5H8NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 83
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA02
4GL8A 4EDPA 2I4CA 3W15C 5LOMA 4NEDA 5I59A 3VVFA 4XXUA 1SDXA 5J1DA 3H6TA 1DOTA 3ODBA 4LZ8A 1ZJLA 5AA4B 1R1NA 1QULA 1AOVA 1B0LA 4KPTA 3MP8A 3LBSA 3PPPA 2UVHA 1FW0A 5DEXB 5AA2B 3E4RA 1SW4A 3UK4A 3S4UA 3VLWA 2DOJA 4Q8RA 2DWAA 4LATA 3W9VA 4Z7EA 2OBGA 4DE8A 3GZGA 4QHQA 2XHDA 3BKIB 4KQPA 1OMPA 4OHNA 1JETA 2THIA 2Q89A 3BBRA 4GWOA 1IXGA 3M8UA 4PFYA 4R2FA 1PB8A 1P1OA 1MPDA 2DVCA 2DYXA 2UVJA 4F1UA 4OVJA 1N04A 4XKNA 3D4GA 4DIGA 3VLVA 2OZZA 4NTLA 3SDFA 5AA4A 2XXWA 5TPAA 3OD7A 2I58A 4G8NA 2GHBA 4N07A 3SEYA 3T9UA 3TCFA 1US5A 3I6VA 1H76A 4IGTA 4YAHX 4RK2A 2GHAA 2NOOA 4ZZAA 4MLVA 1JEUA 4KHZE 3IB0A 1TWYA 4P0IA 3MZ9A 3BFUA 3FJMA 1R9LA 4DXUA 2AL4A 3IO6A 4YB5A 2X7PA 3KN8A 2V93A 1OQGA 5I56A 3A3UA 1IXCA 2DWJA 5KDTA 1VFDA 3ONMA 1QJMA 1I6QA 2NXOA 5FTIA 1B1HA 4PFWA 2HAVA 2XX7A 3V89B 3QUJA 4KI0E 1XOCA 1GV8A 4F2QA 1FTMA 3IK6B 4JXIA 3D4CA 4ND9A 4P0GA 1MG1A 1MQDA 4OTEA 4IY5A 3IOUA 4IGRA 1SYHA 1N7WA 1MY2A 3C31A 2O7UA 3O9PA 2F35A 1ZIUA 4XKQA 4NF4A 4UA8A 1GGGA 4HTGA 4EXKA 1JNFA 4LUBA 5DEXA 5AA2A 1MQHA 4ZEDA 1IUDA 4KFQA 3T9VA 4F18A 2WKYA 4MF3A 1LAFE 1MY3A 1WDNA 3C36A 3KGCA 4G68B 4DZ1A 1AH5A 3HV1A 3TUSA 4G2ZA 4G68C 4FIMA 5CM6A 3T66A 3N94A 3S9LC 3U93A 1M5FA 3CR9A 2ANJA 5I2KA 3OEKA 4DCYA 3P7IA 1A55A 3FXUA 4WEPA 2RINA 3L6GA 4P11A 1MY4A 1Z7NE 2H25A 4OEVA 1MQJA 1B46A 3MZBA 2O1MA 3B6QA 4BDLA 3K1MA 2XXUA 3M3LA 4LONB 5HBCA 4ELRA 3H6VA 3K0VA 4FE8A 1TFDA 4YKJA 1PC3A 2F5XA 1BLFA 3K6WA 5FHMA 1JVYA 1S50A 5ICQA 1H43A 2QS4A 3TTKA 1LLSA 4NF6A 1L5TA 1O7TA 2XX8A 1EZ9A 3MZ1A 3C35A 5K2XA 1A8FA 3A09A 4RNSA 4FAJA 5H8FA 3DLNA 3EPEA 1OLCA 2DSFA 2Y7IA 3E13X 3K1PA 3PUYE 1QUIA 3I3VA 1LAXA 3JV9A 1JW5A 4ISUA 3GBBA 5FHOA 4F3PA 2ONSA 3RPWA 5I58B 2F78A 3G3GA 3TPAA 1D4NA 3EHSA 5ELVA 4ESWA 2PMSA 1DPPA 1B3HA 2I0BA 2RC9A 1YCJA 3LUYA 3MC2A 3PUWE 4NF4B 1ZMGA 5CI5A 3U92A 3WAFA 3S9NC 1QUJA 1FQCA 4OFOA 1XVYA 3R26A 1A40A 2Z23A 4DLDA 3FGSA 5K2YA 2RF1A 3SEUA 4NF5B 3CG1A 3CFLA 1UTHB 4JSDA 5I58A 2VGQA 3TAJA 2PVUA 4JB7A 1H44A 3IAZA 5EHMA 2E1SA 3RUMA 5AE4A 3K6XA 3H4ZA 5FHNA 5H8HB 1LCFA 3PPNA 2ONKE 4PETA 4WKMA 5H8QA 4LZ7A 1SI0A 1XHYA 2OWSA 3PPQA 4L17A 4I62A 1SBPA 3PGFA 3ZKKA 4RJZA 5ITOA 2BJJX 3U94A 2V3TA 4ZEIA 4RY1A 4HW8A 2F8DA 3RNNA 1JW1A 1A54A 3F11A 1NNKA 2ZYKA 2V25A 1PBQA 3FXRA 3K00A 3PD8A 4IO6A 5F1QA 3H7MA 1IXIA 4DCXA 4ZECA 1R6ZA 1T0KA 4OFLA 2RC8A 4POWA 1ELJA 2O84X 3R7XA 3RQTA 1CE2A 4ECFA 1WVJA 4H8JA 3T22A 4ELQA 5A5XB 2DWHA 5EYFA 4DXCA 2UYFA 3U72A 4F22A 2Y7KA 3TDJA 3UP9A 3T9HB 4ZEKA 5DVJA 5F7VA 1ZBMA 3IR1A 1D3KA 3RGYA 4C0RA 4R6YA 3KG2A 4RA1A 2W7YA 1MXXA 5KDTB 3TODA 2Z22A 2XXXA 3MJNA 4RPNA 3KN7A 2Z8DA 4YKKA 1B51A 4R6HA 2HZKA 2HZLA 2P2AA 3TYHA 1FQEA 1EU8A 4OFJA 1KWHA 1LBCA 3SERA 2Y7WA 4R75A 3FJGA 1NFTA 3Q27A 3RTFB 4NWDA 3VDFA 4BDRA 5CBSA 5CC2A 1QW0A 3CRBA 2Q2CA 1O64A 1OQHA 4OETA 3DM0A 2AIXA 1XS5A 4G77A 1D9YA 3SEWA 1ATGA 3I5OA 5CBRA 2ABHA 4LVQA 2ZYMA 5KCJB 3K2DA 5AA2D 1UQWA 5CMMA 3VVEA 4DXBA 2XXYA 1B4ZA 3OENA 3FJ7A 1MXUA 4H5FA 3UORA 1P1WA 1N76A 2E0SA 3SEXA 4GXSB 1AIVA 4OMBA 4G4PA 1S7YA 4QSDA 2ZYOA 5DTBA 1N84A 1I69A 2I3WA 1I6BA 4EQBA 3OO8A 4YICA 5M2VA 3K6VA 4KCDA 1Y1ZA 3W9WA 1IEJA 3RTWB 4KR5A 1SYIA 4H0WA 3FVOA 1LBBA 2XXPA 3FV1A 1AMFA 4ELPA 4QFLA 1IXHA 4ONYA 1Y1MA 3K6UA 4GRKA 4EQ7A 3OMBA 2LAOA 2RKMA 4KYSA 3V8XB 5KCJA 1S9TA 3O66A 5B70A 2PBWA 3PMVA 1B52A 5DT6A 2HFBA 2B3BA 4GOTA 4ZDMA 3N6UA 3KN3A 4U22A 1DMBA 3AXFA 3B6TA 4WXJA 2DXYA 3LSWA 3TZAA 5CMCA 1B6HA 3GBAA 3T9XB 4G68A 1I6AA 2DP8A 1MQGA 3CFZA 3CVGA 3G7WA 3K4UA 4FATA 2V84A 1N0TA 1GVCA 2UYEA 1QKAA 3IOWA 3OOAA 4FJPA 4YU0A 5AA1A 4M1VA 3VXBA 1WODA 4LZ5A 2Y7PA 3KSXA 1MS7A 1XVXA 3OELA 4GLIA 1Y3NA 4YKIA 1A99A 1NH7A 1RYXA 1UTBA 2KLFA 2OJTA 3Q28A 4U4XA 1FTLA 3H3GA 1XT8A 4GIZA 4FECA 3CFXA 4H1XA 4FEDA 3PV0E 4I8CA 4NF8B 1Q35A 5JK4A 3Q26A 1MY1A 1CB6A 3M3FA 1JW4A 4KD5A 3O6IA 3QYTA 2HCAA 2NVUB 3LC8A 4BDQA 2DE2A 3FUZA 3MW0A 1YTVA 1FCKA 2F6PA 1PBPA 3IX1A 4MH5A 4YB6A 2OWTA 3Q25A 4KCCA 3TCHA 1PEBA 3KSJA 3UIFA 1DTZA 4NMYA 3RT6B 1B32A 1EH3A 5L9OA 2DE3A 1Y4CA 4O3CA 1IIWA 4XIGQ 3RN8A 1UTBB 3B6WA 3EQ1A 4R74A 4F3BA 2X7QA 2ZNSA 4TLLB 1LFHA 2NUVA 3FVNA 1A7LA 1OVBA 1Q1KA 4U21A 4ZZEA 4PE5B 5IAIA 1EZPA 4NF5A 3USDA 2XXTA 4NE4A 2DS9A 2QJEA 4GL0A 4RK9A 4YMAA 5KZTA 3IJOB 3RY3A 1P99A 1MXWA 1M5BA 3K1NA 1FTOA 1HSJA 1M5EA 1QUKA 1MXVA 2O6AA 1VFEA 2ESNA 3OO9A 4IO7A 3T93B 3EHUA 2A5TA 3TMGA 3A3CA 4NF6B 5H8NA 4BDNA 5ITPA 2XXRA 4H5GA 3V83A 4XKRA 2QS1A 3TTNA 4R2BA 4ZS9A 2ZXTA 1DTGA 2D21A 1QKBA 1MDQA 4QF9A 3TKDA 1B5HA 1JVXA 2R6GE 3FV2A 2P1SA 1FQAA 4R73A 4H8IA 4F39A 3VLUA 3LSLA 4KYEA 4RXLA 2NWJA 5ICTA 1FQDA 4XKPA 2VD2A 4YMBA 1M5CA 3ECRA 3ILTB 4RPOA 1B7ZA 1Y20A 5I56B 3HCQA 4ZE8A 2PX1A 5I2KB 4EQ9A 3SETA 3MPKA 5I84A 1MRPA 2PYYA 3MBPA 2OCUA 3KOSA 3FIRA 1URSA 3PU5A 1ZTYA 4NF8A 4X1DA 4ZEFA 3EHTA 3SESA 2H5YA 3KFMA 5DYHA 5TU0A 2Q88A 1B4HA 5DVFA 2D3IA 2HXWA 3IORA 5I2NA 2CZLA 2ONRA 4LQ5A 2G29A 5HM4B 1MDP1 2QMWA 2P0SA 3MP1A 3O28A 1UTHA 4G8MA 2O51A 3MWBA 1QVSA 3MVYA 4TLMB 1SI1A 1SD3A 2F7BA 3FZVA 4JWOA 5IKBA 2QPQA 4E0XA 4QRZA 3CI8A 1BP5A 3L6HA 4GVOA 3PMWA 5CRYA 1B0HA 2HQ0A 3TFLA 3TQWA 3TTLA 1H3DA 4OENA 1Y3PA 4U1OA 3O29A 1B3GA 3C4MA 4R6KA 4R9FA 2XD3A 4Z0IA 5FTHA 5BWJA 1SW1A 3IJXB 3PPRA 2H98A 3E3KA 1P1NA 1DSNA 1MXZA 1SW2A 4O3AA 2I49A 1LB8A 4BDMA 4O3BA 4FORA 3PUXE 3K02A 4JWXA 2AYSA 2F6GA 4C1TA 3OSQA 1NH8A 3TELA 5I59B 2DWIA 2H4IA 4OWDA 2ZYNA 3MUQA 4IO3A 4X48A 1DPEA 2GRVA 2Z8FA 3MVZA 4OEUA 2Z8EA 1ZU0A 4F29A 2QL3A 3Q29A 4MLQA 4POXA 2CMOA 4HCWA 5JTYA 2F97A 3G3KA 3O6GA 1NNPA 3GLBA 2PT2A 1POY1 3QIMA 3QUFA 1TXFA 2HAUA 2V3UA 2Q8JA 4IO4A 3VE1B 4EXLA 1FQFA 3OEMA 4ZE9A 3N6TA 2FYIA 3O2AA 1SVXB 3GXAA 3UN6A 1P1QA 3H06B 3JYRA 2GFEA 2I48A 3EN3A 1B1XA 1URGA 4U1ZA 5ISUA 4Q0CA 3CSBA 2I3VA 1LCTA 1D9VA 1N3WA 1MH4A 3FATA 4IO2A 4I1DA 4U2RA 4H6DA 1US4A 2DVZA 1F9BA 2F36A 4K3FA 3O6HA 2R9JA 1NNTA 3E9XA 3G3JA 5HPQA 4GD5A 3DP4A 4WEDA 1OIBA 5EHSA 1Y3QA 1OLAA 3N26A 4THIA 3FXQA 4QFNA 3PUVE 4OYVA 3BFTA 1MH3A 2VP1A 2A5TB 1B7HA 2V3QA 3MQ9A 2RC7A 2ZNUA 3SEVA 3DELB 3O97A 3VV5A 1BTJA 1FQBA 4QFOA 3N5LA 4JSOA 3IB1A 2R71A 1FTKA 2XXIA 2F34A 1PB7A 1VR5A 4F2OA 3TQLA 3QXMA 1SW5A 1UIUA 4JBZA 1MM7A 4H67A 1TFAA 4ZEBA 5JEIA 2UVIA 4BLAA 4EUOA 1GTKA 1MY0A 4G8HA 1Z7ME 1TT1A 3PUZE 2FNCA 3C34A 3VVDA 5TP9A 1ANFA 1B05A 3KJ7A 1MM6A 1H45A 3S9EA 3S9MC 3KEIA 1B58A 4R9GA 1HSLA 1IZ1A 1Y9UA 4AB5A 4LQ2A 2QS2A 5AA3A 5I57A 5CMBA 1II5A 3ZSFA 3ILUB 2QSXA 2A5SA 1VE4A 3HSTA 1B3EA 5A5XA 4HS7A 2YLNA 1N7XA 3IB2A 3QAXA 4U23A 3ZS6A 4JDFA 2XXVA 4ELOA 3LSFB 5TP9B 3DP6A 2O7IA 3KOTA 3QK6A 4OERA 1R9QA 4F31B 1POTA 3MAMA 5TPAB 2D5WA 4OZ9A 5H8SA 2Y84A 2ALUA 2QRYA 2YPNA 3THIA 3HPIA 2UXAA 1FTJA 2PT1A 1URDA 2I6EA 4F1YA 4QSEA 2B3FA 1AL3A 3PPOA 5H8NB 1RYOA 1P1UA 2XXHA 3HHGA 3JZJA 1O63A 2H9BA 2VOZA 4KYDA 4QSCA 4PP0A 4PFTA 2DXRA 3LSXA 1SQYA 2QMXA 1MXYA 3EF7A 1MQIA 4I9DA 4MFIA 3HN0A 1LGBC 4GFRA 4QFPA 4C1UA 3G3FA 2H99A 3R6UA 1ZKBA 2M8CA 4UACA 3IOVA 2ZNTA 3KZGA 2O69A 2AL5A 4GXAA 4X1BA 3RLFE 4IB2A 3QSLA 5DVIA 3UGWA 4F1VA 1Y4TA 1B7UA 2IA4A 2Q2AA 3H6WA 1B9JA 1PDAA 2GH9A 1LSTA 3C9HA 4QFKA 1EZOA 4XTCQ 4PQJA 3OO7A 4DDDA 3H03A 1XC1A 3TEPA 1OVTA 4OQOA 4BDOA 1UIVA 2F7AA 4F19A 5BUUA 2X26A 5I57B 3CIJA 4N13A 3HO7A 3K01A 3FVKA 4EF1A 1NL5A 1B5IA 1HSEA 2O1LA 2VD3A 4RYAA 4ESXA 1LFIA 3C33A 5H8HA 3TCGA 3VXCA 3PMXA 3IO4A 1LAGE 4AQ4A 1USYH 1MPBA 2F7CA 2Y7RA 3IOTA 3MVXA 2DE4A 1ZLQA 2REJA 2RCAA 2XD2A 2XX9A 2XXQA 5L9MA 3U8QA 2DQVA 3VFJA 5B7DA 3DP8A 5CMKA 1USYE 2Q9TA 4GF8A 1RKMA 3OXNA 2FA7A 2B65A 2QS3A 1N3XA 3KBRA 2O68A 3ZKLA 1J1NA 1JQFA 1MPCA 2OLBA 3CSGA 1GR2A 3OSRA 4IO5A 3B7DA 4LP2B 4GQOA 1LFGA 4N6PA 4Q5TA 4YKPA 1B40A 3G3IA 3S2VA 3UA8A 4PFUA 1IITA 1B3LA 3FD3A 1IQ7A 1JEVA 3T96B 3TTMA 1YPNA 3V5AA 3FASA 5L8DA 4TQUQ 1LB9A 4X9TA 2OK2A 5H8FB 3OO6A 3U1OA 1B2HA 1B5JA 3G3HA 3MP6A 5I2NB 2HEUA 1A8EA 1B3FA 3MPLA 3SKPA 3WAEA 3IL1B 4R72A 2I0CA 5L9SA 1YAEA 1NMUA 3M3KA 3RT8A 4JWYA 4U4SA 2IEEA 3FVGA 4EF2A 2I4BA 4H65A 4M4GA 2YJPA 4LA9A 1BIYA 4IY6A 4YB7A 4E0WA 3HHFA 4OXVA 4F3GA 3CG3A 4HCYA 1PB9A 1NNFA 4FEBA 1BKAA 4MBPA 4NWCA 4YZZA 2REGA 1M5DA 2UVGA 2RCBA 3TTRA 2VHAA 3LR1A 2ZMBA 4F3SA 1LAHE 5H8QB 3C32A 2G93A 4OESA 3PD9A 1NKXA 4Q30B 5JTYB 4AB6A 3KJTA 1VSOA 3H6UA 3MVWA 4TOZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FBEA 5J1DA 4LZ8A 1AOVA 1QULA 4IR8A 5AA2B 4O8MA 2DOJA 4Z7EA 1JETA 2Q89A 1PB8A 1P1OA 1MPDA 2UVJA 4XKNA 2OZZA 3SDFA 1FPFA 4N07A 3SEYA 1US5A 1H76A 2GHAA 2NOOA 4MLVA 3IB0A 2QVVA 3MZ9A 1R9LA 4DXUA 5EQ8A 1XOCA 4F2QA 1FTMA 1FSAA 1MG1A 4PDHA 2F35A 1GGGA 4ZEDA 1EYKA 1MY3A 1WDNA 3TUSA 4G68B 1AH5A 4PF8A 4XF5A 4FIMA 5CM6A 3N94A 2ZZWA 5I2KA 3P7IA 3M3LA 4ELRA 4NHBA 2XWVA 1JVYA 5ICQA 3TTKA 4JVDA 1EZ9A 3C35A 4P47A 3A09A 4RNSA 3DLNA 1OLCA 2DSFA 3E13X 3K1PA 1QUIA 1JW5A 1D4NA 3EHSA 2PMSA 1DPPA 1B3HA 2RC9A 5CI5A 3S9NC 4PDDA 2RF1A 3CFLA 1FBPA 5LDZA 2PVUA 4JB7A 1H44A 3IAZA 5H8HB 1LCFA 4PETA 1SI0A 3PGFA 5ITOA 4RY1A 4HW8A 2F8DA 3F11A 1NNKA 3PD8A 4IO6A 4OFLA 3R7XA 5A5XB 1LBWA 5DVJA 5FBPA 2FHYA 4C0RA 1MXXA 3TODA 3MJNA 4RPNA 4XEQA 4YKKA 1B51A 3TYHA 1KWHA 3SERA 2Y7WA 3Q27A 3RTFB 3VDFA 5CC2A 1QW0A 4OETA 2AIXA 1XS5A 1D9YA 3I5OA 1RDXA 2ZYMA 3K2DA 3VVEA 2XXYA 4PCDA 3UORA 1P1WA 3SEXA 4GXSB 1JP4A 4EQBA 2VPNA 4YICA 3W9WA 4PFIA 3RTWB 4KR5A 1SYIA 4H0WA 1LBBA 4ELPA 1AMFA 1Y1MA 4GRKA 2LAOA 1NV7A 4GOTA 2Y5KA 5CMCA 3T9XB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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