5I14A

Truncated and mutated t4 lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGGGSGGDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTHSLHALQHKHWDHAAVHLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords mutated and truncated T4 lysozyme
publication title Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 44
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5i14A00
228LA 1ZURA 1P46A 145LA 3GUMA 1C6JA 239LA 173LA 1L77A 156LA 1P2LA 1LYIA 2LC9A 107LA 1G07A 171LA 1OWZA 1L26A 250LA 4K5YA 1L27A 109LA 1L13A 199LA 155LA 4LDOA 4ARLA 1L72A 1L36A 2RBNA 4I7RA 248LA 157LA 1QT5A 1C6FA 1OYUA 3OE6A 126LA 205LA 3CDRA 4ARQA 3SB5A 1L69A 1L0JA 1L87A 3HTGA 4YXAC 1L38A 2OTYX 1L34A 3NYAA 241LA 1DYEA 255LA 185LA 1L66A 1L75A 152LA 1G0JA 4OO9A 1P6YA 1PQOA 229LA 4W59A 3GUIA 143LA 123LA 4GRVA 4AQNA 1L53A 1C6NA 1JQUA 2B6YA 1XEPA 1LYDA 4I7PA 159LA 2B72A 1L52A 1L19A 180LA 3UONA 1LYEA 186LA 1C61A 1KY1A 1L08A 1D3FA 222LA 244LA 3L64A 1C6EA 182LA 1C6CA 1C6BA 224LA 1SWYA 1QS9A 1L25A 2RBRA 3DKEX 140LA 1L50A 183LA 1L65A 4W55A 1JTMA 1L00A 1T6HA 3NY8A 129LA 2A4TA 2B6XA 3NY9A 158LA 176LA 1P37A 1CX7A 1LI2A 2RBSA 2LCBA 188LA 3HT8A 1P36A 4LDEA 1C6QA 223LA 3HTFA 1L24A 1OVHA 1L47A 187LA 1L39A 1L12A 114LA 1WTHA 214LA 3C83A 1L41A 1L92A 220LA 2O4WA 3CDVA 1C67A 2RB2X 1SWZA 3DN1A 1LGXA 2RH1A 4DKLA 2B75A 1L89A 3SBBC 1C68A 2LZMA 3HH5A 2RB0X 1KW5A 1OVKA 4I7LA 1L01A 1LI3A 3LZMA 1P5CA 148LE 1LWGA 1CUQA 1C60A 3DN4A 262LA 1L29A 2Z6BA 3C82A 4EXMA 3C80A 1L10A 104LA 3GUOA 2B7XA 247LA 4EJ4A 195LA 3G3XA 1L02A 5I14A 1L20A 108LA 233LA 1L18A 2OEAX 2Q9EA 4I7OA 1PQIA 1QT3A 1QSBA 3C81A 1D3MA 1L98A 4W57A 2O7AA 2B74A 3L2XA 1L23A 130LA 1L09A 1L28A 1CVKA 1LI6A 1L64A 1L43A 1L35A 3PBLA 3SN6R 246LA 3OE8A 1T8FA 3DN3A 227LA 128LA 1C65A 1DYGA 1L06A 3F9LA 218LA 1G0KA 138LA 1SSWA 211LA 1G0LA 151LA 174LA 221LA 3CDTA 3C8RA 146LA 257LA 4I7NA 1LGUA 3GUPA 216LA 3SB7A 4E97A 1L84A 1C6AA 4ARQB 2QARC 3DN6A 5LZMA 1L82A 2CUUA 169LA 1C69A 3ODUA 1T97A 1PQMA 1L80A 1T8GA 111LA 4EKQA 1CU2A 168LA 1L31A 1LYHA 2RBPA 1L73A 4W58A 1CV1A 150LA 226LA 4I7JA 1EPYA 2L78A 1DYFA 1L94A 1L15A 4EPFA 1DYCA 2NTHA 2RAYX 3V2YA 1L63A 3CDQA 1L03A 161LA 1LLHA 1CTWA 1DYDA 1T8AA 3HU8A 2ANXA 115LA 149LA 1L85A 190LA 1SSYA 4GBRB 1D2YA 2HUKA 3HH4A 1L79A 1C6HA 1D9WA 141LA 4ARJA 3HDFA 1CV4A 2B70A 3HT7A 1L60A 4ARMA 181LA 160LA 1L83A 1G0MA 1G1VA 1L22A 1L93A 1P7SA 2B6WA 4W54A 1L17A 3HH6A 2OU9A 1QUDA 252LA 3RZEA 1I6SA 3EMLA 2B73A 2OU0X 4ZPUA 1LGWA 127LA 2IGCA 166LA 1L51A 230LA 3C7ZA 170LA 2OTZX 1QTHA 1P2RA 3JR6A 215LA 1C64A 201LA 1NHBA 1L04A 1KY0A 3C7WA 1L33A 1CX6A 3FADA 1K28A 1DYBA 237LA 2B6ZA 1P64A 1G06A 1L44A 1L45A 3V2WA 3DN8A 3FI5A 3PDSA 1G0QA 147LA 2OE7X 4YX7C 2OE9X 196LA 1G1WA 210LA 110LA 139LA 2HULA 1D3NA 2RBQA 1OVJA 4EKPA 235LA 3DMVA 260LA 1CU5A 234LA 102LA 1P3NA 4YXCA 1L56A 1LW9A 231LA 1L74A 3HUKA 1L61A 1LWKA 4W56A 4W53A 243LA 164LA 7LZMA 1CV5A 245LA 1L21A 1L30A 236LA 3SB6A 1L14A 4PJZA 3VW7A 2RAZX 3DMZA 6LZMA 1L42A 1L59A 261LA 3DMXA 1L86A 1L0KA 4S0WA 122LA 112LA 1L81A 2ANVA 1C6TA 3HH3A 1L95A 3K2RA 1DYAA 3SBAA 206LA 4ARPA 1LYFA 251LA 3F8VA 137LA 1L96A 1OV7A 1L11A 1QT6A 3QAKA 184LA 1QTDA 1CU3A 1QTCA 3GULA 131LA 3GUKA 259LA 253LA 4LDLA 191LA 177LA 1QUGA 249LA 3HT9A 2B6TA 2OE4X 1QT7A 3G3WA 1LYGA 1L49A 3C7YA 4I7TA 103LA 4EPIA 1QTBA 4I7QA 1L70A 1CV3A 1CV6A 1XJTA 1D3JA 3OE9A 3G3VA 1L57A 1XJUA 3CDOA 165LA 113LA 200LA 1KNIA 1L07A 2QB0B 4I7KA 1QT8A 2O79A 4EKSA 197LA 163LA 3HU9A 2F2QA 2RB1X 1SX2A 3SB8A 3HT6A 4ARMB 256LA 3C8QA 1SX7A 4LZMA 162LA 1QUOA 178LA 144LA 1QTZA 192LA 2RBOA 172LA 1TLAA 1ZYTA 232LA 1CU0A 1C6KA 1QTVA 1L88A 1C6LA 1L97A 2F32A 1C6DA 1L16A 3C8SA 189LA 4DJHA 1L58A 1QS5A 1C6MA 1C63A 1JTNA 2OU8A 212LA 1B6IA 1L37A 1L62A 4PK0A 209LA 4IAPA 4EKRA 258LA 175LA 219LA 118LA 254LA 1L76A 1L67A 1CU6A 3HUQA 1PQKA 1D2WA 213LA 4W52A 240LA 4W51A 2NTGA 1G0PA 1C6IA 1L05A 1L48A 1CV0A 1L99A 1KS3A 1L90A 4DAJA 198LA 1L71A 125LA 2Q9DA 1L68A 1L46A 1OWYA 1C66A 1QSQA 3DN0A 3HTDA 3HDEA 4I7MA 3DN2A 1LPYA 225LA 3HWLA 1CUPA 1C62A 1QT4A 3OE0A 2F47A 120LA 142LA 1QUHA 1L91A 1PQDA 1LYJA 3FA0A 3HUAA 1ZWNA 3RUNA 3SB9A 4I7SA 1L55A 242LA 1C6PA 1OV5A 3GUNA 1P56A 1KW7A 167LA 238LA 3D4SA 1C6GA 1L40A 3DNAA 3HTBA 2HUMA 119LA 1G0GA 1PQJA 217LA 1L54A 3GUJA 1L32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SLYA 145LA 5FELA 3GUMA 3LYTA 4GCBA 4CHXA 1G7IC 2C8PA 1G07A 1YAPA 171LA 1IWVA 1L26A 4UWVA 109LA 1L13A 1VFBC 3P64A 1B5UA 1GF9A 4I7RA 3WU9A 1VAUA 1QT5A 3RW8A 4YXAC 2OTYX 1ZMYL 1ZVHL 1OUAA 3LHMA 4WM4A 1L75A 152LA 1BB6A 1P6YA 4IJ4A 4W59A 5D5CA 1QSAA 1LAAA 3FE0A 2BQKA 4DD0A 2FBDA 1LYDA 3P65A 159LA 4LYCA 2BQCA 2BQLA 180LA 186LA 2G4NA 2I25L 5KXRA 3IJUA 1HHLA 4TUNA 1F0WA 1L50A 183LA 1WQOA 1L00A 3TMWA 4WM3A 1IOQA 176LA 1P37A 4WO9A 2I26L 2Z39A 188LA 3HTFA 1REMA 133LA 3W6FA 1LSMA 1KIQC 1L39A 1CJ9A 4NSJA 114LA 2O4WA 1OUEA 193LA 1WQRA 2B75A 3K3TA 1C68A 2LZMA 1DKKA 1KW5A 1L01A 1NDMC 3DN4A 2Z6BA 4EXMA 3C82A 3C80A 3GUOA 1B5YA 4EJ4A 1B5WA 4B4JA 5I14A 1GEZA 1L20A 4I7OA 2LZ2A 1IOSA 1GFVA 1GHLA 1LHKA 2O7AA 2B74A 1UC0A 135LA 1L23A 1GBSA 1LI6A 1FKQA 3DN3A 1GB0A 5F9XA 3TXKA 138LA 4HJYA 4DYGA 3A96A 4HPIA 151LA 3CDTA 3C8RA 2W1XA 4W96A 1BB4A 1LGUA 4RW2A 216LA 3N9AA 1L84A 1CKCA 1GB7A 1C6AA 5LVHA 2QARC 3DN6A 4DQ5A 111LA 2HUBA 3CT0A 4WLXA 2ZNXY 1EL1A 1JTOL 4HTNA 5DN5A 150LA 5J7CA 5KXYA 1EPYA 4DQJA 1D0LA 5A3ZA 2F4AA 1LZNA 3AGGG 3CDQA 1B7QA 4LYTA 149LA 4NSGA 1SSYA 1VDPA 3HH4A 4R0FA 1LPIA 4ARJA 2ZQ4A 3HDFA 1JHLA 1L60A 3HBDA 4ARMA 181LA 160LA 1GB9A 1FLUA 4YENA 5JENB 1OUBA 1L93A 1YIKA 1Z55A 1RJCB 5F9UA 3EMLA 2OU0X 1LGWA 1IP5A 1L51A 2BQBA 2Z18A 5KXKA 3AZ5A 5F16A 4CFOA 1C64A 1LJKA 4ANRA 4TX7A 1K28A 4NSIA 4TWSA 1D9UA 1VEDA 1GFGA 1JSEA 2LYOA 1IY3A 3DN8A 1GB8A 1NKHA 1OUIA 4WMGA 2EQLA 1GF8A 110LA 1MLCE 2HULA 2BQAA 2RBQA 4EKPA 1ZVYB 260LA 2I6ZA 234LA 2XTHA 4NIJA 2BAAA 1L56A 5KJ9A 4OWAA 1D6QA 1L21A 2ZIKA 5B59A 2LZTA 4H9BA 1KXYA 2RAZX 1JKDA 1QDTA 1L59A 1GAYA 1L81A 4WM5A 1LYOA 3HH3A 3SBAA 1YILA 1C10A 4NY5A 5LINA 5LYMA 1LZ6A 1QT6A 3QAKA 5KXNA 2BQDA 4DDAA 3GULA 131LA 1ZV5L 4LT2A 259LA 2YBLA 3T36A 1QUGA 249LA 3HT9A 1WVVA 1LZCA 1VDSA 1L49A 4HPEA 1OQMA 1XJTA 1D3JA 3AZ4A 200LA 2RSCA 5M1YA 2Z2FA 1GF6A 1LJJA 4ARMB 256LA 4BAFA 1F6SA 4A7DA 178LA 3ATNA 3TXFA 4ZEEA 1JWRA 1JTPL 2RBOA 172LA 1TLAA 3A92A 1GB3A 2BQJA 4AXTA 1L97A 2F32A 1L16A 1C46A 2DQFC 5B07A 3EXDA 1QS5A 1BVKC 4GN3A 1XGTC 2B5ZA 1UICA 5KXLA 209LA 4IAPA 4EKRA 175LA 1CU6A 4XJDA 1I56A 1D2WA 2W1MA 4OOOA 1D0KA 1QUSA 4H9CA 1IP2A 3D9AC 1F10A 1NQIA 3AGHA 1KS3A 1HEOA 2MEFA 4KXIA 1QSQA 4G4HA 5E9RA 3RU5A 3HWLA 2BQIA 5LA8A 1QT4A 4GCFA 1LZYA 4XJFA 1CJ6A 1PQDA 3A8ZA 3RUNA 3GUNA 1KW7A 1GD6A 1XSFA 1TBYA 1WQPA 2HUMA 3KAMA 1IWXA 3GUJA 3WVYA 2LYMA 1UIEA 4J0LA 4UWUA 1LKSA 239LA 4N1EI 4WLTA 4Z41A 1P2LA 4EOFA 4HP0A 1YKXX 1GFJA 3F6ZA 2LC9A 4NHSA 250LA 2Y8PA 2BPUA 155LA 1YAQA 1L72A 2RBNA 157LA 205LA 1LSBA 5IHGA 1L69A 1L0JA 1L87A 3HTGA 1JJ3A 1L38A 3B0IA 1J1XY 241LA 4B49A 255LA 1YROA 3A34A 1PQOA 2G4QA 4LT1A 1LSCA 5KY1A 1XEPA 2B72A 1L19A 5I54A 4HTKA 2F30A 4GCEA 4O34A 1GDXA 1KY1A 1L08A 222LA 244LA 3L64A 1C6EA 182LA 1C6BA 1JTTL 1V7SA 3DKEX 1L65A 4H91A 3NY8A 3A3RX 3NY9A 1IWWA 1LI2A 4RLNA 1CNSA 4LDEA 5C6JA 1B7RA 1DPWA 1C6QA 1LJNA 1L24A 1L47A 2X0AA 5DL9A 4D9ZA 1LYSA 1WTHA 3C83A 1L41A 1IX0A 4NG8A 1C67A 1LZGA 1WQMA 4LYZA 2MEBA 1FLQA 2H9KA 3QNGA 2HTXA 1IIZA 1OVKA 3WXUA 2FYDA 1GF0A 1UBZA 2NWDX 1LI3A 1CUQA 1TCYA 262LA 1OUDA 1OUHA 1NBYC 108LA 1IVMA 1L18A 5HNCA 1PQIA 4IATA 4WG1A 1L98A 3G3BB 4W57A 2MEHA 1GEVA 130LA 1L09A 2YBJA 4DDBA 3WXTA 4XADA 246LA 5LXWA 4H8XA 1LJFA 1UIGA 3WUNA 1DYGA 1L06A 2PC2A 3E3DA 3W6EA 3A91A 1G0KA 1SSWA 1G0LA 1LMNA 4WM6A 3RZ4A 146LA 1IO5A 5IELA 1YAOA 257LA 4QDNA 4H8YA 4E97A 4OW1A 1LMQA 4DD3A 3B72A 1N4FA 4GN5C 5LZMA 4XN6A 1C69A 1DPXA 1UIBA 3LZ2A 1C08C 1PQMA 1L80A 1T8GA 2ZYCA 5DN4A 3WW5A 1CU2A 1LHHA 1GB2A 3EMSA 3LYMA 1LYHA 4HV2A 4W58A 2YBIA 1CV1A 4C5FA 3IJVA 3QE8A 1G7JC 226LA 3VWOA 1NDGC 1DYCA 2NTHA 1L63A 161LA 1LLHA 2EKSC 3J4GA 1LHJA 4WO6A 5L3HA 5LYZA 1CTWA 4NGYA 1T8AA 3HU8A 3TXJA 2ANXA 115LA 190LA 4GBRB 5LA5A 3TMXA 5HMJA 2MEDA 2ZWBA 4UWNA 1HELA 4XENA 4HV1A 3CB7A 2B70A 1VATA 1L83A 1G0MA 1LSYA 4X3BA 1XGRC 3ATOA 1GF5A 2B6WA 2HEFA 1GF7A 4W54A 2OU9A 5I4XA 3A67Y 2ZILA 5ILCA 2B73A 1NBZC 166LA 3T6UA 1QTHA 1OUFA 1JKCA 5D5FA 4N0JA 4HJVA 1NHBA 1L04A 3WU7A 1LHLA 1L33A 1CX6A 5LVIA 3FADA 5HLLA 1GF3A 237LA 1DYBA 4ETDA 2F2NA 2B6ZA 4CJ2A 1P64A 3M18B 3FI5A 2OE7X 4YX7C 1LHMA 2OE9X 1G7MC 196LA 1G1WA 1KXWA 1IP4A 1F6RA 2D4IA 1QIOA 1IOCA 2D6BA 5FSTA 4H8ZA 1LW9A 1O23A 1GBYA 231LA 3HUKA 1L61A 1LWKA 3WU8A 4W56A 1A2YC 1HFYA 243LA 164LA 7LZMA 1CV5A 4H9EA 1HSWA 1CKHA 4NGZA 5K7OA 4PJZA 1LSDA 4WLYA 1UCOA 1L42A 1EQEA 261LA 2YBNA 2YBMA 3A95A 1L0KA 122LA 4H90A 1AM7A 4R6CA 4N1CC 1C6TA 4N9RA 2YBHA 1G7LC 3F8VA 137LA 1GF4A 1L11A 1B7MA 1XFPL 1XEKA 184LA 8LYZA 4Z46A 5HNLA 1LSFA 3GUKA 4ETEA 1B5XA 1KXXA 4H9FA 3AW6A 2B6TA 2DQIY 3TMUA 4Z3MA 4DC4A 3C7YA 1SQ2L 4I7TA 1EQ4A 1QTBA 3AJNA 1TEWA 4I7QA 1L70A 1B7PA 1LJ3A 3TXGA 1L57A 3CDOA 165LA 1VDTA 113LA 2LHMA 2QB0B 1GFTA 1QT8A 2F2QA 1BB3A 1SX2A 3WH1A 4B4IA 2CJLA 3HT6A 1B5VA 3C8QA 2AUBA 1LHIA 1QTZA 1FN5A 5B06A 4DWXA 5KKJA 3A3QA 232LA 1BQLY 1DZBX 2DKVA 1C6DA 189LA 4DJHA 5ILFA 4LZTA 1HNLA 1JTNA 212LA 1B6IA 3EBAB 1OUGA 1L37A 4ETCA 2DQAA 1LZTA 1LKRA 254LA 1L76A 213LA 4W52A 2XBRA 1IP7A 1HEPA 4H9AA 1PZYA 3SP3A 1IP1A 1JEFA 2FYCA 1ALCA 1L46A 1OWYA 3WPKA 4QEQA 4GLAA 3HDEA 4L41A 5LIOA 1B9OA 3DN2A 1BWIA 1C62A 3OE0A 1LSZA 1FBIX 4HSFA 4BADA 4KPMA 1LYJA 154LA 3WVXA 1LCNA 4I7SA 2HEAA 3AB6A 2DQDY 167LA 2Z12A 3BKHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SLY A;  145L A;  5FEL A;  3GUM A;  3LYT A;  4GCB A;  4CHX A;  1G7I C;  2C8P A;  1G07 A;  1YAP A;  171L A;  1IWV A;  1L26 A;  4UWV A;  109L A;  1L13 A;  1VFB C;  3P64 A;  1B5U A;  1GF9 A;  4I7R A;  3WU9 A;  1VAU A;  1QT5 A;  3RW8 A;  4YXA C;  2OTY X;  1ZMY L;  1ZVH L;  1OUA A;  3LHM A;  4WM4 A;  1L75 A;  152L A;  1BB6 A;  1P6Y A;  4IJ4 A;  4W59 A;  5D5C A;  1QSA A;  1LAA A;  3FE0 A;  2BQK A;  4DD0 A;  2FBD A;  1LYD A;  3P65 A;  159L A;  4LYC A;  2BQC A;  2BQL A;  180L A;  186L A;  2G4N A;  2I25 L;  5KXR A;  3IJU A;  1HHL A;  4TUN A;  1F0W A;  1L50 A;  183L A;  1WQO A;  1L00 A;  3TMW A;  4WM3 A;  1IOQ A;  176L A;  1P37 A;  4WO9 A;  2I26 L;  2Z39 A;  188L A;  3HTF A;  1REM A;  133L A;  3W6F A;  1LSM A;  1KIQ C;  1L39 A;  1CJ9 A;  4NSJ A;  114L A;  2O4W A;  1OUE A;  193L A;  1WQR A;  2B75 A;  3K3T A;  1C68 A;  2LZM A;  1DKK A;  1KW5 A;  1L01 A;  1NDM C;  3DN4 A;  2Z6B A;  4EXM A;  3C82 A;  3C80 A;  3GUO A;  1B5Y A;  4EJ4 A;  1B5W A;  4B4J A;  5I14 A;  1GEZ A;  1L20 A;  4I7O A;  2LZ2 A;  1IOS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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