5H8HA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA02
1Q1KA 4TQUQ 4RA1A 1IUDA 2DE3A 3A3UA 3E9XA 2F7BA 3JV9A 4JWOA 3ZSFA 4RJZA 1HSLA 2I58A 3TTNA 4AB6A 1QW0A 4X1BA 4ZDMA 4ELPA 2B65A 3HSTA 3MZ1A 2I6EA 3ZS6A 4EQ9A 2NUVA 2V3QA 2HAUA 3R6UA 1MXZA 4ZECA 2DWJA 4DXUA 2ESNA 3N5LA 2HFBA 3TYHA 5I2KA 4MBPA 1PEBA 1D4NA 1JQFA 4LQ2A 4XKQA 3K6VA 3W9WA 3TCHA 4RY1A 2W7YA 5AA1A 2QPQA 4OEUA 4P11A 4DCXA 1H76A 1PDAA 2O84X 4ZS9A 3SESA 2ABHA 1JETA 3OEMA 3UIFA 3Q28A 1S50A 2DWHA 4GXSB 2UYEA 1IQ7A 1MPBA 4IY5A 4QFNA 1SVXB 4DDDA 4YB5A 2PYYA 4H1XA 5ITPA 2PX1A 3C9HA 4OMBA 2O6AA 3C4MA 2OZZA 3KBRA 1M5EA 3C34A 3BFUA 3K1NA 3M3KA 1EZ9A 5DYHA 4G68B 5F7VA 3RN8A 3RTFB 4BDRA 1RYOA 3PUXE 1LAFE 3H6VA 4GQOA 5DT6A 1P1UA 3K02A 2VOZA 3MAMA 5FTIA 1XVYA 5AA4B 3K1PA 3IX1A 3KJTA 1CB6A 3FVOA 1IXCA 4RNSA 2D21A 3DLNA 3KOSA 3DP4A 4FJPA 1MM6A 3FVNA 3ODBA 4H5FA 3MW0A 4JWYA 3RT6B 1B40A 3TTLA 4FATA 3SDFA 4XTCQ 3BKIB 1LGBC 1TT1A 1ZLQA 2QS3A 1NFTA 3PUWE 3QUFA 5FTHA 5LOMA 4F2QA 4THIA 4N6PA 3TDJA 4FIMA 3TPAA 3C36A 1VFEA 3LC8A 1Y9UA 3IOWA 2Z23A 4U21A 3JYRA 3S9EA 3IB1A 3G3KA 1B3LA 3GBBA 3KSXA 4O3BA 2XXRA 1F9BA 1B5IA 2FA7A 1UTHA 4HCWA 4IO7A 2PMSA 3SERA 1MY4A 1TWYA 4G68A 4KD5A 4QFOA 2P1SA 1FTJA 3ZKLA 5AA2A 2F36A 4IO2A 2X26A 4KHZE 2A5SA 4R72A 2NOOA 3PD9A 4WEPA 3TTKA 2Q9TA 4DIGA 5AA4A 3QYTA 2H99A 1Y1ZA 4P0IA 3VLUA 2GRVA 2VD2A 4DXCA 3CVGA 4M4GA 4ESXA 3CFLA 4IO6A 4IGRA 2DS9A 4Q30B 3FUZA 4U1OA 4Z0IA 3IAZA 1B58A 3KOTA 2HQ0A 4KQPA 4M1VA 1P1QA 4YU0A 1ZKBA 4IB2A 1PBQA 2RCBA 2ZXTA 1Y3QA 5H8QA 1XC1A 2ALUA 3HHFA 4OTEA 2DXRA 1NH7A 3U92A 3C35A 4GOTA 4F18A 2Z8DA 5FHNA 2I4CA 3A09A 5FHMA 2DE2A 1H45A 1OLCA 1B3HA 4XIGQ 3OSRA 3FATA 3TTRA 4C1TA 4ECFA 4ELOA 3SKPA 3FD3A 1ZTYA 4G68C 1N3WA 5H8SA 4EQBA 1P99A 4NF4A 1LAXA 2Z8EA 3RLFE 1UQWA 4YICA 5K2XA 5I2KB 4KFQA 3CFZA 4OERA 4U22A 4DXBA 1BTJA 1RKMA 3PMWA 5CM6A 4GWOA 3VFJA 2VP1A 3MPLA 2ZYMA 3VLWA 4MF3A 1WDNA 3KN7A 4LUBA 2I49A 4X48A 4OFJA 4GIZA 5DEXB 3DP6A 2XD3A 4QSCA 1B3EA 5ISUA 1URGA 3H6TA 1R9LA 3FXUA 1IIWA 3R7XA 1NNFA 2CMOA 4YZZA 4QFPA 1BLFA 2O68A 4NF5B 2I4BA 4O3CA 1IEJA 2D3IA 5H8QB 3V5AA 2Z22A 1M5CA 1URSA 2XXPA 5H8NA 5CMMA 3VLVA 4OZ9A 1I6QA 2HCAA 4U23A 4E0WA 1Y20A 1YCJA 2H9BA 2OCUA 3FV1A 3FXRA 4R9GA 4OWDA 2Y84A 3TCFA 2Z8FA 4XKPA 2I3WA 4F3PA 4G77A 4OEVA 2DXYA 4NTLA 4Q0CA 2F6GA 3U1OA 5AA3A 4F1VA 5KDTB 3HHGA 3IJOB 4QF9A 3IJXB 1Y3PA 4HCYA 2XX7A 1OMPA 2RC8A 3LUYA 4F39A 4OESA 3TODA 2PT2A 3TAJA 1A99A 1EZOA 1M5BA 4KYDA 1N0TA 3EHSA 3HCQA 4NF6A 4XKNA 2A5TB 1H43A 3O66A 3HN0A 1B5HA 2GH9A 3I6VA 4GVOA 1FW0A 1H3DA 2LAOA 1JVYA 1MXUA 1US4A 2DOJA 3L6HA 3CG1A 4G2ZA 5JTYB 2VHAA 4ZZAA 2R71A 4ISUA 4IO3A 2DWAA 4R6YA 5EHMA 4YMBA 1FTKA 4GL0A 1MY1A 4LZ7A 1SI1A 3G3GA 4JSDA 4BDLA 4OHNA 1DMBA 3T9VA 2F97A 3E3KA 4EF2A 5CMKA 1B51A 4TLLB 3MBPA 2OK2A 2XXQA 5CMCA 2OJTA 2G93A 2VGQA 3HPIA 1R1NA 4NMYA 1IXIA 2AIXA 2H4IA 1D3KA 2XX8A 3O6GA 3TELA 3LR1A 3G3HA 4F1YA 4P0GA 3MP8A 2AL5A 3K2DA 1MQHA 1SW4A 2FYIA 3H06B 1OVTA 2XD2A 3ONMA 1MQGA 3FZVA 3GZGA 4R6HA 1MXVA 2F35A 3CR9A 3OD7A 1TXFA 4X9TA 4PFYA 3V83A 1WODA 3N26A 1A8FA 3FJGA 2F7CA 1LSTA 4ONYA 3RGYA 1SI0A 2GFEA 3B7DA 3F11A 1B7ZA 5JTYA 3PPPA 1MQIA 1NKXA 1OIBA 2UVHA 3HV1A 4F1UA 1A54A 2R6GE 3K6UA 4HTGA 1ATGA 5EHSA 3S4UA 1MXWA 4NEDA 3U72A 4G8HA 4BDMA 4EXLA 2VD3A 1Z7ME 2ZYKA 4DE8A 5I58A 2OBGA 5I84A 1PBPA 2FNCA 3T93B 3H3GA 2ZMBA 1RYXA 5TPAB 3UP9A 1LBBA 4PE5B 2O7UA 2ONKE 3RNNA 2D5WA 5I57B 5DEXA 1BIYA 4DZ1A 3T9UA 2XHDA 1WVJA 4ZEDA 3CG3A 3DM0A 1ZJLA 1D9YA 3MWBA 1HSJA 1QKBA 4GF8A 4PQJA 1A8EA 4GD5A 4R9FA 3CRBA 3U94A 5ELVA 3W15C 1T0KA 1QUJA 2AYSA 1SW1A 3QAXA 2F78A 5TP9A 1QUKA 3OEKA 1KWHA 1MY3A 2QMWA 2X7QA 4RYAA 4YKPA 5DVFA 3MC2A 4OFLA 2F5XA 3I5OA 3TQLA 2H98A 1FQEA 5IKBA 3K6WA 3IO6A 5B70A 2B3BA 3SEXA 4H0WA 1N7XA 4Q8RA 2XX9A 1NL5A 3B6TA 4ZEFA 1EH3A 1SBPA 5I58B 3N6UA 4LA9A 2HZKA 4Z7EA 3O29A 1GVCA 4YKIA 4F3BA 3EN3A 3O28A 1IXHA 5KZTA 4I1DA 1M5DA 3QSLA 2A5TA 2Y7IA 1GTKA 3FVGA 3UK4A 3OSQA 1TFDA 2GHAA 1ZU0A 3LSXA 4PFUA 4RXLA 4UA8A 3UN6A 3L6GA 5CC2A 1B3FA 3IO4A 3MZ9A 1B46A 2NVUB 3IOTA 3PUVE 1FTMA 1B05A 1S9TA 2HEUA 4IO5A 5TP9B 2OWSA 5CRYA 4R75A 4R73A 1DSNA 1QKAA 3IOVA 4YMAA 4ZE9A 1MRPA 4POWA 3BFTA 1MH4A 4IO4A 4OXVA 1URDA 2V84A 3PMVA 3GLBA 1B4HA 4DCYA 3UORA 4H8IA 1UIVA 4JWXA 4U1ZA 1ZBMA 5H8HB 4JBZA 5TU0A 3OMBA 1VR5A 4FECA 3H4ZA 4FE8A 5F1QA 1NNPA 4H8JA 4KR5A 3N94A 4I62A 1BP5A 1Y3NA 3DELB 4LQ5A 1A55A 3KEIA 4ZEIA 3OO8A 4ZEKA 1JEUA 5JK4A 1A40A 1MS7A 4RPNA 4YKKA 2Y7RA 2Q2CA 1OQGA 3K6XA 2DSFA 4X1DA 4ESWA 3CSBA 4KYSA 4NF5A 4EF1A 3MVXA 3TTMA 1B52A 1MXYA 2XXVA 1PB7A 1PB9A 5HBCA 3Q27A 4KCCA 1PC3A 1TFAA 2G29A 4ELRA 1DOTA 2QS1A 2Y7WA 4QHQA 1NMUA 3HO7A 3EF7A 3VDFA 1NNKA 2O51A 1UTBB 2OWTA 1SYIA 4NF8B 3SEUA 5I2NB 4QRZA 1B1HA 1JW4A 4LVQA 5DVIA 5K2YA 2Q2AA 1SD3A 1L5TA 2ZYOA 4JB7A 3U93A 5KDTA 2I48A 5EYFA 1I6AA 3MPKA 1HSEA 4MLVA 4R6KA 4DLDA 1POTA 1Y4CA 4F2OA 1YPNA 3IB0A 3C31A 3SEYA 2REJA 3Q26A 1JVXA 1IZ1A 3MVYA 4WEDA 3TFLA 4IY6A 3T9XB 3N6TA 4C0RA 1SW2A 4EUOA 3O9PA 1LB8A 3QUJA 4TOZA 3RTWB 1P1OA 1B1XA 4OYVA 3IR1A 3LSWA 3PMXA 4QSEA 2XXHA 1MG1A 4YKJA 4EDPA 4HW8A 5A5XB 3G3FA 1O64A 1D9VA 2I0CA 3KN3A 2UXAA 4RK2A 4BDNA 4EXKA 4L17A 5DVJA 1JEVA 2I3VA 4OQOA 2QMXA 3VXBA 2E0SA 5CBRA 5L9OA 4GRKA 5ICQA 3MVZA 3PUYE 1LCTA 5ITOA 4G4PA 3V8XB 1UIUA 2THIA 3OENA 4NF8A 2BJJX 1SYHA 3RPWA 2REGA 2HXWA 3G7WA 5ICTA 1IITA 3PPQA 4OVJA 1B7HA 1LAGE 2R9JA 3EQ1A 1XT8A 3PU5A 4HS7A 4LATA 3SEWA 2Y7KA 3M3FA 1R9QA 3M8UA 1A7LA 2ONRA 3K01A 3EHTA 3U8QA 2E1SA 3PV0E 2F6PA 1N76A 1B7UA 1B2HA 2QS2A 3OO9A 3S2VA 3VVFA 4QFKA 1MDP1 3FASA 3G3IA 4PFTA 3W9VA 3BBRA 3T96B 1OVBA 4KCDA 3V89B 1MY0A 1XHYA 5I59B 2DVCA 5DTBA 1YTVA 2PT1A 4IGTA 3RQTA 4KYEA 3THIA 2PBWA 1PB8A 3IOUA 3PGFA 1B6HA 4K3FA 1MPCA 1AH5A 2RF1A 2RINA 3MJNA 5AA2B 4C1UA 2KLFA 5L9SA 4F3SA 3PUZE 1J1NA 1NNTA 1FQBA 3P7IA 5I57A 1B9JA 3PPRA 4ZZEA 4G8NA 2HAVA 5J1DA 4NF6B 4UACA 1QUIA 1QVSA 4F31B 1JW1A 1LCFA 1Q35A 2RC7A 3I3VA 4PP0A 5L8DA 4F22A 2O69A 4OETA 5FHOA 1QJMA 1USYH 3MP1A 3RT8A 5BWJA 1LFHA 1FTLA 3H6WA 4MH5A 2NWJA 1AMFA 3WAEA 1N84A 1LLSA 3Q29A 3G3JA 2UVJA 4G8MA 4R74A 4RPOA 2QJEA 3SEVA 3TZAA 1B32A 4ND9A 2YLNA 2V93A 1GV8A 1I6BA 2V25A 1JW5A 2B3FA 1ELJA 3CIJA 5H8FB 5I56B 2Q8JA 3DP8A 1LFGA 3T9HB 5I59A 2Q88A 4F19A 5B7DA 4NF4B 2QS4A 4GLIA 1MPDA 2ZNTA 2I0BA 4Q5TA 1JNFA 4WKMA 4YAHX 3USDA 1USYE 1FTOA 1LAHE 1SW5A 3EHUA 3FV2A 3MUQA 3MZBA 2P2AA 3PPNA 1B4ZA 4MLQA 3RUMA 1Z7NE 3B6QA 4KI0E 2XXWA 1P1NA 3H6UA 4FAJA 4NWCA 1B0LA 2DQVA 2Q89A 2ONSA 4JXIA 3UA8A 1DPPA 4BDOA 3KFMA 3VXCA 2PVUA 1SQYA 1H44A 1LFIA 1R6ZA 4QFLA 2XXXA 3K4UA 4GL8A 1OLAA 3QIMA 4XXUA 1OQHA 3MP6A 3EPEA 2ANJA 4EQ7A 4F3GA 1AIVA 1MQJA 2P0SA 4PFWA 4WXJA 3SETA 2RC9A 5AE4A 1UTHB 1VSOA 3OXNA 1MM7A 4U4SA 5H8NB 2O1MA 1DPEA 2XXTA 4U4XA 4ZE8A 2RCAA 2RKMA 3FIRA 5CMBA 1FQDA 5H8FA 5I56A 1VE4A 2DYXA 3TQWA 4LONB 5CBSA 3O97A 1YAEA 4PETA 2DWIA 4JDFA 2F7AA 1P1WA 2UVGA 3OO6A 1XVXA 3LBSA 3CI8A 3O6HA 4BDQA 2ZNSA 3KN8A 3KGCA 1O63A 3RY3A 3TMGA 4GFRA 3WAFA 5JEIA 4R2FA 2X7PA 2XXIA 3PD8A 2AL4A 5AA2D 3IK6B 4I9DA 1MQDA 3IB2A 2V3UA 1MXXA 3GXAA 5KCJA 2ZNUA 3ECRA 3UGWA 3LSLA 4AB5A 1M5FA 3VVDA 2F8DA 3LSFB 5HPQA 2UVIA 3MVWA 4JSOA 1EU8A 1S7YA 3TEPA 3Q25A 3TUSA 2XXUA 2M8CA 1B0HA 4FEDA 2O7IA 3E13X 2HZLA 2DE4A 3K0VA 3T66A 3TCGA 1ZMGA 3S9NC 4O3AA 3ZKKA 1EZPA 1QULA 4NE4A 2CZLA 1I69A 1CE2A 3T22A 1DTGA 4FEBA 2H25A 3AXFA 3H7MA 5IAIA 5L9MA 1NH8A 3VV5A 1UTBA 3ILTB 3MQ9A 1GGGA 2QRYA 5M2VA 3FVKA 5I2NA 1LBCA 3OO7A 3CSGA 4ELQA 1MY2A 2V3TA 4POXA 3S9MC 3K00A 4KPTA 3FJMA 4F29A 2DVZA 1GR2A 3CFXA 4BLAA 2Y7PA 3O2AA 1FQCA 1ANFA 1O7TA 3KJ7A 4NWDA 3FGSA 3R26A 3FJ7A 2XXYA 1AL3A 4H6DA 3VVEA 2DP8A 1IXGA 4E0XA 3QK6A 1N04A 4ZEBA 4N13A 4N07A 2YJPA 3B6WA 5KCJB 4XKRA 2H5YA 1Y1MA 2IEEA 3M3LA 4OFOA 4RK9A 1II5A 2IA4A 3KSJA 3IORA 4LP2B 2ZYNA 1XOCA 3D4CA 3IL1B 4YB7A 3D4GA 1POY1 2UYFA 4FORA 5A5XA 4TLMB 1FQFA 2NXOA 2O1LA 3E4RA 4I8CA 4LZ8A 3OOAA 1FQAA 1LB9A 4LZ5A 3KG2A 1AOVA 1DTZA 3C32A 2WKYA 1MDQA 4MFIA 4R2BA 4U2RA 2F34A 4GXAA 1SDXA 4H67A 3A3CA 3ILUB 1BKAA 1N3XA 3K1MA 5H8HA 3VE1B 1FCKA 3H03A 3C33A 4YB6A 5TPAA 1VFDA 4OENA 4H65A 3PPOA 2QSXA 3KZGA 2YPNA 3JZJA 2OLBA 3FXQA 4QSDA 5HM4B 3S9LC 1ZIUA 1B3GA 3OELA 1Y4TA 3QXMA 1US5A 2GHBA 1B5JA 1N7WA 4H5GA 5CI5A 1MH3A 3GBAA 3O6IA 4AQ4A 2QL3A 5BUUA 3TKDA 1XS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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