5FTG | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	378
structure length	353
Chain Sequence	DEQPEPRTRRRAYLWCKEFLPGAWRGLREDEFHISVIRGGLSNMLFQCSLPDTTATLGDEPRKVLLRLYGEAMVLESVMFAILAERSLGPKLYGIFPQGRLEQFIPSRRLDTEELSLPDISAEIAEKMATFHGMKMPFNKEPKWLFGTMEKYLKEVLRIKFTEESRIKKLHKLLSYNLPLELENLRSLLESTPSPVVFCHNDCQEGNILLLEGRENSEKQKLMLIDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWMYDYSYEKYPFFRANIRKYPTKKQQLHFISSYLPAFQNDFENLSTEEKSIIKEEMLLEVNRFALASHFLWGLWSIVQAKISSIEFGYMDYAQARFDAYFHQKRKLGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	Design, Synthesis, Crystallization and Biological Evaluation of New Symmetrical Biscationic Compounds as Selective Inhibitors of Human Choline Kinase Alpha1 (Chokalpha1) pubmed doi rcsb
molecule keywords	CHOLINE KINASE ALPHA
total genus	127
structure length	353
sequence length	378
ec nomenclature	ec 2.7.1.32: Choline kinase.
pdb deposition date	2016-01-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01633	Choline_kinase	Choline/ethanolamine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	5ftgA01
3.90.1200.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	5ftgA02

5DBXA 1Q3DA 3DPKA 1YDRE 4FKVA 5T68A 4KKEA 3V6SA 5CI6A 2C3KA 4PMSA 2CCHA 4MTAA 2ZM3A 5KMKA 4EZ7A 3AT4A 4O6EA 5DT3A 4CT2A 3OT8A 3QA8A 3AXWA 3SX9A 5FXQA 1SZMA 3NLBA 4BY9E 3T3VA 3L9NA 3QGYA 4KKHA 4DH8A 2ETRA 5IA5A 4FT5A 4ANSA 4H1JA 4FZ7A 2VNWA 1XHAA 1YKRA 1ZYDA 3HRBA 4NM3A 4ZZOA 4LRKA 1Q24A 2GCDA 2YM7A 2X39A 4U3ZA 2QOHA 1SVGA 3G0EA 5CSHA 2C5YA 3KXGA 2OGVA 4IWOA 4FKWA 3IDPA 5DYJA 4GL9A 2ZB0A 3OCGA 5HORA 5FTOA 3C4XA 1KUTA 3IQ7A 4QTAA 2ZV2A 2GHGA 3FMEA 1YHVA 1YRPA 1Q8YA 3R9OA 4W4WA 3ZFYA 2HAKA 3MB7A 5C26A 4FSUA 5IDPA 2XVDA 4FNYA 4NM5A 4OBOA 3QQUA 3LJ2A 3R9HA 3LM0A 3HECA 3NYOA 2PUIA 3DU8A 5L6PA 4FV4A 4E73A 3PP1A 3T9TA 2JDRA 3BU3A 5K4JA 5A4TA 4JT3A 5JK3A 4D5HA 1RJBA 2BZHB 3ETAA 3D2IA 5D1JA 3EFJA 3JVSA 3Q3BA 4I6QA 4I24A 4NM7A 4ACGA 2WU6A 2NPQA 3SXSA 3FMJA 3ZEPA 5C27A 4C4EA 3PG3A 4S34A 4KRDA 4HJOA 1H1RA 3NMUF 4L8MA 2YA9A 1WVYA 3R6XA 2PUNA 2X7FA 2XKFA 3BYMA 4C3RA 4BBEA 4YJUA 4JIKA 1O6KA 3CP9A 5HI2A 4FTLA 3UTOA 4EQCA 1VJYA 1KWPA 3FJQE 3TZ9A 3A99A 4QYYA 3FI8A 4FTJA 3W32A 3A62A 4MXYA 4M14A 2XBJA 1XH5A 2I1MA 3DBCA 3FBVA 4GUBA 2R3QA 2W7XA 1MRVA 3HAMA 3VJNA 5CU6A 1XR1A 2QO9A 5D7AA 5EKOA 4AZSA 3QZIA 3IGOA 3EH9A 4LG4A 3PXKA 3ZDIA 3W0QA 4C7TA 4O27B 3R8MA 4AOTA 4NFMA 4DINA 1NVRA 4GMYA 4I5CA 4M97A 2JFMA 3FL4A 5ETAA 1CKIA 2BZJA 4LUEA 3LFAA 3KXXA 3MTFA 3CY2A 3ZXZA 3KULB 1QPJA 1Y57A 3KKVA 4M0ZA 5ETFA 5CF8A 3NUNA 5FTQA 4FV0A 4TXCA 1H0WA 2ITZA 3KC3A 2XNBA 3HMPA 4OBQA 4L01A 2E9VA 4OT6A 4NTTA 3A2CA 2OJIA 4KRCA 2JBPA 2ITXA 3Q4CA 4DG0E 3V5PA 3VS7A 4YJRA 5EM8A 4ASDA 1LR4A 5CAOA 4PDPA 2Z7LA 2HOGA 3HNGA 4U6RA 4F9CA 3BBTB 4MXZA 1OITA 4FNZA 4GU9A 2YCSA 5KMJA 4RQKA 4BTJA 2PVNA 1Q41A 4Y5QA 2B9IA 3PY3A 2OZOA 5IG1A 5GNKA 3FQEA 2OIBA 5LVOA 1OKVA 5IH6A 1UNGA 2XEZA 4FKGA 3NW7A 4H58A 4KIQA 2HXLA 5I9XA 3M42A 4FEWA 3ATSA 2WMVA 4F64A 2Q83A 3UGCA 2YCRA 2GNIA 3PZEA 3A4OX 4FTMA 1VR2A 4EOOA 3RAIA 3C7QA 5BVOA 5JRQA 5A6NA 2ITOA 2H6DA 3D9VA 2AUHA 3FMKA 1CM8A 3O50A 4L9IA 4UXQA 2X8EA 1B38A 3F2NA 2W05A 3GU7A 4PDOA 1ZMWA 4C35A 1KE6A 2R3HA 1VZOA 3S4QA 1SVHA 2XB7A 4YSMA 4ZMEA 5EH0A 4JDKA 1BKXA 1Q8UA 1Q62A 2OH0E 2QR8A 2QVSE 3VC4A 4MK0A 1DAWA 3K5VA 3SDJA 5FQDC 3VNTA 4ITHA 3EYGA 2DUVA 1SYKA 2Z7SA 2OJGA 4IH8A 1UKHA 1UA2A 4FIEA 3WIGA 4U8ZA 2J0MB 3QWKA 2BTRA 3MY5A 4WG5A 3B8RA 4ZSLA 4CNHA 5AA8A 5CEKA 3MH0A 1T45A 3VW6A 3WF8A 3C5UA 1T46A 2BTSA 3ODZX 4FTRA 4ZTLA 2IZUA 2WMSA 1P5EA 4NKSA 4HVGA 1IA8A 3GC8A 3P86A 4QMPA 2ZM4A 4QMYA 4ZAUA 4CGAA 2X6EA 3OY3A 4ZSJA 4BIBA 4ENXA 3OEFX 5AX9A 1SMHA 3CSVA 4F4PA 3HKOA 2WELA 5EQEA 1FPUA 5AUVA 4NZWB 3SG8A 1E1VA 5CLPA 2UZVA 4DH7A 2JDVA 3GU4A 3C9WA 4MXCA 5B0XA 4EUTA 1SNXA 2VWWA 4M84A 4C61A 3G6HA 1E1XA 2C1BA 3T3UA 5M53A 5HE3A 4LUDA 4ZTSA 3COKA 2CHLA 4CKJA 3UQCA 2I0VA 3EQPA 4GCJA 5FLFA 2C5XA 3RK9A 1ATPE 2X8DA 3E8DA 2B53A 1VYZA 3UNZA 1ND4A 4G3GA 1IASA 1RQQA 2IPXA 4QMQA 4ZY4A 1U54A 2W0JA 1YQJA 3GT8A 4HGSA 3QD2B 4IAKA 4GSBA 5DG5A 5FXRA 1XH4A 4I0SA 2OBJA 2J0IA 4V0GB 3MIAA 4U40A 4XJ0A 4PX6A 3Q04A 1REKA 3U8WA 3LCOA 5CEMA 4DN5A 4UZHA 4K9YA 4HCTA 3W2OA 5L2TA 2F2UA 3L8SA 4U43A 4M67A 2WB8A 3FHRA 4AGUA 1F5QA 5FRIA 2BKZA 3U9CA 3A60A 3G9LX 4CD0A 4XEYA 2WMWA 4GIHA 3WZEA 3SA0A 4WNMA 4YZCA 2YIRA 5BVDA 4FMQA 3H0ZA 4QMVA 2C3JA 4F1TA 2F7EE 4L67A 4S2ZA 4I5HA 1IRKA 3R1QA 2O3PA 1G3NA 2KULA 2WTDA 3ID6C 3MPMA 4FIFA 4M12A 3EFWA 5E8ZA 5BNJA 5JZJA 4LV8A 2O2UA 3ALNA 2Z7QA 2YIWA 3MH2A 4IVDA 2XH5A 3QKLA 3O2MA 3P08A 4FZAB 4Q5EA 4TN6A 3HUCA 1ZZ2A 5FEDA 2ZVAA 4EH6A 3C51A 4PTEA 2R3NA 3V5LA 3IW5A 2C6MA 3QGWA 1U59A 5LVPA 3SC1A 2WU7A 4ASZA 4YGAA 4HNIA 3V04A 3FLZA 2OZAB 3ZUTA 4FV5A 4EC8A 2OLCA 1W7HA 1WBOA 3KRXA 4QTDA 4BDIA 3NUAA 1I09A 1H24A 3ZC5A 3D7TA 2BHHA 2C0OA 4O7PA 2PVJA 3MFTA 4O86A 3VHEA 2ONLA 3QAME 4LQMA 3FPQA 4CFNA 4PQNA 5FP6A 4E4LA 3RINA 4L45A 3B2WA 2HY0A 1H00A 3OWLA 4NIFB 4ZSGA 4PDYA 3MS9A 5CSPA 2GNHA 3LKMA 5G6VA 4A07A 4AF3A 1S9JA 3PWDA 2VRXA 4ACHA 1WAKA 4ALVA 2BIKB 3CXWA 3PFQA 3SV0A 3I6WA 4DFBA 1K2PA 4P5ZA 2Z8CA 5M44A 4ASXA 2UV2A 2VTTA 1GZNA 3PSBA 4DCAA 2W99B 2C0TA 3LLAA 3KVXA 3UBDA 2ZOQA 3OWPA 4A7CA 4DEGA 4EYJA 1PMEA 2W96B 4BHZA 1NVSA 3FKLA 3MGYA 2P55A 3P0MA 3AGMA 1PKGA 3LPBA 3LIJA 1JQHA 4I5MA 5AUZA 4AOJA 4YPDA 2IWIA 4V05A 2WQOA 2QODA 1OB3A 2W1HA 1YDTE 1M52A 1Z9XA 2JIUA 2QONA 2W1FA 3LJ1A 4GVJA 5EW8A 4F08A 2P33A 5IQFA 3H4JA 4F9BA 1UU8A 5IA0A 3AQVA 4KNBA 3ZBXA 3UVPA 5E1EA 4YZMA 3SRVA 3GU6A 3KN6A 4AGWA 2WNTA 1W84A 1Q61A 2O8YA 3FZPA 3UYSA 3VWAA 4ZSEA 4CEGA 3O7LB 3NR9A 1GAGA 3Q53A 4JAJA 4I94A 4K6ZA 2YCQA 1H0VA 5M4FA 2XK3A 4YZNA 1W83A 3G51A 4EQMA 5C8NA 4HVSA 5GIOE 2FGIA 4DITA 5CSXA 4FV9A 3PZHA 4QMMA 4EK8A 5F94A 2VTPA 4ZTNA 4HPUE 5A4LA 2XM8A 3TDVA 4ZTMA 4G3DA 3NRMA 5EM5A 4RBLA 2C47A 1YHSA 3IS5A 4O96A 2F49A 2WMUA 3R04A 4L46A 4NJDA 1H1QA 3OW4A 3O71A 4JOAA 1O6LA 2YERA 1LUFA 2JC6A 3COIA 3PUPA 4JVGA 4MVFA 3NUXA 3RHKA 4EOJA 4RVTA 3JR1A 4IWDA 2G2HA 4YPSA 5HEZA 3SRVB 4BCMA 5C03A 2UW4A 5FBOA 4FVQA 5TKDA 4MNEA 1LEZA 2C3IB 4BTKA 3F7ZA 3CD3A 4HZRA 4PTCA 4Y73A 5CENA 4DFUA 2HENA 2PVFA 4ANMA 2DS1A 4QTBA 4Z7GA 5CANA 3NWWA 3R02A 4FEQA 4YUQA 5ANDA 5AADA 4BYIA 1KE5A 3MI9A 5EI6A 4RJ8A 4ANLA 4R3RA 4M13A 5IU2A 2RFSA 5DPVA 4MXOA 2J0LA 4JQEA 3AC2A 3BHTA 3D5UA 2B4SB 3BLQA 1L3RE 3AGLA 4U97A 3ORMA 3EQRA 4FKIA 3R8VA 3LFBA 4LGHA 5HE0A 2ITTA 3RAKA 3R01A 2E2BA 4MNEB 1IA9A 5CU4A 4RPVA 4LRMA 1YDSE 3NNVA 4TKSA 3PVGA 5KZIA 3E3PA 2OIQA 3HYHA 3QLFA 4BI2A 5EG3A 3W33A 3NUYA 2CLXA 3R7VA 4X3FB 