5I2KA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA02
3TFLA 3M3LA 1R1NA 1B05A 1PC3A 1XC1A 1H3DA 1FTJA 3CSGA 2DE3A 3I3VA 4G8NA 2F6GA 1Z7ME 2QL3A 4F2OA 2ZYOA 1P1NA 1MY3A 3VLWA 3ODBA 4ND9A 5H8FB 3IOVA 1M5DA 2O1LA 5AA3A 4YMAA 2UVIA 3OO8A 3HHGA 1UTHB 3H03A 5CMBA 1GGGA 4XXUA 4RXLA 3TEPA 3BBRA 3CIJA 1M5EA 5AA4B 5EHMA 3WAFA 4NF6A 3CR9A 1OMPA 3ZKLA 3FVOA 1FQDA 4WEPA 3OEMA 4I9DA 1EZPA 4OWDA 3H3GA 1B3FA 1TXFA 2BJJX 3FXQA 4ESWA 4KHZE 5CBRA 3K4UA 4X48A 4AQ4A 1XVYA 2QS3A 1A99A 3H06B 5DVJA 4QHQA 3T9XB 3VVDA 3WAEA 1I6AA 2HQ0A 4PE5B 1FCKA 3IJOB 5KDTA 3KN3A 1MPCA 4NEDA 1P1UA 4LONB 5KCJA 2HAUA 4OETA 5KZTA 3IL1B 4ZEDA 3OXNA 4AB6A 1BLFA 4OFJA 3SEYA 1ELJA 3N6TA 3HO7A 4F19A 1SYIA 3K1NA 3R6UA 2O51A 1EU8A 3T9UA 3JYRA 1ZMGA 3OSRA 1I69A 1MXZA 3E4RA 3USDA 2RINA 4DCYA 3UGWA 2HZLA 5H8SA 1H44A 5B7DA 4M1VA 5F1QA 3G3HA 4FECA 3G3IA 5JTYA 1TT1A 4RK2A 1BKAA 3PPPA 1OIBA 1URSA 4G68B 4EXKA 4PFTA 3AXFA 2R9JA 4BDOA 5L9SA 5I58A 2I6EA 4QFNA 2YJPA 4UA8A 1JQFA 4L17A 3MC2A 2QMXA 1N7XA 3QUFA 1H45A 1RKMA 1A54A 4F18A 3K6VA 2ZNUA 3I6VA 3V83A 4LZ8A 2OJTA 1QVSA 3A09A 3OEKA 3LC8A 3MPKA 3W9VA 2CMOA 1D4NA 1M5BA 2HXWA 2I3WA 2GHBA 2Z8EA 4BDMA 3N6UA 1Y1MA 1MY1A 2DYXA 3C4MA 3MQ9A 2Z23A 1UIUA 2W7YA 3OENA 3TTNA 4GWOA 1B4ZA 1JEVA 4OERA 3EPEA 1LB9A 3OSQA 1ZJLA 3M8UA 4DLDA 3V89B 2Z8DA 4QF9A 3RT8A 4EUOA 5ITPA 1IQ7A 2AL4A 4MLVA 4KI0E 1SVXB 1B7HA 1B46A 1USYH 1QULA 2I48A 3IO6A 3P7IA 3TCGA 2ONKE 3IO4A 1O7TA 5EHSA 1MY4A 4G8MA 4ELPA 3I5OA 5FHNA 3DP4A 4LATA 4ESXA 3H6TA 1PB7A 2RCBA 3IORA 1ZIUA 1FQCA 4NWCA 2V3TA 3PMXA 2Q89A 3TCHA 3RT6B 3EN3A 3TKDA 2ABHA 2PVUA 3T9VA 4K3FA 3R26A 4YAHX 1YPNA 5TP9B 5LOMA 5K2XA 1NKXA 1TWYA 2I0BA 3PV0E 3TTLA 3KBRA 4PETA 3C35A 2RC8A 4KCDA 1Y3NA 4E0WA 3RN8A 4F39A 3K0VA 4H65A 3SKPA 4FEDA 3KOTA 1NNKA 3UP9A 2RCAA 3M3KA 3O9PA 2REGA 4R75A 2HAVA 2XXTA 4MBPA 5H8QA 4YKJA 1NNPA 2ALUA 3SEVA 3UORA 1MQJA 3RUMA 3KGCA 1B1XA 3EHSA 3HHFA 3TELA 2Y84A 1OQGA 4GQOA 5IKBA 4H8JA 3CFXA 4DZ1A 3CVGA 3ONMA 3TQLA 1FTLA 2LAOA 1AMFA 1VE4A 3H6WA 1SW2A 3PUXE 3LSFB 4X9TA 1PBPA 4DXBA 4HS7A 1Y4CA 3U1OA 4PFUA 3O28A 1XT8A 4LP2B 2QRYA 2O1MA 5HM4B 2F35A 3M3FA 3K00A 5H8HA 5ICTA 2E0SA 2DQVA 1MPDA 4X1BA 4MLQA 3OO7A 4GIZA 1IIWA 4OMBA 1IZ1A 3CRBA 2H4IA 1ZBMA 2RF1A 4P11A 1A8EA 3FGSA 3OO9A 1MDP1 1JEUA 2H5YA 4IB2A 2DXYA 3OMBA 1FW0A 1LB8A 1B0HA 4AB5A 2QPQA 1LCTA 3JZJA 1Z7NE 4DE8A 1AOVA 4POWA 1P1QA 3G3KA 3DP6A 4IY6A 1FQEA 3VXBA 3FJMA 1GVCA 3QK6A 2R6GE 4I1DA 4E0XA 2HEUA 3MVXA 4XIGQ 4M4GA 2ANJA 2GRVA 3BFTA 5I2NB 4KCCA 2GFEA 3MZ9A 3G7WA 5I56A 3K1PA 3H6VA 1H76A 3RQTA 1SI0A 4WXJA 5L8DA 1IXIA 2Q9TA 4MF3A 4KYSA 4BLAA 4JWXA 3HSTA 4PP0A 2YLNA 4TLLB 3KSJA 4QFOA 4H5GA 5H8NB 4FORA 3GBAA 3KJTA 3PUYE 4WEDA 3O6IA 4HCYA 3PUVE 4TOZA 3TODA 1US5A 3PUZE 3E3KA 2UYFA 2OWTA 1UTBB 2ZMBA 4ZE8A 3T22A 5ELVA 2DVCA 1AL3A 4ZEKA 3U94A 2VGQA 2V3QA 2I4CA 2F7CA 1R9QA 2ZNTA 3MVZA 1O63A 3RTFB 1R6ZA 3L6GA 4O3AA 3VV5A 1MXWA 1S7YA 3IOWA 5L9OA 1D9YA 1ZKBA 4Q30B 3S9EA 3KG2A 2DS9A 3MJNA 4OQOA 4IO5A 4LVQA 1JW4A 2KLFA 3GLBA 3SERA 5AA2A 4O3BA 5ICQA 5AA2D 2DXRA 4IGTA 4G4PA 3EHUA 1MQDA 4P0GA 4LA9A 1JETA 1USYE 3K6XA 4RNSA 2XX7A 2Y7WA 3TZAA 2QS2A 3OO6A 1LCFA 1LAXA 3U72A 1MM7A 3D4CA 4F2QA 4PFWA 1LFHA 1SW5A 3DM0A 1IITA 1URDA 2YPNA 5I2KB 3HN0A 3PMWA 3C31A 4OEVA 1B7ZA 1MH3A 1NNFA 1SW4A 5TPAB 4H5FA 3THIA 4EQ9A 3K1MA 1B3GA 4BDNA 3FVNA 4GVOA 1JVXA 3FV2A 1QKBA 5F7VA 3FJ7A 3QXMA 4KQPA 2AIXA 5BWJA 3U93A 3SETA 2XXVA 2A5SA 1S9TA 4NF4A 4FE8A 3O2AA 4WKMA 2UYEA 4FAJA 4F3BA 5I57A 3IX1A 2QJEA 3TMGA 4KYEA 4PFYA 5ITOA 2VD2A 3W9WA 1PB8A 2V3UA 4EQ7A 2Q2AA 1A40A 3A3UA 1PEBA 3LBSA 4YB7A 2RC9A 2M8CA 2H25A 2G29A 3KN7A 1LBBA 3LR1A 1JW5A 3BKIB 1FQFA 2XXXA 4RA1A 2Q88A 4R72A 5TP9A 4C1UA 4THIA 4F1VA 1LFIA 5CBSA 2F78A 3EHTA 4U21A 1MQIA 1WDNA 4BDLA 3E13X 1BP5A 3K2DA 1JVYA 1IUDA 1VFEA 1SW1A 3V5AA 3K01A 3TQWA 3U92A 3VXCA 2A5TB 3O97A 4QSCA 4JDFA 4NF6B 3VE1B 4N07A 3O66A 3FASA 3MW0A 4RPOA 1IEJA 4NF8B 1DTZA 2AL5A 3ZSFA 3PPNA 3PUWE 3OD7A 2OWSA 4GL0A 4H0WA 4X1DA 2B3FA 4XKQA 1L5TA 1PBQA 3D4GA 4Q8RA 3PPQA 1A7LA 1M5CA 5HPQA 3SESA 4I62A 3QUJA 2Z8FA 4GL8A 2DOJA 1B52A 4TLMB 2Y7IA 1SYHA 5KDTB 3SEUA 5JK4A 3F11A 3FJGA 1LLSA 2PMSA 1NL5A 3T9HB 4RYAA 5KCJB 5AA1A 3RPWA 3IB0A 1MY0A 2H99A 2QS4A 1A55A 1IXHA 3DELB 4ECFA 4Z0IA 2XXYA 1EZ9A 1N3WA 1CB6A 2XXRA 1B32A 3ZS6A 4F3GA 3ECRA 2ZYNA 2F36A 4JSOA 4N6PA 1RYOA 2ONRA 1A8FA 3SEXA 1I6BA 2UVGA 2DWIA 1DPPA 5JTYB 1PB9A 3S9NC 4OEUA 1Q1KA 3VLVA 1B0LA 5A5XB 2XD3A 1ZU0A 4U22A 2NWJA 2XX8A 3HV1A 4OTEA 3IB1A 2XXUA 1AH5A 3K02A 4GXSB 4MFIA 1LAFE 4R2BA 5DVIA 4NTLA 3PGFA 2Q2CA 3K6WA 3PPOA 2NOOA 4F3SA 3TTKA 3Q26A 3GZGA 1QUJA 1P99A 3MP1A 2VHAA 3LSLA 1II5A 1ZLQA 4JSDA 2Q8JA 3E9XA 2QS1A 4ZE9A 4LZ7A 2UXAA 3ILUB 1B51A 3S2VA 1QKAA 1P1WA 3C34A 1B40A 2F34A 3C36A 3GXAA 3S9LC 3EQ1A 4KYDA 4GOTA 3TCFA 4OVJA 3N94A 5DEXA 1FQAA 3DP8A 1UTBA 4XKPA 4H67A 2VOZA 3TDJA 1ANFA 4DXCA 2OCUA 4OZ9A 1SBPA 3CSBA 2XXHA 2AYSA 3W15C 3OELA 4GF8A 5CC2A 4OFOA 2GH9A 1PDAA 1B5IA 3IJXB 2B65A 4H1XA 5H8FA 1WVJA 3LSXA 1TFDA 4MH5A 4Q0CA 1SI1A 4POXA 4ZZEA 1CE2A 1OVBA 1N04A 3IOUA 1UTHA 1QUKA 4FEBA 4DXUA 1NH7A 2Z22A 4LQ2A 2B3BA 1SQYA 3L6HA 4TQUQ 5I59B 4Q5TA 1J1NA 5CMMA 4YKIA 4F1UA 5AA4A 2X26A 4EF1A 4ELOA 3TTMA 4OFLA 4EF2A 1SD3A 3KZGA 4GLIA 1MXXA 2FA7A 3MVYA 1HSEA 5CRYA 4IO3A 2ONSA 4U4SA 4FJPA 1N3XA 3FD3A 3MZ1A 2HFBA 1ZTYA 3GBBA 1T0KA 5L9MA 3B7DA 2XXPA 4NF5B 4F22A 1B6HA 3H6UA 1B9JA 1LAGE 3VLUA 5TPAA 4C1TA 3HPIA 3QAXA 2XXIA 3TTRA 5H8QB 1XS5A 3MUQA 3KJ7A 2XX9A 1LFGA 2I4BA 1LGBC 1RYXA 3N5LA 3IOTA 1VFDA 2WKYA 5TU0A 2NXOA 1OQHA 2DWAA 4IO4A 1QUIA 2O6AA 4ZEIA 1XVXA 1DOTA 3A3CA 3T96B 3VFJA 1AIVA 4RPNA 4U4XA 1S50A 3UK4A 5DYHA 3G3GA 4KPTA 3S9MC 4G68A 3RLFE 1DPEA 1JNFA 3G3FA 4ZEFA 1B7UA 1MXYA 5H8HB 1HSLA 2G93A 1DSNA 2V93A 3MPLA 1MY2A 2P2AA 3T93B 4ZS9A 2PYYA 2OZZA 3Q29A 3MVWA 4G68C 4QSEA 1N0TA 3LUYA 3TUSA 3IB2A 4G2ZA 3N26A 1YCJA 4JXIA 2VP1A 3FUZA 2DWJA 3PPRA 2O84X 1QJMA 1MH4A 2A5TA 3C9HA 4R6YA 2RC7A 1Y20A 5JEIA 2V84A 1O64A 5FTHA 3RGYA 4NF8A 5DVFA 2XXQA 1I6QA 3ILTB 1D9VA 1JW1A 4YU0A 4R6HA 3KN8A 4P0IA 1EZOA 2F6PA 5IAIA 2V25A 3T66A 3DLNA 1LSTA 2I58A 3FVGA 5I56B 4R6KA 3EF7A 3FZVA 3KEIA 2P1SA 4U1OA 2ZNSA 2ZXTA 3MP8A 4YKPA 2ZYMA 5FHMA 3TYHA 2Y7RA 1FTKA 2UVHA 3MAMA 4R9GA 3IAZA 2PX1A 2ZYKA 2PT1A 5DTBA 4G8HA 1GR2A 3UIFA 3B6QA 4LQ5A 1LBCA 3B6WA 5FTIA 2X7QA 3PD9A 1UQWA 4N13A 4JB7A 2XD2A 4XTCQ 1TFAA 3TAJA 1POTA 3FVKA 3O29A 1MDQA 1Y3PA 3C33A 4FATA 3R7XA 2F5XA 1NH8A 4ZZAA 4EDPA 4YICA 5CMCA 3CFZA 1MG1A 5A5XA 4HCWA 4Z7EA 4ZEBA 2NUVA 4YB6A 5FHOA 4QFKA 1VSOA 2P0SA 2IA4A 3FXRA 4GD5A 2H9BA 5AA2B 5DT6A 4ZECA 3KSXA 3CG1A 4YZZA 4XKNA 1F9BA 2DP8A 4RY1A 3TPAA 3H4ZA 3PD8A 1B5HA 3MZBA 3OOAA 4NWDA 4GXAA 3UA8A 3BFUA 4BDQA 1URGA 3HCQA 5EYFA 3MP6A 2NVUB 3SDFA 1EH3A 4H6DA 2GHAA 2ESNA 5HBCA 1NFTA 1B5JA 2O69A 4QRZA 3KOSA 1N84A 1MM6A 4QFPA 4IY5A 1KWHA 3CG3A 2O7IA 4KFQA 1B3EA 3LSWA 4QFLA 2F7AA 4IGRA 1POY1 3B6TA 4FIMA 2FYIA 3K6UA 1OLCA 5B70A 4JWYA 1M5FA 1Q35A 2PT2A 3G3JA 3CFLA 4YB5A 3U8QA 4R9FA 2QSXA 1Y1ZA 4I8CA 4NF4B 1B2HA 1WODA 4ISUA 1MS7A 1OLAA 5I57B 1P1OA 4EXLA 2F97A 2R71A 4YMBA 1H43A 1B3LA 4F29A 3FV1A 3KFMA 4LZ5A 1HSJA 3RY3A 4ELRA 3Q27A 3SEWA 4NE4A 1DTGA 4JWOA 4GRKA 4OXVA 2DE2A 1D3KA 1IXCA 5I59A 4ZDMA 5I58B 4UACA 1QW0A 3PU5A 4EQBA 2HCAA 4DCXA 4R2FA 4OHNA 1GV8A 3MBPA 5ISUA 1DMBA 4ONYA 4O3CA 1IXGA 2O68A 5I2NA 3RNNA 4OYVA 2E1SA 2VD3A 4YKKA 4NF5A 3FXUA 1ATGA 1B58A 3PMVA 4F31B 3QSLA 1UIVA 2OBGA 1MQGA 1FTOA 2THIA 3RTWB 4NMYA 1YAEA 5H8NA 4KD5A 3VVFA 2CZLA 1US4A 4RJZA 2I49A 1Y9UA 4OESA 2UVJA 1R9LA 3FATA 4QSDA 2XHDA 5M2VA 1OVTA 3VVEA 1Y4TA 2QMWA 4IO6A 4JBZA 4IO7A 1B1HA 5CM6A 1NNTA 3QYTA 3JV9A 4R74A 5CI5A 4RK9A 3VDFA 4OENA 3O6HA 4LUBA 4H8IA 2DVZA 4HW8A 4XKRA 1N76A 2Y7KA 1BTJA 3V8XB 2H98A 5I84A 3C32A 4C0RA 4R73A 3O6GA 3QIMA 1LAHE 1B3HA 2IEEA 4DIGA 4PQJA 2F8DA 4U23A 4U2RA 4HTGA 4F3PA 3ZKKA 3UN6A 3Q28A 1FTMA 5CMKA 4IO2A 1Y3QA 2OK2A 1XOCA 2PBWA 2OLBA 3Q25A 2FNCA 4ELQA 5K2YA 1GTKA 1SDXA 1XHYA 4BDRA 1NMUA 2O7UA 5I2KA 5BUUA 3IR1A 2D5WA 4GFRA 2D21A 4DDDA 2RKMA 1BIYA 1MXVA 1MXUA 1YTVA 2Y7PA 2DWHA 4U1ZA 4F1YA 2REJA 1MRPA 5J1DA 1MPBA 2XXWA 2X7PA 2DE4A 2I3VA 2HZKA 3CI8A 4KR5A 2DSFA 1VR5A 2D3IA 3H7MA 1B4HA 1MQHA 3FIRA 2I0CA 1N7WA 1FQBA 5AE4A 4G77A 3S4UA 5DEXB 2F7BA 3MWBA 3IK6B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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