5HQPA

Crystal structure of the erp44-peroxiredoxin 4 complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the ERp44-Peroxiredoxin 4 Complex Reveals the Molecular Mechanisms of Thiol-Mediated Protein Retention.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase/chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hqpA00
2PVOC 4HS1A 2WULA 2YWMA 3GUSA 1JFUA 3DEXA 3I69A 4CDOA 1V58A 2LTKA 3MDKA 4ID0A 1YDKA 3QMXA 2HYXA 2HRFA 3H1NA 2CVBA 4YQMA 1QUWA 4EC0A 2V32A 2DBCA 6GSVA 1B8XA 2MYGA 2FCHA 2N5AA 3IAS2 2GSTA 1TI3A 2KOKA 3IDVA 3UOMA 1F6MC 2IJYA 3UVHA 2B5YA 2DJJA 5D9TA 4ECBA 6GSWA 3KH9A 3DWVA 5DCHA 5IPGA 4JBBA 3EU4A 4TOPA 5KN1A 3EU3A 5DQSA 2DMMA 4O5RA 4MH3A 2OBIA 2YN1A 4Z7XA 2GLRA 2JZSA 4IGJA 19GSA 1WIKA 3LYKA 2XHFA 1AQXA 2WJUA 6GSSA 1DE1A 1SL0B 5H5SA 1U3IA 5IM9A 2B7KA 5HFGA 1PN9A 5J9BA 3QPMA 2J9HA 4TXVA 2X8GA 1KBNA 2PERA 5DCGA 1YKCA 16GSA 4V2MA 3F6FA 2VL2C 2J23A 1R4WA 4P3YB 2ZUPA 3FKFA 1PL1A 4NHWA 3MAKA 5ECOB 1H4OA 1W4VA 1K0AA 5C04A 3LORA 4YAPA 2O8VB 3UBKA 4QQ7A 1XXUA 3TJKA 4RQRA 1K0MA 1YJ6A 2LKUA 3US3A 1EEJA 1PL2A 2AHEA 2LQOA 1DUGA 1GRXA 4ZIJA 2LS5A 1X9MB 4HJ2A 1QFNA 1WP0A 6GSTA 3ZREA 5H5QA 1U3AA 1T4ZA 3KTBA 2H73A 2IMKA 5DAKA 3LJRA 2OBKA 3LEFA 1FW1A 2OKAA 1BX9A 2NTOA 2RM6A 5E4WA 1ERUA 3U6VA 3M0FA 3RHCA 1JZWA 3TGZA 3N5OA 1M2AA 4I2UA 1GUMA 4N30A 3ZLPA 3IV4A 3QR6A 2GQMA 1K3OA 1OKDA 2DC5A 3H79A 1X5EA 3VWVA 2P0GA 2XPEA 4GXZA 1YF0A 2TRXA 2H66A 3D0ZA 4EF0A 3M9KA 2VCQA 3GURA 1WJKA 4I5QA 3FZ5A 2BTOT 14GSA 1ERWA 3HYPA 1XW5A 3ED3A 1EGOA 2CX3A 3ZL5A 1XWGA 5EPFA 2A2SA 1WWJA 1O6JA 4BVYA 1T1VA 3HY2A 4Q5NA 5D9XA 3Q19A 1SKWB 4YH2A 2DIYA 3WT2A 3DMLA 2AB6A 5ECSA 2GSQA 2L5LA 3UEMA 3EURA 4TKYA 1TP9A 2H74A 4TW5A 4MF6A 5CYYA 1OYJA 1Z5YE 20GSA 1OC9B 1R5AA 2L4QA 2WCIA 4HQSA 3V1WA 5HFKA 2VCWA 1IYIA 1VF2A 3QD9A 2CZ2A 3APOA 2LRTA 5B6MA 3G7JA 3A2VA 2PBJA 1T8EB 2YJ7A 2IL3A 2FY6A 4K7NA 5JWQB 4HDEA 3Q18A 3CRUA 1K0CA 5KN2A 3D4MA 13GSA 1UC7A 3KEBA 3TJGA 3F3RA 2WRTA 5AN1A 4I6XA 4NAXA 2HRNA 4RI7A 1G7OA 1GTBA 1HNCA 2NPBA 2MMNA 3F4RA 5E59A 4NHZA 2HXKA 1EGRA 3KP8A 3ZITA 3HVVA 2H0IA 1GSEA 2OA7A 3DVXA 4WR5A 3A3TA 1EZKA 3D5JA 1THXA 2N5FA 5F8BA 2CVKA 1EP8A 3M3MA 4GRFA 5JCWA 1E2YA 4RQXA 4DSSB 5DVBA 5G5FA 3SWLA 4JU5A 4JZQA 3ZYWA 4GTUA 5HR0A 2IN3A 4TN8A 1GTUA 8GSSA 1TJDA 2CT6A 1KNGA 3HJPA 3E9JB 2O85A 2G2QA 1U87A 4MJAA 1RW1A 2KLXA 3GKMA 3KZQA 1GSSA 4X0XA 1YQ1A 4K0NA 2GZYA 2YPMA 4IQ1A 5CRWA 2VLVA 3G9BA 5HQPA 3WGDA 1T00A 1GLQA 3KTLA 2VM2A 3VPTA 3GL5A 1Z3EA 1EEMA 1F3BA 2HZEB 1N8JA 3BCIA 4X43A 1B4QA 5ECPB 1O85A 1XW9A 3FZ9A 4H86A 2GQKA 3FR9A 5ELGA 3ISOA 5ELAA 2YOIA 1R26A 2H72A 4BA7A 4GSTA 2F51A 1NW2A 1NHOA 2C0GA 3EMXA 1MDIA 1A0RP 2LJAA 5D9WA 2FLSA 1ZYQB 1QXHA 3TJFA 4FIWA 1AW9A 2VL9A 5EL8A 3IPZA 4PQHA 2XPDA 1J0FA 1H75A 4TXOB 2CZ3A 2M72A 2CAIA 3KMNA 4KDUA 1FHEA 5FT3A 3F0IA 3NOFA 2QKEA 5EY6A 3UAPA 3GX0A 1T7PB 2LV3A 2FA4A 1A2MA 4V2NA 1XZOA 1W89A 2K8SA 2X8CA 1WMJA 1TKDB 1LBKA 3EINA 3WD6A 3UVTA 2OACA 3VK9A 2CV4A 1QQ2A 1OC9A 4OCEA 4ECCA 3C1RA 2VD1A 1GWCA 3M8NA 4O7HA 2BJXA 4EKZA 2MBTA 2PPTA 1FOVA 2PVQA 3N9JA 1MDJA 3A2XA 3CSJA 2ES7A 4HJMA 3QDNA 2I3YA 3VI5A 1CQHA 2OADA 2X99A 1YEXA 3GMFA 2TIRA 5IMFA 3UL3A 5J4UA 2EIQA 3G7IA 2HLSA 4XRAA 1TXXA 2VM1A 2P5QA 4BPYA 1XOAA 1T4YA 2H76A 3I6AA 2VLTA 3L0HA 1VRSD 1EV9A 2WGRA 1XWBA 3KJYA 4F9ZA 4RUVA 1AUCA 1G7EA 2EIRA 2VUPA 3DKSA 2O87A 1YY7A 4DSSA 1V2AA 3OR5A 4WKWA 2YZUA 2YP6A 4MH2A 2KP1A 1SJ6A 1SD9A 5JCGA 3M9JA 3LXTA 4L0UA 2OE3A 5HFIA 5KN0A 1OC3A 1V57A 2H01A 4MABA 1GULA 2BMXA 3DIEA 2HSYA 4HZ2A 2M46A 4IN0A 3I43A 2YWNA 3PGTA 3UJ1A 5INYA 2HZEA 3TRXA 4IBPA 4KX4A 2WDUA 4MCUA 4TR1B 1WPIA 5F07A 2NBSA 1M2DA 4POKA 3P90A 1SENA 2MMZA 3TKPA 2V6OA 3BOAA 4OD7A 5IO0A 4PGTA 4L8EA 3IHQA 2GSSA 2KHPA 2WFCA 4I2TA 5L71A 2F8AA 1J9BA 1MTCA 5G2ZA 1GUKA 4N10A 1GNWA 4K7OA 5HR1A 4V1Ag 2L6CA 1SL1B 5CO3A 1THOA 4NXIA 4TXOA 1LU4A 1XWCA 3VFIA 4TR4A 3W6GA 5A4WA 3VI7A 3LWAA 2H1AA 3Q74A 4OO5A 2K18A 1PSQA 5ID2B 2ZCTA 3WYWA 5IMCA 4ECJA 3ZMKA 3A2WA 1A0FA 1B48A 1TK5B 4MF5A 5DALB 12GSA 3VURA 1S3DA 1VGLA 2C0EA 3CXGA 2FNOA 4QL9A 1SYXA 3FW2A 4HZ4A 4KW6A 3IA1A 4WF5A 1SK1A 3HZ4A 5DJLA 2GS3A 5DJMA 3WT1A 4MJCA 5IQYA 1YF1A 3ZFLA 2AAWA 1BAYA 2JL4A 4MK3A 2C0DA 1V98A 4LMVA 2H71A 2D2ZA 4KCEA 1IYHA 2OE1A 1S3AA 2AV4A 1O8WA 3IBHA 2V2GA 1M99A 1JZDA 3D4TA 3GFKA 4GCIA 1YKAA 4MZWA 4POBA 3UIWA 3UARA 1XWKA 1M7TA 4KUNA 3GA4A 2LJRA 3C73A 5ECQB 4G19A 4LL4B 4IVFA 5AIVA 2RUFA 2FWHA 1QGVA 5GAPD 3TKSE 4JR6A 1FO5A 1Q98A 2YV9A 4XS1A 2AYTA 3HHVA 4ULXA 2AJQB 5COHA 1TW9A 3IAM2 1F9MA 1Y6EA 3HXSA 5J41A 1PA3A 1C72A 1XOBA 2O89A 2YCDA 4TR1A 1TTZA 4J57E 2GT6A 5ECNB 2H1BA 3C8EA 1GNEA 4FH8A 1AQVA 3HZ8A 1UN2A 4OFNA 5G1KA 4X1UA 5DBQA 4MPGA 2H8LA 6GSXA 5CRHA 2YNXA 3KMOA 2VCXA 2I9HA 1KEBA 18GSA 1XBSA 4KCAA 5ECHB 17GSA 1PX7A 4L0WA 1ZYEA 1X5CA 1ACVA 3RAZA 1F2EA 1OVNA 5CAXA 4HQZA 1GSDA 5B8AA 1XVWA 1ILOA 3O6TA 2L5OA 3GSTA 4ZILA 1XIYA 3KXOA 4GQFA 5H5RA 1JZRA 3PINA 2QC7A 5ECIB 1SKRB 3L4NA 4O32A 4MJBA 2CQ9A 2KP2A 4ZBBA 2EIOA 5ID2A 4OFMA 1U88A 4EDYA 4EDZA 1NSWA 4XIHA 3EVIA 1WOUA 5F05A 3HVSA 4K2DA 5EVOA 5DALA 4QL7A 4XS4B 3GKNA 2PWJA 3L9UA 4MA9A 5IIZA 1U6TA 3F4SA 2R3XA 1DBYA 1XCCA 2E0QA 4WEYA 4ECIA 2K8VA 1USBA 1FG4A 1OC8A 3SBCA 3L9SA 1Y25A 2ON7A 3CTFA 1JLVA 3LSZA 2C0FA 1M9BA 4MJEA 3FYGA 1ZL9A 5F06A 4WXTA 1AXDA 5D93A 1XVQA 3DYRA 3O3TA 4DVCA 1X9SB 1V40A 1BEDA 5D9VA 4PQIA 4TR0A 4KB3A 3P7XA 2LJKA 2R2JA 4PNGA 3HJMA 3QOUA 1EP7A 1B4PA 2P31A 3PR8A 3DRNA 2EC4A 2JSZA 1OAZA 2DJ3A 3GH6A 4FYBA 3IOSA 4WBRD 2DLXA 2HZFA 3QAVA 3GN3A 2A2RA 1TRVA 2GZPA 1A23A 4WF4A 2E2MA 4DSRA 2H0GA 4KE3A 4LLRA 4BWQA 2E2GA 5B8BA 1VF1A 4OWYA 3M1GA 5ECKB 5G31A 3KCMA 3I9V2 2GDRA 9GSSA 3GYKA 1SD8A 1ML6A 4F82A 4IP6A 1SU9A 2LRCA 4KAEA 3GRXA 4O92A 3ERWA 4OFTA 2H6ZA 4NPBA 5IMDA 1G6YA 1A2LA 4I8BA 1SYRA 1FB0A 2FA8A 4MP4A 1BQ7A 3LYPA 1TI1A 3LGCA 3GL3A 1HNAA 2XBQA 2DJ1A 1X9WB 1X5DA 2DJKA 4OCFA 3BD2A 3MWHA 2RLIA 1ERVA 3EWLA 4IJIA 3GHAA 1SK0A 3K8NA 4ZB9A 2FGXA 4KA0A 2CX4A 1HQOA 4HUAA 5CNWA 1URMA 1FVKA 2FWEA 4D73B 4GF0A 1R7HA 4JE1A 7GSSA 3HD5A 3O76A 1TRWA 3F8UA 3H8QA 3VWWA 2LUSA 1A8YA 1B9YC 1TU7A 4PXOA 2R37A 4Q5FA 2N5BA 4JRRA 2QSIA 2B1LA 1I9DA 5A4UA 2GSRA 4F0CA 3DVWA 1ZOFA 4XS4A 2XBIA 3EMPA 4MMMA 3R2QA 2L4CA 4MZCA 2JADA 3ZFBA 4E8EA 2HFDA 4N0VA 5IOWA 3W8SA 2RUEA 1GSUA 4ZXGA 5DQYA 3P8WA 2HNLA 3D6IA 1I5GA 4EO3A 1J08A 2IMDA 5J9CA 2X64A 2C80A 1BJXA 4DEJA 4XHMA 1GSYA 2PU9C 3H93A 3E3EA 1MD3A 3TJJA 1JHBA 2GT5A 5B7CA 2Z9SA 3UBLA 1ZZYA 4FO5A 2OE0A 2RIIA 3IE3A 4HEA2 5AISA 3TOUA 2CA8A 2JSYA 4ML6A 3Q6OA 2IFQB 4FYCA 4XTSA 2DIZA 4YQUA 4AJ8A 4MDCA 4HOJA 1O81A 2FWGA 2LNSA 1GTIA 4IKHA 1PKWA 1ON4A 2L6DA 3W8JA 3TKSA 4KNDA 3ZVJA 10GSA 3GSSA 3KGKA 1CQGA 2MMOA 2PGTA 2CAQA 3WGXA 4NWYA 1HNBA 3DD3A 2F3MA 2IPAA 4ZBAA 1GTAA 4GLTA 3CRTA 3ZVJD 1UA5A 2H70A 5J3RA 1Q4JA 2HT9A 2XC2A 5F0GA 3KP9A 5KEJA 4KSMA 1EOGA 3TKQA 1RQMA 3EE2A 2LNTA 2LEGA 4V1Ap 3F3QA 3HVXA 2DJ2A 2DMLA 5G1LA 3TRQA 4K0GA 3WGEA 5J5NA 1GSFA 4OO4A 3U5RE 3KD0A 2F8FA 4PURA 3HCZA 4YAVA 2JACA 4PNFA 5A5KA 2LSTA 3VLNA 3KIJA 2C3QA 2H6XA 1GSQA 3IC4A 4E8HA 1BG5A 1DE2A 3VWXA 5GAND 4AJ7A 2YWOA 4D73A 5GZZB 1AAZA 2AUVA 3ERGA 1F37A 4ILFA 1A8LA 1Z6MA 2R4VA 3GX8A 3NIVA 1K0NA 4IW9A 1GLPA 2NVLA 4G9HA 3J7Yb 3FHKA 4TVEA 1YZXA 2LRNA 2V6KA 1O7UA 4GSNA 2B5EA 5JWOB 2VD0A 2P5RA 2G0FA 3TUEA 1Z7PA 4J2FA 3QFAC 2VL3A 2PMTA 4XCSA 1XW6A 1WRYA 4F2IA 3HKRA 4XS6A 3ZTLA 2FHEA 4ACSA 1XPVA 2VCVA 1JLWA 2VCTA 1FB6A 1O73A 4I97A 2B1KA 1GP1A 4OMVA 1QMVA 3D22A 2MBSA 4KGIA 4EUYA 4K8MA 3RHBA 3S9FA 3LFLA 5IO2A 1BYEA 2C8UA 4IQAA 4PQ1A 4V2LA 4K7IA 3A5WA 1PX6A 4MZBA 2F9SA 1K3YA 3VPQA 1YEPA 1ZCPA 2MMAA 2X8HA 3TJBA 4G2EA 1OKTA 4PX1A 3CBUA 3CSIA 2IFQA 3BJ5A 5FHIA 2GZZA 2M80A 2B6MA 2V1MA 2V41A 5D8IA 2H0HA 3HA9A 4TRXA 3TDGA 1LJRA 1X0RA 3L78A 4IJ3A 1N2AA 3GTUB 4KDXA 2OJLA 4CW9A 1FAAA 3F63A 1GL8A 3ERFA 3GKXA 3FK8A 1EWXA 5CREA 1AC1A 2C1YA 1TRSA 3FEUA 1RK4A 1UVZA 4IHUA 4IP1A 3APQA 3ZIJA 2B7JA 3LG6A 1TRUA 3H4KA 4ZL8A 4ZBDA 3GNJA 3GKKA 5HR2A 3HDCA 2IIYA 2A4VA 2LQQA 1PD21 1TOFA 2VCZA 1PGTA 4POLA 1V9WA 1G6WA 1Z6NA 2FUG2 4MLYA 2H30A 2O7KA 4G10A 3C1SA 3CYNA 1SJZA 3ME8A 2KUCA 3MSZA 4J56E 1GH2A 4ML1A 2C3NA 2CVDA 3IK7A 5LNKe 2DJ0A 3GV1A 4Q5QA 2I4AA 3ZIVA 3QCPA 1EOHA 1S3CA 5G5EA 4HU9A 5FWGA 3FR3A 1ERTA 2YJHA 4KSOA 3CTGA 2B3SA 5ABRA 3CMIA 2IWTA 2H75A 1SK2A 3IXRA 5CRDA 2HE3A 3ZZXA 2IMFA 2K9FA 3QAWA 4LMWA 2C4JA 5C00A 3DGQA 1R5PA 2R5GA 2JZRA 3BBYA 5B6NA 5LD0A 6GSUA 1SL2B 1ZGNA 2VO4A 5A4VA 3TKSC 4GQCA 4IELA 5IMVA 4TR3A 1VF4A 2L57A 1F3AA 1NHYA 4JEDA 4MPFA 4WETA 1WE0A 5AIXA 1E6BA 5LCZA 3C7MA 3ZMLA 3QFBC 4KH7A 1ST9A 2YZHA 3TB2A 4Q5RA 5ECRB 2ON5A 11GSA 2QGVA 1MDKA 2YV7A 3J7Yk 2WS2A 2B5XA 3JCML 2I81A 1Z7RA 4PUFC 5IMZA 4ZB8A 3NZNA 4F0BA 2TRCP 1KTEA 3HJOA 2VOCA 2VL2A 5IPHA 1MD4A 2L59A 4NMUA 5D96A 1B9XC 3F6DA 3LXZA 1EV4A 2GTUA 3EYTA 3F9UA 1QK8A 3ZRDA 2HI7A 4JR4A 3E0UA 5DDLA 3TKRA 3GH9A 3TCOA 1A2JA 3IK9A 2MZCA 3FY7A 3QAGA 4HU7A 1Z9HA 4BL7A 4ISDA 5ECMB 1M0UA 1PRXA 3DXBA 3IR4A 1M9AA 3KH7A 3GTUA 2VLUA 1K0OA 2NDOA 1HYUA 3MNGA 2I1UA 4N0ZA 4AF2A 1TU8A 3L9VA 1SJIA 4CHSA 1SKSB 1AIUA 2H1GA 1O8XA 22GSA 4ZB6A 4NV2A 3RDWA 1ZMAA 3G7YA 5ECLB 2YANA 4DSQA 4PUAA 2GQLA 5ENUA 3FZAA 4N11A 4K9ZA 4IS0A 4BVXA 2R6KA 3C71A 2DSAA 4RI6A 2REMA 4WR4A 2VIMA 2JZTA 4NV5A 6GSYA 4MF7A 5GSSA 1K0BA 4LA1A 1JZOA 1TK0B 5GSTA 1OE7A 5AGYA 1TK8B 3APSA 4AGSA 1TDIA 2K6VA 3F4TA 4YQVA 3KM6A 2GVPA 4POMA 1A24A 1T3BA 2JU5A 1NM3A 5KN3A 1HD2A 3BCKA 4EE0A 3EC3A 1VF3A 2HSHA 3ME7A 1GUHA 4KDYA 1DSBA 4GSSA 4EXJA 2GGTA 3VWUA 4BWSA 1PMTA 3FR6A 4XRDA 5CRGA 4FYUA 1G0TA 2IMEA 3TRPA 2H1DA 3PH9A 4HI7A 4F03A 2E7PA 5DAKB 5JWRB 1PKZA 3UMAA 3CSHA 2YWIA 4WBJA 2H19A 3FZ4A 2WZ9A 3RBTA 1AQWA 3RPPA 5HR3A 3FRCA 2PN8A 1K0DA 2ZNMA 2VAFA 4K6XA 4ZL9A 3GIXA 2ALBA 1PQNA 3P2AA 5G30A 1K3LA 3LQ7A 2H6YA 1FVJA 1XFLA 4ZL7A 1OE8A 2C3TA 1M2BA 5IMAA 4K1FA 4AJ6A 4LL1B 3AY8A 2PUKC 3IRAA 3TOTA 4L5OA 2WB9A 5JCUA 2IMIA 2RM5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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