4QP7A 5E1SA 3IO7A 3D5VA 4FG7A 4G6OA 1JAMA 3KQ7A 3U9NA 4KINA 4F1MA 4IAIA 1UWJA 5DLSA 2EXMA 2X1NA 5FGKA 2V5QA 3FZOA 4I22A 1R39A 2RFDA 4CFWA 4BRXA 3LFSA 3ZLWA 4U9AA 5DIAA 5IEVA 4O0RA 4IWPA 4QMNA 2XCKA 1MP8A 3G15A 3O8UA 3H3CA 5CU3A 3TTJA 4D4VA 4YNOA 5GJGA 3A8WA 2WXVA 4U94A 3GQIA 4EHZA 2R2PA 4Z55A 1K3AA 4RA4A 3R71A 4D5KA 3FV8A 2HWPA 3R30A 5IMEA 2I6LA 5EYDA 5HNGA 3AC8A 3PA4A 5LVNA 3ODYX 2RL5A 1LP4A 5TF9A 1M7QA 3TV7A 3MY1A 4CFUA 4E4XA 1IR3A 1NT2A 2CLQA 2R9SA 5CVGA 3VRYA 4EBVA 4FKSA 4FEXA 2JDTA 4I6FA 1JPAA 2YZLA 3WF9A 2YAAA 3M11A 3RJCA 2JFLA 3HGKA 3UMWA 3MYGA 1ZMVA 2XK7A 3BKBA 3MFSA 4HGEA 3TL8A 2YACA 4F0GA 4G3EA 2VWXA 5AUUA 3MVHA 1IEPA 5FD2A 4GFOA 3LOKA 3R73A 5JFSA 4PWNA 5GHVA 4IE9A 4TYJA 3QD0A 4FSNA 4RZVA 4TT7A 4RJ7A 4X3FC 1HCLA 3NNXA 3D94A 4FT3A 3R83A 4FOCA 3WARA 4CMTA 5L8KA 4DH5A 2Y0AA 2WEIA 3P9JA 5AM6A 1OPKA 1ZY5A 1GIHA 3HA8A 1A48A 2R3OA 2Y4IC 2CKEA 5J7HA 3LQ3A 2Y8OA 4FKTA 2RG5A 4RWIA 4UBAA 4E4NA 1KE8A 2AC3A 4C4HA 3P7AA 3EZVA 4BCIA 2H8HA 1AGWA 1RE8A 3KRWA 3LZBA 4JR7A 4ZLOA 2WTWA 2XIXA 4GH2A 2GU8A 2XIZA 2P2IA 1XQZA 4N0SA 4ANBA 3LMHA 2Q0NA 3D2KA 1OUYA 3WBLA 5JZNA 3DZOA 3MIYA 4JG6A 3UP7A 4BGQA 3ACKA 4GYIA 1OVEA 1UNHA 3JUHA 4XCUA 2RKUA 4KWPA 3VHKA 3DLZA 2IZRA 2PVHA 3IDCA 4WA9A 4O7WA 5LOHA 2YM6A 5H9BA 2HZIA 3QTIA 4E93A 2UW0A 3IOKA 5CEOA 5EHOA 4CTCA 2ETMA 4FKLA 3HV6A 4FICA 3TNIA 2B1PA 4WT6A 3CTHA 2QI8A 3LLTA 3H9OA 4YR8A 3E8EA 4KB8A 4RVMA 3QYZA 1BL6A 2QR7A 1BMKA 3FMDA 1H26A 3W0SA 4FSQA 3TI1A 3DBQA 4G3FA 4MHAA 4LMNA 5ETIA 4HOKA 4FTOA 3W2RA 4OTHA 5H8GA 2XRUA 4IC8A 3V5WA 4ERWA 3QFVA 4YBJA 4YJPA 2Z7RA 3W16A 2UZBA 1GZ8A 3QA0A 4C4FA 5LMKC 1WBSA 5D41A 3BRBA 2XP2A 1FBNA 1STCE 2C6IA 2UW3A 2YCFA 4FIJA 5CAPA 5HIDA 3RPSA 3ZEWA 4FL2A 4JX7A 5F4NA 3PPKA 5F9EA 4QPAA 3H0YA 2Y7JA 3ORPA 4HYSA 4JDIA 1OL2A 4XOYA 3DT1A 3Q4UA 1YOLA 3UZRA 3KY2A 2CMWA 2E9UA 2UZWE 3QRKA 4NL0A 3FYJX 3WZKA 4D2RA 2C5VA 4KA3A 3VF9A 5M08A 3OD6X 4FKQA 4O22A 3VS5A 4YMJA 1V0BA 3ORNA 4FSMA 2W5BA 3LFFA 3QKKA 3PIYA 3R28A 4R3PA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4ASE A;  3OTV A;  5HLN A;  4Q5H A;  4U0I A;  4Y8D A;  2XK6 A;  1KOB A;  4Z9L A;  5E92 A;  5KO1 A;  3BU5 A;  4PP7 A;  