5H8NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 83
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nA02
3ECRA 2F78A 3HSTA 4R6YA 4XIGQ 4BDLA 3C4MA 5A5XB 4EXKA 4F3GA 3G3HA 3T66A 1XT8A 4OHNA 1FQCA 5I2KA 3FVOA 3BFUA 1B5HA 2R71A 5K2YA 2V3TA 4ZZAA 5TP9B 3K02A 5DT6A 4F19A 4NWDA 3T9XB 4JWOA 4F2OA 1YAEA 4TQUQ 2H4IA 2O69A 2OZZA 1DMBA 4YKPA 5FHMA 2B3FA 1LAXA 3N26A 3I5OA 2DS9A 4U4SA 4C1TA 2NUVA 4E0XA 5AE4A 2ONRA 1O63A 1MPDA 3R26A 4U21A 1FW0A 4EXLA 4DXBA 4XKQA 1GGGA 3V5AA 4H8IA 1B5JA 5DYHA 4OVJA 3FD3A 1MPBA 3G3JA 4R73A 3IOWA 2X26A 1IXCA 2Q2CA 4NF5A 3CFXA 3TFLA 3TTKA 3MZBA 3CSBA 4RA1A 2Q89A 4FE8A 4IY6A 2ZYNA 4ZEFA 3O66A 3ILTB 2PMSA 3UA8A 4F2QA 4GWOA 1L5TA 1N7XA 2P2AA 2NOOA 1AIVA 2ONKE 2XHDA 4EQBA 4YKJA 1UTBA 3T96B 3B7DA 4MH5A 2ZYMA 5H8NA 1MM7A 1CE2A 1QJMA 4JWXA 5M2VA 4F1YA 4R6KA 4U22A 4QRZA 1US4A 2I3WA 3H6VA 3D4CA 2WKYA 2W7YA 1USYE 3RNNA 2XXHA 3Q29A 1S7YA 1MDQA 3IB1A 2I4CA 2ABHA 2UVHA 4LZ7A 1P1NA 1MXYA 4OFLA 3AXFA 3MBPA 4ZZEA 5I56B 4PE5B 3RTWB 3MJNA 1PBPA 1H76A 1XS5A 1B7HA 3C9HA 5TP9A 3S9MC 5HPQA 3CG1A 2O68A 1ZKBA 1HSLA 3QK6A 1BKAA 2F5XA 3IOTA 5H8HB 5ELVA 3KFMA 2ANJA 5IKBA 2CZLA 3CFZA 1S9TA 3ZKLA 5AA4A 1A8EA 5ICTA 4C1UA 2X7QA 3H6WA 3S4UA 2V93A 2OLBA 5CBRA 1UIVA 1IXIA 4JSDA 5KDTA 1RKMA 3SDFA 1JEUA 3MP8A 5AA2B 4GL8A 3KOSA 4EF2A 1SVXB 2HAVA 4QFLA 4X48A 3UP9A 3ODBA 1B6HA 3PUXE 1FQEA 3JZJA 3R7XA 3MVWA 1MM6A 2F7AA 4LZ5A 1LB8A 1AL3A 3S9NC 3FXRA 4ONYA 3O97A 4AB6A 3KBRA 1JVXA 2VD2A 1VFEA 4IO4A 2HFBA 1SI0A 3CIJA 1R9QA 3QIMA 2O1LA 4G8HA 3RQTA 5F1QA 1XVXA 4LONB 2DP8A 2DVZA 3T22A 5JEIA 3MZ9A 1ZBMA 4GVOA 4NF8B 1GR2A 4JDFA 3TTRA 1ZIUA 3RUMA 4RPNA 5DVFA 1IXHA 4R74A 3TPAA 2ZMBA 5KCJB 2I58A 1UTHB 3LSWA 4GF8A 3PUVE 2H99A 2UVJA 5H8HA 3PPQA 1YCJA 1MY4A 4UA8A 3EF7A 1HSEA 2XXQA 5DEXA 3IJXB 3UN6A 3MPKA 2B65A 4KQPA 1SYIA 2QPQA 2E1SA 4ZE9A 3VXBA 1QKBA 2BJJX 3W15C 1EZOA 2OCUA 3T9UA 3FXUA 4U1ZA 1Y4TA 2ESNA 5DTBA 1SW5A 3SEUA 4H65A 2I0BA 2HZLA 2A5SA 2V25A 3ZKKA 1ZU0A 3HPIA 1B52A 2RINA 1LCFA 1MS7A 3PPRA 4F1VA 3H4ZA 4ZEIA 2KLFA 3ZS6A 2GFEA 3SESA 3KOTA 3Q25A 4YICA 1R6ZA 2I4BA 1N3XA 3PUYE 2V84A 2ZNSA 1H43A 1O64A 2LAOA 3LSXA 3O6HA 3W9WA 2O7IA 4NEDA 4F22A 1RYXA 2OWTA 1PDAA 4TLMB 3H6TA 5L8DA 5H8QA 4QFKA 2DVCA 4QHQA 5I2KB 3MW0A 4OMBA 5I59B 1SQYA 5TU0A 3K4UA 2XXXA 5CBSA 3OO8A 2ONSA 5I58A 4ELOA 3BBRA 2HZKA 2XXTA 4NF8A 5JK4A 3LC8A 4O3AA 2RKMA 1MY3A 2I6EA 3B6QA 2DWJA 3K1NA 3TEPA 3MWBA 2DOJA 3GLBA 4KFQA 1P1UA 1ZLQA 2FNCA 4G77A 5KCJA 3OOAA 3KSXA 3DM0A 4R6HA 3GZGA 1DTZA 2Q9TA 3O9PA 3H7MA 4GD5A 4KYDA 1MY2A 4MLVA 1NFTA 3KZGA 4FAJA 1MPCA 3VVEA 1Y1ZA 1SBPA 3N94A 5H8FA 1Y1MA 2F6PA 4R72A 3JYRA 4MLQA 3TUSA 1PB7A 3GBBA 2NXOA 2B3BA 3KJTA 3VLWA 3SEXA 2VOZA 3TELA 1FTOA 3K0VA 4NF4B 5EHMA 1NNKA 4F31B 3USDA 1FCKA 5B7DA 1D9VA 4PFWA 5KZTA 1LAHE 1P1OA 1TXFA 4IGRA 1IEJA 1JVYA 2UYFA 2F8DA 2DE2A 1UTBB 3N6TA 4F39A 1Y4CA 1N84A 2RF1A 3W9VA 3B6WA 1ATGA 3HO7A 4HCWA 4GXSB 3E3KA 1BTJA 3TTLA 1MXUA 3MUQA 3TQLA 5DVIA 3ILUB 4EQ7A 3WAEA 4GIZA 2RC8A 4RK2A 2ZXTA 4YB5A 2Y7PA 5I59A 1SW2A 3C34A 3Q26A 1OQGA 2QS4A 4QSCA 2QS3A 3RPWA 3OEKA 2PX1A 1VR5A 3VFJA 3C32A 1R1NA 1I6QA 2REGA 5IAIA 2M8CA 4GFRA 1MQHA 4G2ZA 3SKPA 1F9BA 2DYXA 2X7PA 1Q1KA 3U92A 2YLNA 3HN0A 2OBGA 4JBZA 3PD9A 4KR5A 5AA4B 2DXRA 1AOVA 3PPPA 3DELB 4IB2A 3OENA 4RXLA 1BLFA 4XXUA 3A3UA 1A99A 4YB6A 4ESWA 4YKIA 5KDTB 4DE8A 4YU0A 2H5YA 1HSJA 4GXAA 3RT8A 1QW0A 4MFIA 3TODA 1GTKA 3FATA 2REJA 4F1UA 3QYTA 4OYVA 1NH7A 4NF4A 3TKDA 3G7WA 5FHNA 1DPEA 3MAMA 1Y9UA 3IAZA 3G3KA 4YMBA 2XXIA 5I84A 3M3KA 3U94A 3N5LA 1EZPA 1N3WA 1XHYA 2PBWA 3MP1A 4EDPA 2ZYOA 1SDXA 4ELRA 4C0RA 4JB7A 2D5WA 5ITOA 1Z7ME 2Y7WA 3N6UA 3O6IA 2PT2A 3IB0A 4KYEA 1T0KA 1ELJA 1M5FA 1QKAA 2QJEA 1FQDA 3O2AA 4OZ9A 3PGFA 1NMUA 4F3PA 4LQ2A 4AB5A 1MQJA 2F34A 2XXWA 4TOZA 2XX9A 1LBCA 1WODA 1B4ZA 5JTYB 3KEIA 2F7CA 2I3VA 4YKKA 4G4PA 3RN8A 3OO7A 3TDJA 1MDP1 2THIA 3TQWA 4LA9A 3MPLA 3O29A 3QXMA 2RC9A 1RYOA 4Q30B 1N04A 5DEXB 5ICQA 3SEYA 2Z22A 3CSGA 4LVQA 4JXIA 4H5GA 5CMMA 3KJ7A 2G29A 1Z7NE 4OXVA 3I3VA 1B32A 4QSEA 1H44A 4XKRA 1B58A 1QULA 3IO4A 3RLFE 2NWJA 1B3FA 1SD3A 4OFJA 2Q2AA 3O28A 4F29A 3HHFA 4P11A 4KYSA 1MH4A 3G3FA 1LSTA 3ZSFA 3KN3A 4PETA 4GQOA 4OEVA 2XXPA 4ZEDA 1PB9A 3LSFB 1WVJA 4G8MA 1GV8A 5FTIA 2DQVA 4DCXA 1B40A 1P1QA 1FTKA 4GL0A 2Z23A 5H8QB 4NF6B 1MY0A 4ZEKA 4OTEA 3PMWA 3V83A 4PFUA 5FTHA 1N76A 4F3SA 3FXQA 5I58B 3FVGA 2O7UA 3KN7A 3G3GA 5JTYA 3C31A 1N7WA 1B9JA 1MQIA 4RNSA 1LCTA 1TFDA 4THIA 3U8QA 5ITPA 1GVCA 1MH3A 1B4HA 4N13A 2GHAA 1CB6A 4JSOA 3JV9A 1A8FA 4BDMA 1A55A 4KCDA 4ZEBA 1D9YA 3EHSA 1OMPA 1FQAA 1AMFA 2I49A 3OD7A 1B0LA 5H8FB 4Z0IA 4POXA 3K6UA 1Y20A 1LAGE 1B0HA 2QS2A 2YJPA 1LB9A 1MQGA 4X9TA 3TMGA 5I57B 4OEUA 4WEPA 3EHTA 2YPNA 1URSA 4LP2B 4H5FA 3OXNA 5CMBA 3IR1A 3VVFA 3KN8A 4EUOA 4FEBA 2DWAA 3KG2A 3QUJA 1IZ1A 5AA3A 4FIMA 1KWHA 1A54A 2D21A 4IO2A 3IO6A 3H06B 4NMYA 3OSRA 4OQOA 4IO6A 4O3CA 4DCYA 3TTNA 1UQWA 1I6BA 3CR9A 1DTGA 2F35A 1OQHA 5LOMA 1TFAA 3K6WA 1JW5A 4NF6A 3S9LC 3RGYA 1XC1A 3L6GA 3OSQA 3U93A 4EQ9A 1OIBA 5EHSA 2UYEA 2O6AA 1DSNA 3TAJA 1MXZA 2DXYA 4L17A 2QRYA 2IEEA 3H6UA 1POTA 4GLIA 1VFDA 5F7VA 1VE4A 5L9MA 1IIWA 4ECFA 4XKNA 2FA7A 1B1HA 4QFNA 4G68A 5K2XA 1URDA 1PC3A 2NVUB 1MXWA 3UIFA 1MRPA 4G8NA 4M4GA 3QSLA 3C36A 1B3LA 4H6DA 3E13X 4HS7A 2DWIA 4N6PA 1FQBA 2QL3A 3MZ1A 3CFLA 3FJGA 3M3LA 1USYH 4OWDA 4Z7EA 3I6VA 2UVGA 4HW8A 1SW4A 3TZAA 5I57A 5CM6A 2O84X 3VDFA 1IITA 2Z8FA 4I1DA 2F97A 3S9EA 4I8CA 2UXAA 4RPOA 2GRVA 1B3GA 1EU8A 3VE1B 4XTCQ 2VGQA 3FUZA 2VHAA 4RJZA 4TLLB 3HV1A 4RK9A 1FQFA 3F11A 2Y7RA 4PFYA 4IO7A 5I2NB 2A5TB 3GXAA 4QSDA 2R9JA 1LFHA 4ZS9A 1M5EA 2OWSA 2HQ0A 3FJMA 4X1DA 3EHUA 1PEBA 4PFTA 5CRYA 3SEVA 5L9SA 3KGCA 5HBCA 2XXYA 1P1WA 5AA2D 3VLVA 4ZE8A 4F18A 4BLAA 3D4GA 3K1PA 3FV1A 1XVYA 4KHZE 3VLUA 2P0SA 1YTVA 3A3CA 3PPNA 2I48A 4RY1A 2VD3A 3BFTA 4YZZA 2ALUA 2HCAA 4ZDMA 2PYYA 1D4NA 4R75A 5CMCA 3MC2A 3TCFA 4I62A 1ZTYA 1QUKA 4DZ1A 2QMWA 4DDDA 4R9GA 2F7BA 3K1MA 1AH5A 3TTMA 4IGTA 5HM4B 3RTFB 4O3BA 4QFOA 1XOCA 4WKMA 1B3HA 3CRBA 4U23A 1EH3A 3VV5A 1OVBA 1LFIA 1US5A 3MP6A 3IB2A 4H8JA 3IOUA 3DP6A 1H45A 3OELA 3PV0E 3Q28A 1JW4A 4QFPA 3H3GA 3CVGA 1UIUA 3FGSA 3FIRA 3HHGA 4Q8RA 4MF3A 1LGBC 3IK6B 2GHBA 4IO5A 2O1MA 2DE4A 5I2NA 2A5TA 4DIGA 2DE3A 4KPTA 3UK4A 1B1XA 1URGA 2F6GA 3VVDA 3ONMA 2XD3A 1Y3PA 3M3FA 1S50A 2QMXA 2RCAA 1LLSA 2RC7A 4DXUA 2CMOA 3IORA 1ZMGA 4PQJA 2Y7IA 3E4RA 1MQDA 1Y3NA 3PUZE 4R2BA 5A5XA 2PVUA 3IX1A 1B7ZA 3THIA 1SW1A 3EN3A 2P1SA 3PPOA 3HCQA 3V8XB 4LZ8A 2XXVA 4P0GA 1B51A 3V89B 3FV2A 4GRKA 4AQ4A 4F3BA 1QVSA 4DXCA 5CI5A 2AIXA 1Y3QA 4BDQA 5BWJA 3K2DA 4POWA 3PUWE 2PT1A 3SERA 3MVXA 4FECA 4BDRA 2V3QA 2XD2A 1B2HA 1MXXA 1MXVA 5H8SA 4LATA 3K00A 4NTLA 3U1OA 1NL5A 5EYFA 4EF1A 1OLCA 1MG1A 3K6XA 4LUBA 3A09A 1ANFA 2FYIA 2ZYKA 3WAFA 2DWHA 1OLAA 3L6HA 2AL5A 4XKPA 4H67A 5J1DA 2D3IA 5AA1A 4Q0CA 3CG3A 4ELQA 3S2VA 2Z8EA 3OEMA 4ESXA 1PB8A 2G93A 3PMVA 4K3FA 3OO9A 5TPAB 2RCBA 4FEDA 4UACA 3RT6B 4IO3A 4FORA 4ELPA 2HAUA 4NWCA 2R6GE 1LBBA 1YPNA 3OMBA 1B5IA 4KI0E 2Q88A 4RYAA 3PMXA 1FTLA 4ZECA 3MQ9A 1MY1A 2DSFA 1OVTA 3QAXA 1I69A 3PU5A 3BKIB 4FATA 2XX7A 4G68B 1IQ7A 1BP5A 5I56A 1M5CA 4KCCA 1B05A 4HCYA 1FTMA 4QF9A 3EQ1A 1B3EA 2QSXA 2VP1A 3G3IA 2GH9A 3LBSA 1D3KA 3TCGA 2Y7KA 1M5DA 1TT1A 3PD8A 1SYHA 3Q27A 1M5BA 1IUDA 4YMAA 4HTGA 4U1OA 4U2RA 2ZNUA 1POY1 4WEDA 3U72A 1J1NA 3K6VA 4OESA 3EPEA 4H0WA 2Z8DA 3IOVA 1NNPA 3TYHA 2XXUA 3O6GA 1ZJLA 3DP4A 4OENA 2Q8JA 1BIYA 4P0IA 5AA2A 4DLDA 4WXJA 4E0WA 2OJTA 3UGWA 1WDNA 1II5A 4OFOA 3P7IA 4I9DA 2H98A 3IJOB 5B70A 1NNFA 3CI8A 3DLNA 1JEVA 2QS1A 4ISUA 4PP0A 1NH8A 1H3DA 4H1XA 1SI1A 2UVIA 2HXWA 1IXGA 3LSLA 1B46A 3UORA 1A7LA 5TPAA 3T9HB 1VSOA 3LR1A 3K01A 1JETA 4MBPA 3TCHA 4YAHX 3C35A 3GBAA 3KSJA 1JQFA 3SEWA 3MVZA 5FHOA 4BDNA 4BDOA 2I0CA 1P99A 4R2FA 1Q35A 2AL4A 3SETA 2AYSA 2OK2A 3FASA 3VXCA 1O7TA 1B7UA 3DP8A 3FVKA 3R6UA 4JWYA 2XXRA 5DVJA 1DOTA 4LQ5A 4OETA 1JW1A 4ND9A 1LFGA 3LUYA 2ZNTA 2Y84A 3MVYA 5CMKA 3T9VA 1A40A 1NNTA 2O51A 1UTHA 4OERA 4Q5TA 2IA4A 2XX8A 1EZ9A 1QUJA 3FVNA 3B6TA 5BUUA 3OO6A 3RY3A 2V3UA 1DPPA 1FTJA 3T93B 4NF5B 2H25A 1NKXA 3FJ7A 3C33A 1I6AA 4R9FA 1LAFE 2H9BA 3IL1B 1JNFA 3H03A 4N07A 4KD5A 1R9LA 2F36A 2HEUA 2E0SA 5L9OA 3FZVA 5ISUA 4GOTA 1QUIA 4NE4A 4U4XA 1N0TA 3QUFA 4FJPA 4YB7A 1PBQA 3E9XA 4X1BA 1TWYA 4M1VA 5CC2A 3M8UA 5H8NB 4G68C 4IY5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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