5F4NA

Multi-parameter lead optimization to give an oral chk1 inhibitor clinical candidate: (r)-5-((4-((morpholin-2-ylmethyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)pyrazine-2-carbonitrile (cct245737)
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
267
structure length
258
Chain Sequence
FVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
publication title Multiparameter Lead Optimization to Give an Oral Checkpoint Kinase 1 (CHK1) Inhibitor Clinical Candidate: (R)-5-((4-((Morpholin-2-ylmethyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)pyrazine-2-carbonitrile (CCT245737).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 77
structure length 258
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5f4nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5f4nA01
3PP0A 2UZVA 3FSFA 3FC2A 4RJ7A 1QCFA 3KK9A 2X8EA 3NYNA 4AACA 2YIYA 5DFPA 3EZVA 4QMPA 5KE0A 3CLYA 1PHKA 3FXXA 5LMKA 3FLQA 3VQHA 4CFUA 3Q32A 5HVJA 2ZB1A 2YM4A 3O7LD 4I1ZA 4NUSA 5AAEA 3QD3A 1GY3A 3UNJA 4ASZA 3E7OA 5JKGA 5LVNA 2HK5A 1YXTA 2J5EA 3EWHA 2C6TA 3OTUA 4DCAA 2WHBA 4FZDB 2HW7A 4V0GA 5E8WA 2PULA 5F20A 4F9AA 4RA5A 3QC4A 5DWRA 3KRWA 5ITAA 3IDBA 1XQZA 4LV8A 3PPJA 3PIZA 2VTSA 2JFLA 5E92A 3UOKA 4ZY4A 3BE2A 3NNVA 3ZLWA 3I60A 4FE2A 3AOXA 3FZ1A 5H3QA 3EFWA 1OUYA 2PE0A 5A4TA 5FEDA 2GS2A 4R1YA 5E8YA 2BHHA 1JKTA 2VTPA 3C7QA 3HMMA 4AZWA 4M69B 1IEPA 4OT6A 3KXMA 1ZLTA 5M4FA 4MTAA 3UZPA 3NCZA 3KXHA 4LG4A 4ZSEA 2VO6A 5C4LA 1PW2A 4WBOA 3ACJA 5E8ZA 2BIYA 1XKKA 3UIBA 5AAGA 2OBJA 3G51A 1IG1A 5IDPA 4Q9ZA 1MRVA 4O2ZA 3A62A 4RC3A 4XP3A 3Q3BA 3SHEA 3OWKA 4F4PA 1BMKA 4RJ3A 1LR4A 3GQIA 4CEGA 1H1WA 3IO7A 2I7QA 4USDA 4TN6A 3RNIA 3TIZA 1Q3WA 3HV7A 4FV0A 2WMVA 4MBIA 4O7YA 2G2HA 3OCGA 3JPVA 3HGKA 4O0RA 5C4KA 2CKOA 4LRMA 2WOTA 3IW8A 5EYDA 3W1FA 1Q5KA 4PL3A 3PG1A 5KMOA 2PMIA 2BKZA 4DH3A 3ZUVA 1YXXA 4AP7A 4RIYA 3L8XA 3GU5A 3F7ZA 1Q41A 3MGYA 1JPAA 4FT0A 2OIDA 3MA6A 2WTDA 4OGRA 5AP5A 1R0PA 2C6EA 3HA6A 4U81A 1O6YA 2ERZE 3W32A 4I5MA 4ANQA 5L8KA 2Z7QA 4OW8A 2BIKB 5HTCA 4CFNA 3ZOSA 