5HNCA

Synchrotron x-ray single crystal diffraction from protein microcrystals via magnetically oriented microcrystal arrays in gels
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Neutron and X-ray single-crystal diffraction from protein microcrystals via magnetically oriented microcrystal arrays in gels.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5hncA00
2HU3A 4LT3A 4ANRA 1B2KA 1HEMA 1IC5Y 4KL7A 1UIEA 1XEIA 3WYHA 1G7MC 2W1LA 1D6QA 1F6RA 3KAMA 3W6AA 4MCKA 4TTDA 1NWGA 1GFKA 1CKHA 2MEHA 4RW2A 3W6FA 1HFXA 3B0IA 1GB6A 1QSWA 1KXYA 1LZ1A 4WLXA 3AJNA 4BAPA 1GFGA 133LA 5LYZA 1LSFA 3IJUA 5T3FA 2I25L 3TXFA 4ETBA 3WPKA 3P65A 4J1BA 1AZFA 1QUSA 1LJIA 1LCNA 2D4JA 4GCEA 4LYCA 4RLMA 4WMGA 4WM2A 2DQCY 1DKJA 3RT5X 1XGTC 4XENA 1GE3A 1GFRA 1LMNA 2Q0MX 4H9AA 4J1AA 3WW6A 1XGQC 4H8XA 2FBDA 4CFOA 2HU1A 2MEDA 1INUA 1LJHA 2G4PA 4IATA 4PRQA 4WM3A 4NHQA 1B7OA 4QDNA 4NGOA 1OUFA 1LPIA 2IFFY 1YQVY 1JJ3A 1GB3A 1LJ4A 4H9IA 4Z98A 2FBBA 4H8ZA 1XGRC 3TXIA 2YBHA 4H9EA 5IELA 2ZIKA 3RU5A 4DDBA 1LMPA 3E3DA 4NGIA 3TMXA 2DQHY 1IO5A 3LYMA 1T3PA 3LYZA 1B5XA 5HMJA 1B5UA 4PJ2C 5KXZA 4HTNA 1LYYA 1GBSA 1GF5A 1BWIA 1TCYA 2GV0A 3A8ZA 1TDYA 1IC7Y 1UACY 2G4NA 4HP0A 4LT2A 2DQGY 1J1PY 4NGLA 3A67Y 1JTOL 1LHLA 5DN5A 4DD1A 1LZRA 3LYTA 1NDMC 2D4KA 2ZNXY 1REMA 5DLAA 1GFEA 5LVIA 1VDQA 2FYCA 4WM5A 5LIOA 2Y8PA 1IWTA 1LZ4A 4WLTA 4OW1A 1HEQA 3AZ5A 4NY5A 4N1EI 1LSYA 2DQJY 3A90A 3RNXA 5LYMA 1XEJA 4NGYA 3WH1A 1IC4Y 4H94A 1LHJA 4NHPA 1ZVHL 2X0AA 4LYBA 4HTKA 1LJKA 3WULA 1D0LA 1QDTA 2LZ2A 2MEBA 2EKSC 3AW7A 4KXIA 4LYZA 4TSCA 4J7VA 4NHSA 4DT3A 5I5QA 4DYGA 3A6CY 1LHMA 2MEFA 4N8ZA 3M3UA 1C43A 1LZ5A 1BVXA 1YIKA 1D0MA 2BQCA 1DQJC 1IR8A 1HMLA 3QE8A 1GB8A 1LSEA 1B9OA 2ZQ3A 4LGKA 2F30A 1LSDA 4XN6A 4M4OA 4LFXA 2A7FA 1IEEA 1DZBX 2LYZA 4DD2A 1HELA 1B7NA 1BHZA 1VEDA 4X3BA 3WUMA 4AGAA 5F14A 5F9XA 5LA5A 1FLQA 5C6LA 4YEMA 1IOTA 1IWWA 1LMCA 2ZWBA 4B1AA 1CJ7A 5IDDA 1O23A 5EBHA 2BQLA 1OUGA 4BADA 4HV1A 3CT0A 1I20A 3AB6A 3IJVA 4QGZA 134LA 4TWSA 2DQFC 1NQIA 1F10A 4XJBA 1BB5A 1V7TA 2BPUA 3ZEKA 1LOZA 1LZEA 1JKCA 1IP1A 1VAUA 3A34A 6LYTA 2LZTA 2H5ZA 4HJVA 4H90A 2MEEA 4YF2A 4WM4A 1BB7A 1RFPA 3T36A 3W6EA 4NHTA 1H87A 3A94A 5KXMA 1LJGA 2FYDA 5L3HA 1F6SA 4LYOA 4EMNA 3BKHA 1YAPA 4XYYA 1BWHA 1GBOA 1WQPA 1FLUA 3OJPA 1C10A 1MELL 3WU7A 5B1FA 1LSAA 1HENA 1B5ZA 2VB1A 2YBMA 4DD3A 1DXJA 3EBAB 4C3WA 4PRUA 1OUDA 1LMTA 1G7JC 3A3RX 1IR7A 1YAQA 1YAOA 7LYZA 1NBYC 2W1XA 2ZYPA 3G3BB 5KXTA 1GE2A 1NBZC 2HTXA 3A6BY 4WLYA 4Z3MA 5FHWA 3HFMY 2IHLA 5KXKA 1WTNA 1XGUC 2YBNA 4MR1A 1IVMA 4N5RA 3WXTA 1LZ8A 4HPIA 4PPOA 4WL6A 1GF6A 5I54A 1JWRA 2XJWA 3AW6A 3EO5A 1GBWA 2PC2A 4UWUA 5KXPA 5I4YA 1IP6A 4OWAA 3AZ6A 1UBZA 1RI8B 4NHIA 1VFBC 4GN3A 1B7MA 1FKQA 3CSZA 4I0CA 5B1GA 4QEQA 4DC4A 4LZTA 1LKRA 1WQOA 1DI3A 3WPJA 3B72A 5LA8A 1LSZA 2YBJA 4KT3A 4ETAA 1CKDA 1FDLY 1IWYA 1N4FA 1IWZA 4GLVA 2W1YA 4ETCA 4RLNA 2CGIA 1LYOA 1XGPC 1H6MA 1KIQC 2Z12A 3QY4A 2BQDA 4A7DA 5KXXA 2MEIA 2EPEA 1BWJA 2XBSA 4Z46A 2DKVA 1D0KA 3A96A 3ATOA 2LYOA 1REZA 1JKBA 1LZ9A 2BQOA 4OWCA 4BS7A 4C5FA 1JIYA 1BQLY 1QQYA 1UC0A 1XFPL 2RSCA 3HBEX 3AZ4A 1I56A 2XBRA 4ETEA 1LZDA 1CKCA 1PS5A 1GDXA 2G4QA 4OOOA 4WL7A 5KXYA 3W6BA 5C6JA 1WVUA 207LA 1JUGA 1LZGA 2BQNA 3FI7A 1LSPA 1BGIA 5DN4A 5LAFA 5LVJA 1WVVA 5KXOA 4N9RA 2D6BA 1NMMA 4G9SA 1GWDA 4TX7A 2AUBA 5F16A 1YKZX 2B5ZA 2H9KA 1LHHA 4CJ2A 1E8LA 2ZQ4A 4NSHA 5JENB 1IOCA 1EL1A 1D6PA 1YKYX 1EQEA 2BQAA 4J0LA 4HJYA 2Z39A 1BVKC 4GN4A 5D5FA 3TXGA 1OUBA 4N1CC 1NDGC 3OK0A 5AMYA 1OUCA 1JTTL 3P4ZA 4ET8A 4H9FA 1HSWA 4G4CA 1C46A 4NFVA 1GE1A 2YBIA 1F0WA 1OUIA 1AT5A 4YEOA 5L9JA 1LSBA 1B5WA 1SQ2L 2A7DA 2DQEY 4KPMA 1JJ0A 1IWXA 1YROA 1IP5A 1LSCA 1REXA 5HLLA 1LJJA 5FELA 1LMQA 1P2CC 1KXXA 3G3AB 1GFJA 1HFYA 208LA 4ETDA 1LZCA 5APEA 4ZFPA 1GB9A 2DQDY 1ALCA 3P68A 5I53A 3WPLA 4LYMA 2BQIA 1GB0A 4GCBA 1HNLA 1W6ZA 5DM9A 1GEZA 4WM1A 5LYTA 2HEDA 1UIDA 1B7QA 1QIOA 3ATNA 1D9UA 1VDSA 3AGGG 5DL9A 4DDAA 1CJ9A 4LT0A 3WU9A 1B7LA 4EOFA 2DBTA 1B7RA 5KXRA 1LZSA 2MEAA 4NIJA 4R6CA 3W6DA 2C8OA 1IP2A 1UIHA 4RDSA 4NGKA 5KKIA 1LHIA 4DDCA 1LAAA 4DD7A 2F2NA 1B7SA 1LTMA 4IASA 1AM7A 1HEWA 5KXWA 1FLYA 1KIRC 2CWIA 5HQ1A 3AYQA 1A2YC 1GE0A 1REYA 2XTHA 3N9AA 4B4IA 3A92A 3WW5A 1LKSA 1WQMA 4DD9A 5E4PA 1A4VA 1GF4A 1WQRA 1C08C 4RW1A 3ZVQB 1GAYA 2F4AA 4LYTA 1WQQA 1JTPL 1LJEA 1GBYA 1C45A 1GB2A 1XSFA 1AT6A 1WTMA 3D9AC 1GFAA 1GF7A 4FJRA 2N5ZA 1GF3A 2EIZC 153LA 4XADA 1IOQA 4Z41A 1GBZA 3GXRA 1LZBA 3W3EA 1GBXA 4DD0A 1NKHA 2D91A 1QTKA 2C8PA 1MLCE 154LA 1FBIX 2Z18A 1LZ6A 4H9HA 3WVXA 2YSSC 1G7HC 3T6UA 1HERA 1W08A 4HJZA 3P64A 5B59A 1GFUA 1OUAA 2W1MA 1UIGA 5HNCA 2BQKA 1RE2A 4G4BA 3MGWA 4ML7A 1IIZA 5FDJA 5HNLA 1IP7A 4NSJA 3HBHA 4NEBA 4D9ZA 5KXLA 1HC0A 1HEPA 1GF8A 1JSFA 3WXUA 1DPWA 5APCA 2MECA 1EQ5A 1JKAA 1TAYA 5M1YA 2ZYCA 1GXXA 1CJ6A 1YL0X 1B5VA 1UUZC 4ZIXA 2ZNWY 1PZYA 4I8SA 4B4EA 3TXEA 4E3UA 5LVKA 4HPEA 2HEAA 2BQMA 1GAZA 3A95A 3M18B 1LMAA 3D3DA 2BAAA 3LZ2A 1IX0A 4B0DA 5APDA 4PHIA 5A3EA 5LXWA 1YL1X 1KXWA 5KKJA 4WM6A 1IWVA 5IHGA 4CHXA 5KJ9A 3WMKA 2Z37A 2D4IA 1JEFA 1JSEA 1SLYA 3A3QA 3IWRA 4NG1A 1AKIA 1CKFA 1LYSA 2HUBA 1IY3A 8LYZA 1UIBA 2HEFA 1V7SA 1UA6Y 1GEVA 1LJ3A 4QY9A 4GCFA 4H1PA 1IY4A 1LJNA 2F4GA 1BB6A 1LZAA 1BB4A 4G4HA 1YAMA 4NSGA 1GPQC 1GE4A 5ILFA 4WLDA 1GB5A 4H91A 3N9CA 1G7IC 2CJLA 4WG1A 3WL2A 1VDTA 1QTEA 1HFZA 2LHMA 2BQBA 4GLAA 4LFPA 2ZIJA 3SP3A 4LT1A 1HMKA 5FSTA 4XJDA 1B5YA 5F9UA 1HHLA 1IR9A 4AXTA 1OP9B 1QUTA 6LYZA 1ZV5L 3WUAA 1LSMA 4II8A 3B6LA 1CKGA 2BQJA 5D5CA 3WU8A 2Z38A 5K7OA 1DPXA 4ET9A 3A93A 1J1OY 4TSBA 4NGJA 1I1ZA 3CT5A 3TXBA 1IORA 1QSAA 1CNSA 1KIPC 1GHLA 1FKVA 1OUJA 3LN2A 1G7LC 5FCPA 4B49A 1BB3A 2HECA 2HEBA 3LZTA 2BQGA 2EQLA 5L3IA 2MEGA 4ZEEA 3N9EA 5B07A 1GD6A 4IJ4A 1OQMA 1UIAA 2BQFA 3B0KA 3LYOA 4NGWA 3RZ4A 3CB7A 1LZNA 4NGZA 4OOTA 1QDRA 3TMWA 3TMVA 1UICA 2YDGA 4WOAA 4CGEA 1OUHA 4O34A 5F81A 1FLWA 5ILCA 5APFA 5KY1A 4TUNA 5I4XA 1GDWA 4GCCA 4UWVA 193LA 2HEEA 3RW8A 2ZILA 3ULRA 4N0JA 5B05A 3J4GA 5II3A 5B06A 3K3TA 4MSTA 4XJGA 2H9JA 4NWEA 1LMOA 2CDSA 3EXDA 1T6VL 5KXNA 3TXHA 3WUNA 1JPOA 1Z55A 2BLYA 1TBYA 4UWNA 5FEKA 3TXKA 4NSIA 3QNGA 5LVGA 4OWHA 4HV2A 1DI5A 1JISA 1HF4A 1GF9A 1LSNA 1LJFA 1LYZA 2I26L 5C6IA 4HSFA 5E9RA 1VDPA 1JKDA 4W94A 1GB7A 1CJ8A 2YBLA 2Z2EA 4U3XB 4NWHA 3AZ7A 3AGIA 1HEOA 1IP4A 3ZVQA 1C7PA 1LHKA 1LZTA 3TXJA 3GXKA 1B0DA 3EMSA 4WO9A 3WVYA 2WARA 5LVHA 4L41A 4FDYA 2DQAA 1IOSA 1TEWA 4BAFA 4H9BA 1ZVYB 1JITA 1GFHA 3CSQA 3P66A 4OWBA 4M6DA 1GF0A 3HBDA 2BLXA 4GN5C 1JHLA 194LA 135LA 1GFTA 3CSRA 4G49A 4YENA 3F6ZA 4NGVA 3FE0A 4PGJB 3B0OA 1VATA 4YOPA 3W6CA 3BKVA 5HMVA 4XJFA 4XJHA 5I4WA 1IP3A 1GXV2 3TMUA 4YM8A 3AGHA 3CQLA 4HTQA 1YKXX 2BQHA 2Z2FA 4DWXA 1RJCB 1FN5A 1GFVA 1NF5A 4OWEA 1NHEA 1LZYA 2Z19A 5KXSA 9LYZA 1LSGA 4WG7A 4H8YA 3J6KA 1DI4A 2BQEA 3LHMA 5J7CA 5LAGA 4XJIA 1DKKA 4WO6A 1OUEA 1HSXA 1YANA 1XEKA 2DQIY 1B7PA 2NWDX 3VWOA 1UCOA 2YVBA 5A3ZA 4H92A 4NG8A 4H9CA 1J1XY 4GCDA 1EQ4A 3A91A 1YILA 3TXDA 1JJ1A 132LA 1RCMA 4H93A 2I6ZA 4B4JA 5LINA 1IWUA 4P2EA 4CFPA 1ZMYL 1WQNA 4R0FA 1UIFA 2LYMA 4W96A 3CT1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UIEA 1XEIA 3WYHA 2RB0X 4MCKA 1GFKA 1CKHA 2NTGA 4RW2A 1L16A 3B0IA 1QSWA 1L29A 2RB1X 4EKPA 1LZ1A 4WLXA 3AJNA 5T3FA 5LYZA 4ETBA 1G0JA 3P65A 1DKJA 1GFRA 1INUA 2HUKA 3CDVA 2ANVA 4Z98A 2FBBA 1T8AA 4ARLA 4H9EA 1C69A 5IELA 4DDBA 4NGIA 5KXZA 1B5UA 4HTNA 1GF5A 1CUPA 4DAJA 3A8ZA 4HP0A 1J1PY 1L45A 1L24A 3SB5A 1G1VA 1L21A 5DLAA 1REMA 1GFEA 5LVIA 1VDQA 1IWTA 3CDRA 1L59A 3HT8A 2DQJY 3WH1A 1ZVHL 2X0AA 1CV0A 4HTKA 1D0LA 2LZ2A 4LYZA 4TSCA 2EKSC 4KXIA 1C6TA 4DT3A 232LA 4N8ZA 4W53A 1BVXA 192LA 1IR8A 243LA 2ZQ3A 1LSDA 1L17A 1CV1A 1LI3A 2A7FA 1L64A 1HELA 1B7NA 1BHZA 3WUMA 5LA5A 1FLQA 1IOTA 5IDDA 3G3VA 1OUGA 1QTDA 4TWSA 6LZMA 1QS9A 1NQIA 1BB5A 1VAUA 1QT4A 2H5ZA 2MEEA 4EPIA 4WM4A 3T36A 1L88A 4LYOA 3FADA 1YAPA 1FLUA 1C10A 3WU7A 5B1FA 1LSAA 1HENA 238LA 4PRUA 1L72A 1SX7A 2W1XA 1NBZC 4WLYA 1D3NA 1XGUC 2YBNA 1IVMA 1L70A 2OE4X 4WL6A 1GF6A 3HT6A 4I7PA 190LA 1L27A 1RI8B 102LA 1VFBC 5B1GA 1FKQA 4DC4A 1LKRA 1WQOA 3WPJA 4KT3A 4ETAA 1L77A 1XGPC 126LA 2BQDA 2MEIA 1BWJA 1ZYTA 1D0KA 1JKBA 1L73A 1UC0A 1QQYA 1XFPL 1L69A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2HU3 A;  4LT3 A;  4ANR A;  1B2K A;  1HEM A;  1IC5 Y;  4KL7 A;  1UIE A;  1XEI A;  3WYH A;  1G7M C;  2W1L A;  1D6Q A;  1F6R A;  3KAM A;  3W6A A;  4MCK A;  4TTD A;  1NWG A;  1GFK A;  1CKH A;  2MEH A;  4RW2 A;  3W6F A;  1HFX A;  3B0I A;  1GB6 A;  1QSW A;  1KXY A;  1LZ1 A;  4WLX A;  3AJN A;  4BAP A;  1GFG A;  133L A;  5LYZ A;  1LSF A;  3IJU A;  5T3F A;  2I25 L;  3TXF A;  4ETB A;  3WPK A;  3P65 A;  4J1B A;  1AZF A;  1QUS A;  1LJI A;  1LCN A;  2D4J A;  4GCE A;  4LYC A;  4RLM A;  4WMG A;  4WM2 A;  2DQC Y;  1DKJ A;  3RT5 X;  1XGT C;  4XEN A;  1GE3 A;  1GFR A;  1LMN A;  2Q0M X;  4H9A A;  4J1A A;  3WW6 A;  1XGQ C;  4H8X A;  2FBD A;  4CFO A;  2HU1 A;  2MED A;  1INU A;  1LJH A;  2G4P A;  4IAT A;  4PRQ A;  4WM3 A;  4NHQ A;  1B7O A;  4QDN A;  4NGO A;  1OUF A;  1LPI A;  2IFF Y;  1YQV Y;  1JJ3 A;  1GB3 A;  1LJ4 A;  4H9I A;  4Z98 A;  2FBB A;  4H8Z A;  1XGR C;  3TXI A;  2YBH A;  4H9E A;  5IEL A;  2ZIK A;  3RU5 A;  4DDB A;  1LMP A;  3E3D A;  4NGI A;  3TMX A;  2DQH Y;  1IO5 A;  3LYM A;  1T3P A;  3LYZ A;  1B5X A; 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 3QNG A;  5LVG A;  4OWH A;  4HV2 A;  1DI5 A;  1JIS A;  1HF4 A;  1GF9 A;  1LSN A;  1LJF A;  1LYZ A;  2I26 L;  5C6I A;  4HSF A;  5E9R A;  1VDP A;  1JKD A;  4W94 A;  1GB7 A;  1CJ8 A;  2YBL A;  2Z2E A;  4U3X B;  4NWH A;  3AZ7 A;  3AGI A;  1HEO A;  1IP4 A;  3ZVQ A;  1C7P A;  1LHK A;  1LZT A;  3TXJ A;  3GXK A;  1B0D A;  3EMS A;  4WO9 A;  3WVY A;  2WAR A;  5LVH A;  4L41 A;  4FDY A;  2DQA A;  1IOS A;  1TEW A;  4BAF A;  4H9B A;  1ZVY B;  1JIT A;  1GFH A;  3CSQ A;  3P66 A;  4OWB A;  4M6D A;  1GF0 A;  3HBD A;  2BLX A;  4GN5 C;  1JHL A;  194L A;  135L A;  1GFT A;  3CSR A;  4G49 A;  4YEN A;  3F6Z A;  4NGV A;  3FE0 A;  4PGJ B;  3B0O A;  1VAT A;  4YOP A;  3W6C A;  3BKV A;  5HMV A;  4XJF A;  4XJH A;  5I4W A;  1IP3 A;  1GXV 2;  3TMU A;  4YM8 A;  3AGH A;  3CQL A;  4HTQ A;  1YKX X;  2BQH A;  2Z2F A;  4DWX A;  1RJC B;  1FN5 A;  1GFV A;  1NF5 A;  4OWE A;  1NHE A;  1LZY A;  2Z19 A;  5KXS A;  9LYZ A;  1LSG A;  4WG7 A;  4H8Y A;  3J6K A;  1DI4 A;  2BQE A;  3LHM A;  5J7C A;  5LAG A;  4XJI A;  1DKK A;  4WO6 A;  1OUE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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