 4L3QA 3FR0A 2ITMA 3D2EA 4CZIA 3ENHA 4ISEA 3H1QA 4XH4A 5AQTA 5ADXA 4LC9B 3GG4A 4JAXA 3EL2A 3U9DA 5AQPA 4QS9A 3JS6A 4MLEA 4XH5A 4MLHA 3ZEUA 4BC2A 3M6GA 4CZEA 3U4LA 3KHYA 2V7ZA 1T44A 1YUWA 5I9EB 4K41A 3VEOA 1QHAA 1YVNA 3QDKA 2E2OA 3O8MA 1E4FT 2A40A 3UKUA 4AM7A 2E1ZA 4EHTA 1RGIA 2QW9A 5AZIB 3DXKB 1Z6RA 4BRKA 3EO3A 1KAXA 4CBXA 1BO5O 3A0IX 3QBWA 3VEXA 3ZETB 3KZBA 4BR7A 4IJAA 1QQNA 3CQYA 3U9ZA 4XEIA 2ZGZA 1X9JA 1QQMA 2P9IB 4CD3A 4FWRA 4JHDB 3CJ9A 3D2FA 4CZFA 4MO4A 3A5LC 1HPMA 1NMDA 3U8XA 3A8YA 4BG8A 3BF1A 3VERA 3WQTA 4PL8A 2YI1A 5BRDA 1LCUA 5AQIA 4M63C 4B1UB 3CJ7A 5F0XA 3VPZA 5JMVA 3ATVA 4BQZA 4CZGA 1NGDA 3WXLA 5AZIA 3DXKA 4FO0A 3FZMA 2V51B 4H5VA 5BPLA 1S22A 1GLFO 1XQSC 4NO7A 4PKGA 5BN9A 3G25A 3SMPA 4FPAA 3ENOA 3H46O 5AR0A 2Q2RA 3O1WA 1NGJA 1JCFA 1WOQA 2P9UA 2QM1A 5ELZA 5KQ8A 2VYPA 3SK3A 3O08A 4AM6A 4CZMA 4WQ5A 2Q97A 2YHYA 2BTFA 4A2BA 1NGAA 5BRFA 2FF3B 4JHDA 4BGBA 1BA1A 4DQ8A 4BQLA 3O1BA 2YCHA 4CZKA 3HZ6A 2YHWA 5AQJA 5AQLA 5BN8A 2I7PA 1MWKA 2IVPA 3GOIA 5F2RA 3ID8A 4BRQA 3HI0A 3FE1A 3WXKA 3VGLA 5EVZA 4GY2B 4Y0WA 1GLCG 3CJCA 4BR2A 3SJHA 5LY3A 3DJCA 4GNIA 3IDHA 2J4RA 1NGGA 4M7YA 2GELA 1IG8A 4ISFA 5BPMA 3R8EA 3ZEUB 2D1KA 3VEYA 3FLCO 3UB5A 2KHOA 3D7EO 1BU6O 1IJJA 2Q0RA 1R59O 3I33A 4YDUC 1YAGA 3UKUB 4FWOA 4BVOA 2ASPA 1DGKN 1LOTB 2P9NB 3MN9A 4K42A 1HUXA 2A5XA 3H3OB 4H5TA 5AQMA 5AQQA 2IVOA 5TKYA 2OANA 2ZWHA 3MMVA 2VWBA 5BPNA 2Q36A 1MWMA 3A5OC 3C0BA 4I6MB 4A61A 1HJOA 3IMXA 2EWSA 1ATNA 5AQYA 3VF6A 4MO5A 4BROA 4BC4A 5LJVA 3KVGA 3R6MA 2HF4A 3QFPA 4FWSA 3D2FB 4H0VB 1WUAA 1T6DA 5AQRA 3BEXA 4IZ9A 2QWLA 5AQXA 1V4SA 2CGKA 3ULEA 2P9LB 3O5BA 2BUPA 2PAVA 4K43A 2A42A 3WEEA 1JCEA 2D0OA 3MK6A 2QWOA 2GEMA 2P9NA 2FSJA 4CI6A 1HLUA 1U2VA 3QB0A 4H0YB 1ZC6A 1XC3A 3A5MC 1HX1A 3EZWA 1BOTO 3FGUA 2GWKA 4PL7A 4BRFA 4IJNA 5EOYA 4BRNA 4H0XB 5AQWA 2YHXA 1K8KB 3JXUA 3CQXA 5FPNA 2P9UB 4B1VA 2NZTA 5BREA 1P8ZA 4I6MA 5FPEA 3FFKB 2WUSA 1E4GT 2CH5A 3P4IA 2QXLA 4JN4A 3CJ1A 1ZXOA 3DWLA 5KPTA 3CJAA 5E84A 4BRLA 3MN5A 1RDWX 3TPQA 3AARA 4H0OA 3BUZB 2H3GX 2QWQA 3FZLA 1ATRA 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G99A 4FK2A 4FK0A 3DLKA 1XRSB 