5F4WA

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes in complex with tbp
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
ITLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
publication title NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
total genus 128
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f4wA00
3WJWA 4O0ZA 2YSWA 4IXXA 3EWUA 1OVDA 3ZS4A 3TUUA 1LROA 1SZFA 3UPWA 3S1VA 3STEA 1F5ZA 3L5AA 2NV2A 1HO4A 2B7NA 1CX9A 1OYCA 1GEQA 2B7PA 2NUXA 1OABA 2I9EA 2IQTA 3HMJG 2A1YA 3L21A 3QPYA 3NQ8A 3L0NA 2Q8LA 5D03A 1WAUA 4KWWA 4CQ8A 3DFTA 1XDLA 1DBTA 2Z1BA 4FO4A 3LX9A 3BK0A 4BI7A 3W74A 1F76A 3S5OA 3I6RA 2YX0A 4NX5A 1Q6RA 3L5MA 2QDGA 4CCDA 2YW4A 1DVJA 1EEPA 3NQ6A 2VFGA 1T0OA 5CSSA 2W6RA 1Q6LA 3LV5A 1EUNA 3W1QA 4Q4KA 4FX8A 3M5ZA 3O6DA 5D32A 3W7MA 1VQTA 1WV2A 1KM6A 2VELA 1ONRA 1JCYA 3GDMA 4TMCA 5FF2A 3M1ZA 3PB0A 1ZAIA 1AG1O 4MZ1A 4NZJA 2Y85A 2WSQA 3KOFA 4UUIA 3HG2A 2YYTA 3EX3A 1HTIA 5FI8A 4HPJA 4J9JA 2FTPA 1PE1A 2X1RA 4QNEA 2TMDA 4AEOA 3R12A 3EB2A 2FPTA 2VOMA 3EX2A 1KLYA 3SI9A 2VEPA 3LBMA 2QCDB 3IRDA 3EXSA 2P0OA 1O60A 2DP3A 3B8DA 1AMKA 1D9EA 1LRTA 1B4EA 1TCDA 3G0SA 2YXGA 3HOJA 3O6YX 4AVFA 3N19B 2R94A 4PA8A 1KLZA 3P7YA 1IXNA 3C3NA 2NX9A 3OVPA 1ICQA 1LBLA 1JJKA 3LTYA 3MO7A 3DGRA 3C56A 5DCDA 2QJHA 3M43A 3PUOA 4GC4A 4ZQOA 4E2DA 1WOBA 3HGRA 5HR6A 4JDYA 3MHGA 3EEGA 3DHDA 3W71A 2RDTA 1TTQA 3W23A 1ME7A 2B4GA 1H7XA 1QPQA 3FFSA 3W7QA 4E2BA 3NQEA 1JR1A 2DZTA 3EWYA 3RU6A 5FF0A 4G1KA 1QO2A 3P5ZA 3G1AA 4GNJA 3T55A 4A22A 3LXAA 2A6LA 2EHHA 3DFOA 4H6KA 1S5VA 4S2CA 5BMWA 3HGOA 3HJZA 3N34A 4U4MA 2PE4A 3OG3A 3B04A 1GVFA 3NG3A 3HGJA 3LHVA 3LDVA 4OV4A 1THFD 3TAKA 4Y6GA 3HQ1A 4ONVA 3UXAA 1VYPX 2VFDA 2QCMA 3F1QA 3W86A 2ZCGA 4EIVA 5AHEA 2DZXA 3HG4A 4FXRA 1GTEA 2CLOA 3KXQA 5AC8A 4S2BA 1SW3A 1MXSA 2FJKA 3S1WA 1ZALA 2DZVA 3INPA 5I3IA 3LI1A 2EKCA 5J5DA 2X2GA 1K3UA 4IMDA 4O15A 3BW2A 3CC1A 4X9SA 4A21A 1NF7A 2AAMA 5CG7A 1MEWA 2QEZA 