5HUPA

Crystal structure of nadc from streptococcus pyogenes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
STDLTPFQIDDTLKAALREDVHSEDYSTNAIFDHHGQAKVSLFAKEAGVLAGLTVFQRVFTLFDAEVTFQNPHQFKDGDRLTSGDLVLEIIGSVRSLLTCERVALNFLQHLSGIASMTAAYVEALGDDRIKVFDTRKTTPNLRLFEKYAVRVGGGYNHRFNLSDAIMLKDNHIAAVGSVQKAIAQARAYAPFVKMVEVEVESLAAAEEAAAAGVDIIMLDNMSLEQIEQAITLIAGRSRIECSGNIDMTTISRFRGLAIDYVSSGSLTHSAKSLDFSMKGLTYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m4 (strain mgas10750)
publication title Streptococcus pyogenes quinolinate-salvage pathway-structural and functional studies of quinolinate phosphoribosyl transferase and NH3 -dependent NAD(+) synthetase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (Carboxylating)
total genus 80
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B, C, E, F, H
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2016-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5hupA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 5hupA01
2Y70A 1SU5A 4M6VA 2DZPA 1U83A 2GJLA 2RDTA 1OK4A 3IIOA 1KM5A 1GVFA 2HS8A 3G1FA 4O1DA 2Y85A 4WX2A 2B7QA 5K7JA 1FXQA 3QJAA 2AGKA 3MWAA 3GDRA 3UQNA 1GOXA 4JTIA 3P60A 3HF3A 1P1XA 3QM3A 3P5ZA 3MP5A 1Q3NA 1FBAA 4GNJA 1GYLA 3NM3A 3HB9A 5CPLA 4WZHA 2WNZA 1KLZA 3LLFA 3DU0A 1OX4A 4UTJA 3HO8A 3NGJA 3H54A 4WY0A 1PVNA 3T44A 1R46A 3IGSA 3NPVA 4O50A 2YYUA 1O60A 2E6DA 1PIIA 4H4IA 3L0KA 2QCFA 3W75A 3CB8A 3FS2A 2BWGA 3M5ZA 1H7OA 3NQDA 4JTSA 4ZQNA 3B0VC 2CU0A 1F2JA 1J5TA 3GVGA 4X22A 1TTPA 3BW3A 4JGDA 3WJSA 3UWYA 5DBTA 3O6YX 5HR7A 3ELFA 1DORA 1OFPA 1DBTA 5LHEA 1RD5A 2QCNA 1OFRA 4N4QA 4RR4A 4K36A 4TX9A 1ICPA 3H55A 1FWRA 1XBXA 5KSWA 3LHWA 1P0NA 3L5AA 1KM2A 1EB3A 5F4SA 2C15A 3SY5A 3IIPA 4UMCA 4FNRA 3SR7A 2JKPA 3TCEA 4UTLA 3ATZA 3LCHA 2VEIA 4XKYB 3DKJA 3NDOA 1OFAA 2YZRA 4A22A 2RH9A 3TH6A 4U4MA 3B4UA 3NQFA 2NV1A 3N2XA 4JTUA 4JS3A 2PRMA 3E0IA 3EWZA 3I7SA 1AW1A 3MYOA 1F5ZA 2DZWA 2E6YA 1GZGA 1DQXA 2QCCA 3QMTA 1Z41A 2A21A 4RLIA 2ZCGA 3ZWTA 4A21A 4MOZA 2VC6A 3C61A 1H62A 2Q8LA 4FNTA 1G6CA 3IIXA 1V5XA 3HG2A 5D2VA 3NPXA 4ZQPA 3DFSA 5G1TA 3HBLA 5HMSA 1OYCA 1JVNA 4AHPA 2WSQA 4B5NA 1QMLA 2QDHA 3INPA 3TE9A 1RZMA 2A5HA 3PSWA 3LI0A 1BTMA 4HNNA 4MYAA 4IUOA 2A0NA 2V30A 3M41A 2QUUA 1JCJA 3NEVA 4JY8A 3LCXA 2ZZ7A 1GTHA 1QFEA 1HFBA 3GYEA 1WV2A 5K4ZA 1QOQA 2ZRVA 4LS0A 3KRSA 3W3OA 3DI1A 4TU1A 2C18A 4EIVA 3S5OA 5DY3A 1GEQA 4MLRA 3PS7A 3FOKA 1YLVA 2P0OA 3HMJG 1W54A 3UNDA 3HIJA 4MY1A 5EMUA 3BLEA 1VS1A 1KM0A 1N8FA 1P0KA 5FF2A 5DXXA 1OX6A 2FB2A 1G4EA 1AL8A 3CWOX 3EWXA 2X30A 4XQ6A 1QPNA 2EF9A 3G18A 1YXDA 4MFEA 4YWIA 1Z44A 1ZENA 3TROA 4DBDA 1SZNA 5C54A 4DELA 3I68A 3R89A 4MIMA 1QAPA 3W2KA 1TV7A 1VZWA 1KW1A 3A9IA 2JGQA 3PBWA 1Z42A 1CW2A 3GXPA 3TAKA 4UTHA 1S5TA 3W7OA 1RQHA 1H51A 4FX8A 4GC4A 3S1XA 5LNWA 2R94A 4K7VA 1FWTA 4LRSA 4IGHA 3N9RA 1K8XA 4NX5A 4RX0A 1KTBA 3B03A 5HR6A 1C29A 2Y7GA 3CIWA 4AWSA 1JQVA 2NWRA 1JCLA 2WJZA 3W7NA 4BFAA 3NZ1A 3WJXA 5HWNA 3EX1A 3BG3A 2VFFA 3W85A 1FX6A 3BVJA 1KFJA 1HTIA 4PODA 3C0JA 2H90A 3QEZA 4IQLA 3GDMA 2A6LA 2NXGA 3NL5A 1W56A 3MI2A 1I4NA 3P80A 3HPXA 1G67A 1F6PA 3N14A 3UXAA 3TC6A 4RXFA 1GQNA 1TRIA 5EY5A 4E38A 1TV5A 1F05A 4XBKA 5FF3A 3L2IA 2XN0A 4RK8A 3W87A 1YDNA 3O6DA 3GR8A 3G22A 3PBUA 3UWQA 1WX0A 2YGYA 3FA5A 3UPWA 3GDKA 3NYZA 3TFXA 3DHDA 3HG5A 3W1RA 3E02A 3IIZA 4DF0A 3TR2A 4EOUA 3M43A 5BMWA 4MLJA 3LERA 3PG8A 3M9YA 4IPIA 3VNDA 1YTDA 4BR1A 1YXCA 1ICQA 5AC7A 2H8ZA 4HKPA 3V1PA 3M5YA 5TQLA 2TRSA 4M7TA 2YSWA 5BRBA 5AHNA 3Q37A 3UWVA 1TO3A 3W83A 3NQCA 1XDMA 1EWDA 4FNPA 5DXYA 5AB3A 4FF7A 4HSNA 3W7EA 4JTLA 4N9DA 4QNEA 4OV9A 1NSJA 3NNTA 2VENA 3HG3A 4M6PA 5BW6A 3FEMA 1KM4A 3E49A 4LVAA 1O94A 2JK2A 4UTKA 3PM6A 4S1FA 3GNDA 2HS6A 3NQ7A 2ZRXA 4GUHA 1X1OA 5BNKA 4FIQA 4JY9A 3W2LA 1TPWA 3BGJA 1ZAIA 4E0CA 3NAVA 4JXCA 3EEGA 3ANYA 3TC7A 1IF2A 3BO9A 2DZVA 3IEBA 4LC8A 1WYIA 4BF9A 4LU0A 4EF9A 4UNLA 1GG0A 5IM51 2ABBA 3S1VA 1MZHA 2PC4A 2FLIA 4GBUA 4O54A 5KITA 2CZFA 2GVLA 3DXIA 5A8GA 5CG7A 2ZZ4A 1D9EA 1SO6A 1FDZA 4NVTA 2PRHA 5DLCA 1JRCA 4O8RA 1LBFA 3S5ZA 3C56A 1JULA 2WQPA 1SW3A 4IMFA 5EKYA 1VYRA 1P4CA 4Z1DA 1FWWA 1TPB1 5G4EA 3TK7A 3B8DA 5L9FA 2Y7DA 2RHGA 2PRLA 2RDWA 2CFFA 2A85A 4ZQMA 2WSRA 3DENA 4RV8A 4TMCA 2GQ9A 3QQ0A 2X1SA 2P10A 4YXGA 3R12A 1XUZA 1W3TA 1MXSA 3E96A 1A5SA 4DXVA 1ML1A 3HGSA 4HPJA 5LKYA 4OHQA 3W1TA 4XKYA 3TW6A 3BV4A 2V81A 5LZLA 2PCQA 2DZSA 1FWNA 5FI8A 3TNOA 3ZR4A 2YW4A 5GVJA 1QOPA 5J5RA 5C2XA 1SO4A 4S2CA 4QNWA 1NF7A 2HSAA 2ZA2A 3BPWA 1WBHA 3PBYA 3LTSA 4H3DA 1IGSA 3BARA 4O4VA 5KMYA 1O5KA 3EKZA 4N6FA 3C2FA 4ZMGA 1LOQA 8TIMA 3LOTA 1FCBA 4QJ1A 4GUGA 4ADUA 1NAL1 5AN7A 1VCGA 2CLLA 4GXMA 4NNBA 3QZEA 3G0XA 5G5IA 1R30A 4X3ZA 3W1XA 3RLUA 3LHUA 3P74A 5CPNA 3LXBA 5TBOA 4AF0B 4L4MA 5KZMA 3W9ZA 2GUUA 1B3OA 1TJRA 5CZTA 3W1PA 3G0UA 2W79A 2ZRUA 3TQKA 1PHQA 3CWNA 2V0TA 3HJZA 4N2YA 5CPOA 1IXOA 4O1CA 1QO2A 1VYPX 5K9CA 2ZDRA 3KRZA 3JRKA 5K4XA 3W7LA 1WAUA 4GFSA 4QQ3A 2GJNA 5CPMA 3MMTA 1JRBA 4RCXA 4JTHA 3W2NA 1A5BA 4IMEA 1G4PA 2Q3OA 3W2MA 1IXNA 4LUIA 1TPEA 5FEXA 2BLEA 4ZQCA 3HGJA 3GR7A 1VQTA 3W73A 5F2MA 3LXAA 3CT7A 1LM1A 1LBMA 3M6YA 3OVPA 4KFOA 1JQXA 1SUXA 4BK9A 3B06A 2ZBTA 4NXSA 4UFKA 2VFHA 1VHCA 5E1QA 1W3IA 3EWUA 3KVJA 2Y62A 2ZFAA 3LCGA 1TB3A 4PEKA 2CLMA 1I2NA 1XUUA 1L9WA 3T55A 4JR5A 3DI0A 3EX2A 3CHVA 2CLIA 5KZEA 3S5NA 1K02A 4JICA 3W7DA 2QJHA 3R13A 1I8JA 3P8JA 4JTKA 5I3GA 3LV5A 3QF0A 4LVGA 2B0MA 4A3UA 3WK0A 3TDFA 1WBJA 1TPVA 5D30A 3EWWA 3MP4A 3PC0A 4JIPA 4RZ4A 2NX9A 5DBUA 2ABAA 1H1ZA 2VEMA 2ZTKA 5EPDA 5U4NA 1TYGA 3QSRA 2JGYA 4NX0A 4UMBA 1GVSA 3QMRA 5E0KA 2YFOA 4X2RA 4ALDA 2DU2A 4CCCA 2J9YA 3KOFA 4R53A 1T96A 3MBFA 1QO5A 1XCFA 4PCFA 1DHPA 4UTMA 5CSRA 3PR2A 3A24A 2E5DA 3O07A 3WK1A 3S1UA 1RR2A 1QPQA 2OJPA 3NOEA 3ZFHA 1KTNA 4H6KA 1W5NA 3IGXA 5HWJA 4KFPA 5E93A 2GPTA 3PY2A 5D2TA 1RQBA 3GDLA 1EWEA 4Z1BA 3TFCA 1BKSA 1DVJA 1G7UA 4K7YA 4NU7A 3W2JA 4O1BA 1GG1A 3EXSA 1X1ZA 1TCDA 1UCWA 1PS9A 2OT1A 4IXHA 1RVGA 5HNRA 3C52A 4JX5A 3S8HA 3FYOA 1XBZA 2BSLA 2A7RA 1KFKA 1BWLA 3W71A 1QR7A 1I45A 1FWSA 4YMZA 3PB0A 1KV8A 5FESA 4O4WA 4UFHA 1XKYA 5SWUA 2ISWA 5D04C 1LCOA 3O15A 5DCDA 1JCNA 1TMHA 3VI2A 1SZGA 4UFMA 2QAPA 4NJGA 3P84A 2GOUA 4Z0SA 3TKFA 4AAJA 3PWAA 5G1YA 2QCEA 2J24A 4PL2A 1EUNA 1UUMA 3LCWA 1AK5A 3N9SA 4PL1A 3SIZA 3NQ6A 5I3JA 5I3IA 1U5JA 4QAIA 3MHFA 1KFCA 4JNMA 2OZ0A 3L0NA 3U8GA 5HUOA 3AO0A 4MY9A 4CQAA 2CZ5A 2EHHA 5G2HA 3QPYA 2NXHA 4R7JA 5BMXA 3GAYA 1UUOA 3RLVA 2Y88A 4LNYA 1J2WA 3NZRA 2C16A 4AHOA 1FY6A 1TPC1 4NNCA 2J88A 1I2RA 3TSMA 4NZFA 3BK0A 2WKJA 1W37A 4UIOA 5AYZA 1W5PA 3PUOA 2X2GA 4ORIA 4RZ5A 1AL7A 4NT0A 4LV4A 3NA8A 3L21A 3STCA 5AC8A 3USBA 4JDBA 1FCUA 1Y0EA 1DKWA 1CI1A 3DZ1A 1JCYA 3DKLA 3QSTA 4GWEA 3BG5A 2YPIA 4JYEA 1IXPA 2Z1BA 2DJLA 3I7QA 4M19A 3LRLA 3B05A 1HUVA 2JBMA 2ZTJA 3FLUA 1VGAA 2CW6A 2XN1A 4IX0A 4UR7A 1I2QA 1WDWA 5I3KA 3SGUA 1TTIA 4DPQA 2E6FA 5AHFA 3LCIA 2TYSA 2VEKA 3OVQA 1SFJA 3RFAA 4ZZ9A 1AG1O 1N55A 1B9BA 5U7SA 1K3UA 4TIMA 1LOLA 1MSSA 4DBEA 3CQ0A 2I1OA 4R33A 5CZ0A 3SFKA 1JUBA 4LS1A 1RPXA 1Q45A 1M7PA 1R47A 1WOBA 4LV9A 2V5BA 4UTIA 1WOAA 1A5CA 1PV8A 3G0SA 4ZL1A 3HQ1A 3HOJA 1B57A 1SSDA 1RQEA 1Q6QA 1KFEA 2FPTA 2J9ZA 4JTFA 5KINA 5J5DA 5CGQA 1GPWA 2VKZG 1HL2A 1R2SA 1OFDA 1A50A 4DF2A 1VR6A 4U28A 3W1QA 3VKJA 3TMLA 1ZAJA 2Y6ZA 4RZ6A 4CCDA 3UWUA 2C19A 3EXTA 1JUEA 3WK2A 2CZEA 2FDSA 1F7BA 1QWGA 3HGRA 4N9EA 1OYBA 2YDAA 3G3DA 4O12A 4Q33A 3LGEA 4WQ6A 1Q6RA 4MJZA 4O19A 2V2HA 1TTJA 1LZOA 2A7PA 5AHIA 2UV8G 2GQAA 2Y89A 4O16A 4I7UA 4WOZA 2XN2A 5D2WA 1GTEA 4AF0A 1ZALA 2GVJA 1TSIA 3G1DA 2ZQ0A 4WY0F 3WJYA 4FXSA 1SFLA 1XL9A 2BXVA 3FKKA 1FDJA 2NUXA 5AHMA 1TIMA 3WJZA 3B0PA 4JN6A 5LNUA 2J27A 1OX5A 4J9JA 3PG9A 1IIHA 1LRTA 2E09A 3V75A 3AJXA 3NQVA 1XI3A 2QF7A 4WXZA 3EX6A 4ORMA 3W7HA 3LRKA 3M44A 3Q2DA 3T40A 3SSJA 3OIXA 2PURA 1G69A 3QW4B 2E5BA 3EB2A 2F84A 1FDYA 3HG4A 3ABSA 1ZJIA 1H61A 4O13A 1B4KA 1DV7A 4DO5A 1SO5A 4OE7A 1KA9F 2G95A 4QM1A 3LX9A 2ZZ3A 3C6CA 2ZZ2A 4FNSA 2C1HA 3KVMA 3GDTA 2X1TA 2XFWA 4LOCA 3B0UX 2B4GA 5G4WA 4DPPA 2TSYA 3G8EA 1DJNA 3DH7A 1AMKA 1EEPA 3LHYA 5DY2A 3E9AA 2BX7A 3GKFA 3MBDA 4K6AA 5G2WA 4QSHA 3NL3A 3W84A 4JTJA 2QCMA 3LCLA 1WQ5A 1EP1A 4IXXA 3C2EA 3O1NA 4Y9AA 2YW3A 4CNPA 1DOSA 4QITA 1F6KA 3A22A 3LB0A 4XZ9A 1LTDA 3SGZA 2O7SA 4C1LA 4FX7A 5FF4A 1Z48A 5HJLA 3S5YA 1B4EA 3DHFA 4AWUA 5HINA 2Y61A 2CLEA 2VEPA 3OBKA 5D32A 4CNOA 5C55A 3NXFA 5I3HA 3KX6A 1TPH1 2WO5A 2A2IA 1BWKA 1XFBA 3PVFA 1OFQA 1K7EA 3QPZA 5TIMA 3F4NA 3RNDA 1O95A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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