5FHNA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-methylbenzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 1.6 a resolution
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhnA02
3U72A 4ZDMA 5ICTA 3A09A 4H5GA 1D9VA 4FAJA 2OK2A 2VD2A 1I6QA 5HBCA 3V8XB 4MFIA 4KQPA 4XKQA 3HPIA 3GBBA 3MP6A 3I6VA 4RY1A 4Q8RA 2Q2AA 3FGSA 3H6VA 4PFTA 1B0HA 3M3LA 2V25A 3R26A 1ANFA 3K01A 2Z8FA 3N6UA 1Y4TA 1ZIUA 1TWYA 1URGA 3PMXA 3R6UA 1HSJA 3MZ9A 1WODA 2XXUA 3MVXA 2H4IA 1Y4CA 3PPRA 3P7IA 1OQHA 1Y1MA 3VVEA 2VD3A 5ISUA 1OLAA 2NWJA 2XXQA 3K02A 2Y7WA 3TMGA 3H3GA 4NF4B 2HEUA 3ODBA 5I2NA 2OWTA 4FEDA 1IQ7A 1SVXB 2I49A 5L9MA 3LSXA 2HFBA 1R9LA 3DLNA 2OCUA 3DELB 5BUUA 5AA2B 1PB7A 5LOMA 1EZOA 4RNSA 4YAHX 3V83A 1EU8A 3ZS6A 2UVJA 3VLWA 3LSLA 4ZEKA 2B3BA 4FE8A 4ONYA 5I57A 5BWJA 1P1QA 1USYH 4H8JA 3WAFA 5H8SA 3VDFA 3MZ1A 3IOVA 5H8HA 2PMSA 5KDTA 5ITOA 1MQGA 1Q35A 4C1UA 3RT8A 3RY3A 4QSDA 2ZYNA 3KGCA 1QULA 3K00A 5K2YA 1XC1A 4G68B 3OENA 4KR5A 1MXVA 4HTGA 5JTYB 4OFJA 2ZNUA 4R73A 4NF6B 3FJ7A 1QUJA 2XD3A 3TQLA 4OVJA 4Q0CA 3BFUA 2PX1A 2HZKA 3KN3A 4R6YA 3VXCA 4G4PA 2DP8A 3U1OA 1N04A 3FASA 2RF1A 4YICA 3B6WA 1JNFA 2D3IA 2REJA 2F7BA 1PEBA 1PBQA 2DE3A 2DWJA 2P0SA 2DS9A 2QMWA 4MF3A 4NWCA 5TP9B 3SKPA 3JZJA 1P1NA 4KYEA 4F31B 1B0LA 4R72A 5FTHA 2H99A 2XX7A 3MW0A 1ATGA 4NWDA 2GRVA 3FUZA 3HCQA 2P2AA 1B3HA 1UIVA 3KG2A 2F78A 1LFHA 3Q27A 3CI8A 3UGWA 4F29A 4O3CA 1BKAA 2ANJA 1Y3QA 4M1VA 3FATA 3KSJA 4GD5A 1MXYA 1MQDA 4QFKA 1QW0A 1M5FA 5FHOA 1B7UA 4NF4A 4DE8A 4ND9A 1GGGA 1H76A 3S9LC 3S4UA 1MQJA 3IORA 4RA1A 3ZKKA 3KOSA 4O3BA 1D3KA 3ONMA 1IXHA 2QS4A 4HCYA 3G7WA 3PV0E 1FQCA 5AA2A 4KPTA 1LAHE 1SW2A 2X7PA 3O9PA 1B6HA 4PFUA 2QS1A 3HV1A 3V89B 1R1NA 3ECRA 3PUXE 4U23A 1Z7NE 2XXIA 4QFOA 5I59B 4PFWA 3SESA 1MY3A 1JW1A 4DLDA 4BDNA 4U4SA 3O28A 1LAGE 2XXRA 3UK4A 5ICQA 3FVOA 2BJJX 1DSNA 4X48A 5I2KB 3IR1A 1MS7A 3PMWA 1FTLA 4YKPA 3FXRA 1N7WA 1M5EA 1IIWA 3HHGA 4G68A 3BBRA 1AIVA 5EYFA 1B5HA 4IO4A 1UIUA 1FTKA 2UVHA 1MQHA 4IO7A 1B1XA 3EQ1A 4U4XA 4DXBA 3M8UA 1OVBA 2OBGA 4N6PA 3OEKA 5TU0A 3PGFA 1B4ZA 1YTVA 1US5A 1RYOA 3LSFB 3M3FA 4YMAA 1LBCA 1A7LA 3TZAA 2VP1A 1Z7ME 3DP6A 5TP9A 3IOUA 3G3FA 4QFLA 2RCBA 4GFRA 1B46A 1GTKA 2YLNA 2I0CA 4IY6A 2ZMBA 4ZEFA 1MDP1 2F97A 4OERA 3HO7A 4QFPA 4UACA 2NVUB 1OQGA 1XT8A 1VSOA 2FNCA 5CMKA 5I2NB 1MPCA 4F1YA 1B1HA 4KCCA 4FEBA 5JEIA 1IITA 3C4MA 4F18A 1A55A 4KHZE 3UORA 1SW5A 4ESWA 4XIGQ 3KBRA 4NEDA 5CMMA 1PDAA 2THIA 1BLFA 1P1UA 4F19A 2PBWA 2PVUA 1BIYA 3CG3A 3M3KA 3QK6A 1M5DA 3LUYA 4ZEBA 4F1VA 2HAUA 3SEWA 3H03A 2Y7PA 4YMBA 1ZMGA 4IGTA 4R9GA 2FYIA 3DP4A 4EQ9A 1POTA 4C0RA 1I69A 2IEEA 3C31A 3TPAA 3SETA 5H8FB 5KDTB 1KWHA 1VFDA 4Z0IA 2I48A 2PT1A 4RYAA 3FVGA 2Q2CA 3EHSA 1EZ9A 1MH3A 3KZGA 5L9OA 4WEDA 4BLAA 5I59A 3CFZA 3KFMA 1XVXA 4H5FA 4OHNA 3H06B 4ZEDA 3FD3A 1HSEA 4F2OA 3RTFB 1B5JA 4IO6A 3G3JA 3D4CA 4JB7A 2VGQA 1EZPA 4OENA 1B32A 3TTLA 2Q89A 1ZKBA 4MLQA 2Z8DA 4ZE9A 2DOJA 4OFLA 5HM4B 1R6ZA 1LCFA 3MZBA 2H5YA 1ZJLA 3FJMA 4G68C 1UTBB 2E0SA 4R75A 1NNKA 3TTNA 2I3VA 5AA2D 3CFXA 1JETA 2HZLA 4KFQA 2I4CA 2X7QA 3N26A 4BDMA 1O7TA 1FQEA 3PU5A 4GQOA 2R71A 2Z22A 3MJNA 2AL4A 1B3EA 2DYXA 4R74A 4IB2A 3B7DA 1AOVA 4LQ5A 2PYYA 2GFEA 5CBSA 3O97A 2IA4A 3MVYA 3TTMA 1AH5A 5B7DA 1JVXA 1JEVA 3MVWA 1FQFA 2F5XA 4YB6A 4JXIA 1N0TA 2UVGA 1N84A 4GL0A 4N07A 5AA3A 3Q25A 3V5AA 4FORA 4RK9A 1SW4A 3THIA 2WKYA 4AQ4A 2O7UA 4OTEA 3DM0A 2AYSA 4QF9A 1MM6A 3MVZA 4H67A 1QKAA 3MQ9A 3KSXA 4EF1A 1QUIA 1DPPA 3W9WA 3IK6B 1LGBC 3RQTA 1QKBA 1P1WA 4U1ZA 2VOZA 3A3CA 4FATA 2QL3A 3RGYA 1B58A 1MXUA 3TTKA 4NTLA 2LAOA 4TOZA 4M4GA 2ZYOA 1AL3A 2ABHA 4YKJA 3SDFA 2QPQA 2O68A 2B65A 3MBPA 1LFIA 4LZ7A 4OWDA 5AE4A 4YKKA 3E3KA 4LZ8A 5H8FA 4KI0E 4JSDA 2DXYA 3KJTA 1I6AA 2V3TA 4PETA 1FQAA 3VV5A 2ZYMA 4RK2A 1XVYA 4G8NA 1CB6A 2R9JA 2ZNSA 1S9TA 1P99A 4ZZEA 2DVCA 2QJEA 2Q8JA 2I0BA 4GOTA 5HPQA 3PD8A 2F6PA 1LAXA 4N13A 1FQDA 3PUZE 2FA7A 3T9XB 3HHFA 2QRYA 3O2AA 2ONRA 4OMBA 3VXBA 5AA1A 5FHMA 5AA4B 2NXOA 1RKMA 1MY1A 1UTBA 3KN7A 2OZZA 4LONB 3MP8A 4EXLA 1B3FA 4I1DA 1NMUA 5F7VA 3K4UA 4AB6A 1A8EA 4RPOA 5DVJA 1F9BA 4GRKA 1GV8A 4F1UA 2V3QA 4OEVA 5IKBA 2X26A 4BDQA 5IAIA 1OVTA 1SI0A 4MLVA 4THIA 2RC7A 5B70A 3SEXA 3FV2A 3T9HB 4PE5B 4G2ZA 2Y7RA 4LQ2A 2VHAA 1Q1KA 3UIFA 1LB9A 1NNFA 3O6HA 3G3GA 1P1OA 4YKIA 1PB9A 4LA9A 4DXCA 1NNTA 3G3IA 3K1PA 3Q26A 3T96B 3T22A 1M5BA 5CMBA 3I3VA 3MP1A 4LATA 1B3GA 3LC8A 3MAMA 4XTCQ 1ELJA 4E0XA 2H98A 2F34A 1QUKA 2V93A 3G3KA 5I58A 4QRZA 2XXVA 3EF7A 4P11A 3MUQA 4I9DA 2XX9A 2A5SA 3KEIA 1FCKA 1IZ1A 1Y20A 1B3LA 1MQIA 2DQVA 5FTIA 2QSXA 3TCGA 1XOCA 3IJOB 3LBSA 1DMBA 3HSTA 1GR2A 3QSLA 3TKDA 4ZS9A 4Q30B 4R2BA 1YPNA 2GHAA 3CRBA 4FIMA 3PMVA 3IAZA 4WEPA 5TPAB 5M2VA 4OESA 1JW4A 4GXSB 3D4GA 3EPEA 3K1NA 2R6GE 4ESXA 4DDDA 4AB5A 4IGRA 4MBPA 1B51A 4DIGA 4E0WA 4TLMB 3CSGA 2DWHA 4G8HA 1IXGA 3CIJA 1OLCA 2UYFA 3K6UA 4P0GA 5AA4A 4EUOA 2B3FA 3OELA 5DYHA 1LSTA 4MH5A 1RYXA 2KLFA 1MY2A 5F1QA 1PB8A 3OO7A 1IXIA 2E1SA 1XHYA 1MPDA 1POY1 1QVSA 2G93A 1DPEA 3USDA 1N3WA 3K0VA 2D21A 3CR9A 3UP9A 4GL8A 3K1MA 3RUMA 4JBZA 3S9EA 1VFEA 3EHTA 2Z8EA 3IO4A 2OLBA 4JSOA 3IO6A 2Y7KA 1OIBA 4G8MA 4DZ1A 2F36A 1TT1A 1SI1A 1D9YA 3EHUA 2I58A 4LUBA 5K2XA 5CRYA 1I6BA 4F3SA 3OSQA 4FECA 4JWXA 3JYRA 3E4RA 3IX1A 5A5XB 1B9JA 1CE2A 4U21A 3B6TA 2XXWA 2V3UA 4ELRA 3QIMA 4L17A 2NOOA 2O84X 2A5TB 3PUYE 4ELPA 1H44A 4RXLA 5CI5A 3T9UA 3VVFA 1NL5A 3HN0A 4ZECA 1LLSA 1NNPA 4KCDA 3C33A 2O1MA 3S2VA 3PPQA 3QAXA 5L8DA 3TCFA 2H25A 3H6UA 5DT6A 3WAEA 4HCWA 4O3AA 2Q88A 3U94A 3C32A 2YJPA 3ILUB 1J1NA 1PC3A 4JWOA 4UA8A 3U92A 4XKRA 5CC2A 3KN8A 3FVKA 1R9QA 5CMCA 4U1OA 4TQUQ 5DTBA 1MH4A 3PUWE 1MXWA 4X1BA 2ONSA 3T66A 5TPAA 1MDQA 1BP5A 4C1TA 2H9BA 4NMYA 3GBAA 1UQWA 3DP8A 4PFYA 3G3HA 4HS7A 1FQBA 2O69A 3RN8A 3O6IA 2ONKE 3PPPA 4R9FA 3MPLA 3TFLA 4BDLA 1A99A 1MY4A 3LR1A 1JVYA 3CG1A 4R6KA 1JEUA 1A54A 1FTMA 4PQJA 3IL1B 3L6HA 4U2RA 1B5IA 3T9VA 1ZU0A 3IOWA 4X1DA 1MM7A 2OWSA 3GZGA 3FXUA 1MG1A 4BDRA 2QS3A 3C36A 1MPBA 4IO2A 2OJTA 4OYVA 4GF8A 2DE4A 1Y3NA 2I3WA 3N5LA 4GIZA 1WVJA 4ZE8A 3OO9A 4IO5A 4KD5A 3SERA 3IB2A 3K6XA 3CVGA 3A3UA 3RNNA 2Y7IA 3OSRA 1QJMA 3BFTA 4QFNA 3RT6B 4R2FA 1A40A 3KOTA 1YCJA 4IY5A 2XXYA 4NF5B 5I56A 1M5CA 2HAVA 2XX8A 5I58B 1ZTYA 5A5XA 3W9VA 2ZYKA 3TUSA 3S9MC 2A5TA 4WKMA 3MC2A 2DXRA 4WXJA 4F3PA 3VE1B 4IO3A 3VVDA 4EDPA 3SEYA 5CM6A 4DXUA 2F7CA 3JV9A 1SYIA 4I62A 3ZSFA 1T0KA 1ZBMA 3B6QA 