5F81A

Acoustic injectors for drop-on-demand serial femtosecond crystallography
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Acoustic Injectors for Drop-On-Demand Serial Femtosecond Crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 41
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5f81A00
1IP5A 1YAPA 1DZBX 3QE8A 1GF3A 1LZNA 5DN5A 3AYQA 3WH1A 4B4JA 4XYYA 1LSGA 1WVUA 1LKRA 4ETCA 1BGIA 1WQQA 5I4WA 1AZFA 4XJGA 4B0DA 1CKFA 4XJIA 4BADA 5KXYA 1GDXA 2HEEA 1GB0A 3N9CA 3TMVA 4XN6A 4LGKA 4WM6A 1ZV5L 1MELL 4OWAA 5F9XA 4AXTA 1VFBC 1IR9A 5A3EA 4H90A 3TMWA 1IP1A 2LYOA 2ZIKA 4HV2A 1OUHA 4H9HA 4WLXA 1NBZC 4NSGA 4TUNA 1LZ8A 1FN5A 2LYMA 3B0OA 5KY1A 3TXIA 1QTKA 1KIPC 9LYZA 4NGJA 4NWEA 5JENB 3M3UA 5FELA 1VAUA 4YM8A 1JWRA 1LSCA 1BB7A 3CQLA 2LYZA 1J1PY 4ETDA 1UCOA 1HEWA 3A90A 2H9KA 2BQDA 3E3DA 2FBBA 5KXZA 1JPOA 1LZSA 3AZ5A 1LCNA 1LZBA 5LYZA 7LYZA 1VDPA 5FDJA 5KKJA 1REXA 3ATOA 1IP4A 5LVIA 1IR7A 4NGLA 4TSCA 1NF5A 1HFXA 1IC7Y 1VDSA 1LJ4A 1LMCA 4NHTA 2G4NA 3TXJA 2RSCA 4XJDA 5LAFA 1J1XY 1QSAA 4LYBA 1GF9A 1YKXX 1OQMA 5IELA 2Z18A 4LYCA 2C8OA 3N9AA 3WPKA 1BVKC 1YIKA 5DL9A 5LAGA 5KKIA 1H6MA 5B07A 1VDQA 4PJ2C 4B49A 1AM7A 1GFEA 1GE3A 3A91A 153LA 3AZ4A 2HEDA 193LA 5KXPA 4CHXA 3BKVA 1OUEA 5LXWA 1LHLA 1QDTA 4H9CA 1REYA 5F81A 4UWVA 1LMOA 1LSYA 4KXIA 4R6CA 4Z98A 3TMUA 2YVBA 4N0JA 4RLNA 1ALCA 1CJ7A 1AT5A 1JJ3A 1GF4A 1LMNA 2Z37A 1FKVA 3CT5A 3LZTA 1BWHA 1HF4A 3LYMA 3QNGA 3M18B 4N8ZA 4NG8A 1HMKA 5APEA 1LSEA 4DD0A 1RFPA 4CJ2A 3IJUA 5KXNA 3WUNA 2D4JA 1D0MA 1FDLY 1G7HC 4PPOA 1YANA 3AJNA 1YL1X 1BQLY 1WTNA 2IFFY 5C6LA 2PC2A 1B7LA 1LPIA 3EXDA 4OW1A 1IX0A 3RZ4A 3P4ZA 4WL6A 2DBTA 3W6AA 1A4VA 1GBSA 1WQOA 2HEBA 1UIEA 1NBYC 1B5XA 1HEPA 4DD7A 3OK0A 1IP6A 4RW1A 4WM4A 2Q0MX 5LA5A 1GF0A 1GHLA 1LJHA 3AW6A 2BQCA 4OWHA 2F2NA 3P66A 3W6BA 1GFGA 1CJ8A 1GXV2 1AT6A 1GXXA 3LYOA 2ZILA 3WU9A 3WYHA 1LHMA 1LTMA 2D4IA 4NGZA 3B0KA 5FSTA 1TDYA 1GB7A 4OOOA 3SP3A 5M1YA 1KIRC 2DQJY 5ILFA 5KXXA 1UICA 1C7PA 1JIYA 1AKIA 2W1MA 3D9AC 2EKSC 2EPEA 4HTKA 3LN2A 2LZTA 2EIZC 1LSBA 4NGKA 5B1GA 1LSZA 4GN3A 4H9BA 3RNXA 1NDMC 1HEOA 3FE0A 3CT1A 1BB6A 2BQJA 4P2EA 4DDBA 5B06A 1D6PA 5FEKA 1CJ9A 4NGOA 1UIAA 5LVJA 2XBRA 1CKHA 2HU3A 1LZDA 4R0FA 4GCEA 1XGQC 5T3FA 1XFPL 1DPWA 1LYZA 1LOZA 4G49A 1D6QA 4G4CA 5KJ9A 2D91A 1REMA 3HBDA 3J6KA 207LA 1F6RA 1OUBA 2F30A 1D0KA 1GB9A 1XEIA 2CJLA 3F6ZA 4NEBA 1XGRC 4UWNA 1DKKA 4H8ZA 1YQVY 2MEAA 1IOCA 1UIBA 4WM1A 3J4GA 1JKAA 1I20A 2BQKA 1TEWA 5B05A 3B72A 4NSJA 2VB1A 3WUMA 5LYMA 3T36A 1SQ2L 2W1XA 3EMSA 1HEMA 4G4BA 1CKGA 4UWUA 2YBIA 1IOTA 4IJ4A 4M6DA 3WPLA 4ETEA 1JISA 1UACY 4W94A 5L3HA 4RLMA 4NHQA 3WPJA 4WM5A 3EO5A 2BQBA 1C08C 1GBWA 1IEEA 1B7PA 1GB8A 4ML7A 1JJ0A 1GEZA 3A67Y 4XJHA 3T6UA 3TXFA 3RW8A 1LMQA 3A93A 5IHGA 1C10A 4PGJB 1DKJA 3AZ7A 1B7OA 4BAPA 1B5YA 1HSXA 1UUZC 1TAYA 3A34A 4HJYA 5AMYA 5C6JA 5I54A 2FYDA 4QDNA 1LHKA 4H8YA 1GE0A 1W6ZA 4NGVA 4WO6A 132LA 1CNSA 3WU7A 1I56A 4YEMA 1MLCE 1GDWA 4WM2A 135LA 2G4QA 1LAAA 1YROA 1GBYA 4QY9A 5B59A 5A3ZA 1KXXA 3GXKA 3B0IA 1NMMA 1IWWA 1BVXA 1REZA 1DI5A 3W6FA 1FKQA 1GFJA 1G7LC 1HELA 5KXMA 4TX7A 2H9JA 4H9EA 4LYTA 4KL7A 3LHMA 4WO9A 3WUAA 2FBDA 1H87A 1D9UA 2LHMA 4DC4A 2F4GA 1GAZA 2HTXA 5APFA 2A7DA 1LSAA 3W3EA 2Z38A 4NIJA 4HTQA 1YAQA 4LT3A 4II8A 3P68A 1EQEA 1LZTA 1EL1A 3EBAB 3TXKA 1GFHA 1JTTL 4ZEEA 1QQYA 2N5ZA 4A7DA 1UA6Y 1JJ1A 1JSEA 1LZRA 4D9ZA 3WU8A 1GF5A 4H1PA 1IORA 1IWZA 1BB5A 1FBIX 1GFVA 134LA 2G4PA 5APDA 1KXYA 2BQLA 3HBHA 2DQIY 3HBEX 5II3A 5HNLA 2HU1A 3HFMY 4LFXA 3TXEA 2Z12A 6LYTA 1XEKA 4G4HA 5IDDA 4KPMA 4H93A 5LYTA 3ATNA 1LMPA 4ET9A 1GF7A 1ZVHL 1LJNA 4KT3A 3WW5A 1IY3A 2H5ZA 4LYMA 1B5UA 1IWYA 1V7SA 4LT2A 2Z39A 4RW2A 2XJWA 1YKZX 3ULRA 4J7VA 4DT3A 3A3RX 1FLQA 1QUTA 2BQGA 1OUCA 1LMAA 4DD9A 4H91A 3W6CA 1LHJA 1GAYA 4HJVA 2I6ZA 4N1EI 2HEFA 5F14A 2BPUA 1LMTA 4H9FA 4CGEA 3TXHA 5E9RA 1LHHA 2FYCA 4NGWA 1LZ5A 4ETAA 2ZNXY 1GF8A 2MEBA 4HSFA 3WL2A 2BLYA 2DQAA 1G7JC 4L41A 1QTEA 1WQRA 2MEEA 1HMLA 1DQJC 4HPEA 4H9AA 5EBHA 4YF2A 1IY4A 2Z2EA 5KXKA 1UIDA 3A6CY 1IOSA 1A2YC 2CWIA 4G9SA 1LHIA 2NWDX 2YBJA 1OUGA 1SLYA 2YBNA 4H94A 4FJRA 3LYZA 5KXWA 1V7TA 1XGTC 1LYSA 2BQIA 1GF6A 1D0LA 3N9EA 5I4XA 