5F61A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with ma4-022-1
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f61A01
4O7BA 5DYUA 2D82A 4HXPA 2OO1A 4KV4A 5FFWA 5DFCA 5CFWA 4TQNA 3P1EA 4PTBA 5CTLA 5HFQA 4QSUA 4CUPA 4A9IA 5HFRA 5EA1A 4QSWA 4IR4A 5C8GA 5FE7A 5F36A 3MQMA 4NS5A 5FBXA 3UVXA 4YBMA 5EWDA 4NXJA 4O76A 5EQ1A 4YABA 4QSSA 1JSPB 5DFDA 5HRVA 3IU5A 4NR5A 4NR9A 5G4RA 3SVGA 3MB3A 5I29A 4QSRA 4TT6A 5LKZA 2N9GA 4Q0OA 4QYLA 3SVFA 4QYDA 5EVAA 2KTBB 5ENCA 4YYNA 5I7XA 4QSTA 5A5SA 5IBNA 4QSPA 5DLXA 4HBVA 5HCLA 2H60A 5D3PA 3U5JA 3UVDA 4CFLA 4MR5A 4QSXA 2I7KA 5I86A 5KHMA 4A9KA 4IOOA 2I8NA 4UIVA 4UIXA 3JVKA 4LRGA 5HQ5A 4YC9A 4TYLA 4NYXA 5CRZA 4C67A 5F1LA 3O36A 1ZS5A 2RO1A 4J0RA 4C66A 4UIWA 5C89A 4YYIA 4E96A 5L99A 4F3IA 4QR3A 4UYGA 4HXKA 5DKHA 5ENBA 5FE2A 4NRAA 4MR3A 4TTEA 5IGLA 3DAIA 5DW1A 3O34A 3UV2A 4N4IA 2RNXA 4MR6A 5CQ5A 4PCIA 2FSAA 5L96A 4NQNA 4TT2A 5CP5A 5A5QA 2DATA 5DYXA 2E3KA 4CUQA 5DY7A 4IR5A 5FG5A 4UYDA 5A83A 4N4HA 5DX4A 3I3JA 3JVMA 5D26A 5E74A 4CL9A 4HXLA 5CY9A 3U5OA 5D3JA 3D7CA 3U5KA 5F61A 4OGJA 5D3RA 4TU6A 3RCWA 3LQIA 4LC2A 5BT4A 2R0VA 2YDWA 2YEMA 3HMFA 4YAXA 4IR3A 4BW2A 4QEWA 5A7CA 4TU4A 4YH3A 5FH6A 4QUUA 5K29A 5EICA 4KV1A 5D25A 3G0JA 4WHWA 4UYFA 4HBXA 4UIUA 5CQ7A 5J0DA 4QSQA 5EPSA 4MEQA 5ETBA 3AADA 5FE6A 4QC1A 4A9LA 5EI4A 3Q2EA 5E9YA 4BHWA 4HBYA 4J3IA 5A5NA 3S91A 5DW2A 2R0SA 5HM0A 4LZSA 5DBMA 3LQJA 3LQHA 5BT3A 4AKNA 2DVQA 4O78A 4ZW1A 5KO4A 5ACYA 4A9OA 3O35A 5EPRA 2MJVB 4O72A 5ENFA 4Z93A 5A5PA 4MENA 4YYKA 5L98A 5I89A 2DKWA 4TZ8A 5EWHA 3HMEA 5CQ3A 5CUBA 4FLPA 5EWVA 4ALHA 4NR8A 4A9JA 1WUMA 5LUUA 5LVQA 3K2JA 1N72A 2WP1A 5IGKA 5AMEA 5FB1A 1WUGA 4X2IA 5A5RA 4O75A 2NXBA 3UVWA 4NRBA 2YELA 5F1HA 5LJ0A 5LJ2A 5CQTA 4HXOA 5EISA 5D3LA 5CRMA 5II2A 5CQ6A 2RNWA 4PY6A 5EWCA 2R10A 4A9NA 4BW3A 5CUAA 3O37A 3S92A 5FE5A 4WIVA 5HRWA 4O74A 5CUEA 5FFVA 5F25A 4UYHA 5AD2A 4MEOA 5IIDA 4RVRA 