5F8B | Genus

Total Genus 71

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	71
sequence length	215
structure length	215
Chain Sequence	MVFGTLYTFPGDQCRTIAIKAVAKANGLDLDIRETPRTPDHLSISKLGKVPAFQGADSFKLFECMAIALYITSQNEQTTLLGKDKKEYAEIIKWMSFFNTEIVILMTQQLLPQLGVIPYDRDQVEFFANMTQRSVDVVEEYLQDRTFLVGDQLSLADLFCAGNISLGFQFFYGKAWRQQNPNVSRWYEMVCHQPIYAAVTDKFQLLDEPKLTNNP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Oxidative trans to cis Isomerization of Olefins in Polyketide Biosynthesis. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
molecule keywords	Glutathione S-transferase, putative
total genus	71
structure length	215
sequence length	215
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-12-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00043	GST_C	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	5f8bA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5f8bA01

3U5RE 3KMOA 5G5FA 3C7MA 2LJAA 3FKFA 2B1KA 5B6MA 4ZBDA 2P5QA 4L5OA 3IK9A 2JZTA 1XOAA 3HJMA 3ERFA 2F8FA 1SYXA 1K0NA 2JZRA 1ST9A 3P7XA 4HU7A 2DIZA 3VWUA 2NDOA 1K3OA 4KW6A 2GQLA 2BTOT 3KH9A 3TOTA 3F63A 2YANA 5G2ZA 3QAWA 1XVQA 4JRRA 2PERA 5CRWA 2H71A 3LEFA 2OJLA 3IXRA 1O6JA 3VLNA 2H75A 1WJKA 5CRHA 5D9XA 3KH7A 1B9YC 2QGVA 4ISDA 1T1VA 3BOAA 1JLVA 5J4UA 2F9SA 2YV9A 1U87A 3GSTA 2I1UA 1PMTA 2D2ZA 5B8AA 4KF9A 4FIWA 1Q4JA 4PUFC 1H4OA 3FZ4A 1TTZA 1G0TA 3RPNA 2N5BA 1VRSD 3VWXA 2AAWA 3ZMLA 4JEDA 3H4KA 1OE7A 4TR1A 1IYIA 3VPTA 2R5GA 2OBKA 4HUAA 4BVXA 5HFIA 2X99A 4OWYA 2RUEA 4PQIA 2RM5A 4KB3A 2FUG2 3MNGA 4F9ZA 2C4JA 1AQXA 3CXGA 2K8VA 4GSNA 3RPPA 5JWOB 3ZYWA 3GKNA 3H1NA 3GFKA 2WGRA 2VLTA 1A0RP 4KCEA 1GL8A 1AW9A 2EIRA 5LNKe 1ML6A 3ERWA 5IMCA 1GP1A 4F0CA 4OCEA 1Q98A 1AQWA 3TRXA 3D4MA 3M8NA 2DJ2A 3IA1A 2XBIA 4IS0A 4O32A 2VM1A 1AAZA 3TJFA 1Y6EA 1B4PA 1MDKA 1SD8A 1M2AA 2LUSA 2MMAA 4TR0A 1SYRA 1A2MA 2DMMA 3QFAC 3DWVA 4G9HA 1MD3A 2GSRA 1X5CA 4MJEA 2ZNMA 3KXOA 2IMDA 1FHEA 3HYPA 3RHCA 4PUAA 4GWRA 3BD2A 2OACA 4MK3A 2H01A 2LQQA 1Z7PA 2VLVA 2H76A 2C0FA 3GYKA 2WULA 4KE3A 5D9TA 2ON5A 9GSSA 3I9V2 2FNOA 1B9XC 2YP6A 3FY7A 2LSTA 4K0NA 2DSAA 4IN0A 1ILOA 2WS2A 1V58A 1GUHA 4I97A 3CMIA 3F4RA 1ON4A 2IL3A 4ACSA 4MP4A 1W89A 3D4TA 2WRTA 5IMZA 5COHA 2MMOA 4NXIA 3VFIA 2YZUA 5H5SA 2H19A 3CSIA 1E2YA 2I81A 1YKCA 2CX3A 2FHEA 3ZIVA 4KDXA 5AIXA 2O7KA 4K7NA 3F6FA 3G9BA 2LNSA 1ZGNA 4DSQA 5GAND 2VL2C 5L71A 3TJGA 2HZFA 2V41A 4G19A 4ECJA 3ZTLA 2KHPA 3IV4A 17GSA 4FYBA 1KTEA 1O73A 3L9SA 3HKRA 5IOWA 1ZCPA 5G5EA 1JFUA 4K6XA 1K0DA 4EE0A 3TUEA 1G7EA 2IFQB 1SL1B 3J7Yb 3W8JA 2FWFA 5D9WA 1DUGA 3UBLA 2YPMA 5ECHB 3KZQA 4TXOB 1TP9A 3ZVJA 5ENUA 1YDKA 3ME7A 2FWEA 1AIUA 2X8CA 1GSQA 2HSMB 5HQPA 2PVOC 5F0GA 4GSSA 3MWHA 3CRUA 4N11A 2C3QA 4DSRA 5F05A 1TK5B 4KH7A 1LJRA 2P5RA 1XW9A 2VD0A 3EWLA 3LGCA 4NAXA 5GAPD 4RQXA 1JLWA 2CAQA 2IMFA 1HYUA 1FB6A 1QMVA 1F2EA 2L6DA 4LLRA 4G0LA 2BMXA 1K0OA 4L8EA 1GTUA 1HQOA 1GLQA 2I4AA 3APSA 5G1LA 2HI7A 4WBJA 4OD7A 5IMDA 1GWCA 3A2VA 3U6VA 4GSTA 4PURA 5ECRB 5DCHA 2XHFA 2M46A 2B5XA 5E4WA 3DVXA 4MH2A 1X9SB 5INYA 1XWKA 5ID2A 4E8EA 3F9UA 3SWLA 3FZ5A 5LD0A 5AN1A 2E2MA 4KA0A 2VAFA 1YJ6A 3P90A 1M2DA 2HZEA 4YQMA 3R3EA 3HD5A 22GSA 5KN3A 3RBTA 4FYCA 2LNTA 5IOXA 4ML6A 4MZBA 1A24A 1NW2A 1YEPA 2HSYA 4N0ZA 1JZDA 3KIJA 3ZVJD 5F07A 2O87A 3HVVA 4I2TA 3HHVA 4GF0A 3GV1A 3UEMA 3ZFLA 4RI7A 2AB6A 4PTSA 3VURA 4FH8A 1XIYA 1F37A 4IKHA 3UBKA 4XCSA 1N8JA 1K0BA 2R2JA 1X0RA 1KNGA 3E0UA 2RUFA 1WRYA 1EWXA 1FAAA 2GTUA 3UIWA 3BCKA 1XVWA 1WMJA 2HT9A 4NPBA 3IBHA 5HFKA 