5F3AA

Crystal structure of the bromodomain of human atad2 in complex with compound a14
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Crystal structure of the bromodomain of human ATAD2 in complex with Compound A14
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f3aA00
4IR3A 5E3DA 4QBMA 4MR4A 5FG5A 5I7XA 4A9KA 5LJ1A 2DVSA 4NR4A 2RS9B 4LDFA 5EWDA 5HM0A 4QYDA 5IBNA 5FB1A 5CUDA 5FE4A 4YYKA 5FH6A 4HXPA 4Y03A 4LC2A 4E96A 5AD3A 5FFVA 3O33A 3QZVA 4HXOA 3U5OA 4QB3A 5DYUA 3NXBA 5FDZA 5DFBA 5G4RA 4A9NA 5ENFA 2I7KA 5ETDA 5ENCA 5DW2A 5A81A 5F5ZA 1WUMA 2OUOA 5EV9A 4J0RA 5H85A 2LSPB 5L8UA 5EWWA 4LYIA 5F62A 4UIWA 5CQTA 5L8TA 5CUCA 4YC9A 4N3WA 4MR3A 4PCEA 4NR5A 4UIUA 3ZYUA 2R0YA 4N4HA 5D3RA 2YDWA 5HFRA 4YYMA 5I40A 5A85A 5F3AA 4TTEA 1E6IA 5FG6A 4O7BA 4TS8A 4ZC9A 2DVRA 2R0VA 3P1CA 4Z6HA 4Q0OA 4UIYA 4NYVA 4MEPA 5LUUA 5F61A 5AMEA 3UVXA 5F1LA 2N9GA 4QSXA 2DVVA 5FH8A 5FE7A 4QC1A 3U5JA 4IR4A 4O7CA 5A7CA 3JVKA 4CFKA 4YAXA 5I88A 2GRCA 4QC3A 3IU6A 4O74A 5D3LA 5LKUA 4YADA 5CQAA 5D24A 3UV2A 3O35A 4CUTA 5DW1A 4YYJA 2DKWA 2WP1A 4WIVA 3U5LA 3RCWA 3MQMA 3UV5A 4IR6A 4YBSA 4NR6A 5EWHA 2L84A 5DYXA 5DBMA 4ZW1A 4QSUA 4IR5A 3P5OA 5EM3A 5FE8A 5CUBA 4CL9A 2F6JA 4YBMA 4QEVA 4Z1SA 4QR4A 4TT6A 4MEOA 4N4IA 5EQ1A 4QEWA 3IU5A 5FFWA 5I89A 5EICA 5CUGA 4PTBA 5FH7A 4PY6A 4ALHA 4NUCA 2DATA 5CQ6A 5I1QA 4YYGA 3QZSA 5IGMA 2YYNA 3P1FA 4QSWA 5F2PA 5JI8A 4QY4A 4XY8A 5KU3A 5HRWA 5IG6A 4NYWA 5IGNA 3G0JA 5CGPA 5FB0A 5A82A 4QSTA 4C67A 5CZGA 3LXJA 5D3HA 5E3GA 3D7CA 3S92A 2D9EA 3UVYA 5FE9A 5HCLA 4YBTA 4YYIA 2YW5A 4F3IA 3DAIA 2YEKA 5CTLA 5HQ5A 4HBXA 5TB6A 2NXBA 5E74A 5A5RA 4QSPA 4QYLA 2OSSA 5EISA 4TQNA 4TZ8A 4PCIA 5DLZA 5ENEA 5K29A 5TCMA 4IOOA 3O37A 3P1EA 4X2IA 4O70A 4NYXA 5F63A 3HMHA 4HBWA 5C4QA 5LJ0A 3JVMA 5F25A 5CY9A 5FE5A 3U5MA 5E9LA 5CUAA 4PS5A 5E9IA 4PKLA 3SVFA 5A5NA 3UW9A 5KTUA 4HBVA 1JSPB 4YH3A 5KTWA 2YEMA 3AQAA 4N4FA 1JM4B 3K2JA 4LR6A 5A5SA 4NR9A 4MEQA 5CUEA 4A9OA 5I29A 4UYHA 4BW4A 3MXFA 5JWMA 5CQ5A 2G4AA 4QSVA 5DY7A 4YY4A 4LYWA 5E9YA 4A9HA 5CQ4A 5HEMA 5LKXA 4NR8A 4UIXA 5FBXA 5IIDA 5LVQA 4CUSA 5DFDA 5C8GA 5EPSA 4TYLA 5CP5A 3HMFA 4XY9A 5CFWA 5EWCA 4TZ2A 5D3JA 5I86A 5FE2A 4AKNA 5ENIA 3FKMX 4NR7A 4HXNA 3SVHA 5FFYA 3S91A 4ZQLA 5ENJA 2R10A 5CQ8A 3MULA 4UYEA 4YYDA 4ALGA 2RI7A 1EQFA 4MENA 3MB3A 5H1UA 4QSQA 2RNWA 2H60A 2RO1A 5BT5A 2FSAA 4O75A 4A9IA 5BT4A 5KO4A 3UVWA 5ACYA 4FLPA 4CFLA 5G4SA 5DKDA 3LQIA 5I7YA 3AADA 1X0JA 5EA1A 5AD2A 3TLPA 3GG3A 4Z6IA 5L98A 4YY6A 4N4GA 5D3TA 3O36A 4A9FA 5DLXA 2E3KA 4QNSA 5A83A 4BHWA 5D3SA 4HXRA 2I8NA 4NRAA 5I83A 3LQHA 2L5EA 4NRBA 5FE6A 4HXKA 5E9MA 5E9KA 5HELA 5CPEA 4YH4A 3MUKA 5KHMA 5ETBA 4BW2A 5F36A 5EPBA 4A9JA 5EP7A 5CU8A 5LJ2A 5E0RA 5II1A 5BT3A 4CUUA 4TT4A 4QSSA 5FG4A 4WHWA 2E7NA 5IGKA 2WP2A 4O7EA 4LRGA 5D3PA 2DVQA 5LKZA 3U5NA 4TU6A 1WUGA 2F6NA 5DYCA 5E73A 5EU1A 5FE1A 3MB4A 4YABA 4YATA 3QZTA 4OUFA 5ENGA 4BW1A 5A5OA 5LVRA 5F1HA 4A9LA 2RNXA 4NXJA 5C85A 4QR3A 1ZS5A 3Q2FA 4O7AA 5HQ7A 5KTXA 4TU4A 4DONA 4CUPA 4LZRA 5J0DA 4Z1QA 4O76A 5ENHA 5HJCA 5DFCA 4QUUA 4J3IA 2YQDA 3LQJA 5D7XA 4YYHA 5A5QA 4YYNA 4CLBA 3JVLA 5HRVA 5D3NA 5EK9A 5HQ6A 4KCXA 2L85A 3DWYA 4RVRA 4A9MA 4NRCA 4UYFA 4QZSA 4KV4A 4XYAA 5CQ3A 4HXMA 4Q0NA 5E9VA 4UIZA 4HBYA 4HXLA 5C7NA 4UITA 4O72A 4Z93A 1N72A 3U5PA 5FE3A 2R0SA 5F60A 4O77A 5EWVA 4LYSA 2D82A 4MR5A 5FE0A 5CRMA 4NUDA 2RNYA 5CS8A 5EI4A 5EPRA 4UYGA 4CURA 5HRXA 4LZSA 5E7DA 4NUEA 5EGUA 5HFQA 5CQ7A 3I3JA 5H1VA 5C89A 3P1DA 5COIA 2MJVB 5D26A 4CUQA 4O71A 3LJWA 4QR5A 5I80A 5DX4A 3U5KA 4IOQA 5DYAA 4MR6A 4O7FA 4QSRA 4XUBA 5D0CA 4KV1A 5C87A 4OGIA 3SVGA 2E7OA 4A9EA 2RFJA 4UYDA 4QEUA 4BW3A 3JVJA 5DKHA 4YK0A 5L99A 5DKCA 4TT2A 3ONIA 5HENA 2OO1A 5CRZA 3Q2EA 4NS5A 5AMFA 2YELA 4WHUA 5L97A 5LKTA 3G0LA 4LZ2A 4J0SA 5D25A 2KTBB 5H1TA 4BJXA 4O78A 3O34A 4NQNA 5L96A 4UYFB 5EVAA 2DWWA 3UV4A 1F68A 5HLSA 5ENBA 4QUTA 3UVDA 4HXSA 4GPJA 4UIVA 4NQMA 4C66A 5A5PA 5IGLA 4OGJA 5II2A 4XUAA 4J1PA 3HMEA 4IORA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IR3A 5E3DA 4QBMA 4MR4A 5FG5A 5I7XA 4A9KA 5LJ1A 2DVSA 4NR4A 2RS9B 4LDFA 5EWDA 5HM0A 4QYDA 5IBNA 5FB1A 5CUDA 5FE4A 4YYKA 5FH6A 4HXPA 4Y03A 4LC2A 4E96A 5AD3A 5FFVA 3O33A 3QZVA 4HXOA 3U5OA 4QB3A 5DYUA 3NXBA 5FDZA 5DFBA 5G4RA 4A9NA 5ENFA 2I7KA 5ETDA 5ENCA 5DW2A 5A81A 5F5ZA 1WUMA 2OUOA 5EV9A 4J0RA 5H85A 2LSPB 5L8UA 5EWWA 4LYIA 5F62A 4UIWA 5CQTA 5L8TA 5CUCA 4YC9A 4N3WA 4MR3A 4PCEA 4NR5A 4UIUA 3ZYUA 2R0YA 4N4HA 5D3RA 2YDWA 5HFRA 4YYMA 5I40A 5A85A 5F3AA 4TTEA 1E6IA 5FG6A 4AKGA 4O7BA 4TS8A 4ZC9A 2DVRA 2R0VA 3P1CA 4Z6HA 4Q0OA 4UIYA 4NYVA 4MEPA 5LUUA 5F61A 5AMEA 3UVXA 5F1LA 2N9GA 4QSXA 2DVVA 5FH8A 5FE7A 4QC1A 3U5JA 4IR4A 4O7CA 5A7CA 3JVKA 4CFKA 3VKGA 4YAXA 5I88A 2GRCA 4QC3A 3IU6A 4O74A 5D3LA 5LKUA 4YADA 5CQAA 5D24A 3UV2A 3O35A 4CUTA 5DW1A 4YYJA 2DKWA 2WP1A 4WIVA 3U5LA 3RCWA 3MQMA 3UV5A 4IR6A 4YBSA 4NR6A 5EWHA 2L84A 5DYXA 5DBMA 4ZW1A 4QSUA 4IR5A 3P5OA 5EM3A 5FE8A 5CUBA 4CL9A 2F6JA 4YBMA 4QEVA 4Z1SA 4QR4A 4TT6A 4MEOA 4N4IA 5EQ1A 4QEWA 3IU5A 5FFWA 5I89A 5EICA 5CUGA 4PTBA 5FH7A 4PY6A 4ALHA 4NUCA 2DATA 5CQ6A 5I1QA 4YYGA 3QZSA 5IGMA 2YYNA 3P1FA 4QSWA 5F2PA 5JI8A 4QY4A 4XY8A 5KU3A 5HRWA 5IG6A 4NYWA 5IGNA 3G0JA 4AKIA 5CGPA 5FB0A 5A82A 4QSTA 4C67A 5CZGA 3LXJA 5D3HA 5E3GA 3D7CA 3S92A 2D9EA 3UVYA 5FE9A 5HCLA 4YBTA 4YYIA 2YW5A 4F3IA 3DAIA 2YEKA 5CTLA 1ZKRA 5HQ5A 4HBXA 5TB6A 2NXBA 5E74A 5A5RA 4QSPA 4QYLA 2OSSA 5EISA 4TQNA 4TZ8A 4PCIA 5DLZA 5ENEA 5K29A 5TCMA 4IOOA 3O37A 3P1EA 4X2IA 4O70A 4NYXA 5F63A 3HMHA 4HBWA 5C4QA 5LJ0A 4AI6A 3JVMA 5F25A 5CY9A 5FE5A 3U5MA 5E9LA 5CUAA 4PS5A 5E9IA 4PKLA 3SVFA 5A5NA 3UW9A 5KTUA 4HBVA 1JSPB 4YH3A 5KTWA 2YEMA 3AQAA 4N4FA 1JM4B 3K2JA 4LR6A 5A5SA 4NR9A 4MEQA 5CUEA 4A9OA 5I29A 4UYHA 4BW4A 3MXFA 5JWMA 5CQ5A 2G4AA 4QSVA 5DY7A 4YY4A 4LYWA 5E9YA 4A9HA 5CQ4A 5HEMA 5LKXA 4NR8A 4UIXA 5FBXA 5IIDA 5LVQA 4CUSA 5DFDA 5C8GA 5EPSA 4TYLA 5CP5A 3HMFA 4XY9A 5CFWA 3ERRA 5EWCA 4TZ2A 5D3JA 5I86A 5FE2A 4AKNA 5ENIA 3FKMX 4NR7A 4HXNA 3SVHA 5FFYA 3S91A 4ZQLA 5ENJA 2R10A 5CQ8A 3MULA 4UYEA 4YYDA 4ALGA 2RI7A 1EQFA 4MENA 3MB3A 5H1UA 4QSQA 2RNWA 2H60A 2RO1A 5BT5A 2FSAA 4O75A 4A9IA 5BT4A 5KO4A 3UVWA 5ACYA 4FLPA 4CFLA 5G4SA 5DKDA 3LQIA 5I7YA 3AADA 1X0JA 5EA1A 5AD2A 3TLPA 3GG3A 4Z6IA 5L98A 4YY6A 4N4GA 5D3TA 3O36A 4A9FA 5DLXA 2E3KA 4QNSA 5A83A 4BHWA 5D3SA 4HXRA 2I8NA 4NRAA 5I83A 3LQHA 2L5EA 4NRBA 5FE6A 4HXKA 5E9MA 5E9KA 5HELA 5CPEA 4YH4A 3MUKA 5KHMA 5ETBA 4BW2A 4AKHA 5F36A 5EPBA 4A9JA 5EP7A 5CU8A 5LJ2A 5E0RA 5II1A 5BT3A 4CUUA 1PUOA 4TT4A 4QSSA 5FG4A 4WHWA 2E7NA 5IGKA 3VKHA 2WP2A 4O7EA 4LRGA 5D3PA 2DVQA 5LKZA 3U5NA 4TU6A 1WUGA 2F6NA 5DYCA 5E73A 5EU1A 5FE1A 3MB4A 4YABA 4YATA 3QZTA 4OUFA 5ENGA 4BW1A 5A5OA 5LVRA 5F1HA 4A9LA 2RNXA 4NXJA 3D1DA 5C85A 4QR3A 1ZS5A 3Q2FA 4O7AA 5HQ7A 5KTXA 4TU4A 4DONA 4CUPA 4LZRA 5J0DA 4Z1QA 4O76A 5ENHA 5HJCA 5DFCA 4QUUA 4J3IA 2YQDA 3LQJA 5D7XA 4YYHA 5A5QA 4YYNA 4CLBA 3JVLA 5HRVA 5D3NA 5EK9A 5HQ6A 4KCXA 2L85A 3DWYA 4RVRA 4A9MA 4NRCA 4UYFA 4QZSA 4KV4A 4XYAA 5CQ3A 4HXMA 4Q0NA 5E9VA 4UIZA 4HBYA 4HXLA 5C7NA 4UITA 4O72A 4Z93A 1N72A 3U5PA 5FE3A 2R0SA 5F60A 4O77A 5EWVA 4LYSA 2D82A 4MR5A 5FE0A 5CRMA 4NUDA 2RNYA 5CS8A 5EI4A 5EPRA 2EJNA 4UYGA 4CURA 5HRXA 4LZSA 5E7DA 4NUEA 5EGUA 5HFQA 5CQ7A 3I3JA 5H1VA 5C89A 3P1DA 5COIA 2MJVB 5D26A 4CUQA 4O71A 3LJWA 4QR5A 5I80A 5DX4A 3U5KA 4IOQA 5DYAA 4MR6A 4O7FA 4QSRA 4XUBA 5D0CA 4KV1A 5C87A 4OGIA 3SVGA 2E7OA 4A9EA 2RFJA 4UYDA 4QEUA 4BW3A 3JVJA 5DKHA 4YK0A 5L99A 5DKCA 4TT2A 3ONIA 5HENA 3D1BA 2OO1A 5CRZA 3Q2EA 4NS5A 5AMFA 2YELA 4WHUA 5L97A 5LKTA 3G0LA 4LZ2A 4J0SA 5D25A 2KTBB 5H1TA 4BJXA 4O78A 3O34A 4NQNA 5L96A 4UYFB 5EVAA 2DWWA 3UV4A 1F68A 5HLSA 5ENBA 4QUTA 3UVDA 4HXSA 4GPJA 4UIVA 4NQMA 4C66A 5A5PA 5IGLA 4OGJA 5II2A 4XUAA 4J1PA 3HMEA 4IORA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IR3 A;  5E3D A;  4QBM A;  4MR4 A;  5FG5 A;  5I7X A;  4A9K A;  5LJ1 A;  2DVS A;  4NR4 A;  2RS9 B;  4LDF A;  5EWD A;  5HM0 A;  4QYD A;  5IBN A;  5FB1 A;  5CUD A;  5FE4 A;  4YYK A;  5FH6 A;  4HXP A;  4Y03 A;  4LC2 A;  4E96 A;  5AD3 A;  5FFV A;  3O33 A;  3QZV A;  4HXO A;  3U5O A;  4QB3 A;  5DYU A;  3NXB A;  5FDZ A;  5DFB A;  5G4R A;  4A9N A;  5ENF A;  2I7K A;  5ETD A;  5ENC A;  5DW2 A;  5A81 A;  5F5Z A;  1WUM A;  2OUO A;  5EV9 A;  4J0R A;  5H85 A;  2LSP B;  5L8U A;  5EWW A;  4LYI A;  5F62 A;  4UIW A;  5CQT A;  5L8T A;  5CUC A;  4YC9 A;  4N3W A;  4MR3 A;  4PCE A;  4NR5 A;  4UIU A;  3ZYU A;  2R0Y A;  4N4H A;  5D3R A;  2YDW A;  5HFR A;  4YYM A;  5I40 A;  5A85 A;  5F3A A;  4TTE A;  1E6I A;  5FG6 A;  4O7B A;  4TS8 A;  4ZC9 A;  2DVR A;  2R0V A;  3P1C A;  4Z6H A;  4Q0O A;  4UIY A;  4NYV A;  4MEP A;  5LUU A;  5F61 A;  5AME A;  3UVX A;  5F1L A;  2N9G A;  4QSX A;  2DVV A;  5FH8 A;  5FE7 A;  4QC1 A;  3U5J A;  4IR4 A;  4O7C A;  5A7C A;  3JVK A;  4CFK A;  4YAX A;  5I88 A;  2GRC A;  4QC3 A;  3IU6 A;  4O74 A; 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