5FH7A

Crystal structure of the fifth bromodomain of human pb1 in complex with compound 18
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKYMTPMQQKLNEVYEAVKNYTDKRGRRLSAIFLRLPSRSELPDYYLTIKKPMDMEKIRSHMMANKYQDIDSMVEDFVMMFNNACTYNEPESLIYKDALVLHKVLLETRRDLEGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Protein polybromo-1
publication title Identification and Development of 2,3-Dihydropyrrolo[1,2-a]quinazolin-5(1H)-one Inhibitors Targeting Bromodomains within the Switch/Sucrose Nonfermenting Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fh7A00
4HXNA 4CUSA 3AQAA 4OUFA 2YDWA 3U5PA 4IORA 4NUEA 5CUDA 5KU3A 3P1FA 3U5NA 2R0YA 5FE1A 5L98A 4XUBA 5FG4A 3IU5A 5F25A 4CUPA 2L84A 2LSPB 3LJWA 5HENA 4Q0NA 4ZC9A 3MQMA 4A9JA 4QSTA 4O71A 4YK0A 2E3KA 5DYAA 5CUCA 5HFQA 1ZS5A 5EK9A 5HJCA 2DATA 4UYDA 4QR5A 5HCLA 5EA1A 5F60A 4YATA 4PCIA 5ENEA 5ACYA 4WHUA 5E9YA 4NUDA 3U5OA 5AD3A 3U5KA 4A9IA 5IGMA 2YEKA 4MR6A 4HBVA 3S92A 2YW5A 5HLSA 5EWHA 5F61A 5DKCA 2WP2A 3TLPA 4LZRA 4Z6IA 2L5EA 5FE3A 5H1VA 3Q2EA 4CL9A 4NYWA 5ENIA 3JVLA 2YEMA 5D0CA 5C85A 4HBYA 5LVQA 5D3TA 5HQ7A 4TZ8A 3G0JA 4QB3A 5CU8A 4UITA 4UIVA 5CZGA 4HBWA 2YYNA 4IR4A 5D7XA 4CLBA 5FH6A 2RS9B 4ZQLA 5EICA 3JVJA 4LYSA 4IR6A 4NUCA 5CQ4A 4MR4A 3U5LA 4YH3A 5EWVA 4MEQA 5D24A 5I29A 2OUOA 5EWDA 5F3AA 5D3HA 3UW9A 4PY6A 4YYIA 5D3NA 4QSQA 3NXBA 5E9MA 5I7XA 5HQ5A 5CQ5A 5FH7A 4TT4A 4BJXA 5EWWA 5CGPA 3SVHA 4HXRA 5DKHA 3P1EA 5EPRA 3G0LA 4CURA 3HMFA 3ONIA 5KTUA 4F3IA 1N72A 3U5MA 4TQNA 5D3PA 4TT6A 4NR6A 4QSSA 5TB6A 3LQJA 4QZSA 2YQDA 4ALGA 4NR5A 4N4GA 5F5ZA 4UIUA 4YADA 5FFVA 4A9LA 5IGLA 5CRZA 5DBMA 5LJ0A 2DKWA 5HQ6A 3FKMX 1WUGA 5FH8A 5D3LA 5E73A 2G4AA 5HFRA 5C7NA 5DYUA 5C4QA 5DY7A 5LKZA 4CUUA 4HBXA 4N4IA 4BW2A 3U5JA 4YYGA 4Z93A 2DWWA 4HXSA 4NR7A 5HRVA 5L8UA 4YH4A 3D7CA 5FG6A 4NR4A 4O78A 4UYHA 4YBMA 5E74A 3MULA 4NR9A 5A5RA 4O74A 4IOOA 2GRCA 4UIZA 4O75A 5EPBA 3QZTA 5CQTA 5CQ6A 5IBNA 4IR5A 5I83A 4X2IA 5I86A 3MUKA 5F63A 2F6NA 5EU1A 5IIDA 5KO4A 5FG5A 5E3DA 4UYGA 4BW1A 5G4RA 