5I2KA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA02
1CB6A 4ESWA 1MPCA 2I4CA 2A5TB 4P11A 2PBWA 1LCTA 3GXAA 5AA1A 1ZBMA 1LFGA 1HSJA 4O3BA 1M5BA 4RY1A 4F1UA 4PFUA 1CE2A 2O1MA 3EHTA 2QMXA 3KBRA 4P0GA 1B5JA 4X48A 2Z8EA 5ICQA 1UTHA 3H3GA 1MPDA 4ELOA 1Z7NE 1A8EA 4R2FA 2DWIA 1TFDA 3SEYA 4KQPA 4QFOA 4KYDA 1XVYA 3TKDA 4PQJA 3VLVA 4YICA 1II5A 3V83A 5CBSA 1P1UA 1MM7A 5AA4A 4IY6A 4QSCA 4YB7A 2HZKA 3RTWB 3VFJA 4H5GA 4H1XA 3RLFE 2PX1A 3O6GA 3TTRA 1Y3PA 3I5OA 5I2KB 3C9HA 4YKJA 1MXZA 2CZLA 4LZ8A 4F1YA 3MC2A 1LSTA 1P99A 1O7TA 4KFQA 3RGYA 3VV5A 4OENA 5TP9A 3PPPA 4ELRA 1AIVA 4F22A 4IO2A 1LAHE 3FVGA 5K2YA 2A5TA 3I3VA 4C0RA 5TU0A 1I6BA 1Z7ME 3LBSA 1XS5A 4F2QA 3LR1A 3F11A 2ANJA 2UVGA 3RTFB 2VGQA 2AL4A 4Z0IA 2F7BA 3B7DA 3OOAA 4ZE8A 3IL1B 1JW1A 1AOVA 3IR1A 2QS4A 4OFLA 3KG2A 1Y1ZA 3S9MC 4F1VA 5I84A 4NF8B 4H8JA 2F6GA 4EF1A 4GWOA 3QUFA 1BIYA 3FXQA 4DXCA 5FHMA 2R9JA 3ECRA 2OWSA 3G3JA 1URDA 4ZDMA 2XXVA 1GR2A 3O9PA 1YPNA 2ZNSA 3LSXA 3VVEA 2Z8FA 4JB7A 1LLSA 3MJNA 1LB8A 3OMBA 1M5EA 1FQCA 5I2KA 2OLBA 3HCQA 3WAEA 1SBPA 3QXMA 2I3VA 4F3PA 2P1SA 2GRVA 4GOTA 5CRYA 1IUDA 3MVWA 2O7IA 4R73A 3OO7A 4ZEKA 4KHZE 1B2HA 1XHYA 4LVQA 1SW1A 3CG3A 2UVHA 4XKRA 1Y3QA 1H76A 1VFEA 4OMBA 3FJGA 2XXIA 2QL3A 4YKIA 1F9BA 2DP8A 3PU5A 4IB2A 3TTNA 3S9NC 2NUVA 4NF8A 3DP4A 3PPRA 3HSTA 3CR9A 3FXUA 2KLFA 1JETA 2Z8DA 2GFEA 5CI5A 4YKKA 4EUOA 2DS9A 3T93B 1QKBA 3K6XA 2PYYA 3QYTA 1LFHA 1MXXA 3U94A 3FASA 2I0BA 3KZGA 5ISUA 1Y9UA 3H06B 2D21A 4FORA 3FV1A 4QFLA 2Q2CA 3TYHA 2AL5A 4KCCA 1MPBA 1B3FA 3Q28A 1FW0A 2VD3A 1MM6A 3U8QA 2B3BA 1NH7A 3G7WA 1M5FA 1A55A 4XKPA 5JK4A 1OIBA 3I6VA 1ZIUA 1B58A 3TQLA 1UIVA 1H3DA 3G3HA 2P0SA 2FYIA 1JW5A 1M5CA 1FQDA 1R9LA 4AQ4A 1EZOA 4IY5A 1B3HA 2UXAA 5HM4B 1ZJLA 4QRZA 4JBZA 2VP1A 3C35A 5FTHA 3HV1A 2QSXA 4H0WA 3SEUA 4HTGA 3FJ7A 4ESXA 2YJPA 2P2AA 3IO6A 1SW4A 4IO6A 3K01A 3QAXA 4PETA 1A40A 1DSNA 3K6UA 2DE2A 1B05A 3SEWA 3IJOB 2Q88A 4IGRA 2FA7A 4C1UA 2ALUA 2ZNUA 2UYEA 1SI1A 3EHUA 3Q29A 5M2VA 1ZLQA 1IIWA 1QUJA 3R7XA 3LC8A 5KCJB 3KOTA 3K00A 1MY2A 5L9SA 2I4BA 4IO7A 2DXYA 3H6UA 4I62A 5I56B 3K6VA 5DEXB 3IX1A 2PT1A 1US4A 2O84X 3JYRA 3QK6A 2XX9A 3T9VA 2XX7A 3TTKA 3K1PA 4MBPA 3TAJA 2H98A 3RUMA 3MBPA 3E13X 2RC9A 3CG1A 1MXVA 3RNNA 4MH5A 2QS3A 3K1NA 2A5SA 2DQVA 1T0KA 3BFUA 4YB6A 3JV9A 4TOZA 4RK2A 5J1DA 1NNPA 2OCUA 4F3SA 4FAJA 4HCWA 4DIGA 2F34A 1RYXA 1LBCA 4C1TA 1ZTYA 2UYFA 1XOCA 5ITPA 1AH5A 4ELQA 4DLDA 2XXXA 1UIUA 5H8QB 3E4RA 1B0LA 4OESA 3UIFA 2O6AA 3HHFA 3PUWE 1N76A 5KCJA 4E0XA 3TTMA 4DCYA 1AL3A 4H65A 3QSLA 4R74A 5H8NB 2Z22A 5I56A 4RYAA 4WXJA 4ZEDA 1RKMA 5DEXA 4Q5TA 1ZKBA 2BJJX 2Y7WA 3ONMA 3S9EA 3WAFA 3U1OA 2DE3A 2DXRA 1IITA 4LATA 3QUJA 3A3UA 3M3FA 4WEPA 4G68B 4BDOA 3IB2A 4F31B 1B7UA 5JEIA 3T9XB 4RJZA 3CI8A 4AB6A 4UA8A 1PB8A 2X7QA 3FZVA 1SD3A 4M4GA 2REJA 2XXRA 3IK6B 3LSWA 5A5XB 2HCAA 4FEDA 2O7UA 3C4MA 4GD5A 2DOJA 1B7ZA 2ABHA 2Q2AA 2ZNTA 4BDLA 2F6PA 4NF4B 1H43A 4DZ1A 2ZYOA 4K3FA 4QFKA 4O3CA 1MDP1 3G3FA 1JVXA 1BLFA 1NMUA 5H8QA 3C33A 3RQTA 3MVZA 5CM6A 1Q1KA 3ZKKA 2HAVA 4H67A 2NWJA 2QS1A 1EZPA 3FIRA 1RYOA 1B5IA 2REGA 1B3EA 5H8NA 3VDFA 3DP6A 1FTMA 3O66A 4KD5A 4QF9A 5F7VA 4G77A 2PMSA 3KJTA 4FECA 5H8SA 3TFLA 4G4PA 4UACA 4THIA 5JTYB 4N13A 4EF2A 1JVYA 4G68A 4LUBA 1B40A 1Y4CA 5FHOA 3L6HA 3ZSFA 3OO8A 4DDDA 1B0HA 2G93A 5HPQA 2G29A 1UTBB 3T22A 3R6UA 2F5XA 5A5XA 3U92A 1YTVA 2DVCA 3PPNA 5DTBA 4JWYA 3A09A 4NF4A 1B52A 1ZMGA 4NTLA 1SVXB 1S50A 3U93A 3K0VA 3UGWA 5EHMA 1QW0A 3MP6A 4YB5A 1P1WA 5B7DA 2DWHA 3N94A 3EN3A 1GGGA 4FEBA 3SKPA 1POY1 3RN8A 2I0CA 4QSEA 4U1ZA 1PB7A 4G8HA 3KN3A 1JEVA 4JXIA 5JTYA 1VR5A 1NNKA 3R26A 2GHBA 1QVSA 2ONSA 4AB5A 1S9TA 3TQWA 4GXSB 1Y20A 4OYVA 3K1MA 1UTBA 1M5DA 1SW5A 1NL5A 2GH9A 2E0SA 4OWDA 5K2XA 1LB9A 5AA2B 1XT8A 1B1XA 4MLVA 1TXFA 4U21A 4NE4A 3VVFA 3E9XA 5IAIA 3Q27A 1IXCA 1ATGA 2IEEA 1URGA 3M8UA 3TCFA 5DVJA 3KN8A 2F36A 3N6TA 3PPQA 4NF6B 3SERA 5H8FB 2F78A 2V3QA 3FJMA 4GIZA 5ELVA 3IJXB 4YMAA 3FV2A 2B3FA 2R71A 3TTLA 4ZEFA 4OEUA 4ZECA 3H6VA 2NOOA 4F39A 1IZ1A 2O68A 3VXBA 3B6TA 3M3LA 3IORA 1ELJA 1MQGA 4KYEA 4U22A 3EPEA 3T9UA 2Q8JA 3FVKA 4KPTA 3EF7A 4LQ5A 4F3BA 1KWHA 2RINA 3O28A 4ONYA 4DCXA 3OO9A 1LAFE 2I3WA 1QUKA 3CRBA 2XD2A 5H8HB 4IO5A 4HCYA 5L9MA 2VD2A 5AA2A 3OENA 3MZ1A 1YCJA 1NKXA 2XXTA 2F7CA 4YAHX 1MH3A 3PUXE 3MUQA 2UVIA 1NNTA 4EQ9A 3T9HB 3CFLA 3PUZE 4NF6A 3SESA 3PV0E 4QSDA 4LP2B 5H8FA 1N3XA 3PGFA 2Z23A 4H5FA 3S2VA 4ZS9A 2Y7KA 3W9VA 3B6WA 1I6AA 1OLAA 2DYXA 2GHAA 3PMWA 3SDFA 2ZYKA 2XXHA 4KR5A 4HS7A 4G2ZA 2Q9TA 3KEIA 4X9TA 1P1OA 4U4XA 3TODA 4RK9A 2H99A 4BDRA 4R6YA 3BKIB 3VVDA 3KN7A 3K02A 5AA2D 1PEBA 1N3WA 1MY1A 3FD3A 1XVXA 1B3GA 1FTLA 4GXAA 3KFMA 3KJ7A 3UORA 4BDNA 1UQWA 3TDJA 5H8HA 3H7MA 4OETA 4PE5B 3K4UA 5KZTA 1L5TA 1MXYA 3OSQA 3RPWA 5KDTB 4GFRA 4OZ9A 3CSBA 1ANFA 4BDMA 5EHSA 4ZZEA 3S4UA 4NWDA 3KGCA 1HSLA 2XXWA 1SQYA 4LZ7A 3QIMA 2XX8A 3CVGA 2QRYA 2ONRA 4KI0E 2V25A 4U23A 3KSJA 5IKBA 1QJMA 4IO3A 4PP0A 2IA4A 5HBCA 3PPOA 1B32A 1TFAA 3VLWA 1MS7A 1NNFA 3S9LC 1QKAA 4U2RA 3OXNA 1LGBC 4P0IA 1R9QA 3MP8A 3DP8A 4E0WA 3W9WA 1O63A 4MF3A 1GV8A 2HAUA 5B70A 2Y7RA 1IXIA 2V84A 4R75A 4M1VA 3GBAA 3TUSA 4GQOA 3RT6B 2Y7IA 4ISUA 3O2AA 4JSDA 1GTKA 3G3KA 4Q8RA 5L8DA 5KDTA 4NF5B 1D4NA 4R6KA 3V5AA 2X7PA 1R6ZA 2RCBA 3N6UA 4IGTA 4PFWA 3O6IA 2RCAA 4NEDA 4G68C 5DVFA 3BFTA 4U4SA 5CBRA 2R6GE 1A54A 1MQDA 3SETA 4NWCA 3TZAA 3FVOA 1I6QA 4ZZAA 1EH3A 4RA1A 2ZYMA 1FQEA 4QFNA 1FQAA 4TLMB 2QS2A 3LSFB 1JQFA 2OZZA 3OEMA 5CMCA 5CMMA 4GL8A 2H4IA 4R2BA 1BP5A 4PFTA 1B6HA 1MY0A 3U72A 3VLUA 4R6HA 1WODA 4X1DA 5BUUA 1POTA 3ODBA 1R1NA 2H25A 1FQFA 4GL0A 1OQGA 2XXPA 2D3IA 5BWJA 5F1QA 1P1NA 4OQOA 1B51A 3RT8A 5LOMA 4NF5A 1URSA 1MY4A 2V93A 2FNCA 4XKNA 4OTEA 3O97A 3UN6A 3MP1A 2LAOA 1B4HA 1H45A 4OFJA 1N84A 3N5LA 2F8DA 1S7YA 2Y84A 3IO4A 3VE1B 4OHNA 4KYSA 5FTIA 3G3GA 1JW4A 3ZKLA 4LQ2A 3MPLA 1SYIA 3ILTB 2WKYA 3TELA 2HEUA 3EQ1A 1D3KA 3GZGA 1PC3A 4GF8A 5DYHA 2ZYNA 5DVIA 1JNFA 4ZEIA 4DXUA 4KCDA 1MQIA 3K2DA 2V3TA 2PVUA 1OMPA 3VXCA 2HZLA 4Q30B 4BDQA 3MVYA 5FHNA 3FGSA 4LZ5A 5AA3A 3FATA 2OBGA 4F19A 1O64A 3PD8A 3THIA 1B7HA 4F2OA 3IOTA 4U1OA 3TCHA 4FATA 1USYH 3MZ9A 1SI0A 2NVUB 2DWJA 1FTJA 2QPQA 2ZXTA 2W7YA 1GVCA 5DT6A 3M3KA 1IQ7A 3PD9A 3LSLA 1N0TA 1Y3NA 1PDAA 3HPIA 2I58A 3D4CA 1DPPA 4ELPA 2PT2A 4OFOA 3H4ZA 3ILUB 4EDPA 2RC8A 1N7XA 2THIA 3B6QA 4GRKA 1H44A 5TPAB 5ITOA 4ND9A 3FXRA 2RKMA 1MDQA 3LUYA 4EXLA 5I58B 4FE8A 3MW0A 4ZE9A 2YPNA 3V89B 3P7IA 1MXUA 4RNSA 5I57B 3OSRA 4I8CA 5EYFA 2OK2A 4NMYA 1AMFA 3SEVA 1EZ9A 2O51A 2I6EA 2QMWA 4POWA 3V8XB 1N04A 3FVNA 2AIXA 3BBRA 4XIGQ 3A3CA 4G8MA 1SYHA 5ICTA 1B1HA 4ZEBA 3TEPA 3T96B 4QFPA 2M8CA 5CC2A 1SW2A 3IOUA 3Q26A 3AXFA 1SDXA 4XKQA 2E1SA 1PBPA 3CFXA 1D9VA 5I59B 2ONKE 1J1NA 1A8FA 2O1LA 4HW8A 1D9YA 4YZZA 3DLNA 2VHAA 5TPAA 3CFZA 2HFBA 4JWXA 1B3LA 1Q35A 4RPOA 5I2NB 4YU0A 3H03A 4R72A 3D4GA 1LBBA 1QULA 3FUZA 1TT1A 4WEDA 3N26A 5I58A 4YMBA 1USYE 2XXQA 5I57A 1YAEA 4EQ7A 2Y7PA 4XTCQ 3IB1A 3CIJA 1LAXA 4LA9A 3UA8A 4EQBA 3USDA 2XD3A 4QHQA 3TCGA 1IXGA 3C32A 3OEKA 2DWAA 3IOWA 1LAGE 3TMGA 2OWTA 3ZS6A 2F97A 2XHDA 1FQBA 3G3IA 3K6WA 1IXHA 4WKMA 4R9GA 3UK4A 2V3UA 3IB0A 3UP9A 4DXBA 1LFIA 4MFIA 1WVJA 5I59A 1MXWA 2ESNA 4N07A 2I49A 3DM0A 2XXYA 1N7WA 3MQ9A 2HQ0A 4N6PA 4L17A 4JSOA 3MPKA 4YKPA 4R9FA 1MQJA 3RY3A 4X1BA 1B4ZA 1IEJA 3GBBA 2NXOA 4G8NA 1DMBA 4H6DA 3TPAA 5I2NA 4POXA 2QJEA 1QUIA 4PFYA 4FIMA 3C34A 3PMVA 1DTZA 4DE8A 4EXKA 1I69A 2DSFA 2VOZA 3MZBA 1NH8A 4FJPA 1MQHA 1VFDA 1DOTA 2AYSA 1OQHA 4IO4A 4BLAA 3KSXA 3W15C 4GVOA 3DELB 1BTJA 2Q89A 2F7AA 4F3GA 1OVTA 3O29A 1MY3A 1Y1MA 1LCFA 1B5HA 1FTOA 1VSOA 3OO6A 3Q25A 2H9BA 4XXUA 1JEUA 1MRPA 1XC1A 4OXVA 1P1QA 3KOSA 1HSEA 3PUVE 5CMKA 2I48A 1BKAA 4OERA 1PBQA 1PB9A 2D5WA 4OEVA 3PMXA 4RXLA 2HXWA 3MAMA 1VE4A 2OJTA 4GLIA 2RF1A 2UVJA 4MLQA 2ZMBA 1FTKA 1TWYA 4I9DA 1OVBA 3L6GA 3GLBA 4I1DA 3O6HA 1FCKA 3C31A 3HN0A 3EHSA 3IAZA 3OD7A 4JWOA 1MG1A 1A7LA 5AE4A 1UTHB 4ECFA 1OLCA 3H6WA 2DE4A 3C36A 2H5YA 2F35A 2X26A 4TQUQ 3PUYE 1B46A 1US5A 1DPEA 1B9JA 4F29A 2XXUA 3E3KA 3JZJA 1MH4A 5AA4B 3T66A 3MVXA 3IOVA 2B65A 1A99A 2O69A 3H6TA 3SEXA 3MWBA 2DVZA 3HO7A 4RPNA 5L9OA 4Z7EA 4Q0CA 1DTGA 1Y4TA 5CMBA 1NFTA 1EU8A 1WDNA 4O3AA 4TLLB 4F18A 2CMOA 4OVJA 3CSGA 3HHGA 2YLNA 2RC7A 4LONB 4JDFA 5TP9B 1ZU0A 4H8IA 3OELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2ZNSA 3LSXA 3VVEA 2Z8FA 4JB7A 1LLSA 3MJNA 1LB8A 3OMBA 1M5EA 1FQCA 5I2KA 4P9KA 2OLBA 3HCQA 3WAEA 1SBPA 3QXMA 2I3VA 4F3PA 2ZZVA 2P1SA 2GRVA 4GOTA 5CRYA 4JVDA 1IUDA 3MVWA 2O7IA 4R73A 3OO7A 4ZEKA 3CHGA 4KHZE 3T1BA 4H45A 4KXPA 1B2HA 1XHYA 4LVQA 1SW1A 3E78A 3CG3A 2UVHA 4XKRA 1Y3QA 4O8MA 1H76A 2XA5A 1VFEA 2KQZA 2WBBA 4OMBA 3FJGA 4NX1A 2XXIA 2QL3A 4YKIA 1F9BA 2DP8A 2Y5KA 3PU5A 4IB2A 3TTNA 1FJ9A 3S9NC 4HXVA 2NUVA 4NF8A 3DP4A 3PPRA 3HSTA 3CR9A 3FXUA 2KLFA 1JETA 2Z8DA 2GFEA 5CI5A 4YKKA 1FSAA 4EUOA 2DS9A 3T93B 1QKBA 3K6XA 2PYYA 3QYTA 5EQ8A 1LFHA 1MXXA 4O94A 3U94A 3FASA 4NHBA 2I0BA 3KZGA 5ISUA 1Y9UA 3H06B 4NG7A 1DBZA 2D21A 4FORA 5EYGA 3FV1A 4QFLA 2Q2CA 3TYHA 4MNIA 2AL5A 4KCCA 1MPBA 1B3FA 3Q28A 1FW0A 5LDZA 2VD3A 1MM6A 3U8QA 2B3BA 1NH7A 3G7WA 4NF0A 1M5FA 1A55A 4XKPA 5JK4A 1OIBA 3I6VA 1ZIUA 1B58A 3TQLA 1UIVA 1H3DA 3G3HA 2P0SA 1RDYA 2FYIA 1JW5A 1M5CA 1FQDA 1R9LA 4OVSA 1FBFA 4IR8A 4AQ4A 1EZOA 4IY5A 1B3HA 2UXAA 5HM4B 1ZJLA 4QRZA 2FIXA 4JBZA 2VP1A 3C35A 5FTHA 3HV1A 2CZHA 2QSXA 4H0WA 3SEUA 4HTGA 3FJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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