5H5S | Genus

Total Genus 56

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	56
sequence length	164
structure length	163
Chain Sequence	DWRAARSMHEFSAKDIDGHMVNLDKYRGFVSIVTNVASQGKTEVNYTQLVDLHARYAERGLRILAFPSNQFGKQEPGSNEEIKEFAAGYNVKFDMFSKIEVNGDDAHPLWKWMKIQPKGKGILGNAIKWNFTKFLIDKNGVVVKRYGPMEEPLVIEKDLPHYF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Discovery of GPX4 inhibitory peptides from random peptide T7 phage display and subsequent structural analysis pubmed doi rcsb
molecule keywords	Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochond
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	56
structure length	163
sequence length	164
ec nomenclature	ec 1.11.1.12: Phospholipid-hydroperoxide glutathione peroxidase.
pdb deposition date	2016-11-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00255	GSHPx	Glutathione peroxidase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5h5sA00

3ERWA 2FGXA 2K6VA 3ZYWA 3LYPA 1X9SB 3FK8A 3IK7A 4YQMA 5DJLA 1SKWB 2GSSA 5JWOB 4ZBDA 1I5GA 3HVSA 1SJ6A 3RPNA 6GSTA 5D96A 1SKRB 1PN9A 4LA1A 3CSIA 1EOHA 3GUSA 5ECSA 3WGXA 5G5FA 2E2MA 3N5OA 2AJQB 1GSDA 3APQA 2C3QA 4XHMA 1ZMAA 4GF0A 4MF7A 2K8SA 2VUPA 2H0IA 5JCUA 2LV3A 5AISA 1K0BA 18GSA 1WJKA 2VLVA 5J3RA 2RM5A 3ZVJD 2RM6A 2VL2A 4LLRA 4DSQA 2L4CA 4I97A 4TVEA 3M8NA 4HS1A 1B4QA 4ZBAA 2DMMA 3ZIJA 4F82A 4CHSA 3EVIA 4ECJA 1GSYA 3GL3A 4ID0A 2OACA 1XWCA 3QR6A 2V41A 1Z9HA 2JL4A 2YWOA 2GQMA 4YH2A 3HVVA 1WWJA 1X9MB 4TW5A 1ZL9A 2OA7A 3FW2A 1PSQA 2LRCA 2C0EA 2C80A 4JRRA 2D2ZA 4HI7A 2LJAA 1EWXA 10GSA 3HVXA 3RHCA 13GSA 2H1GA 2H6ZA 4EDYA 1S3CA 1A2LA 1SL2B 2VL9A 3C73A 1PL1A 3RDWA 3VURA 4I2TA 1XW5A 4I8BA 3TOUA 1B9XC 1Z7RA 1TOFA 1K0AA 3IR4A 3EE2A 4WR5A 3UAPA 2NTOA 2ZUPA 2GT5A 2L4QA 1O8WA 4ACSA 1A0RP 4IW9A 5D93A 4GQCA 5H5RA 3GRXA 3TJFA 2ES7A 2GZPA 4NPBA 2PWJA 1AQWA 1GL8A 4YAPA 4V2LA 2H6XA 3G7IA 1GTAA 2H01A 1TI3A 1M2AA 5B8BA 2M46A 1QGVA 1AW9A 1M0UA 2K8VA 4HUAA 4KH7A 2R3XA 1NW2A 2DC5A 4N30A 3ZTLA 2B7KA 5IOWA 1SK0A 1XW6A 5KN0A 1XWAA 4BWSA 3TKSC 3QOUA 2DIZA 3N9JA 2HYXA 5EPFA 1T00A 4RQRA 1YKCA 1HNCA 1T8EB 3HCZA 3BBYA 3DIEA 2B3SA 2B7JA 4V1Ag 5ECPB 2GQKA 1XW9A 1V2AA 4F9ZA 3GSTA 1ERVA 1FO5A 2CVBA 3HHVA 4ZB9A 5G30A 1Q4JA 3TDGA 1X5DA 5B7CA 1VF3A 2YCDA 4HOJA 2GQLA 3MAKA 4LMWA 4MPFA 4XS4B 5FHIA 4V2NA 1CQGA 2YV9A 3Q19A 4DSSA 3ED3A 2FWHA 19GSA 3R2QA 1JZOA 3UVTA 2DJ0A 2ALBA 1ACVA 1ZZYA 2E2GA 3LWAA 1TRVA 2EIRA 2H8LA 5IMAA 2IMDA 2H6YA 2XBIA 2P0GA 2CA8A 4KX4A 4GTUA 3J7Yb 3PR8A 4Z7XA 3QFBC 1V98A 1AUCA 4ECCA 4ZL8A 2WFCA 4ZXGA 1TRSA 1UN2A 2P5RA 4EF0A 5H5SA 2A4VA 3WYWA 3EU3A 2CX4A 4HEA2 1NM3A 3LG6A 5DJMA 2AAWA 2J23A 1PKZA 3Q74A 4V2MA 4JU5A 3UBLA 4PQIA 5AGYA 2RIIA 1GP1A 5IM9A 2LKUA 4FH8A 1F6MC 2O85A 3C71A 4F2IA 2JSYA 2LUSA 1J08A 3P7XA 3GTUB 4KUNA 2C8UA 2RUFA 1A8LA 4XTSA 2I81A 4E8EA 2VCTA 3F6DA 5CRDA 3LQ7A 2L6CA 4OMVA 4EO3A 3F4SA 2FA8A 5HR3A 3GKNA 3IA1A 4PURA 1VGLA 1OC3A 1JZDA 3M3MA 2BJXA 2VLUA 4GSSA 1MDIA 3H79A 4EKZA 4K0GA 4X1UA 3ME7A 1Y6EA 3CRTA 2VIMA 2MBSA 5D73A 3VWVA 2ZCTA 4JR6A 5ID2B 4TXVA 4XS1A 1OKDA 1J0FA 4JBBA 4L0UA 2QSIA 5D9WA 4ECIA 4KDXA 1TK0B 3F6FA 5CNWA 4EL1A 2OE3A 4EVMA 5IQYA 1YF0A 4PGTA 5ELAA 4KE3A 1MDJA 2P31A 1SYXA 2EIOA 4GQFA 1VF4A 1DE2A 4P3YB 4GCIA 4HZ4A 2EC4A 2PN8A 3MWHA 4AGSA 3ZITA 3VPQA 5DCGA 1Z6MA 5ECIB 2VO4A 5G5EA 3E0UA 1USBA 2MMOA 2LQOA 5IMCA 2H1DA 3MDKA 1YY7A 2CV4A 3UL3A 3DVWA 5A4VA 1OAZA 3GL5A 3TUEA 3A5WA 1SJIA 4EE0A 4OFMA 3I69A 3WT1A 1PX6A 4AF2A 4FIWA 1TI1A 1EV4A 1KNGA 1PKWA 2L5LA 1X5EA 1ERTA 2JACA 1GTIA 1MD4A 3CSJA 1SENA 1AC1A 1FVKA 5ECOB 3TJBA 3KXOA 2IL3A 1TK8B 5DQYA 3J7Yk 2OE0A 4D73B 1WMJA 5DALB 3LGCA 2I3YA 4XS6A 5ECLB 2M72A 2PVOC 5IO2A 3L0HA 4TXOB 5DAKB 1OC9B 4AJ7A 1BAYA 3VLNA 1SYRA 1QFNA 1OC8A 5ECNB 3VPTA 2B5XA 2H0HA 4Q5NA 2H74A 3DD3A 2L6DA 2PERA 4TR0A 3ZMKA 1K0MA 3M9JA 4N10A 2DSAA 3MNGA 3W8SA 3KGKA 1JLWA 5INYA 2F8AA 2FUG2 3I6AA 5IMVA 2QC7A 2HE3A 3EINA 2O8VB 1T4ZA 1GUKA 1XWBA 3EWLA 3TB2A 4HU9A 2O7KA 1W89A 4FYCA 2BTOT 3GX0A 4ZBBA 1A2JA 2LS5A 3QPMA 5IMZA 1EGRA 5C00A 1ZCPA 3UMAA 1H75A 1FB0A 2KUCA 3O6TA 2IWTA 4J57E 2YWIA 1WIKA 1XFLA 5HR1A 3BCKA 1WOUA 3RPPA 2XBQA 1TP9A 2H1AA 2MZCA 2XC2A 3GH9A 3GKKA 4O7HA 4CDOA 1GSEA 3DYRA 1SU9A 5HQPA 4G19A 4BWQA 1GSSA 1YJ6A 4K9ZA 7GSSA 4L5OA 5GAND 1V58A 4PNFA 2ZNMA 3VI5A 4K1FA 1E2YA 4LL4B 1X5CA 3GX8A 3H8QA 5GZZB 3U5RE 5CRHA 9GSSA 2K18A 1O6JA 2CZ3A 5FWGA 5G2ZA 4YQUA 3PGTA 4JZQA 5JCGA 2AB6A 1EP7A 2KLXA 2LNSA 4MZCA 5HR0A 4MP4A 5IMDA 2PU9C 4OWYA 3NOFA 1PL2A 1TKDB 3ME8A 2L57A 5CRGA 2AYTA 2EIQA 3KMOA 3UEMA 2R6KA 1OKTA 4PXOA 2VOCA 4GLTA 3TRPA 3Q6OA 4O5RA 5H5QA 5LD0A 1PQNA 3I9V2 1TXXA 3EU4A 3CXGA 3FZ4A 1B48A 4TR1B 3QAWA 1XZOA 5ELGA 1O8XA 3D6IA 2R4VA 2HZEA 2VLTA 4I2UA 3H93A 2VM2A 2J9HA 5IPHA 2HNLA 2CVDA 2CT6A 1PGTA 1AXDA 5HFIA 1NHYA 3DRNA 1AAZA 4QQ7A 2AHEA 2NPBA 2WULA 2VM1A 4IQAA 3CSHA 3A2XA 3KZQA 5JCWA 1A0FA 2HSYA 2N5BA 2YJHA 3GA4A 4OO4A 4K0NA 1O7UA 6GSWA 5AIXA 4N0ZA 2FWFA 3GHAA 5F06A 1J9BA 1THOA 1RQMA 4MF5A 4TR1A 1JZWA 2QKEA 3GYKA 2JZTA 5EL8A 3ZRDA 3HY2A 4WF4A 4EDZA 2HRNA 2E7PA 1ON4A 3DVXA 3F0IA 4O92A 3GNJA 4TR4A 6GSYA 2E0QA 3IK9A 2VCQA 3F8UA 5D9TA 4XIHA 4NV5A 2LEGA 1CQHA 1FB6A 2OKAA 2R37A 1R7HA 6GSSA 3HDCA 11GSA 4NV2A 4ZB8A 2H70A 4ZIJA 1N8JA 3F3RA 2LRNA 5F8BA 3IAS2 1K0DA 2WS2A 3EMXA 4BVYA 1U87A 4K8MA 3E3EA 1XOBA 4DSSB 3F4RA 3IAM2 3GKXA 1ZYEA 1XWGA 1IYHA 4FO5A 5B6MA 3FZ5A 5F0GA 1RW1A 2RLIA 3CRUA 1ML6A 3APOA 1G0TA 3FKFA 1F3BA 1K3LA 1GNWA 2L59A 4WXTA 3FY7A 2IMIA 3GN3A 2FCHA 3ZL5A 2IMFA 5GSSA 3BOAA 5CRWA 3QD9A 2CVKA 3DMLA 2KHPA 5FT3A 2GLRA 2YANA 1HNAA 3KP9A 5D9VA 1Z7PA 1BQ7A 1GUMA 4WF5A 1PX7A 3MSZA 1K3YA 4HJ2A 3IPZA 2CQ9A 5ECQB 4O32A 1FVJA 3A2VA 5DDLA 1EZKA 5DBQA 3ZMLA 3FZ9A 3IE3A 5KN2A 3UVHA 3DWVA 1GWCA 1TK5B 3EYTA 1JLVA 1N2AA 2VL3A 2HRFA 4OCEA 3TOTA 1E6BA 3HZ8A 4ML1A 5KN1A 2DIYA 1GLPA 2NVLA 1A2MA 1Y25A 3L4NA 1K0NA 2MMZA 2MMAA 4POKA 1YZXA 1O73A 3IHQA 1OE7A 5E59A 1KEBA 4NHWA 2PGTA 3C8EA 1WP0A 1Z5YE 3LEFA 1M9AA 1NSWA 1O85A 3KM6A 4L0WA 1F3AA 1ZYQB 1MEKA 2P5QA 3DGQA 4EUYA 1BYEA 1UA5A 2HZFA 1BJXA 3GSSA 1RK4A 1A24A 1K3OA 2OJLA 3QAGA 3G7YA 3LSZA 1FAAA 1GTUA 5DVBA 2F8FA 4TRXA 4Q5RA 2WDUA 3PINA 3PH9A 3F9UA 3GMFA 4OFTA 4I5QA 3L78A 4MK3A 1EV9A 4ZL7A 2IN3A 4MDCA 3HJOA 4K7NA 1A8YA 2KP1A 2ON7A 1EEJA 4IQ1A 1U3IA 2PBJA 2HSHA 3LYKA 5ECHB 3H4KA 3KD0A 1AQXA 4IVFA 2LJRA 1ST9A 2VCZA 3FEUA 2BMXA 4ZILA 3HJMA 4NAXA 2HFDA 3GH6A 2JZSA 4MCUA 4TOPA 3S9FA 2WZ9A 1SJZA 3P8WA 2LSTA 2VAFA 1XXUA 3KH9A 3NIVA 4NHZA 2C3NA 5GSTA 4GRFA 5ECRB 2M80A 4WETA 1X0RA 3W6GA 3TJJA 1R4WA 4HDEA 4QL9A 4IBPA 2H71A 3RAZA 3IC4A 4YQVA 1BG5A 1M2DA 2YZUA 5KEJA 4FYUA 2H0GA 4GXZA 4FYBA 2I9HA 2YN1A 1GSFA 3M0FA 1FW1A 3IXRA 1TRWA 3SWLA 3HJPA 1GH2A 3VI7A 3M1GA 2PVQA 2FA4A 3HZ4A 3LXTA 3UBKA 5HR2A 3KH7A 5LCZA 2F3MA 1EEMA 3BJ5A 1PA3A 2HXKA 3G9BA 3TKQA 1ILOA 3ERGA 1JFUA 1XCCA 4F0CA 2NDOA 3CBUA 4PUFC 2N5FA 4TN8A 5EVOA 4MJEA 1T1VA 22GSA 2LQQA 3GV1A 3CMIA 3UOMA 3D4TA 1U88A 3LXZA 17GSA 1KBNA 2DJ2A 3ZLPA 1FHEA 4KW6A 2AV4A 1B4PA 4LL1B 1U3AA 4DEJA 1EGOA 1TU8A 2H1BA 4I6XA 4HQZA 1G6WA 1VF1A 2JSZA 4K6XA 1AQVA 3CTFA 