5JCGA 1QFNA 4BWSA 4WEYA 6GSXA 3HZ8A 5E59A 2YV7A 1J0FA 2C1YA 2IJYA 4ZL9A 2V2GA 1MDIA 4IJIA 2B7JA 1M2BA 4J57E 4L5LA 4RI6A 3TKSE 2AYTA 1NHYA 1J08A 5CNWA 4V2NA 3PPUA 4X0XA 1SL0B 2GZYA 2XPDA 3QPMA 2K6VA 1M9BA 3GTUA 3E3EA 1T00A 4HJ2A 1EV4A 3QR6A 1S3DA 4ID0A 2C0DA 4KCAA 1WIKA 3GH9A 5ELAA 4YAPA 5A4UA 4POKA 1GULA 1RK4A 4MZCA 1LU4A 4HEA2 4OMVA 4MDCA 2PBJA 3GIXA 4JR6A 1GLPA 1S3AA 5IQYA 1R5PA 4AJ6A 2H73A 3LORA 2Z9SA 2V6OA 4PQHA 1TU7A 3HZ4A 1GUKA 2YOIA 4IP6A 1XOBA 1EEJA 5CREA 2XBQA 2O85A 3DYRA 3I69A 1OC8A 3CRTA 4ILFA 2VOCA 3KTLA 3KD0A 4EKZA 4WBRD 5KN0A 3TJBA 1U3AA 3I43A 2H6XA 3FEUA 3A2WA 2ZCTA 1TK0B 3IC8A 3FR9A 1EEMA 3PH9A 1PX6A 2QC7A 1PRXA 1FO5A 5F06A 1UA5A 4WR5A 5IPHA 2IMKA 3RAZA 3GUSA 1EOHA 3DD3A 5F8BA 3O6TA 3Q6OA 1YKAA 4GTUA 1V98A 2ON7A 4ZB8A 1EOGA 3N5OA 5KN1A 1GTIA 2MYGA 3ZREA 2VCZA 1T4YA 4RUVA 3EINA 5JWQB 2MZCA 3HY2A 4WF5A 2AJQB 2GQMA 16GSA 1SJIA 5C04A 1XW5A 1F9MA 1EP7A 4BPYA 1DE2A 1WWJA 3IAM2 3A3TA 4N0VA 2LEGA 4Z7XA 3TJJA 1B48A 3GKXA 3MDKA 2V6KA 2YJ7A 2F3MA 4FO5A 4MJCA 3GMFA 4H86A 1A2JA 4JR4A 5DJLA 5ABRA 4TOPA 3GRXA 3S9FA 3HA9A 2J23A 2IMEA 3CBUA 2GZZA 2C0GA 1F3AA 4KGIA 4K2DA 5EL8A 4Q5NA 2O89A 4FYUA 6GSVA 2N5AA 4HDEA 3H8QA 1VF3A 2H6YA 3NOFA 2GZPA 4EO3A 1R26A 4PGTA 2B7KA 2CV4A 3G7YA 2NVLA 1LBKA 3FZ9A 4NV5A 14GSA 3LQ7A 1G6WA 3GN3A 4Q5QA 3DGQA 5IPGA 3ZRDA 2HRKB 2H1AA 2H6ZA 2F8AA 1S3CA 1OC3A 4MA9A 4MLYA 3IRAA 4EF0A 2HSNB 2IPAA 3P8WA 4DSSB 1SJ6A 3KGKA 5J5NA 1O81A 2KOKA 6GSTA 1QQ2A 2LS5A 4G2EA 3CTFA 2LKUA 4DVCA 4WETA 2H1BA 4ULXA 13GSA 1XCCA 2CT6A 4USSA 2HQTA 3FR6A 2VLUA 2HRKA 1TRVA 4BVYB 1PSQA 3WYWA 3EC3A 2WCIA 3TDGA 4QL7A 4XRDA 2VCQA 4WXTA 2N5FA 4MPGA 3DKSA 4KSOA 1RW1A 3DIEA 5A4VA 2H1GA 4MJBA 1SL2B 4CW9A 3KP9A 2G0FA 3M1GA 4MJAA 4IBPA 4V2LA 1GUMA 11GSA 1QXHA 2KUCA 3WT2A 5IO2A 3F8UA 2YWIA 2PGTA 1DSBA 1SKWB 2L5LA 3IOSA 3LYPA 2H66A 3KTBA 3ZFBA 2EIQA 2L4QA 4EDYA 4IW9A 1TJDA 2F51A 4DEJA 3HJPA 4ZIJA 4K9ZA 2HRNA 4ML1A 2YJHA 3KM6A 4TW5A 5FHIA 5ECPB 2HNLA 4PXOA 4PX1A 4ECIA 3CTGA 1X9MB 4L0WA 3WD6A 4YAVA 5C00A 2AHEA 4TVEA 4QQ7A 3LJRA 5CYYA 2DLXA 3QFBC 4HJMA 4XS6A 2GT5A 4FQUA 1A8YA 2H0IA 5J41A 2DJJA 2GVPA 2DIYA 2GLRA 1BYEA 4JU5A 4V1Ap 3C71A 3M9JA 2XC2A 1G6YA 4GRFA 4F82A 3GH6A 1G7OA 1ZZYA 1X5DA 5IO0A 10GSA 3FHKA 2I3YA 3VK9A 1HD2A 4JZQA 1B4QA 2C3NA 2AV4A 3F3QA 4KDYA 4O5RA 4TXVA 3C1RA 4ECBA 1GSSA 1H75A 5HR2A 2B6MA 2IFQA 4CDOA 2A2RA 1AQVA 1NM3A 2G2QA 1IYHA 1TRUA 4MCUA 4MZWA 1EV9A 1Z6NA 2WFCA 4TXOA 2PMTA 2FY6A 5HR3A 4GLTA 4AJ8A 4IQAA 2V1MA 5CRGA 5IMAA 4ZILA 4QL9A 1GSUA 1WP0A 3W8SA 4RQRA 2B5EA 3QMXA 3C8EA 2HSMA 2OA7A 2C80A 3D0ZA 1MDJA 5D96A 4WF4A 4EXJA 5D8IA 2OADA 4LA1A 2HLSA 4KX4A 3CYNA 2RIIA 2E0QA 3ZMKA 4D73B 3APQA 1Z5YE 1FW1A 1HNAA 3I6AA 4POMA 5B8BA 3F3RA 2LQOA 6GSUA 3GX8A 1PL1A 4IGJA 3VWVA 1CQGA 4MH3A 2VD1A 3SBCA 2X8GA 2R4VA 1XXUA 3FK8A 3QDNA 1A8LA 2EC4A 1GTAA 18GSA 4EL1A 5ECSA 4AF2A 1DE1A 2JACA 3KJYA 4LL4B 4JE1A 5DCGA 3NZNA 3TKQA 1Z9HA 4NMUA 2L5OA 3BCIA 2TRXA 4PNFA 1SKSB 4EDZA 2L4CA 2LTKA 1N2AA 2NBSA 2VIMA 4E8HA 2HE3A 2B1LA 3D22A 1TI3A 1X5EA 3IDVA 3UARA 1FG4A 2PU9C 3GX0A 4F03A 1HNCA 1I5GA 3CSHA 4EUYA 3TKSC 1K3YA 1T3BA 4KNDA 1GSFA 1A2LA 2R37A 1BQ7A 2H0GA 1YZXA 2B5YA 4XRAA 3W6GA 3UMAA 3DRNA 3EU4A 1VGLA 2VUPA 3LWAA 5HFGA 1EP8A 1GNWA 8GSSA 4GXZA 1BG5A 4HQSA 2GS3A 1OC9B 4OFTA 1A0FA 3TKSA 1URMA 3G7JA 1OAZA 1NSWA 3TRQA 5B7CA 5CAXA 5IIZA 5DAKB 1WE0A 1F6MC 4ZBAA 3DXBA 4HU9A 4V2MA 1ERWA 3LSZA 5ECQB 3UVHA 2JZSA 4IJ3A 1O85A 4GQCA 2JSZA 5CRDA 2CZ3A 3NIVA 1K0MA 2EIOA 2FCHA 4EVMA 4YH2A 1E6BA 3HVXA 2X64A 4XS4B 2HSHA 5J3RA 1T4ZA 3APOA 2MBTA 1ERUA 1PD21 4K7OA 1ABAA 3L0HA 1Z3EA 1ACVA 1T8EB 3TGZA 2J9HA 3F0IA 3GKMA 3ED3A 1OKDA 3ZIJA 4POBA 2REMA 4IVFA 1O7UA 3AY8A 5GSTA 4BL7B 3LYKA 1MTCA 1GRXA 3WGEA 1TW9A 3WT1A 3GKKA 1XFLA 2DBCA 2YCDA 3QOUA 3DMLA 2DC5A 3EE2A 1BJXA 1Z6MA 4GQFA 4N30A 3GNJA 2WZ9A 2UZ8A 2RLIA 1U88A 2C8UA 3TCOA 4HOJA 4HS1A 1PX7A 3ERGA 3JCML 3LXZA 3IAS2 3HJOA 5EPFA 3DVWA 3TOUA 2CVKA 1ZYQB 3V1WA 5DQSA 4NHZA 3IPZA 1PKZA 3VPQA 2B3SA 1GSYA 1AUCA 1C72A 3FR3A 5J9CA 5ECKB 2MMZA 3IE3A 3TB2A 1V2AA 2PVQA 6GSSA 3HXSA 1X9WB 4TRXA 2H74A 2L6CA 3D21A 5KN2A 3L4NA 2OE1A 1TRWA 1WOUA 1M0UA 2L57A 1TOFA 1VF2A 1JZOA 4MF7A 2H1DA 4CHSA 3VI7A 2R3XA 1SU9A 3OR5A 2PPTA 4TR1B 2CQ9A 4X43A 4LL1B 2WJUA 5IMVA 1UC7A 3KMNA 4BVXB 1THOA 1WPIA 2JU5A 1TK8B 4ECCA 1K0AA 4OCFA 4HQZA 1EGRA 1GSDA 1GH2A 2FA8A 4X1UA 3LXTA 2ES7A 5G30A 4Q5FA 3A2XA 4MMMA 4OO4A 5DQYA 1FVKA 4XIHA 5DJMA 2E7PA 2DJKA 2YNXA 1XBSA 4JBBA 1SENA 1XZOA 1USBA 4G0KA 5CO3A 3UJ1A 5AGYA 1JHBA 4KUNA 3EU3A 4Q5RA 2HFDA 1NHOA 1BEDA 5AISA 2FLSA 1SKRB 5ECNB 6GSYA 5FT3A 1FOVA 3HDCA 3J7Yk 4MABA 4K7IA 1TRSA 5EY6A 4KAEA 2GT6A 4P3YB 1BAYA 5ECIB 1TXXA 2IMIA 5BMUA 12GSA 2CVBA 1R7HA 3UL3A 2VCTA 3F4SA 4IELA 2PN8A 3VI5A 2JADA 4K1FA 2YWMA 1U3IA 3TRPA 2GSSA 2C0EA 1GNEA 1QK8A 6GSWA 4XS1A 3DEXA 2GSTA 3A5WA 2VCVA 4DSSA 2CA8A 4NWYA 3GA4A 1OKTA 1K0CA 4I5QA 1TU8A 5ELGA 3VWWA 3LG6A 2PWJA 3GHAA 2DJ1A 1AXDA 2OBIA 4N10A 2CVDA 2GDRA 3C1SA 2LJRA 3L9VA 4BVYA 3IC4A 3HCZA 1Z7RA 2QKEA 1ERVA 2FGXA 1SK2A 2PUKC 3GL5A 3WGXA 3Q19A 4MF5A 1FVJA 3FW2A 4PQ1A 2VM2A 4GCIA 2FD3A 1GTBA 2NTOA 2OKAA 3PGTA 4NV2A 5LCZA 2MMNA 2GQKA 2K9FA 3QAVA 2VO4A 3F4TA 2QSIA 2YN1A 3L78A 2A4VA 2K18A 3EMXA 1PN9A 2CAIA 5IMFA 5HR1A 2R6KA 4LMVA 4TN8A 2FWHA 5JCUA 2H8LA 2IIYA 1VF1A 