3LOTA 5J5RA 1W3NA 2V30A 2BSLA 1F7BA 3CIXA 4JD4A 4UXDA 2TPSA 4LV9A 3Q94A 1ZNNA 2J6XA 2YFNA 3W7LA 4UTLA 3S6DA 5FEPA 3LM7A 1H7NA 3PB2A 1H7RA 4O57A 1EA0A 2ZZ2A 3PUDA 4A2RA 5I3FA 3T4CA 1GOXA 4JY9A 4OV9A 1GQNA 3MW7A 3N2XA 5LKYA 3GDTA 3QRHA 3VNDA 4MY1A 4QSHA 2ABBA 3G1HA 4RR4A 3NQAA 1LRQA 3G0XA 2XN0A 4O28A 1MEIA 2VFFA 1TB3A 1SO4A 1W5OA 2CLHA 4N4QA 4RLIA 4LWWA 2ZZ5A 3UY7A 1OFEA 4FIRA 4U28A 1FWNA 3NL2A 1OX4B 4NNCA 1K02A 3VI2A 3WJZA 3BGGA 1AL8A 1TPDA 1TRIA 4UR8A 1G4EA 1W5PA 4JICA 2V0TA 4HKPA 2OT1A 5LNWA 1H7OA 1W54A 1XDMA 2R14A 4XTDA 3WJXA 4JYDA 3ZWSA 4R53A 4MJMA 4OT7A 5FEZA 5DBUA 2CZDA 3LHTA 3PY2A 3C2OA 1LOLA 2TRSA 4PEKA 1Z42A 4HN4A 3DHFA 4O17A 1XFBA 3TAOA 3U2OA 1VPXA 2DORA 4LVFA 2ZZ7A 1XBZA 4XKYA 5KZMA 3BV4A 5AYYA 4AWUA 3F4WA 4OE7A 1SZGA 4MLRA 4WX2A 3A22A 2QCDA 2A4AA 3PR2A 3WK0A 3CT7A 3G22A 3PBVA 5CPNA 1C8VA 4D2JA 5K4ZA 3IVUA 4LVAA 4JTLA 4MLJA 4TO8A 5TIMA 3TCEA 1XBYA 3O07A 2JBMA 1IXPA 3LCWA 4E38A 4M6QA 1KFEA 1OK6A 1PL9A 1LM1A 1IXQA 4DXVA 4IMCA 2GVLA 4O53A 1KTNA 5D33A 3NNTA 2C14A 1DQXA 1JUKA 3S1XA 2WJZA 3IIXA 4K39A 3CWOX 2E68A 3EKZA 3QZEA 4AAJA 4HPXA 1RPXA 4JTTA 2CWNA 3LXBA 2BXVA 1DL3A 1WYIA 1CW2A 2ZQ0A 3TA6A 5K3VA 3W1NA 2NWSA 6ALDA 5CPOA 3NZRA 5EL1A 2H3BA 5H2ZA 4UTKA 3E49A 3S5NA 5HUOA 4FNRA 1X7FA 1JRBA 1FCUA 2Y63A 4FXSA 3TSDA 4XBKA 5D38A 1DJQA 1OFQA 4TU1A 2C1HA 4BK9A 3FJ6A 3KVMA 4JNMA 1M6JA 4Y96A 3L68A 3GR7A 1QOPA 2F7FA 2ZZ1A 3MHFA 4K37A 5D2XA 5EY5A 3FLUA 1WA3A 4O1DA 1D3GA 1UJPA 5AHNA 1ZY9A 1ZJIA 4Y90A 3W1XA 4S1FA 2QUTA 1KM0A 1JCMP 3LTPA 4TMBA 3SR7A 1UCWA 3W7JA 2TSYA 3NQGA 4JTEA 5CZ0A 5AYXA 3TDFA 3FKRA 1VGAA 5LNRA 2X1UA 5T26A 1ME9A 1VCGA 3WFAA 3LCFA 1SO3A 1FXQA 3C61A 2NXHA 4EOUA 5K4XA 1FDYA 2B7QA 3A21A 3CQ0A 3PVFA 4LC8A 5EKYA 4YWIA 2Y6ZA 3UZ5A 4Q33A 3WJSA 3LCHA 3DU0A 2Y7GA 4N6EA 4IPIA 1R2SA 2XFWA 4JYFA 1X8FA 4IMGA 1W5MA 2C18A 4HNNA 1EP1A 2E5CA 1XKYA 2QAFA 3GAYA 1FDJA 2ZYFA 1TV7A 3T40A 2FFCA 4UFHA 2NLIA 3GR8A 4BI6A 3CB8A 4TR9A 3W73A 3IEBA 3BPWA 3HF3A 3C2FA 5D05A 4UC5A 3DKJA 1K7FA 1TPB1 3LCLA 1OX4A 4MYAA 1L6SA 2ZRWA 4O8RA 1GYNA 3GXPA 3EXRA 2WO5A 3W7CA 3M44A 3NPXA 4C1KA 4WXZA 3KRUA 3C2RA 3LB0A 5FF3A 3Q2DA 5U7SA 3UWZA 5D2YA 4N02A 1SFLA 4O18A 3LCIA 4UCGA 1TQXA 4WY0A 3GXTA 1GG0A 3W1UA 4GE8A 1RQBA 1PCWA 3W7OA 1CI1A 1TTPA 1TPH1 2QKFA 1ZCOA 3M7WA 1R2RA 3P8JA 4LU0A 1JULA 1RR2A 1QAPA 4H4IA 3GYEA 5HNRA 1QNVA 3GVGA 4AF0B 4UTTC 2EGZA 4IJBA 4XUGA 3NM1A 2CLKA 1BKSA 4MYXA 5E93A 4BF9A 2O7SA 1B57A 2GPTA 4IX2A 1A5AA 3TW6A 4CNOA 4JY8A 3UWYA 1JCJA 2LLEA 4PFMA 5F2MA 4DBEA 2A0NA 1LLZA 1LLWA 3HO8A 3P67A 3TROA 3KVLA 2D73A 2XN2A 2O7QA 1ICSA 2A2IA 2NV1A 3B0PA 1VRDA 4CCEA 1VCFA 5CZJA 3TIMA 3W2NA 5CZSA 1ZAHA 3IGXA 4Y8FA 5K9CA 5G2HA 3O63A 1FUYA 1I2NA 2A85A 5EYWA 2G97A 2ZZ4A 3PSVA 2C19A 1A5SA 4ZMGA 4LVDA 5BMXA 3I7QA 2DU2A 3B03A 3M6YA 3DKLA 3NEVA 2FDSA 2BTMA 3DI1A 4MKNA 1MO0A 3H53A 3LXCA 3QF0A 4JX4A 1TV8A 4NXSA 1AW1A 2V5LA 4O13A 5HWJA 5E1QA 5BNKA 1R30A 4DO6A 3PSWA 3G24A 1L6YA 3NAVA 3UWQA 2CLIA 2ZTKA 1KFLA 3Q58A 3HPZA 4NJHA 3LBCA 2Y70A 1TPC1 1OFDA 1NF0A 4PC8A 3GNDA 3BGJA 4DPPA 4JDBA 3MP4A 2P1FA 3MBDA 1G4TA 4M7SA 4LUJA 4XQ6A 5A5WA 2PRLA 2GVJA 1OFAA 4XTIA 3N9RA 2BWGA 3TXVA 1R47A 3DBPA 1B4KA 1DOSA 3NM3A 1Q6OA 3QSRA 2ZRZA 3IVTA 1UASA 1PIIA 4HHPA 4QJ1A 4NVTA 1JQVA 4I7WA 1H1YA 1RD5A 3CEUA 3RLUA 2YFOA 4FX6M 1L2UA 1ZFJA 5CPLA 4UTUA 2Y7EA 1G67A 3L0GA 3UNDA 4OHQA 3U6WA 1YDNA 3R2GA 1L6WA 4L4MA 4Z08A 4ORMA 2X1SA 5EPDA 3L9CA 5K2ZA 1TO3A 1T99A 3QPZA 4AHOA 3STFA 1TMHA 4GUFA 2GQ9A 3QJAA 4O12A 3B06A 1F6PA 2HS8A 3MWAA 2B7OA 4JTIA 3W2UA 4UFMA 2Z2UA 1F74A 2KZHA 4O52A 4MZYA 1KFJA 3QYQA 4ZZ9A 3KVKA 4PCFA 3PM6A 1F6KA 1QMLA 3H55A 3MI2A 5AOUA 4RZ5A 4JEQA 4JN6A 3TV8A 1X1OA 1WX0A 3HPSA 2E6AA 3LLDA 3T7VA 1ZHAA 3PUEA 4UTIA 3TJLA 2NX3A 3C52A 5CSRA 3BO9A 3E0IA 5KZDA 1SPQA 1M7OA 4X22A 5FESA 1ICPA 5LGXA 3ATZA 3M5YA 1DHPA 2HSAA 1SSDA 4WY0F 3C8FA 2FPVA 5C2XA 3DFQA 3QQ1A 4YL2A 2QAPA 2P10A 7TIMA 3G1FA 1M5WA 2CW6A 1OF6A 3STGA 4ZQCA 4DO4A 4R33A 3GAKA 1XC4A 5DELA 3LGEA 2CLFA 1VH7A 4AB4A 2VEKA 3HBLA 5L9FA 2E09A 3GK0A 1ALDA 3TSBA 3C0JA 1OYAA 1XCFA 1VLIA 4WQ6A 4UNKA 5K9XA 2E6DA 4LS0A 4N9BA 4BWLC 3L66A 2AGKA 2J24A 3TKFA 4RXFA 1VYSX 3LERA 4KFOA 3KHJA 2FPYA 1FCBA 4FB7A 5G2WA 4FNTA 4N9DA 3O06A 4MOZA 2RDUA 4M6PA 3CEPA 1KFBA 2A21A 2RFGA 4X2RA 1H60A 3UWVA 2FLIA 1QPOA 3PC0A 4RX0A 4KFPA 2J9ZA 2ZA2A 4DBDA 3GDLA 1DKWA 1LZOA 3HB9A 4IWWA 3UPBA 1J5TA 4UTTA 1J4EA 2F84A 3KRZA 2NUWA 4FHAA 5G1TA 1KM5A 3BG5A 3P80A 2G96A 2V81A 2JKPA 3N3MA 3WK3A 1UB3A 3I7SA 4TX9A 4I7VA 5ABTA 5KITA 3BG3A 3SSJA 4MY9A 2PC4A 1TQJA 3UZJA 3GKAA 2QJGA 1E51A 3BW4A 3R13A 1PHQA 2NXIA 4IXHA 4IX0A 3W7GA 1KM3A 4O19A 1OJXA 4IQLA 4AMAA 3QMSA 1QR7A 1YXDA 4JTGA 4XBSA 3W7KA 1RZMA 3JRKA 3W7RA 2ZDRA 2FQIA 3NQ2A 5HR7A 3W85A 1K8ZA 1QDSA 4DQWA 1N8FA 5LHEA 3W2MA 2GQ8A 2QCFA 4RXGA 3CTLA 3GLCA 4AWSA 4B5NA 1N7KA 1X1ZA 3W7PA 3S5ZA 3W9ZA 1HG3A 3M9YA 3EWZA 1I4NA 2JK2A 1TTIA 1YTEA 1DQWA 2YPIA 3QW4B 4ZQRA 5G4WA 4K38A 5AHLA 3I65A 3E9AA 4WOQA 1ZENA 3ABOA 3IIPA 4RZ6A 3CHVA 1DORA 1PCKA 2GQAA 4CLMA 3NXFA 3W76A 5G2IA 2I1OA 2WNZA 2QUUA 3M5XA 4Z1BA 2YCEA 4DO5A 5AHIA 3S8HA 2ZA1A 4LUIA 1FDZA 4LRTA 5LHFA 3ANYA 3P61A 4GFSA 5D2WA 1S3HA 1G7UA 1WBJA 4HT3A 4RKAA 4UFKA 5DXXA 4ORIA 5KZEA 2NZLA 4FF7A 2WQPA 3NGJA 4NU7A 1LORA 3N9SA 5LSMA 1I2OA 3DI0A 4N6FA 1IIHA 2AQWA 3FS2A 3WK1A 5AC6A 3L2IA 1NEYA 4YCPA 2H6RA 4AXKA 3OVRA 2Z6JA 3GX9A 4NT0A 1OFRA 3VE9A 3STCA 2PURA 5KMYA 5AC7A 1GTHA 2CU0A 1YTDA 1O5XA 3S1UA 4K36A 4LW7A 2EPHA 2NX1A 1GG1A 5FF7A 4MZ8A 4MFEA 3W1RA 4Z1CA 2VC6A 3SZ8A 4ZVJA 4UFLA 5EBUA 3TC6A 4PH6A 4C1LA 2YGYA 3DXIA 4OWGA 2FB2A 3PAJA 4UTWC 3QMTA 1ML1A 1EX5A 2Z6IA 3G0UA 1MEHA 1VC4A 3AJXA 1L9WA 1O4UA 1XUZA 1H7PA 1EWEA 1QWGA 1SR9A 3BLFA 1WDWA 1S5WA 4Z0JA 3C2EA 2V2DA 3NR0A 3GB6A 3DFNA 4O1AA 4A2SA 5F4SA 1S5TA 3NQFA 1OFBA 1Z44A 4JR5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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