4F09A 3PSBA 1YOLA 1S9IA 4HVHA 3NX8A 3KRXA 4F6SA 2WEIA 3MTFA 2ITXA 2XEYA 3QBNA 3Q4TA 5AP7A 4RA4A 4D5HA 3LHJA 2CDZA 3BCEA 4JRNA 4ZSJA 5ETIA 3SW7A 3FQSA 4OTPA 2J2IB 3QQHA 4OTDA 4QTAA 2CGXA 3QTRA 3ZYAA 4BRXA 2X4FA 4L68A 5ETCA 3QU0A 5CEKA 4QTEA 4D58A 3K3IA 2PVMA 3OT8A 3A61A 2QD9A 3WILA 3NUAA 2HY81 4G9CA 5FWKK 2BDJA 3DK3A 3VW6A 5IA1A 2UZTA 4ANNA 3JR1A 4R5YA 3OEFX 1LUFA 3FY0A 4DGLC 2VV9A 3MJ1A 3O71A 3R00A 3RJCA 2PMNX 1JLUE 4OTHA 5EG3A 3CPBA 3ATSA 4HPTE 4FV2A 2OJFE 3E8NA 2YCQA 4USEA 2C5YA 4V04A 1OPKA 1WBVA 2PVRA 3HYHA 5FXQA 2IO6A 3F2NA 2IW8A 2IVVA 2IZRA 3WF9A 2WTJA 4CG9A 3PWDA 2VWZA 4MF0A 4U3ZA 5AA9A 2BFXA 3VAPA 3QRTA 2WMSA 2QC6A 4FKGA 4XV9A 4E5AX 3NUPA 3AC4A 4EHGA 4NM5A 4TYHA 4FV5A 4RFYA 3O2MA 4BDIA 2C6LA 4K33A 1IA8A 4YJVA 3KC3A 5GIPE 3NMUF 4G17A 2QO9A 5FEQA 4AE9A 3ZRMA 4WSYA 3V6SA 4MXYA 1FVRA 3RM7A 2YISA 3MN3A 3KREA 4U8ZA 4IZ7A 1H08A 2CNUA 4M0ZA 4WKQA 2R3GA 4LMNA 2ITOA 4NWMA 3NNXA 1H8FA 5IQBA 2WQOA 5CEIA 4XG7A 4PRJA 2EU9A 2WKMA 1B39A 1OL5A 4W8EA 2C1AA 2PZPA 3BELA 1H1PA 2WEVA 3SGCA 1JBPE 4QP6A 4BDFA 3VUIA 5JFWA 3D94A 2GMXA 5KHWA 2B7AA 4TXCA 3CSVA 3AQVA 4G3EA 2JC6A 4K0YA 3EYHA 4Z3VA 1FVTA 3QZFA 2WZJA 3QKMA 1KOBA 2G15A 4BWXA 1K3AA 3SVVA 3U6JA 4GVJA 3VJOA 2PUPA 4O84A 4IDVA 3T9TA 4PNKA 1WBNA 2OF2A 5KBRA 5IH4A 5A3XA 2Y0AA 4UALA 5IG1A 4GG7A 3O8UA 3LPBA 4X7QA 3NPCA 4FYNA 4MK0A 3ZFYA 1ZY4A 3V8WA 1BUHA 5FQDC 4CKJA 4JG7A 1Z5MA 4ZTQA 2C5VA 4RT7A 4NEUA 2YM5A 3R71A 3ELJA 2W1DA 3MVHA 3RALA 3D83A 5DR2A 5IQDA 3NUUA 4P5ZA 3H10A 1J7IA 5IH5A 4I93A 4JBQA 3GP0A 2W1IA 2F57A 1MP8A 2WXVA 3FE3A 3KCFA 3DZQA 3P0MA 4FTCA 5HBEA 3R02A 5DG5A 4FIFA 2XNMA 4FMQA 4DFNA 4FEVA 3LMGA 3OEZA 1U5RA 2JLDA 2C47A 4WIHA 3W2PA 3MY0A 4EYJA 4BGQA 4NK9A 1P4FA 3NSZA 3PFQA 4J97A 5GNKA 2XCKA 4UV0A 1JSTA 1ZYCA 3GU8A 3FKNA 3S0OA 3A7IA 4XNEA 2CGVA 3V6RA 2I0HA 5EW8A 4C38A 4QMUA 2QOIA 5HE2A 4FSZA 4LFIA 3ORZA 4DEGA 3OWJA 5J5TA 3IDPA 1F0QA 4DAWA 4PY1A 3O7LB 3ZEPA 3NR9A 5JSMA 3VO3A 5F9EA 3E3PA 5E4HA 2C3LA 3I7CA 3Q52A 3R22A 4RVLA 4YC3A 5L2IA 4HW7A 1Y6BA 2GDOA 3DNEA 2UW0A 1FQ1B 4C4GA 2PUNA 3QRUA 2XKFA 4IDTA 5EI6A 3NVMB 2UW5A 1YWVA 3GFEA 3KY2A 3S00A 5H9BA 2QOOA 3LFAA 3KMUA 3KQ7A 3SRVA 4FKJA 5J79A 5M53A 1J7UA 4X0MA 3W33A 4FOCA 1QL6A 3R1QA 4FTUA 3CTQA 3WF5A 1OGUA 2IJMA 2DQ7X 3O50A 4TYJA 5M06A 3PY1A 3OHTA 4PMMA 4JDJA 1V0OA 5CSVA 4B0GA 3II5A 1OVEA 1TQPA 4QD6A 4UX9A 5L4QA 2FSOX 4GJ2A 4C0TA 4BY9E 1FINA 3S4QA 4BB4A 5AR7A 3GQLA 3TTJA 2IVTA 3ZM4A 2XF0A 5DRBA 2UZDA 3R7YA 4L43A 4D5KA 4PPBA 3UE4A 4TYEA 4FKVA 4KKHA 4TW9A 1H26A 4E93A 3EQPA 4FV9A 3DFCB 3VC4A 4CTCA 3D15A 5L3AA 4KA3A 3GCQA 4FKQA 3WZJA 4ACHA 1ZYLA 1RQQA 4WG3A 1R3CA 3ETAA 4XH6A 4DTAA 5GIOE 3RZBA 1JVPP 4L3JA 2O0UA 4IM3A 3ZONA 2C0IA 2ITTA 4QPSA 2QG5A 3MPTA 4K2RA 4A4OA 2ZAZA 4JDHA 3RM6A 4F9YA 5M4UA 4NYEA 4L3PA 3P4KA 2C0TA 4O96A 1UA2A 5TKDA 4IJPA 3KA0A 3QFVA 3IKAA 1XBAA 3GFWA 3NW5A 3SXSA 4KB8A 3RK5A 4F99A 4J96A 4NT4A 5L2SA 3PA3A 3UNKA 3FDNA 4MBLA 3EN7A 4FKSA 4AN9A 5AR2A 4NTSA 3C0HA 5FTQA 2EXMA 4HYSA 2Q0BA 5CQUA 4YC6A 2CGUA 4HGTA 1GNGA 3BGZA 3HDMA 3ZXZA 4K77A 4L44A 5K4JA 4IW0A 3TNPC 2XM8A 2QLQA 3E8EA 3GC8A 2XVDA 4DFBA 5HNBA 2WB8A 4QP1A 2XJ1A 3R9RA 1HOWA 3DBDA 3TNIA 3HV3A 4IWPA 4FIEA 1YDRE 4D2TA 4CZTA 2ZM1A 3CD3A 4FKPA 4TYHB 5I0BA 3KFAA 2ITQA 4FV6A 4O0TA 2BZJA 1P4OA 2BILB 2J4ZA 2ZB0A 4FK3A 3P78A 4CT2A 4UMPA 2GPHA 4FT3A 3IGOA 4NKSA 3R2BA 3I6UA 3NGAA 3NYVA 4FSWA 3PXZA 5L2QA 3MB7A 3VBTA 1PXMA 3RCDA 1H1RA 5AUZA 5B2LA 4QMZA 3VN9A 4L42A 1NVRA 5BYZA 1NW1A 5AUUA 5JQ5A 3TEIA 2V7OA 3VS5A 3RK9A 2F7ZE 2XZSA 4X3JA 3HLLA 3EL8A 1PF8A 2WTWA 2YFXA 4EWQA 4XG2A 2YZLA 1IRKA 1UNGA 2VTIA 3H9FA 4QQ5A 4X6RA 3PSCA 2I0YA 3FSKA 2PK9A 4FV4A 4C4EA 2XNPA 2W1EA 1Y8YA 2HOGA 2JAVA 4CLIA 3U9CA 1OL6A 2B9JA 2JAMA 4DFZE 3JXWA 2KULA 5JRSA 3NW6A 4JLCA 3FI3A 4MAOA 3QD4A 3SV0A 4EH4A 2PU8A 3W16A 1GZ8A 1PYEA 4LL5A 2Y6OA 4NIFA 5DIAA 4KABA 4FODA 5CU6A 3JY0A 4HZRA 2QU5A 1NVSA 4XBUA 3MYGA 4ONAA 5B0XA 5HHWA 4ORKA 3KB7A 4GFMA 4JBVA 4TWNA 5AP4A 1J1CA 3BZ3A 3GC7A 5AM7A 3FMEA 5I3OA 3T3UA 2E9PA 2WMUA 2GNGA 3FZOA 4RJ4A 4EZ7A 3ORTA 4FTRA 3R30A 4A9YA 4E4XA 4LGHA 4ZY5A 5CXHA 4EWHA 4DT8A 4KBKA 4L53A 4OUCA 5CWZA 1U5QA 2PE2A 3M2WA 3MH1A 5CEMA 4FTJA 4U42A 1YI4A 3E87A 4Y73A 4FT7A 5E91A 2OZAB 1CM8A 3OOMA 4JR3A 4MH7A 5EFQA 4F0FA 4I5CA 3ATTA 4MEDA 3RI1A 4ALUA 3E92A 3F66A 3RHKA 4B9DA 4WUNA 2HZIA 5B7VA 3DXQA 5D12A 2DUVA 2ITNA 3IS5A 3R6XA 3KCKA 1JNKA 3ZCLA 3KRLA 3KXXA 4U0IA 3DKGA 3VS6A 4H3PA 4RC2A 4APCA 2EWAA 3CS9A 4XOYA 2O65A 3AT2A 3O51A 3LJ1A 3OCSA 4HOKA 4IAKA 5EYMA 2OLCA 1OIUA 5HE0A 4BYIA 4ZLOA 1AGWA 4ZP5A 3VHKA 4F7SA 3JYAA 4DT9A 4DH8A 2W1ZA 1H25A 3DJ6A 4A07A 3C4ZA 4C35A 4UMUA 4MNEA 3C0GA 3OS3A 5CI6A 3KN6A 3TNHA 4RRVA 3KN5A 4KBAA 5IA4A 4ANSA 4DFYA 1DAYA 1FGKA 4ZZMA 1YOJA 3REPA 3SD0A 3N9XA 3BU5A 5E8SA 4IWOA 2QLUA 3TNWA 3V3VA 4CSVA 3LOKA 4IC8A 1OI9A 3ZS5A 3R8UA 2JKOA 4H58A 4ACDA 4X3FC 2B0QA 1E1XA 3F5GA 5TT7A 3TDVA 2Y8OA 4TWPA 4IM0A 3GVUA 3LXLA 3PA5A 3E93A 3NWWA 5J7HA 1BLXA 1QPCA 2CLXA 3O17A 4NCTC 3U6IA 2YM6A 3OCBA 1CKPA 4XV3A 2XIZA 5AUWA 4V01A 5KMLA 5D7AA 3AD6A 3DNDA 3DLSA 3PDTA 3P23A 3F69A 4L67A 3BKBA 4FTLA 4BIBA 5EDRA 3ORIA 1OITA 2CLQA 4FNZA 4BDEA 2GNHA 1SZMA 3OW3A 5C01A 4S34A 3DQWA 1J3HA 1QPDA 5IMXA 4E3CA 4G5PA 3WIGA 4C62A 5FRIA 4U41A 5AX3A 4BZOA 2EXCX 4AWIA 3NAYA 4LGGA 1P14A 3FZTA 4FG9A 4TYGA 3NUYA 5DVRA 4M69A 3DTWA 3EN9A 3QQKA 2GFCA 1J7LA 2CNVA 4FSRA 3WE8A 4PWNA 1H00A 4DGGA 4EH3A 2XIYA 5ANEA 2QHNA 5A9UA 4EQUA 3PJ8A 3ORNA 3DV3A 4N70A 3CQEA 5IUHA 3MJ2A 4I23A 5HI2A 2PSQA 5EKOA 2F2CB 3F5UA 4UMRA 4FUXA 3RPOA 2R3QA 4BBMA 2C4GA 3D5WA 4HGLA 5AP2A 3CR0A 3VRYA 5IQAA 4V05A 5FD2A 1IR3A 2GNLA 5E8VA 4QMTA 1MQBA 4DLJA 3QRKA 2JEDA 4D2VA 2C3KA 2VWIA 1UV5A 4M66A 2C6OA 2WQNA 4S2ZA 4C3RA 3ORKA 4IM2A 4M3QA 1CMKE 2WMRA 2YIQA 1KE8A 3OTVA 3QUPA 3TCPA 2CCHA 2PVLA 2XK6A 3PSDA 4QQCA 4O6EA 3H30A 4FTIA 2VO0A 3QTWA 1WCCA 3HRBA 3SC1A 4YUQA 3DTCA 5ETAA 2Z8CA 2DYLA 3BQCA 3SAYA 3U51A 4BCQA 2XBAA 2OI4X 1CKIA 1BL7A 5EOLA 5DN3A 3AD4A 4RGJA 3BGPA 4IC7A 5JMSA 3R0TA 4YZDA 4L7FA 1H07A 2XS0A 3HV5A 3VBXA 4EOOA 1XH6A 5F95A 3F7WA 5AJQA 4FSYA 4MHAA 5GZ9A 3FZSA 4I41A 2QURA 2W96B 3HMPA 3PJCA 4D1XA 3D2KA 3BLHA 3OZ6A 2PVFA 4BL1A 3LJ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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