5H8NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
b'NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 83
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA02
1DMBA 5FHOA 3H3GA 3O6HA 1URDA 3TTMA 3PD9A 3IL1B 2Y7KA 1LFGA 4DCYA 2QL3A 4ZE8A 4NF4B 1P1OA 4R6KA 3TTLA 4G8NA 3S4UA 1FTKA 1OVTA 1NNPA 4NE4A 5FTHA 1PB9A 2ONSA 4NTLA 5I58B 1MXYA 1EZOA 3RTFB 4N07A 4EF2A 1XVXA 5AE4A 4FORA 2VD3A 5FHMA 3ZKKA 2XXRA 4EQ9A 1AOVA 5I59B 1JEUA 4GOTA 1MS7A 3MAMA 2AL5A 4DCXA 3LSWA 3EPEA 4OEUA 3KN7A 4QSEA 5I84A 1II5A 2DVCA 3WAEA 4F1YA 1FTOA 4F2OA 3E9XA 3IOVA 3PUYE 3MQ9A 4MLQA 2A5TA 2FYIA 2I0CA 2XXWA 1VFDA 3HSTA 3PPQA 2OLBA 4EQBA 3H6TA 3RY3A 3KFMA 2RC8A 2XXYA 5KCJA 2F6GA 1I6AA 2XXHA 4XKRA 3O29A 3TDJA 3HHFA 4QSDA 1B7HA 1H45A 4ECFA 2NVUB 1WODA 4YMAA 1OIBA 2D3IA 1LBBA 4EXLA 4IO3A 3CRBA 3PMVA 2NOOA 2RCBA 2DWIA 2F36A 1YAEA 1Y3QA 1YTVA 5I2KA 1ATGA 2RINA 1LAFE 5L9MA 4F31B 3V89B 3TPAA 3P7IA 3N6UA 5CI5A 1O64A 4MFIA 3IO6A 2O1LA 1H76A 3LSFB 1UTBA 4NMYA 2H98A 4UACA 2Q2AA 4ZEBA 2I3VA 1BLFA 4P0GA 2ZYOA 2DS9A 1QKBA 1JEVA 1B51A 1ZJLA 4ELQA 1R6ZA 1FQAA 2V3TA 1PB7A 5I57A 2DWAA 3E4RA 5H8NA 2HZKA 4GVOA 3VVEA 3FXRA 1MY0A 2DXRA 1M5BA 4QF9A 3LR1A 2XD2A 1BKAA 5CBSA 3MP6A 4QFLA 3L6GA 4R73A 5H8HA 3KEIA 1D4NA 5JTYA 4GWOA 4PP0A 1FCKA 4QFPA 1US5A 4QFNA 2PMSA 4HCWA 4EQ7A 3MVZA 5B70A 4PFTA 1H44A 5AA3A 4ZEKA 4KYDA 3C35A 1NH8A 2GRVA 4HS7A 2Q2CA 1TWYA 4YB5A 3CSGA 3MZBA 4H65A 2YJPA 1USYH 3DP4A 4K3FA 1QKAA 4JWYA 3T9XB 3KBRA 3L6HA 1PEBA 2F8DA 1PC3A 1UIVA 1DTZA 1FQBA 2A5TB 3KZGA 4OFJA 5L8DA 4GRKA 3PUXE 3R6UA 5ICTA 1TT1A 1SI1A 3C32A 1SYIA 3V8XB 5ELVA 5ITPA 3FGSA 1OQHA 1MQIA 4BDOA 1MXWA 3IOWA 4KPTA 1UTHA 2O68A 3H4ZA 2DP8A 5EHSA 3OEMA 4KHZE 5KDTA 3R7XA 3KSJA 3CI8A 4RY1A 3KOSA 4G4PA 5DVIA 2OWSA 4THIA 3FASA 4GQOA 2UXAA 1MPBA 2OWTA 3CIJA 4X1DA 3OOAA 2UVGA 4F19A 1N0TA 3Q28A 3H6VA 4RXLA 4DLDA 2AIXA 3PPOA 4RNSA 3ZKLA 1J1NA 1JVXA 5I2KB 4OESA 4U4SA 4DE8A 4ELPA 3VV5A 4X9TA 1TFAA 4M1VA 3N6TA 4Z7EA 5HM4B 1HSJA 4R74A 1UTBB 3HCQA 1Y20A 3OXNA 2HCAA 3K02A 4IY5A 3IB2A 3T22A 3OSRA 5JK4A 3IO4A 2HAVA 3FJGA 4G8MA 3A3CA 5I57B 3FV1A 4KQPA 5H8NB 3SKPA 4LP2B 4Z0IA 3R26A 5IAIA 4YB6A 4FATA 1DTGA 3CG3A 2Q9TA 5DT6A 5I59A 5H8HB 2O7IA 1IIWA 4IGRA 5JTYB 3N5LA 3S9NC 4O3CA 1N7WA 4GIZA 3K01A 1MY4A 1XHYA 2QS4A 1B6HA 5M2VA 5H8QA 3EHTA 2ABHA 2R6GE 1B0LA 3QAXA 5AA2A 1B05A 2PX1A 2R9JA 1DOTA 3GBAA 2B65A 4EF1A 2VHAA 1QUIA 2V93A 4C1UA 1OLAA 4GL8A 4OERA 3RGYA 4LQ5A 1BIYA 4L17A 3VFJA 2Y7RA 1JVYA 1WVJA 4F39A 1B3LA 2D5WA 3AXFA 1UTHB 4FJPA 3TELA 2I58A 4ESWA 2YPNA 3O6GA 5KDTB 1UIUA 1XT8A 2XXIA 4JSDA 2F7AA 3K2DA 1XOCA 1RYXA 3K6UA 5B7DA 1LBCA 5DTBA 3CG1A 2DOJA 5TU0A 3N26A 1R9QA 3QXMA 1MQGA 4ELRA 3RNNA 2XXUA 4M4GA 4MH5A 3MUQA 2WKYA 1LAXA 3TUSA 3ILUB 2REJA 2XXXA 2DSFA 5IKBA 1QULA 2QS2A 1P1NA 2F35A 4RK9A 4N13A 3OD7A 3H06B 2ALUA 2DE2A 2UVJA 1EZ9A 3SEUA 3DP8A 4ONYA 1SW5A 2R71A 4BDQA 4OTEA 3FJMA 4F2QA 3SESA 4IY6A 2O84X 3ODBA 1IQ7A 3Q25A 4OWDA 1IXIA 3T96B 1BTJA 2VGQA 3VVDA 1POTA 2Z8EA 4ZECA 3UK4A 1LCTA 1XVYA 5L9SA 1N76A 1YPNA 4RK2A 4JWXA 1A7LA 3SERA 1WDNA 3H7MA 3OO7A 1IXGA 4BDMA 1MPDA 1MPCA 1B5IA 5F7VA 2HFBA 2BJJX 3U8QA 4BDRA 5H8QB 3F11A 3BFUA 1NNFA 4Q30B 4R2BA 5CMCA 3G3FA 2NXOA 3LC8A 1Q35A 2Y84A 1NNTA 4BDNA 5AA2B 2QSXA 3PV0E 4X1BA 4R72A 1LGBC 3LBSA 4I8CA 4KCDA 5F1QA 1SW1A 4XKNA 1A55A 1LCFA 3PPPA 4YKJA 3S9LC 3HPIA 3OO6A 4GF8A 3PUWE 1IEJA 4POXA 1UQWA 1Z7NE 1TFDA 3SEYA 2Y7PA 2ZXTA 3MVXA 4OEVA 2H99A 3K00A 4G68A 2FA7A 2PVUA 3C36A 2RC9A 3DM0A 4ZZAA 4Q8RA 4HCYA 3ZS6A 2DVZA 2W7YA 3C34A 1F9BA 4LUBA 3IR1A 3K6XA 2OJTA 3OEKA 2ZYMA 3TEPA 3CFLA 2O6AA 1DSNA 1GGGA 3I6VA 1QUKA 3KJ7A 3MC2A 1LB9A 2G29A 5AA1A 2ANJA 1RKMA 3KN3A 3OENA 2I4CA 1N04A 3EHSA 4F1VA 4F3PA 1SW4A 2GHAA 2DE4A 1AL3A 1MXZA 3K1PA 3BFTA 3BBRA 4ZEFA 3MPLA 4YMBA 2V84A 4GXAA 2IEEA 4IO5A 4NEDA 3CFXA 4MBPA 1B7UA 4PFWA 3SEVA 2QS1A 2I49A 1B1XA 1MQJA 3MW0A 4IO2A 1IZ1A 2OZZA 2QPQA 4U4XA 5TPAA 1EH3A 3O66A 3RUMA 4UA8A 4YU0A 3TFLA 1JETA 1FW0A 5KZTA 1MM6A 2D21A 3DP6A 5L9OA 2F7BA 1N7XA 1NL5A 2DXYA 4LQ2A 1M5DA 4IO4A 3IOUA 4JDFA 4N6PA 1B9JA 1N3XA 1FTMA 4GFRA 2QRYA 4WEDA 1VSOA 1NH7A 2E0SA 3PPRA 1ZIUA 3PGFA 2H25A 2Z22A 4KD5A 5DVJA 3OELA 3QUJA 2V3QA 1PBQA 5HBCA 4OXVA 4ISUA 4I9DA 3FIRA 3K1NA 1OMPA 3V83A 1B5JA 2LAOA 2O7UA 1ZMGA 1B1HA 1N3WA 1LAGE 5CC2A 3VLVA 2NUVA 1IUDA 4H8IA 1LFIA 1DPEA 1D3KA 3FD3A 3G7WA 1A8FA 2AYSA 1MDP1 3B7DA 3UA8A 1FQDA 2RF1A 2V25A 3N94A 4NF8A 3M3FA 2DWJA 4LVQA 4LONB 4H6DA 3QK6A 4JSOA 3FVOA 1B4HA 1Q1KA 4JB7A 4G68B 1MXXA 3ILTB 5AA2D 3ZSFA 4OQOA 3T9UA 5LOMA 2A5SA 3O97A 1D9VA 4OVJA 3EN3A 3KJTA 4OHNA 1B3GA 1S7YA 4AQ4A 5HPQA 4FECA 3SDFA 2RCAA 3VXCA 3MP8A 5K2YA 3RQTA 1LB8A 1B3HA 1M5EA 2DE3A 2XX7A 4KYEA 4YICA 5AA4A 3IB1A 1I6QA 5ISUA 2F6PA 2XXTA 4LZ8A 4X48A 4GLIA 1B46A 1MQHA 1PBPA 4ZS9A 3TMGA 1B32A 4R75A 2HQ0A 1HSEA 1PB8A 3K6VA 3GLBA 4G77A 2UYEA 1MY3A 2ZNSA 1M5CA 1HSLA 3C33A 3PMWA 3H03A 2QS3A 1MXUA 4JWOA 3USDA 1FTJA 5ICQA 4RPNA 5TPAB 1QJMA 1D9YA 1US4A 2QMXA 2VP1A 2ZNTA 4PQJA 4BDLA 3IB0A 3ONMA 4O3BA 3HN0A 4O3AA 2UVIA 3A09A 4H5FA 4F1UA 1SVXB 1JW4A 1SDXA 2H5YA 4G68C 3OMBA 3LSLA 4C1TA 4OETA 2RC7A 3FVGA 5CRYA 3TQWA 3PPNA 3D4GA 2M8CA 1S9TA 1MH4A 2RKMA 1A54A 4WXJA 1MM7A 3G3IA 1SQYA 3VVFA 2B3BA 4YAHX 3UIFA 2P1SA 4ND9A 4FE8A 4NF6A 3CVGA 3RN8A 3T9HB 1B3EA 3QIMA 4BLAA 4NWDA 2YLNA 1SW2A 3TAJA 3W15C 4LZ7A 1P99A 3G3KA 3GZGA 1B5HA 2QJEA 2Q88A 2FNCA 2O1MA 1GV8A 1QVSA 1FTLA 2QMWA 1DPPA 2GHBA 1S50A 1R9LA 4NF8B 1B40A 3KGCA 1H43A 4F22A 2Y7IA 1Y3NA 1EU8A 4FIMA 3OSQA 4WKMA 4F3SA 2PT2A 3TQLA 4RYAA 1MY1A 4NF5A 2VD2A 4QFOA 3QSLA 3ECRA 3GBBA 4FAJA 3MZ9A 3WAFA 5DYHA 2CMOA 3G3GA 4OFLA 1P1UA 3MPKA 1LLSA 3FUZA 5AA4B 5TP9A 4Q5TA 1TXFA 4G8HA 1SI0A 4ZEIA 3VDFA 2XXPA 4PETA 2H4IA 5CMKA 2X7PA 4R9GA 1OQGA 1MY2A 4ELOA 2UYFA 1N84A 4U22A 3K0VA 5ITOA 3BKIB 4YKKA 2I48A 5CMBA 3O6IA 4EDPA 3UGWA 1NMUA 1URGA 3OO8A 2HXWA 3VE1B 1MG1A 3RLFE 4XTCQ 1Y3PA 1B2HA 3IJXB 3MJNA 4R6HA 3TTRA 3E13X 1L5TA 3K6WA 4Q0CA 4FEDA 1IITA 4OMBA 3T9VA 3JV9A 4E0WA 1MQDA 4OENA 4RPOA 1M5FA 3UORA 4OFOA 4OZ9A 2B3FA 3O28A 1USYE 3MBPA 1AIVA 4XXUA 5BUUA 3S9MC 2Y7WA 3U93A 1FQFA 3FXQA 3RPWA 4C0RA 4DDDA 2GH9A 4NF6B 3T66A 4XIGQ 2VOZA 1GVCA 5EYFA 2F97A 2H9BA 3FATA 4U21A 5JEIA 2Q8JA 2PBWA 4PFYA 3RTWB 5J1DA 4KI0E 2ONRA 3H6UA 4U2RA 4U1OA 2V3UA 3KG2A 4U1ZA 2O69A 3PMXA 1Y4TA 4FEBA 3I5OA 4ESXA 1ZTYA 3JYRA 2XHDA 2Z8FA 3TODA 1MXVA 3RT6B 3V5AA 3GXAA 1ELJA 5DVFA 4NF5B 3MWBA 3TTNA 1MDQA 3G3JA 1RYOA 2G93A 3W9VA 3FXUA 1FQCA 1Y9UA 1OLCA 3VLWA 4KFQA 4U23A 1ZLQA 3FVKA 2P2AA 1SYHA 4EUOA 5TP9B 1QUJA 1YCJA 4QFKA 3M8UA 5I2NA 4TOZA 4YZZA 2ONKE 1VFEA 3A3UA 4TLLB 4IB2A 3S2VA 3SETA 4MF3A 3KOTA 1A40A 2I3WA 4F18A 3UP9A 3EHUA 4XKPA 2DQVA 1VR5A 2REGA 3DLNA 3MVYA 4LZ5A 4I62A 4GL0A 3U1OA 1NNKA 2ZYNA 3Q26A 4WEPA 4IO6A 4QSCA 1B3FA 4R9FA 1IXCA 2UVHA 2KLFA 2O51A 5BWJA 3VXBA 4OYVA 2I6EA 3CSBA 3B6QA 1B7ZA 3DELB 4F3BA 3C31A 4H5GA 3KN8A 3HHGA 2XXVA 1ZU0A 4HTGA 4YKIA 1EZPA 1MRPA 3E3KA 2HAUA 4R2FA 1ZKBA 2ZYKA 2HEUA 3IORA 3CFZA 5CM6A 3D4CA 4P0IA 3SEWA 1AMFA 2F78A 3EF7A 2Q89A 5EHMA 5A5XA 4IGTA 1GR2A 1R1NA 3FZVA 3TTKA 1FQEA 3I3VA 2CZLA 3Q29A 2X7QA 1O7TA 1B4ZA 4HW8A 3B6TA 1H3DA 4RJZA 4TLMB 3CR9A 2ZMBA 3THIA 2XX8A 4H0WA 3TCFA 4DXBA 1B52A 1P1QA 2PYYA 2HZLA 4EXKA 1MH3A 4AB6A 5KCJB 1JW1A 4DIGA 3QUFA 2ESNA 2XD3A 1LSTA 4G2ZA 5DEXA 3VLUA 4PE5B 3MVWA 1CB6A 4GD5A 2GFEA 2OCUA 4H67A 1A8EA 1NKXA 3LSXA 2Z8DA 3K1MA 2XX9A 3C9HA 1LFHA 2ZNUA 4JXIA 3MZ1A 3SEXA 5H8FA 3U92A 1Y1ZA 3M3KA 2AL4A 4ZE9A 4MLVA 5I2NB 5I56A 4H8JA 4KCCA 1SBPA 4NWCA 4RA1A 2XXQA 3IAZA 1I69A 4JBZA 3TYHA 1URSA 3EQ1A 2OK2A 2F7CA 2F5XA 1LAHE 1B58A 4NF4A 3HV1A 3PUZE 4F3GA 1AH5A 3KSXA 3TCGA 1KWHA 4YB7A 3FVNA 1T0KA 1NFTA 3H6WA 3W9WA 3B6WA 4KR5A 4DXUA 2I0BA 5I58A 3O2AA 1JW5A 3FJ7A 3C4MA 4TQUQ 4DXCA 3IK6B 1P1WA 4QRZA 4QHQA 3U94A 1Z7ME 1A99A 3PUVE 3HO7A 1BP5A 5CBRA 1QW0A 1Y1MA 4POWA 3OO9A 2E1SA 1JNFA 4I1DA 3IX1A 4DZ1A 5K2XA 2P0SA 3IJOB 3TCHA 1IXHA 1B0HA 3JZJA 1OVBA 2IA4A 1SD3A 3PD8A 1CE2A 3LUYA 5A5XB 1O63A 2PT1A 3FV2A 3S9EA 2THIA 3IOTA 1I6BA 1JQFA 2NWJA 4GXSB 3T93B 3M3LA 3MP1A 5CMMA 4AB5A 1XS5A 2Z23A 3TZAA 1ZBMA 3UN6A 4ZZEA 1GTKA 4KYSA 2DWHA 3RT8A 4LA9A 4PFUA 1VE4A 1PDAA 4F29A 4LATA 3K4UA 5DEXB 2DYXA 2X26A 2I4BA 5FTIA 3G3HA 5FHNA 1POY1 4ZEDA 4IO7A 5H8SA 4E0XA 3U72A 1ANFA 4YKPA 4H1XA 4XKQA 1XC1A 4R6YA 3O9PA 3Q27A 2F34A 3QYTA 5H8FB 4ZDMA 3PU5A 3TKDA 1Y4CA 2OBGA 4P11A 5I56B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2Q2AA 4ZEBA 2I3VA 1BLFA 4P0GA 5IZ3B 2ZYOA 2DS9A 1QKBA 1JEVA 2CZHA 1B51A 1ZJLA 4ELQA 1R6ZA 1FQAA 2V3TA 1PB7A 5I57A 2DWAA 3E4RA 5H8NA 2HZKA 4GVOA 3VVEA 2KR0A 3FXRA 1MY0A 2DXRA 3PTYA 1M5BA 4QF9A 3LR1A 2XD2A 1BKAA 5CBSA 3MP6A 4QFLA 3L6GA 4R73A 5H8HA 3KEIA 1D4NA 5JTYA 4GWOA 4PP0A 1FCKA 4QFPA 4LN5A 1US5A 4QFNA 2PMSA 4HCWA 4EQ7A 4MCOA 3MVZA 5B70A 4PFTA 1H44A 5AA3A 4ZEKA 1LEVA 4KYDA 2B4MA 3C35A 1NH8A 2GRVA 4HS7A 2Q2CA 1TWYA 2ZZWA 4YB5A 3CSGA 3MZBA 1KZ8A 4H65A 2YJPA 1USYH 3DP4A 4K3FA 1QKAA 4JWYA 3T9XB 3RPLB 3KBRA 1Q9DA 4PAIA 3L6HA 1PEBA 2F8DA 1FBFA 1PC3A 1UIVA 1DTZA 1FQBA 5EQ9A 2A5TB 3KZGA 4OFJA 5L8DA 4GRKA 3PUXE 5ET5A 3R6UA 5ICTA 1TT1A 4N6KA 1SI1A 1FJ6A 3C32A 1SYIA 1CNQA 3V8XB 5ELVA 5ITPA 4OVQA 3FGSA 1OQHA 1MQIA 4BDOA 1MXWA 2VPNA 1FPGA 3IOWA 5ET7A 4KPTA 1UTHA 2O68A 1IMFA 3H4ZA 4HE0A 2DP8A 5EHSA 3OEMA 4KHZE 5KDTA 3RYDA 3R7XA 3KSJA 4OVPA 2XWVA 3CI8A 4HE2A 4RY1A 3KOSA 4G4PA 4OA4A 5DVIA 2OWSA 4THIA 3FASA 4GQOA 2UXAA 5IZZA 1MPBA 2OWTA 3CIJA 1NV0A 4X1DA 3OOAA 2UVGA 4F19A 1N0TA 3Q28A 3H6VA 4RXLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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