5F81A

Acoustic injectors for drop-on-demand serial femtosecond crystallography
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Acoustic Injectors for Drop-On-Demand Serial Femtosecond Crystallography.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5f81A00
4B4IA 3LZTA 1IR9A 3LYZA 1IC7Y 1GEZA 1OUDA 4W94A 1OP9B 3EMSA 4WM2A 1LKRA 1GF7A 4DD2A 3WW5A 132LA 4NEBA 1CKHA 2Z12A 1IP7A 4NGOA 2LYZA 4PHIA 1B7QA 4WLDA 4ANRA 5C6LA 5LINA 3AGIA 1OUEA 5KXKA 4GN4A 1LTMA 1UCOA 3P68A 4H93A 4YEOA 4WLYA 1QUTA 3W6FA 1GE1A 5T3FA 1QSWA 5FDJA 3K3TA 1SQ2L 207LA 3A95A 3ZEKA 1B5YA 1LMCA 2ZILA 1QIOA 1IWWA 4ET8A 4XYYA 1HMLA 3QNGA 3WH1A 1LZ1A 2MEIA 1JSFA 1IP4A 1LZSA 1HHLA 3A92A 5F9XA 1JWRA 1D6QA 2EKSC 1GFTA 2EPEA 3A96A 4OW1A 1IC5Y 1BHZA 1LAAA 2BQBA 1B7RA 4QGZA 4G4BA 3RT5X 3TMVA 1FLYA 3G3BB 4G9SA 1IR7A 4NHTA 4LFXA 3LYTA 4HJVA 2CGIA 1GWDA 1LZYA 1LSZA 1C46A 1GD6A 2HTXA 4TSBA 1B7NA 3HBDA 5I53A 5IHGA 3N9EA 1VDPA 1J1XY 1UICA 1WQPA 1YQVY 1WTMA 2ZYPA 4R0FA 3B0KA 3WXUA 4H8XA 4XN6A 1LMNA 4NGZA 1LZ8A 1LZNA 5ILCA 1JKBA 3TMXA 1YKYX 1D0MA 4DD7A 4A7DA 1JHLA 2W1XA 3WL2A 1HSWA 1IOSA 4LYTA 5DN5A 4LZTA 3E3DA 3W3EA 1XGQC 5HMVA 1B2KA 4RLMA 4M4OA 1VDTA 1YAOA 2Z19A 5I54A 3AZ7A 2HEEA 5HNLA 3B72A 2Z38A 1P2CC 2DQHY 1IR8A 4HTQA 5DN4A 4NFVA 5C6IA 2HUBA 1JTOL 1SLYA 7LYZA 2Y8PA 4YF2A 4FJRA 2F4GA 4WM3A 3WU9A 1REZA 1UIAA 1KIQC 3QE8A 4BAFA 1GBOA 1BQLY 4OWHA 1C10A 2GV0A 4H8YA 4XJDA 1D0LA 5I4YA 4NWEA 2D6BA 2ZQ4A 1CKGA 1NQIA 4H1PA 4WOAA 1LHIA 2G4PA 1JJ3A 4NHSA 1BGIA 4NSGA 1UBZA 1J1PY 1JKCA 1XEKA 4WM6A 1JPOA 3AZ4A 4PPOA 3AZ6A 1VAUA 2MEFA 1RE2A 1DKKA 5LVIA 4WO9A 1F6RA 4Z46A 153LA 135LA 4I0CA 1IIZA 4NGIA 1KXXA 2LYOA 2MEBA 4GCCA 2FYCA 4ZEEA 2YBNA 2FYDA 4OWBA 4H90A 5KXYA 3WVYA 5KXTA 4CFOA 4NSIA 3CSRA 3TXDA 3A6CY 3P66A 4NG8A 1GBWA 2BQGA 2H9JA 2W1MA 4XADA 4KL7A 1UIEA 5LXWA 1GPQC 1JUGA 3F6ZA 3A91A 3CSZA 1BB5A 1IP6A 1OUCA 3GXRA 3GXKA 1GXXA 4OWCA 1DI5A 1LJGA 1GFHA 2BQJA 5LAGA 1CKFA 4HJYA 1GE0A 1IWUA 4CGEA 2DKVA 4IASA 5KXLA 3MGWA 4IJ4A 2FBBA 4YOPA 1LHLA 1A2YC 1LHJA 1B5WA 1LYOA 1WTNA 4RLNA 4UWUA 