5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
b'GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
2QWPA 5KPTA 3IFRA 3TPQA 2P9NA 4H0YB 3ATUA 2P9UB 4PKHA 5ADXA 4XH5A 5ELZA 5AQVA 4BVPA 2BTFA 4H0TB 4JAXA 2FLOA 4BVOA 1SZ2A 3QICA 3H6EA 3VF4A 5KPZA 4BRMA 4BGAA 4MLEA 3ENHA 3LDQA 4H0VB 2E1YA 4WQ5C 5CE3A 3O6WA 2YJEA 3WXIA 5E84A 5B8HA 1BWFO 1ESVA 4A2AA 1BU6O 3FZMA 1RDWX 4IJAA 4CBXA 3L0QA 1NGHA 1JCEA 3D2FA 3O5BA 1E4GT 5F1XA 2P9IA 2CH6A 5BN8A 3VERA 2E20A 2DPNA 4CZKA 5AZJA 2P9NB 5LJVA 2HOEA 1QHAA 3W3DA 3UE5A 1HUXA 5BR9A 1GLDG 2FSJA 2Q31A 3H1VX 3WXLA 4BC5A 3VF6A 1NM1A 1TYQB 4PL8A 4GY2B 2QWRA 1NMDA 2CGLA 4QS7A 1NGBA 4FWOA 3QFPA 3ZX3A 4B1XB 4ISGA 3MN9A 1U2VB 1R59O 2F9TA 3O1BA 4BREA 4BQLA 1G99A 3EN9A 4J8FA 4WQ4C 4RWTA 3FZHA 2QWOA 2P9IB 2A41A 2Q36A 3U9ZA 4ISFA 3ZEUA 3FLCO 3ULEB 4CZLA 3AAQA 3EO3A 3OHRA 3CJ9A 1C0GA 4H0OA 4BRAA 4DHYA 1BA0A 2E1ZA 2EWSA 2E88A 3UKRB 3M6GA 4PKIA 4FWRA 2KHOA 4IZ9A 2ITMA 1GLLO 2A5XA 3R8EA 2YHWA 3FR0A 3IUCA 4BRIA 1SQKA 3HTVA 3ATVA 1X3MA 5AQXA 3H45C 3H3NO 4IWVA 4BRFA 1J6ZA 2YI1A 4BC2A 4FWLA 4K42A 2F9WA 1K8KB 1Q18A 3WQTA 3CJBA 3EKSA 3VEZA 4FWQA 5AZIB 1BDGA 5JLHA 5EXWA 5AQRA 2FF6A 4B1VA 3R6MA 3VESA 4M63C 1Z6RA 4FWNA 1NWKA 1ATRA 1GLCG 2W41A 5BPMA 2P9UA 5AQJA 1LCUA 4MO4A 2QM1A 4BRGA 4JN4A 1NGIA 4B1YB 4BQZA 5BPNA 2AP1A 1BUPA 2NRHA 5AQHA 3VEXA 2D0OA 5LY3A 2V7YA 4H5TA 2Q2RA 3FGUA 2QWLA 5JICA 4B9QA 3D2EB 3B8AX 2ZGYA 1P8ZA 3SMSA 4H0PA 3LDLA 3JXUA 2CH5A 2GTDA 3FFKB 3QMLA 4MLHA 5AQOA 5JLFA 3SJHA 4QS8A 4AM7A 1ATSA 4BR5A 2YHXA 3LL3A 4GNIA 4H5VA 2Q97A 3GOIA 3QB0A 1RGIA 1NGDA 3VEWA 5AQMA 5AQQA 2UYTA 4BRHA 5BRDA 4AM6A 4XH4A 3VEOA 4CJ7A 2A40A 2BUPA 3ZETB 2FF3B 1NGCA 4CZFA 5AR0A 1TYQA 4BG9A 3DJCA 5TKYA 1KAXA 1U2VA 3R9PA 2QWMA 2HF3A 4M7YA 1BA1A 3ZX2A 4ISEA 4BRNA 3H3OB 3WEEA 1NGEA 4NB4A 3CHWA 3A8YA 3DXMA 4MO5A 4BR9A 1X3NA 3ULEA 1T44A 2PBDA 3VGMA 4WQ4A 4BR2A 1S22A 2HF4A 1NGGA 4I6MB 5KPRA 4HWIA 4EFHA 4CD1A 2FSKA 3CQXA 1GLAG 3UKRA 5BN9A 3LM2A 4IXCA 3VEYA 3VPZA 3VENA 2E8AA 4RCHA 4IO8A 5FPDA 3DXKB 1IG8A 4H03B 5BREA 3BEXA 2NLXA 4XEIA 2P9PB 3BF3A 4K25A 3O8MA 2YCHA 1XUPO 3CERA 3MK6A 2H3GX 2ZWHA 4CZJA 3QDKA 4EIAA 4CBWA 3WEEB 2IVOA 1K8KA 3DXMB 4BROA 5AZIA 2ASOA 4QS9A 5AQUA 2V51B 3GE1A 4WYBA 1JCGA 4JHDB 4HTLA 3EKUA 2VYPA 4O5FA 1CZAN 3MN6A 3CJ1A 3ZX0A 3KVGA 2A6AA 1GLFO 1SAZA 2V7ZA 2GELA 2P9SB 1V4TA 3O80A 4PKGA 1HX1A 4E1JA 3ID8A 4FOEA 1TUYA 2QW9A 3RSEB 3ENOA 3GG4A 2D4WA 5EVZA 3D2EA 2AA4A 2E2QA 1D4XA 2GWJA 3QBWA 4A62A 4BRLA 5AQZA 2A42A 4K41A 2GUPA 5AQLA 5KQDA 2D0PA 4A2BA 2FSNA 2I7NA 1E4FT 2P9LA 4YDUA 5AFUA 1T6DA 3VF2A 3O1WA 4BR7A 3GL1A 2GWKA 3AAPA 4BC3A 4CZEA 5AQPA 1NGFA 3ZETA 2CGJA 1QQNA 3QBXA 3WUHA 3VEVA 1S3XA 3WQUA 3MN7A 5I9EB 3I8BA 3WXJA 3CJAA 4H5WA 3LDNA 5AQKA 1BG3A 1DEJA 1YVNA 3SLCA 3UKUB 4XH1A 4FOIA 4B1ZA 1ZBSA 4BRCA 3S41A 4DQ8A 4NO7A 1LOTB 4WQ5A 1JCFA 1GLJO 4Z94A 1C0FA 3HZ6A 1WOQA 3I33A 2P9LB 2ASMA 2WUSA 3DWLA 1NBWA 5FPMA 1TUUA 5FPNA 3P4IA 3HM8A 2IVNA 3KHYA 4I6MA 3U4LA 4A61A 2D1KA 2A3ZA 1ZC6A 4H0XB 1MA9B 3VGLA 2QXLA 4CZIA 3FZKA 1YXQA 1NLVA 1NGJA 1HKBA 4BRDA 5AQTA 1XQSC 4KBOA 4LC9B 2V52B 5F2RA 3FE1A 1MDUB 4JD2A 1T6CA 4FPAA 3U9DA 3DXKA 3O08A 2P9PA 3A0IX 4K43A 3J8AA 3TU5A 2GEMA 4BRPA 3KZBA 3VGKA 2W40A 1HLUA 4EHTA 1QZ6A 1ZXOA 3FZLA 1H1VA 4FO0A 1XC3A 1WUAA 3HI0A 4JHDA 3IMXA 3LM9A 5FPEA 1QZ5A 2Q0RA 3G25A 3LDPA 2IIRA 4B1UB 5AQIA 1EQYA 2P9SA 3IDHA 1MWKA 3H46O 4CZGA 2J4RA 1Y64A 5AQFA 5F0XA 4JD2B 4C23A 5EX5A 4CZMA 3MCPA 1HPMA 3FZFA 1ATNA 4BC4A 2IVPA 3RSEA 4FWKA 5BPLA 2OANA 2E2NA 2VWBA 4O8KA 5EY4A 3WXKA 4PL7A 4CI6A 4RTFD 3M3ZA 1X9JA 5JMVA 3CJCA 3BP8A 3HBTA 2FXUA 4IJNA 3A5NC 1Z05A 4CD3A 4CZHA 3AY9A 3MDQA 5LJWA 1NGAA 2I7PA 3CJ7A 3QFUA 3JS6A 3VOVA 4BRKA 2Q0UA 4FPBA 3D2FB 3AARA 5BRFA 5AQGA 5BRHA 4H5RA 3U8XA 3CQYA 5AQYA 4BR0A 1BOTO 5AZJB 2NZTA 1DKGD 3HSCA 3UKUA 3H1QA 4FWPA 4DCHA 1QQMA 2HMPA 3GDQA 1IJJA 2ASPA 5KQ8A 4BRQA 5AFUH 4F9OA 3GBTA 1QQOA 1YUWA 2VCPA 4JNEA 3DAWA 5AQWA 4BR4A 3MN5A 2E2PA 3EZWA 4BG8A 1MWMA 3SMPA 3VETA 2Q1NA 4EAHD 4FL9A 2E2OA 3F9MA 3EL2A 4FSVA 2QWNA 3M1FA 1KAZA 2ZF5O 4BGBA 3L4IA 4CBUA 3L6QA 3C7NA 4FWMA 3ZEUB 3SK3A 1BO5O 1HKGA 4M7XA 5AQSA 3CI5A 3CETA 1KAYA 1GLBG 2P9KA 1KXPA 1DGKN 5EOYA 4DB3A 2QWQA 4H5NA 4EHUA 1HJOA 3W0LA 3D7EO 3C0BA 1GLEG 1YAGA 1U6ZA 3A5OC 3A5MC 3MMVA 1RFQA 2YJFA 1OKJA 4B1WB 3O4WA 2CGKA 2ZGZA 5E26A 2YHYA 3CIPA 4FWSA 3C7NB 5AQNA 4YDUC 3BUZB 1V4SA 5ADXH 3LDOA 3A5LC 3WT0A 2PAVA 4L3QA 1HKCA 4Y0WA 3UB5A 3BF1A 2P9KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KPTA 4X65K 3ATUA 4CEBA 5ELZA 4JAXA 3D6RA 1RT3A 3AVNA 4BRMA 3VQ9A 3THYA 3SQ2A 3DLHA 4JS5A 3OYNA 2KW4A 4H0VB 1I94K 2E1YA 4OLAA 3O6WA 5B8HA 1VQ9N 3AV9A 1BU6O 3OS2A 2NY9X 1VQ6N 4W5OA 4CBXA 2KJAA 1OH7A 1OZZA 1I39A 3CCSN 5F1XA 2CH6A 2OTJN 1VHXA 3L3UA 1B9FA 3G4SN 3C95A 2DPNA 3O3GA 5LJVA 4FZYA 3VQ8A 2HOEA 4CEQA 1QHAA 2FBXA 4HTUA 1SNBA 3HJFA 3DOKA 4B9MA 4FLZA 1OVQA 1BGXT 2Q31A 1ZBIA 1BCOA 1NM1A 4FZZA 4LY7A 2QWRA 1RT5A 1NGBA 1LV5A 2B5JA 2HNZA 3D45A 1UAXA 3AVJA 4ISGA 3SV3A 1WNSA 4YOXA 4J8FA 2UXCK 3FZHA 4C8LA 1S6QA 2P9IB 3DLKA 2A41A 2QKBA 4GV6A 3FLCO 3L3VA 3E66A 3EO3A 4BRAA 1JJ2M 2E1ZA 4DV2K 1RILA 2N2QA 2LN8A 4FWRA 1FKPA 3VQBA 1T7EA 4NXNK 3MEEA 5GADP 3E9PA 2YBRC 2GMOA 1TKZA 3ENBA 4IFEA 3DYAA 1X3MA 1EO1A 5AQXA 4KPYA 3M5RA 1GOAA 1NNEA 4CJRA 4K42A 1Q18A 2E4LA 3WQTA 3TANA 1VNAA 4BY9C 3VTIA 2BANA 1NG9A 3R6MA 1I2VA 1Z6RA 1TAQA 1NWKA 3KKSA 4FW2A 2W41A 4FXDA 1LCUA 2QM1A 1NGIA 4M45A 1U49A 4BQZA 4RG8A 2NRRA 3VEXA 5AQHA 4W5TA 3FGUA 4WFBL 2UXBK 4AB0A 2QWLA 1S9GA 4YOYA 2ZJPL 1LAWA 2ZGYA 1DTQA 4M3TA 3LDLA 2F4VK 4LF7K 3JXUA 1BL3A 3IKMA 4UQGA 1SL1A 5IT9O 1VSLA 5DM7L 3KD5E 3K5LA 1ATSA 3OYMA 3I8DA 5GIOA 3EE8A 3HPGA 3QB0A 3GOIA 3VEWA 5M1OA 2UYTA 4BRHA 5BRDA 1QSLA 4AM6A 4XH4A 2A40A 3ZETB 4KHPK 4FLTA 1ICAA 3KK1A 1NGCA 4TSXA 4ICLA 4CZFA 4BG9A 2DTUA 4YHHK 2UXDK 2LKBA 3LP0A 4FJJA 3F2KA 3P38A 2QA4N 2OPPA 3R9PA 2QEXN 1UA0A 3I0SA 3CCRN 3HXMA 4DV7K 4B9TA 1D5AA 3WEEA 1KC8O 2FC0A 1ZVEA 4CJWA 4NB4A 3A8YA 1CLQA 4BR9A 3C65A 3VQ5A 3S3NA 1L3TA 4E7JA 3PLAA 4BR2A 1A5WA 3U3YA 4I6MB 1HNIA 1HYVA 4LH5A 5CY4A 3C6TA 4Z4HA 2Q3SA 4JKFA 2OZSA 2FSKA 4OPJA 4IXCA 4KH4A 4CECA 2O8BB 3VPZA 3PO4A 4B3OA 5FPDA 4HVJA 3DXKB 5BREA 4DU1A 3QO9A 3BF3A 3MX2A 3O8MA 2YCHA 5J2MA 1XUPO 3TAMA 4EIAA 1NK5A 4CW7B 2F8TA 3O4QA 1VRUA 3M8PA 4A57A 1RBVA 1N8RO 3PSFA 2M8BB 3EKUA 4B9SA 3CJ1A 1T0ZA 3CCEN 3ZLJA 1V4TA 4PKGA 1YI2N 4E1JA 3V9WA 3LP2A 1DQ7A 3LAMA 1LQHA 2YHAA 3RSEB 3ENOA 1A5VA 4JI2K 1C0TA 5EVZA 2WBNA 3T3FA 1I6GA 2ITGA 1TKXA 1EKEA 3QEIA 5AQZA 4JYAK 3VQ7A 4W5NA 1YIJN 2D0PA 3R3LA 1RDCA 3BZKA 4CF2A 2JWLA 2FSNA 4IFYA 4OGEA 4GW6A 4BDYA 2E5LK 1D9FA 1T6DA 4BR7A 3VMFB 3GL1A 4LF4K 4CZEA 3ZETA 1QQNA 3NH1A 3RMBA 4E7HA 3VEVA 4MFBA 3L2VA 1LQIA 3WQUA 3MN7A 2VG5A 3CJAA 1BG3A 1VQMN 2KZMA 3QERA 5CYQA 2WFBA 4B1ZA 4J2AA 1ZBSA 2D0AA 3AVHA 3S41A 4OVLA 4HCBA 2UUCK 3SUQA 1JCFA 5HROA 3HZ6A 3NBPA 3LPTA 1DLOA 4WF9L 2WUSA 1NBWA 3P4IA 2MBKA 3OYEA 4FJIA 4I6MA 2IVNA 4A61A 2D1KA 1ZC6A 1MA9B 2QXLA 3FZKA 3S9HA 1NLVA 1Q81O 2P5OA 4LFBK 1XQSC 2E6MA 4JI4K 1MDUB 3VN5A 2O8BA 1T6CA 4FPAA 2HHQA 5BR8K 3CCVN 3DXKA 4CIFA 4CJUA 3O08A 1RT1A 3TU5A 4GMJB 4NXMK 3PUFA 2LSNA 1XNRK 4JI0K 2GL1A 3NH0A 1XHZA 2YIOA 1H1VA 4FO0A 4DFPA 3CG7A 3IMXA 5FPEA 1QZ5A 1S6PA 2G8WA 3ZT3A 4FVUA 2IIRA 4B1UB 5AQIA 1IV0A 4LSNA 1MWKA 1VNBA 1NMNA 4CZMA 3RRHA 4JI8K 2YV0X 1YITN 2P1JA 3FZFA 1HQUA 4BC4A 4DS4A 4DTJA 3RSEA 3N4QA 4FWKA 5BPLA 1HYSA 4K8ZA 2VWBA 3S3MA 5EY4A 1K9MO 2E2FA 3V1OA 4CGGA 4U67L 3KLIA 4FJNA 5JMVA 3CJCA 3LWMA 2FXUA 3O9TA 3LALA 1JXEA 3L2QA 1U04A 3C94A 1NGAA 2I7PA 3CJ7A 3QFUA 1TVRA 4H8KA 5H1SQ 1VQLN 3DLBA 3TARA 3D2FB 5BRFA 3J81O 1RBRA 1BIUA 2A7TA 3CQYA 4RW7A 2DY4A 2VQFK 5AQYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5KPT A;  4X65 K;  3ATU A;  4CEB A;  5ELZ A;  4JAX A;  3D6R A;  1RT3 A;  3AVN A;  4BRM A;  3VQ9 A;  3THY A;  3SQ2 A;  3DLH A;  4JS5 A;  3OYN A;  2KW4 A;  4H0V B;  1I94 K;  2E1Y A;  4OLA A;  3O6W A;  5B8H A;  1VQ9 N;  3AV9 A;  1BU6 O;  3OS2 A;  2NY9 X;  1VQ6 N;  4W5O A;  4CBX A;  2KJA A;  1OH7 A;  1OZZ A;  1I39 A;  3CCS N;  5F1X A;  2CH6 A;  2OTJ N;  1VHX A;  3L3U A;  1B9F A;  3G4S N;  3C95 A;  2DPN A;  3O3G A;  5LJV A;  4FZY A;  3VQ8 A;  2HOE A;  4CEQ A;  1QHA A;  2FBX A;  4HTU A;  1SNB A;  3HJF A;  3DOK A;  4B9M A;  4FLZ A;  1OVQ A;  1BGX T;  2Q31 A;  1ZBI A;  1BCO A;  1NM1 A;  4FZZ A;  4LY7 A;  2QWR A;  1RT5 A;  1NGB A;  1LV5 A;  2B5J A;  2HNZ A;  3D45 A;  1UAX A;  3AVJ A;  4ISG A;  3SV3 A;  1WNS A;  4YOX A;  4J8F A;  2UXC K;  3FZH A;  4C8L A;  1S6Q A;  2P9I B;  3DLK A;  2A41 A;  2QKB A;  4GV6 A;  3FLC O;  3L3V A;  3E66 A;  3EO3 A;  4BRA A;  1JJ2 M;  2E1Z A;  4DV2 K;  1RIL A;  2N2Q A;  2LN8 A;  4FWR A;  1FKP A;  3VQB A;  1T7E A;  4NXN K;  3MEE A;  5GAD P;  3E9P A;  2YBR C;  2GMO A;  1TKZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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