5F1XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
380
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 117
structure length 380
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f1xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f1xA04
1NGJA 3GE1A 5KQDA 4HTLA 3KVGA 4BQZA 4BRCA 4FSVA 3ENOA 3I33A 2HF3A 5EX5A 3DXMA 4CD1A 3ATUA 4A2AA 1HKGA 1YXQA 4EHTA 1KXPA 2Q0UA 4IO8A 4H5TA 4EHUA 2P9NA 4NO7A 3H1VX 1U2VA 3H1QA 3ID8A 1V4SA 1YAGA 4PL8A 4FWPA 1GLEG 2P9KA 5AQYA 2P9PB 3I8BA 3QB0A 1NGHA 1LOTB 1Z6RA 3RSEA 1HJOA 3LDPA 4B1ZA 1Q18A 3ZEUB 4DCHA 5ADXH 1K8KA 1QZ6A 2A5XA 3WXKA 1JCGA 3TU5A 2YHWA 4K41A 1TYQA 4EIAA 2QWQA 3GG4A 3GOIA 1X9JA 4BRIA 3MN9A 1OKJA 4XH1A 4BRGA 1JCEA 3VGKA 3QFUA 1BWFO 2H3GX 3MN6A 1QQOA 4WQ5C 2E20A 3H46O 4IJAA 5KPRA 3G25A 4XEIA 5AQSA 2HF4A 5KQ8A 4B1UB 2YHXA 2IVPA 3EKSA 5AQNA 4AM7A 2A40A 4CZFA 4GY2B 2V7ZA 2FSJA 1LCUA 5EVZA 3FGUA 4FWMA 2V51B 3ZETB 4ISEA 3DJCA 4BR2A 1HPMA 5AQIA 2P9PA 3D7EO 5F2RA 4BQLA 3W0LA 1IG8A 1EQYA 4FWRA 4WYBA 2QWRA 3ZEUA 3BF1A 4BRHA 2QWLA 1SZ2A 2FF6A 3U8XA 2A41A 4K25A 5AQOA 2A6AA 4BRKA 5BPLA 5JLHA 1T6CA 1IJJA 4BVPA 4BR0A 3EN9A 4BRAA 5BPNA 4AM6A 3MN5A 2FLOA 4BROA 2BTFA 2Q97A 3MDQA 3O8MA 4JHDA 4NB4A 2Q0RA 1QHAA 5JICA 3SMSA 1Y64A 3S41A 3DXMB 3L4IA 2Q36A 4O5FA 3VPZA 3MK6A 3WT0A 1HX1A 1GLBG 1NGAA 3H45C 3VEZA 5E26A 5AQGA 2CH5A 2GEMA 4FWKA 5AQKA 5BRHA 4PKHA 2AA4A 4BREA 3WXLA 4H0XB 2VYPA 3ZETA 1MA9B 5FPNA 4BC5A 4BRQA 4EAHD 3LL3A 5LJWA 4BG8A 1K8KB 3O6WA 3HI0A 3H6EA 3GBTA 1D4XA 3C7NB 3JXUA 5F1XA 2UYTA 1MWMA 4BRPA 4BR5A 3FZHA 1TYQB 1BG3A 5AQVA 3WXIA 4MLEA 3LM9A 1ATRA 1YVNA 1ATSA 3ATVA 5LY3A 2ASMA 4B9QA 2IIRA 3CI5A 2YJEA 1DKGD 4BR4A 2WUSA 5AZJB 2QWNA 4H03B 5AQRA 4A62A 3MMVA 4BGBA 1NM1A 3ZX2A 2YJFA 4M7XA 5AQMA 4ISFA 3VEOA 5BRFA 4CBXA 1HKBA 