5FNKA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fnkA00
4XIXA 4CNXA 4ZX1A 3DV7A 4QSBA 3OIMA 5BRUA 2GD8A 4Q83A 4WW8A 3TMJA 1XQ0A 3MDZA 1A42A 2FNMA 5FDIA 5SZ7A 1BNMA 1UGGA 4YGLA 1YO2A 4Q7PA 2HNCA 1FQRA 4QJPA 3D9ZA 3V3HB 5AMDA 1AZMA 2FMZA 4RUZA 1BICA 3F8EA 1RAYA 3RJ7A 3DVCA 3K2FA 3IAIA 9CA2A 3S75B 4KUVA 3M2NA 3OYQA 4Z0QA 1IF9A 3HS4A 3K7KA 4ZWXA 3TVOX 1ZFKA 3W6HA 4Y0JA 4HU1A 4JSZA 4QK2A 4QIZA 5E2SA 5E2KA 4ZAOA 1ZNCA 3MHIA 4KP8A 4YGJA 1T9NA 2W2JA 4M2UA 3M3XA 12CAA 4L5UA 4MO8A 3RGEA 3IBIA 1LG6A 1TH9A 5G0CA 1HCBA 1G0EA 3W6IA 3MHCA 4FVNA 5FLOA 2EZ7A 3M1QA 4YHAA 3RLDA 4RIVA 3S76A 4KUYA 3ZP9A 1CAZA 5FNJA 1YDCA 3M04A 1UGEA 5JEHB 1DMXA 1DMYA 3JXFA 3KOIA 1YO0A 5DSPA 4WL4A 1MUAA 3GZ0A 2Q38A 3HKUA 5E2NA 4HF3A 1FSRA 4ZWYA 1G4OA 3RYXB 2NXSA 4Q08A 4PXXA 1LGDA 3DA2A 1I9LA 5EH8A 5HPJA 1IF6A 5AMGA 1OKLA 5A6HA 3P4VA 5BRVA 1IF7A 4Q8XA 3KLDB 2NN7A 2ILIA 1BN4A 4FU5A 2FOYA 3RZ1B 1G0FA 4MDGA 5EOIA 3NI5A 4PYXA 6CA2A 5DRSA 4ETQC 1FQNA 5DSIA 1CINA 4XIWA 5DSMA 3M96A 1CNXA 3U47A 1RJ5A 4RN4A 4E49A 2WEHA 4KP5A 5LMDA 2QO8A 1CCSA 2NXRA 2X7TA 3P3JA 3S74B 2CBEA 3M2YA 4QJOA 5E5UA 1TG3A 1ZSCA 2CBCA 4Q87A 3M14A 1CAYA 5SZ1A 1I9PA 1AM6A 1HECA 2CA2A 5FL4A 3T5UA 3V3IB 4ZWIA 3MNUA 5EHWA 3M40A 4QSAA 5JEPB 3RZ0B 3S9TA 4UOVA 2WEOA 5JEGB 3RG4A 1FLJA 1G54A 4CQ0A 4QJWA 5EIJA 3MNJA 5JG3B 3MHMA 3OIKA 2POUA 3DCSA 2OSMA 1CCTA 4DZ7A 5E2MA 1YDBA 1G46A 4LU3A 1OKMA 5EZTX 1CNIA 3F4XA 2AW1A 1TEUX 3V3JA 4L5VA 1CNYA 4Z1EA 1Z9YA 4KAPA 1URTA 3HLJA 5JG5B 4YXIA 4QEFA 4IDRX 4E4AA 1UGAA 1UGCA 1V9IC 4K13A 3QYKA 3M2ZA 3V2MA 3LXEA 3OILA 4KUWA 4Q06A 4HEZA 2Q1QA 5SZ0A 4RH2A 5JDVB 4L5WA 3S73B 5JGSB 4E3GA 4Q6EA 2QOAA 1TEQX 2X7SA 4JSAA 1Z93A 2NNGA 3FFPX 3DD8A 2EU2A 3T82A 4ILXA 4BF6A 3RG3A 2FNNA 3UYNA 3S78B 1BNNA 1CRAA 3MWOA 4YX4A 4R59A 1JV0A 1CNCA 3ZNCA 2NNSA 3N2PA 1UGFA 4LP6A 1CILA 2AX2A 3RYVB 3D8WA 4KNMA 3RZ7A 3ML5A 4CACA 5G0BA 3M98A 5EH7A 4IWZA 4QK1A 1G4JA 5FLPA 3RZ8A 2ZNCA 1RZDA 4ZX0A 1ZGEA 1CAKA 4Z1NA 4PZHA 2FOUA 2OSFA 3N3JA 4ITPA 1EOUA 3M67A 3U3AX 3R17B 1ZE8A 5EH5A 4E3DA 1LZVA 5SZ6A 4TWMA 4QJ0A 4MDMA 1FSNA 3MNKA 3SAPA 3V7XA 3B1BA 3RZ5A 4BCWA 4M2VA 3T83A 5CACA 3V2JA 1I9NA 4MLTA 4RUXA 1CAIA 2HD6A 3FE4A 2O4ZA 1CVEA 2NMXA 4WUPA 5FLTA 4Q0LA 1CAMA 1MOOA 1OKNA 1YO1A 3S71B 4LHIA 1BZMA 1CA3A 1BNVA 4Q7SA 1HEDA 3DVBA 4JSWA 3KOKA 5AMLA 1CNWA 1IF4A 1CA2A 5E28A 5EHVA 3UYQA 4YGKA 2NNVA 1G48A 3F7BA 5EKHA 1CCUA 2FOSA 5DSLA 3IGPA 1Y7WA 3P44A 4PQ7A 2FOQA 5FNMA 3M2XA 1BV3A 1CVAA 1DCBA 2H15A 5DSKA 4CA2A 5FNKA 1XEGA 5FL5A 5JGTB 4N16A 4CNWA 5JQ0A 3S77B 4FIKA 1RZBA 5JESB 3T84A 1FR7A 3K34A 3V3FA 3TVNX 3N0NA 3MNIA 4Q07A 5SZ2A 2CBDA 2FW4A 2EU3A 1CNGA 1BNQA 3P5AA 5L3OA 2WD3A 4HBAA 2HL4A 1BNTA 3MNHA 1F2WA 4C3TA 5DSNA 1I91A 3D93A 4E9OX 3F7UA 1IF5A 4KV0A 1CNJA 1CALA 2X7UA 5FLQA 3CA2A 3D92A 4QK3A 3EFIA 3OY0A 4G0CA 3U45X 1RZAA 1ZH9A 4FPTA 3ML2A 3U7CA 1I90A 4CNVA 4QTLA 1UGDA 1BN3A 4Q8ZA 3IBUA 1CAOA 4Q9YA 5DSOA 4YXOA 1HCAA 2NN1A 1ZSBA 3L14A 2HKKA 1TE3X 3DC9A 1KOPA 1FR4A 1G6VA 2NWZA 1I8ZA 3M1WA 5DSQA 5IPZA 3KWAA 3MMFA 5E5RA 4RUYA 5BYIA 4K0SA 2GEHA 5FL6A 1OQ5A 3M5TA 3MNAA 1TB0X 5CLUA 3Q31A 1CNHA 1CANA 1JD0A 3RYZA 3JXGA 2WD2A 1CVDA 4QSJA 4TWLA 5E2RA 1RZEA 4JSSA 4M2WA 4CNRA 1KWRA 1FQLA 1BNUA 4RFCA 4E5QA 3CZVA 4JS6A 3DVDA 3BL0A 1G52A 1FQMA 1I9MA 3D0NA 4XFWA 3M1KA 3V3GB 3HFPA 5DOGA 3BETA 4KNJA 2VVAX 3IBLA 4Z1KA 1CIMA 1TG9A 4K0ZA 4KNNA 5DOHA 4Q7WA 3RYYA 4HT2A 4M2RA 2NXTA 5EKJA 4RIUA 5FNHA 3C7PA 4HEYA 1RJ6A 1JCZA 4WR7A 3MYQA 3B4FA 1BCDA 1XPZA 3KONA 4YGFA 3HKNA 4Q7VA 5EHEA 1BNWA 5L6KA 1KWQA 5EKMA 3S8XA 5CJFA 3NB5A 3IBNA 5G01A 1CVFA 3DD0A 3V5GA 3KIGA 4X5SA 8CA2A 3PJJA 2WEGA 3M5EA 1IF8A 5FNLA 4FL7A 4KNIA 5FNGA 4Q90A 3SBHA 1G53A 1RZCA 1I9QA 1V9EA 2POWA 4Q81A 3VBDA 5J8ZA 1HUGA 4R5AA 3M5SA 4COQA 4HEWA 4Q09A 2CABA 4MLXA 3SBIA 4QSIA 4GL1X 1CNBA 3NJ9A 1HEAA 1CNKA 1CAJA 4Q49A 3DCWA 1CVHA 5FLRA 4K0TA 4DZ9A 3T85A 1UGBA 1RAZA 4BF1A 5CA2A 1AVNA 1TBTX 3OKVA 1G1DA 1ZSAA 4ZWZA 2NNOA 1I9OA 1KEQA 2NWYA 4K1QA 3T5ZA 1J9WA 2NWPA 1TTMA 4PYYA 5DVXA 2F14A 5G03A 1G3ZA 1YDAA 4XZ5A 3S72B 2WEJA 1CZMA 1CAHA 2ABEA 3MHOA 4WUQA 1DCAA 4QJMA 3DC3A 1LUGA 4QIYA 1KOQA 3HKTA 4N0XB 3HKQA 2FOVA 4RFDA 2IT4A 4Q99A 1ZGFA 3OKUA 3PO6A 3S97A 2CBAA 4Z1JA 5FLSA 4E3HA 3MHLA 3FW3A 2FMGA 5A25A 3DAZA 4ITOA 3R16A 1LG5A 4FRCA 2HOCA 2NWOA 3DCCA 1ZFQA 3EFTA 4R5BA 4XE1A 4YVYA 5SZ5A 3M1JA 1BN1A 7CA2A 2VVBX 2Q1BA 4Q78A 4YXUA 1HUHA 3KKXA 4QY3A 1Z97A 1CVBA 3N4BA 2CBBA 1HEBA 2POVA 3OYSA 2QP6A 3SAXA 4MDLA 3BL1A 3P58A 3P5LA 3PYKA 4YWPA 5SZ3A 3RYJB 5DSJA 5SZ4A 3P55A 4QJXA 5DSRA 4Q6DA 1H9QA 1HVAA 1CVCA 3DBUA 4G7AA 3KNEA 5FDCA 5FNIA 4FVOA 1CRMA 4MTYA 5BRWA 1G45A 2H4NA 5C8IA 1FSQA 1XEVA 3KS3A 3JXHC 1YDDA 1THKA 5BNLA 3MZCA 1H4NA 4Q8YA 4E3FA 3CAJA 3IEOA 2HFWA 4HT0A 5JQTA 4YYTA 4YGNA 3P3HA 4WW6A 2FNKA 1H9NA 3CYUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XIX A;  4CNX A;  4ZX1 A;  3DV7 A;  4QSB A;  3OIM A;  5BRU A;  2GD8 A;  4Q83 A;  4WW8 A;  3TMJ A;  1XQ0 A;  3MDZ A;  1A42 A;  2FNM A;  5FDI A;  5SZ7 A;  1BNM A;  1UGG A;  4YGL A;  1YO2 A;  4Q7P A;  2HNC A;  1FQR A;  4QJP A;  3D9Z A;  3V3H B;  5AMD A;  1AZM A;  2FMZ A;  4RUZ A;  1BIC A;  3F8E A;  1RAY A;  3RJ7 A;  3DVC A;  3K2F A;  3IAI A;  9CA2 A;  3S75 B;  4KUV A;  3M2N A;  3OYQ A;  4Z0Q A;  1IF9 A;  3HS4 A;  3K7K A;  4ZWX A;  3TVO X;  1ZFK A;  3W6H A;  4Y0J A;  4HU1 A;  4JSZ A;  4QK2 A;  4QIZ A;  5E2S A;  5E2K A;  4ZAO A;  1ZNC A;  3MHI A;  4KP8 A;  4YGJ A;  1T9N A;  2W2J A;  4M2U A;  3M3X A;  12CA A;  4L5U A;  4MO8 A;  3RGE A;  3IBI A;  1LG6 A;  1TH9 A;  5G0C A;  1HCB A;  1G0E A;  3W6I A;  3MHC A;  4FVN A;  5FLO A;  2EZ7 A;  3M1Q A;  4YHA A;  3RLD A;  4RIV A;  3S76 A;  4KUY A;  3ZP9 A;  1CAZ A;  5FNJ A;  1YDC A;  3M04 A;  1UGE A;  5JEH B;  1DMX A;  1DMY A;  3JXF A;  3KOI A;  1YO0 A;  5DSP A;  4WL4 A;  1MUA A;  3GZ0 A;  2Q38 A;  3HKU A;  5E2N A;  4HF3 A;  1FSR A;  4ZWY A;  1G4O A;  3RYX B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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