5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
3M3ZA 2A41A 4BGAA 4F9OA 4WQ5A 1NLVA 2E2QA 2Q2RA 5AQSA 4CZIA 4LC9B 4B1UB 4BR0A 4BG8A 2FLOA 2P9UB 2P9KA 3MMVA 1HX1A 3CJBA 4BRMA 3UB5A 4XEIA 2F9WA 4YDUA 3FZMA 3FFKB 1NWKA 5AQKA 4E1JA 3ENOA 4I6MA 4XH1A 5KPTA 3AAQA 1NGIA 5I9EB 4CD3A 2QWMA 2A3ZA 4JD2B 4BC4A 5ELZA 2FF6A 4M63C 5FPMA 1T44A 3JXUA 2GUPA 4FOIA 2QWQA 1G99A 4HWIA 3CJ9A 4IJAA 2J4RA 3VF6A 5BN9A 1MWKA 2Q31A 2QXLA 3QB0A 4CZKA 3ENHA 3P4IA 2FSJA 4BQLA 1H1VA 2ZWHA 5AFUA 5AQOA 2BTFA 4JNEA 1QQOA 3VEYA 1K8KB 3ZX3A 5JLFA 4WQ4A 1HKCA 5BPNA 4BROA 2Q97A 5F0XA 1YUWA 1NM1A 4B9QA 5EX5A 2E2PA 1R59O 4DHYA 3QDKA 3GL1A 2CGJA 2V52B 4FOEA 1X3MA 1DGKN 1RFQA 2GELA 3HI0A 5KPRA 2EWSA 2NZTA 5ADXH 3LDNA 1GLEG 5CE3A 5AQPA 1ZC6A 4J8FA 4NO7A 3ULEB 4JD2A 1HKGA 3SJHA 2AP1A 4BR2A 4O8KA 3D2EB 1SAZA 1X3NA 4ISGA 2FF3B 1NGEA 2ZGYA 3EKSA 2ASMA 2CGKA 1KAXA 1ESVA 3B8AX 4FWMA 4CBXA 1KAYA 4FWQA 1JCGA 3HBTA 4H03B 2E20A 4A2BA 2D0OA 5EXWA 3UKRA 3H46O 1JCFA 4IJNA 1GLBG 2GWJA 4CD1A 3H45C 4FO0A 3FR0A 5AQVA 5E84A 5FPEA 3GE1A 3U9ZA 3UKUB 1GLAG 2E8AA 2DPNA 1NGFA 2HMPA 2YHYA 2GWKA 2E2NA 2Q0RA 4O5FA 4BC2A 4BR9A 4H5NA 4K41A 3MCPA 2P9KB 4BG9A 3O4WA 3C7NB 1T6DA 3VGLA 4CZJA 3QBXA 3FE1A 1ATRA 1GLJO 3EKUA 4I6MB 2IVNA 4QS9A 2P9PB 3WEEB 3UE5A 4A61A 4CZHA 3O1BA 4H5RA 2ZGZA 3ULEA 1Y64A 4EIAA 4HTLA 1QHAA 2QWPA 2V7YA 3A0IX 2V51B 2BUPA 2QWRA 2F9TA 2E2OA 5AQHA 3VERA 5AZIB 2H3GX 3OHRA 3IDHA 5AFUH 1DKGD 5AQXA 3UKUA 4CBWA 3H3NO 2VYPA 5AQWA 5AQYA 4CBUA 2HOEA 4DB3A 5JLHA 3KZBA 3L6QA 4CZGA 1C0GA 3WQUA 3SLCA 2GTDA 3EZWA 4GNIA 4QS8A 2PBDA 5EY4A 3C7NA 3O80A 2W41A 5AQGA 5AR0A 2HF3A 2YI1A 4RCHA 1ZBSA 4IXCA 3AY9A 1HLUA 5LJVA 4B1ZA 3ZX0A 4B1WB 2P9PA 3KVGA 3WEEA 2ZF5O 3M1FA 3WXKA 3VEOA 2D0PA 4MO5A 4H0OA 3C0BA 1IJJA 2W40A 1NGJA 1GLDG 3LM2A 3GDQA 4BREA 3CQXA 3IUCA 5AQFA 3MN7A 4EFHA 1C0FA 3D7EO 4H0XB 4M7XA 3I33A 2AA4A 3ZEUB 3TU5A 3MN9A 3UKRB 4MLHA 1HUXA 5AZIA 4CZFA 4BRAA 3EN9A 5AZJA 1ATNA 4CI6A 5LY3A 1BDGA 1TUUA 3CI5A 3GOIA 4B1XB 3VEVA 5EVZA 4L3QA 4QS7A 4BC3A 2A6AA 3JS6A 3WQTA 5KQDA 1Z05A 4M7YA 4H5VA 4FL9A 3BEXA 1YVNA 1GLFO 4PL7A 2IIRA 3VEWA 3L4IA 3J8AA 4FPBA 5JMVA 1BO5O 5AQRA 5AQZA 4EHUA 4A2AA 4FWOA 2CH6A 3DJCA 5BRFA 4Z94A 4ISEA 2QWNA 1TYQA 1WOQA 1RDWX 4CJ7A 2E1ZA 4MO4A 3HTVA 4BRDA 1QZ6A 3ZEUA 1NGDA 3LDPA 1D4XA 3HM8A 1NGBA 2NLXA 4H5WA 5BPMA 3S41A 5BRHA 4GY2B 2A5XA 3IFRA 4JHDB 4BRIA 4BVOA 3SMPA 5LJWA 2E88A 1YAGA 3VF4A 4K42A 1E4GT 3MDQA 3CJCA 2QWOA 4K25A 5FPNA 5AQLA 1HKBA 5AQNA 2ASPA 3QICA 5AQUA 3RSEA 3LDLA 2CH5A 1GLCG 1U2VB 2P9LA 4BRFA 3BP8A 4ISFA 3QMLA 5F2RA 1SZ2A 1RGIA 3LL3A 4BQZA 3A8YA 1WUAA 1J6ZA 4BRQA 3GBTA 3VGMA 3FZLA 1BA0A 2A42A 2D4WA 4A62A 3VENA 2IVOA 4WYBA 3LDQA 1BA1A 4DCHA 4CZEA 4EAHD 2A40A 3LDOA 1ZXOA 4MLEA 4BRCA 3ATUA 2KHOA 1SQKA 2YJEA 2Q36A 3U4LA 5FPDA 3R8EA 1LOTB 5TKYA 2E1YA 3BF1A 5AQJA 4FSVA 5AZJB 1BOTO 4H0TB 1V4TA 3CHWA 4JHDA 3I8BA 4BRKA 4CZLA 3A5MC 2YJFA 3BUZB 4FWKA 2IVPA 2VWBA 4AM7A 2NRHA 3U8XA 4NB4A 3WXJA 4FWLA 4BR5A 1GLLO 1MWMA 3QBWA 2Q1NA 1U2VA 3MK6A 5KPZA 3AAPA 4BR4A 5BR9A 4XH4A 3ZX2A 4BGBA 2D1KA 2OANA 2Q0UA 3VF2A 5E26A 1TYQB 4BVPA 4B1YB 4WQ5C 3WUHA 3ZETA 3A5LC 2WUSA 4BRLA 3AARA 1P8ZA 4IO8A 4Y0WA 2PAVA 4FWRA 4PKIA 5AQIA 1Q18A 3DWLA 2P9IB 2VCPA 3IMXA 1KXPA 1NMDA 3A5OC 3F9MA 3CJ1A 1QQNA 3BF3A 2P9NB 2FSKA 3QFUA 2V7ZA 3FLCO 4JN4A 3VOVA 4YDUC 3U9DA 3DXKA 3CERA 3O1WA 1BG3A 4XH5A 2YHWA 3DXMA 3KHYA 3CIPA 3FZHA 5AQQA 2P9SB 4BC5A 3QFPA 3D2FB 1LCUA 2I7NA 3EO3A 4FWSA 3EL2A 3ID8A 3RSEB 1NGGA 4DQ8A 4AM6A 4FWNA 5KQ8A 4PKGA 5F1XA 1X9JA 2I7PA 2P9LB 3DAWA 3M6GA 3WT0A 3L0QA 5BRDA 1V4SA 3O8MA 5AQTA 4IZ9A 4BR7A 4PKHA 3G25A 1NGAA 1BU6O 3MN6A 2QW9A 3FGUA 2P9UA 2ASOA 4RWTA 4FPAA 3FZKA 1EQYA 1OKJA 1Z6RA 1NGCA 1BWFO 4FWPA 3FZFA 4RTFD 2P9IA 1HJOA 3VESA 4WQ4C 4H0YB 5B8HA 4BRNA 4IWVA 2QWLA 1DEJA 2P9NA 4CZMA 2CGLA 3MN5A 2UYTA 3W3DA 1MDUB 5JICA 3VETA 3A5NC 5BPLA 2YHXA 1YXQA 1U6ZA 1QQMA 2P9SA 4BRHA 1ATSA 3D2FA 3CJ7A 3GG4A 1XC3A 3WXLA 3VEXA 4H5TA 1TUYA 3H1VX 3VGKA 3W0LA 3LM9A 5BREA 3O6WA 1K8KA 4KBOA 3SK3A 1NBWA 1XUPO 3H1QA 5EOYA 1NGHA 1CZAN 4PL8A 3R6MA 2FXUA 2YCHA 3HZ6A 3ATVA 3ZETB 4EHTA 1S3XA 2FSNA 3O08A 3CQYA 4H0VB 1T6CA 3R9PA 5AQMA 3TPQA 1XQSC 3CETA 4BRGA 4K43A 5ADXA 1S22A 3HSCA 2ITMA 3O5BA 3VPZA 3WXIA 3VEZA 3DXKB 1BUPA 3H3OB 2HF4A 1HPMA 3D2EA 5BN8A 1E4FT 1QZ5A 4C23A 4BRPA 3DXMB 3SMSA 1KAZA 2GEMA 4B1VA 4H0PA 1JCEA 3CJAA 4JAXA 1MA9B 2QM1A 1IG8A 3H6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LP0A 3MX5A 5GAHP 4IG3A 1NK4A 1NLVA 2E2QA 4L8RB 3MEGA 1VQ7N 3PX0A 2EHGA 4BG8A 2BRZA 2FLOA 1HX1A 2PYLA 4CHOA 4CF1A 3DLHA 3CYGA 3CCMN 2W6KA 1NWKA 3ENOA 4I6MA 4JKAA 1MR4A 5C10A 1K73O 5KPTA 3AAQA 5I9EB 1Q82O 3SCXA 1EKEA 3DYAA 1BHLA 2GUPA 4FOIA 3SYZA 1G99A 3OYEA 3S3MA 4CZKA 1IKVA 2P51A 4BQLA 2HBKA 3OTOK 5AFUA 3ALYA 3FFIA 5AQOA 3CCEN 3K5MA 3NMUA 3L2QA 3VEYA 1K8KB 4DTUA 3QNNA 4FLZA 1Y97A 1XWLA 3CMEN 5BPNA 3HT3A 4AHSA 1NM1A 4O5BA 5EX5A 1KLMA 3AO1A 2NY9X 1RFQA 1GPTA 5CR4A 4HUFA 1BIUA 3HI0A 5M1QA 3OYAA 3OYDA 2EWSA 4OPKA 5ADXH 5J1EA 4YY3K 2F4VK 1GLEG 4ELVA 2LKBA 3QEIA 3LP2A 1RTIA 4BR2A 4DTPA 1X3NA 4CF9A 1NGEA 4NCBA 3OVNA 4FWMA 4CBXA 3EEQA 2E20A 3O4NA 4CJPA 2AJQA 1R0AA 2YNHA 5EXWA 3EE9A 1JCFA 4IJNA 5KK4A 4DKWA 1GLBG 2GWJA 2KZZA 3QINA 5E84A 3V9SA 1GLAG 1Q8IA 5GIPA 2YHYA 2GWKA 4BC2A 2HB5A 4K41A 3O3HA 3CXCM 1IBLK 4BG9A 3O4WA 2BE2A 1T6DA 4M42A 3AVMA 3QBXA 4LF6K 4DLGA 5IT9O 4KH5A 4LFAK 4CGDA 4YOVA 2IVNA 2O8BB 1S1XA 4CZHA 3IRXA 1Y64A 1I2UA 5J2MA 4W5RA 3QERA 4E19A 3DOKA 2V51B 2N69A 2BUPA 3AO2A 3L8BA 2KW4A 1VQLN 3VERA 4FZZA 1RDDA 3IDHA 1WBDA 1JKZA 1U04A 2UXDK 4DR1K 4KHPK 4KYPA 3H3NO 4IFEA 4JI5K 1LAWA 5JLHA 3KZBA 4CZGA 3G71N 1LWFA 1VSDA 3KD5E 4QS8A 1CXUA 5CYMA 4FJGA 4DU1A 3OA9A 3S3NA 3AY9A 4AEIA 3LZIA 4LY7A 5LJVA 2P9PA 4UAFE 3NVMA 2E4LA 3L56A 4CJFA 3P39A 5GADP 4M3YA 1WSJA 1IKYA 3NAEA 2W40A 3TAMA 1HQEA 3GDQA 2JWLA 3D7EO 4M7XA 3P38A 1NJXA 2ETJA 1IKWA 4B3RK 4IDHA 2HBJA 3BZKA 3KWIA 4A59A 3ZSYA 3G4SN 1JJ2M 3VQ7A 3CC2N 4Z4GA 1HUXA 2OPPA 3EN9A 4CGJA 2Y1JA 4E0DA 3C65A 1BDGA 1OVYA 3PO4A 2VG5A 3CI5A 5CY4A 4M3TA 3VQBA 3TAGA 1XI1A 1G15A 5JVHL 1NU0A 5EVZA 5HRNA 1AHOA 3MWPA 5KQDA 4CESA 1YJ9N 3M5RA 1XHZA 4JI6K 3RR7A 2ZJQL 3VQ9A 3VTIA 4CEOA 2IIRA 3VEWA 1BO5O 4G1QA 1VQNN 1HNVA 4CK2A 4EHUA 3VQ8A 2CH6A 2R7YA 1TKXA 2HVHA 1GOBA 2E1ZA 3EYZA 2O4GA 2FC0A 4BWMA 2WOMA 4LSLA 3CPEA 1TK0A 4LD0A 4NYFA 2A1RA 3SF4D 2ZM6K 4B9LA 2HSTA 5BPMA 2IOCA 3SAGA 4GY2B 4NXNK 4RW4A 5LJWA 3EZ5A 1YT3A 3KLGA 4M3UA 4ID1A 4Z4CA 1WSIA 3S9HA 1XNQK 2QWOA 4DR4K 5AQLA 3NF7A 4OPAA 3C6HA 3WNFA 2KJAA 4ISFA 3QMLA 3CW4A 5DM7L 4BRQA 3GBTA 1UAXA 3V1QA 3ZLJA 4A62A 4BEBA 4DF4A 1P90A 1F21A 1NRBA 2D0CA 4DCHA 3J7AP 4JKDA 2KBHA 4NCGA 5T7BA 3ATUA 1MYNA 4BDZA 3G6EN 3U6FA 2HW3A 4CW7B 5GAEP 4AHUA 2KGQA 5M1KA 4IEEA 1XMQK 3F5TA 4B9SA 4H0TB 1V4TA 4JHDA 4BRKA 3A5MC 1ASVA 1Z25A 3IG1A 2JLEA 4CGHA 3ENBA 3WXJA 4DF8A 1T1TA 2WTUA 3DLLL 3QBWA 2Q1NA 1B9FA 1U2VA 4JK8A 4DSFA 3KD1E 2W00A 1K8BA 4BR4A 1KVAA 1WSHA 4XH4A 4C8NA 4BY9C 3ZX2A 3J7ZO 3T19A 1T7EA 4B9TA 1NK0A 5E26A 2O8EA 2ZJPL 4B1YB 2VGMA 3WUHA 2WUSA 1NPIA 3THVA 3CCLN 2VGNA 4IO8A 1NG9A 4FWRA 1ZVEA 3OS2A 5AQIA 3DWLA 4FW1A 1NMDA 3A5OC 3F9MA 3TANA 3C6UA 4Z4FA 3BF3A 3ITHA 4JN4A 3FLCO 4FJ8A 1ZUTA 3U9DA 3DXKA 3VQAA 1J5OA 3E66A 4LH4A 1VQ5N 2O8DA 4ID5A 3QEVA 2QK9A 3OYNA 2Z1GA 4A5BA 1SN4A 3KHYA 5D3GA 2P9SB 4BC5A 4EP4A 2I7NA 1ASUA 1RBSA 1RBTA 3F2KA 3ID8A 1WN7A 3RSEB 1RBUA 5KQ8A 5F1XA 3DAWA 1JZAA 3OS0A 3P83D 1ZYQA 4DTSA 4CJWA 4IZ9A 3G25A 1BU6O 3FGUA 2ASOA 4RWTA 4GV6A 4FPAA 1K9MO 4O4GA 1NGCA 1AYJA 1BMRA 5GAGP 3FZFA 3HL8A 4FJ5A 1HJOA 4FK2A 4KHSA 4ZTJA 4W5OA 3TR8A 4IFVA 3HPHA 3Q7BA 1N5YA 4B3TK 3THWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LP0 A;  3MX5 A;  5GAH P;  4IG3 A;  1NK4 A;  1NLV A;  2E2Q A;  4L8R B;  3MEG A;  1VQ7 N;  3PX0 A;  2EHG A;  4BG8 A;  2BRZ A;  2FLO A;  1HX1 A;  2PYL A;  4CHO A;  4CF1 A;  3DLH A;  3CYG A;  3CCM N;  2W6K A;  1NWK A;  3ENO A;  4I6M A;  4JKA A;  1MR4 A;  5C10 A;  1K73 O;  5KPT A;  3AAQ A;  5I9E B;  1Q82 O;  3SCX A;  1EKE A;  3DYA A;  1BHL A;  2GUP A;  4FOI A;  3SYZ A;  1G99 A;  3OYE A;  3S3M A;  4CZK A;  1IKV A;  2P51 A;  4BQL A;  2HBK A;  3OTO K;  5AFU A;  3ALY A;  3FFI A;  5AQO A;  3CCE N;  3K5M A;  3NMU A;  3L2Q A;  3VEY A;  1K8K B;  4DTU A;  3QNN A;  4FLZ A;  1Y97 A;  1XWL A;  3CME N;  5BPN A;  3HT3 A;  4AHS A;  1NM1 A;  4O5B A;  5EX5 A;  1KLM A;  3AO1 A;  2NY9 X;  1RFQ A;  1GPT A;  5CR4 A;  4HUF A;  1BIU A;  3HI0 A;  5M1Q A;  3OYA A;  3OYD A;  2EWS A;  4OPK A;  5ADX H;  5J1E A;  4YY3 K;  2F4V K;  1GLE G;  4ELV A;  2LKB A;  3QEI A;  3LP2 A;  1RTI A;  4BR2 A;  4DTP A;  1X3N A;  4CF9 A;  1NGE A;  4NCB A;  3OVN A;  4FWM A;  4CBX A;  3EEQ A;  2E20 A;  3O4N A;  4CJP A;  2AJQ A;  1R0A A;  2YNH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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