4J0SA 5F62A 3LXJA 4O7CA 5ENFA 3LQIA 3JVKA 5I88A 5FE4A 3HMEA 5JI8A 5FE9A 5IG6A 4CFKA 3IU6A 3O36A 5EM3A 5DLZA 5EQ1A 5EGUA 4QC1A 5DW2A 4YAXA 5FB1A 4YYKA 4QC3A 4PTBA 5HRXA 3UV4A 5II2A 4O7BA 4LRGA 4HXOA 4QUUA 4A9HA 4KCXA 4YABA 4LYWA 5A82A 5ENBA 4HXPA 5I89A 4LC2A 4QR3A 4YYMA 5TCMA 4Z6HA 2RO1A 4MENA 5ENCA 2DVVA 5F36A 5F1LA 4O76A 3HMHA 4QNSA 2L85A 5I80A 5E9IA 5BT5A 5IGKA 4O72A 3QZSA 4TZ2A 2FSAA 3ZYUA 5BT3A 4YC9A 4NXJA 3UVDA 4BHWA 4O7FA 5H85A 5A81A 4QYLA 5FE5A 2DVRA 4QSWA 5E9KA 5FB0A 3UVXA 2RNWA 4LDFA 4TU4A 5D3RA 2RFJA 4NQNA 5CP5A 4A9NA 4LR6A 5LKXA 5L8TA 5A85A 1WUMA 3UV5A 5CUBA 5FFYA 5CY9A 5A5PA 5ENJA 3GG3A 5FE2A 5CFWA 5EISA 4QUTA 5FE6A 4A9MA 5C8GA 5AMFA 5AD2A 4LYIA 4YBTA 4C66A 2NXBA 4QSVA 5DW1A 3S91A 4N3WA 4QSXA 3O35A 5DFCA 5EI4A 4TU6A 5L97A 3P1DA 4MEPA 4O7EA 5F2PA 5LUUA 4DONA 5DFBA 5COIA 2F6JA 4O70A 5FE7A 4KV4A 4TTEA 4XYAA 5HELA 3P5OA 5H1UA 4Z1QA 4UIXA 5CUGA 3DWYA 3UVYA 4A9FA 4OGIA 4MR5A 3O37A 5FBXA 5D3SA 5EWCA 4YYDA 1JSPB 4FLPA 4XY9A 4NQMA 4QSPA 5D26A 5ENGA 5E9LA 4XUAA 5CUEA 4ZW1A 4NRCA 4QSRA 5L96A 2D82A 4BW3A 5EVAA 2N9GA 3DAIA 5II1A 3RCWA 4QYDA 5D25A 2WP1A 5KTXA 4PS5A 4UYFB 5DYXA 5A5NA 5KTWA 2R0SA 3K2JA 4Q0OA 4XY8A 4AKNA 5CTLA 4QSUA 5LKTA 3I3JA 4MR3A 5DYCA 5A5SA 5E3GA 4IR3A 4QEVA 5ETBA 4QEWA 5DX4A 4LZSA 2DVQA 4HXMA 5DLXA 2RNYA 3MB3A 4TYLA 4BW4A 5CPEA 4WIVA 3UVWA 4CUQA 4UIYA 2I8NA 4YYNA 4QBMA 3O34A 5K29A 3SVFA 5BT4A 5I7YA 1E6IA 4E96A 5FFWA 5EV9A 1X0JA 2RNXA 1JM4B 4N4FA 5CRMA 5I1QA 5CQ3A 2D9EA 5J0DA 4NRBA 5CQ7A 4NR8A 1EQFA 4TT2A 5EPSA 5FE8A 4LZ2A 4YY4A 5JWMA 4PKLA 4PCEA 4UYEA 5L99A 5HRWA 5LJ1A 4RVRA 3LQHA 5HM0A 2H60A 5CQ8A 4YYHA 3AADA 3JVMA 5E0RA 4NYXA 4GPJA 5E9VA 5LKUA 4J3IA 5I40A 2RI7A 4J0RA 5F1HA 3Q2FA 4N4HA 4WHWA 5IGNA 5A5OA 5G4SA 5A5QA 5FE0A 3UV2A 5AMEA 5HEMA 2R0VA 4OGJA 4QY4A 5FDZA 4UYFA 4MEOA 5C87A 2MJVB 4KV1A 4A9KA 4A9OA 5DKDA 4HXLA 4O7AA 2OSSA 5KHMA 5C89A 4A9EA 4QR4A 4YYJA 5D3JA 5E7DA 3P1CA 4ALHA 4YY6A 3O33A 4NRAA 3MXFA 5H1TA 2DVSA 4C67A 4QEUA 3MB4A 5A7CA 1F68A 5EP7A 5LJ2A 5A83A 4NYVA 