5H8HA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
b'DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA02
4X9TA 4E0XA 1MXVA 1PBPA 3ZS6A 5ITOA 1R9QA 1SDXA 2NOOA 4P0GA 1NL5A 1NNKA 4I8CA 1IEJA 4R9GA 3KOSA 3SDFA 2UXAA 4NTLA 2XXXA 4BDRA 4QFKA 3O6GA 3TKDA 3QXMA 4K3FA 2UVJA 2ZNSA 4RY1A 1CE2A 2QS2A 3GXAA 3VV5A 2Z8EA 3FVNA 3UORA 1JW4A 3O66A 3DP4A 3DP8A 3PD9A 5K2XA 3DM0A 5HBCA 2NUVA 2PT2A 5H8SA 2XX7A 1PDAA 4OYVA 5KZTA 4YAHX 2DP8A 4NF4A 3SEWA 4EQBA 2XHDA 3H03A 1O7TA 1URDA 1QUKA 4OVJA 1UIVA 4BDNA 1QKBA 4QSCA 5L9MA 1ZMGA 2PVUA 1GTKA 4YU0A 2VHAA 4G8MA 3PGFA 3TODA 1KWHA 3FXRA 4LUBA 5EHSA 5H8FB 5H8NA 2GHBA 3V5AA 4G2ZA 3B6WA 1IXIA 2I0CA 3H6VA 5I2KA 1B3LA 3H6WA 1FQDA 4RPOA 3S2VA 5IAIA 3R6UA 3KGCA 4U1OA 1OIBA 3G3HA 5FHOA 3KG2A 3QYTA 2UVHA 4QFPA 1NNTA 3IOWA 3VE1B 3CFXA 3UGWA 4JB7A 3PPNA 3UK4A 1P1WA 4DLDA 5AA4B 2I48A 1GV8A 2XXWA 5ICQA 1B3EA 3U72A 4GIZA 3SEUA 3UIFA 4F3GA 3VFJA 5DEXA 1LB9A 1MQJA 3K02A 3PV0E 1BLFA 5EHMA 1BKAA 1XS5A 1FW0A 2Y7IA 5I56B 1WVJA 2XXVA 1I6BA 2Q2CA 3K6WA 1MQGA 3RY3A 2XXHA 1B58A 1ZIUA 2QMXA 4RYAA 3MVYA 3M3FA 4ZEDA 2RC8A 3HV1A 1AH5A 5LOMA 1H76A 1SW5A 3P7IA 4XKQA 3TTRA 3QAXA 4IO6A 2F34A 3E9XA 4WXJA 4RNSA 4NWDA 2UYEA 5A5XA 4OETA 3OSQA 4DDDA 4OEUA 4F3BA 3QUJA 1VE4A 4OERA 3TEPA 2YLNA 1P1QA 3BFTA 2Y7KA 2GH9A 4YB6A 3QK6A 4X1DA 4YB5A 4X1BA 1B5JA 4JWOA 3RTFB 4GL0A 2F7CA 4YKPA 3K6UA 1F9BA 1JVXA 4R6YA 2RC9A 1MQIA 1OQHA 3B6TA 2DVCA 3EPEA 4YMBA 2ESNA 1BP5A 3E4RA 4EXLA 4DCYA 2Q9TA 3U93A 1OLAA 1MXWA 2V3UA 3CRBA 2D21A 3H06B 4I62A 3PUVE 4NF8A 4PFTA 4RPNA 4QF9A 1DMBA 1JVYA 3TTNA 1XVYA 4R2BA 2UYFA 4JXIA 2B3FA 1LAXA 4IGTA 3A3UA 4LP2B 2V84A 2F6PA 3BFUA 1B3FA 3IO6A 4XXUA 2F36A 1GVCA 5FTIA 1IXGA 2Q2AA 2XXYA 5I58B 3UA8A 5KDTB 3MC2A 4G68C 2DS9A 1Y3NA 3FXUA 4FIMA 2H9BA 4TOZA 5K2YA 1H44A 1MQHA 4NF5B 2I4CA 1B7HA 3M3KA 2FA7A 4ZZAA 2OBGA 3C4MA 3RTWB 1USYE 4G77A 3KN8A 3HHFA 3O6IA 1GGGA 2DQVA 5DVIA 3TMGA 1QUIA 3HCQA 4NF6A 1I69A 5ISUA 3TTKA 4P11A 5KCJA 1UIUA 1MXXA 3MBPA 4H5FA 1SD3A 4PQJA 2H25A 1AIVA 1EH3A 1H3DA 4RJZA 4BDMA 1QVSA 2XXQA 2Z23A 3PMWA 3N26A 1FTKA 1MH3A 3PPQA 3GBBA 1N84A 3THIA 1Z7NE 2QPQA 1B5HA 1S9TA 3T93B 4L17A 1B4HA 1LFHA 3VVEA 1ZTYA 3ZKKA 3PUYE 1IUDA 4F3SA 1Y3QA 1QW0A 3N6UA 1IIWA 4F39A 4G8HA 3DP6A 1FQEA 1M5CA 2Q88A 5H8QB 4EQ9A 2F8DA 2QRYA 4HTGA 3SETA 4DIGA 2HXWA 1GR2A 2Q89A 1LAGE 3KFMA 3RT8A 2Y7PA 1QULA 4QFLA 4BDOA 4FORA 3RNNA 1UQWA 2ONSA 1N7WA 1N76A 4YKKA 2Z22A 1LAFE 1T0KA 4JDFA 3IJOB 5DT6A 1NNFA 3USDA 2G29A 1A40A 4TLMB 4F22A 4DXCA 4U4SA 4KFQA 2ZYOA 3TQWA 2DWJA 3MW0A 3TCFA 1P99A 4POWA 3IR1A 1POTA 3I3VA 4FE8A 3HO7A 3CFLA 2P0SA 4C1UA 4QFOA 3Q28A 4KHZE 3IB1A 3CVGA 1HSLA 2XD2A 1MXZA 2ZNUA 3W9WA 3OOAA 5H8HA 4THIA 1IQ7A 3JZJA 2HAVA 2AL4A 4F29A 1URGA 3PUWE 1R9LA 2XXTA 4ZDMA 3ODBA 4KYEA 2XXPA 2HEUA 2QMWA 4PE5B 5I59A 3CG1A 1D3KA 1IZ1A 5JTYB 2A5TA 1RYXA 1EZPA 3S4UA 3VDFA 3JV9A 5F1QA 2OWTA 3IL1B 4ELRA 5JK4A 4M4GA 5CMCA 3M8UA 4ZS9A 4HCWA 1SW2A 1FQAA 4DCXA 3OO9A 3OENA 3G3FA 4PFUA 4C0RA 3FJMA 5M2VA 2I3WA 4IY6A 4QRZA 1S50A 3O6HA 2YPNA 3O9PA 1SI0A 3IB0A 3PPRA 1NKXA 1SQYA 3BBRA 2XXRA 1MM6A 3C31A 1EZOA 3MZ1A 3FV1A 3PMXA 2FNCA 4ZE8A 2F78A 4AB5A 3KJ7A 4UA8A 2OJTA 4F2OA 4POXA 4GOTA 3T9VA 1DPPA 3FVGA 4OQOA 4E0WA 2DVZA 4UACA 1FTJA 4KCDA 3MUQA 5H8FA 2E0SA 3MPLA 1LSTA 1MH4A 3OEMA 4LZ7A 1J1NA 4NF4B 1II5A 3MQ9A 4MFIA 1B05A 1IITA 4FJPA 5IKBA 2B65A 2IA4A 3T9HB 3S9EA 2FYIA 1MPCA 1VFDA 1LFIA 2AIXA 4JSOA 4BLAA 5H8NB 2DOJA 2RINA 3CFZA 1JEUA 4GQOA 1I6AA 4OENA 3L6HA 1N7XA 4H5GA 4OFLA 5I2KB 1B7ZA 1MPDA 3TAJA 1M5DA 4C1TA 4PFYA 3PUXE 4NMYA 3LBSA 5TP9A 2THIA 1US5A 3JYRA 3FD3A 5TU0A 3EHUA 2H4IA 1PB9A 5AE4A 3TCHA 1YCJA 4ELPA 1URSA 1NMUA 5FHMA 2M8CA 3H6TA 1UTHA 4U1ZA 4IO2A 2ONKE 3G3KA 4OHNA 4IO5A 2VGQA 3I6VA 1PC3A 3EN3A 5DEXB 2HCAA 4G68A 2LAOA 3CG3A 3FXQA 2Y7RA 4AB6A 1WODA 1SYIA 2DXYA 2PT1A 4DE8A 4JWXA 3FVOA 4IY5A 4FATA 2F7BA 3PU5A 4DXBA 1B9JA 4F19A 3RN8A 1LGBC 1TT1A 2PBWA 2GFEA 4R75A 3C36A 2QSXA 3SEXA 2O84X 2BJJX 1MPBA 1B46A 2PYYA 1AOVA 2VP1A 1BIYA 4U2RA 4MH5A 4QSEA 1B0HA 1B7UA 4IO3A 5EYFA 4KQPA 1B40A 4Z7EA 1PBQA 1TWYA 1D9VA 2D3IA 4YB7A 3EHTA 1Y3PA 3K1NA 1XOCA 3DLNA 2WKYA 4R9FA 2ZNTA 3KN3A 3M3LA 2R71A 1ZU0A 3H4ZA 4QSDA 3VVDA 3VLUA 