2BH1A 4CGDA 1NK0A 1VK0A 2FSKA 3KTQA 1HNZK 3DAWA 5HOOA 4RW4A 3SUQA 2D4WA 4CEZA 1VSLA 4RWTA 1RBTA 2OPRA 1XHZA 1BA0A 4FJNA 2JWKA 3ASMA 4RW7A 3KLHA 4FM2A 3VEVA 1EWRA 2OYQA 5GAEP 2HOEA 3DI6A 3KIOA 4CBUA 4GKJK 1HYSA 4M3XA 1TL1A 3QICA 4RCHA 4MDAA 4N76A 4O55A 3WXIA 3CCLN 4BR0A 4FSVA 3FZKA 3OBWA 3IKMA 4FOEA 3OYMA 1WSHA 3CQ8A 3C94A 4HCCA 4ILGB 3SUOA 3ATUA 5AQHA 1ASWA 2GUIA 1QSYA 3SJJA 3CMAN 3H1VX 3LWLA 4KH4A 2E8AA 3OJSA 1SAZA 4DF8A 4C8LA 2WBNA 1PX9A 4FOIA 4B9NA 1KV0A 5J2QA 3J80O 3CYMA 3DOLA 3VMFB 2DPNA 1BHLA 2PBDA 1U45A 3DMJA 4EAHD 4B9MA 4DQQA 2VG7A 3IAYA 1MU2A 3OYCA 4A5BA 3W0LA 4I2QA 2CGJA 2HHTA 4DHYA 4GVEA 4HUGA 3WQUA 1GLEG 4B9QA 5BR9A 3J7YP 3ZT4A 2QKBA 5FPMA 2I7NA 4NYFA 4JK7A 4CGGA 3J7ZO 1D4XA 4FWQA 4GV3A 3AO4A 2ZJPL 3PY8A 4B9SA 3CJBA 2ETJA 4B9TA 5AQUA 3E9PA 1TL3A 1ZBSA 4HUFA 5FRMA 2W41A 2ZQBA 1JKHA 4CF2A 1VQ6N 4Z4IA 1SZ2A 1EETA 1HNWK 2IIRA 4FJ9A 1IKWA 2VQFK 3P39A 3SQ0A 2YC1C 4BRCA 1EXQA 4FWMA 4DTRA 4H0TB 3VGKA 4AHRA 4BRDA 4F9OA 1NGHA 1O1WA 3ZSYA 4BRMA 4HUEA 3KK3A 4O5BA 3QLHA 3ZX2A 3EN9A 3UKRB 3CHWA 3LAKA 3WNEA 3QNNA 1WB9A 4E1NA 1UWBA 3SBGA 1GLJO 4B3TK 1NM1A 3CCUN 3ZSRA 3VQQA 1RDAA 3HL8A 4JV5K 3OS2A 1U6ZA 3RMDA 4B9LA 2QA4N 4OKEA 4BGAA 4B3RK 1ZVEA 3TSQA 3HXMA 4FWLA 1NRBA 1BIUA 5AZJB 2F8SA 1HNIA 3WXJA 4GV9A 1JZAA 3F73A 2X74A 2YX6A 2B5JA 1QZ6A 4B9UA 4EHUA 1NWKA 2HNZA 3IRXA 3VOVA 5KPZA 3UKRA 5JICA 3PO5A 3DLHA 3QEVA 3SI6A 3K5NA 4DF4A 2E2NA 3AAQA 3ZETA 3KK7A 1TAQA 3RTVA 4DR2K 2N69A 4CF1A 2Y1IA 4CHOA 2P9IA 3U6FA 4Y1CA 1HKGA 3CFOA 3K5LA 2YJEA 4CIEA 4IO8A 2OTLN 1U04A 2NLXA 4BC3A 1G15A 1YF5L 3N4PA 3MWPA 3N4QA 4K8ZA 1RDCA 4DV6K 5AQOA 4PKIA 3AO5A 4Z0UA 1JCGA 4UJ0A 1NGCA 3SAHA 3D2EB 3MWTA 5C24A 3KOZA 3THWB 1GLAG 3QETA 1RTJA 1YT3A 3OYGA 2KBHA 1VHXA 3TANA 4B9VA 1Z25A 4BRPA 4EP5A 1VQPN 3WUHA 5LMUK 2E0HA 4LFAK 2D0PA 3VESA 4CF0A 3NCIA 1VQ4N 3LAMA 4UADE 4FLUA 1DLOA 1Q7YO 1QZ5A 3L4QA 1JXEA 1A5VA 1FK9A 2VGNA 1I2UA 3CC2N 4K0KK 3KOYA 5E26A 4W5NA 3B6OA 2UUAK 1YXQA 1CLQA 3GDQA 3S3NA 3M3ZA 4B1XB 4CJ7A 4LF8K 3BGRA 1JLEA 4L3QA 2E2FA 1OH5A 2ITMA 5H1SQ 3OJUA 3D2EA 4CZIA 2D56A 4ISEA 4CJSA 3RWUA 1RNHA 3THWA 3VA3A 4FJLA 2IGIA 1VQKN 1WN7A 