5FE4A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment mb364 (fragment 5)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe4A00
2YEKA 5FH7A 3AQAA 3GG3A 4UIXA 5DKHA 5ENIA 5CQ4A 5EWVA 5HRWA 5IGLA 2E7OA 4DONA 2NXBA 5A83A 4UYEA 3U5LA 4KV1A 4N4GA 5DKCA 4CUSA 5EA1A 5L98A 4UITA 5JWMA 2GRCA 5AMFA 5ENCA 3I3JA 5C85A 5FFWA 2DVSA 5HRVA 4TU6A 4O7FA 4OGJA 4NR5A 4NR9A 4BW2A 4HXRA 5LKUA 3RCWA 3DWYA 4HXPA 3SVFA 5F1LA 4ZW1A 3UV2A 5CUGA 5II1A 4NUCA 4QYDA 4YH3A 4QSSA 5FE3A 5TCMA 4O72A 3O34A 5HQ6A 3U5NA 4N4HA 3MB3A 4QSUA 5ETBA 4CUPA 2KTBB 4IR3A 5KTUA 4UYGA 5DYUA 5EU1A 5J0DA 4IOQA 2RNWA 5KTXA 3JVJA 4MEOA 4CFLA 5E9IA 5I88A 4QSWA 4O71A 4PCEA 4YC9A 5CP5A 4ZQLA 2DKWA 5LKZA 5EM3A 5EVAA 4PS5A 5F60A 2YELA 4UIYA 1WUMA 3FKMX 5D3HA 4NQMA 4QBMA 5FE4A 5I80A 5D7XA 5HFRA 4QUTA 2RNXA 2L5EA 5EV9A 5L96A 1EQFA 5A82A 5I83A 5CS8A 5IIDA 4TYLA 5F63A 5HM0A 4CURA 3QZSA 4XUBA 3U5MA 5CUEA 3K2JA 5FE6A 5EPBA 2OSSA 2D9EA 4MR4A 4QNSA 4BHWA 5EGUA 4HBVA 5DLZA 4MENA 5FFVA 5E73A 5FH8A 5DW2A 4YK0A 5D3RA 4QSXA 5CU8A 4ZC9A 3TLPA 4Q0NA 2R0VA 5F3AA 5LKTA 4MR3A 4TZ8A 4UYHA 5EICA 4J1PA 2FSAA 3LJWA 4PCIA 5TB6A 5FE5A 5I86A 5CQTA 4C66A 4YBTA 3UVDA 5DFBA 5I89A 3JVKA 3U5PA 5CFWA 3QZTA 4CFKA 4LC2A 5F61A 5CRMA 4NR6A 5FE1A 1JSPB 2YDWA 4YADA 5C7NA 5A85A 5CUAA 5H1VA 4LZRA 5FG5A 4A9LA 4HBYA 5HELA 4HXOA 3O37A 4O77A 4YYJA 5EQ1A 4LRGA 5A5NA 5G4SA 5BT5A 5E9VA 4XY8A 4YBSA 5E7DA 5CUBA 5CQ8A 5C87A 4NRAA 4LYWA 2MJVB 3ONIA 5CGPA 4YYGA 2YQDA 2F6JA 5KHMA 5CQAA 5D3SA 4QSVA 4TU4A 4QUUA 4Z6HA 5C89A 5CY9A 1WUGA 3S92A 5F5ZA 4O78A 4KV4A 5FE2A 5HENA 5I29A 2L84A 3NXBA 4YY6A 5CTLA 3D7CA 4Z93A 2D82A 3P5OA 4MEPA 5FFYA 4XUAA 5CRZA 4HXSA 4CUTA 5E9KA 4QY4A 4TTEA 5A81A 4MR5A 4PTBA 3Q2FA 5E9YA 5HQ5A 5FG6A 5IGNA 4HBXA 5IBNA 5DW1A 4ALGA 5C8GA 5L8UA 3AADA 1E6IA 2WP2A 5EI4A 2RO1A 2L85A 1ZS5A 5LKXA 5LVQA 5D0CA 3P1CA 4O7CA 3S91A 2I7KA 4LDFA 4UYFA 2DVRA 4QR3A 2DATA 4CUQA 5FG4A 4NR4A 5D3JA 5DX4A 4O7AA 5D26A 4YBMA 5EP7A 4LYIA 4YH4A 4TQNA 4J0RA 4YYIA 4HXLA 4A9FA 5FH6A 5DLXA 3LXJA 5F36A 5CPEA 4PKLA 4QB3A 2RS9B 4BW4A 4UIVA 3O33A 5ENEA 4BW1A 2OUOA 3G0LA 5DFDA 4NUDA 4UIUA 4MEQA 3P1EA 2DVVA 5EWDA 3LQJA 4TZ2A 5I40A 4BJXA 4LR6A 4N4FA 5F25A 5FBXA 3IU5A 3MUKA 4QZSA 5K29A 2YEMA 4TS8A 5ETDA 4HXKA 4F3IA 4QEVA 2DWWA 3UV5A 4PY6A 4UIWA 5A5OA 4A9NA 4NYWA 5CQ6A 3JVLA 4WHUA 3MQMA 3ZYUA 5E9MA 4YYDA 4Z1QA 5CQ7A 5AD3A 4IOOA 4NYXA 4NRCA 5D25A 5KO4A 5FB1A 3QZVA 5ENBA 4QEWA 5D24A 4AKNA 2RFJA 4IR5A 4QYLA 5HFQA 5EK9A 3U5KA 4E96A 5FE7A 4NYVA 4LYSA 4Z6IA 5DBMA 4J0SA 4O7BA 5KU3A 4KCXA 2WP1A 1JM4B 5IG6A 3P1FA 5HEMA 4WHWA 4N3WA 5AMEA 3Q2EA 5ENGA 5I1QA 2RI7A 4UIZA 4LZ2A 1N72A 5A7CA 2RNYA 5L97A 5LVRA 5F2PA 4A9EA 4QSQA 5CZGA 4N4IA 4J3IA 2I8NA 5HJCA 4QR4A 2H60A 5FE8A 3U5OA 5D3NA 5E3DA 4NUEA 4UYFB 5DYCA 4X2IA 5L8TA 3JVMA 4CLBA 5IGKA 5DYAA 5CUCA 4A9OA 5H85A 5H1TA 5ENFA 5LUUA 5H1UA 1X0JA 5I7YA 4NXJA 5FE0A 5E74A 5KTWA 3SVHA 5E0RA 4IR4A 5A5SA 5LJ2A 4O76A 4OUFA 4ALHA 5A5RA 4NR7A 4UYDA 3SVGA 4CUUA 2YYNA 4Z1SA 5IGMA 4HXMA 5ENJA 3UW9A 3DAIA 3HMHA 5F62A 5CUDA 5DKDA 4CL9A 3UV4A 3U5JA 3LQHA 2DVQA 5E3GA 5DYXA 5ACYA 4YY4A 3HMFA 4YAXA 3IU6A 5G4RA 3HMEA 3LQIA 5F1HA 4GPJA 2R0SA 4O75A 5AD2A 4QR5A 4A9JA 2E7NA 5EPRA 5FDZA 3UVXA 4TT6A 5EWCA 3G0JA 4C67A 4NRBA 5II2A 4NR8A 2E3KA 3P1DA 4OGIA 4XYAA 4A9KA 5D3LA 2YW5A 5HQ7A 4Y03A 2N9GA 5COIA 4QEUA 5CQ5A 4QC1A 4QSRA 2OO1A 5FB0A 4TT4A 2R0YA 4TT2A 4YYHA 5E9LA 1F68A 5D3TA 2LSPB 4A9IA 4NS5A 4YYMA 5A5PA 4QSTA 4A9HA 3O35A 3MULA 4HBWA 5EISA 5DY7A 4O70A 3MXFA 5HRXA 4YABA 4FLPA 5ENHA 4BW3A 4YYNA 3UVWA 4NQNA 5L99A 4QSPA 5C4QA 4WIVA 4A9MA 2F6NA 4QC3A 3O36A 5EWWA 5BT3A 5A5QA 2R10A 2G4AA 3UVYA 4O74A 5HLSA 5LJ1A 4IR6A 4Q0OA 4HXNA 5D3PA 5EWHA 4IORA 4YATA 5CQ3A 5EPSA 5DFCA 4O7EA 5FE9A 4YYKA 4XY9A 5BT4A 4LZSA 3MB4A 5I7XA 5HCLA 4RVRA 4MR6A 5LJ0A 5JI8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AI6A 2YEKA 5FH7A 3AQAA 3GG3A 4UIXA 5DKHA 5ENIA 5CQ4A 5EWVA 5HRWA 5IGLA 2E7OA 4DONA 2NXBA 5A83A 4UYEA 3U5LA 4KV1A 4N4GA 5DKCA 4CUSA 5EA1A 5L98A 4UITA 5JWMA 2GRCA 5AMFA 5ENCA 3I3JA 5C85A 5FFWA 2DVSA 5HRVA 4TU6A 4O7FA 4OGJA 4NR5A 4NR9A 4BW2A 4HXRA 5LKUA 3RCWA 3DWYA 4HXPA 3SVFA 5F1LA 4ZW1A 3UV2A 5CUGA 5II1A 4NUCA 4QYDA 4YH3A 4QSSA 5FE3A 5TCMA 4O72A 3O34A 5HQ6A 3U5NA 4N4HA 3MB3A 4QSUA 5ETBA 4CUPA 2KTBB 4IR3A 5KTUA 4UYGA 5DYUA 5EU1A 5J0DA 4IOQA 2RNWA 5KTXA 3JVJA 4MEOA 4CFLA 5E9IA 5I88A 4QSWA 4O71A 4PCEA 4YC9A 5CP5A 4ZQLA 2DKWA 5LKZA 5EM3A 5EVAA 4PS5A 5F60A 2YELA 4UIYA 1WUMA 3FKMX 5D3HA 4NQMA 4QBMA 5FE4A 5I80A 5D7XA 5HFRA 4QUTA 2RNXA 2L5EA 5EV9A 5L96A 1EQFA 5A82A 5I83A 5CS8A 5IIDA 4TYLA 5F63A 5HM0A 4CURA 3QZSA 4XUBA 3U5MA 5CUEA 3K2JA 5FE6A 5EPBA 2OSSA 2D9EA 4MR4A 4QNSA 4BHWA 5EGUA 4HBVA 5DLZA 4MENA 5FFVA 5E73A 5FH8A 5DW2A 4YK0A 5D3RA 4QSXA 3VKGA 5CU8A 4ZC9A 3TLPA 4Q0NA 2R0VA 5F3AA 5LKTA 4MR3A 4TZ8A 4UYHA 5EICA 4J1PA 2FSAA 3LJWA 4PCIA 5TB6A 5FE5A 5I86A 5CQTA 4C66A 4YBTA 3UVDA 5DFBA 5I89A 3JVKA 3U5PA 5CFWA 3QZTA 4CFKA 4LC2A 5F61A 5CRMA 4NR6A 5FE1A 1JSPB 2YDWA 4YADA 5C7NA 5A85A 5CUAA 5H1VA 4LZRA 5FG5A 4A9LA 4HBYA 5HELA 4HXOA 3O37A 4O77A 4YYJA 5EQ1A 4LRGA 5A5NA 5G4SA 5BT5A 5E9VA 4XY8A 4YBSA 5E7DA 5CUBA 5CQ8A 5C87A 4NRAA 4LYWA 2MJVB 3ONIA 5CGPA 4YYGA 2EJNA 2YQDA 2F6JA 5KHMA 5CQAA 5D3SA 4QSVA 4TU4A 4QUUA 4Z6HA 5C89A 5CY9A 1WUGA 4AKHA 3S92A 5F5ZA 4O78A 4KV4A 5FE2A 5HENA 5I29A 2L84A 3NXBA 4YY6A 5CTLA 3D7CA 4Z93A 2D82A 3P5OA 4MEPA 5FFYA 4XUAA 5CRZA 4HXSA 4CUTA 5E9KA 4QY4A 4TTEA 5A81A 4MR5A 4PTBA 3Q2FA 5E9YA 5HQ5A 5FG6A 5IGNA 4HBXA 5IBNA 5DW1A 4ALGA 5C8GA 5L8UA 3AADA 1E6IA 2WP2A 5EI4A 2RO1A 2L85A 1ZS5A 5LKXA 5LVQA 5D0CA 3P1CA 3ERRA 4O7CA 3S91A 2I7KA 4LDFA 4UYFA 2DVRA 4QR3A 2DATA 4CUQA 5FG4A 4NR4A 5D3JA 5DX4A 4O7AA 5D26A 3D1BA 4YBMA 5EP7A 4LYIA 4YH4A 4TQNA 4J0RA 4YYIA 4HXLA 4A9FA 5FH6A 5DLXA 3LXJA 5F36A 5CPEA 4PKLA 4QB3A 2RS9B 4BW4A 4UIVA 3O33A 5ENEA 4BW1A 2OUOA 3G0LA 5DFDA 4NUDA 4UIUA 4MEQA 3P1EA 2DVVA 5EWDA 3LQJA 4TZ2A 5I40A 4BJXA 4LR6A 4N4FA 5F25A 5FBXA 3IU5A 3MUKA 4QZSA 5K29A 2YEMA 4TS8A 5ETDA 4AKGA 4HXKA 4F3IA 4QEVA 2DWWA 3UV5A 1ZKRA 4PY6A 4UIWA 5A5OA 4A9NA 4NYWA 5CQ6A 3JVLA 4WHUA 3MQMA 3ZYUA 5E9MA 4YYDA 4Z1QA 5CQ7A 3D1DA 5AD3A 4IOOA 4NYXA 4NRCA 5D25A 5KO4A 5FB1A 3QZVA 5ENBA 4QEWA 5D24A 4AKNA 2RFJA 4IR5A 4QYLA 5HFQA 5EK9A 3U5KA 4E96A 5FE7A 4NYVA 4LYSA 4Z6IA 5DBMA 4J0SA 4O7BA 5KU3A 4KCXA 2WP1A 1JM4B 5IG6A 3P1FA 5HEMA 4WHWA 4N3WA 5AMEA 3Q2EA 5ENGA 5I1QA 2RI7A 4UIZA 4LZ2A 1N72A 5A7CA 2RNYA 5L97A 5LVRA 5F2PA 4A9EA 4QSQA 5CZGA 4N4IA 4J3IA 2I8NA 5HJCA 4QR4A 2H60A 5FE8A 3U5OA 5D3NA 5E3DA 4NUEA 4UYFB 5DYCA 4X2IA 5L8TA 3JVMA 4CLBA 5IGKA 5DYAA 5CUCA 4A9OA 5H85A 5H1TA 5ENFA 5LUUA 5H1UA 1X0JA 5I7YA 4NXJA 5FE0A 5E74A 5KTWA 3SVHA 5E0RA 4IR4A 5A5SA 5LJ2A 4O76A 4OUFA 4ALHA 5A5RA 4NR7A 4UYDA 3SVGA 4CUUA 2YYNA 4Z1SA 5IGMA 4HXMA 5ENJA 3UW9A 3DAIA 3HMHA 5F62A 1PUOA 5CUDA 5DKDA 4CL9A 3UV4A 3U5JA 3LQHA 2DVQA 5E3GA 5DYXA 5ACYA 4YY4A 3HMFA 4YAXA 3IU6A 5G4RA 3HMEA 3LQIA 5F1HA 4GPJA 2R0SA 4O75A 3VKHA 5AD2A 4QR5A 4A9JA 2E7NA 5EPRA 5FDZA 3UVXA 4TT6A 5EWCA 3G0JA 4C67A 4NRBA 5II2A 4NR8A 2E3KA 3P1DA 4OGIA 4XYAA 4A9KA 5D3LA 2YW5A 5HQ7A 4Y03A 2N9GA 5COIA 4AKIA 4QEUA 5CQ5A 4QC1A 4QSRA 2OO1A 5FB0A 4TT4A 2R0YA 4TT2A 4YYHA 5E9LA 1F68A 5D3TA 2LSPB 4A9IA 4NS5A 4YYMA 5A5PA 4QSTA 4A9HA 3O35A 3MULA 4HBWA 5EISA 5DY7A 4O70A 3MXFA 5HRXA 4YABA 4FLPA 5ENHA 4BW3A 4YYNA 3UVWA 4NQNA 5L99A 4QSPA 5C4QA 4WIVA 4A9MA 2F6NA 4QC3A 3O36A 5EWWA 5BT3A 5A5QA 2R10A 2G4AA 3UVYA 4O74A 5HLSA 5LJ1A 4IR6A 4Q0OA 4HXNA 5D3PA 5EWHA 4IORA 4YATA 5CQ3A 5EPSA 5DFCA 4O7EA 5FE9A 4YYKA 4XY9A 5BT4A 4LZSA 3MB4A 5I7XA 5HCLA 4RVRA 4MR6A 5LJ0A 5JI8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YEK A;  5FH7 A;  3AQA A;  3GG3 A;  4UIX A;  5DKH A;  5ENI A;  5CQ4 A;  5EWV A;  5HRW A;  5IGL A;  2E7O A;  4DON A;  2NXB A;  5A83 A;  4UYE A;  3U5L A;  4KV1 A;  4N4G A;  5DKC A;  4CUS A;  5EA1 A;  5L98 A;  4UIT A;  5JWM A;  2GRC A;  5AMF A;  5ENC A;  3I3J A;  5C85 A;  5FFW A;  2DVS A;  5HRV A;  4TU6 A;  4O7F A;  4OGJ A;  4NR5 A;  4NR9 A;  4BW2 A;  4HXR A;  5LKU A;  3RCW A;  3DWY A;  4HXP A;  3SVF A;  5F1L A;  4ZW1 A;  3UV2 A;  5CUG A;  5II1 A;  4NUC A;  4QYD A;  4YH3 A;  4QSS A;  5FE3 A;  5TCM A;  4O72 A;  3O34 A;  5HQ6 A;  3U5N A;  4N4H A;  3MB3 A;  4QSU A;  5ETB A;  4CUP A;  2KTB B;  4IR3 A;  5KTU A;  4UYG A;  5DYU A;  5EU1 A;  5J0D A;  4IOQ A;  2RNW A;  5KTX A;  3JVJ A;  4MEO A;  4CFL A;  5E9I A;  5I88 A;  4QSW A;  4O71 A;  4PCE A;  4YC9 A;  5CP5 A;  4ZQL A;  2DKW A;  5LKZ A;  5EM3 A;  5EVA A;  4PS5 A;  5F60 A;  2YEL A;  4UIY A;  1WUM A;  3FKM X;  5D3H A;  4NQM A;  4QBM A;  5FE4 A;  5I80 A;  5D7X A;  5HFR A;  4QUT A;  2RNX A;  2L5E A;  5EV9 A;  5L96 A;  1EQF A;  5A82 A;  5I83 A;  5CS8 A; 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