5APFA 4HP0A 3WPKA 1YANA 4LT3A 1GE2A 3T36A 1GF9A 4TUNA 1GFKA 1FKVA 4HTKA 1JJ1A 4W96A 4ZIXA 3SP3A 1REXA 2BLXA 1LMAA 1GB2A 2F2NA 1G7IC 3G3AB 4I8SA 1LJIA 2BQMA 1AM7A 1MELL 3AZ5A 4H9BA 1YKXX 5KXNA 3OK0A 4II8A 3AYQA 3RW8A 3WYHA 1IWYA 4L41A 1GBSA 2DQAA 1GXV2 1IWTA 1JEFA 1HSXA 1UIHA 1G7MC 3B0IA 1YL0X 2DBTA 2MEGA 1C43A 2Z18A 4H9EA 4D9ZA 4DYGA 2CWIA 1HF4A 1N4FA 3KAMA 1LJ3A 5LVKA 2HEBA 3J6KA 1F0WA 2A7DA 1IC4Y 1XEIA 5E9RA 1G7LC 2ZNWY 1OUAA 2HU1A 1HFYA 2EIZC 2ZIKA 3IWRA 1MLCE 4NGYA 4TTDA 1LYZA 4TX7A 2H5ZA 4NHQA 4QEQA 4XJHA 4C3WA 5KXWA 3CT5A 3TXKA 4N9RA 1GAZA 1LZGA 6LYZA 1HEMA 5B59A 1LZ5A 2Z39A 5LVGA 5APDA 4CJ2A 1B7MA 1BVXA 3A93A 4R6CA 1BB6A 1REMA 2RSCA 1GE4A 1FLQA 1NBZC 1QTKA 2BQKA 5L9JA 1CJ9A 1LHKA 1REYA 2ZWBA 1D6PA 1GHLA 1NF5A 1FN5A 1GB7A 1GF5A 4J1BA 2D91A 3N9CA 2DQDY 4H9AA 4H9CA 4XJBA 4YEMA 1RI8B 2MEAA 1TCYA 1UC0A 1NWGA 1A4VA 1H87A 2YSSC 5AMYA 4HJZA 1DZBX 1IWVA 1JITA 2I25L 4MSTA 1C08C 4HTNA 2BQAA 1HFZA 3A6BY 1CKDA 2I26L 4N0JA 3P64A 1B9OA 5KXPA 4E3UA 8LYZA 1LSDA 3LYOA 5HLLA 3EO5A 4LT0A 5L3IA 4IATA 5DLAA 1VDSA 1HERA 1TAYA 3EBAB 3ZVQA 2AUBA 4DWXA 4M6DA 1BB4A 3AJNA 1GFAA 1TDYA 4OOTA 193LA 1FLUA 1GFGA 4N1CC 1LCNA 3WMKA 1CKCA 1IWXA 1IY3A 1T6VL 2VB1A 4NGKA 1QTEA 2NWDX 4TWSA 1BWHA 3W6EA 3WUNA 4LYOA 2YBMA 5APCA 5LAFA 2MEDA 194LA 2X0AA 1LJFA 1RFPA 2DQCY 4UWNA 1E8LA 3QY4A 3AW6A 5LVHA 4ETCA 4NSJA 1LSBA 3M3UA 4NWHA 1LJKA 5I4XA 1ZMYL 2YDGA 3FE0A 1LMPA 5EBHA 4J7VA 5B1FA 2MEHA 3TXHA 4NIJA 2DQIY 5F9UA 3IJUA 4GN5C 4DC4A 1OUJA 2HEFA 3A67Y 4HSFA 1B5VA 3FI7A 4X3BA 1IOQA 3D9AC 1JTTL 4U3XB 3HFMY 1D9UA 4GLAA 3T6UA 1EQEA 2BLYA 1YL1X 3BKHA 3LHMA 4LYZA 4B4EA 5KY1A 1B0DA 4DD1A 2BPUA 5F14A 1GF0A 4XJGA 1AKIA 4DT3A 154LA 4GN3A 4N5RA 2BQHA 1HEQA 1IOCA 1LSCA 1UIFA 4PRQA 4H9IA 1B5XA 3WPJA 4CFPA 4ET9A 3J4GA 1JIYA 3HBEX 5KXRA 208LA 4HV1A 1HNLA 1XGRC 3TMWA 5I4WA 2MEEA 1LSYA 5F81A 1LJEA 5II3A 1OUIA 2DQEY 3AGHA 4G49A 3ZVQB 1KXWA 4GLVA 4DD9A 1AT5A 5LIOA 4XENA 1XSFA 1UIDA 3A34A 1B5UA 1B7PA 4WLTA 5J7CA 1UIBA 2H9KA 2ZNXY 4YENA 1WVUA 4CHXA 2FBDA 2CDSA 3RZ4A 3N9AA 5KKIA 1IP2A 4NGLA 2Z2FA 1PZYA 1UACY 3BKVA 3LYMA 3TXBA 1FBIX 1JKAA 1LJ4A 5FHWA 2BQOA 1GF6A 1H6MA 1LJHA 4WO6A 2EQLA 3HBHA 1C7PA 1LZAA 1CJ7A 1LKSA 1LZ6A 4NHPA 3A8ZA 4NSHA 5KXZA 1LSEA 3W6CA 1BWIA 4ML7A 4DD0A 3LZ2A 1KXYA 4N1EI 5IDDA 1YILA 1LZCA 1YAPA 1ZVYB 1DPWA 4FDYA 1LYYA 4OOOA 1DXJA 1I1ZA 2F30A 3W6DA 5B06A 2YBJA 1WVVA 4J0LA 1LMOA 1ZVHL 1GBZA 2C8PA 1WQMA 4BADA 1LYSA 4GCDA 1GFRA 4WM4A 3TXEA 4G4CA 1DKJA 2W1YA 1V7TA 4WLXA 4DDCA 1KIPC 1I20A 1EL1A 1GF3A 2XJWA 5HQ1A 1IO5A 4NGJA 1G7JC 1GF4A 1GDXA 1LZBA 1NKHA 1LOZA 4WMGA 4PRUA 1LZ4A 1OUBA 4H8ZA 4QDNA 3A3QA 4DDBA 5LYMA 2CJLA 4NY5A 1ZV5L 1IWZA 3VWOA 1LHMA 1IY4A 3B6LA 4DD3A 1IOTA 5LA8A 1Z55A 4H92A 4G4HA 2A7FA 4WM5A 4XJFA 1LPIA 1HEWA 2ZYCA 1C45A 1GFUA 1GB0A 2G4QA 4HV2A 4LFPA 9LYZA 1NBYC 2BAAA 5LYZA 3WPLA 2F4AA 3TMUA 1RCMA 4LYCA 4WG7A 1B7OA 6LYTA 1GE3A 1NDMC 1QDTA 3TXFA 1GBXA 4NG1A 4ETEA 3W6BA 1NDGC 1B7LA 1QSAA 2D4IA 3A3RX 1VFBC 1IP3A 5E4PA 4Z98A 1GF8A 3RU5A 4GCBA 1YKZX 3CT1A 1LSNA 2BQDA 1NHEA 4N8ZA 1LHHA 3CT0A 1CNSA 1OUHA 4KPMA 5DM9A 1CJ8A 2WARA 2I6ZA 2D4KA 2C8OA 1W6ZA 2XBSA 4MCKA 4NGVA 4C5FA 1FDLY 2HU3A 1LZDA 1QUSA 1INUA 1IP1A 2BQNA 1WQRA 5FSTA 5ILFA 3AGGG 1XFPL 2Z37A 4PGJB 5KXOA 1JJ0A 1DI4A 1DPXA 1FKQA 3TXJA 4B0DA 2ZQ3A 2N5ZA 4OWAA 1UUZC 3A94A 4YM8A 3M18B 4BAPA 4ZFPA 4OWEA 4TSCA 3WULA 1JKDA 1D0KA 1VDQA 4EOFA 3ATOA 5B1GA 5HMJA 5LA5A 1B7SA 3WUAA 2Z2EA 4RW1A 3CQLA 2XBRA 1OQMA 4AGAA 1BWJA 2LYMA 1BB3A 2BQEA 4WL6A 4DDAA 1BVKC 1HEOA 1HMKA 1WQQA 1GB5A 2BQCA 4MR1A 3P65A 1OUFA 4GCEA 5FEKA 2B5ZA 2IFFY 1F10A 5K7OA 2XTHA 3ATNA 4LYBA 3W6AA 3WVXA 1YROA 3IJVA 1O23A 4B49A 4B4JA 3CSQA 1DQJC 1G7HC 1LZRA 4Z41A 1WQNA 1ALCA 1LJNA 4PJ2C 1LSFA 134LA 2D4JA 1GBYA 4H9HA 2BQFA 2G4NA 1GFEA 5KJ9A 1JISA 1PS5A 1VATA 5IELA 1WQOA 5A3ZA 1AT6A 4KXIA 5FELA 4QY9A 5LYTA 1GB3A 1IEEA 1GFVA 1B5ZA 2HECA 1XGTC 1DI3A 1XEJA 1GB6A 2YBHA 4BS7A 1V7SA 4H91A 3CB7A 3OJPA 5D5FA 1LZ9A 1YIKA 3AB6A 3WW6A 1YAQA 1LMQA 3A90A 2YBLA 3TXIA 1LSAA 2PC2A 4Z3MA 2IHLA 5FCPA 1HC0A 1NMMA 1IP5A 4RW2A 1T3PA 1GEVA 1OUGA 3WUMA 4LGKA 4J1AA 1GDWA 1LSPA 1F6SA 5M1YA 1JTPL 4AXTA 1EQ5A 1HFXA 2Q0MX 1FLWA 1HEPA 1LSGA 1LZEA 4ETBA 5KXXA 2MECA 1HENA 4H94A 3AW7A 133LA 2HEDA 5KKJA 3WU7A 2LZTA 4WM1A 1TBYA 1LSMA 1VEDA 3TXGA 1GAYA 5DL9A 4HPIA 4RDSA 1XGPC 4UWVA 5KXMA 5JENB 5D5CA 4EMNA 3WU8A 1LMTA 1BB7A 4GCFA 3P4ZA 1UIGA 3WXTA 5B07A 5LVJA 1GB9A 1JSEA 4B1AA 1J1OY 1W08A 4ETDA 4LT2A 2BQLA 1IORA 4WL7A 4HPEA 5I5QA 2DQJY 4P2EA 3EXDA 4LT1A 5B05A 3D3DA 1UA6Y 2DQGY 1IX0A 1LZTA 2LZ2A 4O34A 3RNXA 5APEA 1TEWA 3ULRA 1KIRC 1QQYA 1EQ4A 5C6JA 1HELA 5KXSA 4H9FA 2BQIA 1CJ6A 1YAMA 1LJJA 2YBIA 1I56A 1RJCB 5F16A 1IVMA 5L3HA 5A3EA 3B0OA 2LHMA 4WG1A 1GB8A 2YVBA 2ZIJA 1GFJA 2HEAA 4NGWA 1QDRA 2DQFC 2W1LA 4NHIA 4LYMA 4XJIA 3LN2A 1XGUC 5HNCA 1AZFA 4KT3A 4ETAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
125LA 3EMSA 1LKRA 1C62A 5C6LA 130LA 3AGIA 1L26A 3HTGA 4GN4A 1UCOA 3CDQA 1GE1A 3K3TA 207LA 1QIOA 1HMLA 3QNGA 3WH1A 1L16A 1LZSA 1HHLA 1D6QA 2EPEA 3TMVA 1IC5Y 254LA 247LA 4ARPA 4DQ5A 1P37A 4NHTA 1C6NA 1PQMA 1L19A 1GD6A 2HTXA 198LA 5LYTA 3HBDA 1J1XY 1G0MA 4EKSA 1L21A 1LZNA 2RB0X 4LYTA 5DN5A 4LZTA 3E3DA 1CV1A 1YAOA 3AZ7A 2Z38A 1P2CC 5DN4A 5C6IA 1JTOL 1SLYA 165LA 1L20A 1GBOA 1BQLY 4H8YA 4XJDA 2D6BA 1CU2A 4WOAA 2G4PA 4NHSA 1C6KA 3AZ4A 3HDEA 1RE2A 3DN8A 4WO9A 113LA 4I0CA 1L93A 3WVYA 5KXTA 3HH4A 227LA 4CFOA 4NG8A 1GBWA 5LXWA 2B75A 114LA 3DN3A 1DI5A 5LAGA 1GFHA 2BQJA 4CGEA 4HJYA 1P6YA 1G07A 2FBBA 4YOPA 1A2YC 1LHJA 4UWUA 1L91A 3CDTA 1YANA 1L90A 1SWZA 4ZIXA 4W96A 3SP3A 1REXA 4ARLA 2BLXA 1PQJA 3DMXA 2B6ZA 1KW5A 1P2RA 3OK0A 1L34A 3DN4A 1GBSA 2DQAA 1GXV2 1CVKA 2DBTA 1QSQA 2CWIA 1L0JA 1IC4Y 2B73A 1G7LC 2L78A 2HU1A 1C6DA 3CT5A 1LZGA 3DNAA 6LYZA 1B7MA 1L99A 1BB6A 1GE4A 1G0LA 243LA 1D6PA 1GHLA 1FN5A 1T8FA 4XJBA 2OU8A 1RI8B 1UC0A 2YSSC 5AMYA 1DZBX 185LA 3C7ZA 1CKDA 1QS5A 1HERA 3ZVQA 1TLAA 1BB4A 1LWGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B4I A;  3LZT A;  1IR9 A;  3LYZ A;  1IC7 Y;  1GEZ A;  1OUD A;  4W94 A;  1OP9 B;  3EMS A;  4WM2 A;  1LKR A;  1GF7 A;  4DD2 A;  3WW5 A;  132L A;  4NEB A;  1CKH A;  2Z12 A;  1IP7 A;  4NGO A;  2LYZ A;  4PHI A;  1B7Q A;  4WLD A;  4ANR A;  5C6L A;  5LIN A;  3AGI A;  1OUE A;  5KXK A;  4GN4 A;  1LTM A;  1UCO A;  3P68 A;  4H93 A;  4YEO A;  4WLY A;  1QUT A;  3W6F A;  1GE1 A;  5T3F A;  1QSW A;  5FDJ A;  3K3T A;  1SQ2 L;  207L A;  3A95 A;  3ZEK A;  1B5Y A;  1LMC A;  2ZIL A;  1QIO A;  1IWW A;  4ET8 A;  4XYY A;  1HML A;  3QNG A;  3WH1 A;  1LZ1 A;  2MEI A;  1JSF A;  1IP4 A;  1LZS A;  1HHL A;  3A92 A;  5F9X A;  1JWR A;  1D6Q A;  2EKS C;  1GFT A;  2EPE A;  3A96 A;  4OW1 A;  1IC5 Y;  1BHZ A;  1LAA A;  2BQB A;  1B7R A;  4QGZ A;  4G4B A;  3RT5 X;  3TMV A;  1FLY A;  3G3B B;  4G9S A;  1IR7 A;  4NHT A;  4LFX A;  3LYT A;  4HJV A;  2CGI A;  1GWD A;  1LZY A;  1LSZ A;  1C46 A;  1GD6 A;  2HTX A;  4TSB A;  1B7N A;  3HBD A;  5I53 A;  5IHG A;  3N9E A;  1VDP A;  1J1X Y;  1UIC A;  1WQP A;  1YQV Y;  1WTM A;  2ZYP A;  4R0F A; 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 1XEJ A;  1GB6 A;  2YBH A;  4BS7 A;  1V7S A;  4H91 A;  3CB7 A;  3OJP A;  5D5F A;  1LZ9 A;  1YIK A;  3AB6 A;  3WW6 A;  1YAQ A;  1LMQ A;  3A90 A;  2YBL A;  3TXI A;  1LSA A;  2PC2 A;  4Z3M A;  2IHL A;  5FCP A;  1HC0 A;  1NMM A;  1IP5 A;  4RW2 A;  1T3P A;  1GEV A;  1OUG A;  3WUM A;  4LGK A;  4J1A A;  1GDW A;  1LSP A;  1F6S A;  5M1Y A;  1JTP L;  4AXT A;  1EQ5 A;  1HFX A;  2Q0M X;  1FLW A;  1HEP A;  1LSG A;  1LZE A;  4ETB A;  5KXX A;  2MEC A;  1HEN A;  4H94 A;  3AW7 A;  133L A;  2HED A;  5KKJ A;  3WU7 A;  2LZT A;  4WM1 A;  1TBY A;  1LSM A;  1VED A;  3TXG A;  1GAY A;  5DL9 A;  4HPI A;  4RDS A;  1XGP C;  4UWV A;  5KXM A;  5JEN B;  5D5C A;  4EMN A;  3WU8 A;  1LMT A;  1BB7 A;  4GCF A;  3P4Z A;  1UIG A;  3WXT A;  5B07 A;  5LVJ A;  1GB9 A;  1JSE A;  4B1A A;  1J1O Y;  1W08 A;  4ETD A;  4LT2 A;  2BQL A;  1IOR A;  4WL7 A;  4HPE A;  5I5Q A;  2DQJ Y;  4P2E A;  3EXD A;  4LT1 A;  5B05 A;  3D3D A;  1UA6 Y;  2DQG Y;  1IX0 A;  1LZT A;  2LZ2 A;  4O34 A;  3RNX A;  5APE A;  1TEW A;  3ULR A;  1KIR C;  1QQY A;  1EQ4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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