1LSMA 2MEGA 1GFKA 2ZWBA 1LZ1A 4NFVA 4QEQA 1PS5A 4MR1A 4DDCA 3A6BY 4BS7A 3ZVQA 1NDGC 4OOTA 5KXLA 5I5QA 4RDSA 4GCBA 1HERA 2BQAA 2HECA 1GB3A 2YBMA 2BQMA 1RI8B 4GLVA 1B5VA 4GCFA 2YBHA 4NG1A 1YAMA 4IASA 3LZ2A 4NSHA 2BQNA 1GB6A 1LJKA 2BQHA 3B6LA 1IR8A 2W1YA 3ZEKA 1T3PA 2MEHA 1IP3A 2BLXA 4Z46A 2DQCY 1OUFA 1GBXA 4I0CA 1C43A 5LVGA 3OJPA 4LYOA 2AUBA 1LZ4A 3BKHA 5D5CA 4B4EA 1LJGA 4XJBA 2I25L 1GFAA 1TCYA 1IWUA 1HHLA 1LZ6A 2BAAA 3A94A 2MEDA 1JTPL 3D3DA 5LA8A 5KXRA 4NGIA 1IP7A 2D4KA 1ZMYL 4NY5A 4NSIA 3QY4A 3WVYA 1XSFA 4DD1A 5ILCA 4XENA 3AGHA 4PRUA 3A92A 3W6DA 1QIOA 2YSSC 4H8XA 1LYOA 3LYTA 5C6IA 5E4PA 1DI3A 3WVXA 1E8LA 4PHIA 2HUBA 1B7RA 5LVKA 3FI7A 5J7CA 1IWXA 4WM3A 4CFOA 1YAOA 2ZQ3A 1NWGA 4LZTA 1GE4A 2Y8PA 4DD3A 4AGAA 4B1AA 4CFPA 1TBYA 2D6BA 5HLLA 3CSQA 1ZVYB 3AZ6A 1B7QA 4U3XB 4LT1A 1IC4Y 1UBZA 4Z3MA 1CKDA 4GCDA 1G7MC 1GFUA 1LZCA 3WMKA 1WQNA 4HJZA 4WLYA 1B9OA 3W6EA 2DQGY 4H9IA 4NGYA 1GWDA 1CKCA 2GV0A 4J1AA 4ET8A 1BWJA 2HEAA 1O23A 1LJEA 1B0DA 3RU5A 1NQIA 3A3QA 3CSZA 1HFZA 4QGZA 1GBZA 1Z55A 4YOPA 1GB5A 1IWTA 5APCA 4E3UA 4HV1A 1JKCA 4ZIXA 1JKDA 1UIHA 1IC5Y 3G3BB 3P64A 1C46A 1I1ZA 5DLAA 2CGIA 4EMNA 1EQ4A 1HC0A 1HNLA 1LKSA 1B7NA 2Z2FA 3K3TA 2A7FA 3A96A 3P65A 4HP0A 5LIOA 1KIQC 2EQLA 4LT0A 5DN4A 1OUJA 1FLWA 4MSTA 1FLYA 1QUSA 5DM9A 4XADA 1DPXA 1GBOA 1YKYX 2BQEA 2LZ2A 3AGGG 3MGWA 1HEQA 1RJCB 1VATA 1UIFA 1DXJA 3IWRA 4EOFA 1OUDA 2W1LA 1OP9B 3KAMA 1EQ5A 1LZ9A 4LYZA 4HPIA 4N9RA 1OUAA 4MCKA 1XGPC 4WLDA 3TMXA 4C5FA 1IVMA 4N5RA 1B2KA 1PZYA 1JITA 1JKBA 4HTNA 2YDGA 1JSFA 1BWIA 1G7IC 1W08A 2BQFA 4OWCA 8LYZA 2ZQ4A 1B5WA 3CSRA 1INUA 1LZGA 3CT0A 4NWHA 4TWSA 5FHWA 4C3WA 4M4OA 1NKHA 1DI4A 4FDYA 4NHIA 2ZIJA 1NHEA 4ETBA 2DQFC 1LJ3A 2DQHY 2XBSA 208LA 1VDTA 3IJVA 2X0AA 3AW7A 1XGUC 5KXTA 1F10A 1WQMA 4W96A 5HMVA 1GEVA 2MEFA 4WL7A 5LINA 4GN5C 2MEIA 1GB2A 4TSBA 1B7SA 4ANRA 5D5FA 2CDSA 2Z19A 1LZEA 4BAFA 3GXRA 1LJFA 1OUIA 1GD6A 2C8PA 3TXGA 4DWXA 1J1OY 1LZAA 1GE2A 1B5ZA 1CJ6A 2F4AA 4GLAA 5HQ1A 4GCCA 4X3BA 3VWOA 1GE1A 1QDRA 154LA 5I53A 1UC0A 4OWEA 2YBLA 2ZYCA 4IATA 3AB6A 3TXBA 2DQDY 4YENA 5FCPA 4N1CC 1IOQA 5LVHA 4YEOA 4WOAA 1N4FA 1XEJA 4XJFA 1WVVA 4DYGA 2WARA 4I8SA 5KXOA 1LSNA 1GFRA 1WTMA 1GPQC 1JUGA 3WW6A 1BB3A 194LA 1LJIA 1UIGA 2XTHA 2DKVA 1IO5A 4ZFPA 1QSWA 1FLUA 1WQPA 1LJJA 1LZYA 3TXDA 1IWVA 3WXTA 1C45A 1JEFA 6LYZA 3A8ZA 2ZNWY 4J1BA 1LSFA 1LSPA 5B1FA 4DDAA 1RCMA 1VEDA 2ZYPA 1T6VL 4WG1A 4DD2A 1BHZA 5F9UA 3A95A 1B7MA 1HENA 4TTDA 5HMJA 5L3IA 5F16A 4NHSA 1YL0X 5KXSA 1F6SA 1BB4A 1LSDA 1F0WA 3ZVQB 4NHPA 4OWBA 5K7OA 1YILA 4WLTA 1IIZA 4J0LA 3RT5X 2DQEY 4B4IA 1GFTA 4WMGA 2IHLA 3WULA 5HNCA 1IP2A 1JHLA 1RE2A 2MECA 4H92A 3WXUA 3G3AB 1HFYA 4GN4A 5I4YA 3AGIA 4O34A 3CB7A 4LFPA 2B5ZA 1KXWA 4PRQA 4WG7A 2BQOA 5L9JA 133LA 1HSWA 1LYYA 1P2CC 4Z41A 2I26L 1JTOL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DZBX 4PJZA 1LZNA 1G07A 1BGIA 1AZFA 1CKFA 4XJIA 200LA 2HEEA 3N9CA 149LA 4LGKA 1C6HA 1KY0A 4OWAA 1IR9A 5A3EA 172LA 1OUHA 4WLXA 4NSGA 1LZ8A 1FN5A 5KY1A 3TXIA 1L05A 1P2RA 4NWEA 1L99A 5FELA 183LA 4YM8A 2LYZA 1J1PY 4ETDA 4EKPA 1P2LA 119LA 3A90A 5KXZA 1JPOA 1LZSA 3AZ5A 1LCNA 4K5YA 1XJTA 4S0WA 1VDPA 223LA 1IP4A 1L34A 1IR7A 102LA 1IC7Y 1LMCA 4NHTA 3TXJA 5LAFA 1YKXX 1OQMA 1DYAA 3C8SA 1BVKC 1D3NA 5KKIA 3HUKA 1H6MA 1CV1A 1L22A 1GFEA 2HEDA 5LXWA 2YVBA 4N0JA 4RLNA 1CJ7A 3CT5A 1LGXA 4DQJA 3LYMA 1C61A 4NG8A 5KXNA 2LZMA 3AJNA 2PC2A 4EPFA 3P4ZA 107LA 1L00A 1B5XA 1CX7A 211LA 1PQKA 3HT7A 114LA 2RBRA 3CDOA 4OWHA 3LYOA 1LHMA 1LTMA 2D4IA 4NGZA 3SN6R 1TDYA 3DN1A 1GB7A 4OOOA 2DQJY 5ILFA 4HTKA 2EPEA 3HU9A 2LZTA 3DN0A 4NGKA 253LA 199LA 4GN3A 4H9BA 1CJ9A 4R0FA 5T3FA 4G49A 5KJ9A 2D91A 207LA 1GB9A 1L24A 2CJLA 4UWNA 123LA 247LA 259LA 1QTCA 3B72A 3HUAA 1SQ2L 3WPLA 1KW5A 1UACY 241LA 5L3HA 1L31A 3WPJA 1CX6A 1GB8A 1JJ0A 1GEZA 1PQIA 3A93A 4PGJB 1DKJA 4BAPA 1B5YA 1HSXA 4HJYA 5I54A 177LA 1L27A 1GE0A 3HT6A 132LA 3LZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IP5 A;  1YAP A;  1DZB X;  3QE8 A;  1GF3 A;  1LZN A;  5DN5 A;  3AYQ A;  3WH1 A;  4B4J A;  4XYY A;  1LSG A;  1WVU A;  1LKR A;  4ETC A;  1BGI A;  1WQQ A;  5I4W A;  1AZF A;  4XJG A;  4B0D A;  1CKF A;  4XJI A;  4BAD A;  5KXY A;  1GDX A;  2HEE A;  1GB0 A;  3N9C A;  3TMV A;  4XN6 A;  4LGK A;  4WM6 A;  1ZV5 L;  1MEL L;  4OWA A;  5F9X A;  4AXT A;  1VFB C;  1IR9 A;  5A3E A;  4H90 A;  3TMW A;  1IP1 A;  2LYO A;  2ZIK A;  4HV2 A;  1OUH A;  4H9H A;  4WLX A;  1NBZ C;  4NSG A;  4TUN A;  1LZ8 A;  1FN5 A;  2LYM A;  3B0O A;  5KY1 A;  3TXI A;  1QTK A;  1KIP C;  9LYZ A;  4NGJ A;  4NWE A;  5JEN B;  3M3U A;  5FEL A;  1VAU A;  4YM8 A;  1JWR A;  1LSC A;  1BB7 A;  3CQL A;  2LYZ A;  1J1P Y;  4ETD A;  1UCO A;  1HEW A;  3A90 A;  2H9K A;  2BQD A;  3E3D A;  2FBB A;  5KXZ A;  1JPO A;  1LZS A;  3AZ5 A;  1LCN A;  1LZB A;  5LYZ A;  7LYZ A;  1VDP A;  5FDJ A;  5KKJ A;  1REX A;  3ATO A;  1IP4 A;  5LVI A;  1IR7 A;  4NGL A;  4TSC A;  1NF5 A;  1HFX A;  1IC7 Y;  1VDS A;  1LJ4 A;  1LMC A;  4NHT A;  2G4N A;  3TXJ A;  2RSC A;  4XJD A; 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 4ANR A;  5D5F A;  2CDS A;  2Z19 A;  1LZE A;  4BAF A;  3GXR A;  1LJF A;  1OUI A;  1GD6 A;  2C8P A;  3TXG A;  4DWX A;  1J1O Y;  1LZA A;  1GE2 A;  1B5Z A;  1CJ6 A;  2F4A A;  4GLA A;  5HQ1 A;  4GCC A;  4X3B A;  3VWO A;  1GE1 A;  1QDR A;  154L A;  5I53 A;  1UC0 A;  4OWE A;  2YBL A;  2ZYC A;  4IAT A;  3AB6 A;  3TXB A;  2DQD Y;  4YEN A;  5FCP A;  4N1C C;  1IOQ A;  5LVH A;  4YEO A;  4WOA A;  1N4F A;  1XEJ A;  4XJF A;  1WVV A;  4DYG A;  2WAR A;  4I8S A;  5KXO A;  1LSN A;  1GFR A;  1WTM A;  1GPQ C;  1JUG A;  3WW6 A;  1BB3 A;  194L A;  1LJI A;  1UIG A;  2XTH A;  2DKV A;  1IO5 A;  4ZFP A;  1QSW A;  1FLU A;  1WQP A;  1LJJ A;  1LZY A;  3TXD A;  1IWV A;  3WXT A;  1C45 A;  1JEF A;  6LYZ A;  3A8Z A;  2ZNW Y;  4J1B A;  1LSF A;  1LSP A;  5B1F A;  4DDA A;  1RCM A;  1VED A;  2ZYP A;  1T6V L;  4WG1 A;  4DD2 A;  1BHZ A;  5F9U A;  3A95 A;  1B7M A;  1HEN A;  4TTD A;  5HMJ A;  5L3I A;  5F16 A;  4NHS A;  1YL0 X;  5KXS A;  1F6S A;  1BB4 A;  1LSD A;  1F0W A;  3ZVQ B;  4NHP A;  4OWB A;  5K7O A;  1YIL A;  4WLT A;  1IIZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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