5H8HA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
b'DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hA02
1N04A 4TQUQ 2XX7A 4U23A 2O84X 4X48A 3KN3A 1YPNA 2RC7A 3VVDA 2R6GE 3G3GA 2XXRA 2XXUA 4U1OA 5H8HA 3SDFA 4KI0E 2QMWA 3FV2A 1FW0A 4H0WA 3O2AA 4EQ9A 1TT1A 3TPAA 4YKKA 4F1UA 5CC2A 3PGFA 4ELPA 5FTIA 5AA2B 1OQHA 4FJPA 1POTA 2O6AA 3IX1A 1XT8A 4U21A 4NTLA 4IO3A 5I58A 4EXKA 1URSA 2QS4A 5I2KB 2OJTA 1MDQA 1Y4CA 3OO8A 3HCQA 3M8UA 4XXUA 3OSQA 4ZEDA 5BUUA 4IO6A 4F18A 3MAMA 4RPNA 4YMAA 1ZU0A 1WDNA 1POY1 4C1UA 2DXRA 4RK9A 2PT2A 3U94A 2XXYA 4IO2A 3TYHA 4X9TA 3CG3A 4WEDA 3JYRA 5KDTA 3TTMA 1I6QA 4QFKA 5B7DA 2DQVA 3C9HA 3KSXA 4IO5A 4YB5A 4F39A 1TFAA 3CRBA 3VLWA 3RT8A 2XHDA 5CBSA 4EF1A 4IO7A 2DWAA 3TCGA 3FGSA 5A5XA 1IXGA 2O7IA 1B5IA 1D4NA 4BDLA 4OVJA 5H8FB 2NVUB 3UIFA 5CI5A 2HAVA 4M1VA 3UGWA 3VLVA 2OWTA 1NNPA 1SD3A 3RUMA 1P1NA 4ZS9A 4R6KA 1B58A 3AXFA 2CZLA 3IB1A 1NNTA 1M5EA 5JTYB 1FCKA 3MVYA 2UVHA 3UA8A 3FJMA 1TXFA 3MPLA 5DEXB 2XX8A 3IB0A 1N3XA 2Q89A 5K2XA 1S9TA 4EXLA 3VV5A 3S2VA 4ZEIA 1SI0A 1ZLQA 3LR1A 2HAUA 3TTRA 1MPDA 1LFHA 1R9LA 4GWOA 4MBPA 4GIZA 4XTCQ 5EHMA 1DTZA 2ESNA 3QIMA 4R75A 1FTKA 2F6PA 4OTEA 4OQOA 1I69A 3A3UA 1GR2A 1J1NA 2Q9TA 1EH3A 1LAXA 1TWYA 2HXWA 3GBBA 1IITA 1XVXA 3HHFA 2I0CA 3OXNA 1SYIA 2ANJA 4HS7A 2B65A 1N0TA 4C0RA 4F3SA 5L8DA 1FTLA 1ELJA 1SW4A 2F6GA 1B46A 4DCXA 2QS1A 4RXLA 4ZZEA 1URDA 2UVGA 3FUZA 3JV9A 3R7XA 2OCUA 3EN3A 4N6PA 4JWYA 3B6QA 5ITPA 4ZEFA 4E0WA 3LSFB 3QUJA 3EHTA 2DOJA 4G68C 3IO6A 5JK4A 3HPIA 2Y7WA 1UTHB 2I58A 2HEUA 4XKRA 5FHMA 4FATA 1RKMA 3PPQA 3IJXB 1FQFA 1MXZA 1QUIA 3O66A 4LP2B 4QFNA 3K1PA 3FIRA 5AA1A 3S9LC 2V93A 4NF5B 1LFIA 1Y9UA 1B7HA 2V3QA 1URGA 4JWXA 4U2RA 1XOCA 3DP4A 5ITOA 1GVCA 4OHNA 5ELVA 1MQJA 3TUSA 1QULA 3KJTA 3TZAA 2H25A 1JETA 4NF6A 4RJZA 3OMBA 3V89B 1GGGA 4H8IA 1OQGA 2ZYNA 3F11A 4OXVA 4F1VA 4X1BA 2Q8JA 4YB6A 5B70A 3IB2A 1LAGE 