The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
DETGKFLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7F, K60F
rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| total genus |
13
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KXC A; 4D8D A; 2MIO A; 2EYX A; 2F2X A; 2G6F X; 2L2P A; 1UHF A; 1I1J A; 2AZS A; 1TUD A; 2DF6 A; 3I35 A; 2NUZ A; 2PNI A; 2RQT A; 4CC4 B; 1PHT A; 1FMK A; 2EKH A; 2EGA A; 2CUD A; 1M30 A; 4E6R A; 2DVJ A; 3VS6 A; 2A36 A; 1NG2 A; 4J9G A; 3GBQ A; 1QLY A; 2YUO A; 1T3S A; 1UJY A; 4Y92 A; 1UDL A; 3PVQ A; 1HSQ A; 1WXT A; 2AK5 A; 1Y0M A; 1OOT A; 2PZ1 A; 4QT7 A; 2JS2 A; 4RTX A; 4WCI A; 2FEI A; 1SPK A; 4LUE A; 4R0K A; 4D8K A; 2D8H A; 2EYZ A; 2EPD A; 1UTI A; 2HEQ A; 2OAW A; 2YDL A; 2DBM A; 3REB B; 2KYM A; 2JTE A; 3NGP A; 1VYU A; 2KGT A; 1UUE A; 1VYV A; 2KRM A; 2BZX A; 2VWF A; 2RQW A; 3RBB B; 1K0S A; 3VS5 A; 2NWM A; 4EIK A; 1SRM A; 3A98 A; 4F14 A; 1VYT A; 1I0C A; 2CSQ A; 3VRZ A; 2DX1 A; 3EG3 A; 1K76 A; 2J6O A; 1W6X A; 2RQV A; 5L23 A; 3H0H A; 1PRM C; 4OMQ A; 3VS1 A; 4JPB W; 4HCK A; 1ZUY A; 1KJW A; 2BZ8 A; 5IXF A; 1W70 A; 1NEG A; 1KSW A; 1NM7 A; 1E7O A; 2LNH B; 2C0O A; 1SEM A; 2D0N A; 1WDX A; 4RTZ A; 2A28 A; 2DL5 A; 3TVT A; 1M3C A; 1PNJ A; 2O31 A; 1T0H A; 3REA B; 2EVR A; 1BBZ A; 1OPL A; 1WXU A; 4OMN A; 5GJV B; 2D8J A; 1JQQ A; 1B3Q A; 4RTT A; 2CT4 A; 2RNA A; 3UA6 A; 2DRK A; 1BK2 A; 2FPF A; 5IHK A; 1M3A A; 2YUP A; 3THK A; 1K0X A; 2KT1 A; 1J3T A; 2K79 A; 2EYW A; 2SRC A; 4F17 A; 1GL5 A; 1H3H A; 3VS0 A; 1QWE A; 4J9H A; 3VRY A; 1Z9Z A; 2JMA A; 1UG1 A; 1MV0 B; 4IIO A; 2LMJ A; 1PKT A; 2KRO A; 1OPK A; 2ENM A; 1RLQ C; 1ZSG A; 3O5Z A; 3EG0 A; 1IO6 A; 4OML A; 5I11 A; 2MCN A; 1PKS A; 2ED1 A; 2EQI A; 2RN8 A; 1LCK A; 4JJD A; 3UF4 A; 4FSS A; 4IIM A; 4HVW A; 2LZ6 B; 3CQT A; 2LQN A; 1GBQ A; 4J9F A; 5ECA A; 2FRW A; 1ZUK A; 5FWB A; 2DL3 A; 3VS3 A; 4Z88 A; 5IH2 A; 3NMZ C; 1X69 A; 5HCK A; 1ZBJ A; 2GGR A; 4AFU C; 1QWF A; 1W1F A; 2JM9 A; 2EGE A; 1Z9Q A; 2AKK A; 1T0J A; 2XMF A; 3EHQ A; 3QWY A; 1AZE A; 2O2O A; 1ZUU A; 2KE9 A; 5FW9 A; 2K3B A; 5IHI A; 2K7A A; 4J9C A; 1T3L A; 1TUC A; 4HXJ A; 2AKL A; 2RMO A; 3M0U A; 1XOV A; 4DEY A; 4LNP A; 1ABQ A; 1UGV A; 2RQR A; 3EG2 A; 4ZNX A; 1S1N A; 1AWJ A; 2JMC A; 2DM1 A; 4A63 B; 2BTT A; 2YUN A; 2DYB A; 4M4Z A; 2W0Z A; 1UEC A; 2HSP A; 4OMM A; 1H92 A; 2DMO A; 2LX7 A; 2GTO A; 2RQU A; 2JM8 A; 3UA7 A; 1WX6 A; 1WLP B; 1GBR A; 2PTK A; 2CUB A; 2W10 A; 1VA7 A; 1HD3 A; 2M0Y A; 2BZY A; 3PE0 A; 2E5K A; 5I22 A; 1PWT A; 2ROT A; 2C0I A; 1X2Q A; 1KIK A; 2LJ0 A; 3M0S A; 2YT6 A; 1SRL A; 1QCF A; 2LQW A; 3M0Q A; 3H41 A; 2KT8 A; 1RLP C; 1ABO A; 1QKX A; 1WA7 A; 2FRY A; 1K1Z A; 2O9V A; 2JS0 A; 1SSH A; 2A08 A; 1CKA A; 3LH5 A; 4Z8A A; 2J7I A; 2JT4 A; 2LJ3 A; 2FG0 A; 1RI9 A; 1TG0 A; 2DRM A; 2CH4 A; 1MV3 A; 2D1X A; 2DJQ A; 2K2M A; 3R6N A; 1M8M A; 3EG1 A; 4RTV A; 2CT3 A; 2OJ2 A; 2YSQ A; 3KFV A; 1A0N B; 2KBT A; 4JJB A; 3ZL7 C; 1ZX6 A; 1B07 A; 4J9I A; 3VS4 A; 1UFF A; 2JW4 A; 2GQI A; 3UAT A; 2KRN A; 1N5Z A; 3I5S A; 2RF0 A; 3IQL A; 1X6B A; 1YP5 A; 2KR3 A; 1SHF A; 1AWW A; 1K9A A; 1HJD A; 2ESW A; 3TSZ A; 4LE9 A; 3NPF A; 4KRT A; 5EC7 A; 1Y57 A; 1EFN A; 4RTU A; 4LUD A; 2K6D A; 1JU5 C; 2X3X D; 1CSK A; 1YCS B; 1M27 C; 2QDL A; 3TSW A; 1JXO A; 5IXB A; 2J6F A; 1YN8 A; 2K9G A; 1UHC A; 1AVZ C; 2F2W A; 3SEM A; 4Z89 A; 4LN2 A; 2GBQ A; 3JV3 A; 1X43 A; 4J9D A; 2FPE A; 2V1Q A; 3C0C A; 2O88 A; 3M0P A; 3RNJ A; 1X6G A; 2L3Q A; 4RUG A; 2LJ1 A; 1JXM A; 4AG2 C; 1K4U S; 2KXD A; 2JXB A; 1ZLM A; 2VKN A; 3QWX X; 2L3S A; 3VS7 A; 2X3W D; 2EGC A; 1X27 A; 2J6K A; 3PVL A; 4ORZ A; 2HDA A; 1QKW A; 1NYF A; 1OV3 A; 1AD5 A; 1AEY A; 4JZ3 A; 2B86 A; 2O9S A; 4ESR A; 1G2B A; 2I0N A; 2H8H A; 5IHN A; 2A37 A; 1UE9 A; 1WXB A; 3EHR A; 2ABL A; 2F2V A; 1GCP A; 1GFD A; 1AWX A; 1V1C A; 1AZG B; 4AG1 C; 4AFZ C; 2ROL A; 2DLP A; 1OEB A; 3H0F A; 1NLO C; 2SEM A; 4F16 A; 1U3O A; 2OI3 A; 1YNZ A; 1MUZ A; 2ECZ A; 2DE0 X; 2KEA A; 4RTY A; 3NHN A; 2IIM A; 1U5S A; 5FWC A; 4J9E A; 1RUW A; 4DEX A; 2FPD A; 2M51 A; 2EBP A; 2RPN A; 4AFQ C; 3H0I A; 3U23 A; 4K11 A; 2DNU A; 2EYY A; 1BU1 A; 4JJC A; 2FO0 A; 1SHG A; 1AOJ A; 3I9Q A; 1JO8 A; 1WIE A; 2HCK A; 2KRS A; 3I5R A; 4GLM A; 2DL7 A; 2CSI A; 1PRL C; 2DL4 A; 1YWP A; 1E6G A; 2KNB B; 2J05 A; 4RTW A; 3M0T A; 4CC7 A; 3VS2 A; 2EW3 A; 2MOX A; 4JZ4 A; 2CDT A; 2L0A A; 1U06 A; 2J06 A; 4HVU A; 5GJW B; 2HBW A; 4GBQ A; 3M0R A; 2V1R A; 1I07 A; 1X2K A; 3SHW A; 1NYG A; 1ARK A; 2L3P A; 1NLP C; 2C0T A; 1WI7 A; 4CC3 A; 1UJ0 A; 2P4R A; 1FYN A; 1KFZ A; 2CH4 W; 2YUQ A; 2GNC A; 4X1V A; 2LP5 A; 1G83 A; 1H8K A; 2VVK A; 1M3B A; 2ED0 A; 2LCS A; 2DL8 A; 2DBK A; 4AFS C; 4CC2 A; 1BB9 A; 1GCQ C; 2AZV A; 1WYX A; 3ULR B; 2DA9 A; 1AWO A; 1GRI A; 1WFW A; 4HVV A; 1YWO A; 2KYB A; 4OMO A; 2CRE A; 4J9B A; 1E6H A; 1GFC A; 2DIL A; 2GTJ A; 1NEB A; 3FJ5 A; 4OMP A; 1GCQ A; 1JEG A; 1CKB A; 3EGU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4D8D A; 3PNW C; 5KE2 A; 3R6O A; 4M7A D; 3JCM V; 2AZS A; 1I1J A; 4B9W A; 1TUD A; 1IGQ A; 3I35 A; 2PNI A; 4DBR A; 2JNG A; 4QVC A; 1D09 B; 3S6W A; 2EKH A; 4LDW A; 5KYU B; 1C0M A; 2O4X A; 2E4H A; 2CUD A; 2H3J A; 4E6R A; 2A36 A; 3EFR A; 3GBQ A; 2YUO A; 1T3S A; 2M02 A; 1UJY A; 4FIB A; 1UDL A; 1HSQ A; 2R58 A; 3X26 B; 2AK5 A; 1VQ8 A; 1Y0M A; 2X4X A; 2PZ1 A; 1PC0 A; 4WCI A; 4C8Q C; 2FEI A; 1SPK A; 4R0K A; 1OYX A; 1UTI A; 3CC7 A; 2HEQ A; 1VQL T; 3REB B; 2KYM A; 5GAN e; 4KH1 B; 1VYU A; 4M77 F; 3I56 T; 3CCL A; 1N27 A; 1BYM A; 2KRM A; 2VWF A; 5GAN h; 3FRN A; 4F7U F; 3LYI A; 4FW2 A; 4O5V A; 4E2F B; 3H8Z A; 3G6E Q; 5KYU A; 4EIK A; 4DA4 A; 4QQ6 A; 4CI0 C; 3A98 A; 4F14 A; 4AMC A; 2VXF A; 3VRZ A; 3EG3 A; 3VYG A; 3OYM A; 1W6X A; 2AHJ B; 1VQK A; 1BIA A; 2QQR A; 5FRN A; 4M78 C; 1ZUY A; 1KJW A; 2BZ8 A; 4XQ3 A; 5CVI A; 2DER A; 3JCM f; 2X35 A; 1E7O A; 2LNH B; 2C0O A; 4RTZ A; 1YIJ A; 3CCS T; 4HT9 A; 4JRQ A; 2OTL Q; 1WHJ A; 3HHT B; 4M7A C; 1WQW A; 3JAM E; 2OAU A; 2JJ9 A; 2D8J A; 4C0F A; 2RNA A; 3HRT A; 1YCY A; 1QMC A; 2YUP A; 2RB6 A; 4C8Q F; 3RKW A; 3THK A; 2FZG B; 1YJ9 T; 2K79 A; 2EYW A; 3S3O A; 1YIT Q; 1VIE A; 2SRC A; 4KUD K; 3CCJ T; 2K5I A; 1YBY A; 1QWE A; 2P0P A; 1VQ7 Q; 4M7D G; 2JMA A; 1UG1 A; 1MV0 B; 1PSF A; 4IIO A; 4BDZ A; 2LMJ A; 1EIF A; 1X75 C; 3CC2 T; 4OB1 B; 1OPK A; 1TUG B; 1Y7X A; 2ENM A; 3TQ7 P; 1RLQ C; 1ZSG A; 2XDP A; 4PLL A; 1Q82 C; 2K5F A; 5GAN 6; 4OGE A; 1M9S A; 1IHV A; 2MWO A; 2YWW A; 2COY A; 3QDF A; 3QYG B; 3UF4 A; 2RM4 A; 2QA4 A; 4EMH A; 3RKY A; 2LQN A; 5ECA A; 4XK8 E; 1OQK A; 5FWB A; 2RI3 A; 5GAM e; 3QXE B; 3WXM B; 3OYN A; 4PJM A; 5FRM A; 5IH2 A; 1MND A; 1IZ6 A; 5KH6 A; 3PFS A; 1M90 U; 1W1F A; 1G3Y A; 5IT9 E; 2AKK A; 3QWY A; 2O2O A; 4ZN1 A; 2KE9 A; 3BE3 A; 1I5L A; 5IHI A; 2K7A A; 4FM4 B; 4ZGD B; 4A4E A; 3ZEH A; 3V8K A; 4LNP A; 4JS4 A; 4ZTF A; 1OZ3 A; 2RQR A; 3EG2 A; 1P92 A; 1AWJ A; 1YHQ T; 8ATC B; 3INZ A; 2YUN A; 5CQX A; 2E64 A; 5CAI A; 1H92 A; 1PG5 B; 2GTO A; 3UA7 A; 2C06 A; 2W10 A; 1HD3 A; 3PE0 A; 4A54 A; 3M9Q A; 2ROT A; 5GMK i; 1X2Q A; 1N9R A; 1QCF A; 1MNE A; 3M0Q A; 1ZSZ B; 2LQW A; 2KT8 A; 1VQ8 T; 1ABO A; 3SD4 A; 1FMW A; 2EQJ A; 4J6W A; 2VV5 A; 3D7S B; 5AYF A; 2LJ3 A; 4MDX A; 2FG0 A; 3CC7 T; 1IXD A; 1M1K C; 4PJJ A; 4R55 A; 1OU8 A; 3NTH A; 1WHG A; 2D1X A; 3OBY A; 5GAO q; 2K2M A; 3SWN B; 3OYB A; 4IUU A; 1K9M C; 1YIT A; 5J3B A; 4MDW A; 1RAC B; 1VQ7 A; 3HL8 A; 2XDB A; 1JBM A; 2M16 A; 2KR3 A; 1MHN A; 3CCE Q; 2HBP A; 1K9A A; 2QTX A; 4LE9 A; 1UEB A; 2HQE A; 1VQK T; 1Y57 A; 3PMT A; 4J6X A; 1BCM A; 3L2U A; 3V7S A; 1ZSZ A; 4FT4 A; 3M54 A; 1VQO T; 3MET A; 2F2W A; 1YIJ T; 1X43 A; 4XTZ A; 3C0C A; 1S72 Q; 2DK3 A; 4PJO B; 3SWN A; 1K73 C; 1WHK A; 1EX4 A; 2JXB A; 3EGD B; 3JCM J; 2EGC A; 3EH2 A; 4QQD A; 2J6K A; 3VUB A; 3JCM b; 3GNF B; 4X9C A; 1AD5 A; 4JZ3 A; 4ESR A; 2HAX A; 3JCM Q; 2H8H A; 1WXB A; 2ABL A; 1V29 B; 3LGL A; 3JB9 H; 5CKB