4O7EA 5D3TA 4OGIA 4QZSA 4BJXA 5KTUA 4IOQA 5F63A 3ZYUA 5FE0A 5F62A 4YY6A 5D3HA 4UYFB 4KCXA 2YW5A 4ALGA 5I80A 5EM3A 2F6NA 5I40A 2RNYA 2YEKA 4MEPA 5HENA 5AMFA 5F5ZA 5FE8A 3TLPA 3IU6A 4N4GA 5CGPA 5C7NA 4IORA 5EWWA 5ENIA 4QEUA 2RS9B 5CU8A 3SVHA 2D9EA 2DVVA 4GPJA 5IGMA 5L8UA 5CZGA 5FG6A 2L85A 5EP7A 4J0SA 4A9FA 5HLSA 5DKCA 5FG4A 4YYMA 5E9LA 4QY4A 5E9KA 5KTWA 4NYWA 5CQAA 2GRCA 4QNSA 4Q0NA 2DWWA 4YADA 5HJCA 4CUSA 5JWMA 3DWYA 5F2PA 5E73A 2DVSA 3QZTA 4HBWA 5L8TA 5C85A 4YBTA 3AQAA 4NR6A 3U5PA 3HMHA 2WP2A 5CQ4A 5A5OA 4O77A 5FE3A 5JI8A 5H1TA 4XYAA 1E6IA 4PCEA 5EU1A 4QR5A 4J1PA 5HEMA 3JVLA 5ENJA 3MB4A 5L97A 4CFKA 4NQMA 5E3DA 5AD3A 4LYSA 4UITA 5FH8A 5ENGA 4NR7A 4YY4A 5H1VA 5D3SA 4QBMA 5DFBA 3G0LA 4YATA 3GG3A 5EGUA 4QR4A 4YYDA 4LDFA 5HQ6A 5ENEA 4OUFA 5CUCA 4TT4A 5FDZA 4Y03A 5I7YA 5DYCA 5A81A 3O33A 1EQFA 4WHUA 3MULA 5D24A 5TB6A 5DYAA 2OSSA 3P5OA 2L84A 5LVRA 5LJ1A 2R0YA 5FB0A 4ZQLA 5F60A 5COIA 5G4SA 5CUDA 4UIZA 3JVJA 4Z6HA 5E7DA 3MUKA 3Q2FA 4A9HA 2F6JA 5E0RA 2OUOA 5IG6A 2L5EA 5I88A 4YYGA 5LKUA 5HQ7A 4IR6A 3P1CA 2E7NA 4N3WA 5CS8A 2YYNA 4YH4A 3UVYA 5IGNA 5E9MA 5FFYA 5LKTA 5FH7A 4YBSA 4O7CA 4CURA 5E9VA 4LZRA 4NUEA 5E9IA 5D7XA 2E7OA 4UYEA 5H85A 4NYVA 4NUDA 4QUTA 4DONA 4YK0A 1F68A 4O71A 5E3GA 4TS8A 2YQDA 4QB3A 5DLZA 3U5MA 3UV4A 4TZ2A 5TCMA 3QZVA 4MR4A 5EK9A 5FE9A 2DVRA 3P1DA 3QZSA 5CQ8A 4N4FA 4O7FA 5KU3A 5I1QA 5II1A 5A85A 5CUGA 4LYWA 5D3NA 4YYHA 5DKDA 5ENHA 4HXNA 4PS5A 4QEVA 4CUUA 3LXJA 4HXSA 5FE1A 4XY8A 5H1UA 3UV5A 4O7AA 3FKMX 4BW4A 5ETDA 5F3AA 2RI7A 4QC3A 4ZC9A 2RFJA 4CUTA 5I83A 4HXRA 5HRXA 4LZ2A 1X0JA 2LSPB 5C4QA 5A82A 4A9MA 4NUCA 5LKXA 5HELA 4UIYA 4A9EA 4BW1A 3NXBA 4YYJA 4PKLA 3P1FA 4Z6IA 4Z1QA 5EV9A 4QSVA 4XUAA 5BT5A 5FE4A 5CPEA 4Z1SA 4O70A 4NRCA 4LYIA 3U5NA 3MXFA 4CLBA 3ONIA 4HXMA 3UW9A 5EPBA 3LJWA 1JM4B 4NR4A 3U5LA 5D0CA 4XUBA 5KTXA 4XY9A 2G4AA 4LR6A 5C87A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7BA 5DYUA 2D82A 4HXPA 2OO1A 4KV4A 5FFWA 5DFCA 5CFWA 4TQNA 3P1EA 4PTBA 5CTLA 5HFQA 4QSUA 4CUPA 4A9IA 5HFRA 5EA1A 4QSWA 4IR4A 5C8GA 5FE7A 5F36A 3MQMA 4NS5A 5FBXA 3UVXA 4YBMA 5EWDA 4NXJA 4O76A 5EQ1A 4YABA 4QSSA 1JSPB 5DFDA 5HRVA 3IU5A 4NR5A 4NR9A 5G4RA 3SVGA 3MB3A 5I29A 4QSRA 4TT6A 5LKZA 2N9GA 4Q0OA 4QYLA 3SVFA 4QYDA 5EVAA 2KTBB 5ENCA 4YYNA 5I7XA 4QSTA 5A5SA 5IBNA 4QSPA 5DLXA 4HBVA 5HCLA 2H60A 5D3PA 3U5JA 3UVDA 4CFLA 4MR5A 4QSXA 2I7KA 5I86A 5KHMA 4A9KA 4IOOA 2I8NA 4UIVA 4UIXA 3JVKA 4LRGA 5HQ5A 4YC9A 4TYLA 4NYXA 5CRZA 4C67A 5F1LA 3O36A 1ZS5A 2RO1A 4J0RA 4C66A 4UIWA 5C89A 4YYIA 4E96A 5L99A 4F3IA 4QR3A 4UYGA 4HXKA 5DKHA 5ENBA 5FE2A 3D1DA 4NRAA 4MR3A 4TTEA 5IGLA 3DAIA 5DW1A 3O34A 3UV2A 4N4IA 2RNXA 4MR6A 5CQ5A 4PCIA 2FSAA 5L96A 4NQNA 4TT2A 5CP5A 5A5QA 2DATA 5DYXA 2E3KA 4CUQA 5DY7A 4IR5A 5FG5A 4AKIA 4UYDA 5A83A 4N4HA 4AKGA 5DX4A 3I3JA 3JVMA 5D26A 5E74A 4CL9A 4HXLA 5CY9A 3U5OA 5D3JA 3D7CA 3U5KA 5F61A 4OGJA 5D3RA 4TU6A 3RCWA 3LQIA 4LC2A 5BT4A 2R0VA 2YDWA 2YEMA 3HMFA 4YAXA 4IR3A 4BW2A 4QEWA 5A7CA 4TU4A 4YH3A 5FH6A 4QUUA 5K29A 3D1BA 5EICA 4KV1A 5D25A 3G0JA 4WHWA 4UYFA 4HBXA 4UIUA 5CQ7A 5J0DA 4QSQA 5EPSA 4MEQA 5ETBA 3AADA 5FE6A 4QC1A 4A9LA 5EI4A 3Q2EA 5E9YA 4BHWA 4HBYA 3VKHA 4J3IA 5A5NA 3S91A 5DW2A 2R0SA 5HM0A 4LZSA 5DBMA 3LQJA 3LQHA 5BT3A 4AKNA 2DVQA 4O78A 4ZW1A 5KO4A 5ACYA 4A9OA 3O35A 5EPRA 2MJVB 4O72A 5ENFA 4Z93A 5A5PA 3ERRA 4MENA 4YYKA 5L98A 5I89A 2DKWA 4TZ8A 5EWHA 3HMEA 5CQ3A 1ZKRA 5CUBA 4FLPA 5EWVA 4ALHA 4NR8A 4A9JA 1WUMA 5LUUA 5LVQA 3K2JA 1N72A 2WP1A 5IGKA 5AMEA 5FB1A 1WUGA 4X2IA 5A5RA 4O75A 2NXBA 3UVWA 4NRBA 2YELA 5F1HA 5LJ0A 5LJ2A 5CQTA 4HXOA 5EISA 5D3LA 5CRMA 5II2A 5CQ6A 2RNWA 4PY6A 5EWCA 2R10A 4A9NA 4BW3A 5CUAA 3O37A 3S92A 5FE5A 4WIVA 5HRWA 4O74A 5CUEA 5FFVA 5F25A 4UYHA 5AD2A 4MEOA 5IIDA 4RVRA 4O7EA 5D3TA 4OGIA 4QZSA 4BJXA 5KTUA 4IOQA 5F63A 3ZYUA 5FE0A 5F62A 4YY6A 5D3HA 4UYFB 4KCXA 2YW5A 4ALGA 5I80A 5EM3A 2F6NA 5I40A 2RNYA 2YEKA 4MEPA 5HENA 5AMFA 5F5ZA 5FE8A 3TLPA 3IU6A 4N4GA 5CGPA 5C7NA 4IORA 5EWWA 5ENIA 1PUOA 4QEUA 2RS9B 5CU8A 3SVHA 2D9EA 2DVVA 4GPJA 5IGMA 5L8UA 5CZGA 5FG6A 2L85A 5EP7A 4J0SA 4A9FA 5HLSA 5DKCA 5FG4A 4YYMA 5E9LA 4QY4A 5E9KA 5KTWA 4NYWA 5CQAA 2GRCA 4QNSA 4Q0NA 2DWWA 4YADA 5HJCA 4CUSA 5JWMA 3DWYA 5F2PA 5E73A 2DVSA 3QZTA 4HBWA 5L8TA 5C85A 4YBTA 3AQAA 4NR6A 3U5PA 3HMHA 2WP2A 5CQ4A 5A5OA 4O77A 5FE3A 5JI8A 5H1TA 4XYAA 1E6IA 4PCEA 5EU1A 4QR5A 4J1PA 5HEMA 3JVLA 5ENJA 3MB4A 5L97A 4CFKA 4NQMA 5E3DA 5AD3A 4LYSA 4UITA 5FH8A 5ENGA 4NR7A 4YY4A 5H1VA 5D3SA 4QBMA 5DFBA 3G0LA 4YATA 3GG3A 5EGUA 4QR4A 4YYDA 4LDFA 5HQ6A 5ENEA 4OUFA 5CUCA 4TT4A 5FDZA 4Y03A 5I7YA 5DYCA 5A81A 3O33A 1EQFA 4WHUA 3MULA 5D24A 5TB6A 5DYAA 2OSSA 3P5OA 2L84A 5LVRA 5LJ1A 2R0YA 5FB0A 4ZQLA 5F60A 5COIA 5G4SA 5CUDA 4AKHA 4UIZA 3JVJA 4Z6HA 5E7DA 3MUKA 3Q2FA 4A9HA 2F6JA 5E0RA 2OUOA 5IG6A 2L5EA 2EJNA 5I88A 4YYGA 5LKUA 5HQ7A 4IR6A 3P1CA 2E7NA 4N3WA 5CS8A 2YYNA 4AI6A 4YH4A 3UVYA 5IGNA 5E9MA 5FFYA 5LKTA 5FH7A 4YBSA 4O7CA 4CURA 5E9VA 4LZRA 4NUEA 5E9IA 5D7XA 3VKGA 2E7OA 4UYEA 5H85A 4NYVA 4NUDA 4QUTA 4DONA 4YK0A 1F68A 4O71A 5E3GA 4TS8A 2YQDA 4QB3A 5DLZA 3U5MA 3UV4A 4TZ2A 5TCMA 3QZVA 4MR4A 5EK9A 5FE9A 2DVRA 3P1DA 3QZSA 5CQ8A 4N4FA 4O7FA 5KU3A 5I1QA 5II1A 5A85A 5CUGA 4LYWA 5D3NA 4YYHA 5DKDA 5ENHA 4HXNA 4PS5A 4QEVA 4CUUA 3LXJA 4HXSA 5FE1A 4XY8A 5H1UA 3UV5A 4O7AA 3FKMX 4BW4A 5ETDA 5F3AA 2RI7A 4QC3A 4ZC9A 2RFJA 4CUTA 5I83A 4HXRA 5HRXA 4LZ2A 1X0JA 2LSPB 5C4QA 5A82A 4A9MA 4NUCA 5LKXA 5HELA 4UIYA 4A9EA 4BW1A 3NXBA 4YYJA 4PKLA 3P1FA 4Z6IA 4Z1QA 5EV9A 4QSVA 4XUAA 5BT5A 5FE4A 5CPEA 4Z1SA 4O70A 4NRCA 4LYIA 3U5NA 3MXFA 4CLBA 3ONIA 4HXMA 3UW9A 5EPBA 3LJWA 1JM4B 4NR4A 3U5LA 5D0CA 4XUBA 5KTXA 4XY9A 2G4AA 4LR6A 5C87A
chains in the Genus database with same CATH topology
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