4EF2A 3H03A 1MG1A 4G2ZA 3RTFB 1NNFA 2I6EA 3N6UA 3PUZE 5I2NB 3KG2A 2V3UA 3THIA 3D4GA 4ONYA 3MZ9A 3QAXA 1SBPA 1BLFA 4N07A 1QVSA 4XKNA 2QMXA 3EF7A 1O63A 4R72A 4BDOA 1MXWA 2P2AA 2H5YA 1VR5A 1B52A 4GF8A 1AL3A 4DCYA 4Q5TA 4KPTA 3GXAA 5I57A 3IJOB 4X1DA 1SVXB 1AH5A 3RY3A 4G8HA 3DM0A 3MWBA 2XX9A 4Z0IA 2DYXA 4IGRA 1R9QA 1N84A 3I6VA 1BIYA 5AA4B 2REGA 4GVOA 4I9DA 2I3VA 5H8NA 4YMBA 1OIBA 1P1OA 3Q26A 3T96B 3BKIB 3RLFE 1OVTA 3H6TA 1MRPA 2VHAA 1MXXA 1M5CA 3G3KA 3SETA 4HCYA 4OENA 1JEUA 5KCJA 4KYSA 2BJJX 1RYOA 2HZLA 3S9MC 3TTKA 2Y7PA 1FTJA 1MXUA 1VFDA 1IXHA 4PQJA 5DT6A 1NKXA 1FQEA 1A8FA 4NF4B 4DDDA 1Y4TA 1USYE 1FQBA 2NOOA 2QPQA 4POXA 1Y1MA 2HZKA 1NFTA 4QRZA 1LCFA 2RINA 3OEMA 4N13A 3FVNA 1AOVA 2PT1A 5LOMA 3C36A 3C4MA 3TODA 4XIGQ 2V84A 4H67A 5AA2A 4K3FA 2DE2A 4MFIA 4OWDA 4QFPA 3KEIA 2B3FA 3OO6A 3IORA 4KYDA 2UVJA 1MQHA 2VP1A 5I2KA 4FECA 3LSWA 4OFOA 4G68B 4QHQA 1LFGA 3QYTA 3HHGA 4QFOA 4TLLB 3GLBA 1B51A 3SESA 1AMFA 3MVWA 4QSCA 3FVKA 5EHSA 3K4UA 3IAZA 3IOUA 3N94A 3PMXA 4RYAA 4FIMA 2RC9A 4YU0A 3IO4A 4ZECA 3PD8A 3QUFA 1LAHE 2ZMBA 4DLDA 5M2VA 3LBSA 3Q29A 4GD5A 2D5WA 3V83A 2FA7A 2Y7RA 4LA9A 1JNFA 1NH8A 3U72A 3PPNA 5H8FA 4XKQA 1PBQA 1Y3QA 4FEDA 1SYHA 3EHSA 3O29A 2LAOA 1NMUA 2G29A 1LBCA 4BDMA 1B40A 4GFRA 1FTOA 3ILUB 1IUDA 5IKBA 4LUBA 3IOTA 2IEEA 3WAFA 3K0VA 1Y3NA 3E9XA 5JTYA 3L6GA 1B3GA 3CG1A 3TAJA 1OLCA 5DEXA 5IAIA 2XXTA 1VSOA 4ESXA 1EZOA 1QJMA 2XXXA 3ZKLA 4H5GA 3C35A 3Q27A 1XC1A 3PPRA 3U93A 2A5SA 1H44A 2OLBA 2Z22A 3LSLA 4H65A 3VDFA 4FEBA 3V5AA 2HFBA 1PC3A 4DXUA 1IIWA 4ND9A 2W7YA 3RN8A 4O3BA 3U1OA 3N6TA 3JZJA 3MP1A 3RPWA 1B4HA 4U22A 4IY6A 5ICTA 5KZTA 3G7WA 3MC2A 2G93A 3CFLA 4MH5A 2AL4A 3CR9A 4JXIA 5CMMA 1SW1A 1QW0A 2F7CA 3CVGA 1IXIA 1QUJA 3PUWE 3IK6B 1HSJA 4DXCA 4LQ5A 4QF9A 2WKYA 5H8QB 3TCFA 4GL0A 2Z23A 3UK4A 2YLNA 3M3LA 2Y84A 1B05A 4O3AA 4F29A 3K1MA 2DSFA 3KZGA 4AQ4A 1O7TA 1UTBA 3RT6B 1VFEA 2DP8A 1LB9A 1MY1A 1R1NA 3CIJA 4IY5A 5F7VA 1IEJA 4MLVA 2PYYA 2V3TA 3HN0A 4RA1A 3UP9A 2H99A 2H9BA 3QK6A 5AA3A 2PMSA 3RQTA 4G8MA 2F5XA 3FVGA 2ZYKA 3M3KA 3FXQA 4ZE9A 1CE2A 4R74A 3T93B 4JSDA 1GTKA 4IGTA 5TP9A 3U8QA 4OESA 3MZ1A 1ANFA 3MQ9A 1UTHA 3VVFA 1D3KA 1MY3A 1PDAA 1OLAA 3CSBA 2NWJA 3MUQA 2XXQA 5DYHA 1DMBA 1A40A 2ONSA 4IB2A 3PUXE 1FQCA 3O28A 1H76A 2XD2A 2H4IA 3DELB 4PE5B 3SEVA 1PBPA 4NF5A 5EYFA 1MM6A 1SI1A 5H8SA 4YZZA 4DZ1A 1B1HA 4P0GA 3TMGA 3ILTB 3GZGA 5FHNA 3TEPA 3FXUA 2RC8A 3EQ1A 2DVZA 4P11A 5JEIA 3USDA 3IOVA 5TU0A 3FASA 4R9FA 3I3VA 3S9EA 1ZIUA 2P1SA 2Z8EA 3OELA 1OVBA 1A8EA 4R6HA 4G4PA 2V25A 2UXAA 1SW2A 5I84A 3TELA 4F22A 2DWHA 3K02A 3SEUA 3TTNA 4PETA 2O69A 4IO4A 4R2FA 5I2NA 3DP8A 4KYEA 5DVFA 4GXSB 4JDFA 2DWJA 3TCHA 4RK2A 5CRYA 1JW4A 3IL1B 2F7AA 1LLSA 4RNSA 3TFLA 2R9JA 2Q88A 3B6TA 3OEKA 2XXHA 4I62A 4F19A 3MP6A 4LZ8A 4RPOA 4OFLA 2ZYOA 2DE4A 4NMYA 3D4CA 1AIVA 1UQWA 4ZZAA 4YICA 3PU5A 2OBGA 3E3KA 3HO7A 3K01A 5TPAB 3OOAA 1MY0A 4WXJA 1HSLA 2Y7IA 3BFUA 3PMWA 3KN7A 1USYH 1TFDA 4F2QA 2GFEA 3S9NC 2AL5A 4YKJA 2QSXA 4KD5A 2A5TB 2F34A 1JW5A 3PUYE 4ISUA 3M3FA 2YPNA 4Q0CA 4R73A 1MQDA 3ZS6A 5AE4A 3MJNA 2FYIA 5AA4A 5ISUA 2X7QA 2XD3A 4WEPA 4UACA 5L9SA 3ECRA 4G8NA 2O68A 3C31A 1BKAA 1IZ1A 4NEDA 3W9VA 4EDPA 2QS3A 1H3DA 1RYXA 1I6AA 1F9BA 1NL5A 3MP8A 3MVZA 5I59B 5I56B 1D9YA 1DTGA 1ZJLA 1EU8A 1M5BA 3PPPA 4F1YA 1B0HA 1DOTA 4R9GA 3QSLA 2Z8FA 3K2DA 2CMOA 5DTBA 4JBZA 1ZBMA 3ZKKA 4NF4A 4HW8A 3C33A 1B5HA 3LUYA 3W9WA 5L9OA 5I57B 4ECFA 1B9JA 3PUVE 3SEWA 1SDXA 5HPQA 4PFTA 4F3GA 1S7YA 3G3HA 3DP6A 2Z8DA 2QS2A 5CBRA 2ONRA 2I4BA 1DPPA 4NF8B 3SEYA 4ESWA 3TTLA 1JVXA 4ELQA 3H4ZA 1US5A 3FJ7A 1NNKA 2DVCA 4O3CA 4G68A 5J1DA 4H8JA 3N26A 2REJA 3FJGA 3IOWA 3VLUA 2ZNUA 3BFTA 3P7IA 4FE8A 2E1SA 3PMVA 1PB9A 2PX1A 4ZE8A 4U1ZA 1FQAA 4Z7EA 1IXCA 1Q1KA 2ABHA 5CM6A 4YKIA 1NH7A 2DE3A 2FNCA 1DPEA 2DS9A 1P1WA 4UA8A 3T9XB 1QKAA 2I4CA 2QRYA 2VGQA 2HQ0A 1GV8A 2OZZA 4PFUA 1YTVA 3E13X 1XVYA 4KHZE 3V8XB 1ZKBA 5CMKA 1MS7A 4TLMB 4DXBA 2UYEA 1UIVA 1O64A 3A3CA 4OFJA 1EZ9A 1B3EA 1LSTA 2F7BA 3T9HB 2Q2AA 2ZXTA 2D21A 3KN8A 3QXMA 1MM7A 4GQOA 4BDRA 2AIXA 3EHUA 4F3BA 1JEVA 1B4ZA 1LGBC 1B2HA 1EZPA 2F36A 3MVXA 1Z7ME 1JW1A 5H8HB 4KFQA 4OETA 3O97A 4QFLA 5CMBA 3CI8A 3OENA 3GBAA 5ICQA 3H6VA 3FVOA 1CB6A 1A7LA 1A54A 1B5JA 2XXWA 1MQGA 3SERA 3HV1A 4JSOA 1Q35A 2I3WA 3TQLA 3L6HA 4MLQA 3VVEA 4C1TA 4TOZA 1Y3PA 3R6UA 4JWOA 1BP5A 2KLFA 2GHAA 5I58B 3FD3A 4LQ2A 4DIGA 3UORA 4ELOA 1MY4A 4OEUA 3G3JA 2RCBA 1Y20A 4ZEBA 3PPOA 3W15C 1MXVA 1UIUA 3R26A 3EPEA 4POWA 4F3PA 3LSXA 2O7UA 5H8QA 1LBBA 1MH4A 4JB7A 2ONKE 3G3IA 5DVJA 4H5FA 4KCDA 2XXIA 4OYVA 4OEVA 3TQWA 5HBCA 5KDTB 2R71A 2GHBA 3SKPA 1FQDA 1JQFA 1JVYA 2DXYA 4OMBA 4BLAA 5A5XB 3OSRA 3OO9A 1T0KA 4DE8A 3CFZA 2RF1A 4FORA 4LATA 3CFXA 4PP0A 1LB8A 1MDP1 3FV1A 1A55A 4L17A 5CMCA 4GOTA 3K6WA 2GH9A 3TKDA 4RY1A 2Y7KA 1M5DA 2D3IA 5K2YA 4P0IA 1XS5A 4ZDMA 2NUVA 1L5TA 3FATA 2XXVA 4U4XA 3G3FA 1KWHA 2ZNTA 3RNNA 1N7XA 1QUKA 1YCJA 1PB8A 1B3FA 5FTHA 4R6YA 1Z7NE 4QSEA 2I49A 1I6BA 5AA2D 3KBRA 1B7ZA 3RGYA 2ZNSA 1PB7A 4U4SA 3DLNA 2VD2A 2X7PA 1WVJA 1ATGA 3K6UA 1A99A 1B6HA 4GXAA 2I48A 2F35A 2PVUA 3H3GA 1UTBB 2RCAA 1FTMA 3K00A 3SEXA 1M5FA 3O6IA 3N5LA 3PD9A 1BTJA 2AYSA 3KFMA 4ZEKA 2Q2CA 1P1QA 3I5OA 4LZ5A 2YJPA 2P0SA 1ZMGA 1H45A 4AB6A 3VFJA 1B7UA 2O1LA 3O6HA 2HCAA 5TP9B 2ZYMA 3T22A 3O6GA 4KR5A 4QSDA 4E0XA 3WAEA 1D9VA 4F31B 1B1XA 3A09A 4HTGA 1II5A 3KSJA 3Q25A 4GLIA 2THIA 2QJEA 5TPAA 1DSNA 1MXYA 3KJ7A 2RKMA 5L9MA 3OO7A 1ZTYA 4OERA 4BDQA 1OMPA 3VXBA 4EQBA 2I0BA 2A5TA 4LONB 3Q28A 3S4UA 1N7WA 3H6WA 2OK2A 4PFYA 4BDNA 2F78A 1Y1ZA 4XKPA 4G77A 3E4RA 5FHOA 3CSGA 3BBRA 1VE4A 2DWIA 2H98A 4NE4A 3B7DA 5DVIA 1PEBA 1WODA 1SQYA 3T9VA 2UVIA 1MPBA 4WKMA 3K6XA 1SW5A 2VOZA 5HM4B 3MW0A 1US4A 5I59A 4AB5A 2NXOA 5I56A 4EUOA 3TDJA 4NF6B 2UYFA 4Q30B 4Q8RA 4YB7A 4MF3A 3T9UA 4THIA 3H06B 3K6VA 2PBWA 4ELRA 3OD7A 4FAJA 3UN6A 3HSTA 2ALUA 3H7MA 3H6UA 5F1QA 3ONMA 1YAEA 3C32A 2X26A 4I1DA 4KQPA 2XXPA 3FZVA 1P1UA 4PFWA 2OWSA 1HSEA 3FXRA 4NWCA 2O51A 4H6DA 1MQIA 1LAFE 3RTWB 4YAHX 3ODBA 1IQ7A 4HCWA 3VE1B 2QL3A 4NF8A 1MPCA 2O1MA 2B3BA 4LZ7A 2F97A 2IA4A 4GRKA 1H43A 4NWDA 3T66A 1MH3A 1B3LA 3K1NA 3KGCA 3KOSA 1R6ZA 1S50A 3MPKA 4GL8A 2GRVA 3B6WA 3MBPA 2M8CA 1LCTA 4I8CA 4YKPA 4H1XA 4F2OA 3U92A 1N3WA 2VD3A 3O9PA 4LVQA 3ZSFA 1B0LA 3VXCA 5H8NB 1B32A 1N76A 4R2BA 5BWJA 3C34A 4KCCA 1P99A 2E0SA 1QKBA 3LC8A 2F8DA 4EQ7A 4M4GA 1XHYA 3MZBA 3KOTA 3IR1A 5KCJB 1B3HA 4OZ9A 1MY2A 3PV0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N04A 4TQUQ 2XX7A 4U23A 2O84X 4X48A 3KN3A 1YPNA 2RC7A 3VVDA 2R6GE 3G3GA 2XXRA 2XXUA 4U1OA 5H8HA 3SDFA 4KI0E 2QMWA 3FV2A 1FW0A 1NUZA 3A29A 4H0WA 4HE1A 3O2AA 4EQ9A 1TT1A 3TPAA 4GWWA 4AS4A 4YKKA 4F1UA 5CC2A 3PGFA 4ELPA 5FTIA 1EYKA 4MNPA 1OQHA 5AA2B 4FJPA 1POTA 2KQZA 2O6AA 3IX1A 1XT8A 1FRPA 5ET6A 4N6DA 4U21A 4NTLA 4IO3A 5I58A 4EXKA 1URSA 2F3BA 2QS4A 5I2KB 2OJTA 1MDQA 1Y4CA 1KA0A 3OO8A 3HCQA 3M8UA 4XXUA 3OSQA 4ZEDA 5BUUA 4IO6A 4F18A 3MAMA 1YZ0A 4RPNA 4YMAA 1ZU0A 1WDNA 1POY1 4C1UA 2DXRA 4RK9A 2PT2A 4I40A 3U94A 2XXYA 4IO2A 3TYHA 4X9TA 3CG3A 4WEDA 3JYRA 2XXKA 3IFCA 5KDTA 3TTMA 1I6QA 4QFKA 5B7DA 2DQVA 3C9HA 3KSXA 4IO5A 1IMDA 4YB5A 1TFAA 3CRBA 3VLWA 4F39A 3CHGA 3FXBA 3RT8A 2XHDA 5CBSA 4EF1A 4IO7A 2GQ1A 2DWAA 3TCGA 3FGSA 5A5XA 1IXGA 1FPEA 2O7IA 1B5IA 1D4NA 2VPNA 4BDLA 4OVJA 5H8FB 2NVUB 3UIFA 5CI5A 2HAVA 4M1VA 3UGWA 4NX1A 3VLVA 2OWTA 1NNPA 1SD3A 3RUMA 1P1NA 4ZS9A 4R6KA 1B58A 3AXFA 2PFZA 2CZLA 3PTYA 3IB1A 1NNTA 1M5EA 5JTYB 2V4CA 1FCKA 3MVYA 2UVHA 3UA8A 3FJMA 1TXFA 3MPLA 5DEXB 2XX8A 4N15A 3IB0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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