5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
3QMLA 4AM6A 3QBWA 3UKRB 1BA0A 2P9NA 1QQMA 5AQJA 2QWPA 2Q0UA 3CJ1A 3SK3A 4QS9A 4H0YB 4LC9B 3WT0A 4K25A 5JLHA 3DAWA 3ATVA 1ATSA 2GUPA 4PKHA 2A40A 3DXKA 4CZJA 5AQLA 5BREA 3FZLA 3EKUA 4BVPA 1KAZA 3EKSA 4K43A 4JD2A 2ZF5O 4MLHA 2QW9A 2YJEA 2E2PA 3D7EO 1SZ2A 2IVOA 3DXMA 5KQ8A 3AAQA 2Q31A 4BREA 1QHAA 2OANA 1T6CA 3JS6A 4BVOA 2YI1A 4HWIA 1NGEA 3CIPA 1NGAA 1ATNA 1NBWA 3IDHA 2FF3B 1Y64A 4MO5A 3QB0A 4WQ5C 5F2RA 4FWQA 1WUAA 2E2NA 5BR9A 3QFUA 4GNIA 1MDUB 4JAXA 4RTFD 2ASPA 4BRIA 3P4IA 4CZKA 5EXWA 4DCHA 1S22A 1U6ZA 4FWRA 5I9EB 2P9SA 5AQWA 1BG3A 5AQPA 3R6MA 3LM2A 2V7ZA 4BRQA 3CJCA 2ASMA 2CH5A 2P9IA 3R8EA 3CJAA 4BRDA 2P9LA 3U4LA 4CZEA 4M7YA 4H0OA 3D2FA 3IFRA 4WQ4C 2ITMA 3C7NB 3HTVA 3VERA 5FPNA 5AQTA 2BTFA 4NB4A 2E88A 1TYQA 3VEZA 3O8MA 2F9WA 3GG4A 3KZBA 4BR2A 5B8HA 3W0LA 4MO4A 2VCPA 4BRMA 3D2EB 3VETA 4H0VB 1NGGA 2YHXA 1MWKA 3I8BA 1QZ6A 1XUPO 4BG8A 5BRHA 4JN4A 1YAGA 3BP8A 4CI6A 1NM1A 1V4SA 1JCGA 4CBUA 2QWLA 3LDPA 1H1VA 4CBXA 4BR0A 4CBWA 2GELA 3H45C 5ADXH 1GLLO 1HJOA 3MDQA 3O08A 3BUZB 3WXLA 4H0TB 2NLXA 3O4WA 4NO7A 2PBDA 4I6MA 5BPNA 5AQZA 1GLFO 4PKGA 3UKUA 1NWKA 5ADXA 2A6AA 2FXUA 3MN5A 3A5OC 2GTDA 2VYPA 4IO8A 1QQNA 2WUSA 5F0XA 3RSEA 2E20A 5EY4A 1ZXOA 1Z6RA 3VF2A 1BDGA 4EHUA 1RDWX 2HOEA 2GWKA 1J6ZA 2P9KB 1T6DA 3ZEUB 5AZIB 2QWNA 2IIRA 3AARA 4B1XB 5TKYA 4M7XA 5AQSA 4FWMA 2Q1NA 3ZETA 2D4WA 4RWTA 1KAXA 1ZBSA 4IJAA 3EO3A 3R9PA 5AQOA 2QWOA 2P9UA 5JMVA 3ZX2A 1MWMA 3ULEB 1U2VA 3MK6A 4HTLA 4B1WB 2ZGYA 3VGKA 5AR0A 3M6GA 5FPDA 1DEJA 2F9TA 5BN9A 3M1FA 1E4FT 1RGIA 4FPAA 1KAYA 2BUPA 5AQGA 1X9JA 3VEYA 5LJVA 1CZAN 2QM1A 3U9ZA 3LDOA 4EAHD 3LDNA 3FGUA 2YCHA 2H3GX 1GLCG 3BEXA 3VESA 3CQXA 1IG8A 1OKJA 2E1YA 1QZ5A 2IVPA 5EX5A 4BC2A 3ATUA 3H3OB 3S41A 4XH4A 1MA9B 1GLAG 4BRFA 3LM9A 4FSVA 3EN9A 1ESVA 1HKBA 4CD3A 5BRFA 2EWSA 4PL7A 3VPZA 3G25A 3AAPA 2HF3A 4C23A 1R59O 1K8KA 3CHWA 5BPMA 2QWQA 3CJ7A 2FLOA 2P9PA 2IVNA 2W40A 4ISFA 4H5WA 1QQOA 2ZWHA 4JHDB 4YDUC 1NGIA 3ENOA 3VEXA 2V51B 4CJ7A 1GLJO 3MN7A 4JNEA 3ZX3A 1NLVA 3QDKA 3GBTA 3UE5A 3QBXA 4FWPA 3UKRA 2FF6A 1YVNA 1D4XA 5E26A 4BGAA 3FZHA 2PAVA 1NGDA 1TUYA 4E1JA 5AQIA 2W41A 4CZGA 4BRKA 1BU6O 1DKGD 1Q18A 4B1UB 4H0PA 3WEEB 3J8AA 4H0XB 3HBTA 5LY3A 1X3NA 5AQQA 4B1VA 2QWMA 3O1BA 5AZJB 4BROA 1NGCA 4IJNA 4J8FA 4GY2B 2YHYA 4BRPA 4FWKA 4QS7A 1C0FA 2P9NB 3GE1A 2YHWA 4WYBA 3SMPA 2Q2RA 4H5VA 2Q0RA 4F9OA 3CJ9A 5AQHA 3CJBA 4PKIA 4FO0A 5AQFA 5BPLA 1LOTB 4IZ9A 4A61A 1HLUA 3DXKB 4QS8A 3VF6A 5LJWA 4CZFA 2E2QA 2VWBA 5EVZA 3H1QA 4AM7A 2HF4A 4BRGA 1NGBA 4BC5A 4JD2B 2FSKA 3O6WA 3GOIA 3W3DA 3ZX0A 3VENA 3TU5A 3H1VX 3DXMB 5KPRA 3A0IX 3DJCA 5EOYA 4BC4A 5AFUH 4FOIA 3FFKB 1NGHA 1JCFA 4B9QA 1NGJA 3EL2A 4A2BA 1YXQA 1LCUA 4FPBA 3ID8A 4WQ4A 2ZGZA 4CZHA 1DGKN 1YUWA 3IUCA 5AQRA 3U8XA 4IWVA 3O80A 3WXKA 2E1ZA 2NZTA 2V52B 2A3ZA 4EIAA 4H5NA 4Y0WA 3VGLA 4MLEA 1EQYA 4BR9A 3C7NA 3L6QA 2CGJA 2CGKA 3LL3A 4IXCA 4K42A 1HKGA 4BGBA 1BUPA 3GDQA 2P9SB 3WXIA 3EZWA 1BO5O 3QICA 3SMSA 1WOQA 4CZIA 3D2EA 2P9IB 5JICA 3H46O 4CZMA 2P9LB 3CERA 3JXUA 4FWOA 4ISGA 3D2FB 3WXJA 3M3ZA 4FL9A 5AQMA 3CQYA 1SAZA 2AP1A 3FE1A 2QWRA 1X3MA 1TYQB 4PL8A 3WUHA 3KHYA 4BQZA 3H6EA 1E4GT 4XH5A 4BRCA 4FOEA 3FLCO 3I33A 4EHTA 2Q97A 4BC3A 1RFQA 3VGMA 1V4TA 2I7PA 4BRNA 1XQSC 3MMVA 4A62A 2HMPA 3L4IA 5AQVA 1NGFA 2CH6A 1NMDA 4BG9A 1HPMA 3LDLA 2I7NA 4BR4A 3FR0A 4DB3A 5AQXA 2QXLA 2D0OA 2GWJA 3A5NC 3HZ6A 4BR5A 5FPMA 2AA4A 2YJFA 4BRHA 3BF3A 1ATRA 1Z05A 4I6MB 1HKCA 2P9KA 2E2OA 3ZEUA 5KQDA 3FZKA 3L0QA 5AZIA 4FWSA 3UKUB 4B1YB 4H5TA 3IMXA 4L3QA 5AQKA 4DHYA 2J4RA 5KPTA 2FSNA 5AQUA 4BR7A 2KHOA 3RSEB 3TPQA 4BRLA 1C0GA 3OHRA 3BF1A 1GLBG 3A5MC 3VEOA 3ULEA 4B1ZA 1GLDG 3FZMA 3KVGA 4BQLA 3VOVA 3WQUA 3SJHA 5JLFA 5BN8A 2E8AA 3AY9A 1KXPA 2NRHA 1P8ZA 2FSJA 2A42A 3SLCA 1SQKA 5KPZA 4KBOA 5E84A 1XC3A 3LDQA 1IJJA 3ZETB 3A8YA 4XEIA 3MCPA 3MN9A 3CETA 4WQ5A 2P9UB 4O5FA 2GEMA 3HSCA 4EFHA 4FWNA 3O5BA 1U2VB 4CD1A 5AQNA 4A2AA 2Q36A 4RCHA 3VEWA 3DWLA 3WQTA 3ENHA 1S3XA 1ZC6A 1BOTO 3U9DA 4M63C 4Z94A 2V7YA 3UB5A 5BRDA 4H03B 2A5XA 3B8AX 4YDUA 1HX1A 2D1KA 2A41A 4ISEA 3FZFA 4DQ8A 5CE3A 4FWLA 2DPNA 5AFUA 4JHDA 3HM8A 5F1XA 3VF4A 3QFPA 1JCEA 2D0PA 4XH1A 5FPEA 1T44A 3C0BA 1TUUA 3CI5A 4CZLA 2UYTA 2CGLA 3F9MA 3GL1A 5ELZA 3VEVA 1BA1A 1BWFO 4BRAA 3A5LC 1G99A 4H5RA 3HI0A 3MN6A 1GLEG 3WEEA 1K8KB 3O1WA 4O8KA 5AQYA 3H3NO 2P9PB 5AZJA 4K41A 1HUXA 2ASOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QMLA 5KK4A 3KK7A 1MYNA 4DR2K 2QWPA 2Q0UA 1RT7A 1X9MA 3CYGA 1BISA 4H4MA 3NVMA 1YIJN 4QOZB 2GUPA 3THYB 2OTLN 1KLMA 3EKUA 2RHKA 1KAZA 3AVCA 4BVPA 1K9MO 1HYZA 1WLJA 3QIPA 5HBMA 3ISNC 2YJEA 3D7EO 5J1EA 5KQ8A 1WNSA 1PE4A 3VN5A 3AVGA 3OS2A 2YI1A 1QTMA 5AJ3K 2HHVA 4GV6A 1NGAA 1ATNA 1NBWA 3I8DA 2HHQA 2GBZA 1K8AO 1L3VA 1Y64A 3AVNA 1JXEA 3EEQA 3OYAA 4KHUA 4FWQA 3ZSVA 5M1QA 5TKWA 3QFUA 3KLHA 4C8LA 3V1RA 4NXNK 3VQPA 2G2KA 3PO5A 4DUYK 4JLHA 2N2RA 4JAXA 5HRNA 4CFCA 3ZSWA 1S22A 4YNQA 3R6MA 1BG3A 5AQPA 3QEWA 3LM2A 1ZYVA 4W5NA 1W7AA 4DSLA 3K5LA 3SUPA 3KOXA 4BDZA 3CJCA 1S6QA 3CJAA 1KD1O 2P9LA 1XHZA 4CZEA 4H0OA 3K9KA 5M1OA 1HNXK 4CJPA 2AJQA 2E2FA 1VSDA 3K9JA 5FPNA 3K5MA 2YHBA 2E88A 1TYQA 4JI4K 3TSPA 1VQON 3O8MA 1VHXA 4CGHA 4BR2A 4WCEL 4AHUA 1J5EK 4KH4A 3T7ZA 4H0VB 3SQ0A 4LFBK 4DSFA 3AO2A 1WSHA 4OGCA 1QZ6A 3I0SA 4JN4A 5IT9O 4NYNA 1RTIA 4CESA 1CLQA 1F21A 1ZYWA 4CW7B 5CY4A 3TSUA 4KREA 4FLUA 5ADXH 2YNHA 1HJOA 3MDQA 3SZ2A 3RMBA 4H0TB 2NLXA 4AHVA 2PBDA 3C6UA 1OH8A 1JXCA 2RKIA 1GLFO 3CFRA 3R1XA 3UKUA 2LJ7A 4AHRA 5ADXA 1DTQA 2YBRC 2FXUA 3A5OC 3P38A 2D0BA 2VYPA 3O4NA 3AVHA 4IO8A 4AB0A 2WUSA 3OYGA 3HM9A 1LV5A 5F0XA 2P51A 2E20A 4H4OA 3RSEA 4LF5K 1ZXOA 4MDBA 1O1WA 3KOWA 1BDGA 4EHUA 1JLBA 2LY5A 3FFIA 1IKWA 4RG8A 2ZJQL 1JLAA 2IIRA 1LW0A 4OKJA 2GV9A 3S3OA 4JRQA 5BR8K 4A57A 2NRXA 1ZBSA 4IJAA 3EO3A 4Y1DA 3R9PA 2P9UA 4B08A 5JMVA 3ZX2A 1MWMA 3ULEB 1XMOK 4CEEA 1ZVEA 1HQUA 4CEFA 4FVUA 3MK6A 1S6PA 1B7DA 3NF8A 3VGKA 1DEJA 1LAVA 2Z1IA 3HVRA 1WN7A 2IGIA 3M1FA 1E4FT 1QS4A 3QLHA 1RGIA 1XC9A 5FDLA 5AQGA 5DM7L 2N66A 3VEYA 1BMRA 4EAHD 2G8VA 3L2UA 2YCHA 3OY9A 2YC1C 4FK4A 1IBLK 1C1CA 3C6HA 1DTTA 3P5JA 1IH7A 3IS9A 2IVPA 1SL2A 4I7FA 5EX5A 3E1YA 3QEPA 5DM6L 1LW2A 3H3OB 4O44A 4DF8A 4N5SA 1ITGA 1RT4A 3KTQA 4B3TK 1T1TA 5CR4A 2QK9A 1ESVA 1HKBA 4PL7A 2EWSA 4O8UA 3AVIA 4LH5A 3A2FA 3H08A 4LH4A 3AAPA 4C23A 1R59O 1K8KA 4OKEA 3CXCM 4X65K 2FLOA 2W40A 2ZWHA 4JHDB 3LALA 2X6NA 3ENOA 3D0PA 1GLJO 3MN7A 1FK9A 4FCYA 1L3UA 1HNZK 3QBXA 2FF6A 1YVNA 2XY7A 5E26A 1O13A 3FZHA 2Y1JA 2LY6A 4BRKA 1X9WA 1DKGD 4B1UB 4H0XB 5LY3A 2YNFA 2O8DA 3RMDA 2QWMA 4FJ8A 4IJNA 4F2RA 1P0AA 4GY2B 4TSXA 4JV5K 1S1XA 5GIPA 2G8WA 1ZVGA 1EP4A 4HHFA 1TV6A 4WYBA 3SMPA 4CEAA 2M8BB 4EP4A 2O4GA 3CJ9A 4CGIA 4CJ5A 4CCHA 2DFFA 1FH3A 5BPLA 1OMYA 4FYDA 3DYAA 1WSJA 1KCFA 4A61A 3ZSOA 4CZFA 2VWBA 2X78A 5KRSA 2ITGA 4KFBA 1DQ7A 1W9HA 4JD2B 2FSKA 3O6WA 3W3DA 5KPRA 3A0IX 5EOYA 4DFJA 3HPGA 4JI2K 3EL2A 4ZHRA 4AHTA 3OTOK 3T1AA 1Y97A 3OYEA 1U04A 4FPBA 4BDPA 3ID8A 4WQ4A 4CZHA 1VSHA 3IUCA 4OVLA 1U47A 4CHQA 3U8XA 3O80A 3WXKA 5J2QA 1VQLN 4CEOA 1NOYA 2A3ZA 4FW1A 1C0UA 2UU9K 2F8TA 1SN4A 1EQYA 4BR9A 3C7NA 4E72A 3QIOA 3LL3A 4FZXC 4IXCA 1TKDA 1BUPA 2P9SB 3KKSA 4FJXA 3TANA 1DJTA 3B6PA 3D2EA 2P9IB 3H46O 4IOXA 3KP0A 1C1BA 2KFNA 3D2FB 2QI2A 5M1NA 2F8SA 5C2FA 2UUCK 5AQMA 3VQ9A 1U45A 1ICAA 2AP1A 2QWRA 3AA3A 3DLGA 2RN2A 4XH5A 4DR6K 3QEXA 3FLCO 4BC3A 2BDPA 2IDOA 3VTHA 5JENA 5M1PA 1Q8IA 1N8RO 2W6KA 4AF1A 1LAWA 5AQVA 1RBTA 4CK3A 4B9TA 1RBRA 4FJ7A 1NMDA 4BG9A 4OO1J 3LDLA 5C24A 3HYFA 5AQXA 3HZ6A 1BCGA 4JKBA 3LPTA 4BR5A 2O8EB 5FPMA 2AA4A 3K0SA 4I6MB 3V9UA 2P9KA 2C1GA 3RWUA 3ZEUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3QML A;  5KK4 A;  3KK7 A;  1MYN A;  4DR2 K;  2QWP A;  2Q0U A;  1RT7 A;  1X9M A;  3CYG A;  1BIS A;  4H4M A;  3NVM A;  1YIJ N;  4QOZ B;  2GUP A;  3THY B;  2OTL N;  1KLM A;  3EKU A;  2RHK A;  1KAZ A;  3AVC A;  4BVP A;  1K9M O;  1HYZ A;  1WLJ A;  3QIP A;  5HBM A;  3ISN C;  2YJE A;  3D7E O;  5J1E A;  5KQ8 A;  1WNS A;  1PE4 A;  3VN5 A;  3AVG A;  3OS2 A;  2YI1 A;  1QTM A;  5AJ3 K;  2HHV A;  4GV6 A;  1NGA A;  1ATN A;  1NBW A;  3I8D A;  2HHQ A;  2GBZ A;  1K8A O;  1L3V A;  1Y64 A;  3AVN A;  1JXE A;  3EEQ A;  3OYA A;  4KHU A;  4FWQ A;  3ZSV A;  5M1Q A;  5TKW A;  3QFU A;  3KLH A;  4C8L A;  3V1R A;  4NXN K;  3VQP A;  2G2K A;  3PO5 A;  4DUY K;  4JLH A;  2N2R A;  4JAX A;  5HRN A;  4CFC A;  3ZSW A;  1S22 A;  4YNQ A;  3R6M A;  1BG3 A;  5AQP A;  3QEW A;  3LM2 A;  1ZYV A;  4W5N A;  1W7A A;  4DSL A;  3K5L A;  3SUP A;  3KOX A;  4BDZ A;  3CJC A;  1S6Q A;  3CJA A;  1KD1 O;  2P9L A;  1XHZ A;  4CZE A;  4H0O A;  3K9K A;  5M1O A;  1HNX K;  4CJP A;  2AJQ A;  2E2F A;  1VSD A;  3K9J A;  5FPN A;  3K5M A;  2YHB A;  2E88 A; 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