The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KALVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKALD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7A, K60A
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Structural protein
|
| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3RBB B; 2L0A A; 2CH4 A; 2GBQ A; 2J06 A; 1GFC A; 1JXO A; 3UA7 A; 3VS5 A; 1SHF A; 2J6K A; 1WXB A; 2BTT A; 2DX1 A; 5ECA A; 1SSH A; 3C0C A; 2RNA A; 2O88 A; 2AKL A; 5GJV B; 5IHI A; 1YNZ A; 1Y0M A; 3CQT A; 4QT7 A; 2O9S A; 2RQW A; 1Z9Z A; 1G2B A; 2DL8 A; 2EW3 A; 2MIO A; 1SEM A; 3VS2 A; 3FJ5 A; 4OMP A; 1E7O A; 2CSI A; 1I1J A; 1NG2 A; 1WYX A; 2P4R A; 1QWE A; 1N5Z A; 4OMN A; 2KT1 A; 2VKN A; 2LJ0 A; 2A36 A; 1CKA A; 2EPD A; 3M0U A; 2JXB A; 2X3X D; 4OMO A; 1GCP A; 3KFV A; 4IIM A; 3EG2 A; 1PHT A; 3JV3 A; 4DEX A; 1NYF A; 2ABL A; 2A08 A; 1NEB A; 4HXJ A; 2NWM A; 4RTT A; 3QWY A; 1H8K A; 2ED0 A; 1UJY A; 2DE0 X; 2DLP A; 2EYX A; 4EIK A; 5IXF A; 1FMK A; 1HSQ A; 1YP5 A; 2M51 A; 1AVZ C; 2JS2 A; 4Z88 A; 3PVQ A; 3M0P A; 2DBK A; 1ZBJ A; 2EYZ A; 2PZ1 A; 1GCQ C; 4Y92 A; 4LE9 A; 1U3O A; 4AG2 C; 2K7A A; 5FW9 A; 2B86 A; 3EGU A; 2K79 A; 4JJC A; 2CT4 A; 1VA7 A; 2K3B A; 4K11 A; 1SHG A; 2KRO A; 4JZ4 A; 2DYB A; 2L2P A; 2RQR A; 3O5Z A; 1VYU A; 1ZUU A; 1ABQ A; 2EYW A; 2HBW A; 1I0C A; 1RLP C; 2FRW A; 3VS1 A; 3TSZ A; 5FWC A; 3SEM A; 1X2Q A; 1PRL C; 1NEG A; 3M0R A; 1X6B A; 3GBQ A; 3TSW A; 4J9E A; 2V1Q A; 2DM1 A; 1CSK A; 1NYG A; 2D0N A; 1LCK A; 1MV3 A; 2EQI A; 2J6F A; 5FWB A; 4DEY A; 1MV0 B; 4OMM A; 1M8M A; 1SPK A; 4JJB A; 4D8K A; 2DJQ A; 2DL5 A; 1JU5 C; 2M0Y A; 4RTW A; 2YT6 A; 1BU1 A; 1OOT A; 1GL5 A; 3EG0 A; 4JZ3 A; 1IO6 A; 2RQU A; 1ZUY A; 2KNB B; 1GBQ A; 1FYN A; 1WFW A; 2GQI A; 1NLP C; 2OI3 A; 3VRY A; 1JEG A; 1K4U S; 2V1R A; 1K76 A; 1UJ0 A; 2AKK A; 1XOV A; 2RN8 A; 3A98 A; 3VRZ A; 1Z9Q A; 2EGC A; 4HVW A; 1K0S A; 1NLO C; 3REB B; 1S1N A; 1GFD A; 1H92 A; 1UHC A; 2RQT A; 5IXB A; 1U06 A; 4RTZ A; 1T0J A; 1M30 A; 1PKS A; 1MUZ A; 3NGP A; 4GBQ A; 2J7I A; 1J3T A; 1M3C A; 1PRM C; 4M4Z A; 4LUE A; 2DL7 A; 2DA9 A; 2EVR A; 1ZLM A; 2BZY A; 2LX7 A; 1GRI A; 1M3B A; 4A63 B; 2CUB A; 4FSS A; 3QWX X; 1UTI A; 2ENM A; 3EHQ A; 4WCI A; 1WI7 A; 2J05 A; 1Y57 A; 1UUE A; 2XMF A; 5IHN A; 2FPD A; 2LMJ A; 4F17 A; 4OML A; 1UFF A; 1ARK A; 1UEC A; 4RTX A; 3M0Q A; 1NM7 A; 2KRN A; 2AZV A; 4J9G A; 1OEB A; 2DNU A; 2KRS A; 2HCK A; 2YUP A; 3U23 A; 2JT4 A; 2FPF A; 3I35 A; 2L3Q A; 2YDL A; 1KFZ A; 1JO8 A; 1M3A A; 1TUD A; 1AWW A; 2JM8 A; 2KR3 A; 3VS6 A; 1VYT A; 2AK5 A; 2RQV A; 4RUG A; 1EFN A; 2D1X A; 1WIE A; 2KXC A; 2KE9 A; 2DL3 A; 2H8H A; 2JMA A; 1M27 C; 2RF0 A; 4GLM A; 5IH2 A; 2DIL A; 2HDA A; 4CC7 A; 1X43 A; 2LJ1 A; 2GNC A; 1RI9 A; 2FEI A; 1ZSG A; 4R0K A; 4OMQ A; 1T3S A; 2K6D A; 2HEQ A; 3R6N A; 1X69 A; 2CT3 A; 2FPE A; 3H0H A; 1T3L A; 1U5S A; 2LQW A; 1UG1 A; 2KBT A; 1TG0 A; 2K2M A; 2YUQ A; 2BZX A; 2KGT A; 2O2O A; 1AWX A; 4J9D A; 3REA B; 1QKW A; 2C0I A; 3UA6 A; 1YWO A; 2L3P A; 1WA7 A; 2YUN A; 3PE0 A; 1X27 A; 1AWJ A; 2CRE A; 4X1V A; 1OV3 A; 2C0T A; 1QKX A; 2X3W D; 2LJ3 A; 1G83 A; 2W0Z A; 1A0N B; 3TVT A; 4ORZ A; 2F2W A; 4ZNX A; 4HCK A; 4AFU C; 4HVV A; 1W1F A; 1OPK A; 2LP5 A; 1K0X A; 2EKH A; 1YN8 A; 2IIM A; 4J9F A; 3RNJ A; 2JS0 A; 2C0O A; 4J9B A; 2GGR A; 2O9V A; 4AG1 C; 1RLQ C; 1WXU A; 1SRL A; 4F14 A; 2CDT A; 2DMO A; 2MOX A; 2A28 A; 5I22 A; 4Z89 A; 2PNI A; 4Z8A A; 2GTO A; 3VS4 A; 4CC2 A; 1SRM A; 1BB9 A; 2LNH B; 1VYV A; 2LZ6 B; 2RPN A; 1CKB A; 3EG3 A; 2G6F X; 2ROT A; 1ABO A; 2SEM A; 4ESR A; 3H41 A; 1WX6 A; 1JXM A; 4AFZ C; 2PTK A; 2D8H A; 2KT8 A; 2DVJ A; 1H3H A; 2KXD A; 3VS7 A; 1KIK A; 1HD3 A; 1GCQ A; 1JQQ A; 2FG0 A; 2RMO A; 1K1Z A; 5GJW B; 3ULR B; 4JJD A; 5IHK A; 2W10 A; 3NHN A; 2L3S A; 2DBM A; 2OJ2 A; 1W6X A; 3LH5 A; 1K9A A; 2JTE A; 1KJW A; 2EGA A; 2LCS A; 3PVL A; 4JPB W; 4HVU A; 2OAW A; 1ZUK A; 3M0S A; 1X2K A; 2JM9 A; 4RTV A; 3THK A; 4KRT A; 2JW4 A; 1BBZ A; 2DRM A; 3UF4 A; 1WDX A; 1PWT A; 1AZG B; 1KSW A; 2K9G A; 5L23 A; 2EBP A; 4AFS C; 4D8D A; 4F16 A; 1T0H A; 1AZE A; 4J9C A; 2KEA A; 2VVK A; 2CH4 W; 2YUO A; 1WXT A; 2I0N A; 2ED1 A; 3NPF A; 4RTY A; 4E6R A; 3I5S A; 2CSQ A; 1RUW A; 1QCF A; 2FO0 A; 2KRM A; 1PKT A; 1V1C A; 3EHR A; 2QDL A; 1UHF A; 5I11 A; 1ZX6 A; 3IQL A; 3I9Q A; 1X6G A; 1AEY A; 4AFQ C; 2EYY A; 3ZL7 C; 2ECZ A; 2BZ8 A; 1B3Q A; 5EC7 A; 1WLP B; 1I07 A; 3H0F A; 2NUZ A; 1AOJ A; 4J9H A; 1AD5 A; 3SHW A; 3H0I A; 1E6G A; 2JMC A; 3I5R A; 2MCN A; 4CC4 B; 2CUD A; 4J9I A; 2DL4 A; 5HCK A; 1B07 A; 4IIO A; 1UE9 A; 2J6O A; 2D8J A; 4CC3 A; 2F2X A; 2ROL A; 3EG1 A; 1YCS B; 2KYB A; 4LUD A; 2FRY A; 3UAT A; 1UDL A; 1PNJ A; 2YSQ A; 4LNP A; 1OPL A; 3VS3 A; 4LN2 A; 1QWF A; 2E5K A; 1YWP A; 2SRC A; 3VS0 A; 1GBR A; 2DF6 A; 2F2V A; 1HJD A; 2LQN A; 2AZS A; 2ESW A; 3NMZ C; 2A37 A; 2EGE A; 2GTJ A; 2O31 A; 3M0T A; 2DRK A; 1W70 A; 2VWF A; 1E6H A; 1TUC A; 2HSP A; 1QLY A; 4RTU A; 1AWO A; 1UGV A; 2KYM A; 1BK2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RBB B; 4N4I A; 3OMG A; 1NPR A; 4ZN3 A; 3NTK A; 3G6E Q; 1NBE B; 4QVD A; 1N6A A; 2BTT A; 3UT1 A; 3JB9 F; 4FYV B; 1QCN A; 2OX7 A; 4FU6 A; 5LJ3 j; 3C0C A; 5GJV B; 2COW A; 2QAS A; 3NTI A; 4ELZ C; 2F5K A; 2MIO A; 1SEM A; 3X25 B; 4L59 A; 2K5L A; 1WHL A; 3ZEH A; 4OMP A; 5CAI A; 4KT0 E; 2E64 A; 1E7O A; 2CSI A; 4ZGE B; 4M75 B; 2NUP B; 1WYX A; 2P4R A; 1QWE A; 1N5Z A; 1D1C A; 1PC0 A; 4OMN A; 4M7D A; 3CCS Q; 2ZPH B; 2NUT A; 2KT1 A; 3T9N A; 2E3H A; 3LLR A; 4J6W A; 4BB7 A; 1UGQ B; 2MMP A; 1CKA A; 2EPD A; 2PVO B; 5GAN g; 3JB9 I; 2X3X D; 2CYZ B; 4IIM A; 2PUO B; 5IAY A; 1PHT A; 4PJL A; 4DEX A; 2ABL A; 4PJO E; 3I56 A; 4HXJ A; 4PNO A; 2NWM A; 2QEX A; 1VQK Q; 1UJY A; 3JCM V; 2F1L A; 2QGG A; 3JSC A; 3FRN A; 3EFS A; 1H64 1; 4A53 A; 5IXF A; 2M51 A; 1Y96 A; 4Y92 A; 1K73 C; 3CC7 Q; 5FW9 A; 1QVG A; 4JZ4 A; 2HSE B; 1VQ5 T; 5C6S A; 3O5Z A; 2RI5 A; 1TTH B; 1ZUU A; 1M9S A; 3CCU Q; 1RLP C; 5IT9 E; 5FWC A; 2ZPE B; 1YI2 T; 2WSE E; 1X6B A; 4M77 C; 2DJZ A; 2MWO A; 1YIJ T; 1VQ4 Q; 4J9E A; 2V1Q A; 1YJN T; 1Q81 R; 4ME7 A; 3EGX A; 2D0N A; 5CQY A; 1LCK A; 5FLX E; 3OYI A; 2J6F A; 4A4K A; 3DB4 A; 3PMI A; 3GIB A; 2V8I A; 3L2W A; 4FYY B; 2HQH A; 5KYW A; 4D8K A; 4QVC A; 2DL5 A; 1JU5 C; 2VXE A; 2V8K A; 3RKW A; 5GAN 4; 1QP2 A; 2RQU A; 1GBQ A; 2FZK B; 2H3J A; 4QKU A; 1WFW A; 1VIE A; 2MK5 A; 3CC4 T; 1EZZ B; 1M8V A; 1Q7Y U; 1M1G A; 1WJR A; 1IB8 A; 3HRT A; 3M54 A; 3I55 T; 2V1R A; 1QVF P; 4BI8 B; 4E47 A; 1NJI U; 1I5O B; 2QQ9 A; 3A98 A; 1Z9Q A; 5DLQ E; 5DY9 A; 1K0S A; 3HFN A; 3PIP A; 1IGQ A; 4CRI A; 4PJO D; 3OYY A; 2WSF E; 2RQT A; 4OF1 A; 2CGH A; 3OYG A; 1PM3 A; 3A8L B; 2WAC A; 3NGP A; 3LWI A; 4J8O A; 4ANJ A; 1PRM C; 2DL7 A; 1VQO T; 2DEU A; 2QQR A; 2JNG A; 1KD1 R; 1ZLM A; 2BZY A; 3CMA A; 4BDZ A; 5KYX B; 3CCM A; 2DTO A; 3EHQ A; 5IHN A; 2XMF A; 4A4G A; 3EGD A; 1ZSZ A; 4F17 A; 4M7A B; 2LDM A; 3SFM A; 5HKC A; 4J9G A; 2KRS A; 2HCK A; 4MMK A; 2YUP A; 4WF2 A; 4RCC A; 3U23 A; 2OTJ A; 4PJO F; 1R0C B; 3OYA A; 2YDL A; 1JO8 A; 1M3A A; 3QPH A; 1AWW A; 1U1T A; 3VS6 A; 1Q95 G; 3GF5 A; 3WXM B; 2PQW A; 4RUG A; 2QYZ A; 3OY9 A; 1KQS A; 1WIE A; 2DL3 A; 4GLM A; 1M27 C; 5IH2 A; 2DIL A; 4CC7 A; 3ER0 A; 4B6M A; 1GXI E; 4J5Y A; 1B34 A; 2XI9 A; 4KBM B; 2R58 A; 5DM7 R; 4OMQ A; 4HCC A; 4XTY A; 2FPE A; 3OYK A; 3I56 Q; 2JTF A; 2DEQ A; 1T3L A; 3V7S A; 1X6O A; 2NUP A; 4J9D A; 2KGT A; 3REA B; 2G3R A; 3SDZ A; 2C0I A; 3OQ5 A; 4A4F A; 2LCC A; 1MMA A; 3WVD B; 1S72 Q; 2QQA A; 3A8O B; 2X3W D; 4DOW A; 3KUF A; 4ORZ A; 2F2W A; 1BKB A; 1K73 U; 3HP9 A; 1OU9 A; 1K0X A; 2IIM A; 2RI3 A; 4J6X A; 7AT1 B; 4F14 A; 5A0G A; 1VQP A; 1YHQ A; 3VYG A; 4Z89 A; 4M7D G; 3M56 A; 2JUF A; 2LT4 A; 5I2S A; 2LZ6 B; 1OX8 A; 1ABO A; 2D8H A; 5CQX A; 3VS7 A; 5LJ5 j; 1TUG B; 1GCQ A; 2XDB A; 2FG0 A; 3E19 A; 3OYF A; 1V29 B; 5IHK A; 1K1Z A; 1N8R C; 1BYM A; 4PK4 A; 2L3S A; 3JCM Q; 2O4X A; 3PNW C; 2DET A; 4M75 C; 2QA4 Q; 1KJW A; 2MYS A; 4PLI A; 4EMK C; 3M0S A; 2JM9 A; 3OA6 A; 4RTV A; 5GAO p; 4ATO A; 1VQ9 T; 3M5A A; 1BBZ A; 4N4H A; 4LD9 K; 1KSW A; 2DXT A; 4F16 A; 1RAD B; 1T0H A; 3VU3 C; 2VVK A; 2CH4 W; 1WXT A; 2VB6 A; 2HNI A; 2M02 A; 4BI4 A; 3LX7 A; 2XHC A; 1YI2 A; 3CCE T; 1RAG B; 1QCF A; 3CEY A; 3FLG A; 1YJ9 Q; 5GAM j; 4M77 E; 1JJ2 P; 4OB3 B; 4E7L A; 2OAU A; 2QTV A; 5CKD A; 5GAN 7; 5GMK j; 1VQM T; 3OMC A; 2BKD N; 5EC7 A; 1H3Z A; 2DO3 A; 2JZ2 A; 3C95 A; 5GAN h; 4FSX A; 5LJ3 d; 3QDR B; 3CCM Q; 2BE9 B; 1AD5 A; 4PJO C; 3INZ A; 2LQ8 A; 2K2V A; 3CCJ T; 2HL5 C; 1EX4 A; 2D8J A; 2KI7 A; 3CC4 A; 2F2X A; 3EG1 A; 1I4K 1; 2NUT B; 3G6E A; 2EFI A; 4A4E A; 1YCS B; 2GF7 A; 3CC2 A; 2OTJ Q; 2E41 A; 5LJ3 e; 1ACM B; 3LWH A; 2CKK A; 4LUD A; 1WHM A; 5KYX A; 4BE0 A; 4QW2 A; 1OPL A; 1QWF A; 4M7A A; 1RAA B; 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1I0C A; 2FRW A; 1KD1 C; 3P8D A; 3VV0 A; 8ATC B; 4OGC A; 1PRL C; 3QDF A; 3CPW P; 1YJN Q; 3TSW A; 5CIU A; 2R5M A; 3KBG A; 3EGD B; 1ZSZ B; 3CME T; 2XIC A; 1IRX A; 3MP6 A; 2ZCF B; 5KCO A; 2CS7 A; 3MKD A; 3PMT A; 3TU4 K; 1MV0 B; 3SWN B; 1M8M A; 3EH2 A; 2HD0 A; 5CKE A; 5HY6 A; 4M75 E; 2DJQ A; 2E12 A; 1W2B P; 4RTW A; 1NZ9 A; 1BU1 A; 1OOT A; 1SF9 A; 1TU0 B; 3CC4 Q; 1QVF A; 1GL5 A; 4JZ3 A; 1IO6 A; 1M1K U; 2KNB B; 2DKG A; 4DA4 A; 3CC2 Q; 2IPO B; 3BY7 A; 3I55 Q; 4CI0 C; 1UGR B; 1NLP C; 5GAN 8; 2OI3 A; 2LC4 A; 1B34 B; 3CCQ T; 2DIQ A; 3CCL T; 2AKK A; 2E65 A; 4MZM A; 3CD6 T; 2RN8 A; 3VRZ A; 2EGC A; 3EFO B; 2B8A A; 1H92 A; 2LVM A; 1QQJ A; 2O01 E; 2VGN A; 1UHC A; 2DD4 A; 4C5I A; 1OX9 A; 4HCZ A; 1YJW Q; 2XID A; 1VQO Q; 1KK7 A; 3N5B B; 2J7I A; 1J3T A; 1MMG A; 4E7J A; 4LUE A; 3QII A; 1RAF B; 2EVR A; 2RJE A; 4A63 B; 2CUB A; 2BE7 D; 2ZPG B; 3H9N A; 2F69 A; 1UTI A; 4WCI A; 2VYT A; 1OZ2 A; 3QO3 A; 2LMJ A; 3JAM E; 4OML A; 5I21 A; 2CP6 A; 3MEA A; 1M1K R; 1UEC A; 2RO0 A; 4C0G A; 3LGF A; 3V7C A; 1NM7 A; 2QK0 A; 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