5AQPA 1NGFA 3O08A 5F0XA 4FPBA 1NMDA 4H0TB 4Z94A 3EKUA 4BRDA 1XUPO 1GLJO 3CERA 2Q31A 3BEXA 3O1BA 2KHOA 5BN9A 4JNEA 1KAYA 1ZBSA 3TPQA 1V4TA 2VWBA 3FZLA 4JD2A 1SAZA 3O4WA 2CH6A 3C7NA 1JCFA 4FWQA 5ELZA 2F9TA 4Y0WA 3CJ1A 4IXCA 2PBDA 5AQLA 3F9MA 4QS9A 2E8AA 4E1JA 1BA1A 4BR9A 3CJ9A 4JHDB 1C0FA 4WQ4A 3UKRB 4IZ9A 4WQ5A 2QXLA 4QS7A 5AZJA 3HM8A 1J6ZA 3WEEA 2P9SB 3A5LC 3ZX0A 5EOYA 3LDNA 3BUZB 3SJHA 2NRHA 4MO4A 3VEYA 2GELA 1XC3A 3CQXA 1MDUB 4H0OA 3WUHA 2AP1A 3VEVA 5ADXA 3OHRA 1S3XA 5AQQA 4H0PA 4H5RA 1WOQA 1XQSC 2ASPA 4YDUA 2NLXA 3A8YA 2ITMA 4K42A 5B8HA 1QQMA 1BDGA 3IMXA 2W40A 4PL7A 1DGKN 2PAVA 3M6GA 3A5MC 2E1ZA 1H1VA 3SMPA 2I7PA 3VETA 2YCHA 4CZJA 3EO3A 4CZLA 2CGLA 3SLCA 1TUUA 3AY9A 2P9IB 2IVOA 1NBWA 1GLFO 3O5BA 3P4IA 3VGMA 2E88A 3UKRA 1NGCA 5AZIB 4GNIA 1P8ZA 4BGAA 2P9SA 2J4RA 4M63C 5I9EB 2NZTA 5TKYA 2ZWHA 2E2QA 4RCHA 1BO5O 5FPMA 4CI6A 3A0IX 2I7NA 2Q2RA 3GL1A 5LJVA 2QWPA 3BP8A 1WUAA 3VOVA 4JD2B 3U9ZA 5KPTA 4H0YB 4H5WA 2V7YA 1G99A 4JAXA 4QS8A 5EXWA 3R8EA 3VENA 5AQXA 4BC4A 4K43A 1RFQA 5CE3A 3HSCA 2CGJA 3D2EB 3A5NC 4BG9A 4CZEA 4B1YB 3O80A 2FXUA 3WXJA 1Z05A 2P9IA 4CJ7A 2P9LB 4CBUA 1T6DA 2E1YA 3ULEB 4CD3A 3R9PA 3FZMA 3GDQA 3WEEB 2GTDA 5AQFA 2W41A 5AZIA 3HZ6A 4DB3A 2GUPA 3CJAA 1NGEA 3KHYA 3UB5A 3VEXA 1NLVA 4FO0A 1BA0A 3EL2A 3BF3A 1NGGA 4FWNA 4H0VB 1DEJA 4MLHA 5AQTA 2FF3B 1X3NA 4MO5A 3HBTA 3UE5A 3KZBA 2E2OA 5JLFA 2CGKA 4FL9A 3FZKA 3CETA 3LDOA 4L3QA 3FZFA 1HLUA 4CZGA 2F9WA 3WQUA 3VF6A 5AQJA 3WQTA 5AFUH 4CZKA 4BRFA 4KBOA 4H5VA 5EY4A 3D2EA 1BOTO 3B8AX 4FWLA 2FSKA 3VGLA 1BU6O 2P9LA 3CJCA 3CJ7A 1E4FT 3ULEA 3DXKB 3AAPA 1NWKA 4PKGA 3ZX3A 4I6MB 4RWTA 1R59O 4RTFD 1ESVA 1KAXA 4FOIA 2QW9A 3AARA 3M1FA 4FPAA 4ISGA 3IUCA 2VCPA 4CBWA 4DHYA 4JN4A 2E2NA 3A5OC 4BRNA 5AQZA 2P9UB 2D0OA 3CJBA 3FE1A 4B1WB 2D1KA 