2BE2A 4LC9B 3EL2A 2YNHA 1NJIO 1KFDA 3JS6A 4XH5A 4W5OA 2HBMA 1W2BM 4FZZA 2YHAA 1N34K 2HW3A 4KHUA 5I9EB 1VQMN 2OPSA 1KQSM 3KP1A 4BE2A 3PO4A 3QDKA 2E2OA 3LP1A 2A40A 3UKUA 1NK6A 1E3MA 2QW9A 4FJGA 1K9MO 3QIOA 2WTUA 3ZSXA 2O8DA 3EO3A 3WXMB 4DV3K 3VEXA 3HP9A 3M5RA 4IO9L 1C55A 4B08A 4M3YA 3LZIA 1FH3A 2VG5A 1MR4A 2GBZA 3DLGA 1VSKA 2KW4A 3CJ9A 2KPYA 4M3ZA 4UY8O 2E3GA 4JKDA 3SUNA 4X65K 3OYHA 4X66K 4FLYA 1NMDA 3VQPA 4DS4A 1VSMA 3DLLL 4PL8A 5BRDA 4M63C 2G8FA 1POIA 3ATVA 1TK0A 1YVUA 3T19A 5BPLA 3RR8A 3OY9A 2RE2A 1SKSA 4KH5A 2G8WA 2KBKA 3O1WA 1NGJA 1JCFA 1WOQA 3E7UX 2QM1A 2Y1JA 4CJ5A 1WBDA 4KI4A 2MBKA 2GX9A 4AM6A 4CZMA 4WQ5A 2QI2A 2BTFA 3V6DA 4DQ8A 4F2RA 3KOXA 2D0AA 4QOZB 1U47A 4DWIA 4G1QA 1KC8O 4RW9A 5LY3A 3JSMA 2IOCA 4M45A 3LPUA 3D6RA 2J4RA 4LH4A 4LF6K 4YOWA 3QEWA 1YJWN 4V1DC 2IC3A 2XY5A 1D9FA 1RT5A 3KK1A 3UB5A 3D7EO 3ZSVA 3THXA 4RW8A 2YNIA 4M3TA 1R59O 1C1BA 2O8BB 3I33A 4YDUC 4NCAA 4DG1A 4FM0A 2MZ0A 2HBLA 1KVBA 3MN9A 3TAMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1G99 A;  4FK2 A;  4FK0 A;  3DLK A;  1XRS B;  2BH1 A;  4CGD A;  1NK0 A;  1VK0 A;  2FSK A;  3KTQ A;  1HNZ K;  3DAW A;  5HOO A;  4RW4 A;  3SUQ A;  2D4W A;  4CEZ A;  1VSL A;  4RWT A;  1RBT A;  2OPR A;  1XHZ A;  1BA0 A;  4FJN A;  2JWK A;  3ASM A;  4RW7 A;  3KLH A;  4FM2 A;  3VEV A;  1EWR A;  2OYQ A;  5GAE P;  2HOE A;  3DI6 A;  3KIO A;  4CBU A;  4GKJ K;  1HYS A;  4M3X A;  1TL1 A;  3QIC A;  4RCH A;  4MDA A;  4N76 A;  4O55 A;  3WXI A;  3CCL N;  4BR0 A;  4FSV A;  3FZK A;  3OBW A;  3IKM A;  4FOE A;  3OYM A;  1WSH A;  3CQ8 A;  3C94 A;  4HCC A;  4ILG B;  3SUO A;  3ATU A;  5AQH A;  1ASW A;  2GUI A;  1QSY A;  3SJJ A;  3CMA N;  3H1V X;  3LWL A;  4KH4 A;  2E8A A;  3OJS A;  1SAZ A;  4DF8 A;  4C8L A;  2WBN A;  1PX9 A;  4FOI A;  4B9N A;  1KV0 A;  5J2Q A;  3J80 O;  3CYM A;  3DOL A;  3VMF B;  2DPN A;  1BHL A;  2PBD A;  1U45 A;  3DMJ A;  4EAH D;  4B9M A;  4DQQ A;  2VG7 A;  3IAY A;  1MU2 A;  3OYC A;  4A5B A;  3W0L A;  4I2Q A;  2CGJ A;  2HHT A;  4DHY A;  4GVE A;  4HUG A;  3WQU A;  1GLE G;  4B9Q A;  5BR9 A;  3J7Y P; 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