5H5RA 1I9DA 5DDLA 4F2IA 1SJZA 2CZ2A 1R5AA 5D73A 1QGVA 2O8VB 3KCMA 3E9JB 2GSQA 1PL2A 2P31A 1YQ1A 1XPVA 3N9JA 2LRNA 2YWOA 1KBNA 3MAKA 2HXKA 1XW6A 1ERTA 2H0HA 5FWGA 1TDIA 5H5QA 2VCWA 4MF6A 5DVBA 3K8NA 1R4WA 1B8XA 5G1KA 2DJ0A 1M99A 2VL2A 2LJKA 4MPFA 2KP1A 1MD4A 4POLA 1XWCA 2HRAA 2FA4A 3L9UA 3QCPA 5J9BA 3RDWA 2E2GA 3BJ5A 1ZOFA 5DALB 4OFMA 3MSZA 3Q74A 1CQHA 1A23A 3EURA 3P2AA 1SK0A 1UN2A 3D6IA 3O3TA 2NPBA 4V1Ag 3M0FA 5G31A 2TRCP 2M72A 3M3MA 1DBYA 5EVOA 2WB9A 2RM6A 3D5JA 3TKPA 3R2QA 3IK7A 3QD9A 1XWBA 1THXA 3TJKA 7GSSA 3ZZXA 4K8MA 4KSMA 3UVTA 1PA3A 5DALA 4BWQA 1ZYEA 5A5KA 3UAPA 4PNGA 1U6TA 1TKDB 2KLXA 4TKYA 1XWGA 4K0GA 1BX9A 1YEXA 1ZL9A 4I8BA 5A4WA 5ID2B 2TIRA 1ZMAA 4OFNA 3C73A 4G0IA 5GSSA 1GSEA 5D9VA 3BBYA 4D73A 1F3BA 3FRCA 1XWAA 3PR8A 5ECLB 5D93A 2C3TA 1O8XA 2HZEB 2H70A 20GSA 4I2UA 2LRCA 4EC0A 3GSSA 1VF4A 2VCXA 2WDUA 1J9BA 1O8WA 2V32A 1V40A 3QAGA 3G7IA 1YF1A 3LFLA 1JZWA 3GURA 2ALBA 1MEKA 4IQ1A 3Q18A 1QUWA 3WGDA 4XTSA 2JL4A 4ZB9A 4J56E 2K8SA 4XHMA 2OE3A 4YQUA 5IM9A 4WKWA 1W4VA 3H79A 4NHWA 1PQNA 4OO5A 4AGSA 2AUVA 4I6XA 5AIVA 1V57A 2P0GA 1UVZA 4HZ4A 1JZRA 4L0UA 2VL3A 5DBQA 3EYTA 4LMWA 5JWRB 3ZITA 1PGTA 5ECMB 3ISOA 1OE8A 3M9KA 4F0BA 2KP2A 2CX4A 3UOMA 2VL9A 3IHQA 5ECOB 19GSA 4J2FA 5CP1A 2M80A 2BJXA 3EVIA 4HZ2A 3GTUB 2FWGA 2LV3A 3PINA 1KEBA 2H72A 3FZAA 3H93A 3ME8A 2H30A 2IN3A 4O7HA 1T7PB 2ZUPA 2L59A 1M9AA 1OC9A 3IR4A 2HYXA 2I9HA 5JCWA 3KEBA 4TR4A 4ZBBA 4KDUA 4O92A 2YZHA 1YY7A 5DAKA 1HNBA 5KEJA 4WR4A 3US3A 3CSJA 4ZXGA 4G10A 1OVNA 2X8HA 3FYGA 1EZKA 4IHUA 4TR3A 1YF0A 3GL3A 1M7TA 1SD9A 5B6NA 5HR0A 2YWNA 2OE0A 2DMLA 1EGOA 2GGTA 2A2SA 2XPEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5F8BA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations