5G5EA

Crystallographic structure of the tau class glutathione s-transferase migstu from mango mangifera indica l.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
AKSDVKLLGAWPSPYVMRARITLNVKSVDYELLEETLGSKSDLLLKSNPVHKKIPVLIHNDKPICESLIIVHYIDEFWSSGPSILPSDPYDRAIARFWAAYLDEKWYPSLKGIASAQGEEAKKAAVDQVGESLALIEDTYVKLSKGKPFFGGEKIGYLDIAFGCFLGWLRVTEKTSGVKFLNEAKTPHLAKWAVRFCADPAVKDVMPETEKLAEFAKLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights Into Ligand Binding to a Glutathione S-Transferase from Mango: Structure, Thermodynamics and Kinetics
pubmed doi rcsb
molecule keywords TAU CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
source organism Mangifera indica
molecule tags Transferase
total genus 80
structure length 220
sequence length 220
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2016-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5g5eA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g5eA01
5ELAA 1WIKA 4KGIA 3HA9A 3FY7A 1WJKA 1LBKA 4G0KA 1PN9A 2OKAA 5G5EA 4NPBA 1ERUA 2L59A 3DXBA 1X9MB 1MTCA 4G9HA 1XIYA 2YWIA 5CRGA 4BA7A 4K1FA 1B48A 1GSFA 3FEUA 1TI1A 2HZFA 2IJYA 2IMIA 2MBSA 4TXVA 4ZBBA 4LLRA 4I8BA 2RM5A 3TKRA 3WGDA 6GSSA 3I6AA 6GSWA 2C3QA 3TDGA 3KXOA 4KB3A 4IS0A 1URMA 1E6BA 4OFNA 3ERFA 2DJKA 1ZL9A 2E2MA 3VURA 1T4ZA 3KP9A 3IK7A 4Q5FA 3C7MA 4PQ1A 1G6YA 1SKRB 2DSAA 1KEBA 4WETA 4HDEA 4TR0A 2GDRA 1EV9A 2LJAA 2GSTA 4EO3A 2FY6A 3UVHA 2CA8A 2AAWA 1XVWA 5ECKB 4NWYA 2PERA 2B5XA 4MZCA 10GSA 4EVMA 4POLA 1BQ7A 1BX9A 9GSSA 2JSYA 4ZIJA 2TRCP 1I9DA 1VRSD 1E2YA 2LS5A 1ML6A 2HRKB 4GQCA 1G7OA 3HKRA 2OBIA 1OE7A 1Y6EA 1GTUA 1KBNA 2XC2A 1N2AA 3S9FA 5CRHA 1ZZYA 4KDXA 1FB0A 1GSQA 2H75A 13GSA 1EGOA 4KSOA 4HZ4A 1K3YA 3GA4A 1XCCA 4TRXA 3VLNA 4GCIA 2IFQB 2IMKA 2JZSA 3O76A 3UBLA 3ZITA 3U5RE 3M1GA 2VAFA 3C8EA 2XBIA 4K6XA 1TDIA 2IL3A 3GYKA 5CAXA 4PQHA 2C1YA 3EU4A 4L0WA 4CDOA 3TKQA 4DEJA 2F8AA 4EF0A 1SK1A 1JZRA 2GTUA 4H86A 3MWHA 3FR6A 2P5RA 4G0IA 1VF4A 5HR2A 1BEDA 2L5LA 3HHVA 2DJ1A 1JLWA 2B5EA 1GL8A 4G2EA 1GLPA 3F4TA 4EUYA 2YP6A 1LJRA 1C72A 4IQAA 3C71A 2CVBA 2WRTA 1YEXA 1CQGA 1MD4A 1F3BA 2GSRA 5GAPD 2YJHA 1SD8A 2LRTA 1MDJA 1EP8A 1NM3A 4EKZA 1A0RP 4QL7A 5BMUA 3BJ5A 5B6NA 2LRNA 2YANA 2JU5A 2VCTA 5GSTA 4HS1A 3D4TA 2C0FA 1NHOA 4HU7A 22GSA 2RUFA 4LL1B 2CT6A 14GSA 4GF0A 2F8FA 2CZ3A 4ACSA 1WMJA 2VM1A 4FYCA 1OAZA 1XWGA 3ZRDA 4TW5A 1SL0B 1Y25A 2H76A 4KX4A 3DKSA 1U87A 4HU9A 5AIXA 2PGTA 4POMA 1A2LA 3DVWA 1NW2A 3GMFA 1Z9HA 3CSIA 1GUMA 1B4PA 3QOUA 2V1MA 2HXKA 1JZWA 5J41A 4CHSA 1F37A 4RI6A 1S3CA 1YDKA 3TJJA 1S3DA 3SBCA 4TR1A 2I4AA 3KMOA 1J9BA 5F8BA 4JRRA 1ZOFA 3HCZA 1SJZA 4XRAA 4PTSA 4XS4A 1V57A 3RDWA 2X8GA 2L57A 1XWKA 2H1GA 2XHFA 1R4WA 5G5FA 2IIYA 2V32A 4TXOA 3EURA 5AISA 5LNKe 2GGTA 2JADA 2AYTA 3HDCA 3UAPA 5ID2B 4PXOA 1GRXA 2F51A 3HVXA 5DCGA 3ZLPA 2WULA 1M99A 1PKWA 3L9UA 3GH9A 1XOBA 4Q5QA 2AUVA 2LQOA 3WT1A 5DAKB 2JL4A 4MPFA 4WR4A 2GZPA 3DIEA 4YH2A 4GSSA 4PUAA 3QFBC 4EL1A 1IYHA 4YQUA 2H71A 5IM9A 1Z7RA 3RBTA 2DJ2A 1X5CA 20GSA 2H74A 4FO5A 2VLVA 3ZIVA 1FB6A 4DSRA 3SWLA 3OR5A 2LV3A 4L5LA 4PX1A 2PMTA 2V2GA 4KUNA 3D22A 3GIXA 2B1LA 1YZXA 3CSHA 1HD2A 1GUKA 4OO4A 2AJQB 3DRNA 3D4MA 4CW9A 3GNJA 2KP2A 1K3LA 2MMOA 4DSSA 1SK0A 5DDLA 1AIUA 5HFKA 2OADA 2HSHA 2B5YA 5J4UA 1AQVA 1TXXA 1XPVA 5GSSA 5D8IA 1AW9A 3ERGA 4MDCA 3G7IA 3M9JA 1OC9A 2VCZA 2VCVA 3LEFA 2ES7A 2HNLA 2VL2C 4LMWA 1DBYA 3KEBA 4POKA 1ERWA 2MMZA 2YPMA 3G7YA 5J3RA 3EE2A 3TJKA 1O81A 2H6XA 4I5QA 5GZZB 5INYA 2HYXA 2O7KA 3FZ9A 3ZREA 3EU3A 2IMDA 1FVKA 16GSA 2FD3A 1GSSA 4NXIA 3NZNA 4PNGA 4HQSA 3ZYWA 3EMPA 4HJMA 1MDIA 3ME7A 5J9CA 5FHIA 4J2FA 1PD21 2KLXA 4KF9A 3UIWA 5IMDA 3A2WA 3H1NA 5ECPB 2C4JA 4ZXGA 2HE3A 2L4CA 12GSA 3W8JA 1UN2A 5F06A 2CVDA 3A3TA 2L6DA 1V9WA 4ILFA 3A5WA 4XHMA 2CQ9A 5HQPA 4MPGA 1G7EA 2J9HA 1Z6MA 3WYWA 1O85A 2FWEA 2NDOA 4FIWA 1IYIA 4AGSA 5KN1A 2J23A 1M2BA 3KM6A 2H0HA 2WS2A 4NV2A 5ECLB 2O89A 1TK0B 1ERVA 2OE1A 1TP9A 2LJKA 3O6TA 5F0GA 3APSA 3HYPA 2PBJA 3UVTA 3LYPA 4WR5A 3UARA 2B1KA 4MA9A 1FO5A 3C73A 2B7KA 1YY7A 3IAM2 4LL4B 1SU9A 2H70A 2H19A 1DSBA 3W6GA 3LG6A 2H6ZA 5LD0A 2B3SA 3IAS2 3DGQA 3GX8A 3LYKA 3F4RA 1X9WB 3IK9A 1G0TA 1YKAA 4XS6A 3Q18A 4MF5A 1ERTA 4OFTA 5ECOB 4WBJA 5CP1A 1PL2A 4XRDA 2LUSA 3TRXA 2FA4A 5A4UA 2BJXA 3VI5A 4EC0A 2FWGA 2YWMA 4D73A 2VLTA 2TRXA 1ZMAA 1OYJA 4MMMA 1SJIA 4X1UA 3KZQA 1PGTA 1V2AA 1T3BA 2H6YA 3APOA 4BL7A 2H0GA 5ECQB 4WEYA 3QAWA 3FYGA 5ECIB 2ZUPA 5D93A 8GSSA 1GH2A 1FOVA 2RIIA 4DSQA 4MJCA 4OFMA 3I69A 2CAIA 1NSWA 3TJGA 4HJ2A 5E4WA 3GKXA 4YQVA 3TOUA 5FWGA 3WGXA 5EPFA 3CXGA 3US3A 5JWQB 3EYTA 3CTFA 3MAKA 3UMAA 1F6MC 1O73A 2B6MA 3L9VA 5J9BA 3RHCA 11GSA 5C00A 3IHQA 3F6DA 3ZTLA 4ZB9A 2VCQA 5AN1A 1EP7A 1T1VA 5ECSA 1A2MA 4OMVA 4V2LA 4L0UA 3ISOA 2RUEA 1SKSB 3QAVA 4KCAA 2VO4A 3FZAA 1SD9A 2FA8A 1TRUA 5JCGA 3ZZXA 2XPDA 3HXSA 5D9XA 3R2QA 3I43A 3ZVJA 4IN0A 4Z7XA 2JSZA 2V6KA 3P7XA 4JR4A 3TKSA 2PUKC 4EDYA 3GKNA 3TJBA 1A2JA 5JWOB 4XIHA 2VCXA 5H5SA 1JHBA 3UBKA 3D0ZA 1PSQA 2AHEA 5IMVA 4K9ZA 2H30A 2C3TA 4BVYB 1TW9A 1B9XC 4WKWA 1OE8A 3KCMA 3ZVJD 1M9BA 3IOSA 3H4KA 4GLTA 2OACA 4NHZA 1GP1A 2HRFA 3A2XA 2HRKA 4WF4A 2CVKA 2FGXA 1G6WA 1VGLA 3DVXA 3PPUA 2HSYA 4JEDA 3KTBA 5B6MA 3FZ4A 1YF1A 1AQWA 4MZWA 1HNAA 3LJRA 2X64A 2I3YA 2YCDA 18GSA 4N0VA 5HFGA 2VCWA 3ZFLA 1FVJA 1TU8A 1CQHA 1GTAA 3F3QA 3IA1A 3KGKA 1AXDA 3FZ5A 5B7CA 1FHEA 2GQKA 1KNGA 4TN8A 2MMAA 2X99A 3LXZA 1ZCPA 5JCWA 2IFQA 3DEXA 3JCML 3N9JA 4NAXA 5IMZA 4MH2A 4I2UA 3FR9A 4JR6A 2LNTA 2K18A 1SYXA 3GL3A 5H5RA 5A4WA 5G30A 4KA0A 4J56E 3F4SA 3TKPA 5A5KA 1GTBA 5CO3A 1OKDA 1B8XA 1FAAA 3VPQA 2A2SA 1ZYQB 3IRAA 4KCEA 3HY2A 1USBA 2DMLA 5C04A 4L8EA 1R7HA 1ON4A 1MDKA 5DALB 19GSA 1QGVA 1WOUA 1GSDA 2VOCA 1A8LA 2LJRA 5G2ZA 4MP4A 4E8EA 1AAZA 5DJMA 3E3EA 1ZGNA 1O6JA 1W4VA 1OVNA 1M2DA 2PVQA 3EC3A 4KDUA 2L6CA 4FYUA 1R26A 3WD6A 3RHBA 3GH6A 5IO0A 4I6XA 4N30A 4GRFA 2HSMA 2I9HA 2DMMA 4HZ2A 1R5AA 1TOFA 3KMNA 3E9JB 1Z5YE 4HQZA 2GQMA 6GSYA 5D9WA 2P0GA 1HQOA 2EC4A 4MF7A 2ON5A 4K7OA 3TRQA 2VL3A 3QFAC 1DUGA 2GSSA 1TRSA 1Q4JA 2O87A 3J7Yk 2HI7A 4TXOB 1AQXA 2PWJA 1X9SB 4PUFC 3F63A 3F0IA 1X5DA 2FLSA 2N5FA 1F2EA 4GQFA 5ECMB 1JZOA 3ERWA 3MDKA 1PX7A 2NBSA 1GNWA 1Q98A 4N11A 2C80A 4DVCA 2L4QA 1B9YC 4IVFA 3HVSA 4KH7A 4TOPA 2VL9A 3PGTA 3HD5A 1T7PB 4GWRA 1JLVA 3TCOA 4XCSA 2DC5A 4AJ8A 4IKHA 1ST9A 4O92A 3TRPA 5J5NA 3F3RA 4HUAA 1R5PA 2NPBA 3K8NA 2VD0A 5DQSA 4XS1A 2QC7A 4V1Ag 3VWWA 2OE0A 3CSJA 4EE0A 4MABA 1A23A 1VF3A 5EY6A 1V58A 1U3IA 3EINA 3Q6OA 5IOXA 2NVLA 4GTUA 4NHWA 4EXJA 4G0LA 2QKEA 3GKMA 4KAEA 1PX6A 2IN3A 4JBBA 2KUCA 5EVOA 5ID2A 4DSSB 3VWVA 4N10A 3GX0A 2DBCA 1F3AA 3MNGA 1F9MA 5DCHA 1UC7A 2PU9C 1TI3A 3IPZA 1DE1A 2HZEB 5G1KA 1K0DA 3V1WA 4USSA 3IC8A 2TIRA 2I1UA 5DAKA 2HQTA 4O32A 3BCIA 4K2DA 3EVIA 2M46A 5HFIA 4ZILA 3U6VA 2V41A 5AGYA 1UA5A 2D2ZA 2KHPA 5CRWA 1K0BA 3QCPA 3F8UA 5B8BA 4LMVA 2CAQA 1QUWA 1U6TA 2K6VA 4POBA 2I81A 3ED3A 5KEJA 4WBRD 2FCHA 3KH7A 5ECRB 2WFCA 4RUVA 1RQMA 4ZB8A 2R5GA 1M9AA 1OKTA 4K0GA 3WGEA 4BVXA 2IMEA 4V1Ap 2ALBA 1AUCA 3KD0A 5E59A 4FH8A 4YAVA 1XWAA 3QMXA 3CBUA 2EIQA 4XTSA 3QDNA 3GUSA 1K3OA 3L78A 2O85A 2FWFA 5CREA 4RQXA 2WZ9A 4BWSA 2VUPA 4ZL7A 1QMVA 1SK2A 1S3AA 3LORA 1K0OA 2GQLA 2FUG2 1X5EA 1PKZA 4TVEA 1XZOA 2FHEA 1NHYA 4N0ZA 4K7IA 1TJDA 2E2GA 4OCEA 3GTUB 3PH9A 2FNOA 1GSYA 1AC1A 2H1AA 1Z3EA 4OCFA 5F05A 1PRXA 1RW1A 2WJUA 3VWXA 2DJ3A 3LGCA 1GULA 4F0BA 5IIZA 3BD2A 5D9VA 2MMNA 1GLQA 4V2MA 4KE3A 3RPNA 3RPPA 2PN8A 2C0GA 4IP1A 2LKUA 6GSUA 3ZL5A 1XW5A 3ZMLA 3FRCA 3O3TA 1EOGA 5HR3A 3G7JA 5IMCA 2C3NA 4BWQA 1EOHA 1FG4A 3H79A 2KP1A 2GSQA 4BL7B 2QSIA 2O8VB 2V6OA 3UL3A 2EIRA 2RM6A 4JU5A 5EL8A 1ABAA 2H1DA 3TGZA 3L9SA 2AB6A 4K8MA 3R3EA 2YZUA 2H8LA 2HLSA 4IP6A 4YAPA 1TRWA 1YF0A 4E8HA 1WWJA 5G1LA 4L5OA 1M2AA 1Z6NA 2YZHA 2HFDA 3L4NA 3TJFA 3M8NA 6GSTA 2MYGA 5D96A 4F2IA 2G2QA 5ELGA 3RAZA 1GTIA 4GSNA 3DYRA 2GVPA 1K0CA 1HYUA 3FHKA 2GS3A 4QQ7A 3D5JA 3GV1A 1J08A 1YQ1A 4Q5NA 4G19A 4HI7A 4F03A 2DIZA 2CX4A 1WPIA 2ZNMA 1GWCA 2H73A 1V98A 2XPEA 2JZTA 5L71A 3HVVA 4K0NA 3HZ4A 3BBYA 3TOTA 1EV4A 1RK4A 4HEA2 2R6KA 5KN3A 2N5BA 4P3YB 4ZBAA 2LSTA 3TUEA 1GSEA 4JE1A 1M7TA 3HJPA 4IGJA 3GKKA 1QFNA 2C8UA 1T4YA 3TB2A 2E0QA 1M0UA 1XXUA 1GNEA 4MLYA 5DQYA 4ISDA 2X8HA 3M0FA 2VL2A 1PL1A 2VIMA 4K7NA 4LA1A 1T8EB 4IQ1A 3DD3A 2C0DA 3CTGA 4ECIA 3P2AA 4JZQA 1VF1A 1A8YA 1THXA 4FYBA 2VD1A 3CRTA 3IBHA 4WF5A 1XW6A 1JFUA 3ZMKA 3Q74A 2L5OA 3D6IA 3BCKA 1BYEA 2PVOC 5G31A 3BOAA 2DJJA 2OE3A 3UEMA 1VF2A 4MF6A 2K9FA 3MSZA 2WB9A 1MEKA 2YJ7A 1K0AA 1HNBA 4BVYA 4KDYA 2H66A 4F82A 2OA7A 3CRUA 2LTKA 3ME8A 3UJ1A 4NV5A 4PQIA 2HT9A 3IC4A 1A24A 2REMA 2H0IA 5COHA 4PGTA 1SYRA 1PA3A 4TKYA 4PURA 2LNSA 4ZBDA 5F07A 1ILOA 1TK8B 2JZRA 3E0UA 4MCUA 3AY8A 5ECNB 1B4QA 3NIVA 1GSUA 1W89A 3FK8A 2B7JA 2H1BA 4ZL9A 1TRVA 3J7Yb 4RI7A 4MJAA 4GSTA 1J0FA 2MBTA 2OJLA 4IHUA 3HJMA 5AIVA 2R3XA 1A0FA 1XBSA 1PQNA 3I9V2 3CMIA 2FWHA 3NOFA 2M72A 2OBKA 2F3MA 5KN0A 4MK3A 2G0FA 5HR0A 3DMLA 4ML6A 3WT2A 4ZL8A 1OC8A 5ENUA 2NTOA 4TR4A 2HSMB 3IE3A 5IPGA 1DE2A 4OWYA 2VLUA 5JWRB 3IXRA 1QQ2A 4MJBA 5CRDA 2IWTA 1BJXA 2GT6A 1YKCA 1T00A 2JACA 3KP8A 4TR1B 4AJ7A 3FR3A 3QR6A 1ACVA 1SKWB 2WCIA 3UOMA 2RLIA 4I97A 2ON7A 4XS4B 3ZIJA 4ECJA 2HRAA 2Z9SA 3G9BA 4V2NA 5DALA 1UVZA 17GSA 4ZB6A 2BTOT 1V40A 2IMFA 1TK5B 1K0MA 2LRCA 2QGVA 4Q5RA 2YWNA 2K8SA 3H93A 3KJYA 2P5QA 3KTLA 4TR3A 4X43A 5D9TA 2C0EA 2N5AA 1WP0A 2LEGA 2YV9A 1XOAA 2HSNB 2M80A 5DVBA 4NMUA 3GHAA 4O7HA 2YNXA 2IPAA 3EMXA 2PPTA 2YOIA 3C1SA 1O8WA 3GSTA 1O8XA 2GT5A 1SL1B 3L0HA 5B8AA 1TU7A 3GN3A 4BPYA 3C1RA 2R2JA 2R37A 4KW6A 3TKSE 3P8WA 4RQRA 1U88A 1HNCA 4YQMA 4X0XA 1MD3A 3F6FA 3ZFBA 3IV4A 3P90A 3VPTA 2DJ0A 3PINA 4IW9A 4WXTA 3PR8A 5H5QA 4ECBA 5A4VA 1SENA 1FW1A 2R4VA 2E7PA 4ULXA 1SL2B 3LXTA 1X0RA 2EIOA 1XWCA 3GSSA 4ECCA 4QL9A 2P31A 4IJ3A 1TKDB 4EDZA 5CNWA 4F0CA 2KOKA 5IMAA 3VI7A 4J57E 2GLRA 5ECHB 5IPHA 3DWVA 2BMXA 3VWUA 3VK9A 1OC9B 1EGRA 3W8SA 2AV4A 2CZ2A 1WE0A 1THOA 3GRXA 1KTEA 1YJ6A 3CYNA 3FW2A 3M9KA 5DBQA 4ID0A 4BVXB 1H4OA 3KH9A 1SJ6A 1EWXA 3D21A 3A2VA 4G10A 5IO2A 1O7UA 5FT3A 2HZEA 1YEPA 4I2TA 2MZCA 3QD9A 5HR1A 4F9ZA 2XBQA 1EZKA 1BG5A 5LCZA 3TKSC 2GZZA 1LU4A 3IR4A 2DLXA 4IJIA 3LQ7A 2WDUA 2DIYA 5IMFA 5IQYA 5DJLA 1N8JA 1EEMA 1WRYA 4FQUA 4PNFA 1XVQA 6GSVA 6GSXA 1XWBA 3IDVA 4KNDA 4OO5A 1XFLA 7GSSA 2HRNA 4KSMA 2YV7A 2F9SA 3GURA 1BAYA 3HJOA 4ML1A 1U3AA 2X8CA 3VFIA 5IOWA 3H8QA 1K0NA 3QPMA 3GFKA 3LSZA 4OD7A 5KN2A 2YWOA 4O5RA 4MZBA 2UZ8A 4HOJA 3EWLA 3LFLA 1XW9A 1GUHA 2CX3A 3HZ8A 1QXHA 3N5OA 2WGRA 4MH3A 4GXZA 2VM2A 5GAND 2A2RA 5ABRA 3M3MA 1JZDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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