3UJ1A 5G31A 3CTGA 4IHUA 1OYJA 2WGRA 2YP6A 2C0FA 1QXHA 1LU4A 2YWNA 3LJRA 2FLSA 3DKSA 5G1KA 1MTCA 2CZ2A 2B1LA 3HXSA 2IFQA 2X99A 2VCXA 3TGZA 3TKRA 3FYGA 3GFKA 3O3TA 2V1MA 3IOSA 4WBRD 4J2FA 1UVZA 2L5OA 1HD2A 2B5YA 3QCPA 1XVQA 4WR4A 4IJIA 3TRXA 3HKRA 6GSUA 5IPGA 1EOGA 2V6KA 3C7MA 2IMKA 4TKYA 2LNTA 2FHEA 5JWRB 2VCVA 1G7EA 1TW9A 3ZVJA 1SK1A 4HQSA 1KTEA 1YDKA 4OD7A 4EC0A 1V40A 5KN3A 5HFKA 1M9BA 4WKWA 2R2JA 2AUVA 2WCIA 2XHFA 4MABA 1NHOA 3IV4A 2OE1A 1HQOA 4MMMA 2HI7A 3IRAA 3KP8A 1FG4A 1IYIA 1GTBA 5L71A 1THXA 2HZEB 2JADA 5IIZA 4PNGA 2G2QA 3BCIA 1YQ1A 4KB3A 2NBSA 2H30A 4XCSA 1GNEA 1HNBA 2A2RA 5CREA 1M99A 14GSA 2IJYA 3TKSE 4JE1A 1U6TA 3U6VA 1UC7A 5CYYA 1K0CA 1QK8A 2C0DA 3F4TA 2MMNA 4RUVA 1G6YA 2DLXA 3UIWA 2DJJA 4ULXA 4J56E 5E4WA 1XVWA 3KCMA 2CX3A 2YV7A 4NXIA 1SD8A 2B6MA 2LJKA 2I1UA 3DEXA 5HFGA 3TKPA 4IP1A 1YF1A 2VD0A 4TR3A 4Q5FA 1VF2A 4ML6A 4QL7A 2FWEA 4E8HA 3L9SA 4ZB6A 2H19A 4G2EA 1XPVA 1QUWA 3HYPA 3EURA 2GDRA 3D22A 2DJKA 4MJCA 8GSSA 5IO0A 3VWWA 4HU7A 4POBA 1SK2A 3TJKA 4OO5A 4KDYA 5CP1A 4CW9A 1FOVA 2LRTA 3CYNA 4WBJA 1B8XA 4K7OA 6GSXA 1GRXA 4V1Ap 1S3DA 3QMXA 4WEYA 5IOXA 3TKSA 3VFIA 1T3BA 5J4UA 2XPDA 3KMNA 1GSQA 3VWXA 2VL2C 3IDVA 3GKMA 5JWQB 4NWYA 3RHBA 4AJ6A 2X8CA 1TU7A 1B9YC 4G9HA 1AIUA 2X8GA 5B6NA 2CAIA 1PMTA 4ILFA 4KCEA 1F2EA 5J41A 3FR6A 1M7TA 3C1SA 3V1WA 1XBSA 2GT6A 4GSTA 3TCOA 2ON5A 2HT9A 2KP2A 1TRUA 1YEPA 4KA0A 1HYUA 2OBKA 5J9BA 1XIYA 4IKHA 3A3TA 3HD5A 4RI6A 2K9FA 2HLSA 1F9MA 2C3TA 2QGVA 5DCHA 3IBHA 2OBIA 1XWKA 2YWMA 4IP6A 1TTZA 1W4VA 2PPTA 3F63A 2FY6A 2G0FA 5J5NA 2OADA 2Z9SA 4ZL9A 2VCWA 4BL7A 1R5PA 4OCFA 3KIJA 3E9JB 2FWGA 4MF6A 2YZHA 3H1NA 2KOKA 4EXJA 1JHBA 4N11A 2GSRA 2TRXA 3G7JA 12GSA 1DSBA 3VWUA 1QMVA 1VRSD 4JR4A 1ZOFA 1BX9A 1G7OA 2GS3A 2I4AA 2GSTA 2REMA 4MLYA 1ABAA 5DQSA 1X9WB 5J9CA 2YNXA 4PQ1A 3O76A 1M2BA 4MH2A 1S3AA 1OE8A 1Z3EA 2MBTA 4MH3A 2DBCA 2O89A 4Q5QA 3DXBA 1YEXA 2X64A 16GSA 2WB9A 3WD6A 1SL1B 3ZREA 4MZWA 1V57A 3ZZXA 1A23A 2CAQA 4IS0A 3GURA 1TDIA 4PX1A 1DE1A 2H76A 1JZRA 1GSUA 3NZNA 1DBYA 3HA9A 3K8NA 2YOIA 4K7IA 2H75A 3VK9A 4XS4A 5B8AA 4KNDA 3KTBA 4OFNA 4DSRA 2GVPA 4LMVA 1PRXA 1ERWA 3GIXA 5AIVA 3ERFA 4G10A 3ZFBA 4BA7A 4KSOA 1Q98A 2R5GA 3C1RA 3ISOA 4MA9A 3LFLA 2JU5A 2DJ1A 2H72A 4PUAA 3D21A 4POMA 3FHKA 3AY8A 3BD2A 4HZ2A 2O87A 1WRYA 1YKAA 1H4OA 3P2AA 3WGEA 3M9KA 1T7PB 1WPIA 3Q18A 4BPYA 3SBCA 4KGIA 4F0BA 2TIRA 4IJ3A 1F37A 3QFAC 5ECMB 4XRDA 2MYGA 1PD21 2FD3A 3FZAA 3JCML 2GSQA 4KDUA 5LNKe 5G1LA 1GLQA 1SL0B 1QQ2A 3OR5A 1C72A 3GTUA 2F51A 1V9WA 5C04A 2FNOA 3L9VA 2PUKC 1GUHA 4PQHA 3L9UA 2RUEA 4IGJA 6GSVA 2F9SA 20GSA 3APSA 5F07A 2YJ7A 2V2GA 2PMTA 5EY6A 3D0ZA 1LBKA 3TJGA 2B5EA 1T4YA 1ZGNA 4NMUA 1EP8A 3P90A 1I9DA 2YPMA 1BEDA 5IMFA 3FR3A 2V6OA 5ID2A 2B1KA 3KTLA 2H73A 2DMLA 4MPGA 5D8IA 4BVXA 2GZYA 2XPEA 5D9XA 2IIYA 4F03A 5A4UA 5CO3A 4HJMA 4XRAA 1MDKA 1WE0A 2IFQB 2WRTA 1URMA 3A2WA 3EMPA 2GTUA 3RBTA 2GGTA 2VD1A 4DVCA 5A4WA 4AJ8A 3KJYA 4KSMA 1DUGA 4L8EA 3W8JA 4RI7A 4YAVA 1SKSB 4L5LA 2A2SA 4KCAA 3LORA 4X0XA 3QAVA 4JEDA 4MZBA 1MD3A 2C0GA 1R26A 1R5AA 4X43A 4N0VA 5CAXA 4H86A 2N5AA 1LJRA 3ZIVA 3WGDA 2H66A 4ISDA 4POLA 1TJDA 2DJ3A 3WT2A 1XOAA 4D73A 5DALA 1GULA 1ERUA 2GZZA 3D5JA 5ABRA 2JZRA 1Z6NA 3FRCA 5F05A 1K0OA 2IPAA 4IN0A 3I43A 3US3A 4K2DA 3D4MA 1OVNA 2WJUA 2V32A 3QDNA 5ECKB 4TXOA 5DAKA 1OC9A 5A5KA 5AN1A 2X8HA 4MJBA 4ECBA 4RQXA 3KEBA 4MJAA 3F3QA 5ENUA 1SD9A 5GAPD 2C1YA 4KAEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5H5SA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations