5FDZA

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with compound bdomb00091a (compound 14)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
total genus 40
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fdzA00
3O36A 5I83A 4IOQA 4NR6A 5D3TA 4MEPA 4QUUA 4XYAA 4C66A 5C85A 2RNWA 5EPSA 4QBMA 5EWHA 4DONA 5FH8A 4MR4A 5CUEA 2RNYA 4UIYA 5DY7A 5FE8A 5FG4A 4IR3A 4NXJA 5A7CA 2DVQA 5DFDA 4ZW1A 4YBMA 4BW4A 4QSVA 5E3GA 5HRVA 5EWWA 5CS8A 2R0VA 5CUGA 4YADA 5DW2A 4LYSA 5HRXA 4YK0A 4NUEA 5LKUA 5DYAA 5FE3A 5CFWA 4NUCA 5D3NA 4HBVA 5C89A 4ALHA 5HRWA 2RS9B 3SVGA 4LZRA 4NR4A 4YYDA 2OO1A 4CUPA 2N9GA 5CQ8A 5IGLA 4CL9A 5D3HA 5DFBA 5LKZA 4O7FA 4YBTA 4TT6A 5H1UA 4YY4A 5IIDA 3SVHA 5E9MA 5E9VA 4A9LA 3P1DA 4MEQA 4QSWA 5FE4A 4MR6A 2RO1A 4UIVA 4TT2A 5E74A 4XY9A 2NXBA 5CRMA 5FE6A 4UYEA 4TZ8A 5DKHA 4Q0NA 3LQIA 5EVAA 5EISA 5C4QA 4YYGA 4FLPA 3UVYA 5DLZA 5FE5A 2RI7A 4A9JA 4CURA 5HJCA 5D3JA 4O70A 4O76A 4CLBA 4J3IA 4NYVA 4TYLA 2D9EA 5LJ2A 3P5OA 5KO4A 5I86A 5ETBA 5CU8A 3UVDA 4IOOA 5L8TA 5DX4A 5A82A 5EPBA 4ZC9A 4WHWA 1WUGA 5EV9A 5EWVA 5D0CA 4LZSA 5ENIA 3U5LA 2F6NA 4NYXA 5H85A 4A9KA 5ENEA 4YABA 3S92A 5G4SA 5FH7A 4HXLA 4HXMA 3U5NA 5HFQA 5D3RA 4Z6HA 1E6IA 5IBNA 4NRCA 3U5MA 3UV2A 5CUAA 5LVRA 5F60A 4PY6A 5E73A 5CQ4A 5EQ1A 5CQ7A 4CUQA 5LKXA 4NR9A 3U5JA 5LJ1A 5KTXA 2WP1A 4YYKA 5DFCA 5HFRA 5CP5A 3MXFA 3UV4A 2KTBB 5K29A 4TZ2A 2FSAA 5EWDA 3FKMX 4QEUA 4LDFA 3DWYA 5I1QA 5E9IA 2L85A 2OSSA 2YELA 3IU6A 5EPRA 5FFVA 5KTUA 5I40A 4HXSA 4NQNA 2DATA 2OUOA 3MUKA 5CQAA 5D25A 3GG3A 3G0LA 4QSUA 5F5ZA 5A5NA 5I88A 5D7XA 5E3DA 5EU1A 2E7NA 4NR8A 4OGJA 3HMEA 5FE1A 5HQ5A 4UYGA 4CUTA 4LRGA 5DYXA 5CUBA 5HELA 5DW1A 2DKWA 4CUUA 5BT4A 3UV5A 5FBXA 5F1HA 4O78A 5FG6A 5A85A 4UYFA 3G0JA 5D26A 5ENGA 5LJ0A 4KV1A 4Z93A 5F62A 4QYDA 5A81A 4YH3A 4BW2A 2L5EA 5F61A 3AADA 5CZGA 4F3IA 5TCMA 3JVMA 4MEOA 5HLSA 5EICA 5IGMA 5CQTA 4YY6A 4XY8A 5I80A 3I3JA 2I7KA 2GRCA 5L96A 5FFYA 4BW3A 