5I14A

Truncated and mutated t4 lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGGGSGGDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTHSLHALQHKHWDHAAVHLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords mutated and truncated T4 lysozyme
total genus 44
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5i14A00
149LA 2LZMA 3GUIA 1L11A 1G1WA 1L40A 2RBSA 4W52A 166LA 2RAYX 1L69A 114LA 1L90A 1P3NA 1L62A 261LA 1D2WA 1SWYA 1L34A 3DN8A 2QARC 1OYUA 1L47A 3DN4A 1ZURA 2B72A 176LA 1QTZA 1C6NA 111LA 1CU6A 1T6HA 188LA 1C6KA 187LA 2Q9EA 1LWKA 1L58A 1C6CA 215LA 3V2WA 1CV0A 1G0MA 1C67A 1C62A 220LA 1C6LA 1QT6A 1C6GA 3DN6A 3HH6A 3HTGA 104LA 143LA 129LA 160LA 1L51A 216LA 3PDSA 248LA 3ODUA 4I7MA 1KY0A 2B70A 228LA 4W59A 185LA 1L21A 1CX7A 1L94A 257LA 4DJHA 251LA 224LA 1L95A 180LA 151LA 1D3FA 1L64A 226LA 1C6JA 237LA 3C8RA 3HDFA 2B74A 2B6ZA 241LA 2CUUA 3NY9A 2O4WA 1QT5A 1QTBA 1XJUA 178LA 191LA 1L28A 1L46A 3SB7A 223LA 1C6IA 1SWZA 170LA 1DYGA 1L68A 1P7SA 186LA 3CDRA 1QT7A 1LLHA 4EJ4A 1QTHA 1DYBA 1XJTA 1P37A 1L50A 2HULA 198LA 1L05A 1LYFA 1C6FA 3OE0A 1L10A 1P46A 1L85A 3C83A 1L14A 1LI2A 155LA 3HWLA 1CVKA 3GUOA 3DN1A 4PK0A 141LA 1CU2A 1L22A 1LGXA 1LI6A 2B7XA 1DYAA 1G0PA 225LA 1PQDA 200LA 3DMXA 182LA 3FI5A 1L30A 1L80A 1P6YA 2B6WA 4LDEA 2B6YA 1SX7A 1CU3A 3RUNA 1G0LA 1LYDA 4W56A 1PQOA 236LA 1L93A 102LA 2LCBA 1SSWA 231LA 2HUKA 1CV6A 3SB6A 250LA 1L77A 1G0GA 1L25A 4IAPA 3GUJA 131LA 1L76A 1L0KA 3VW7A 2A4TA 3CDOA 1CV5A 4I7SA 145LA 3LZMA 1L36A 3HU9A 1L92A 227LA 1EPYA 255LA 2RH1A 1K28A 3HH3A 1L15A 3C80A 1D3JA 1QTVA 1CV1A 4ARPA 140LA 1PQJA 213LA 1SSYA 3JR6A 192LA 1D3MA 3RZEA 4ARJA 138LA 1T97A 1JTMA 1L18A 1LW9A 1C63A 3HTFA 1C6HA 1DYCA 3DNAA 1KNIA 163LA 197LA 3V2YA 165LA 144LA 3DMVA 195LA 175LA 4YXAC 2LC9A 211LA 1L65A 1L04A 1L83A 127LA 1KY1A 115LA 1L57A 184LA 172LA 1L70A 1L52A 3C7ZA 1L71A 1L96A 3C7WA 4S0WA 190LA 4OO9A 118LA 1L33A 2RBOA 4I7KA 3HT8A 1L42A 3HUQA 1L84A 4W53A 1L00A 3GUMA 3HTDA 249LA 2NTHA 1C66A 1C6EA 3HUKA 126LA 4PJZA 1OWZA 1L59A 1L67A 2F2QA 2RBQA 4AQNA 1CV3A 3C7YA 3GUPA 189LA 1CTWA 1L79A 1L74A 1L27A 2B73A 3DN2A 1SX2A 1L63A 4W55A 1QT4A 