4IWVA 3UKUB 2A42A 4PKIA 3VF4A 2QM1A 4WQ4C 5AFUA 4A61A 1CZAN 2YI1A 4FWSA 4H5NA 1NGDA 5FPDA 4DQ8A 5AQWA 1SQKA 3L0QA 3IFRA 4FOEA 3LDQA 4M7YA 4LC9B 2ZGZA 3QDKA 4J8FA 3DWLA 3U9DA 4HWIA 3MN7A 4BC3A 3W3DA 3QMLA 4BRMA 4O8KA 3R6MA 1TUYA 3QFPA 3FFKB 1ZC6A 3CIPA 4YDUC 1S22A 2FSNA 5BRDA 5BREA 4F9OA 2EWSA 3DXKA 2YHYA 4CZMA 2Q1NA 2ZF5O 1ATNA 4XH5A 4I6MA 4BR7A 2QWOA 4A2BA 5JMVA 1ZXOA 3SK3A 1U6ZA 3IDHA 3MCPA 4EFHA 1GLDG 5AQUA 2A3ZA 3CQYA 4XH4A 1X3MA 3VESA 2P9UA 2GWJA 3VEWA 3LDLA 3D2FB 1C0GA 1T44A 1MWKA 3EZWA 1HKCA 3UKUA 2HOEA 3JS6A 1GLAG 2IVNA 1HUXA 1E4GT 3HTVA 5KPZA 5BR9A 2E2PA 5FPEA 3DAWA 2GWKA 2P9NB 2D0PA 3QBWA 3LM2A 1U2VB 4CZIA 3H3OB 5BN8A 2ZGYA 2QWMA 2P9KB 3AAQA 1BUPA 3U4LA 3FR0A 3VERA 4CZHA 1NGIA 4BRLA 4C23A 2HMPA 4FWOA 1KAZA 3FLCO 4IJNA 3RSEB 3O1WA 1YUWA 3QICA 1RGIA 5AQHA 2V52B 3M3ZA 5AR0A 4B1VA 3L6QA 3C0BA 3VF2A 1QZ5A 2DPNA 3ENHA 5E84A 3QBXA 4BVOA 3CHWA 3H3NO 2OANA 3J8AA 1QQNA 5BPMA 4BC2A 2ASOA 1GLCG 2D4WA 1RDWX 2BUPA 1NGBA 4B1XB 3D2FA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NHGA 3GE1A 1XHZA 1HNVA 5EX5A 5C12A 1Y97A 3OA9A 3ATUA 5LMUK 1IG9A 1YXQA 4CERA 4RW9A 1HJRA 2Q0UA 4BWJA 4H5TA 3BZKA 3SV3A 4Y1CA 2P9NA 3VQ7A 3U6FA 3SNNA 4KRFA 4WFNL 1V4SA 3IS9A 3LP0A 1WNSA 1T8EA 3Q7BA 4FWPA 1GLEG 3I8BA 3KWIA 1JZBA 3QETA 2WONA 4KHQA 3RSEA 5FDLA 1TAQA 4DCHA 1K8KA 1LQQA 3K58A 4FM0A 4JI4K 1QZ6A 4V1DC 1KV0A 1T3VA 4CJ3A 4KHPK 4DV2K 3CM6A 4KO0A 5J2MA 1BGXT 2YIPA 4CQKA 4A5BA 3T1YK 1SL1A 3E9OA 5J2PA 2G2KA 1JCEA 3QFUA 1BWFO 1GOBA 1WSJA 2H3GX 2OPSA 1QQOA 4E72A 3WXMB 1RILA 3QNOA 1C0TA 2YKNA 3EKSA 2NRWA 2V7ZA 2LJMA 5EVZA 3FGUA 4FWMA 2V51B 4HTUA 1B9FA 4ISEA 3DJCA 3V4IA 4IFVA 2PYJA 3AVHA 5C24A 3D7EO 4MDAA 4BQLA 3W0LA 1MU2A 4F2SA 3OS1A 4BRHA 2LI7A 1Q81O 2A41A 2LSNA 2A6AA 3TTFA 4BRKA 1UA0A 2N69A 4KB0A 5GIPA 2E3FA 4BR0A 4FK0A 5BPNA 3RVCA 2OZSA 4DTSA 4RW7A 3MEDA 4Z4IA 4IDKA 4JKFA 4JHDA 3L2WA 2Q0RA 1CZ9A 3EE8A 1NKCA 3TAMA 3DXMB 3L4IA 1BCGA 1LAWA 1VSHA 2UXBK 4CFBA 2KQ2A 3QIOA 3NE6A 3SJJA 2AA4A 1S1XA 3WXLA 4H0XB 3TI0A 3DLKA 3MCAB 3P31A 3VMFB 5GINA 1DT9A 1HNIA 3LP1A 3K57A 4EAHD 4BG8A 1MYNA 2M8BB 1I2VA 3O6WA 1TKDA 4FLWA 1D4XA 3JXUA 4CGIA 4DWIA 2UYTA 1NRBA 2E6MA 3FZHA 3DI6A 4IDHA 3WXIA 1TV6A 2FBVA 3EE9A 5LY3A 1O13A 1NNEA 1W7AA 4H03B 2DTUA 3OW2M 4DFKA 1NM1A 3ZX2A 4X62K 2YJFA 2O8CB 3S5TA 5BRFA 4I9LA 5GIOA 3NAEA 1HKBA 4NCBA 3G71N 3CFPA 4Z94A 3SUPA 4OLBA 2GV9A 4YOYA 4BRDA 2ATQA 4OPAA 4CHYA 1EKEA 1SKRA 4CJVA 4FZZA 1KAYA 3TPQA 1MR4A 3O4WA 2QA4N 2OTJN 5ELZA 3CC4N 5M1OA 2BH1A 3HPGA 4IXCA 3D45A 4CHOA 5AQLA 3SQ0A 2FC0A 4QS9A 4FM2A 4EZ9A 4IO9L 1VQ6N 3AV9A 1BA1A 3CJ9A 5HP1A 2XHBA 1KFSA 1ILYA 4CEAA 1K6YA 4QS7A 3HM8A 1J6ZA 3LWLA 3MWPA 3A5LC 3KC6A 4CCHA 2YILA 3ZX0A 3BUZB 4KAZA 4MO4A 3C6UA 2O8CA 1B9DA 3NVKA 4H0OA 2AP1A 3VEVA 5M1NA 3AVBA 3OHRA 4LFBK 4DG1A 3G0ZA 2WOMA 3RTVA 2ITMA 4DV1K 4U67L 5B8HA 4NYNA 3IMXA 1JLFA 4CEOA 4E7HA 5HRNA 2NRZA 4JKEA 2KGQA 3A5MC 2E1ZA 2IS3A 3NGZA 4BE2A 2NRRA 4LF5K 4O44A 4N56A 4JI7K 4CZLA 3SLCA 4KHYA 1OVYA 1N8RO 4C8KA 3QEIA 3P4IA 4BE7B 2QTDA 4KH4A 3VGMA 3C94A 3G10A 4CJSA 1REVA 4C8MA 1KLMA 3BK3C 1P8ZA 4M63C 2J4RA 4BGAA 1SN1A 3C95A 3ZCMA 4PHTX 3NCIA 4DR1K 2NZTA 3G6EN 2PFUA 3IRXA 5TKYA 1VSFA 3RMCA 1N33K 4RCHA 1BO5O 4N5SA 4CFAA 1JXCA 4CF9A 2I7NA 1TL3A 3DLRA 1WUAA 1VQ9N 5KPTA 4E7JA 4H5WA 1G99A 1ZYWA 3KLGA 3R8EA 4YNQA 5AQXA 2HHXA 2Q3SA 5DK5A 4OGCA 5CE3A 5C0YA 1FKOA 2CGJA 4UADE 1NPIA 4B1YB 3O80A 2FXUA 3AGKA 1Z05A 3AA4A 4DU4A 2P9LB 2Z1JA 3L2UA 1BI4B 3LAKA 1XHXA 4CD3A 5EU7A 1OH7A 2WC9A 2G8IA 3T7ZA 2GTDA 5AQFA 3T1HK 3NF9A 1VQNN 2GUPA 3CJAA 4CE9A 1RTHA 1UAXA 2ZD1A 1TGOA 1LW0A 4JKBA 1L4VA 3UB5A 1NLVA 3VQ9A 3BF3A 1NGGA 4FWNA 3ASMA 3DLBA 4MLHA 1N36K 2YHBA 4DR2K 3NF6A 4E7LA 3UE5A 4FJ5A 1S1WA 3AVGA 3FZFA 1WB9A 3NF8A 1HLUA 3QEVA 4CZGA 2NY8X 3J80O 5KRSA 4OPJA 3CPEA 2GX9A 2NY9X 4UY8O 4KREA 4H5VA 4GW6A 1VQLN 4FWLA 3D0PA 1X9SA 2P9LA 3L8BA 4CHPA 2GBZA 4JK9A 1BI4A 4WCEL 2OPPA 4F3TA 5CHIA 3KOYA 4LSLA 1ICAA 4RTFD 3O9QA 2QW9A 3M1FA 4LFCK 1NMNA 5AQZA 4DSFA 2P9UB 2D0OA 4CESA 4KHWA 4B1WB 4DTOA 3CC2N 4IWVA 1QE1A 3OYAA 3KOXA 5AFUA 1D5AA 2JWLA 4R5PA 4GV6A 4H5NA 5FPDA 3OYGA 3NH2A 5FRMA 4Z4HA 2ATBA 2VG5A 3JAMO 3AVCA 4LC9B 3CG7A 3OYJA 4BWMA 1WSEA 4J8FA 4FLTA 4JI6K 4HWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3NHG A;  3GE1 A;  1XHZ A;  1HNV A;  5EX5 A;  5C12 A;  1Y97 A;  3OA9 A;  3ATU A;  5LMU K;  1IG9 A;  1YXQ A;  4CER A;  4RW9 A;  1HJR A;  2Q0U A;  4BWJ A;  4H5T A;  3BZK A;  3SV3 A;  4Y1C A;  2P9N A;  3VQ7 A;  3U6F A;  3SNN A;  4KRF A;  4WFN L;  1V4S A;  3IS9 A;  3LP0 A;  1WNS A;  1T8E A;  3Q7B A;  4FWP A;  1GLE G;  3I8B A;  3KWI A;  1JZB A;  3QET A;  2WON A;  4KHQ A;  3RSE A;  5FDL A;  1TAQ A;  4DCH A;  1K8K A;  1LQQ A;  3K58 A;  4FM0 A;  4JI4 K;  1QZ6 A;  4V1D C;  1KV0 A;  1T3V A;  4CJ3 A;  4KHP K;  4DV2 K;  3CM6 A;  4KO0 A;  5J2M A;  1BGX T;  2YIP A;  4CQK A;  4A5B A;  3T1Y K;  1SL1 A;  3E9O A;  5J2P A;  2G2K A;  1JCE A;  3QFU A;  1BWF O;  1GOB A;  1WSJ A;  2H3G X;  2OPS A;  1QQO A;  4E72 A;  3WXM B;  1RIL A;  3QNO A;  1C0T A;  2YKN A;  3EKS A;  2NRW A;  2V7Z A;  2LJM A;  5EVZ A;  3FGU A;  4FWM A;  2V51 B;  4HTU A;  1B9F A;  4ISE A;  3DJC A;  3V4I A;  4IFV A;  2PYJ A;  3AVH A;  5C24 A;  3D7E O;  4MDA A;  4BQL A;  3W0L A;  1MU2 A;  4F2S A;  3OS1 A;  4BRH A;  2LI7 A;  1Q81 O;  2A41 A;  2LSN A; 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