5HR0A

Crystal structure of thioredoxin e101g mutant
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKGFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title Structural variability of E. coli thioredoxin captured in the crystal structures of single-point mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hr0A00
1U87A 1GSEA 1YJ6A 3EC3A 2DJKA 4GXZA 2AAWA 2CZ3A 2CZ2A 1HNAA 1DE2A 4EUYA 5D9WA 3EWLA 1YKAA 2HXKA 2B5EA 2XBIA 5GAND 4HEA2 5ELGA 3LXZA 1HNBA 3G7YA 4GTUA 3ZVJD 2IPAA 1K3OA 20GSA 1ACVA 1GP1A 1R4WA 2PGTA 2QSIA 4EDYA 2WZ9A 2DLXA 2MZCA 3HJMA 1U3IA 1GTBA 1AQWA 2IL3A 5FT3A 5ECLB 1MD3A 2FUG2 5G30A 2O8VB 1R7HA 1WP0A 3DMLA 2ON5A 1TU8A 4PQHA 5J4UA 4YAVA 1TOFA 3CSHA 3HA9A 1GL8A 1GTUA 4JE1A 2WRTA 5COHA 5CAXA 2YV9A 1QGVA 3BD2A 5A4UA 3FR6A 3TOUA 3UJ1A 3A2XA 2N5BA 3TCOA 1TXXA 4K6XA 1TRSA 1PN9A 4G2EA 3DEXA 4EKZA 3ME7A 1FO5A 2LTKA 2H0GA 1USBA 3TKSE 1F6MC 6GSWA 3M1GA 1E2YA 2VUPA 4Q5FA 2X99A 4PNGA 3VI7A 2CX4A 4IP6A 4LMVA 1YZXA 4TR4A 3FRCA 3H79A 1ML6A 4XS1A 4CW9A 1B48A 4XCSA 4GLTA 1A2JA 2LNSA 4OD7A 2YJ7A 2H6ZA 1RW1A 1EWXA 1K0OA 1B4PA 4IKHA 3IK9A 5EL8A 4X1UA 1JZOA 1TW9A 2HNLA 3W6GA 2KHPA 1TI1A 5IOWA 4KA0A 5B7CA 17GSA 3WGEA 2DIZA 5F05A 2JSYA 2XPDA 22GSA 2JZSA 4HJ2A 2LKUA 3A2WA 1V57A 3UMAA 4V2LA 1ZYQB 4L0UA 5ENUA 1PL2A 4K0NA 3PGTA 3LQ7A 1X5CA 2H01A 3GA4A 4IBPA 1FVJA 3CTFA 3EMXA 3C73A 3F4RA 1WOUA 4MK3A 1TDIA 1LJRA 1PD21 2YPMA 5DBQA 4POLA 4HU9A 3FR3A 4OMVA 1YDKA 3QMXA 3GTUB 5JWRB 4OFMA 5AISA 4X0XA 5C00A 4F03A 1OVNA 3O3TA 2L5OA 2YJHA 5L71A 4ECBA 5DCHA 2YNXA 3TJBA 1ZGNA 3WT1A 4Z7XA 4L8EA 3V1WA 1PQNA 3CXGA 4LA1A 1FOVA 1U3AA 3LSZA 1ZZYA 1PGTA 4WBRD 4J56E 3HZ8A 1ZL9A 3H4KA 3GSSA 1AUCA 5ECPB 4F0BA 4MZCA 1YEPA 3EU4A 16GSA 1YQ1A 4BPYA 1F3BA 2I1UA 3IV4A 1PX7A 1TKDB 3DXBA 2VLUA 2YWOA 4AJ7A 2WGRA 4ZB8A 2CA8A 2C0EA 4ZBAA 1TP9A 1JZRA 4I6XA 1YY7A 2OE1A 3KGKA 3EE2A 1NM3A 1XPVA 1EOGA 3NOFA 3F4TA 3US3A 2HYXA 1XW5A 1MTCA 2L59A 1RQMA 1GSYA 4TN8A 3H8QA 5HR1A 2XC2A 1DE1A 5ECOB 2OBKA 3BOAA 5AGYA 2JADA 2V32A 3APSA 5EVOA 1N8JA 4YH2A 5J5NA 6GSTA 2D2ZA 4EF0A 5IM9A 3A3TA 1GRXA 2AYTA 3MAKA 2HE3A 5DCGA 3H93A 4KSMA 2DJJA 1SK0A 1C72A 2GTUA 1T3BA 2CAIA 2HZEA 3HVXA 3HHVA 2K9FA 5ELAA 1CQGA 1A8YA 2CV4A 4PQIA 4GCIA 4XHMA 4KUNA 5ID2B 2JZTA 5H5RA 3L9VA 3KM6A 4IN0A 1XWGA 1M7TA 4WXTA 5GSTA 2HSHA 3H1NA 1VF4A 3AY8A 4I97A 5A4VA 4MMMA 2LQQA 4TR1B 2H6YA 5HFKA 2B3SA 3ZREA 2FWGA 3GNJA 4HU7A 1EEMA 1R26A 4BVYA 1UC7A 8GSSA 4HDEA 5KN3A 4MF7A 2B5YA 4XS4B 5HQPA 2C1YA 3TJKA 4J2FA 2G0FA 5INYA 2EIRA 2VCQA 4ZL7A 2IMIA 3QAVA 3GMFA 3ZL5A 3L0HA 4KB3A 5F8BA 2L6CA 2IMEA 2H1GA 3VLNA 2X8GA 4BVXA 1EEJA 3BCKA 1N2AA 4Q5QA 3KMNA 1V98A 1Z6MA 1V2AA 5D9VA 2I4AA 1GSDA 2GQMA 3DGQA 5DQYA 2NTOA 5IQYA 4HZ2A 2KP2A 3IAM2 2OE0A 2IMFA 1EZKA 2HZEB 1E6BA 4KDXA 2K8VA 5G5FA 1XVQA 3D22A 1U6TA 2LRCA 4NWYA 2R3XA 1T8EB 2JL4A 3F6FA 3LORA 1GUHA 2E2MA 1SKWB 5CYYA 4NV2A 2C0DA 1BG5A 2VL3A 3TJJA 2IN3A 5A4WA 2ZNMA 2YWNA 1KBNA 1FAAA 2FD3A 3TGZA 3G9BA 4JRRA 5CRDA 3QAGA 4MJEA 3GSTA 5IO0A 2V6OA 4J57E 1X9WB 2H19A 3TUEA 3FY7A 2WS2A 1AQXA 4HQSA 1Z7PA 5HR2A 2VOCA 2MMAA 2GSQA 2RLIA 2R4VA 5ECSA 2VL9A 1F37A 4NHWA 3ZLPA 1O7UA 3ED3A 5D73A 3PH9A 2H1BA 2C0GA 3GRXA 2OKAA 1AIUA 1M2DA 5G5EA 1OKTA 3UARA 1FB6A 1XWKA 2WCIA 3RPPA 2GZZA 4POBA 6GSSA 1G7EA 5IPGA 18GSA 3HJOA 4EC0A 1LU4A 4HI7A 1GH2A 2H1AA 1XIYA 4MF6A 3TB2A 1X5EA 5JWQB 2DSAA 5DJLA 3C7MA 5D8IA 3VURA 4KGIA 3QCPA 3ZTLA 2P31A 1SJIA 3RAZA 3IRAA 2GQKA 4MCUA 1X5DA 2NDOA 2CVKA 1LBKA 3VWVA 1Z5YE 2HSYA 2YN1A 3EMPA 5EPFA 1SK1A 3NZNA 4EE0A 2GZPA 3GURA 1R5AA 4FYCA 1M2BA 3ZITA 4KW6A 1T4ZA 4O32A 1K0AA 2H70A 1TRVA 1EGRA 1M9BA 3HD5A 3UIWA 2I9HA 3ZMKA 4V2NA 1HD2A 2PMTA 4IP1A 4MPFA 1GTIA 2YCDA 4K1FA 3KH7A 2GT6A 4IGJA 5HFIA 2AB6A 3MNGA 1Z7RA 1AW9A 2CT6A 1K3YA 3E3EA 4XS6A 1DSBA 3D4TA 1EP7A 1KNGA 3R2QA 3TRPA 1W4VA 4JBBA 2REMA 2B7KA 4FO5A 2Z9SA 1AC1A 3F4SA 1S3CA 1M99A 4JZQA 4ZXGA 1X0RA 5JCGA 2JACA 3FEUA 5JWOB 5H5QA 2M72A 3FZ9A 2E0QA 1PMTA 5F07A 1FG4A 2LJKA 3TKSA 4F2IA 1B8XA 