5FLQA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5flqA00
4M2RA 3DVCA 3BL1A 3V3FA 3OY0A 3DD0A 3S76A 4ITOA 2NNSA 3RG3A 1KWRA 2H4NA 1V9EA 3MNAA 4KP5A 1CNIA 3NB5A 3PYKA 3S75B 2POVA 3SBIA 4KUWA 4XFWA 1TEQX 5FNIA 3T5UA 4KUYA 4ZX1A 3RLDA 4QIYA 2QOAA 5JGTB 4HF3A 3OYSA 5L3OA 5CACA 1HEDA 12CAA 3U3AX 3S9TA 1BNUA 1FSRA 2GD8A 3RYYA 5G0BA 5FLQA 3DA2A 4Q8YA 5DSPA 1ZE8A 1CNCA 5SZ3A 1BNWA 4HT2A 4N16A 1HCBA 2X7SA 4QJXA 3FW3A 1I9PA 1ZGEA 3M67A 3MZCA 4QSIA 1CA2A 4ZWYA 3MWOA 4ZAOA 2AW1A 4HBAA 3S71B 3VBDA 2WEGA 4HT0A 3U45X 3T84A 4FL7A 2VVAX 4FPTA 3OIKA 3TMJA 2FNKA 4XE1A 4MDLA 4FRCA 4L5VA 5DSIA 4Q07A 4YVYA 2QO8A 5EHWA 3DAZA 4Q08A 5AMLA 3SBHA 1J9WA 2NNOA 5E2SA 3MHMA 2CA2A 1CAZA 1DMYA 5E2NA 5FDCA 1I90A 1RAYA 3BL0A 4BF1A 5JEHB 2NN7A 5FLRA 1RZBA 5CLUA 1ZFQA 5FDIA 4LU3A 3S74B 1YO0A 5DRSA 3RZ1B 1I9LA 1CVFA 5E2MA 4K0SA 5FL6A 3KS3A 5SZ0A 4Z1NA 1MOOA 1RZDA 5FLSA 4CNXA 2FOUA 5SZ5A 5EZTX 4QJ0A 1ZSAA 1KEQA 5DOGA 4Y0JA 5DSOA 3M1KA 3KNEA 5AMGA 1JD0A 1RAZA 1CCTA 3B1BA 5E5RA 3IBIA 4Q78A 4QK1A 3N0NA 5EHVA 3C7PA 1I9OA 3T82A 5DSRA 3EFIA 3N4BA 4JSAA 4FIKA 4HEWA 4R5AA 4ZWXA 4K0TA 1CIMA 1Z97A 3IAIA 4Q81A 5LMDA 4PZHA 1G4OA 5SZ1A 1BCDA 3RGEA 1IF8A 1XQ0A 4QIZA 1CAYA 1CANA 3F7UA 4HEYA 3IBLA 3T5ZA 3LXEA 3SAXA 1BNNA 1TTMA 4PQ7A 4Z1JA 2ZNCA 2CABA 5EKHA 1BN1A 1CNXA 1DCAA 3HKTA 3MNUA 3V2JA 1JV0A 5BRWA 1AZMA 3OKUA 4KNJA 1CNBA 2WD2A 2NN1A 3MHIA 3DVDA 1CNKA 2HFWA 4Q09A 5SZ4A 2AX2A 5BRVA 4XIWA 4YGLA 3UYQA 4COQA 2ILIA 5DSMA 3RZ7A 2WEHA 3S97A 4QJOA 1G45A 4Q9YA 1ZH9A 3KONA 3DV7A 4CNRA 1CALA 4QK2A 4ZWIA 3IBNA 3M96A 1FQMA 2NWYA 2FOVA 3B4FA 4RIVA 4E3GA 1CNHA 1FQNA 3IBUA 4E49A 5JQ0A 3RYJB 1FR4A 3M2NA 5EHEA 3DC3A 1RJ5A 1ZSBA 4Q49A 5FNJA 3SAPA 2H15A 3DBUA 2NXSA 3T85A 5HPJA 2NXRA 4K13A 5JDVB 4TWLA 4MO8A 1G46A 1CAKA 3Q31A 4DZ9A 4C3TA 3M2ZA 5EKMA 4KNMA 1JCZA 3S8XA 1TB0X 2NMXA 3DCSA 4Q7SA 4ETQC 1CRAA 2IT4A 5AMDA 1THKA 1YDBA 1KOQA 3M5EA 4Q7WA 5IPZA 2NNVA 3M14A 3UYNA 5A6HA 4IDRX 1T9NA 1AVNA 1CNGA 1LG5A 4YGNA 1OKMA 3RYXB 4Q6DA 2Q1BA 4Q06A 4YGJA 4YGKA 4Q83A 2EU2A 1TG3A 4UOVA 4N0XB 1TH9A 2EZ7A 2POUA 3RYZA 2NXTA 1HCAA 1MUAA 3M40A 4RFCA 4JSWA 2X7TA 4LP6A 5JEGB 4JSSA 4Z0QA 2Q38A 4M2WA 1YO1A 1HEBA 3K34A 4FVOA 4Q7VA 3MNHA 3HLJA 4RUZA 1YDDA 3T83A 4M2VA 1CAJA 2QP6A 1ZFKA 4Q8ZA 5FLTA 4YWPA 4RUXA 4Q7PA 4YXOA 2CBBA 1DMXA 1G4JA 5JEPB 2FOQA 2FOYA 4FU5A 7CA2A 3HFPA 4QJMA 4PYYA 1LUGA 3EFTA 1BZMA 3DD8A 3P55A 1H4NA 3KKXA 4Q99A 3HKNA 1G3ZA 3HKUA 3DCWA 3W6IA 4X5SA 3KLDB 4Q8XA 3P58A 4K1QA 1ZGFA 3IEOA 4ZWZA 4WW6A 4XZ5A 2EU3A 1G48A 2WD3A 3N2PA 5BYIA 4LHIA 1UGDA 1HUHA 3M2YA 2WEOA 3HKQA 3R17B 3RJ7A 4QJWA 4BF6A 1G53A 4YX4A 1G52A 5A25A 4MTYA 1UGAA 3OILA 1IF6A 2WEJA 1CAIA 5EKJA 1F2WA 2FMGA 4RN4A 3L14A 3OYQA 3V3GB 1RZCA 4CQ0A 1ZNCA 4WR7A 5JESB 2ABEA 1YO2A 4YXIA 2F14A 4XIXA 1CZMA 1BV3A 3S77B 4KP8A 3ML5A 4ILXA 4RFDA 5JG5B 4L5WA 1CRMA 3CA2A 1IF5A 3M98A 4QEFA 5E5UA 1IF4A 1TG9A 4QSJA 4QK3A 5DVXA 3S72B 5SZ7A 1CNJA 5EOIA 3MHOA 5FL4A 1BICA 3RZ5A 5DOHA 1RJ6A 4PXXA 5FL5A 3V3IB 2FMZA 1FLJA 3M5SA 4WUQA 3V7XA 1CVEA 1HVAA 2NWOA 4Z1KA 5E28A 2Q1QA 4MLTA 1I9NA 4Q87A 4MLXA 3BETA 1CNWA 4QSBA 3FFPX 5BNLA 1BNVA 5EH7A 2HOCA 4KV0A 3RZ8A 5L6KA 3FE4A 4IWZA 4E9OX 5E2KA 4JS6A 5J8ZA 3MHLA 3U7CA 3KOKA 1BNMA 3PO6A 3M3XA 1CVCA 3S73B 1CA3A 1ZSCA 3HS4A 4MDGA 1I91A 1UGFA 1UGEA 5DSNA 2HKKA 1FR7A 2O4ZA 1Z9YA 1EOUA 2OSMA 3F4XA 3JXGA 1Z93A 3M1JA 1Y7WA 3NJ9A 4ITPA 5G0CA 4CNVA 6CA2A 4HEZA 3OKVA 5FLOA 3IGPA 1BN3A 3N3JA 4R5BA 4YGFA 4KAPA 3MHCA 2NWZA 4Q0LA 5G01A 4MDMA 3CYUA 3V2MA 5CJFA 2X7UA 1I9MA 3M1QA 3M04A 3CAJA 1CVHA 4CACA 4HU1A 4WL4A 1IF7A 1FQLA 3F7BA 3JXHC 1CAOA 3M2XA 3MDZA 3RYVB 2POWA 4JSZA 1CINA 1KWQA 1YDAA 8CA2A 5JG3B 5C8IA 2FW4A 1AM6A 3KWAA 4RH2A 3TVNX 1BN4A 4CA2A 4DZ7A 4YYTA 3D92A 1CAMA 3GZ0A 1LZVA 3DCCA 1CAHA 5FNHA 5SZ6A 3JXFA 1A42A 3D0NA 3KIGA 3ML2A 3P44A 5BRUA 3P3HA 5DSLA 5JQTA 3CZVA 4GL1X 1G6VA 1H9QA 3R16A 4G0CA 3DC9A 2NWPA 1OQ5A 1TE3X 4TWMA 4R59A 2W2JA 3K2FA 1H9NA 3S78B 1HUGA 3M1WA 4Q90A 3D8WA 3D93A 5FNGA 3NI5A 2HNCA 1CCSA 4QSAA 1URTA 4E3FA 1XPZA 4K0ZA 5EH5A 3MNJA 1FSQA 5EIJA 3P4VA 3ZNCA 2CBCA 1KOPA 1XEVA 1OKLA 3D9ZA 1CCUA 1CVAA 4Z1EA 1FQRA 4QJPA 4FVNA 3M5TA 4YHAA 1CVDA 1TEUX 1BNQA 2CBEA 4QY3A 5FNKA 4E3HA 4E5QA 5EH8A 1UGBA 3V3HB 2VVBX 1I8ZA 1YDCA 1HEAA 3MNIA 2NNGA 5JGSB 4G7AA 4ZX0A 4CNWA 1UGGA 4RIUA 5DSQA 5FLPA 3V3JA 3TVOX 5DSKA 1RZEA 1CNYA 4E3DA 2FNMA 1G1DA 3V5GA 2CBDA 4L5UA 3MYQA 2GEHA 5SZ2A 3F8EA 4Q6EA 3W6HA 1G0EA 3QYKA 4E4AA 3P5AA 9CA2A 1BNTA 3MMFA 2HD6A 1I9QA 1XEGA 4M2UA 1CILA 1LG6A 1RZAA 3DVBA 3RZ0B 4WUPA 1OKNA 5FNLA 1TBTX 5G03A 1FSNA 4BCWA 1DCBA 2FNNA 1IF9A 1LGDA 3PJJA 4KUVA 1HECA 4KNIA 4RUYA 4YXUA 5DSJA 2HL4A 4QTLA 3P3JA 1V9IC 3K7KA 3KOIA 3MNKA 1G0FA 2CBAA 4PYXA 1UGCA 1G54A 3OIMA 3ZP9A 2FOSA 4WW8A 5CA2A 3RG4A 3P5LA 5E2RA 1CVBA 3U47A 4KNNA 2OSFA 5FNMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M2R A;  3DVC A;  3BL1 A;  3V3F A;  3OY0 A;  3DD0 A;  3S76 A;  4ITO A;  2NNS A;  3RG3 A;  1KWR A;  2H4N A;  1V9E A;  3MNA A;  4KP5 A;  1CNI A;  3NB5 A;  3PYK A;  3S75 B;  2POV A;  3SBI A;  4KUW A;  4XFW A;  1TEQ X;  5FNI A;  3T5U A;  4KUY A;  4ZX1 A;  3RLD A;  4QIY A;  2QOA A;  5JGT B;  4HF3 A;  3OYS A;  5L3O A;  5CAC A;  1HED A;  12CA A;  3U3A X;  3S9T A;  1BNU A;  1FSR A;  2GD8 A;  3RYY A;  5G0B A;  5FLQ A;  3DA2 A;  4Q8Y A;  5DSP A;  1ZE8 A;  1CNC A;  5SZ3 A;  1BNW A;  4HT2 A;  4N16 A;  1HCB A;  2X7S A;  4QJX A;  3FW3 A;  1I9P A;  1ZGE A;  3M67 A;  3MZC A;  4QSI A;  1CA2 A;  4ZWY A;  3MWO A;  4ZAO A;  2AW1 A;  4HBA A;  3S71 B;  3VBD A;  2WEG A;  4HT0 A;  3U45 X;  3T84 A;  4FL7 A;  2VVA X;  4FPT A;  3OIK A;  3TMJ A;  2FNK A;  4XE1 A;  4MDL A;  4FRC A;  4L5V A;  5DSI A;  4Q07 A;  4YVY A;  2QO8 A;  5EHW A;  3DAZ A;  4Q08 A;  5AML A;  3SBH A;  1J9W A;  2NNO A;  5E2S A;  3MHM A;  2CA2 A;  1CAZ A;  1DMY A;  5E2N A;  5FDC A;  1I90 A;  1RAY A;  3BL0 A;  4BF1 A;  5JEH B;  2NN7 A;  5FLR A;  1RZB A; 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