5H8HA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA02
1ZU0A 3SKPA 1RYOA 3VVDA 2A5TA 2ZNTA 2P2AA 4LZ5A 4OEVA 4NWDA 2ONKE 1LAHE 2H98A 2H4IA 3K6WA 2QMXA 3LSLA 1LB8A 1N84A 1LBBA 1NNKA 1Y3QA 3IO6A 1MQIA 3IB2A 2OWTA 3V5AA 3UORA 1MPCA 2Y7IA 2AYSA 2FA7A 4X9TA 4DXUA 4H6DA 4UA8A 1A8EA 3Q25A 1WVJA 2B3BA 3IO4A 1US5A 3HCQA 1POTA 1OVBA 1HSJA 3EPEA 4QSEA 4FORA 5JEIA 4G4PA 3MP1A 1LAGE 2Q2CA 3H6WA 1ELJA 2D3IA 3K02A 4F29A 3IL1B 4KPTA 4WEPA 4FIMA 1S50A 3KN8A 4IO5A 3OD7A 5DTBA 2Y84A 3FJ7A 4QF9A 1WDNA 3K1PA 3MVYA 1ZKBA 3RUMA 3EQ1A 4IO4A 4GXAA 4E0WA 4QSDA 1M5DA 2HZKA 2F34A 3K00A 5AA1A 5EHSA 3THIA 2XXPA 3RT6B 4BLAA 3FXRA 1MXVA 3FXUA 3SEYA 4F19A 1UIUA 5H8HB 4ZECA 4F39A 3V8XB 3KSJA 4RJZA 1SI0A 4WEDA 4QFLA 1JEVA 2XXQA 4F3GA 2Y7WA 4GL0A 3U94A 2X7QA 3IX1A 1FQDA 1SD3A 2Y7RA 2YPNA 1UTBB 3M8UA 3O6HA 5FHMA 5DT6A 2ZYOA 3PMVA 4KYEA 3PPPA 1AMFA 5I57A 3GZGA 3QK6A 3H3GA 3ILUB 3Q26A 3FASA 2R9JA 1UTHB 5CMKA 5AA2A 4XIGQ 2REGA 1OIBA 4ZEBA 4TOZA 3KOTA 1O7TA 4YZZA 4DE8A 4PFWA 5CBSA 1B51A 2IEEA 4G68C 4RA1A 3KN7A 3C4MA 1NMUA 1Q35A 5TP9A 2O51A 1BP5A 3IOUA 1N0TA 5I2KB 3TUSA 1NH8A 1D3KA 4KI0E 1P1NA 2DOJA 3M3FA 3FIRA 5CM6A 3KJTA 4YKPA 2HZLA 5CC2A 5AA3A 1MXZA 2ONSA 1FW0A 4JWOA 4QFKA 3SERA 4O3AA 4GD5A 1NNPA 1A55A 4LZ7A 3OELA 3U8QA 3G3FA 2O6AA 4F2OA 4U2RA 4ELRA 1TT1A 3TKDA 2G93A 3T22A 4ZE8A 2NXOA 3CR9A 3IOTA 4GWOA 2H25A 2F7BA 1LGBC 3RTWB 2XXYA 3MUQA 3E4RA 3TTNA 3LBSA 1PC3A 1OQHA 2QMWA 3F11A 3L6GA 5K2XA 1NL5A 1QUKA 1VE4A 1OMPA 1D9YA 3KZGA 4U1OA 3OSRA 1ATGA 3H06B 1FTJA 3S2VA 3V89B 3MPKA 1B7ZA 3RGYA 3UK4A 3PPQA 2QS1A 4H1XA 1SVXB 4NWCA 1DOTA 2RF1A 3FVNA 3OENA 5AA2D 5FHNA 2M8CA 4H5FA 2ABHA 2Y7KA 3IOWA 4NE4A 2ZYMA 4ZEIA 4R73A 2O84X 2F36A 2DS9A 3VVEA 4OWDA 3O6GA 4X1BA 2XX7A 2O7IA 4NF4A 3A09A 2D21A 1JETA 3A3CA 2DWAA 1CE2A 3IJOB 1CB6A 1YTVA 4R2BA 1Y4TA 1SW4A 3CI8A 2GHBA 2VHAA 2F78A 1B5HA 4PETA 3ILTB 4KHZE 4JDFA 3CG3A 5I57B 3FV2A 1LBCA 4G8HA 5BWJA 2I49A 3O29A 4GIZA 4DIGA 4EQ9A 1Z7NE 1OLCA 1EZPA 2V3QA 1MS7A 3SDFA 5DVIA 1B40A 3QSLA 1Y9UA 3OEKA 2OCUA 4EQBA 4YU0A 3KBRA 3PPOA 1T0KA 1POY1 5TP9B 1LCTA 3VE1B 4AB6A 1FQBA 5TPAA 3C31A 2RC9A 3TQWA 1MM6A 1B5JA 4OVJA 3MZ1A 4GLIA 4IB2A 3QIMA 3EF7A 4Q5TA 2B3FA 2AIXA 1TFAA 3S4UA 2I0CA 1QULA 1SYIA 1QJMA 5I56A 3HHGA 3MAMA 4R72A 4IY5A 1JW4A 4OXVA 5KZTA 2ZYKA 3FVGA 4ELPA 4JSDA 3G3JA 4F1YA 2ESNA 4O3BA 5ICQA 2V93A 4G2ZA 2XXWA 5F1QA 3MW0A 2XXIA 4LVQA 1TXFA 1F9BA 3QXMA 5H8QA 4M4GA 5I58A 1LCFA 1LFIA 3WAEA 1DTZA 2NVUB 1SYHA 2V3TA 3D4CA 1PEBA 2PT2A 3TQLA 1IITA 5FTIA 2Z23A 1FQAA 3MQ9A 4U21A 1H44A 4YB7A 2UVGA 1B05A 3KEIA 3FUZA 3N6TA 2I58A 3H03A 4ZEKA 4EDPA 3BFUA 4IO6A 3CG1A 4YICA 5I84A 2AL5A 3B7DA 1PDAA 3TELA 4C1TA 5M2VA 4H8JA 4KR5A 2I3VA 4DCXA 1D4NA 4LA9A 2DE4A 3ZKLA 4Z0IA 4NEDA 2PVUA 2UVHA 4ND9A 2F97A 1B0LA 1B3LA 2YJPA 4KQPA 4DDDA 3CFZA 1FTMA 5L8DA 4FECA 1NFTA 3IB0A 3LR1A 4YKIA 4JBZA 2E1SA 3B6TA 1LLSA 1SW2A 1Y20A 2Q8JA 3RQTA 2F7CA 4DZ1A 3EN3A 5H8SA 2XXTA 4IO7A 3KSXA 4QFPA 4ZDMA 4R6HA 4OMBA 1EU8A 3U92A 1MQJA 2ALUA 2F8DA 1AIVA 1RKMA 4NF4B 3T93B 2QS4A 3PUWE 4HTGA 3CSGA 2E0SA 5LOMA 2REJA 3MVWA 3PMWA 4X48A 4WXJA 3D4GA 4P11A 1GTKA 4H0WA 1XT8A 1OQGA 3IK6B 4NF5B 1FQCA 1M5FA 4DLDA 3UIFA 3C32A 4BDRA 4MF3A 1N7XA 1A40A 3FVOA 2OZZA 1ZTYA 2RINA 1GR2A 2RC8A 2XD2A 3MVZA 4FAJA 3GBBA 1BTJA 3SEUA 3TFLA 1MM7A 1XS5A 1M5EA 3PD8A 1Y3PA 3HSTA 3SEWA 1JQFA 3VXBA 1BKAA 4POXA 5TPAB 4L17A 1MY1A 1O63A 1TFDA 4I62A 3T9UA 1J1NA 1MXUA 2DVZA 4RY1A 1QKBA 1B32A 4BDMA 5K2YA 3QAXA 1URDA 3LC8A 4ZZEA 2ANJA 4N13A 4QRZA 1ANFA 3DLNA 4AB5A 4KCCA 4GOTA 3K1NA 4NF8A 5H8FA 4RNSA 4JWYA 1YPNA 4ZEDA 2DWIA 2VOZA 3TMGA 5A5XB 5CMBA 3TAJA 1FQEA 2R71A 4R6KA 3DP8A 2NWJA 3A3UA 1MDQA 5DVFA 2F5XA 2XXHA 2OK2A 3O28A 4ZEFA 3C9HA 4OESA 1MG1A 1HSLA 3DP6A 1JW5A 3C34A 5CMMA 3OO7A 5I58B 2R6GE 1AOVA 1M5CA 3FGSA 3K6UA 4MH5A 1S9TA 3M3LA 3CFXA 1SBPA 4XTCQ 1IEJA 3UP9A 4HS7A 3SESA 3H6UA 4DXCA 3MP6A 2I4BA 3O66A 1ZBMA 1SW1A 1MXWA 4ELOA 3VLWA 2I0BA 5ITPA 1EZOA 1MQDA 4THIA 4XKRA 4N6PA 4LP2B 2DE3A 3SETA 4OERA 3HV1A 2I48A 4OFJA 4G68B 4XXUA 2ZNUA 5EYFA 4PE5B 2A5TB 5H8NA 3RTFB 1UIVA 2OBGA 2RCBA 3CVGA 3IJXB 1XOCA 2KLFA 1H45A 3Q28A 4Q30B 3RY3A 3S9LC 4MLQA 3N6UA 1Y1MA 4K3FA 4FEDA 5KCJA 3G3GA 4HCYA 3R7XA 5JK4A 4RXLA 1P1QA 5I59A 2Q9TA 3QUFA 3G3HA 5TU0A 4YKKA 4IGTA 3EHUA 2B65A 2Y7PA 3JV9A 3TCFA 2DP8A 3R26A 1DSNA 4MFIA 1ZIUA 3MC2A 5B70A 3FJMA 3T96B 4BDLA 4F3PA 4R74A 2D5WA 1MY2A 2O1MA 1JVYA 4EF1A 4U4XA 1B52A 2QS3A 3FATA 4LATA 2IA4A 3O9PA 1GVCA 2G29A 1MRPA 1B1HA 4ZS9A 2ZMBA 1LAFE 3CRBA 1DPPA 3GXAA 5HM4B 2GRVA 1AL3A 2DWJA 3EHTA 4XKPA 1NNTA 4PQJA 3OSQA 1B3HA 2Q2AA 2AL4A 3MP8A 4U4SA 3SEXA 1XHYA 2CMOA 4GVOA 3TDJA 4F31B 2XX8A 4IO2A 4NF8B 5H8FB 3I3VA 3CIJA 1B3FA 4H67A 3K4UA 4RPNA 3ODBA 3N94A 2PMSA 3TYHA 5DEXA 2XX9A 3K6VA 2Z8EA 3WAFA 1M5BA 2VD3A 3ZS6A 3O2AA 4LQ2A 1TWYA 2LAOA 4PFUA 1BLFA 3B6WA 4EQ7A 3AXFA 1RYXA 3PGFA 2YLNA 3KN3A 4O3CA 1R1NA 4I1DA 5AA2B 3KGCA 4E0XA 3E9XA 2NUVA 4Q0CA 2VP1A 1IQ7A 1YAEA 3PD9A 2QPQA 4R75A 4FATA 1VR5A 1L5TA 1B6HA 3PPNA 4ZZAA 1LB9A 2QS2A 4WKMA 1PB7A 1QW0A 2I4CA 3OEMA 3KJ7A 3GBAA 1B4ZA 1QKAA 3LSFB 1JW1A 5FTHA 3VDFA 4R6YA 3RNNA 3HO7A 2UYEA 1XC1A 2XHDA 5I2NA 1Y1ZA 1VFDA 4OYVA 5H8NB 2VD2A 4H8IA 5CRYA 2RCAA 2O7UA 5H8HA 1OVTA 1ZMGA 3LUYA 2F35A 4R2FA 2XXRA 1MXXA 5KCJB 2V25A 1IXCA 1BIYA 1B0HA 2XXVA 3EHSA 2PYYA 3K0VA 1URSA 1ZJLA 1QVSA 3S9EA 2UYFA 3SEVA 4GFRA 3H6VA 2XD3A 3KFMA 3MZBA 1LAXA 3VLVA 4ESWA 3ZSFA 3TEPA 3TCGA 1UTHA 3MZ9A 2H99A 3PUZE 1D9VA 1US4A 4YB5A 5AE4A 1URGA 4FEBA 3RT8A 4OETA 1JEUA 3FV1A 2V3UA 4QFNA 3PUYE 3CFLA 3O6IA 3T66A 3OO9A 5ELVA 1A8FA 2HQ0A 5J1DA 3VLUA 4F18A 2W7YA 1SQYA 2I3WA 3RPWA 2P0SA 3OOAA 1MY4A 2ZYNA 5I2KA 3PV0E 1PB8A 4KYDA 1Z7ME 2QL3A 2F6PA 4GF8A 4QFOA 1XVXA 4JB7A 3TTRA 4GRKA 4N07A 1IXHA 4PP0A 2VGQA 3E13X 4LQ5A 2F6GA 3QYTA 2Q89A 4EUOA 3DELB 3MVXA 3GLBA 3FZVA 4HW8A 4KYSA 5HBCA 3VV5A 3IOVA 5DEXB 3TTLA 1H76A 4C1UA 1P99A 1EZ9A 3DP4A 2ZXTA 4U1ZA 2HXWA 1N04A 3C35A 4KD5A 1R9LA 2X26A 4AQ4A 3IR1A 2Z8FA 4ISUA 1PBPA 1Y4CA 3U93A 3B6QA 1I6AA 3H6TA 4MLVA 2HFBA 1FTOA 1GV8A 1JNFA 2OJTA 5ICTA 4JSOA 2BJJX 1QUJA 3K2DA 5L9OA 2HAVA 2HEUA 1FTLA 2RKMA 4F22A 3ONMA 4H5GA 5ITOA 1UQWA 2O68A 1DTGA 3IB1A 4LZ8A 5AA4A 2H9BA 3H7MA 2QJEA 1WODA 1R6ZA 3G3KA 1YCJA 5I2NB 3JYRA 4OHNA 3OO6A 4ELQA 3RN8A 4FE8A 2DVCA 5I56B 1KWHA 4NMYA 4YMBA 3K6XA 3P7IA 1P1UA 2P1SA 2OWSA 3S9MC 5IAIA 3C36A 4Q8RA 3JZJA 2THIA 3C33A 3TPAA 4RK2A 3MBPA 2F7AA 1VSOA 4OFOA 3M3KA 5H8QB 4LONB 4ECFA 3TTMA 3VVFA 4GQOA 4F2QA 1B5IA 1II5A 2I6EA 3LSXA 3W9WA 3UGWA 4JXIA 4RYAA 4H65A 2OLBA 2QRYA 4OZ9A 3U1OA 1B3EA 3FVKA 1NNFA 3HPIA 4YAHX 4F1UA 3N5LA 1A99A 3O97A 2ZNSA 3OO8A 4EXLA 5B7DA 1MPDA 4XKNA 5FHOA 4EXKA 3T9XB 1SW5A 4OENA 4MBPA 4EF2A 3W15C 4GL8A 1VFEA 1ZLQA 3UN6A 1QUIA 2PT1A 3G3IA 4Z7EA 1JVXA 1FTKA 3Q29A 3N26A 3USDA 4BDNA 1MY3A 4ESXA 5JTYA 1GGGA 4R9GA 1IXIA 1NH7A 5CMCA 4LUBA 4IY6A 3HN0A 4UACA 4U22A 4YKJA 4P0GA 2HCAA 1MH3A 1HSEA 1N7WA 4ONYA 3W9VA 4IO3A 1A54A 1B3GA 1N3WA 1O64A 1LSTA 2H5YA 3ZKKA 4F3SA 4NTLA 3TODA 3FJGA 3U72A 2PX1A 5KDTA 4DXBA 3PPRA 4IGRA 4R9FA 1B46A 4X1DA 4PFYA 1USYE 3ECRA 1LFGA 1MY0A 4BDOA 3UA8A 2PBWA 4QHQA 4I8CA 4G8NA 4XKQA 4NF6A 2WKYA 1MH4A 2UXAA 5CI5A 4FJPA 3VFJA 3OMBA 2GH9A 5AA4B 1B4HA 4OFLA 2DE2A 1B7UA 3E3KA 1MXYA 1B1XA 1PB9A 2X7PA 5CBRA 4KFQA 4JWXA 3BFTA 2FNCA 4G8MA 1MDP1 3PMXA 3OXNA 4YMAA 3QUJA 4C0RA 1SDXA 2DWHA 4YB6A 1B7HA 1IUDA 3MWBA 1A7LA 4RPOA 4OTEA 5L9MA 1OLAA 2CZLA 2O1LA 1USYH 2HAUA 2QSXA 3BKIB 1MPBA 1P1WA 3MJNA 3G7WA 5F7VA 1H43A 2DSFA 5L9SA 4NF5A 3T9HB 4M1VA 2A5SA 2ONRA 4F1VA 3K01A 4PFTA 1IZ1A 2FYIA 1R9QA 3V83A 3R6UA 4OEUA 2UVIA 1P1OA 2Z8DA 2DXYA 4ZE9A 3K1MA 1LFHA 1FQFA 4TLMB 1NKXA 2O69A 5HPQA 1I6BA 1XVYA 3LSWA 4KCDA 1AH5A 4POWA 3KG2A 1S7YA 2V84A 2XXXA 1MQHA 2RC7A 4GXSB 1DMBA 3KOSA 3VXCA 4QSCA 5BUUA 1DPEA 4P0IA 2UVJA 2NOOA 5EHMA 3PUVE 3H4ZA 5IKBA 4TQUQ 1B9JA 1Q1KA 3I5OA 5JTYB 3L6HA 4I9DA 1N3XA 2DYXA 2GFEA 3BBRA 5I59B 5A5XA 3MPLA 1B58A 1UTBA 1N76A 3CSBA 2DQVA 1IXGA 3RLFE 3DM0A 3IORA 1Y3NA 1B2HA 2Q88A 4DCYA 1EH3A 3PU5A 4RK9A 3FD3A 3I6VA 5KDTB 1IIWA 1PBQA 3Q27A 1I6QA 2Z22A 3FXQA 4G77A 4F3BA 3PUXE 3HHFA 1FCKA 2GHAA 4U23A 1I69A 3TCHA 3TZAA 1MQGA 1SI1A 4HCWA 4OQOA 2DXRA 4TLLB 4NF6B 1H3DA 3S9NC 3T9VA 5ISUA 2XXUA 5DVJA 4BDQA 5DYHA 3IAZA 3TTKA 4G68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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