A; 4AG1 C; 3OA6 A; 1KK7 A; 3CXC S; 3H0F A; 1NLO C; 2V26 A; 1MUZ A; 5CO7 A; 3GF5 A; 4PJO A; 1UGP B; 1C6V X; 3NFC A; 2XDD A; 5I21 A; 3MEA A; 3EGD A; 1RUW A; 2PQW A; 3JB9 J; 4DEX A; 2EQM A; 2FPD A; 2RPN A; 1LPL A; 1PSE A; 1QW1 A; 2DNU A; 4BAC A; 1SHG A; 3A1P A; 4Y28 E; 1JO8 A; 3QG1 A; 3I5R A; 2DL7 A; 1YWP A; 1LOJ A; 1NPR A; 1BI3 A; 1PM3 A; 2G3R A; 4RTW A; 1KD1 R; 5GAN f; 3G6E T; 4NOY A; 4BUG A; 2YRC A; 1YI2 Q; 2DTH A; 1TTH B; 3PT9 A; 5HK0 A; 3MEU A; 1XNI A; 3RR6 A; 2J06 A; 3M0R A; 1AT1 B; 2V1R A; 5KYN A; 3CCQ Q; 2V8I A; 5LJ3 e; 1BKB A; 4M75 G; 1WI7 A; 1TOV A; 2HZY A; 5LJ3 h; 3C12 A; 2YUQ A; 5M9O A; 2GNC A; 4E7I A; 2OTL T; 1G83 A; 1H8K A; 1S72 A; 2ED0 A; 2LCS A; 1M8V A; 5GAM d; 2CKK A; 4EDU A; 2AZV A; 3ULR B; 5HY6 A; 3GOX A; 2ZPE B; 1BI2 A; 1WFW A; 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1Y07 A; 2E6N A; 1M3C A; 3FJP A; 4X9D A; 2O31 A; 5DLO A; 4BY6 B; 2EVR A; 2JTF A; 1OPL A; 2LCC A; 1JQQ A; 2P0Q A; 4JRK A; 1M4Z A; 4F04 B; 2OX7 A; 3CCE T; 4KH0 B; 1H3H A; 4DBH A; 3VRY A; 1Z9Z A; 3MO8 A; 1K8A C; 2WSF E; 4F7U G; 2KQW A; 2DJZ A; 3OS5 A; 2DEU A; 1NZ9 A; 3HPW A; 2K2V A; 3OYD A; 2LVM A; 2WSE E; 3CCV A; 2COW A; 1AHJ B; 3CCM A; 1N8R C; 2RN8 A; 4JJD A; 3JCM g; 1S72 T; 4IIM A; 2LZ6 B; 3CQT A; 6AT1 B; 2A3L A; 1RAF B; 1YHQ A; 2FYK A; 1MMN A; 2RJC A; 4DOW A; 3VS3 A; 4Z88 A; 1N9S A; 3NMZ C; 2O01 E; 1D0Z A; 5FU7 B; 2GGR A; 4AFU C; 2MMP A; 1KD1 U; 3JCM d; 4XU1 A; 2EGE A; 2K4Y A; 1Z9Q A; 2FZC B; 1T0J A; 1OI1 A; 2K3B A; 4QW2 A; 1NBE B; 2E70 A; 3BFM A; 1KC8 R; 1TUC A; 2PVO B; 3OS2 A; 1YJN Q; 2E41 A; 2AKL A; 3A8L B; 4C8Q G; 4C92 E; 3P8D A; 4XU3 A; 1XOV A; 2COZ A; 3L1A A; 1VQ6 Q; 1UGV A; 3CC4 Q; 4VUB A; 2DM1 A; 2QAZ A; 4A63 B; 2CS7 A; 3MEV A; 4M4Z A; 1UEC A; 3V8L A; 3OYJ A; 1QVF S; 2I2L A; 2RQU A; 2JM8 A; 5GAN 3; 1HXD A; 2PTK A; 4ELY C; 1VA7 A; 4A4K A; 2M0Y A; 3QBY A; 2E5K A; 2P84 A; 2OTJ A; 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