The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
KALVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKALD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7A, K60A
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3JV3 A; 2DL3 A; 2C0O A; 3EG2 A; 5FWC A; 2RQW A; 2RNA A; 1UHC A; 2CUB A; 1BK2 A; 1ABO A; 2MOX A; 1WIE A; 2DNU A; 2O88 A; 2DBM A; 3RNJ A; 1SSH A; 1NEB A; 3VS1 A; 1AWW A; 1E6G A; 1U06 A; 1E6H A; 2KGT A; 4CC4 B; 1K4U S; 2L2P A; 1VYU A; 1A0N B; 1M8M A; 2O2O A; 2DA9 A; 4RTU A; 1UJ0 A; 2BTT A; 3EGU A; 1W6X A; 4CC7 A; 3EG0 A; 1GFD A; 2PTK A; 1AOJ A; 2BZ8 A; 3UF4 A; 1ABQ A; 2LQN A; 2DYB A; 2KYM A; 4Z8A A; 1X6G A; 2HBW A; 2BZY A; 2VWF A; 1M30 A; 1RI9 A; 3R6N A; 1B3Q A; 2GBQ A; 3H41 A; 2BZX A; 1RLP C; 1TUD A; 3EHR A; 1FYN A; 2YUQ A; 1H92 A; 4J9H A; 3NMZ C; 2NWM A; 1MUZ A; 1H3H A; 1NYG A; 4JPB W; 2KR3 A; 1K0X A; 1GL5 A; 2DIL A; 1QCF A; 3EG3 A; 2DJQ A; 2J6K A; 3VS2 A; 2FO0 A; 3PVQ A; 1WFW A; 1GCQ A; 1K76 A; 1YN8 A; 3I35 A; 4JJD A; 2L3S A; 3QWY A; 5IXB A; 2KE9 A; 1NG2 A; 4LE9 A; 4F16 A; 2V1R A; 2YUP A; 1NEG A; 3I5R A; 3ZL7 C; 3VS5 A; 1K0S A; 2OAW A; 2SRC A; 4ORZ A; 2RQR A; 1W1F A; 1X6B A; 4ZNX A; 2LCS A; 4J9E A; 1OEB A; 3A98 A; 3UAT A; 2LJ1 A; 3LH5 A; 4JZ4 A; 1G83 A; 2JTE A; 3EG1 A; 4J9F A; 1ZUY A; 2DF6 A; 1PKT A; 1J3T A; 2E5K A; 1QKX A; 3TSW A; 5FW9 A; 2W0Z A; 2CSQ A; 1H8K A; 2LX7 A; 2D0N A; 2DL4 A; 2J06 A; 3U23 A; 2YT6 A; 2JS2 A; 2RN8 A; 3SHW A; 1QLY A; 1SPK A; 4RTT A; 3UA6 A; 2KXC A; 2CUD A; 2QDL A; 1BB9 A; 4JZ3 A; 1GBQ A; 4OMP A; 5HCK A; 1GCP A; 4K11 A; 2HDA A; 4A63 B; 2K79 A; 2AK5 A; 2AZS A; 2C0T A; 4QT7 A; 4FSS A; 3TSZ A; 3VS7 A; 3PE0 A; 2JMC A; 4HVV A; 2XMF A; 1QWE A; 2J6F A; 4RUG A; 1X2Q A; 2LJ0 A; 4RTW A; 4RTZ A; 2P4R A; 1UHF A; 2PNI A; 5ECA A; 1KIK A; 2O31 A; 1AZG B; 2AKL A; 1JO8 A; 1ZBJ A; 2K9G A; 3VRZ A; 4LUD A; 5IHI A; 1HJD A; 1I07 A; 2DRK A; 1AD5 A; 2X3W D; 1X69 A; 2DMO A; 4RTX A; 2EQI A; 2GTO A; 4DEX A; 1Y57 A; 2AZV A; 2K7A A; 1K9A A; 2DM1 A; 2EBP A; 1VYV A; 3M0S A; 1M27 C; 3KFV A; 2EGE A; 1AVZ C; 2MCN A; 2F2W A; 2LMJ A; 1CSK A; 2CH4 W; 4E6R A; 3CQT A; 1WLP B; 5I11 A; 1WYX A; 1UE9 A; 2F2V A; 3O5Z A; 2ESW A; 4R0K A; 4LUE A; 2J7I A; 1HSQ A; 1OPL A; 5L23 A; 4IIO A; 2HCK A; 1PRM C; 2LJ3 A; 2CDT A; 2KT1 A; 2DRM A; 1MV0 B; 1V1C A; 1Y0M A; 2W10 A; 3NPF A; 1ZX6 A; 4AFU C; 2JS0 A; 2A36 A; 2OI3 A; 4IIM A; 3NHN A; 3ULR B; 3TVT A; 2YUN A; 3I5S A; 4X1V A; 2CSI A; 2RQU A; 2CRE A; 1M3B A; 2RQV A; 1GBR A; 1WXB A; 5GJV B; 1SRL A; 1GRI A; 2VKN A; 5FWB A; 3VS3 A; 1UTI A; 4Y92 A; 2A37 A; 1VYT A; 2GQI A; 1KJW A; 2IIM A; 1YCS B; 1ZLM A; 1NM7 A; 3THK A; 1AWO A; 1OOT A; 3SEM A; 4EIK A; 2H8H A; 3H0H A; 2FRW A; 1CKB A; 4D8K A; 1U3O A; 2RF0 A; 2CH4 A; 2KYB A; 2KT8 A; 1GFC A; 4ESR A; 2YUO A; 3PVL A; 1ZSG A; 2KNB B; 2KRO A; 3RBB B; 4M4Z A; 2X3X D; 2K3B A; 1T0H A; 1CKA A; 4CC2 A; 1AZE A; 4F17 A; 3GBQ A; 3M0P A; 3H0I A; 2ED0 A; 2ABL A; 4DEY A; 1X27 A; 2JM8 A; 2LP5 A; 1PRL C; 1T3L A; 2JW4 A; 2O9V A; 1M3C A; 1WA7 A; 3C0C A; 1YWO A; 1YP5 A; 1MV3 A; 2C0I A; 1W70 A; 5EC7 A; 4F14 A; 1UGV A; 1JU5 C; 1T3S A; 2VVK A; 5IHN A; 1K1Z A; 1UEC A; 1UFF A; 1G2B A; 1JQQ A; 3M0T A; 1B07 A; 1S1N A; 2KEA A; 1HD3 A; 2LNH B; 2HSP A; 2RPN A; 2EYY A; 1OV3 A; 2FPD A; 2LQW A; 2M0Y A; 4LN2 A; 2FEI A; 1TUC A; 3REB B; 4AFS C; 1N5Z A; 5IH2 A; 2RMO A; 4GBQ A; 4J9B A; 1AWJ A; 1PWT A; 2V1Q A; 2DL8 A; 2GNC A; 2PZ1 A; 4KRT A; 4J9G A; 1JXM A; 2D8J A; 1AEY A; 2J6O A; 2A08 A; 4HVW A; 2DL5 A; 2K2M A; 2KRS A; 5IHK A; 4OMM A; 2KRN A; 2K6D A; 4Z89 A; 3M0U A; 1KSW A; 1ARK A; 2OJ2 A; 1BBZ A; 2RQT A; 5GJW B; 2GTJ A; 4CC3 A; 1WXT A; 1I1J A; 2FPF A; 4J9I A; 4OMQ A; 4AFZ C; 3VS0 A; 3VRY A; 2D1X A; 2JM9 A; 1QWF A; 1WDX A; 2EYZ A; 3VS6 A; 1EFN A; 1SRM A; 4J9D A; 4AG1 C; 3I9Q A; 1WX6 A; 2G6F X; 3FJ5 A; 2CT4 A; 2DVJ A; 4RTV A; 2JMA A; 1X2K A; 1KFZ A; 1M3A A; 2DBK A; 2EGC A; 2GGR A; 2KXD A; 4LNP A; 2ROL A; 2L3Q A; 4AG2 C; 1SEM A; 1YWP A; 1UUE A; 2ED1 A; 2EW3 A; 2B86 A; 2EVR A; 1Z9Q A; 2AKK A; 2KRM A; 2NUZ A; 2LZ6 B; 2EYW A; 1LCK A; 1TG0 A; 3REA B; 3VS4 A; 1BU1 A; 4JJC A; 4JJB A; 1ZUU A; 2JXB A; 4GLM A; 2A28 A; 2EPD A; 1WI7 A; 3H0F A; 1JEG A; 2M51 A; 1UDL A; 1WXU A; 2EYX A; 1RUW A; 1FMK A; 1XOV A; 1T0J A; 1RLQ C; 2FG0 A; 3M0Q A; 4RTY A; 2FRY A; 2F2X A; 1Z9Z A; 4Z88 A; 1QKW A; 1UG1 A; 2YDL A; 1JXO A; 2EGA A; 1U5S A; 2I0N A; 2HEQ A; 1PKS A; 2L3P A; 4WCI A; 1PNJ A; 4HXJ A; 1PHT A; 1X43 A; 3M0R A; 4OMN A; 2SEM A; 5IXF A; 2ECZ A; 2ENM A; 4J9C A; 4HVU A; 2JT4 A; 1OPK A; 2KBT A; 2FPE A; 2DLP A; 2DE0 X; 4OMO A; 4OML A; 1E7O A; 1SHF A; 3IQL A; 3QWX X; 2D8H A; 1NLP C; 4D8D A; 5I22 A; 4HCK A; 3UA7 A; 2DL7 A; 2YSQ A; 2O9S A; 1IO6 A; 2ROT A; 1NLO C; 2EKH A; 1GCQ C; 1UJY A; 1SHG A; 2DX1 A; 1YNZ A; 2CT3 A; 2MIO A; 1I0C A; 1AWX A; 2L0A A; 2J05 A; 3EHQ A; 4AFQ C; 3NGP A; 1NYF A; 1VA7 A; 1ZUK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GF7 A; 5D6X A; 2RQW A; 1UHC A; 5J3B A; 1VQ5 A; 4EMH A; 2PVG B; 4DBH A; 2MOX A; 4M7D F; 1KK7 A; 3HRS A; 1QVG S; 2CP2 A; 4BD3 A; 3ER0 A; 1NEB A; 1AWW A; 3D7S B; 2D9T A; 1U06 A; 3LGF A; 1ZSZ B; 1M8V A; 1M8M A; 2QQR A; 3GP8 A; 1VQ6 T; 2BTT A; 2JUF A; 3QII A; 4PK4 A; 2HKQ B; 4QW2 A; 2YRV A; 1GFD A; 2PTK A; 4DOW A; 2BZ8 A; 5GAO l; 2VYT A; 4Z8A A; 5DM7 R; 4RCC A; 4DBR A; 1M30 A; 5HK0 A; 2H3J A; 1RLP C; 2QGG A; 4V2S A; 2LQ8 A; 3CCU T; 4PL6 A; 3PT9 A; 1QVG P; 2OTL A; 1R77 A; 1VQM T; 1G5V A; 2ZPF B; 1VIF A; 1YIT Q; 4A4F A; 1NPR A; 3VS2 A; 3E19 A; 1OZ3 A; 2KK4 A; 1SF9 A; 3RR6 A; 1K76 A; 1YN8 A; 2VB6 A; 2L3S A; 1NG2 A; 2RH2 A; 3MP6 A; 3OB9 A; 1LNX A; 2QQ9 A; 3J7A F; 3VS5 A; 5IAY A; 3G71 Q; 2SRC A; 4ORZ A; 3LX7 A; 1WPY A; 1UB4 A; 3ZEH A; 3LWH A; 2LCS A; 4J9E A; 2XID A; 4ME7 A; 3CCQ A; 3A98 A; 2FZG B; 1WZO A; 2K3X A; 1KD1 U; 2JTM A; 3HL8 A; 2NUP B; 4ZTF A; 4JZ4 A; 2E3I A; 1G83 A; 3EG1 A; 3S3M A; 2DF6 A; 1PKT A; 2E5K A; 3P8H A; 3TSW A; 4M7A G; 2QA4 A; 4C8Q G; 2FZC B; 1H8K A; 1PD0 A; 2LX7 A; 5GAN 6; 2DL4 A; 3SHW A; 3V8L A; 1BIA A; 1M1G A; 2BUD A; 2E12 A; 4CI0 C; 2P4T A; 2EQM A; 2E4H A; 2QDL A; 4AMC A; 1BB9 A; 3MCA B; 1FMW A; 1UEB A; 5KYN A; 4K11 A; 2OAU A; 2K79 A; 2C0T A; 4FSS A; 3QHS A; 5CKE A; 2JMC A; 3CBP A; 2HZY A; 1U1T A; 1V76 A; 3RDV A; 5CR2 A; 1X2Q A; 4II1 A; 1PCX A; 9ATC B; 4EDU A; 3RUX A; 1Q81 C; 3LW5 E; 4KT0 E; 4RTZ A; 2P4R A; 5ECA A; 2YXY A; 3CCS Q; 1KIK A; 1M90 R; 4C0D C; 2K9G A; 1Y07 A; 2DTO A; 1VIE A; 1I07 A; 4PJO E; 4RTX A; 1VQ6 A; 5C6S A; 3OSS C; 3CMA A; 1Y57 A; 2AZV A; 4OMF B; 1YI2 T; 2K7A A; 2E70 A; 3JCM f; 1VYV A; 2LCL A; 2KVQ G; 1VQK A; 1KQS P; 2L3R A; 3OS2 A; 1N6A A; 1BI0 A; 2QK0 A; 3JB9 I; 1OQK A; 1TOV A; 3O5Z A; 4LD6 A; 4LUE A; 3DLM A; 1OPL A; 5L23 A; 2HCK A; 1PRM C; 3G7Z A; 2QQA A; 1PSF A; 2KT1 A; 3NTK A; 3JSC A; 4M78 G; 1VQP Q; 2RD1 A; 3E2U A; 1MV0 B; 1Y0M A; 3OYG A; 2HQH A; 2JS0 A; 2CZ6 B; 3I5S A; 4JJN K; 3NFC A; 5AT1 B; 3CC7 T; 2COY A; 3QPH A; 2HQX A; 2DYI A; 5FWB A; 4FYY B; 1BI2 A; 1JB0 E; 1UTI A; 3CCL T; 1VYT A; 3CCE T; 4M77 D; 2LVM A; 1OOT A; 4PFO A; 3X24 B; 2YRC A; 3FRN A; 2WSE E; 1I5O B; 5LJ3 f; 2RF0 A; 4FCY A; 2AT1 B; 1RAC B; 1S72 A; 3PFS A; 4ESR A; 2YUO A; 2RO0 A; 2YLC A; 2FHD A; 2ZPB B; 5FLX E; 4NL3 A; 2FZK B; 1VQ6 Q; 1BYM A; 2K5I A; 3EFR A; 3CC2 T; 3GBQ A; 3H0I A; 2ABL A; 1OX9 A; 2JM8 A; 2LP5 A; 1H64 1; 1WA7 A; 3F70 A; 3S3O A; 3JCM X; 1SSF A; 1TXQ A; 5GAN h; 4M77 E; 5EC7 A; 1UGV A; 4N4H A; 3QDF A; 4M7A B; 2EQJ A; 5IHN A; 2L8D A; 4C8Q B; 3CCU Q; 1G2B A; 1JQQ A; 3CCR T; 3NTH A; 4TVR A; 4XK8 E; 2D0Q B; 5GAN j; 4J7F A; 2FPD A; 1MND A; 4FYV B; 4LN2 A; 3OW2 A; 1DJ7 B; 3EGX A; 4J6Y A; 5GMK i; 4F7U E; 4A4E A; 1OZ2 A; 3OYH A; 5IH2 A; 3A8L B; 3RER A; 4J9B A; 1PWT A; 3MEW A; 4X9D A; 3KUF A; 3LH0 A; 1I8F A; 2DL8 A; 4MZT A; 4Y91 A; 4OVA A; 3CCV T; 1YI2 A; 2GNC A; 3HFO A; 3V8J A; 1YJ9 A; 1TTH B; 2B8A A; 4FU6 A; 1WQ7 A; 1M1K R; 2V26 A; 3PMI A; 3OA6 A; 1Q86 U; 1KHC A; 1QP2 A; 2RI2 A; 2E6Z A; 5IHK A; 4OMM A; 4BDZ A; 2XIC A; 3QJY A; 3CCM A; 2XG8 D; 1K73 R; 2EJF A; 1KSW A; 2DTI A; 2OJ2 A; 4XAX B; 3OYA A; 5FRM A; 6AT1 B; 1FXX A; 5I2S A; 4AFZ C; 4J9I A; 1M9S A; 3GNF B; 5I2M A; 5A0G A; 1KQ2 A; 1VQ8 T; 2GQV A; 3JCM c; 2MF2 A; 3A5Z B; 4M78 B; 1M2O A; 2DVJ A; 3UWN A; 2JMA A; 3H8Z A; 1QVF P; 4PJJ A; 4ZGE B; 1OYX A; 2ROL A; 1NZ9 A; 3X28 B; 2KDS A; 4AG2 C; 2LRQ A; 3SWN B; 3C4S A; 3DB4 A; 3PGG A; 2CZ1 B; 3M9Q A; 1QVG A; 1UUE A; 2RI3 A; 2JJ9 A; 1Z9Q A; 2AKK A; 5M9O A; 2NUZ A; 1YIJ A; 1LCK A; 1TG0 A; 3JRZ A; 2JNG A; 4JJC A; 5LJ3 e; 1ZUU A; 2ZPH B; 2CYZ B; 2JN0 A; 3OYF A; 1WXU A; 1WHK A; 1RUW A; 5FU7 C; 3RES A; 1T0J A; 1RLQ C; 4ZN1 A; 1TU0 B; 1RAG B; 3M0Q A; 1YI2 Q; 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2CKK A; 2DAQ A; 3QWY A; 5IXB A; 4EMK C; 2YUP A; 1VQ9 A; 3T9N A; 1NEG A; 2VC8 A; 4BE1 A; 1MNE A; 1M2V A; 2OAW A; 5KYX A; 2X51 A; 2RQR A; 4PJO C; 2PUO B; 4ZNX A; 2V8K A; 3CCQ T; 3CCV Q; 4KUI A; 5GAN 7; 2MK5 A; 4BDY A; 4B9W A; 1RI0 A; 4JS5 A; 1UGS B; 2JTE A; 1G3T A; 2R5A A; 2LQK A; 2Z0W A; 3OS1 A; 2QDY B; 4XU0 A; 2QA4 T; 1QKX A; 3JB9 D; 5FW9 A; 1D1B A; 3N5B B; 2CSQ A; 2YWW A; 2D0N A; 2JS2 A; 3EGD B; 1QLY A; 5FRN A; 1HK9 A; 5KYU B; 5FRO A; 3M57 A; 1K73 C; 2ZCF B; 4D6W A; 2HDA A; 3BY7 A; 2AK5 A; 3EAE A; 4E7S A; 5HY6 A; 4HVV A; 2LCC A; 2J6F A; 1D0X A; 2ZPI B; 2LJ0 A; 4RTW A; 4OB2 B; 3TEE A; 4C5I A; 3QDR B; 4DBF A; 4FT2 A; 5KCO A; 2E5Q A; 1D3B B; 2DRK A; 3MPU B; 2DMO A; 1Q7Y R; 2RM4 A; 5KYW A; 1XQH A; 2M1H A; 3VKI A; 1VQ9 Q; 1QW1 A; 3CMA T; 4DEX A; 4C5G A; 1X01 A; 1XJW B; 1K9A A; 2DM1 A; 2HL3 A; 4PJO A; 1MHN A; 3FC3 A; 1VQK T; 3M0S A; 1M27 C; 1VQ4 A; 3KFV A; 2L5Q A; 2ATC B; 4M75 B; 2QYZ A; 4N4I A; 4HCB A; 2F2V A; 4FYW B; 4R0K A; 4BY6 C; 1HSQ A; 1NJI C; 4IIO A; 3GLX A; 4FSX A; 5FU6 C; 2CDT A; 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