2FNOA 1AAZA 3ZIVA 2YZUA 1O6JA 1HNCA 3JCML 2ON7A 2H30A 3UVTA 3HXSA 3FKFA 5IO2A 4I5QA 5IMVA 4WEYA 3GTUA 2GSSA 4AJ6A 2VCZA 4N10A 3KH9A 4ZBBA 3K8NA 3DD3A 1M9AA 1XOAA 3IK7A 1GWCA 1FB0A 1SD8A 2QKEA 3UOMA 1O81A 5JCUA 4AGSA 2FWEA 1A0RP 4ACSA 1ILOA 6GSUA 5DALB 1BYEA 3F8UA 5B6MA 2O87A 4MH3A 2WB9A 1WPIA 2MBSA 5J3RA 3RHCA 2C0FA 2VD0A 1XBSA 2FGXA 3N9JA 2RIIA 4NXIA 3L9UA 1SJ6A 4GF0A 1HYUA 3CRTA 2DMMA 1GUMA 2JZRA 1TK8B 1Q4JA 1GULA 3L9SA 2GGTA 3O76A 2WULA 4MJAA 2I81A 4I2UA 2DJ1A 1SL1B 3VPTA 3MDKA 1NW2A 2K8SA 4MJBA 3IE3A 2A4VA 3D6IA 3MSZA 4FYUA 3NIVA 4LL1B 1IYHA 1DBYA 1KTEA 2B7JA 4MA9A 5KEJA 4PUAA 2N5FA 4WKWA 2VL2C 2LJAA 1A23A 1TTZA 2BMXA 4E8EA 5B6NA 3ZFLA 1GTAA 1URMA 3S9FA 2LEGA 3KCMA 5CRGA 5HR0A 4POKA 2FHEA 5HR3A 1G6YA 4AJ8A 4OFTA 3DWVA 3P7XA 1XXUA 2E7PA 4RI7A 1QQ2A 4GSNA 3CRUA 2B1LA 1PKWA 4MH2A 3WYWA 5ID2A 4OO4A 3SWLA 1SD9A 4MPGA 1VF3A 3M9JA 1U88A 4OCFA 2VIMA 4YQMA 1K3LA 5AN1A 2OACA 2XHFA 4HZ4A 2MMOA 5DJMA 1TI3A 1EGOA 1XVWA 4TR1A 1SJZA 3RBTA 1DUGA 4BA7A 2HT9A 1GSQA 4Q5RA 1ST9A 5KN0A 4OWYA 3WT2A 1OC8A 3LEFA 4XS4A 4EO3A 3KZQA 2KP1A 2DJ2A 5GZZB 2A2SA 1CQHA 3LXTA 4G19A 5IMDA 3G7JA 2FA4A 1FVKA 1UA5A 2FLSA 3QR6A 2DIYA 1UN2A 4IVFA 2RM5A 1GLQA 2LRTA 3KD0A 2OA7A 3QDNA 1XW9A 1IYIA 4YQUA 4ML6A 1MDKA 1SKRB 4EDZA 4OFNA 2DBCA 3IHQA 5LCZA 1NHOA 3LYKA 1I5GA 2H75A 4GQFA 3IA1A 4F9ZA 4JR6A 4K0GA 2BTOT 3L4NA 2HLSA 2C80A 2YWMA 1PL1A 3APQA 1OAZA 3GH6A 2N5AA 2LSTA 3LFLA 3PR8A 4DSSA 4WR5A 2YZHA 2VO4A 2GSTA 5D9TA 1M2AA 2H71A 3M3MA 3ERGA 3WGDA 1WIKA 2H72A 3GKXA 4NAXA 2J9HA 2WDUA 2H8LA 1S3DA 2O89A 4YAPA 4K7NA 2L4CA 2A2RA 2F51A 2OBIA 4L5OA 2CAQA 1A2MA 2RM6A 2VLVA 3QPMA 1K0CA 3LWAA 4NV5A 1ZCPA 1GSUA 1G6WA 3N5OA 4PXOA 3WGXA 3U5RE 3FYGA 5CREA 1PKZA 1QUWA 4LLRA 2V1MA 3GX8A 1ZMAA 3A5WA 1EP8A 3IXRA 3QAWA 1TRUA 2MYGA 4HS1A 2VM2A 4ZL8A 4MZBA 1ABAA 19GSA 1TJDA 2PUKC 2VCXA 4MZWA 5ECMB 2C3NA 3EINA 4HJMA 3DIEA 3QD9A 4F0CA 2WFCA 1GSSA 1V58A 2AJQB 2O85A 3FW2A 5IMZA 5B8AA 1A0FA 2H1DA 2MMZA 4RQXA 1K0BA 3P8WA 4TRXA 1ZYEA 5G31A 4JR4A 3HVVA 4BL7A 4DSSB 4MDCA 1ERWA 5LD0A 5DVBA 1MDJA 4IELA 3TKQA 2HRFA 2GZYA 2OE3A 3EURA 1BEDA 3LJRA 1T00A 4O5RA 1GUKA 2FA8A 5IMCA 3F6DA 1YKCA 5HFGA 4LMWA 2FWHA 4G10A 3MWHA 3BJ5A 2PWJA 1J9BA 1B9XC 1GNEA 2MBTA 4HQZA 4LL4B 1ERUA 3M9KA 4GQCA 1XCCA 4XRDA 3APOA 2KLXA 2M80A 2IWTA 1S3AA 3DKSA 5ABRA 1F9MA 3QFAC 1UVZA 1T7PB 2VLTA 1NHYA 4GSSA 3IDVA 4ECJA 3P2AA 4GWRA 3ZZXA 5F06A 1H75A 1GLPA 3TOTA 2V2GA 2H0IA 2K18A 1X9SB 1M0UA 4N0ZA 1TRWA 3O6TA 4BWQA 1JLWA 4ZB6A 2M46A 3HZ4A 2PN8A 3Q74A 3QFBC 3GFKA 4NHZA 1EV4A 4ECCA 2VCVA 1K0NA 1JZWA 4N0VA 2PVOC 2R37A 4V1Ap 4ZILA 13GSA 3EU3A 3ZYWA 1PA3A 4PX1A 1K0DA 1R5PA 3FZ4A 4K9ZA 2F9SA 4EVMA 4D73A 3HDCA 1WWJA 4ULXA 4TXOA 1VRSD 3BBYA 1ZOFA 4X43A 1BJXA 3ZRDA 3EVIA 1ERVA 2K6VA 5DALA 3C8EA 3IR4A 3TJGA 2IMKA 1FW1A 5G1LA 3RPNA 2ZCTA 4TXVA 2GVPA 3KP8A 2YV7A 2VM1A 3KIJA 5KN2A 3W8JA 1SKSB 1F3AA 2AUVA 1EV9A 12GSA 1OKDA 3HY2A 3VWXA 4ZL9A 3KTLA 3GH9A 5H5SA 2PBJA 4E8HA 1OC9B 2F8FA 2ALBA 2VCWA 3HVSA 1ON4A 5IIZA 2GSRA 5ECHB 2FY6A 3CBUA 3GN3A 3ISOA 3J7Yk 3RHBA 2P0GA 2MMNA 3FHKA 1GNWA 5IMAA 1F2EA 2H6XA 2LQOA 3DRNA 2JU5A 1JZDA 1BAYA 5DAKA 4ZB9A 3I6AA 2L6DA 1WRYA 1G0TA 3GUSA 4WBJA 2DJ3A 3GV1A 1JLVA 4D73B 2YOIA 3LGCA 1OE8A 2H73A 4TXOB 4EL1A 2H0HA 3LYPA 2PVQA 5J9CA 3TRXA 3TDGA 1YEXA 4QQ7A 3I69A 4XIHA 3D5JA 1J08A 5FWGA 5FHIA 1KEBA 1QK8A 3HYPA 2IFQA 4KAEA 1WMJA 3F9UA 1TK0B 4RQRA 4ECIA 5A5KA 4KNDA 4K8MA 2QGVA 4KDYA 2XPEA 1J0FA 2HZFA 5DQSA 1BQ7A 2L57A 2LNTA 2L5LA 2HRNA 3G7IA 2O7KA 1A8LA 2F8AA 3KXOA 4NMUA 1Z6NA 1BX9A 4BWSA 1XWCA 4QL7A 3HKRA 5ECQB 4KX4A 5DDLA 10GSA 3IAS2 1PX6A 2H66A 1Y25A 3CSJA 4K7IA 4K7OA 4IJ3A 2AHEA 4MLYA 4TVEA 1THXA 3GKKA 5IOXA 1XWBA 5DAKB 1V40A 3D0ZA 4IHUA 3ZVJA 3KTBA 5D93A 3U6VA 2P5QA 3RDWA 3TJFA 4TR0A 4AF2A 3KMOA 3CSIA 4L5LA 5E4WA 1AQVA 1PSQA 4GRFA 2HI7A 3ME8A 1PRXA 2NBSA 2FCHA 1W89A 2J23A 6GSYA 2KUCA 1H4OA 2BJXA 2IIYA 4YQVA 1XFLA 2LUSA 4PUFC 4ISDA 3UVHA 5G1KA 3E0UA 2G2QA 2YWIA 2F3MA 1B4QA 5G2ZA 4DSQA 4WR4A 4TW5A 4POMA 2YP6A 4N11A 3SBCA 2C3QA 2TIRA 1OYJA 3GKNA 1O8XA 5LNKe 2IFQB 1T1VA 5ECRB 1YF0A 1MDIA 3GL3A 3HCZA 3ZIJA 3GKMA 5J9BA 1SL0B 5AIXA 5CRWA 3C1SA 1A24A 2RUFA 3BCIA 4FYBA 2OADA 5ECKB 2LJRA 3KP9A 5GSSA 3A2VA 2DC5A 2V6KA 3F3QA 3VFIA 4Q5NA 2VD1A 1THOA 2RUEA 4DVCA 2R5GA 3GIXA 5GAPD 4FIWA 5IPHA 6GSXA 3Q6OA 4O7HA 1QXHA 2EIQA 3VI5A 4EXJA 3D21A 4HUAA 3PINA 3DVWA 1Q98A 4PGTA 5EY6A 3P90A 2TRCP 4JEDA 1TU7A 3IOSA 1A2LA 3DVXA 4JU5A 4ID0A 2NPBA 1XOBA 4XRAA 3EYTA 1QFNA 3FZAA 3J7Yb 1T4YA 1SENA 1B9YC 2CVBA 3TRQA 3UEMA 1MEKA 5JCWA 2GDRA 3VK9A 4H86A 4TOPA 2R6KA 2C3TA 4WF5A 4WETA 3GYKA 4OCEA 3M8NA 3I43A 3F63A 1OE7A 4XTSA 4F82A 2I3YA 3VWWA 4DSRA 1WE0A 4IJIA 2YANA 4V1Ag 2X64A 5CO3A 1RK4A 4TR3A 2VAFA 7GSSA 2CX3A 4KSOA 9GSSA 1O8WA 3TKPA 2VCTA 4MJCA 5CP1A 2B5XA 4TKYA 2C4JA 1OC3A 1XZOA 1VGLA 2LV3A 5KN1A 5AIVA 4I8BA 2R2JA 2X8CA 3I9V2 3LG6A 2E2GA 1YF1A 2B1KA 2CQ9A 2JSZA 4PNFA 1FHEA 3C71A 5ECIB 4V2MA 4N30A 3TKSC 3ZMLA 3HJPA 1SYRA 2DMLA 5CRHA 5F0GA 4MP4A 2B6MA 3CMIA 2ZUPA 4KH7A 2GQLA 4OO5A 4GSTA 4ML1A 1O85A 1SYXA 2HFDA 1MD4A 1SK2A 5IMFA 3ZFBA 1NSWA 5ECNB 2IMDA 3DYRA 4G9HA 1VF2A 4RI6A 14GSA 2PU9C 2GS3A 2XBQA 1QMVA 4KE3A 3VPQA 1WJKA 2LRNA 2QC7A 4P3YB 3F3RA 1O73A 3VWUA 2TRXA 4KCEA 3Q18A 4ZIJA 2LS5A 2CVDA 4RUVA 3KEBA 1Z3EA 3UBKA 2PERA 3UAPA 1EOHA 2VL2A 4CDOA 3FZ5A 2IJYA 1AXDA 2PPTA 1I9DA 4KDUA 3GL5A 3KJYA 2L4QA 5B8BA 3C1RA 3FK8A 1ERTA 5CNWA 2FWFA 1X9MB 2EC4A 4O92A 4HOJA 4CHSA 1V9WA 2KOKA 3GX0A 3FR9A 3OR5A 4IW9A 1Z9HA 3M0FA 1G7OA 2NVLA 3D4MA 4ZBDA 4NPBA 2H74A 3ERFA 1XW6A 3UBLA 3UL3A 2GT5A 1HQOA 2DJ0A 3IPZA 4QL9A 4IQAA 1VF1A 1OC9A 4IS0A 2EIOA 4I2TA 4L0WA 4PQ1A 3E9JB 3CYNA 3ERWA 3IC4A 4ILFA 2P5RA 2OJLA 4PURA 2AV4A 3WD6A 3W8SA 3QOUA 1JFUA 1GSFA 3F0IA 2GLRA 2WJUA 1SU9A 1TK5B 5J41A 3L78A 3Q19A 4FH8A 2H76A 5D96A 1JHBA 4KCAA 2X8HA 4DEJA 1K0MA 4MF5A 5D9XA 4IQ1A 3TKRA 2ES7A 5E59A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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