5H8HB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 77
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hB02
3ODBA 1Y1MA 3CG1A 1JW5A 2CZLA 2B3FA 4PETA 1FW0A 3W15C 1JQFA 5KCJA 1IZ1A 1B4ZA 1ANFA 1AL3A 1Z7ME 5I2NB 4YKKA 3R26A 4ZZAA 1R6ZA 2ONSA 3Q27A 5HBCA 4IY6A 3ZKLA 4FJPA 2I48A 1B32A 1BLFA 2XXTA 3FIRA 5CI5A 1Q35A 4R6KA 1JETA 2DS9A 2REJA 3CFZA 3IJXB 4Z0IA 4Q30B 4O3AA 3JV9A 3G3JA 4F19A 3MBPA 2OWSA 3FV2A 3FJMA 3T96B 1B3LA 1AOVA 3O6HA 1N3XA 3VVFA 1P1NA 2DWAA 2H4IA 1F9BA 3I3VA 4OFOA 2RCAA 5J1DA 4ZZEA 2DWIA 2IEEA 3MVZA 1TT1A 4NF5B 2Q9TA 3FASA 5TP9A 2I4BA 3THIA 3TTMA 3MPLA 3PPRA 3RLFE 3O29A 3HCQA 5CBSA 1R9LA 4LATA 3MVYA 4DZ1A 1NNKA 3KOTA 5EYFA 1MPBA 2UYFA 1QULA 4FAJA 4N6PA 3TTLA 4BDLA 4DXCA 4YMBA 1XHYA 4UACA 2Y84A 4F3SA 3BFTA 4O3CA 4C1TA 3MJNA 4BDMA 2F7CA 1Y4CA 1S9TA 4IGTA 1HSJA 4I8CA 1QVSA 3C33A 1FCKA 5I56A 1P1OA 3K1PA 3KEIA 1DTGA 3SKPA 2F5XA 2XHDA 2ZYOA 3H6TA 4ZDMA 5JTYB 2DYXA 1ATGA 2I49A 4GXSB 3ZSFA 3MWBA 4ZS9A 1S7YA 4KR5A 3BKIB 1ZU0A 5ITOA 1DSNA 1VFDA 4QFKA 2XXYA 5TU0A 2UVJA 2XXVA 2Q88A 1H76A 4H65A 2D5WA 3LSWA 3W9WA 3VV5A 2I3VA 4G8HA 1T0KA 4R72A 1TWYA 2Y7IA 3QUJA 4YKPA 4OEUA 4RA1A 4O3BA 2O84X 1BTJA 2UVGA 1OMPA 5I59A 3VXCA 4ZE8A 4H8JA 1WDNA 1NMUA 1DMBA 4RJZA 3LR1A 4YU0A 3FZVA 1B05A 2V3TA 4JWOA 2OLBA 2VOZA 4N13A 3FD3A 4YKIA 1FTJA 2NOOA 4UA8A 4LUBA 3Q25A 4F22A 2NXOA 2GH9A 4QSEA 1P1UA 3RT6B 3T22A 5ISUA 2VGQA 1OIBA 2O69A 4QRZA 4E0XA 5B70A 2XD3A 3IK6B 3G3KA 2F7AA 2XXQA 1JW4A 3MP6A 3U8QA 3N26A 4EDPA 2XXIA 1L5TA 5AA2B 5DTBA 3KN3A 3UIFA 5DT6A 4KQPA 4AB5A 3MPKA 4JB7A 1B46A 3S9LC 3H7MA 4JSOA 2A5TA 2QMXA 5BWJA 3FVKA 4OWDA 2Q8JA 3O6GA 4G8NA 2ZNUA 2DVCA 2DQVA 5KDTB 1D3KA 4KCDA 1NNPA 4FEBA 4ECFA 2PMSA 4H8IA 4P0IA 1QJMA 4OESA 4Z7EA 1B3EA 3B6WA 2B3BA 3M3LA 4OXVA 4ELRA 3CSBA 3QAXA 1M5FA 1MH3A 3DP8A 4ESWA 3LC8A 2DWHA 4YB5A 1EH3A 4YICA 1JVYA 3GXAA 2D21A 4Q0CA 1QKAA 3PD8A 3ECRA 5DEXB 4BLAA 4LVQA 4FEDA 1GV8A 1B58A 4F1VA 4I62A 3SDFA 3Q29A 1AH5A 3N6UA 3VLUA 2ESNA 5KDTA 4ZE9A 3PUYE 1ZKBA 2H99A 3K01A 5H8QA 4HS7A 1N7XA 1SYHA 3LSXA 2QPQA 4LZ7A 3TFLA 2ZNSA 1D9VA 3IB0A 1EZPA 2OCUA 2F78A 4QSCA 1A8FA 3A3CA 2RC7A 4F39A 1IIWA 1MXVA 4ELOA 3AXFA 5H8FB 3IAZA 2X7QA 5DVIA 3FJ7A 4BDOA 1N76A 3FGSA 3PUZE 4YAHX 1WVJA 2PX1A 2Q2AA 1SW2A 2Y7PA 4IO2A 4NF6B 2QS4A 3A3UA 5I2KB 1JW1A 4LZ8A 4G2ZA 2AIXA 2R9JA 3VFJA 4HW8A 3V5AA 1QW0A 1FQBA 4KYSA 5AA3A 4ZEBA 1LFGA 3VVDA 3OEMA 1GVCA 1FTKA 3U92A 2D3IA 4E0WA 1H45A 4GFRA 3CSGA 5H8FA 1N3WA 2KLFA 3MVWA 3S9MC 3RGYA 1VR5A 4F3PA 1USYH 1MPDA 2HAUA 3TKDA 4BDQA 4NF6A 3N6TA 1Y9UA 2XXHA 1IEJA 2XX8A 4R74A 3MUQA 3SESA 3QK6A 1H3DA 5ELVA 3USDA 2HEUA 2I4CA 2O1LA 2OWTA 3D4CA 1XOCA 2AL4A 2V84A 3PUVE 5A5XB 2F6PA 3VLWA 4HCYA 3MZ1A 4EXKA 5FHMA 1B51A 3CIJA 3EF7A 4F31B 3C31A 3IX1A 2F8DA 3TQLA 4OTEA 3VLVA 4ELQA 1MY0A 3IL1B 3V8XB 4OMBA 4R9FA 1Y3QA 5ICQA 4OYVA 2H9BA 1IITA 3JYRA 3K0VA 2HQ0A 3L6HA 2QJEA 1US4A 2V3QA 5A5XA 3MW0A 3M3FA 2HZLA 1JEVA 3BFUA 4U4SA 4ZECA 1PEBA 2Y7WA 5HPQA 2G93A 2ONKE 4EQ9A 3O66A 1LGBC 3T9VA 2DOJA 3G3IA 3KN7A 1NFTA 4AQ4A 4ISUA 3F11A 1LB9A 1NKXA 4PFTA 1FQDA 1XVXA 1J1NA 1A8EA 1Y4TA 3KGCA 2R6GE 1HSLA 4OVJA 2F36A 2QS3A 3A09A 2DE2A 2WKYA 5DVFA 3UK4A 4MLVA 2F97A 3DELB 4F2OA 3K1NA 3LSFB 3UA8A 1Y3PA 3HN0A 1IXHA 3UGWA 3S4UA 1MM7A 3TZAA 5I2NA 3TTRA 3OO8A 3MVXA 3CFLA 3OO6A 5B7DA 3M8UA 2PBWA 4Q5TA 1MM6A 2O51A 3IO4A 2NUVA 4OENA 4GL0A 4ELPA 1Z7NE 5FTIA 1BP5A 4R73A 3KBRA 3U1OA 5DYHA 4IO5A 2VHAA 2P2AA 5AE4A 4GIZA 1FQCA 4H1XA 4LQ2A 1MXXA 1NH8A 3FXRA 3V83A 1M5EA 3U72A 1LAHE 2DWJA 4K3FA 3TAJA 1URDA 1OQGA 3OEKA 1MG1A 4JSDA 5I84A 1WODA 2Z8EA 1FTOA 4KCCA 3RQTA 1B3GA 3PUWE 4WXJA 4KYDA 3RY3A 1POY1 2XX7A 5CC2A 5LOMA 4U22A 1I69A 1GGGA 4FATA 4NF5A 5L9SA 3H3GA 1ZJLA 1OVTA 1N04A 3QXMA 3O2AA 3U94A 3HHGA 3HPIA 4MBPA 4DLDA 1OLCA 4LQ5A 1AMFA 3FVGA 4RPNA 3OELA 4G77A 3G3HA 5CMBA 3OO9A 4QFLA 3RTFB 1VFEA 1B1XA 2O68A 3GLBA 3L6GA 2VP1A 1FQAA 1VSOA 1S50A 4I1DA 1Y20A 3TDJA 4NMYA 2XD2A 3LBSA 1PC3A 3EN3A 4GWOA 4JXIA 4GL8A 4U4XA 4EQ7A 5I58B 1M5BA 2QSXA 2VD3A 1QKBA 3G7WA 2OK2A 2UVHA 4ND9A 4JWXA 5JTYA 1LB8A 1MRPA 1B5HA 3TMGA 3HSTA 3K02A 3U93A 1URSA 1OQHA 1B7HA 5EHMA 1B3HA 2Q2CA 1M5CA 1QUKA 3DP4A 2UYEA 4IO3A 3KZGA 4NTLA 1SI0A 2QL3A 2OBGA 4XTCQ 4DXUA 5I58A 3RT8A 1PB9A 3OOAA 1UIVA 5K2XA 3V89B 4QFOA 4THIA 1US5A 4QHQA 1SYIA 1TXFA 3JZJA 4RK9A 4EF1A 4XKQA 2O7IA 2GHBA 4L17A 4XKNA 1I6QA 3MC2A 1LAXA 1EU8A 1MY2A 3UN6A 3OO7A 1ZIUA 1ZBMA 3K1MA 4KHZE 2QRYA 4KYEA 2YLNA 1B40A 5L9MA 3QSLA 3OSRA 3KN8A 4KPTA 4OETA 3CVGA 3WAEA 4WKMA 3SERA 1LBBA 4IY5A 5AA1A 2DSFA 1ZTYA 3N5LA 5H8NB 2OJTA 2HFBA 4G4PA 1UTBB 3RUMA 1MXUA 1FTLA 5AA2A 1B4HA 2Y7RA 3C4MA 3C9HA 4C1UA 3TUSA 4XKPA 3E4RA 3DP6A 4U1ZA 4NF8B 4KFQA 1DOTA 2YPNA 2AL5A 4BDNA 3PMXA 4F1UA 1N7WA 1N84A 2G29A 1LFIA 4ZEDA 1O63A 2Z22A 1Y1ZA 1SVXB 4DE8A 3KFMA 4WEPA 5AA4B 2A5SA 1RKMA 3K6UA 3TCHA 2I58A 1UTBA 3T9UA 3IOWA 4G68B 4DDDA 2XXUA 3KG2A 5JK4A 3T66A 1MY1A 3O28A 4IO7A 2HXWA 2P1SA 4H67A 4GXAA 4MH5A 3W9VA 2E1SA 1A7LA 1LAGE 3EHTA 3SEUA 2QMWA 5BUUA 3FATA 1PDAA 2RKMA 4NF4B 5F7VA 5DEXA 4C0RA 4U1OA 3O9PA 2YJPA 3TTNA 1RYOA 1KWHA 2ALUA 1B9JA 4GQOA 3C36A 3KJ7A 3H6UA 3IO6A 4G68A 2HAVA 4JWYA 1I6BA 1PBPA 4TLMB 2BJJX 4F18A 5CBRA 3DM0A 2R71A 3UORA 3H4ZA 2VD2A 4KD5A 3K2DA 4PQJA 4RK2A 1D9YA 3I6VA 5K2YA 3MQ9A 5CM6A 5H8HB 3CRBA 3CG3A 3I5OA 2QS2A 4IO4A 5I2KA 1LCTA 4NWCA 1UIUA 4F3BA 4ZEFA 3IORA 1P1QA 3TQWA 4DXBA 5ICTA 3RN8A 4GF8A 1SW4A 3OXNA 1D4NA 3SEYA 1OLAA 1ZLQA 3R6UA 2DVZA 1USYE 3WAFA 2X7PA 3IJOB 1LCFA 1A40A 1HSEA 3K6WA 1B7UA 2ZYMA 2I0BA 2PT1A 4X9TA 1A55A 2PYYA 5L9OA 5H8HA 4JDFA 4F29A 4F3GA 2I0CA 4NEDA 5IKBA 5KCJB 1JEUA 1B0HA 2ANJA 2Z8FA 2LAOA 1LSTA 1XT8A 4XXUA 1AIVA 1SDXA 3SETA 3CFXA 3MP1A 4ZEIA 1LFHA 4R2BA 5M2VA 1MQDA 3S9NC 1B5IA 1IXIA 2V3UA 3IOTA 4M1VA 4U2RA 5CRYA 3KSJA 3M3KA 1B5JA 1MY3A 3QYTA 3OENA 1RYXA 2THIA 2XXXA 3HV1A 4GRKA 4IO6A 1B52A 1M5DA 3ZKKA 4QFNA 4RPOA 3QUFA 3B6TA 1MDQA 3TCGA 4G68C 2DXRA 3IB2A 3PUXE 2HCAA 4PFWA 3O6IA 1IUDA 3RPWA 3EPEA 3C34A 3R7XA 4YKJA 3ILTB 1DTZA 3VVEA 2DE4A 1XC1A 5TP9B 3PGFA 4GVOA 3ZS6A 4XIGQ 4NWDA 1MXZA 2HZKA 4JBZA 3B7DA 3OD7A 2OZZA 4H5GA 1MH4A 2XXPA 3CR9A 2IA4A 3FJGA 5F1QA 4OHNA 5CMKA 1POTA 4FE8A 2ZXTA 3TELA 1GR2A 2O1MA 2NWJA 4YZZA 2FA7A 2E0SA 4QFPA 2DP8A 4TQUQ 3K6XA 4KI0E 1DPPA 5AA2D 3T93B 1IXGA 2RINA 2Q89A 2ABHA 3RTWB 3KOSA 4GLIA 3IR1A 5I56B 3VE1B 3PMWA 1P99A 2QS1A 4LA9A 1LLSA 2H5YA 3FV1A 1B3FA 3KJTA 3O97A 3GBAA 3S9EA 4LP2B 3LUYA 3H6WA 3Q26A 3IOUA 3UP9A 2GHAA 1FQEA 1PB7A 4R6HA 4H5FA 5TPAB 5FHNA 4EUOA 2Y7KA 3PU5A 4G8MA 1NNFA 3PMVA 1B7ZA 1YCJA 3GBBA 4R75A 4Q8RA 2XXWA 1PB8A 4YB6A 4AB6A 2UXAA 5I57B 3GZGA 5CMMA 4ESXA 4OFJA 3SEWA 3FXQA 2XX9A 3EHUA 4H0WA 1B0LA 4TOZA 1Q1KA 4EF2A 1MPCA 5I59B 1CE2A 3H06B 4DIGA 2F7BA 5TPAA 2Z8DA 1MQIA 5ITPA 1LBCA 2REGA 4OFLA 4R9GA 2RF1A 1XS5A 4POWA 4X1BA 1JVXA 1UQWA 4P11A 1CB6A 3TCFA 2PVUA 5EHSA 2FNCA 3C32A 4NE4A 4YMAA 1FQFA 3S2VA 1MXWA 4MFIA 5I57A 3H6VA 3FUZA 1DPEA 3ONMA 4YB7A 2ONRA 3TPAA 3BBRA 2B65A 1H44A 1UTHB 1SW5A 2ZNTA 4EQBA 1GTKA 2ZYKA 3D4GA 2O7UA 3KSXA 4U23A 3ILUB 1A54A 1B1HA 1O7TA 4PFUA 2V93A 1P1WA 1OVBA 3RNNA 2UVIA 3T9HB 4RYAA 4QSDA 5HM4B 3VDFA 1EZOA 4LZ5A 2A5TB 1TFAA 1II5A 1EZ9A 1Y3NA 3OMBA 1SQYA 3DLNA 3K4UA 2XXRA 3LSLA 1MY4A 4IGRA 1UTHA 5KZTA 1I6AA 2GRVA 5FTHA 5H8SA 1O64A 2F34A 2NVUB 1SW1A 4DCYA 1QUJA 1TFDA 4HTGA 4F1YA 1IXCA 1B2HA 1MQGA 1MQHA 2M8CA 1MQJA 3IOVA 2DE3A 1NL5A 2I3WA 2I6EA 4BDRA 3OSQA 4R6YA 4FECA 1VE4A 1R9QA 1YTVA 5H8QB 2H98A 1MXYA 1H43A 2FYIA 1QUIA 3E9XA 1XVYA 1MDP1 1YAEA 4OZ9A 4P0GA 3PPOA 2W7YA 3B6QA 2X26A 3IB1A 3H03A 4OEVA 4GOTA 4XKRA 5H8NA 3P7IA 2DXYA 1NH7A 1SI1A 4TLLB 1N0TA 3PPNA 4FIMA 2RC8A 4DCXA 3SEVA 3VXBA 3FXUA 2GFEA 1IQ7A 4LONB 4NF8A 1ELJA 2PT2A 3QIMA 3SEXA 4H6DA 4MF3A 3E3KA 1URGA 1SBPA 4RY1A 4R2FA 2CMOA 4POXA 4X48A 2ZMBA 1MS7A 5AA4A 2V25A 4I9DA 1B6HA 1BIYA 2P0SA 3K00A 1ZMGA 3K6VA 5JEIA 1A99A 2O6AA 3PD9A 4GD5A 4QF9A 3G3GA 3MAMA 4NF4A 4PP0A 3FVOA 4ZEKA 1YPNA 4U21A 3PPPA 3T9XB 4ONYA 5FHOA 2AYSA 2ZYNA 4EXLA 3E13X 3PV0E 4FORA 4F2QA 1JNFA 1LAFE 3EHSA 3N94A 1FTMA 4M4GA 1SD3A 1PBQA 2H25A 4IB2A 3PPQA 3G3FA 3TODA 3MZ9A 4PFYA 2RC9A 3TYHA 5CMCA 5IAIA 3Q28A 4WEDA 4N07A 3FVNA 4OQOA 4PE5B 1BKAA 4MLQA 4X1DA 2F6GA 3CI8A 2RCBA 4RXLA 3TEPA 1R1NA 3HHFA 5DVJA 3TTKA 3EQ1A 4OERA 5L8DA 3C35A 2F35A 4HCWA 3HO7A 2Z23A 1NNTA 3MP8A 4RNSA 3MZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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