4O77A 2I7KA 5ENHA 5CUAA 4CFLA 2E7OA 4UIWA 2R10A 4IOQA 2OO1A 2E7NA 4TS8A 2KTBB 5DFDA 3QZVA 4J1PA 4YBSA 4Z1SA 5LVRA 4NS5A 5CS8A 4HXKA 4Y03A 3SVGA 2YELA 4CUTA 5CQAA 5ETDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXNA 4CUSA 3AQAA 4OUFA 2YDWA 3U5PA 4IORA 4NUEA 5CUDA 5KU3A 3P1FA 3U5NA 2R0YA 5FE1A 5L98A 4XUBA 5FG4A 3IU5A 5F25A 4CUPA 2L84A 2LSPB 3LJWA 5HENA 4Q0NA 4ZC9A 3MQMA 4A9JA 4QSTA 4O71A 4YK0A 2E3KA 5DYAA 5CUCA 5HFQA 1ZS5A 5EK9A 5HJCA 2DATA 4UYDA 4QR5A 5HCLA 5EA1A 5F60A 4YATA 4PCIA 5ENEA 5ACYA 4WHUA 5E9YA 4NUDA 3U5OA 5AD3A 3U5KA 4A9IA 5IGMA 2YEKA 4MR6A 4HBVA 3S92A 2YW5A 5HLSA 5EWHA 5F61A 5DKCA 2WP2A 3TLPA 4LZRA 4Z6IA 2L5EA 5FE3A 5H1VA 3Q2EA 4CL9A 4NYWA 5ENIA 3JVLA 2YEMA 5D0CA 5C85A 4HBYA 5LVQA 5D3TA 5HQ7A 4TZ8A 3G0JA 4QB3A 5CU8A 4UITA 4UIVA 5CZGA 4HBWA 2YYNA 4IR4A 5D7XA 4CLBA 5FH6A 2RS9B 4ZQLA 5EICA 3JVJA 4LYSA 4IR6A 4NUCA 5CQ4A 4MR4A 3U5LA 4YH3A 5EWVA 4MEQA 5D24A 5I29A 2OUOA 5EWDA 5F3AA 5D3HA 3UW9A 4PY6A 4YYIA 5D3NA 4QSQA 3NXBA 5E9MA 5I7XA 5HQ5A 5CQ5A 5FH7A 4TT4A 4BJXA 5EWWA 5CGPA 3SVHA 4HXRA 5DKHA 3P1EA 5EPRA 3G0LA 4CURA 3HMFA 3ONIA 5KTUA 4F3IA 1N72A 3U5MA 4TQNA 5D3PA 4TT6A 4NR6A 4QSSA 5TB6A 3LQJA 4QZSA 2YQDA 4ALGA 4NR5A 4N4GA 5F5ZA 4UIUA 4YADA 5FFVA 4A9LA 5IGLA 5CRZA 5DBMA 5LJ0A 2DKWA 5HQ6A 3FKMX 1WUGA 5FH8A 5D3LA 5E73A 2G4AA 5HFRA 5C7NA 5DYUA 5C4QA 5DY7A 4AI6A 5LKZA 4CUUA 4HBXA 4N4IA 4BW2A 3U5JA 4YYGA 4Z93A 2DWWA 4HXSA 4NR7A 5HRVA 5L8UA 4YH4A 3D7CA 5FG6A 4NR4A 4O78A 4UYHA 4YBMA 5E74A 3MULA 4NR9A 5A5RA 4O74A 4IOOA 2GRCA 4UIZA 4O75A 5EPBA 3QZTA 5CQTA 5CQ6A 5IBNA 4IR5A 5I83A 4X2IA 5I86A 3MUKA 5F63A 2F6NA 5EU1A 5IIDA 5KO4A 5FG5A 5E3DA 4UYGA 4BW1A 5G4RA 4J0SA 5F62A 3LXJA 4O7CA 5ENFA 3LQIA 3JVKA 5I88A 5FE4A 3HMEA 5JI8A 5FE9A 4AKIA 5IG6A 4CFKA 3IU6A 3O36A 5EM3A 5DLZA 5EQ1A 5EGUA 4QC1A 5DW2A 4YAXA 5FB1A 4YYKA 4QC3A 4PTBA 5HRXA 3UV4A 5II2A 4O7BA 4LRGA 4HXOA 4QUUA 4A9HA 3ERRA 4KCXA 3D1DA 4YABA 4LYWA 5A82A 5ENBA 4HXPA 5I89A 4LC2A 4QR3A 4YYMA 5TCMA 4Z6HA 2RO1A 4MENA 5ENCA 2DVVA 5F36A 5F1LA 4O76A 3HMHA 4QNSA 2L85A 5I80A 5E9IA 5BT5A 5IGKA 4O72A 3QZSA 4TZ2A 2FSAA 3ZYUA 5BT3A 4YC9A 4NXJA 3UVDA 4BHWA 4O7FA 5H85A 5A81A 4QYLA 5FE5A 2DVRA 4QSWA 5E9KA 5FB0A 3UVXA 2RNWA 4LDFA 4TU4A 3VKHA 5D3RA 2RFJA 4NQNA 5CP5A 4A9NA 4LR6A 5LKXA 5L8TA 1ZKRA 5A85A 1WUMA 3UV5A 5CUBA 5FFYA 5CY9A 5A5PA 3VKGA 5ENJA 3GG3A 5FE2A 5CFWA 5EISA 4QUTA 5FE6A 1PUOA 4A9MA 5C8GA 5AMFA 5AD2A 4LYIA 4YBTA 4C66A 2NXBA 4QSVA 5DW1A 3S91A 4N3WA 4QSXA 3O35A 5DFCA 5EI4A 4TU6A 5L97A 3P1DA 4MEPA 4O7EA 5F2PA 5LUUA 4DONA 5DFBA 5COIA 2F6JA 4O70A 5FE7A 4KV4A 4TTEA 4XYAA 5HELA 3P5OA 5H1UA 4Z1QA 4UIXA 5CUGA 3DWYA 3UVYA 4A9FA 4OGIA 4MR5A 3O37A 5FBXA 5D3SA 5EWCA 4YYDA 1JSPB 4FLPA 4XY9A 4NQMA 4QSPA 5D26A 5ENGA 5E9LA 4XUAA 5CUEA 4ZW1A 4NRCA 4QSRA 5L96A 2D82A 4BW3A 5EVAA 2N9GA 3DAIA 5II1A 3RCWA 4QYDA 5D25A 2WP1A 5KTXA 4PS5A 4UYFB 5DYXA 5A5NA 5KTWA 2R0SA 3K2JA 4Q0OA 4XY8A 4AKNA 5CTLA 4QSUA 5LKTA 3I3JA 4MR3A 5DYCA 5A5SA 5E3GA 4IR3A 4QEVA 5ETBA 4QEWA 5DX4A 4LZSA 2DVQA 4HXMA 5DLXA 2RNYA 3MB3A 4TYLA 4BW4A 5CPEA 4AKGA 4WIVA 3UVWA 4CUQA 4UIYA 2I8NA 4YYNA 4QBMA 3O34A 5K29A 3SVFA 5BT4A 5I7YA 1E6IA 4E96A 5FFWA 5EV9A 1X0JA 2RNXA 1JM4B 4N4FA 5CRMA 5I1QA 5CQ3A 2D9EA 5J0DA 4NRBA 5CQ7A 4NR8A 1EQFA 4TT2A 5EPSA 5FE8A 4LZ2A 4YY4A 5JWMA 4PKLA 4PCEA 4UYEA 5L99A 5HRWA 5LJ1A 4RVRA 3LQHA 5HM0A 2H60A 5CQ8A 4YYHA 3AADA 3JVMA 5E0RA 4NYXA 4GPJA 5E9VA 5LKUA 4J3IA 5I40A 2RI7A 4J0RA 5F1HA 3Q2FA 4N4HA 4AKHA 4WHWA 5IGNA 5A5OA 5G4SA 5A5QA 5FE0A 3UV2A 5AMEA 5HEMA 2R0VA 4OGJA 4QY4A 5FDZA 4UYFA 4MEOA 5C87A 2MJVB 4KV1A 4A9KA 4A9OA 2EJNA 5DKDA 4HXLA 4O7AA 2OSSA 5KHMA 5C89A 4A9EA 4QR4A 4YYJA 5D3JA 5E7DA 3P1CA 4ALHA 4YY6A 3O33A 4NRAA 3MXFA 5H1TA 2DVSA 4C67A 4QEUA 3MB4A 5A7CA 1F68A 5EP7A 5LJ2A 5A83A 4NYVA 4O77A 2I7KA 5ENHA 3D1BA 5CUAA 4CFLA 2E7OA 4UIWA 2R10A 4IOQA 2OO1A 2E7NA 4TS8A 2KTBB 5DFDA 3QZVA 4J1PA 4YBSA 4Z1SA 5LVRA 4NS5A 5CS8A 4HXKA 4Y03A 3SVGA 2YELA 4CUTA 5CQAA 5ETDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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