4E97A 1L49A 1B6IA 147LA 1JTNA 2B6TA 181LA 150LA 1L35A 4DKLA 1QSBA 1L89A 235LA 1KS3A 1L31A 1DYEA 2OU8A 168LA 1T8FA 1C6MA 1LI3A 1QUHA 103LA 242LA 1C6QA 1L03A 2F32A 3SB8A 1XEPA 1L86A 1L81A 3HH5A 196LA 1KW5A 1L23A 5I14A 1PQIA 217LA 4ARMA 159LA 1L72A 1L97A 4I7PA 3SBBC 1L20A 3HDEA 230LA 125LA 210LA 3HUAA 1OVKA 4ARQA 1CUQA 4ARLA 1NHBA 2HUMA 1DYFA 2OU9A 3NYAA 1L37A 152LA 258LA 3GUKA 119LA 1L54A 3SN6R 1D9WA 2ANXA 169LA 3GULA 2OTZX 1L19A 108LA 2RB2X 1L29A 3HTBA 1CU0A 107LA 1P56A 4I7QA 4EPFA 4YXCA 7LZMA 1L41A 199LA 3UONA 4I7LA 259LA 3L2XA 4EXMA 1I6SA 171LA 1L12A 2RAZX 2Z6BA 1KW7A 2IGCA 4EKPA 260LA 3DKEX 1L08A 113LA 4I7JA 4EPIA 1G1VA 157LA 123LA 1P64A 4I7OA 1C6PA 3CDTA 4I7RA 1C69A 4W58A 2O7AA 221LA 158LA 183LA 3G3WA 1L99A 1CUPA 2B75A 3HH4A 174LA 1ZWNA 1L13A 1PQMA 1C68A 233LA 1CX6A 1L98A 1G07A 2RBPA 3OE6A 3OE8A 1OV5A 1LYEA 3L64A 1L43A 3FADA 2NTGA 2OU0X 4EKQA 1TLAA 4YX7C 2RB1X 3C8SA 1LGWA 1C61A 4DAJA 4W51A 256LA 122LA 1L24A 1LWGA 161LA 206LA 3FA0A 234LA 2OE7X 3K2RA 219LA 212LA 3D4SA 1L09A 3EMLA 1LGUA 1L44A 112LA 1DYDA 3C8QA 142LA 130LA 1OVJA 1L66A 1L55A 156LA 1G0JA 1C64A 1QSQA 1QS5A 1L0JA 4EKRA 4LZMA 139LA 1L75A 1L82A 1ZYTA 1L91A 4I7NA 3C81A 1QTCA 3DN0A 3HT9A 1PQKA 109LA 162LA 1L06A 1L88A 1L07A 218LA 2RBNA 229LA 1L60A 1LYGA 1QUDA 1C6DA 254LA 1QT3A 5LZMA 4EKSA 1P2LA 1L32A 3CDQA 1JQUA 3F9LA 4I7TA 2OTYX 1L39A 1G0KA 3DN3A 4LDLA 1G06A 232LA 245LA 148LE 209LA 1G0QA 1L02A 2Q9DA 3DMZA 1QUOA 243LA 222LA 3G3VA 252LA 205LA 4ZPUA 3OE9A 3G3XA 4GBRB 120LA 244LA 1LYJA 214LA 4K5YA 4LDOA 1L38A 1QTDA 1QT8A 164LA 3CDVA 262LA 1C6TA 1P2RA 1L26A 177LA 3SBAA 6LZMA 4W54A 3QAKA 1WTHA 246LA 3HT6A 3C82A 253LA 239LA 1L01A 1LYIA 1QS9A 4GRVA 110LA 3GUNA 201LA 3F8VA 1OVHA 4ARMB 1L87A 1P36A 4W57A 1T8GA 1D2YA 1C65A 1QUGA 2L78A 1T8AA 173LA 1L56A 1D3NA 1CU5A 3SB9A 3HT7A 137LA 1C6BA 1C6AA 4ARQB 1L48A 240LA 1L16A 3NY8A 247LA 1CV4A 1L17A 1C60A 1P5CA 1OWYA 2RBRA 1L45A 1L53A 238LA 2ANVA 3SB5A 2OE4X 1L73A 2OE9X 146LA 2F47A 2OEAX 2O79A 2RB0X 2B6XA 1L61A 128LA 167LA 3HU8A 1LYHA 2QB0B 1OV7A 3PBLA 1LPYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UWUA 1LMOA 3GUIA 4WG7A 4H8ZA 4NSJA 1L34A 2ZILA 2N5ZA 1IWTA 2D4IA 1GB8A 2YVBA 4IASA 4RLNA 1PS5A 111LA 1QDRA 4II8A 4OW1A 1IIZA 1HFXA 1JPOA 3IJUA 215LA 1TDYA 1IY4A 1C67A 2H9KA 3D3DA 1LSCA 3DN6A 143LA 3ODUA 5APDA 4C3WA 4WLDA 1JITA 4W59A 1L94A 4LGKA 4DJHA 1KXYA 5FHWA 4H8YA 1D3FA 4M6DA 4H1PA 4J7VA 1CKGA 3HDFA 241LA 2CGIA 3ZEKA 1XJUA 1GBOA 1DI3A 5I4YA 178LA 1GB0A 5LVKA 3WXTA 1C6IA 4HV1A 4KXIA 2FBBA 1H6MA 1BHZA 4H9IA 1LJ3A 4H9FA 2Z39A 3CDRA 1QT7A 1B0DA 4WLYA 4EJ4A 5LVGA 1GFVA 4HJVA 1XJTA 1P37A 1GFHA 4GCFA 3TMWA 2HU3A 3N9AA 2BQMA 4WM3A 198LA 1INUA 1L05A 1LYFA 1OUHA 4LYMA 4W94A 1L85A 1L14A 1DI5A 4DC4A 1HC0A 141LA 1L22A 1YIKA 5FDJA 1G0PA 3A3QA 1QSWA 1YAMA 5ILCA 1IP5A 4WM2A 1L80A 3WVXA 1CJ9A 1CU3A 1MELL 236LA 1SSWA 2HUKA 1G0GA 1LMQA 3WW5A 4IAPA 5FCPA 1NHEA 4XN6A 3CDOA 3A67Y 4I7SA 145LA 1L36A 4XENA 227LA 1GF8A 2AUBA 255LA 2RH1A 3HH3A 3WPKA 1D3JA 4J0LA 3ATNA 3WULA 1YROA 140LA 192LA 4ARJA 1OUGA 1T97A 5IDDA 1LSPA 4CFOA 3V2YA 165LA 195LA 3F6ZA 1L65A 4WM1A 1LMPA 2MEHA 1L52A 1B7RA 1L96A 2YBMA 4GCCA 1DQJC 3HUQA 1L84A 1NMMA 126LA 1OWZA 1GD6A 1L59A 1L67A 4WLXA 1KXXA 3GUPA 189LA 3AGHA 4NGWA 2F4GA 1L27A 2B73A 1VFBC 4E97A 1IEEA 2Z18A 1B6IA 147LA 1FN5A 1JTNA 2BQNA 1L35A 1V7SA 1L89A 1KS3A 4GLAA 2LYOA 3LZ2A 1DYEA 1IR7A 1WVUA 5C6JA 2F30A 103LA 1L03A 4YEMA 2F32A 1XEPA 1VEDA 196LA 1LZAA 1PQIA 217LA 4ARMA 5KXXA 3A94A 1L20A 5K7OA 4WM4A 1OUFA 230LA 3HUAA 5HMVA 1KIPC 2BLXA 1CUQA 2I6ZA 3TXKA 2EPEA 1DYFA 2HUMA 1LYOA 4NSIA 1VDPA 3CT1A 2NWDX 2HTXA 3OJPA 2DQDY 4DDAA 119LA 1LYSA 2DQCY 1IP3A 1TAYA 2MEDA 1IC5Y 5LA8A 3GULA 4I0CA 4LT0A 5APFA 1LSGA 4YXCA 1V7TA 3RNXA 1LZ9A 3UONA 4I7LA 1D0KA 1YKZX 4EXMA 3EO5A 3D9AC 1I6SA 4U3XB 2RAZX 3LZTA 3HFMY 1KW7A 5DLAA 1LZTA 4I7JA 2Z19A 4DYGA 3TXGA 4HJZA 4J1AA 4LYZA 1OUDA 1VDQA 1UUZC 1C69A 2H9JA 183LA 1QTEA 2B75A 4HJYA 1IR9A 3IWRA 3RU5A 1CX6A 1OV5A 3B0KA 1LYEA 1RE2A 1LZ4A 2NTGA 2OU0X 4EKQA 1LGWA 1C61A 1B5UA 4NHSA 4DAJA 4W51A 4ET9A 5KKJA 3FA0A 1GXV2 1F6RA 3D4SA 3EMLA 1LGUA 112LA 3C8QA 142LA 5KXRA 1ZMYL 1YKXX 1GB3A 4TSCA 4NSHA 1QS5A 1L0JA 1C43A 1O23A 2ZYCA 1KIRC 4I7NA 3DN0A 218LA 3A95A 1GB7A 1GBXA 3TMVA 2RBNA 1DXJA 1QT3A 1GF7A 4I7TA 2OTYX 1GF9A 2MEEA 1LZ8A 3QE8A 4B4IA 4AGAA 4HP0A 4YM8A 3GXKA 2Q9DA 1UIBA 3G3VA 252LA 4ZPUA 3OE9A 2FYDA 1LYJA 135LA 134LA 3CDVA 1HNLA 1LSEA 4DQJA 1C6TA 1IOCA 1B7QA 1XGUC 5B1FA 1YKYX 1EL1A 1F0WA 4DT3A 3IJVA 3J4GA 208LA 2EIZC 1IWWA 3GUNA 3WUMA 1ALCA 4G4HA 1XEJA 1LZCA 4WOAA 1BWIA 4W57A 1UIAA 2ZNXY 2L78A 3J6KA 1CU5A 3HT7A 1C6AA 4H8XA 4B4JA 4ARQB 5J7CA 240LA 1L16A 1LKRA 2Z2EA 1OUJA 5FEKA 3A91A 4NGOA 1NBZC 2Z37A 3SB5A 2F47A 2MECA 4OOOA 2RB0X 1LHHA 1L61A 4BAPA 128LA 4QY9A 2A4TA 3A96A 1L11A 3FI7A 1L40A 166LA 114LA 3N9EA 1D2WA 3DN8A 1OYUA 1GEZA 2B72A 176LA 1GFAA 5LYMA 1QTZA 1T6HA 1CU6A 188LA 1GFGA 1I1ZA 1C6CA 1CV0A 3CSZA 1LSBA 220LA 1AZFA 3HTGA 1DI4A 160LA 1L51A 216LA 3PDSA 1KY0A 1DZBX 1OUBA 228LA 185LA 3P64A 224LA 4H9EA 1HFZA 1L64A 1CJ7A 3C8RA 2B74A 2D6BA 3QY4A 3WUNA 2B6ZA 1C46A 2BQCA 2ZQ4A 191LA 2LYMA 4CFPA 4N0JA 1QSAA 2DQEY 1HEMA 5LIOA 1SWZA 1GXXA 4IJ4A 186LA 1RFPA 1LLHA 1QTHA 1FBIX 4IATA 3SP3A 1NKHA 1L50A 2HULA 4G4CA 1OQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UWU A;  1LMO A;  3GUI A;  4WG7 A;  4H8Z A;  4NSJ A;  1L34 A;  2ZIL A;  2N5Z A;  1IWT A;  2D4I A;  1GB8 A;  2YVB A;  4IAS A;  4RLN A;  1PS5 A;  111L A;  1QDR A;  4II8 A;  4OW1 A;  1IIZ A;  1HFX A;  1JPO A;  3IJU A;  215L A;  1TDY A;  1IY4 A;  1C67 A;  2H9K A;  3D3D A;  1LSC A;  3DN6 A;  143L A;  3ODU A;  5APD A;  4C3W A;  4WLD A;  1JIT A;  4W59 A;  1L94 A;  4LGK A;  4DJH A;  1KXY A;  5FHW A;  4H8Y A;  1D3F A;  4M6D A;  4H1P A;  4J7V A;  1CKG A;  3HDF A;  241L A;  2CGI A;  3ZEK A;  1XJU A;  1GBO A;  1DI3 A;  5I4Y A;  178L A;  1GB0 A;  5LVK A;  3WXT A;  1C6I A;  4HV1 A;  4KXI A;  2FBB A;  1H6M A;  1BHZ A;  4H9I A;  1LJ3 A;  4H9F A;  2Z39 A;  3CDR A;  1QT7 A;  1B0D A;  4WLY A;  4EJ4 A;  5LVG A;  1GFV A;  4HJV A;  1XJT A;  1P37 A;  1GFH A;  4GCF A;  3TMW A;  2HU3 A;  3N9A A;  2BQM A;  4WM3 A;  198L A;  1INU A;  1L05 A;  1LYF A;  1OUH A;  4LYM A;  4W94 A;  1L85 A;  1L14 A;  1DI5 A;  4DC4 A;  1HC0 A;  141L A;  1L22 A;  1YIK A;  5FDJ A;  1G0P A;  3A3Q A;  1QSW A;  1YAM A;  5ILC A;  1IP5 A;  4WM2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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