4H6DA 3RTWB 4ECFA 5H8QB 4U22A 4Q5TA 3FV1A 4YB7A 1N7XA 1LCTA 3FVNA 3TDJA 1AMFA 1USYE 2HQ0A 4ELOA 2I4BA 1LFGA 4OXVA 3KJ7A 4X9TA 1NH7A 2V84A 2GHBA 1FTOA 2I6EA 1OMPA 4H0WA 2O7IA 4JDFA 3IB0A 3GXAA 1LB8A 1XS5A 3C34A 3BKIB 4F3BA 4ELQA 3TQWA 4OFOA 5DVIA 2UXAA 5CBRA 4LZ5A 4P0IA 3TELA 4F2QA 4R6HA 2Z23A 3OXNA 3I5OA 1O64A 4H1XA 4OETA 2NUVA 1B7HA 2ALUA 3FXQA 5ELVA 2ZXTA 4POXA 1MXZA 1JW5A 1NFTA 1SDXA 3FZVA 1DOTA 1N3XA 4LVQA 2GH9A 1H45A 3FIRA 3C9HA 4QSEA 1B7ZA 1D4NA 5EHSA 1FTJA 3ZKLA 2D5WA 5EHMA 4GVOA 5DVFA 2XXHA 3IB1A 4EQ7A 4EF2A 2XHDA 4F3GA 3FJGA 2G29A 1N76A 1SW1A 3O66A 1IEJA 2RKMA 3EN3A 4NF8B 3TTRA 5H8NB 1US4A 4LP2B 4OEUA 4NE4A 5DEXB 4ZZAA 1FW0A 3MPKA 3VFJA 4NF5A 3F11A 3H6TA 5L9SA 3L6GA 3K6VA 4GWOA 4OQOA 2HCAA 3OOAA 1B2HA 1H43A 1Y9UA 1UTHB 4XXUA 3MWBA 2XXPA 2XD2A 1BTJA 4GXAA 1Y1ZA 2DSFA 4TLLB 1SYHA 4G77A 1MRPA 1DTGA 5H8QA 4H8IA 4ISUA 2DVZA 3TCHA 3O29A 2P1SA 5ITPA 2XXXA 2CMOA 2Q9TA 3VLUA 5KCJB 3SEVA 2QS2A 2F7AA 3PPOA 3OEMA 2ZNTA 5FHNA 1MXXA 3H7MA 2AIXA 5JTYA 3U93A 4F22A 4NF6A 2QMXA 1O63A 2HXWA 2RC9A 3K6WA 4I8CA 1EH3A 3TEPA 4OZ9A 3LSWA 3AXFA 1URDA 4RJZA 3Q29A 4PP0A 3N94A 3GLBA 1NKXA 2RC8A 1SD3A 2F6GA 4K3FA 2O1LA 1ZLQA 3CSBA 3SEUA 1URSA 2DE2A 2W7YA 3TAJA 1L5TA 2YPNA 2REGA 4Z7EA 1B40A 3K2DA 3E13X 3R7XA 2RCAA 2ESNA 3H4ZA 2O51A 3ILTB 3U8QA 4ZEIA 1IUDA 5KZTA 4DCYA 5JK4A 2AL5A 4HW8A 1JQFA 1TXFA 3VLVA 2XXTA 5I56B 1NH8A 2Y84A 4NF8A 3QUJA 3RLFE 1S50A 4QHQA 1SBPA 5I84A 1MY0A 1PBPA 1VE4A 1SQYA 5H8NA 3S9NC 3OO6A 1IXCA 1WDNA 4XKNA 4GLIA 5DEXA 3UA8A 4YU0A 3RPWA 3Q28A 1HSLA 3IJXB 1VR5A 1A8FA 3E9XA 3PPNA 4FJPA 5I57B 4EXKA 2F35A 1S7YA 4KYSA 4EQBA 2F8DA 1B52A 3H6WA 2PT2A 1UTHA 1LAFE 3UN6A 3CFLA 5H8HB 1GVCA 2O6AA 1TFAA 4YZZA 2DWAA 3QUFA 4POWA 5J1DA 3TODA 4DCXA 3N6TA 2RINA 2DWIA 2CZLA 1Y3PA 4YB5A 3TYHA 1B4HA 3T93B 1B05A 4H65A 3O6GA 1II5A 1YAEA 4JWYA 1H3DA 2UVIA 3QXMA 1TFDA 4F39A 4RPNA 5I2KA 3PD9A 3W15C 3C35A 2UYEA 3IOTA 1LBBA 3PUVE 5KCJA 4KYDA 3OO8A 4XKPA 4BDOA 3OD7A 4QSCA 2M8CA 1DTZA 3QYTA 3OMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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