5I57A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
281
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 81
structure length 281
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A02
1NL5A 4DIGA 3KSXA 3E4RA 2I0BA 4KCDA 4U1OA 5F1QA 2PMSA 2NWJA 2HXWA 1TXFA 3MAMA 3G7WA 1Y4TA 5I58A 5AA4A 2G29A 5FTIA 4U4SA 4ESXA 2Y7IA 3K1PA 3V89B 5JK4A 3QUFA 2DWIA 4MLVA 5I84A 1B52A 4ZEKA 3W15C 4NTLA 3EHUA 3O2AA 2XX7A 4OMBA 4BDOA 3I5OA 4H67A 3FZVA 4YB6A 4F3SA 1EU8A 3GBAA 2I49A 1EZ9A 1P1NA 1Y9UA 2I58A 2OWSA 4RPNA 4PETA 4ND9A 2O51A 2DE2A 4QSCA 1IUDA 4F22A 1IIWA 1MXXA 1I69A 4YU0A 1LSTA 2AYSA 2Z8DA 2O7IA 4OENA 4NF4B 3P7IA 2Q88A 5TPAA 5H8NB 4KHZE 5KZTA 4G77A 1D9VA 3PUWE 5ICQA 3TZAA 4QFKA 1Y20A 3SDFA 2Y7WA 3QUJA 1ZTYA 4KQPA 4JSOA 4QFOA 3OXNA 3OENA 2XXUA 3RUMA 1FTJA 4ZE9A 2QMWA 1SW2A 2I0CA 1M5CA 2HFBA 3OO7A 4EF2A 2F7BA 5K2XA 3IOTA 1FQBA 1GTKA 3K2DA 3SEVA 1QUJA 1ZIUA 4EXLA 1Y1ZA 1OQGA 5TP9A 1IQ7A 1MG1A 4F2QA 1FCKA 3PU5A 1TWYA 1B4HA 3IO4A 2RC8A 5JEIA 3VVEA 5H8FA 4IY6A 3UP9A 3OEMA 3TTLA 4PFTA 2V3UA 1B1XA 3G3FA 1R9LA 5HPQA 4F18A 3DLNA 3FXUA 4DXBA 4ECFA 5BWJA 3I3VA 4OFJA 3UA8A 1B4ZA 2IEEA 3CFLA 2F7CA 3M3KA 1OMPA 3FV2A 2ONSA 1LAHE 2R9JA 3TTNA 5AA3A 1GVCA 2DE3A 3IB1A 1P1UA 4IGRA 3MZBA 5L9OA 5CC2A 1LFGA 3RTFB 1SW5A 3DP4A 4QSEA 5DEXA 2DS9A 4LONB 1NNFA 2XXPA 3RY3A 2VHAA 1B0HA 5H8HA 1N7WA 4GL8A 4YICA 2F35A 3QAXA 1L5TA 5AE4A 3K6VA 1LAGE 3TODA 4RNSA 4U22A 2XXIA 4G68C 1XT8A 3N6TA 4XTCQ 3K00A 3OOAA 2ZYMA 4KD5A 4RYAA 1D4NA 3KN7A 3R7XA 4G8MA 5TP9B 2QSXA 3IJXB 1P1OA 4C0RA 2UVIA 1A99A 4R2BA 1NNKA 2DXYA 2UVHA 4G2ZA 4OFLA 2OK2A 2AL4A 3LR1A 1B46A 1MQHA 5BUUA 3R26A 3OSRA 2QPQA 5H8FB 1DTGA 2QS3A 4O3CA 1UTHB 2O1LA 2DXRA 1LBBA 4QFLA 1JW5A 2HZKA 2X26A 3U72A 2IA4A 4EQBA 3C9HA 2H99A 3CFZA 4R6HA 1EZPA 2ANJA 1CE2A 2PT2A 3KGCA 2QL3A 4DXCA 4P0IA 3Q26A 1MY2A 4XXUA 1IXHA 1SYIA 1A55A 4Z7EA 1OLAA 3OO9A 2PT1A 1YCJA 4RK2A 1NNTA 3G3GA 2V84A 2HAUA 4NF6B 2XX8A 3MPLA 5CMBA 3FJGA 3KFMA 4ZEDA 2F97A 2Y84A 1MQDA 4R73A 3UORA 1DPEA 4GFRA 2O68A 3M3FA 1LCTA 4XKPA 5CMCA 4JXIA 3Q25A 1ZJLA 1DMBA 4F1VA 1MY3A 3B6WA 3IORA 3EHTA 1J1NA 3T96B 5ICTA 4FIMA 3K1MA 4DCYA 4RY1A 1XHYA 1TFAA 3Q28A 4ZDMA 3PGFA 3W9VA 2VOZA 4OTEA 2Z23A 2HZLA 4GL0A 3TTKA 1PEBA 2DWAA 1SW1A 2OLBA 5K2YA 1VFEA 1S7YA 1PB9A 5I2NB 3FVGA 4OEUA 1QUKA 1M5DA 3PMWA 3LC8A 5KCJB 3C35A 4GIZA 1PBQA 4EF1A 1FTMA 3RN8A 2V93A 5H8QB 2F6PA 2OZZA 1WODA 5KDTB 1URGA 1I6AA 4KI0E 3TDJA 3TUSA 5ITPA 1B1HA 3GXAA 3JV9A 3KEIA 1PB7A 3CVGA 4JBZA 4PFYA 3TTMA 5I57B 1A40A 3RTWB 2HQ0A 1DSNA 4ZEFA 1ATGA 2GFEA 3MVWA 1B2HA 4YKJA 2XXQA 1IXCA 2DVZA 2DSFA 4YMAA 3PV0E 1AL3A 2FA7A 5TU0A 3ZSFA 3TQWA 4X48A 4H5GA 4GRKA 1OQHA 4O3BA 1LB8A 3IB0A 4EQ7A 3C34A 1VFDA 1QULA 3H03A 3KN8A 1QKAA 3S4UA 2DP8A 3KG2A 1B40A 4JDFA 3FATA 4MFIA 3FVKA 2LAOA 2XXHA 1FTOA 4F19A 3H6VA 5DVJA 1YPNA 2KLFA 3RT6B 3C31A 3CFXA 4C1TA 3MVYA 4H65A 3PMXA 3MZ1A 4ELOA 4OVJA 1POTA 3CSBA 1ANFA 1UTBA 3K02A 4I8CA 3VVDA 2DWJA 3VLVA 3H6WA 4X1DA 3U8QA 2V25A 1USYH 4ELRA 1II5A 1B7UA 2XXWA 5ITOA 5I2KB 2F78A 1LB9A 1H43A 1HSLA 2HEUA 2UXAA 1N84A 3S2VA 1MS7A 2NVUB 1OLCA 4GD5A 4TQUQ 2ZNUA 1MXZA 1MPDA 4OHNA 3IL1B 4F31B 4FECA 5DVIA 2RC9A 5EYFA 4R72A 4YKPA 4IO7A 1FTLA 2XD2A 1SDXA 4KYSA 1LLSA 1QW0A 4PE5B 1BKAA 4IO3A 3LSLA 4BDRA 4FEBA 3C33A 4JSDA 1IXIA 4F3BA 3FGSA 1N04A 1D9YA 3CIJA 4BDQA 4ELPA 1DPPA 2BJJX 2ONRA 4X1BA 5J1DA 3VLWA 4OERA 3SESA 3OSQA 2DVCA 4OXVA 2RKMA 4WEPA 4OEVA 1PDAA 3HSTA 1POY1 2A5TA 1US5A 5I58B 5AA4B 4EDPA 3V8XB 1XC1A 3K0VA 3A3CA 2G93A 5CRYA 3S9EA 4YKKA 3ZS6A 5I59A 3O9PA 3S9MC 1SVXB 1RYOA 1ZU0A 3LBSA 3TPAA 4JB7A 1B6HA 4FEDA 3VXBA 1XVYA 1A54A 3ILTB 1B5HA 5L9SA 4HS7A 4YZZA 1BIYA 2PYYA 2UYEA 2F34A 3ODBA 2UYFA 4HW8A 5EHMA 3DP6A 3MJNA 4OESA 4GVOA 2AIXA 4ISUA 3CRBA 1M5FA 3C32A 1LAXA 3QSLA 1S50A 5AA2A 5L8DA 1MY4A 1NKXA 3N94A 2YLNA 3SEXA 1MPCA 3TELA 1Y3NA 3K4UA 1I6BA 4H5FA 4LZ5A 4GWOA 4LQ2A 3UIFA 2NOOA 4G68A 4RXLA 3RGYA 4IO5A 1RKMA 4I9DA 3R6UA 3SEYA 4THIA 4ZZEA 1P99A 3SERA 1ZBMA 4P0GA 2ZXTA 1N7XA 3QK6A 3D4CA 3FJMA 5TPAB 3HV1A 2GHAA 2NXOA 4Z0IA 2VD3A 2O84X 4MF3A 1O64A 2YJPA 4F2OA 1UQWA 2REJA 3T9HB 4OWDA 3U94A 2RCAA 2Y7PA 3TTRA 1FQDA 4QSDA 2X7PA 3KOSA 2Y7KA 3MPKA 1LCFA 3KSJA 4MH5A 2XXTA 5I56A 2O69A 3I6VA 5HBCA 1HSJA 3MVXA 3O97A 4NF5A 2ALUA 3IJOB 3IOWA 3IB2A 4TLMB 2DWHA 4NEDA 1SI1A 4G8NA 1M5EA 3V5AA 4DDDA 4G8HA 1MDP1 4KR5A 4RJZA 3B6QA 3LSFB 2P2AA 3G3KA 2F5XA 2XXRA 3VXCA 1FQEA 2OJTA 1N0TA 5JTYA 1AOVA 1IITA 3L6HA 3MUQA 3MQ9A 4U2RA 1MM6A 4QHQA 1IXGA 3DM0A 3HPIA 3EPEA 2Z8FA 5DYHA 3SEWA 1H3DA 5EHSA 1JW1A 4JWXA 1A7LA 4RPOA 1XVXA 1Z7NE 5L9MA 4TLLB 4Q8RA 3A09A 4OFOA 5CMMA 3THIA 4QF9A 2THIA 5FHNA 3MWBA 2D21A 4F39A 3IX1A 4IO4A 4GLIA 3RLFE 2O6AA 5FHOA 1AIVA 3IK6B 4KYEA 4H6DA 3HO7A 4F3PA 1Q35A 3LUYA 1MXUA 3MP8A 3O6GA 5DEXB 1WDNA 4N6PA 3HN0A 2PBWA 1ELJA 5H8HB 4Q30B 3U93A 3OELA 2ONKE 4MLQA 4HCYA 2WKYA 1LBCA 3T9VA 4RA1A 4ONYA 1JQFA 4NMYA 4QFPA 4BDMA 1D3KA 2A5SA 3RQTA 4FJPA 1MQIA 3LSWA 4Q5TA 3FD3A 2QS4A 1US4A 3PPRA 4G4PA 3ZKLA 1URDA 1MXVA 4OETA 4R9GA 1I6QA 1Y3PA 4IGTA 1OIBA 3CG1A 3GZGA 3PD9A 5M2VA 1FQFA 2RF1A 2I6EA 3CI8A 3U92A 4ZEIA 1IZ1A 2H5YA 4AQ4A 4LQ5A 1LGBC 4ELQA 1LAFE 2AL5A 3IO6A 3LSXA 3S9NC 1EZOA 1B7ZA 1EH3A 3WAEA 1B58A 2HCAA 3N5LA 3PPPA 4DE8A 2D3IA 1XS5A 3H4ZA 3Q29A 3E9XA 1S9TA 4PP0A 4LVQA 1A8FA 4R2FA 3UGWA 1GR2A 3JYRA 3C36A 4H0WA 2ZYOA 3KZGA 3AXFA 2NUVA 1R9QA 1FQAA 5AA2D 1CB6A 4LA9A 1QKBA 3PUZE 2RINA 3H7MA 1UIUA 3T22A 3VLUA 2I3VA 1KWHA 3SEUA 2QMXA 2QJEA 4GQOA 3VE1B 2UVGA 3A3UA 4ZZAA 1NH8A 2H25A 2W7YA 4R6KA 2ZMBA 2F8DA 1B05A 2DYXA 5CI5A 4EQ9A 2ESNA 1Y3QA 1LFIA 5IKBA 3EQ1A 4TOZA 2PX1A 4U23A 4NWDA 3K01A 1Y1MA 3WAFA 4NF4A 2P0SA 1A8EA 3ILUB 4X9TA 3TAJA 3KJTA 1MDQA 5H8NA 2ZNTA 1JW4A 1MQJA 4GXSB 1XOCA 3EHSA 2GRVA 2XXXA 2QS1A 1SQYA 4EUOA 1YAEA 3H6TA 1B9JA 1Y4CA 2B3FA 2M8CA 4YB5A 3HCQA 1PBPA 4K3FA 1OVTA 1ZMGA 2CMOA 3OO8A 1NNPA 2RC7A 3H06B 4P11A 4U21A 2R71A 4H1XA 4XIGQ 3BBRA 4GXAA 4BDNA 3H3GA 2Z22A 1VSOA 3PUYE 4XKQA 5A5XA 5DTBA 3C4MA 1MQGA 4YAHX 1NH7A 2GH9A 3D4GA 1HSEA 4ESWA 1MRPA 3ZKKA 4F29A 4GOTA 5B7DA 4U1ZA 4KYDA 4QRZA 3K6UA 4UACA 1NFTA 1MY0A 3PD8A 4ZE8A 3KBRA 3W9WA 3N6UA 4WXJA 2I4CA 4M1VA 2VP1A 1B3GA 1N3XA 3T9UA 2OCUA 3FXRA 2F36A 3T9XB 3KOTA 1QVSA 3FASA 2X7QA 3TMGA 3K6XA 4OZ9A 4NWCA 5DT6A 4LZ7A 4F1UA 1VE4A 1MH3A 1UTBB 4FE8A 1URSA 4O3AA 1VR5A 2B3BA 3SETA 1M5BA 4R74A 3TEPA 4RK9A 4DLDA 3MVZA 1MXYA 2XX9A 1O7TA 1F9BA 4AB6A 3ONMA 2UVJA 3OMBA 1PC3A 3OO6A 2RCBA 3VV5A 5A5XB 1JEUA 2F7AA 1QJMA 3TQLA 4DCXA 3G3JA 1R6ZA 2R6GE 3Q27A 3S9LC 1AH5A 5CM6A 2I4BA 4U4XA 2ZYKA 1FQCA 3DP8A 2XD3A 4NF8A 4BLAA 3TKDA 1UTHA 1Z7ME 1USYE 2GHBA 1OVBA 2Q2AA 4C1UA 2XXVA 2ABHA 3T93B 4YKIA 3E3KA 4OQOA 4Q0CA 3BKIB 3BFTA 3H6UA 1B5IA 4PFWA 1QUIA 4DXUA 3G3IA 5F7VA 5AA1A 4WKMA 2A5TB 4MBPA 1JEVA 4UA8A 2E0SA 3PMVA 2B65A 3FIRA 4FAJA 1TFDA 4NF6A 4PFUA 4YB7A 3TYHA 4LZ8A 5HM4B 2E1SA 2I3WA 5I59B 3F11A 3FJ7A 3GBBA 4KCCA 3ECRA 4F3GA 3MZ9A 4I62A 3MW0A 3VDFA 2HAVA 3FUZA 3IR1A 4IO2A 2ZYNA 4JWYA 3QYTA 3CG3A 3KN3A 3UN6A 1ZKBA 1MPBA 3FVNA 1BLFA 1H76A 4H8JA 4BDLA 3N26A 3KJ7A 3OD7A 4GF8A 3PUXE 3USDA 1NMUA 3BFUA 3QIMA 5CMKA 2DQVA 5AA2B 5IAIA 1FW0A 4N13A 1JNFA 3IOUA 4ZS9A 3M3LA 2OBGA 2Z8EA 3MP1A 4L17A 4WEDA 3EF7A 4KPTA 3QXMA 4G68B 1IEJA 1RYXA 4NF8B 2VGQA 5I2NA 1JVYA 3CSGA 1WVJA 5FTHA 5KCJA 5ELVA 3U1OA 2V3QA 3B6TA 1FTKA 4IY5A 4R9FA 1N3WA 4POXA 2Y7RA 3DELB 3O6HA 3PPNA 5ISUA 5H8QA 4IB2A 2XHDA 4E0XA 5KDTA 3PUVE 2F6GA 2Q8JA 2P1SA 1B7HA 5B70A 3E13X 4FATA 1AMFA 2DOJA 2H98A 3MBPA 4F1YA 3MP6A 1JVXA 4N07A 3PPQA 1P1QA 5I57A 1MY1A 5H8SA 2I48A 1B3HA 3FV1A 3PPOA 5CBSA 4KFQA 5I56B 2Q2CA 4NF5B 4R6YA 1Q1KA 2VD2A 2XXYA 3K1NA 4IO6A 1B5JA 1PB8A 2QRYA 3L6GA 1P1WA 3M8UA 3MC2A 2FNCA 2H9BA 4QFNA 3RNNA 3O66A 1UIVA 4XKNA 3OEKA 4R75A 4HTGA 1B0LA 4I1DA 1H45A 1BTJA 2REGA 1SW4A 5JTYB 2D5WA 4PQJA 2OWTA 3G3HA 3IAZA 3CR9A 4E0WA 4LP2B 1MH4A 3T66A 4YMBA 3IOVA 2FYIA 5FHMA 3SKPA 1JETA 3O29A 1SYHA 2V3TA 1SI0A 4AB5A 4DZ1A 3VFJA 4FORA 3TCHA 4JWOA 3JZJA 2QS2A 3HHGA 1TT1A 3FVOA 1N76A 1B51A 5DVFA 4ZECA 1SD3A 3HHFA 4ZEBA 2H4IA 2O1MA 3RT8A 3VVFA 2DE4A 1B3FA 3V83A 1H44A 3UK4A 4NE4A 1DOTA 1GGGA 5I2KA 3TCGA 1T0KA 4LUBA 5CBRA 4H8IA 1MM7A 1B32A 4HCWA 3K6WA 1BP5A 4XKRA 4OYVA 1ZLQA 4POWA 4LATA 3B7DA 1O63A 3GLBA 1YTVA 1GV8A 2ZNSA 2Q89A 3O28A 1SBPA 2O7UA 3TFLA 2PVUA 4EXKA 3EN3A 3TCFA 2Q9TA 2YPNA 3O6IA 1MXWA 3RPWA 1DTZA 4M4GA 1LFHA 3FXQA 1B3EA 2CZLA 1R1NA 1B3LA 5LOMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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