1NH8A 3EHSA 1POY1 3EQ1A 4F18A 3FUZA 4ISUA 3O29A 3RGYA 2OCUA 1YAEA 4GRKA 1ATGA 4KCCA 2XX8A 4M1VA 4BDLA 3QIMA 5TPAA 4AQ4A 3PPOA 1FTMA 4FECA 3OO7A 2A5SA 3RLFE 1N04A 4YKIA 3VVFA 3TFLA 2DE4A 2I49A 4TLLB 1HSJA 5B7DA 2O69A 1R1NA 3T9XB 4OZ9A 4O3CA 4WEPA 4P0IA 1CB6A 3L6GA 2ZMBA 3OXNA 4NF8B 1Y20A 3VLWA 3KJTA 2O6AA 4GWOA 3K6XA 5BUUA 1XHYA 5I84A 2QS1A 1H45A 1B4ZA 3FJGA 3U94A 3LSFB 5L9OA 3CIJA 3U8QA 3K01A 2NXOA 2V3QA 1FTOA 3LSLA 3R26A 4F2QA 4Q5TA 1NNPA 2Y7WA 5I2NA 2XX9A 4LQ5A 4MLQA 5CRYA 2I6EA 3H3GA 3KZGA 2REJA 1MXUA 2Q8JA 3D4CA 2O7UA 4F1UA 3O2AA 3Q29A 4ZE9A 5I57A 1VFEA 3BKIB 3T9UA 3Q26A 1M5FA 2ZYKA 3FJ7A 5KCJB 1YPNA 1M5EA 4H1XA 4GXSB 3GLBA 1B6HA 1UTBA 3MZBA 1DOTA 5CMKA 4GL8A 4Q30B 1JW5A 2H98A 3TTLA 3MVWA 3CI8A 4U21A 3SESA 3SERA 1AMFA 2G93A 1B51A 1USYH 4IO7A 1EU8A 4LZ8A 3EF7A 1B52A 3TPAA 3K2DA 3LUYA 3A09A 2F6GA 4XKNA 4YICA 4GXAA 1RKMA 1A7LA 2GHAA 4OWDA 1LCTA 5F7VA 4R73A 1O64A 2OK2A 3SEYA 1IXCA 3MAMA 3MP8A 4HCYA 1ZLQA 1B3HA 4KR5A 3R7XA 1IXHA 3IJXB 2I58A 1PEBA 2F5XA 1OVTA 1JQFA 3RPWA 1LBBA 1SBPA 3QSLA 4NE4A 1AL3A 5AA2A 1JETA 3K6VA 2QL3A 2Y84A 2NWJA 2AL5A 2Z8DA 4LZ5A 3I5OA 1B2HA 4MLVA 2AYSA 2UVGA 1D9YA 3PPPA 3OO8A 4RK9A 4WEDA 1QUJA 4KD5A 1Y4TA 3WAEA 3T22A 3K1MA 3HN0A 3UP9A 5CM6A 3CSBA 2RKMA 3HPIA 2DXRA 4RK2A 1FCKA 3S9LC 2DWIA 4H67A 1OVBA 2RCAA 2VD3A 4O3BA 4FEBA 3PMVA 1XT8A 1LBCA 1N3XA 5AA3A 3FVKA 3W9VA 2O51A 3O97A 2F97A 1B32A 3HSTA 3RQTA 2ALUA 5H8HB 4KI0E 3IOVA 2HZKA 2QS4A 4ECFA 3D4GA 4U4XA 1JEVA 1L5TA 5HM4B 1P1NA 3B7DA 3KSXA 5HPQA 3TCGA 3C34A 3OSRA 4FEDA 3N6TA 4OEVA 3E3KA 1S7YA 4ZECA 3C9HA 1OMPA 1Z7ME 2NVUB 2F35A 3ECRA 4ELOA 2V93A 1P1UA 3MVXA 2CMOA 5B70A 5DYHA 2XXIA 3IO4A 4ELQA 1MDP1 4H8JA 3E13X 2DSFA 3N5LA 4YKJA 2Z8FA 1LB8A 4U22A 4EF1A 2VD2A 4KPTA 1DPEA 4XTCQ 5CC2A 4GF8A 3DELB 3VXCA 4ZZEA 4IB2A 4U23A 4N13A 2DWAA 3OMBA 5CMBA 1D4NA 1Y4CA 3S9MC 3U1OA 1M5BA 4HW8A 3LSWA 5BWJA 3IOTA 3T96B 4IGRA 3LR1A 1MG1A 3K00A 4R72A 1A8EA 3CR9A 1PB8A 5ICTA 2P1SA 3KN7A 3FZVA 2VOZA 4R6HA 3KEIA 3C33A 4EDPA 5L8DA 4ESWA 3IORA 3LSXA 4ZEFA 3IX1A 2X26A 4LONB 2HFBA 5AA4A 1SW4A 2I0BA 1A8FA 4OMBA 1B5IA 4LVQA 4OTEA 2ABHA 3O28A 3G7WA 4ESXA 1SVXB 4LA9A 1TFDA 5ITPA 5J1DA 3LC8A 2QJEA 2HAUA 1N3WA 4Q0CA 1OQGA 1Y1MA 4MF3A 2D5WA 4GFRA 3C35A 4I9DA 2OZZA 4DXUA 4XKPA 1RYOA 1P1OA 2H5YA 4IO4A 5I56A 3RUMA 3K0VA 2H99A 4ND9A 3H7MA 5TP9B 2DYXA 3T66A 2X7QA 1PB7A 2X7PA 3VXBA 3HHGA 3MZ9A 1EZ9A 3IK6B 1TFAA 3FIRA 1ANFA 1MRPA 1DTZA 4OFOA 4N07A 1MQDA 1Y1ZA 1UTHB 1ZKBA 5CBSA 4GVOA 3W15C 4OESA 2QS3A 2R6GE 4HS7A 1SW1A 4Z0IA 2XXUA 2DE2A 4I1DA 3FV2A 1A99A 4G68B 3PD8A 4RXLA 4QFNA 4EUOA 1MS7A 3G3JA 4YMAA 4FAJA 1HSEA 3MP6A 3N94A 3OEKA 5FTHA 3MWBA 3B6QA 3H6UA 1LCFA 4JSDA 2REGA 3MVZA 5A5XB 3K1PA 4LATA 1I6QA 4ZEBA 5CMMA 3SKPA 3OD7A 5DTBA 2O1MA 2W7YA 2HZLA 2CZLA 3VLVA 2O1LA 3TELA 2R9JA 3Q25A 1A55A 3FGSA 2HQ0A 3G3GA 4PETA 1US4A 4OFJA 4MBPA 5AA2D 3ONMA 1LLSA 1MXYA 1MY3A 3MJNA 4R74A 4XIGQ 1DTGA 3PUZE 3TYHA 3G3IA 3V89B 4F1VA 1BTJA 2UVIA 4O3AA 5TPAB 4ZEIA 5I58A 5KDTA 3V8XB 3UN6A 2DE3A 2ZYNA 1SI1A 3GBAA 4XKRA 3OELA 4GD5A 3FATA 3FASA 3ILUB 3KOTA 4NF5A 1FTLA 1FQBA 2V25A 4KYSA 3V83A 4KYDA 1TXFA 1B0LA 4TQUQ 2PX1A 1MY0A 1VR5A 1QKAA 4JWYA 1O63A 1B1XA 2DWHA 2I4BA 2E1SA 3QUFA 1MY2A 4OXVA 4RA1A 2ZYMA 3F11A 4X48A 4NEDA 4PP0A 2XD3A 3MPKA 2KLFA 1LFGA 3TZAA 5FHNA 3RT6B 3WAFA 5AA1A 3C32A 1QJMA 4NF6B 5I2NB 5L9SA 1XVXA 5CI5A 5DVFA 2IEEA 3CSGA 1LAHE 3U92A 5CBRA 1SYHA 3GZGA 4ZEKA 2PMSA 1Q35A 1R6ZA 4EQ7A 1ELJA 5I57B 3K4UA 1MM7A 1NH7A 3SEVA 5JEIA 1MY4A 3ZKLA 5H8QA 4G4PA 4JBZA 2B3BA 3KSJA 2RF1A 2YJPA 3MP1A 1DSNA 3ZSFA 1UTBB 2ZXTA 4F1YA 1WDNA 2I3VA 2GRVA 1VSOA 4NWCA 1MDQA 4WKMA 5DVJA 4G8NA 2O68A 1B1HA 2OLBA 4ONYA 4N6PA 4Q8RA 2RC7A 1A54A 3OO6A 1XC1A 1FQCA 2V3TA 3Q27A 4LQ2A 1YTVA 4BDQA 4DZ1A 2O7IA 1Y9UA 3TQLA 5ELVA 4YZZA 1NFTA 3ILTB 1Q1KA 4H65A 3S9NC 3IOUA 1ZBMA 4H0WA 3AXFA 4R6KA 5AA2B 2RCBA 1JW1A 1B3GA 1OLCA 1H43A 4GLIA 3IB2A 4R2FA 3TTMA 3KBRA 4EF2A 2OWSA 2ONRA 3IAZA 1JNFA 4EXKA 5JTYA 4PFWA 2P2AA 4QHQA 4H8IA 3TUSA 3A3CA 3TDJA 2F7AA 1ZJLA 1FQFA 1MY1A 2ANJA 1N0TA 5I59B 4H6DA 4F3PA 4F31B 2A5TB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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