4UIUA 4Z1SA 4O72A 4UIWA 4IR4A 5A5PA 4UITA 4RVRA 1EQFA 4HXNA 4A9NA 4LC2A 4LZ2A 5COIA 4WHUA 5BT3A 2DWWA 4HXRA 4ALGA 4OGIA 5AMFA 5FDZA 3U5KA 5L99A 4QY4A 3JVLA 4XUAA 5D3LA 5I29A 4ZQLA 4QC3A 5AD2A 5CPEA 4TQNA 5A5RA 5EP7A 4PCEA 1JM4B 1ZS5A 4UYFB 5EWCA 5H1VA 4QSTA 4KV4A 5LKTA 4TS8A 4WIVA 4YC9A 5FE2A 3HMFA 4UIZA 5EK9A 5TB6A 4YYIA 5LVQA 4O7EA 4YAXA 4A9HA 5A5SA 5ENHA 4PKLA 3MB4A 4OUFA 5DKCA 3MULA 4MR3A 3Q2EA 2I8NA 5ENFA 2MJVB 3JVJA 4QB3A 4N4HA 5F63A 2R0YA 4O74A 5LUUA 4NR7A 2RFJA 5A83A 5AD3A 5L97A 3RCWA 4O71A 2E3KA 2YEMA 5FG5A 1F68A 5E9YA 4TTEA 5H1TA 5DYCA 3UVXA 3K2JA 4QSQA 5E9LA 2R10A 5DLXA 4BHWA 5ENBA 5ACYA 5E7DA 5FE7A 3MB3A 1JSPB 4NYWA 5CTLA 5A5OA 5JWMA 4E96A 4XUBA 2E7OA 4N4FA 4A9IA 4J0RA 5IGNA 4NRBA 2YEKA 3ONIA 3TLPA 5II2A 4LR6A 5CQ5A 4QC1A 4CUSA 5CQ6A 3O35A 4MENA 5II1A 2YYNA 4YH4A 2F6JA 4O7AA 5DBMA 3QZSA 5I89A 5HQ6A 5BT5A 4GPJA 4IORA 5DKDA 4TT4A 5CUDA 5L8UA 4HXOA 5DYUA 4NUDA 5IGKA 4O75A 4YYMA 5F3AA 4Z1QA 4QEWA 5C7NA 5FH6A 5AMEA 4BJXA 4NR5A 5FE0A 3O37A 3AQAA 3NXBA 5I7XA 1N72A 5CY9A 5ENCA 3DAIA 2G4AA 4C67A 5FB0A 3JVKA 5C87A 4CFLA 3LQHA 4LYIA 4CFKA 2R0SA 4YATA 2H60A 5EM3A 4N3WA 5D3PA 2WP2A 5EA1A 5FB1A 5HENA 5KU3A 2YDWA 5FE9A 4QSXA 4NRAA 3LJWA 4N4GA 3QZVA 4X2IA 3MQMA 3UVWA 5IG6A 2DVVA 5F36A 5CRZA 2RNXA 3P1CA 5ETDA 5HQ7A 2YQDA 5EGUA 4O77A 3Q2FA 4J0SA 4QUTA 4IR5A 4J1PA 5JI8A 1X0JA 4QR3A 4NS5A 4HBXA 4NQMA 4MR5A 3LQJA 4QSRA 4YYHA 2DVRA 5F1LA 3U5OA 5D3SA 4PTBA 4QYLA 4TU6A 2DVSA 5D24A 4UIXA 3O33A 4A9FA 4IR6A 3LXJA 5F25A 4KCXA 4O7CA 5CQ3A 5KHMA 4YYNA 5C8GA 4QSSA 5E0RA 3SVFA 5G4RA 5F2PA 5CGPA 1WUMA 4UYHA 5J0DA 4YBSA 3IU5A 2LSPB 3P1FA 5CUCA 5HM0A 4Q0OA 4YYJA 2D82A 5ENJA 3S91A 4LYWA 4PS5A 5KTWA 4HXPA 4QSPA 5HCLA 4Y03A 4UYDA 3U5PA 3O34A 4PCIA 4TU4A 4QR4A 5E9KA 3D7CA 4QNSA 4QZSA 4QR5A 3QZTA 5I7YA 4HXKA 2L84A 3HMHA 4HBYA 4O7BA 5EI4A 4QEVA 5L98A 2YW5A 3ZYUA 3UW9A 3P1EA 4A9MA 4Z6IA 4AKNA 4A9EA 4N4IA 4HBWA 4A9OA 4BW1A 5A5QA 5HEMA 5FFWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O36A 5I83A 4IOQA 4NR6A 5D3TA 4MEPA 4QUUA 4XYAA 4C66A 5C85A 2RNWA 5EPSA 4QBMA 5EWHA 4DONA 5FH8A 4MR4A 5CUEA 2RNYA 4UIYA 5DY7A 5FE8A 5FG4A 4IR3A 4NXJA 5A7CA 2DVQA 5DFDA 4ZW1A 4YBMA 4BW4A 4QSVA 5E3GA 5HRVA 5EWWA 5CS8A 2R0VA 5CUGA 4YADA 5DW2A 4LYSA 5HRXA 4YK0A 4NUEA 5LKUA 5DYAA 5FE3A 5CFWA 4NUCA 5D3NA 4HBVA 5C89A 4ALHA 5HRWA 2RS9B 3SVGA 4LZRA 4NR4A 4YYDA 2OO1A 4CUPA 2N9GA 5CQ8A 5IGLA 3VKHA 4CL9A 5D3HA 5DFBA 5LKZA 4O7FA 4YBTA 4TT6A 5H1UA 4YY4A 5IIDA 3SVHA 5E9MA 5E9VA 4A9LA 3P1DA 4MEQA 4QSWA 5FE4A 4MR6A 2RO1A 4UIVA 4TT2A 5E74A 4XY9A 2NXBA 5CRMA 5FE6A 4UYEA 4TZ8A 5DKHA 4Q0NA 3LQIA 5EVAA 5EISA 5C4QA 4YYGA 4FLPA 3UVYA 5DLZA 5FE5A 2RI7A 4A9JA 4CURA 5HJCA 5D3JA 4O70A 4O76A 4CLBA 4J3IA 4NYVA 4TYLA 2D9EA 4AKHA 5LJ2A 3P5OA 5KO4A 5I86A 5ETBA 5CU8A 3UVDA 4IOOA 5L8TA 5DX4A 5A82A 5EPBA 4ZC9A 4WHWA 1WUGA 5EV9A 5EWVA 5D0CA 4LZSA 5ENIA 3U5LA 2F6NA 4NYXA 5H85A 4A9KA 5ENEA 4YABA 3S92A 5G4SA 5FH7A 4HXLA 4HXMA 3U5NA 5HFQA 5D3RA 4Z6HA 1E6IA 5IBNA 4NRCA 3U5MA 3UV2A 5CUAA 5LVRA 5F60A 4PY6A 5E73A 5CQ4A 5EQ1A 5CQ7A 4CUQA 5LKXA 4NR9A 3U5JA 5LJ1A 5KTXA 2WP1A 4YYKA 5DFCA 5HFRA 5CP5A 3MXFA 3UV4A 2KTBB 5K29A 4TZ2A 2FSAA 5EWDA 3FKMX 4QEUA 4LDFA 3DWYA 5I1QA 5E9IA 2L85A 2OSSA 2YELA 3IU6A 5EPRA 5FFVA 5KTUA 5I40A 4HXSA 4NQNA 2DATA 2OUOA 3MUKA 5CQAA 5D25A 3GG3A 3G0LA 4QSUA 5F5ZA 5A5NA 5I88A 5D7XA 5E3DA 5EU1A 2E7NA 4NR8A 4OGJA 3HMEA 5FE1A 5HQ5A 4UYGA 2EJNA 4CUTA 4LRGA 5DYXA 5CUBA 5HELA 1PUOA 5DW1A 2DKWA 4CUUA 3ERRA 5BT4A 3UV5A 5FBXA 5F1HA 4O78A 5FG6A 5A85A 4UYFA 3G0JA 5D26A 5ENGA 5LJ0A 4KV1A 4Z93A 5F62A 4QYDA 5A81A 4YH3A 4BW2A 2L5EA 3D1BA 5F61A 3AADA 5CZGA 4F3IA 5TCMA 3JVMA 4MEOA 5HLSA 5EICA 5IGMA 5CQTA 4YY6A 4XY8A 5I80A 3I3JA 2I7KA 2GRCA 5L96A 5FFYA 4BW3A 4UIUA 4Z1SA 4O72A 4UIWA 4IR4A 5A5PA 4UITA 4RVRA 1EQFA 4HXNA 4A9NA 4LC2A 4LZ2A 5COIA 4WHUA 5BT3A 2DWWA 4HXRA 4ALGA 4OGIA 5AMFA 5FDZA 3U5KA 5L99A 4QY4A 3JVLA 4XUAA 5D3LA 5I29A 4ZQLA 4QC3A 5AD2A 5CPEA 4TQNA 5A5RA 5EP7A 4PCEA 1JM4B 1ZS5A 4UYFB 5EWCA 5H1VA 4QSTA 4KV4A 5LKTA 4TS8A 4WIVA 4YC9A 5FE2A 3HMFA 4UIZA 5EK9A 5TB6A 4YYIA 5LVQA 4O7EA 4YAXA 4A9HA 5A5SA 5ENHA 4PKLA 3MB4A 4OUFA 5DKCA 3MULA 4MR3A 3Q2EA 2I8NA 5ENFA 2MJVB 3JVJA 4QB3A 4N4HA 5F63A 2R0YA 4O74A 5LUUA 4NR7A 2RFJA 5A83A 5AD3A 5L97A 3RCWA 4O71A 2E3KA 2YEMA 5FG5A 1F68A 5E9YA 4TTEA 5H1TA 5DYCA 3UVXA 3K2JA 4QSQA 5E9LA 2R10A 5DLXA 4BHWA 1ZKRA 5ENBA 5ACYA 5E7DA 5FE7A 3D1DA 3MB3A 1JSPB 4NYWA 5CTLA 5A5OA 5JWMA 4E96A 4XUBA 2E7OA 4AKIA 4N4FA 4A9IA 4J0RA 5IGNA 4NRBA 2YEKA 3ONIA 3TLPA 5II2A 4LR6A 5CQ5A 4QC1A 4CUSA 5CQ6A 3O35A 4MENA 5II1A 2YYNA 4YH4A 2F6JA 4O7AA 5DBMA 3QZSA 5I89A 5HQ6A 5BT5A 4GPJA 4IORA 5DKDA 4TT4A 5CUDA 5L8UA 4HXOA 5DYUA 4NUDA 5IGKA 4O75A 4YYMA 5F3AA 4Z1QA 4QEWA 5C7NA 5FH6A 5AMEA 4BJXA 4NR5A 5FE0A 3O37A 3AQAA 3NXBA 5I7XA 1N72A 5CY9A 5ENCA 3DAIA 2G4AA 4C67A 5FB0A 3JVKA 5C87A 4CFLA 3LQHA 4LYIA 4CFKA 2R0SA 4YATA 2H60A 5EM3A 4N3WA 5D3PA 2WP2A 5EA1A 5FB1A 5HENA 5KU3A 2YDWA 5FE9A 4QSXA 4NRAA 3LJWA 4N4GA 3QZVA 4X2IA 3MQMA 3UVWA 5IG6A 2DVVA 5F36A 5CRZA 2RNXA 3P1CA 5ETDA 5HQ7A 2YQDA 5EGUA 4O77A 3Q2FA 4J0SA 4QUTA 4IR5A 4J1PA 5JI8A 1X0JA 4QR3A 4NS5A 4HBXA 4NQMA 4MR5A 3LQJA 4QSRA 4YYHA 2DVRA 5F1LA 3U5OA 5D3SA 4PTBA 4QYLA 4TU6A 2DVSA 5D24A 4UIXA 3O33A 4A9FA 4IR6A 3LXJA 5F25A 4KCXA 4O7CA 5CQ3A 5KHMA 4YYNA 5C8GA 4QSSA 5E0RA 3SVFA 5G4RA 5F2PA 5CGPA 1WUMA 4UYHA 5J0DA 4YBSA 3IU5A 2LSPB 3P1FA 5CUCA 4AKGA 5HM0A 3VKGA 4Q0OA 4YYJA 2D82A 5ENJA 3S91A 4LYWA 4PS5A 5KTWA 4HXPA 4QSPA 5HCLA 4Y03A 4UYDA 3U5PA 3O34A 4PCIA 4TU4A 4QR4A 5E9KA 3D7CA 4QNSA 4QZSA 4QR5A 3QZTA 5I7YA 4HXKA 2L84A 3HMHA 4HBYA 4O7BA 5EI4A 4QEVA 5L98A 2YW5A 3ZYUA 3UW9A 3P1EA 4A9MA 4Z6IA 4AKNA 4AI6A 4A9EA 4N4IA 4HBWA 4A9OA 4BW1A 5A5QA 5HEMA 5FFWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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