5LCK A;  3ZO1 A;  4LV5 A;  2Z02 A;  3K3J A;  4EJN A;  3EQI A;  3ZSH A;  4KKG A;  4QP1 A;  3UC3 A;  2PZ5 A;  3WOW A;  4C0T A;  3TZ8 A;  1GJO A;  5KKR B;  3BHV A;  4K33 A;  5KNJ A;  3DTW A;  2JKK A;  5DHJ A;  5EHL A;  5AUX A;  2GS6 A;  5E9E A;  3VS2 A;  5IUH A;  3UZP A;  3ZDU A;  3MVL A;  4QYH A;  3BYO A;  3ZHP C;  5AP5 A;  4EHE A;  3DY7 A;  3VUD A;  3LFC A;  3PIX A;  2F7X E;  2GS7 A;  3VO3 A;  4P5Q A;  3OCB A;  4B7T A;  2QUR A;  5HD7 A;  4AT5 A;  4E1Z A;  2ZMD A;  4IM3 A;  5CF5 A;  5H8E A;  4QQ5 A;  3MVM A;  4E6Q A;  4XG8 A;  3U4W A;  4YTC A;  1BL7 A;  1RDQ E;  4L68 A;  1XH9 A;  3NCG A;  4M3Q A;  4ACC A;  4YTH A;  4IAZ A;  3EMG A;  3BQR A;  4D9U A;  2IW6 A;  2YIY A;  4I6H A;  5HE1 A;  4UYA A;  3RTP A;  3EKK A;  4O0V A;  3QRJ A;  1M7N A;  3BYV A;  3BEG A;  4FNW A;  3QZG A;  3MWU A;  3RI1 A;  4H05 A;  4G6L A;  4FE2 A;  4MXX A;  4YU2 A;  4U41 A;  3TNW A;  4DFN A;  4TPT A;  3NYX A; 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 2J4Z A;  3O8T A;  2DYL A;  2ITW A;  2REI A;  3P4K A;  4A4X A;  3BGZ A;  2UVX A;  2EVA A;  3F3W A;  3FAA A;  3GOP A;  5DT4 A;  3S95 A;  3W0M A;  4D58 A;  3EKN A;  4YSJ A;  1XH7 A;  5FEE A;  3VBX A;  1OZ1 A;  4Y5H A;  1URW A;  3MA3 A;  3FZS A;  4O84 A;  3JPV A;  4MQ1 A;  4X2K A;  5K9I A;  1E9H A;  2FB8 A;  2WZJ A;  4BCN A;  2VTI A;  5HIE A;  1U4D A;  1PMN A;  4ENY A;  5IQA A;  1UU9 A;  3LCK A;  4BDE A;  3CLY A;  5DR6 A;  2BFY A;  3HZT A;  4X2G A;  5E8S A;  5ACB C;  2IVU A;  3PJ3 A;  5FG8 A;  4RX7 A;  3DKO A;  2GQS A;  4GU6 A;  4JBQ A;  3I4B A;  3QQF A;  3PSC A;  1JNK A;  1Y8Y A;  2EU9 A;  2P4I A;  2KTY A;  2YM5 A;  5EDR A;  2R64 A;  4IW0 A;  4RVK A;  4TY1 A;  5E8T A;  4JDH A;  5IIS A;  1J3H A;  2OFU A;  4N6Y A;  3MSS A;  4BDC A;  4QYE A;  5KZ0 A;  4BIC A;  4ZS0 A;  5HIC A;  2BFX A;  3FWQ A;  1W8C A;  1PRY A;  2QOK A;  5HE2 A;  2C5N A;  3POO A;  2JIT A;  4DED A;  5M57 A;  4FV2 A;  1IAH A;  4ZP5 A;  4LRJ A;  5IMX A;  3IOP A;  3MDY A;  2V62 A;  4AOI A;  4PNI A;  4AE6 A;  2VV9 A;  4IB3 A;  3N9X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5FTGA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations