5HOS | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	316
structure length	316
Chain Sequence	LKYAGVNLSGAEIKSSQKPGVLNIDYRYPAADEYAYFAGKHMNTVRLPILWERLQPRAGGELDPAQLALIRQAVANAKAAKMYVIVDVHNYAKYYGHTIGSTKVPISTFNDLWRRLAIAFKSDNAVIFGLMNEPYDIDPQAWATAAQASIDTIRKTGATNLILVPGALWTGAHSWYSTVAGQSNAVAMASIRDPLNRYAIEAHQYLDADSSGTSGGCVSATVGVERLRSFTEWLRLNKKRGFLAEFGTGNTVTCNLALNGMLGYMESNSDVWMGWSWWAAGAWWSGAYPFNVQPDAQGRDKPQMSILSPRARRITD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title	Crystal structure of the endo-beta-1,4-glucanase Xac0029 from Xanthomonas axonopodis pv. citri rcsb
molecule keywords	Cellulase
total genus	127
structure length	316
sequence length	316
ec nomenclature
pdb deposition date	2016-01-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	5hosA00

3WF1A 3RJXA 3A47A 5DFAA 3GH5A 2XVLA 4OZOA 4D6DA 3VGEA 1WE5A 2VVNA 4U2ZA 3BSGA 1FOBA 2J8FA 3I3EA 3W25A 2Y8VA 1PZ2A 4UQAA 2J7CA 1ZB5A 1PBGA 2WKGA 4CVUA 2DIEA 1XCXA 1C93A 3D3AA 5E6YA 5CGTA 4OKDA 2WC3A 1QI2A 1JF6A 2ZXBA 3OZPA 3GNPA 1JIBA 1V3LA 3WQVA 1UR4A 2QMKA 2WVVB 4TVUA 1HP4A 4TTUA 1AQMA 4KGLA 1JZ8A 1SYTA 2G8ZA 2WHJA 2NT1A 2J78A 4OOZA 3N11A 6A3HA 1V03A 3AOFA 2V38A 4ZENA 1CPUA 4QP0A 3W6MA 1LJYA 3AXIA 1UUQA 2B31A 4GINA 3UG5A 4MNMA 4WKAA 1GQJA 2WMJA 3WKZA 4Z2JA 5LYRA 4MB4A 5D8ZA 1W9PA 3GTNA 3VX0A 3DYPA 3QR3A 5GNYA 1WDSA 4BF7A 3WN6A 4HOZA 1OT2A 3EMCA 4GI6A 2PBGA 3EYPA 3U5UA 1HT6A 4DUVA 1MVYA 1L8NA 2BVYA 3F5JA 4AISA 1UWQA 4GIAA 1A3HA 2HVMA 3BLKA 1ZBWA 1GHSA 2C0HA 3KL5A 4M56A 1W9VA 1S46A 1H0GA 5M03A 4DWSB 4W88A 3WD2A 4H41A 3TA9A 2AMGA 3IK2A 4PBGA 3VVGA 1V6YA 1ITCA 2WBKA 4MPKA 2ZXAA 5IFTA 3EMQA 2E0PA 2WVUA 4JZ5A 5ABFB 3GXIA 4TUFA 1HJXA 1EQPA 3WNNA 2E4TA 1E9LA 2F8QA 1QOXA 3N1AA 2D22A 3WDQA 1CGUA 2QPSA 1UWTA 2XWDA 4PN2A 1E4MM 3GBDA 4WIWA 5JBEA 3GXMA 3AIQA 1UD3A 4JFSA 5A6BA 1V0NA 3POHA 2CBUA 3OA5A 1C8XA 2VX5A 1J0JA 1LLOA 1TA3A 3AMLA 3OZOA 2ZWYA 1RP8A 1FH9A 2XFYA 5CSUA 4EE9A 2C7FA 2OWXA 2V3FA 2X2YA 1FA2A 1C8QA 4UFKA 1ISZA 4PTXA 2CNCA 3ZR5A 2JF7A 4KRUA 3VIKA 4CD7A 2VNCA 2PWDA 2UY5A 3AS0A 1JZ5A 2BY3A 4P7OA 2VO5A 2J75A 2E9LA 2FGLA 2JE8A 4C7GA 1AQHA 4PSPA 3DECA 4UNIA 5I78A 3O9NA 1QI3A 2BY0A 3GNOA 1CGYA 4E2OA 1WZMA 4J3VA 1W3JA 2G41A 3K4DA 4J28A 2D24A 3VGHA 1E71M 1KFWA 1RD6A 1VRXA 2WMKA 2D1ZA 5A6MA 5I6SA 4XB3A 4V2XA 2YKKA 7TAAA 2XUCA 1W1TA 1GOIA 4AEEA 1MW2A 4YN5A 1CENA 4CCDA 3L4WA 2BS9A 4JCMA 4HA3A 3W26A 2WYSA 1VJZA 4HOWA 2TAAA 2XSAA 3AFBA 2EXOA 1NP0A 1ZS2A 2X1IA 3JUGA 4NZCA 3OLGA 1PAMA 2VQUA 3SCRA 3W29A 1QNPA 1EHNA 1HVQA 4NI3A 1BYDA 4D6HA 4F8XA 2X8RA 2QPUA 3WUEA 1K9TA 4M24A 2ZX9A 3BAKA 4MNJA 3PZMA 3WD3A 3SURA 1HJWA 2DH2A 4U3AA 3MMDA 1EOMA 3THCA 1G94A 1WB0A 3AMKA 4U33A 4AD5A 3T2PA 3ZOAA 5AC4A 3SEPA 3CUIA 2VX4A 3W6LA 2WVSA 2FHBA 2BHUA 4JIEA 1I1XA 4MAVA 3DHUA 1VIWA 4U31A 4W7UA 3WSUA 3AXHA 3GDBA 4MAZA 2WKLA 3RDKA 4JCLA 3VUPA 2CESA 4UTFA 1QI0A 3B9DA 1JG9A 3OLIA 4P8VA 4LQ1A 1GOKA 1FH7A 1ZL1A 3AHVA 2WK2A 1OD8A 4QCFA 1V0KA 3OB8A 1C7SA 2VRKA 4M29A 5BRQA 1LWJA 3ZT5A 1D2KA 3PTMA 2E9MA 4PUDA 3W4RA 1E6XM 1V08A 1EDGA 4AWEA 3N18A 3WQ4A 3GM8A 5KEZA 4WF7A 4C7FA 2O9OA 4N42A 1V3IA 1B0IA 4ACZB 5CPSA 3WH5A 2XM1A 1RH9A 2C8NA 1JI1A 3AMCA 1CWYA 3VGFA 1OB0A 2V3GA 5CG0A 3K46A 2CBJA 2YDRA 1M7XA 1RPKA 4W8AA 4DUWA 2CIPA 3W38A 2VUYA 3PZQA 1VENA 4M82A 3RJYA 2XVKA 3T2QA 5A69A 2G3JA 1K6AA 3VDCA 3FY1A 1OGGA 1JYWA 3NSMA 1TCMA 3AHZA 3EDDA 5DEZA 1E6PA 4M8UA 3CHDA 3VPLA 3BAXA 1MWOA 1W1VA 2PI6A 2MANA 5DT7A 4M1RA 4BQ4A 4LYPA 1QHOA 1W2PA 2VZVA 1XH1A 3A4XA 1UD8A 1EIBA 3UR8A 2YOCA 2WWDA 2YA0A 4AZ6A 2EO7A 1E6QM 3ZQ9A 1UQZA 5C8BB 1EHAA 5EFDA 1UA3A 2ZUVA 4PYSA 4HMDA 1US2A 4NRRA 3SCQA 5D9PA 2WNWA 2DH3A 1OIFA 1J0YA 2YJQA 4TX6A 5E09A 1WKYA 3GNRA 3EDEA 2BXZA 4GXPA 1R85A 4F79A 4AZGA 1E55A 1UR1A 3VO0A 2JFEX 3FAXA 2VL4A 3CZ8A 1GONA 1CZ1A 3VM7A 1HKKA 3W37A 3MV11 3AYSA 1CLXA 4JL2A 1JFXA 1UG6A 4RE3A 5HDRA 2GJXA 2ZX8A 4BS0A 3NDYA 2UY4A 4CCCA 4Z2HA 5CPTA 4U2YA 4WSKA 4UQCA 2CPUA 1JGIA 3VINA 4BZYA 3VGGA 3VGBA 3N15A 4IM4A 5IHRA 3W81A 1J9YA 1H0IA 4PMRA 4DM2A 3SUUA 3GXDA 4FK9A 3PTKA 5AYBA 2WB5A 2FH6A 5E6ZA 2W67A 2VCAA 1FP8A 2A3BA 2J8GA 1NARA 3WNOA 4F9JA 1UD6A 3WNMA 1BYBA 3WEOA 4AIOA 4UZSA 5M5DA 2V3DA 3FNDA 1C3FA 3PBGA 2BHZA 4MDPA 3LPPA 4W85A 4H04A 4QLLA 3BMWA 3W53A 1JZ2A 4LGXA 3CUFA 3BMVA 1Q6CA 1B3XA 5D9MA 1G5AA 4OBSA 4D6JA 1GNXA 2DEPA 2W4XA 3AIRA 4QLKA 1B90A 4AD2A 4HU0A 2VQTA 2ZE0A 2CYGA 1UD4A 2WC4A 4AY1A 1JZ6A 2D20A 1AVAA 3SUVA 2CERA 2VZUA 4AD0A 3T2OA 4Z2KA 3OGRA 1QI4A 1FH8A 3G6LA 3BLPX 1O7AA 5F7UA 1HKMA 1H3GA 2W62A 3FAWA 1FHLA 4AYSA 1LG1A 4D6FA 3NIYA 3VGDA 3OLDA 1TA3B 2PB1A 4A4AA 1KWKA 1V0MA 3WH9A 1GW1A 5HPOA 3K8MA 3RILA 5A8NA 3KEHA 1VFMA 4D1JA 1HN1A 2YIHA 4YHGA 4HU8A 4U3CA 4HP5A 4AZBA 2J7GA 3AISA 1OINA 1VEOA 3K8LA 1E1FA 1DWHM 3UG4A 2GVYA 3ARZA 3B9AA 3ZJ6A 4D72A 1GQIA 2WLYA 3WD1A 3ALFA 5E9AA 3IJ8A 5FOOA 4L4PA 3NJ3A 3CZEA 2E9BA 5GNZA 4W5UA 4PMYA 1HNYA 5I3DA 4WK9A 5LA2A 2RGLA 2EJ1A 1MQRA 1BTCA 1ITXA 4Y7EA 5ABEA 3VOCA 3WL0A 1BGGA 4B9YA 3CZLA 2X09A 3CO4A 4HA1A 1IZJA 4E8CA 1JD7A 3AZSA 2WHKA 2VMFA 1ISVA 1E72M 1R87A 1KQZA 2GDUA 4ATWA 5I79A 3VNZA 1EO7A 1JXJA 1Q6FA 3NSNA 3WDIA 3GBEA 2GK1A 1OT1A 1KXVA 5IFPA 4PMNA 2WXDM 4JKLA 1JD9A 4E8DA 3ARUA 2BVTA 5FD0A 1WZKA 3AHXA 3MUAA 3SCPA 2XHYA 3SUSA 5A6KA 1W9BM 1FFQA 3N04A 3TP4A 5JBDA 1TG7A 3FHQA 4MJ2A 1US3A 4OJYA 2YL8A 3L2MA 4FF5A 4J27A 4PMUA 1R86A 2CXGA 4JAWA 1VJSA 4JKMA 4MADA 1QBAA 4TVCA 1WZLA 3WMBA 1JYNA 2W5FA 4U5IA 4MTVA 2UY2A 1R7OA 3DHPA 3B8SA 1UA7A 4CN1A 3L4ZA 4Z2LA 1CGXA 3K1DA 1PX4A 3QHOA 5JIWA 3VIFA 4AD4A 3VDAA 4HOXA 3ZJKA 4CUCA 1XV8A 3PZGA 3AYRA 1KQYA 3MANA 1TUXA 1V6VA 2OYKA 4XZBA 4ZFMA 1CXFA 1M01A 2E40A 3BC9A 2DSZA 2QV4A 3M6DA 3I3DA 3CH9A 5M17A 2DSVA 2DPEA 2XG9A 1JYXA 1BHGA 2ZWZA 1DTUA 1JFHA 4KWUA 2CHOA 3WELA 6CGTA 4K68A 3IAPA 2IUZA 2YDSA 2W63A 5HNNA 4F9DA 1J11A 4A3YA 3M7SA 1J0IA 1VAHA 5A8PA 3BH4A 3MS8A 1CEOA 1M03A 1L0PA 4HMCA 4PCSA 3F5KA 4GQQA 5I24A 3EDJA 1TZ7A 2JIWA 4P7NA 3U7BA 1EO5A 4AIUA 5EFFA 3WFZA 5A3HA 3QGVA 3MMWA 1PZ3A 2E8ZA 4W8LA 1EH9A 2X0YA 2G3NA 4B3KA 4PEEA 1DP0A 1KBBA 3QHNA 5I5RA 4ZEPA 4CU6A 1QNQA 3OGVA 2Y8KA 3ARSA 1HIZA 1W2VA 4UQBA 4DUXA 2EPMX 1WDQA 2OSWA 1LQ0A 1RP9A 1BYCA 3SCOA 3EMZA 1WDPA 3GXFA 2ZUWA 3F5LA 2BY1A 3M07A 5IDIA 1UHVA 2ZIDA 4P7LA 3L4TA 3G6MA 4TOQA 2DSWA 2OWWA 1ZU8A 4MNKA 1J0KA 2J7EA 1ECEA 1MFUA 4M81A 1CGWA 3K4AA 3GZAA 4PTMA 4B9ZA 2WCAA 1E6ZA 4CCEA 1ESWA 1J10A 3M46A 1W1YA 8CGTA 5D8WA 4KMQA 1XRVA 2VI0A 3WQ6A 3WQ8A 4PMVA 5IHSA 5A6LA 1U30A 3HU7A 2GJXB 1ZBKA 5FCZA 1NWRA 3CHEA 5E0FA 4L4OA 3N12A 1VBUA 4DWSC 1BVZA 3VU2A 3EDFA 5CZKA 2VJXA 5TD4A 3UG3A 4MB1A 5A2BA 1NWUA 4B3LA 4W7WA 3WH8A 1GZJA 1BQCA 4GQRA 1V6UA 2YBUA 2ZUSA 1KGXA 2NT0A 3WUGA 4AD3A 1XSJA 3T08A 4TVDA 4H7VA 1UKPA 2XFRA 1X6NA 3PTQA 1JZ3A 4J3XA 2A3AA 4AEFA 4S3KA 2XIBA 2WSKA 2DIJA 2O92A 4GZIA 5FIPA 3WH6A 1IZKA 3TTOA 2Q8XA 3WD4A 2DT3A 4JHZA 1VFUA 1HKJA 4Z2IA 3AIVA 3QOKA 1EDTA 3L2LA 4J3WA 1B3ZA 3RM4A 3APGA 4P8UA 5JBFA 2EPLX 3CUGA 4KGJA 1H11A 2V5CA 2DQXA 5FL1A 1B9ZA 3WDJA 4GKLA 1V3MA 5E0CA 4AZ7A 4QDMA 1B3VA 1X6LA 3WEZA 4JKKA 1W91A 2EQDA 1Q6DA 1QHPA 3BCFA 3IJ9A 3BXWA 4EK7A 1C92A 2E8YA 4MB5A 3UETA 2QLYA 4W87A 4P8WA 5D9NA 1JNEA 1CXIA 3ZMRA 1XGZA 2O9PA 1H49A 1PX3A 1JDDA 4DM1A 4W7VA 5BWFA 4CN6A 4CN4A 5DF0A 2FHFA 4V28A 1E70M 1WNOA 1W3KA 1GPFA 3VIMA 1JYVA 3B9EA 1XD0A 3AZTA 2PWFA 2ZICA 1J12A 3DC0A 4QFUA 1W3HA 3SCUA 4UQEA 5A6JA 5HOSA 1TE1A 3THDA 1H1NA 2EBNA 2DSUA 4C7DA 1PX8A 4WKHA 1JDCA 2QF8A 2D0FA 4B15A 1B3WA 1V02A 4W8BA 2Y4SA 1DEDA 2D3LA 1B31A 5BCAA 1V0LA 1QPKA 2JALA 3RM9A 4CVWA 1C90A 2PWEA 3GH4A 1B30A 3UEQA 4UFJA 1YQ2A 3RPMA 5I23A 1QI5A 2WCSA 3ZT7A 7CGTA 1DWFM 3PZVA 4UQDA 2DSKA 4EKJA 2ESCA 3WDPP 4UOQA 1H09A 3DYOA 4ZXLA 2YL9A 4JFWA 3WMCA 1UKSA 2OYLA 5EBAA 2V5DA 3MU7A 8A3HA 2Y24A 4WKFA 1NH6A 1CIUA 3SCTA 4XZWA 2D3NA 3ARPA 1E3ZA 1K9EA 3MO4A 1KWGA 4AW7A 2GK1B 2NSXA 4IISA 1J0ZA 1GVYA 2J74A 5IXEA 3ARVA 3OLEA 1CXLA 4W86A 4Q7NA 3WL1A 3RMEA 1HJSA 1B3YA 3WDRA 2CETA 4PMOA 2ZOXA 2UWFA 1NOWA 3WUFA 1NP2A 3S6TA 1B2YA 1E43A 1UWRA 3ZSTA 1TFVA 1QNOA 1WP6A 1LL6A 5CLWA 4FLRA 1ODUA 2QMJA 2VURA 4UFHA 3MMUA 3HN3A 4H8VA 3RM8A 1TVNA 3ARRA 3FW6A 4CD8A 2WMIA 2VOTA 2J7BA 4AMCA 1UH3A 4X9YA 3BCDA 2E3ZA 4D71A 2WHMA 1CGVA 4P7RA 3VD7A 2HISA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5HOSA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations