5H8HA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA02
1EZ9A 2QMWA 1I69A 1B7HA 3OSQA 3MJNA 4JDFA 1MXXA 3ZS6A 4HTGA 3CRBA 1N3WA 3HO7A 1OQGA 1B5HA 1H45A 4LATA 3IL1B 4IO7A 1YPNA 2Q8JA 1NNFA 2D3IA 1GTKA 4NEDA 1CB6A 2ESNA 3L6GA 4EF2A 3MVZA 4AB5A 3MW0A 2DE4A 4GWOA 3MBPA 2F7CA 1RYXA 1ZTYA 4XKRA 3KOSA 1M5DA 5I2KA 1QULA 1JVYA 3C34A 1Q35A 4Z0IA 4LA9A 3VVEA 3G3KA 1II5A 4ZS9A 5I58B 4OENA 1S50A 4IY6A 3FIRA 1XOCA 4ELPA 1ZLQA 1B4ZA 1PC3A 3IR1A 5I56A 4EXKA 4IO2A 4O3AA 3SKPA 1BTJA 1SVXB 3MZ1A 3OO7A 1I6BA 1OQHA 3HN0A 3O66A 1FW0A 1NL5A 4OWDA 1T0KA 1XVXA 2QL3A 3K02A 1QUJA 5F1QA 1SI0A 3D4CA 1UTBA 1B05A 4R6YA 1QKBA 4TLLB 4DLDA 3PUYE 2ZYKA 2I4CA 4E0XA 3T9VA 2R9JA 3Q26A 3EPEA 4JB7A 1LAXA 4R2FA 1XT8A 4NF5A 4G68A 4NF8B 4X1BA 2XX7A 3S9EA 4JSDA 3FXRA 4F3BA 2HQ0A 1Y1ZA 3H6UA 3KN8A 4OMBA 2RCBA 3U8QA 2DWHA 3DP4A 1MQDA 3IX1A 4BLAA 3M3KA 1OIBA 3O97A 3MPKA 1EU8A 2H98A 1O7TA 4IO6A 5AA1A 1DPEA 1PDAA 4RY1A 1J1NA 4Q30B 4PFYA 1JW1A 2UVHA 2ZMBA 4EQ7A 2REGA 4HW8A 3M3LA 2E0SA 3A09A 3QSLA 4QFLA 1GGGA 5ITOA 5AA2A 3SEVA 1PBPA 1O63A 1D9VA 4H8JA 3OD7A 3K0VA 1SQYA 3F11A 2HAVA 1MPBA 4UA8A 3IB0A 3S9MC 3TZAA 1B5JA 4Q8RA 3TTKA 1P1NA 5EHSA 4WEPA 3O9PA 3H7MA 4IGTA 2DE2A 1AH5A 2DQVA 1BIYA 2O51A 2YLNA 1MG1A 2O7UA 4YB5A 4KCDA 4ISUA 4ESWA 2ONKE 3K1PA 4ZE8A 2ONRA 3JV9A 1A7LA 2HZKA 4GOTA 3FGSA 2O69A 1IXCA 3G3GA 2UVGA 3T9XB 1Y3NA 2F97A 3PU5A 4ZDMA 1DOTA 4NF4B 3K6WA 1M5CA 4EUOA 4PETA 2DSFA 5H8QA 3IJOB 3UA8A 1A55A 2O6AA 4EQ9A 5L8DA 1IQ7A 3TEPA 3S9LC 2XXPA 1MXVA 2H99A 2AIXA 3LSWA 3TTLA 5KDTB 5A5XA 4P0GA 1NNTA 1H44A 5IAIA 4PE5B 3IOUA 1AL3A 2RF1A 3GZGA 1H76A 3THIA 1NNPA 1MXUA 3OENA 3TYHA 4XKNA 3T66A 2NOOA 4IO5A 1MQGA 4H0WA 3HV1A 4LONB 4O3BA 4RXLA 3EHUA 1B3GA 1QW0A 1B3LA 1N7XA 3CG1A 2CZLA 3Q28A 1FQFA 4L17A 5L9MA 5CBRA 4RJZA 4U2RA 3PD8A 3TCFA 3LSLA 2P0SA 4YKKA 1TT1A 3U94A 3WAFA 1MH4A 1SW4A 5CI5A 3LC8A 1JETA 5EYFA 3O6IA 1MY4A 1Y3PA 2QRYA 1XS5A 2GH9A 4G4PA 4F39A 4TQUQ 2F7AA 4POXA 3MVWA 3KFMA 3IAZA 2QS1A 4M4GA 3SERA 4JXIA 5TP9B 1SD3A 3GXAA 2O84X 3O2AA 3R26A 2X7PA 1US4A 1MM7A 3RQTA 1Z7NE 1UQWA 5DT6A 1ELJA 4HCYA 2HXWA 3BFUA 4NTLA 1LLSA 4KCCA 1Q1KA 1ZMGA 2XXVA 4KYSA 4IO4A 4QSEA 4F1YA 1N3XA 1N84A 1IXHA 4P11A 4F2OA 2HAUA 4QFPA 2F34A 2VOZA 2DOJA 3KGCA 1SW2A 2I58A 1LCFA 2ZXTA 4DXUA 4U4XA 3Q29A 4OZ9A 1B46A 3R6UA 1JQFA 1D3KA 2R71A 1MDQA 3PUVE 4JWXA 3IOVA 3B7DA 3PV0E 1PB8A 2G29A 2Q89A 1Y9UA 2O68A 3CSGA 4OERA 3USDA 2I49A 3E3KA 2I0CA 5KCJB 1LSTA 1B3EA 4H67A 3RGYA 3I5OA 3S9NC 3MPLA 4G8MA 3TUSA 1FQCA 1NFTA 2ZYNA 3TQLA 2V25A 1A99A 3Q27A 5AE4A 3SEXA 1P99A 4HCWA 2XXQA 1M5BA 1EH3A 3MP1A 1R1NA 3B6TA 3OO9A 3BBRA 2XXHA 4MBPA 4YKJA 5CMBA 1ZJLA 4N13A 3C31A 4UACA 1B4HA 2DWIA 4X48A 4WKMA 1AOVA 2I4BA 1MS7A 5I59A 3OO6A 4G8NA 2F6PA 3BKIB 4YKPA 1NNKA 2XXTA 5H8HA 3FVGA 1GV8A 4JWOA 2OLBA 4QF9A 3I3VA 4OHNA 1MXWA 1N7WA 3O29A 2QPQA 3MVXA 3RPWA 2Y84A 1D4NA 4ONYA 2THIA 4ZEDA 4F1VA 2A5SA 1LAFE 1P1QA 2DXRA 1DMBA 5ICQA 1DTGA 1FTOA 3U92A 4YU0A 2HCAA 2RC7A 3WAEA 3LBSA 3VVDA 3CFXA 3S2VA 1SW1A 3ECRA 3KJ7A 3MZBA 1WVJA 3PMXA 4I1DA 1NH7A 4ND9A 3PPPA 3DELB 3MVYA 1B3HA 5TPAB 4YMAA 1TFAA 3VE1B 1R9LA 4OQOA 4FJPA 4PQJA 4ELOA 2D21A 4G68C 3H3GA 1ZIUA 3FD3A 4HS7A 2ONSA 2QS3A 3VDFA 3PMWA 2O7IA 2ZYOA 1B32A 2Y7IA 4EQBA 3W9VA 3DP8A 3QYTA 5JTYB 4BDRA 3MP8A 2X7QA 2PVUA 4FIMA 4G8HA 4OFJA 4H6DA 2R6GE 1TFDA 3DP6A 3FVOA 3TAJA 4FEDA 2FNCA 1D9YA 5I2NA 1UTHA 3GLBA 5AA3A 3JYRA 1ANFA 1LFGA 3TODA 4F3GA 3ZSFA 2RC9A 1EZPA 4H8IA 5LOMA 2V3TA 2KLFA 3RUMA 3U1OA 1PEBA 1SYIA 1Y3QA 4RNSA 1RKMA 4OTEA 1LFHA 3H03A 3C35A 5K2YA 2ALUA 4LQ2A 4QFKA 3KZGA 5H8FA 1EZOA 1B0LA 3TPAA 2A5TA 4QSCA 2ZNUA 4GL8A 1FQBA 1WODA 1UIUA 4ZZEA 1FCKA 3FXUA 3VXCA 5I84A 4RK2A 4GF8A 3O6GA 1LCTA 3H6WA 1I6AA 4MFIA 4FECA 3K4UA 3ZKKA 3CFZA 3G3JA 4LUBA 1M5EA 1FTJA 4YZZA 1YAEA 3H6VA 3TTNA 3QUJA 2XD2A 3ODBA 4G77A 2FA7A 5EHMA 3FJ7A 4OYVA 4NE4A 5TU0A 5H8NB 2FYIA 2Z22A 1PBQA 2HZLA 2UYFA 1B0HA 4NF6A 4O3CA 5DEXB 4WXJA 1SW5A 4KI0E 3H6TA 4EDPA 2Y7RA 2D5WA 1MPDA 1MH3A 1LBBA 2F36A 5ITPA 3C33A 2Y7KA 3T22A 2IA4A 4LZ7A 3LSFB 3IB1A 5L9SA 1B7UA 4IY5A 3FJGA 2I48A 2P2AA 3EN3A 3IB2A 4NMYA 5FHMA 3O6HA 3GBBA 3IO4A 1GVCA 4MLVA 2LAOA 4M1VA 4OXVA 4PFUA 2Y7WA 1HSLA 3VLWA 3T9UA 2XXXA 5B7DA 1A54A 4DXCA 3EF7A 5AA4A 3UIFA 3V8XB 2HFBA 1MY3A 1RYOA 4QFNA 3K00A 4ESXA 1B6HA 3W9WA 2H9BA 1OLAA 5ICTA 3K1NA 1IEJA 3N6TA 2WKYA 3PD9A 4RK9A 3IO6A 4ELRA 5F7VA 4F2QA 3BFTA 4KFQA 3CR9A 1DSNA 4GD5A 4DE8A 3CIJA 1LBCA 5I2KB 1JEUA 3PUZE 2ABHA 3RY3A 3V5AA 4H5GA 4ZEIA 1SBPA 1MQIA 4R6HA 2RC8A 2GHAA 1OMPA 2GFEA 4R73A 5I58A 4C0RA 1IZ1A 4ZEFA 2DS9A 2Q2CA 4OESA 3FVNA 5FHOA 2PT1A 3C36A 4Z7EA 4KD5A 5I56B 4EXLA 1URSA 4YB7A 4Q5TA 3DM0A 1VFEA 2QMXA 4RYAA 4TLMB 4GL0A 4ZEBA 2DWJA 4QSDA 3C4MA 1A40A 4LQ5A 1B9JA 2XHDA 2O1MA 2QS4A 1GR2A 5L9OA 4KYEA 4KQPA 1ZBMA 2Z8DA 1UTBB 3IOWA 5DVIA 2ZYMA 2XD3A 2Z23A 2F35A 3QIMA 3N6UA 4IGRA 1FQAA 1LB8A 3PUWE 3MUQA 4XKQA 3TTRA 1R6ZA 2OWSA 4NF5B 2ZNSA 4G68B 4H65A 5BUUA 4R2BA 1LAHE 4OVJA 1IITA 3KEIA 4NF8A 3S4UA 3VFJA 2OBGA 4DZ1A 4QHQA 1MY2A 1A8EA 2NUVA 4F3PA 5FTIA 4XIGQ 2VHAA 3RNNA 1DPPA 1AMFA 2OCUA 1US5A 1QJMA 3I6VA 1BLFA 1CE2A 4F3SA 4YMBA 1AIVA 1B7ZA 4XXUA 4PP0A 4LZ8A 5JK4A 3P7IA 5H8SA 1B1XA 3K6UA 2I3VA 2F5XA 5AA2B 2DWAA 2Z8EA 3OELA 3KG2A 4I9DA 1POTA 1YTVA 1NH8A 3N94A 4AB6A 4BDMA 5H8NA 5KZTA 3LUYA 3HSTA 4F29A 1Y20A 1MRPA 1R9QA 1N0TA 3FXQA 1HSEA 1LFIA 2PMSA 1N04A 1URDA 3TTMA 3FVKA 3IORA 2F6GA 1FTLA 4ELQA 4FE8A 4G2ZA 3EHTA 4MLQA 4LP2B 1JNFA 4N07A 3VVFA 1BKAA 1JEVA 2ANJA 2YJPA 4NWCA 3H4ZA 2PT2A 5HPQA 4U1ZA 3M3FA 2NWJA 3JZJA 4EF1A 1S9TA 4RPNA 3TKDA 3G3FA 5H8QB 4NF4A 1SI1A 5BWJA 1B52A 3W15C 4E0WA 3VLVA 1OLCA 2E1SA 3B6WA 4IO3A 2PX1A 4WEDA 1MDP1 2V84A 1ZKBA 5A5XB 4TOZA 3TDJA 5K2XA 5KDTA 2RINA 2Z8FA 2DVCA 2M8CA 3V89B 2RKMA 4Q0CA 1MQHA 4ZZAA 3QXMA 4N6PA 3KN3A 2NVUB 2RCAA 3SEYA 3FASA 3T96B 4U22A 3OEMA 2XXYA 1MY1A 3KSXA 1B58A 1FTKA 4F18A 3SESA 2XXWA 1URGA 4BDLA 2OK2A 3CFLA 2W7YA 1KWHA 1N76A 4GQOA 4FAJA 4R9GA 1F9BA 1IXGA 3N26A 2F7BA 5CC2A 4U4SA 2AL4A 3CG3A 1XHYA 3FUZA 1PB9A 4F19A 2REJA 1MY0A 2F8DA 3SDFA 4DCXA 5M2VA 3E4RA 1USYE 3UP9A 1JVXA 3T9HB 5FHNA 1VFDA 4JWYA 3ILUB 1USYH 5FTHA 1MXYA 2DE3A 3D4GA 2OZZA 2I3WA 4QRZA 2I0BA 1I6QA 3U72A 5J1DA 1VE4A 5AA2D 2XX9A 3MZ9A 5TP9A 2AYSA 3HPIA 3N5LA 1QUKA 4POWA 1QKAA 4K3FA 3OO8A 3UK4A 1ATGA 2GRVA 5DTBA 3TCGA 4KHZE 3RT8A 3TCHA 1QUIA 4R74A 3TFLA 2B65A 5DVFA 4AQ4A 2YPNA 4KR5A 2OJTA 3O28A 4GLIA 5HM4B 3V83A 1MPCA 3A3CA 1B3FA 3PPOA 4MF3A 4GIZA 1WDNA 4MH5A 3VLUA 5IKBA 1M5FA 3LSXA 1SYHA 1FQDA 3SEUA 3HHFA 4ZECA 5CBSA 2DXYA 3GBAA 5CMCA 2V3UA 1UIVA 2O1LA 3VV5A 1MXZA 2XXIA 3FJMA 1A8FA 4PFWA 1BP5A 5KCJA 3MAMA 1OVBA 1MM6A 3K01A 3U93A 2QJEA 1Y4CA 5CMMA 4QFOA 2X26A 4LVQA 3CSBA 2OWTA 4FORA 4YICA 3PPRA 5I57B 1YCJA 4JSOA 1B5IA 4X1DA 4F31B 2B3BA 4GFRA 4GXAA 2PBWA 3OXNA 3K6XA 5ELVA 3RT6B 2UVJA 3OMBA 5DYHA 3FV2A 2VD3A 2XXRA 3EHSA 1FTMA 3CVGA 4C1TA 3RN8A 3RTWB 5ISUA 4JBZA 3MWBA 2V3QA 3ONMA 4GRKA 4H1XA 1SDXA 2VGQA 1XVYA 3MP6A 1NKXA 4OEVA 5I59B 3M8UA 3PMVA 4BDOA 5H8HB 3SEWA 2VP1A 2XXUA 1H43A 3A3UA 2XX8A 2IEEA 4RPOA 1IXIA 1DTZA 3H06B 4FEBA 5CM6A 3TMGA 4H5FA 3OSRA 3KOTA 4DCYA 2B3FA 4LZ5A 4DIGA 2Q9TA 4R72A 1TWYA 4DDDA 3DLNA 2AL5A 4ZE9A 3IK6B 5CMKA 3TELA 1POY1 4OFOA 1P1WA 4U1OA 4C1UA 1NMUA 3MC2A 1IUDA 4KPTA 2UYEA 3B6QA 3EQ1A 3T93B 3E9XA 4U23A 4BDNA 3ZKLA 3G3IA 5B70A 3L6HA 4IB2A 2VD2A 1HSJA 1FQEA 3FV1A 2NXOA 4R9FA 1MQJA 4GVOA 3FATA 4I62A 5TPAA 3UORA 1LAGE 2CMOA 3SETA 1H3DA 3QUFA 4P0IA 3C9HA 3K6VA 2BJJX 4ZEKA 1OVTA 2H25A 3ILTB 3IJXB 4GXSB 1QVSA 2I6EA 4XKPA 3KN7A 1B1HA 4FATA 1IIWA 3CI8A 2Q2AA 2DP8A 1B40A 1S7YA 5JTYA 3KBRA 2HEUA 1VR5A 3PUXE 1P1OA 2ZNTA 1B51A 4XTCQ 3K2DA 3HHGA 4PFTA 5I2NB 1UTHB 3K1MA 4R6KA 1JW5A 3FZVA 2Q88A 2Y7PA 4DXBA 4OEUA 4THIA 1XC1A 4OETA 1LGBC 2PYYA 3UN6A 3KSJA 5JEIA 5H8FB 3UGWA 4X9TA 2A5TB 4F22A 3RTFB 4R75A 1B2HA 3OEKA 2H5YA 3IOTA 3QAXA 3VXBA 2DYXA 1PB7A 4YB6A 5HBCA 2QSXA 1JW4A 4RA1A 3LR1A 1Z7ME 1VSOA 3TQWA 3RLFE 3KJTA 2V93A 3E13X 1Y1MA 2G93A 3PPQA 3G3HA 2H4IA 1ZU0A 2UVIA 3PPNA 3C32A 4NF6B 1TXFA 4KYDA 2GHBA 1Y4TA 3Q25A 4YAHX 5CRYA 3HCQA 5DEXA 5DVJA 2P1SA 4I8CA 4NWDA 4ECFA 2UXAA 4OFLA 3QK6A 2QS2A 1O64A 1P1UA 4YKIA 5I57A 2F78A 3AXFA 1LB9A 3PGFA 4BDQA 2DVZA 3G7WA 3OOAA 3MQ9A 3R7XA 4U21A 4F1UA 1L5TA 5AA4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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