5I57A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
281
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 281
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A02
4ISUA 1WODA 1MG1A 2XXPA 4C0RA 3MAMA 4QRZA 1FTJA 1N3WA 3H7MA 1PBPA 1LAXA 1DSNA 2QS3A 2ZNUA 4DZ1A 4BLAA 3C33A 1H76A 1MS7A 1S7YA 2F6PA 3OEMA 1RYXA 4OERA 2QS1A 4BDQA 3K2DA 2H5YA 4QHQA 3H6UA 3M8UA 1ATGA 1MH3A 3CIJA 4G2ZA 3WAFA 1SW2A 1D9YA 2HEUA 4KYEA 4FORA 1QUIA 4PFUA 4EQ7A 3ZKLA 4PFTA 3H3GA 3KZGA 1YTVA 1B46A 1A55A 2XXYA 3IB1A 1JNFA 2DWIA 1O7TA 3DM0A 5HBCA 1B1XA 1IQ7A 3FXUA 5CI5A 3QXMA 4FEBA 4P0GA 2RC7A 4BDRA 3UGWA 3TODA 3UK4A 1MXWA 1B0LA 3Q28A 4G8NA 3RGYA 1MXXA 3OOAA 3TZAA 4KFQA 3PMXA 5H8QB 4IO6A 5EYFA 2QS2A 1UTBA 3QIMA 3U94A 5FHOA 4HTGA 1P1NA 1MXUA 1JEVA 5L9SA 1B32A 1BIYA 2QPQA 1QUKA 3C31A 1LB8A 2O7UA 3RTFB 4PETA 2H25A 3MP8A 3C4MA 4JSDA 4MLVA 1LCFA 2V3TA 2ZYMA 4LUBA 2UVHA 5CC2A 5AA4B 3PMWA 4OFJA 3TPAA 2V25A 3Q26A 3OO7A 3FGSA 1B5JA 1QJMA 5I57B 1ZIUA 2Q89A 4EF2A 3V83A 4HCWA 1HSLA 4YU0A 3KSJA 2RF1A 4H67A 3VVFA 4F3SA 1B4ZA 2P0SA 3PUYE 1DOTA 2V3QA 3MBPA 4KCDA 2ZYNA 3OMBA 4I9DA 1A54A 4IY5A 3BFTA 5I2KA 3M3LA 4DCXA 4Z0IA 3TTKA 3K6XA 1US5A 1VR5A 2AYSA 4G77A 2ALUA 1B0HA 4EQ9A 4FEDA 2HQ0A 3KOSA 3TYHA 5H8NB 3UN6A 3WAEA 2UVIA 3MUQA 5CM6A 1A40A 3KBRA 5H8NA 2B65A 2Z23A 3MPKA 2RC8A 1OMPA 2XXRA 2BJJX 4R73A 1M5DA 1R9LA 4ZEKA 2G29A 2QL3A 3L6HA 5TPAB 2XXWA 3E4RA 3T66A 3FD3A 4AB5A 3BKIB 4F3GA 3UORA 3HO7A 2OCUA 1B3FA 4KPTA 4MLQA 4JXIA 3CFXA 4LP2B 4DIGA 4R6KA 4F19A 4LA9A 3R26A 3VV5A 1M5FA 4OESA 4F2QA 4NF5A 3V89B 3MQ9A 4IO5A 4O3AA 1PB7A 4P0IA 3RQTA 3OEKA 1NNFA 2DVCA 1Z7NE 4WEDA 4OFOA 4N13A 1AOVA 3PUVE 3QSLA 4MBPA 1NNTA 4GRKA 4U1OA 4LZ7A 1MRPA 1MY4A 2XXVA 2ZNSA 4GOTA 1B05A 3PPNA 3TFLA 4GF8A 4RYAA 3QAXA 1Y4CA 3QK6A 4ONYA 3GBAA 2ZMBA 2UYEA 1ZTYA 1LFGA 3N6UA 3C32A 3SKPA 1R6ZA 4XTCQ 2VGQA 3O6GA 4TLLB 1SYHA 2V93A 4GXAA 1USYE 3UIFA 4F3PA 4NWCA 2NWJA 1CB6A 1TXFA 4G68B 4F1VA 3CSGA 3T22A 3PV0E 1WDNA 2I4BA 1RKMA 5I58B 5A5XB 2H98A 1OLAA 1R1NA 2Q9TA 5A5XA 2F78A 4H65A 2B3BA 4RXLA 2UXAA 3LSWA 5H8HA 3H6WA 3IO6A 3TTMA 4U22A 4GL8A 3BBRA 2H4IA 3H4ZA 1ZBMA 5KZTA 3TQLA 3PPQA 4C1UA 1B3HA 3K1NA 3MZBA 2VOZA 3DP4A 4QSEA 1LCTA 2O68A 5DEXA 2H99A 3IOUA 2OWSA 2ZYKA 2UYFA 4OYVA 1VFDA 5TP9B 1BP5A 5TP9A 5I84A 5FTIA 3RTWB 2OZZA 1MPDA 1B1HA 2P1SA 3H03A 3N26A 4R2FA 1XT8A 2NUVA 2QJEA 1B52A 5EHMA 4MF3A 3VVDA 4RJZA 2O7IA 4YKKA 2FNCA 1MY2A 4RK9A 4DXUA 3VDFA 4X1BA 2DWHA 2Z8EA 3A3UA 3ODBA 4G8MA 1NH8A 1CE2A 4QF9A 4R9FA 4TLMB 3T9HB 1POY1 4ZE9A 4NWDA 2Y7IA 4QFOA 3W9VA 4RNSA 2RINA 4IO2A 4JBZA 3IX1A 2Z8DA 3K01A 1A99A 4DDDA 3I3VA 2QRYA 5KCJB 5DTBA 2DWAA 5JTYB 3FJ7A 5KCJA 4IY6A 3QUJA 1Y4TA 4G4PA 2Q88A 4N07A 4O3BA 3E9XA 3MJNA 2A5SA 4QFPA 3GZGA 1SQYA 4F31B 1M5CA 4TQUQ 1B40A 1SBPA 3D4GA 3K6VA 2DOJA 2PMSA 2XHDA 3KJTA 1TFDA 5AA2B 2XXUA 3E3KA 1GGGA 2WKYA 1NNKA 4H5GA 3KJ7A 3RN8A 1HSJA 5L9MA 2Y7KA 4NF6B 2XXXA 4F2OA 1VFEA 4NF6A 1XHYA 3Q27A 3MVYA 2F6GA 2PBWA 2R71A 1XS5A 2B3FA 1S50A 3C9HA 3FXQA 2Z8FA 4QFNA 4H0WA 3RNNA 2IEEA 2XX8A 3LR1A 1SD3A 4ZEFA 1S9TA 1JQFA 3SEXA 4EDPA 2Q2CA 1L5TA 1LB9A 3KSXA 5JK4A 3G3GA 4YKIA 3Q29A 3SESA 1H45A 3PPRA 4EQBA 3USDA 2OWTA 4IGRA 3OELA 1PB8A 1Y1ZA 4DXCA 2O1MA 3S9NC 3QUFA 4XKQA 2Y7RA 3C35A 5EHSA 5H8QA 4IO3A 1YPNA 1GV8A 4QFLA 4HCYA 3KG2A 2O69A 1TWYA 4KD5A 4OTEA 3ILUB 2D21A 3N5LA 3K6UA 4E0WA 4OMBA 1NMUA 1DTZA 3CVGA 2YLNA 3U92A 4RPOA 5CMBA 1I6QA 4JWOA 1MM7A 1P1OA 3VLUA 2VD3A 3G3IA 2AIXA 1ZLQA 5CMMA 5AA4A 1BLFA 5H8FB 3O66A 1URDA 4UACA 3TELA 1DTGA 4EUOA 5H8FA 4OHNA 2RCAA 5I57A 4LONB 3FZVA 3MZ9A 3V8XB 3VVEA 1LAGE 3TKDA 2XXHA 3HPIA 3B7DA 4EF1A 1B7UA 1Y20A 5F1QA 5FHMA 1B6HA 2NVUB 1TFAA 1I6BA 3A09A 3SEYA 4FAJA 4DCYA 4IB2A 3EN3A 2Y7WA 1LLSA 3EPEA 1H3DA 2M8CA 3OO6A 4ESWA 3UA8A 1FQFA 2A5TB 4FATA 1FQDA 2Z22A 4C1TA 2THIA 2A5TA 1BKAA 3TQWA 1MY1A 1Y1MA 1B3LA 1QULA 1FQAA 4GIZA 3HN0A 3F11A 5AE4A 4BDOA 1EU8A 2F7CA 1N7XA 5ITOA 4YB5A 4DE8A 5TPAA 1B2HA 3T9VA 1SW1A 1FTMA 4NF4B 3IB0A 1AL3A 4NF4A 2I3VA 1SI1A 3KEIA 1MQJA 4BDLA 3S9MC 1Y3QA 3THIA 1PDAA 2DYXA 1GVCA 1NH7A 2PT1A 4LQ5A 2X7PA 3UP9A 2ZYOA 3RPWA 2QS4A 4KR5A 2E0SA 3FATA 1EZPA 3G7WA 2O1LA 5K2YA 4LZ8A 1P1QA 5I56B 3JZJA 3TMGA 2F34A 1NNPA 5I56A 1IUDA 5L9OA 2DE4A 1DPPA 5KDTB 1N7WA 2YJPA 3MW0A 3ZS6A 5L8DA 5ELVA 1FTOA 3H06B 1RYOA 5CMKA 5ICQA 3ONMA 5LOMA 3RY3A 1MPCA 1MQIA 3SETA 1B9JA 4YB7A 2I48A 4H5FA 2RC9A 4Q5TA 4ZDMA 1SVXB 4XIGQ 2I6EA 3IL1B 3PGFA 3O2AA 4TOZA 3GBBA 3T96B 1SDXA 4JWYA 2D5WA 3VXBA 4YKPA 2ABHA 2G93A 3VXCA 1FQCA 1EZOA 4RY1A 2H9BA 3EHTA 5F7VA 2XD2A 2I4CA 4GFRA 5I2NB 5IAIA 1Y3PA 5I2NA 1URGA 5K2XA 1A8EA 4WXJA 1FQBA 5HPQA 5DVJA 3K02A 1XC1A 4G68A 4POXA 3FVNA 3U72A 4LZ5A 1P99A 2I0CA 1POTA 1JW4A 3KFMA 5I58A 5FTHA 3H6VA 3N6TA 1NL5A 4GD5A 3LC8A 2VHAA 3SDFA 2X26A 1JW5A 1UIUA 1OVTA 3OO9A 3S2VA 3U8QA 1N0TA 2ANJA 1I69A 5HM4B 3EHSA 3OSQA 3VFJA 2I3WA 4JWXA 3SEWA 4ZZEA 3PPOA 1MQGA 4OEUA 1OQGA 1YCJA 3ZSFA 1Q35A 1XVXA 4H8IA 4GWOA 3DLNA 4XKPA 4OENA 2NXOA 4R75A 3Q25A 2DP8A 4GXSB 4G68C 1D4NA 4F1UA 3TEPA 4R72A 4F39A 1T0KA 4IGTA 4YMAA 3W15C 2AL4A 5ICTA 4JB7A 1H43A 3HHFA 3TTNA 4EXKA 1IITA 2RCBA 5H8SA 5BUUA 2PYYA 3B6WA 3IR1A 3B6TA 3IJOB 3TCGA 3PU5A 5M2VA 3VLWA 2I49A 3EQ1A 1AMFA 3M3KA 4U21A 2RKMA 1I6AA 4DLDA 4ELRA 4OVJA 4R9GA 3PUWE 4U23A 4MFIA 4I62A 4DXBA 1XVYA 4PP0A 4YICA 2F7AA 3O29A 4E0XA 4AB6A 1MQDA 2FA7A 4OFLA 3O9PA 3PUXE 4YKJA 3CG1A 2OK2A 4R6HA 1N3XA 2Y7PA 4ND9A 1FQEA 5JTYA 3PMVA 1MY3A 3K6WA 1A7LA 2KLFA 4I1DA 1LBBA 5BWJA 3K0VA 3FV1A 4GL0A 2DXYA 4PQJA 3S9EA 1JETA 1IEJA 4KI0E 3U1OA 1H44A 2F97A 2GHAA 5AA2A 2VD2A 1VE4A 4H8JA 4RA1A 3T9UA 1VSOA 1M5EA 4N6PA 4NF8B 1UQWA 4ZECA 1PBQA 4XXUA 4NF8A 3MVZA 4X1DA 2CZLA 4OQOA 1MDQA 2VP1A 2PX1A 1JEUA 3FJGA 1NFTA 1Q1KA 4R6YA 5IKBA 3KOTA 3FJMA 1ZKBA 3TCHA 1Y9UA 2HCAA 2UVGA 1SW4A 3VE1B 1D9VA 2D3IA 4YAHX 3H6TA 4U2RA 2GHBA 3I5OA 2V84A 2OBGA 2REGA 1IZ1A 1BTJA 3LUYA 1JVXA 1QKBA 1B51A 3SERA 2HZKA 4R74A 3O97A 3P7IA 1B5HA 4M1VA 4NEDA 3MC2A 3FUZA 3CI8A 3A3CA 5CMCA 3IAZA 4ELQA 5ITPA 3MVWA 3GXAA 3CFLA 2XX7A 2DSFA 3MVXA 1B3GA 1KWHA 2ZXTA 2DVZA 4LVQA 4THIA 4FECA 3IOWA 1HSEA 3DP6A 3EF7A 2FYIA 3KN7A 1EZ9A 4YB6A 3PUZE 3CR9A 3C36A 1P1WA 1F9BA 1LBCA 4RPNA 4U1ZA 1UIVA 4FIMA 1UTBB 4QSCA 1MXZA 3O28A 5AA1A 2REJA 1MXYA 2F8DA 2XXQA 1M5BA 4GQOA 4F3BA 4X48A 2QSXA 4EXLA 1LFHA 3T93B 3ILTB 5AA3A 3LSXA 1DPEA 4G8HA 4POWA 5AA2D 1UTHB 3IB2A 1R9QA 1MPBA 1UTHA 2O6AA 2NOOA 1O64A 2F5XA 5CBRA 4ELOA 1N04A 3D4CA 3G3FA 3EHUA 4ZEBA 1PB9A 1OLCA 2OLBA 4YMBA 2DE3A 1B3EA 3PPPA 1QKAA 1YAEA 3IOVA 3S9LC 1QW0A 4FE8A 4ZZAA 3FVOA 3L6GA 3R7XA 4F18A 2E1SA 1PEBA 3B6QA 1D3KA 3I6VA 3TCFA 1DMBA 3LSFB 1B7ZA 3SEVA 4ESXA 5I2KB 2UVJA 3RT8A 1B7HA 1MH4A 3LBSA 3GLBA 1N84A 5DYHA 1B58A 3M3FA 2HZLA 2ZNTA 5B70A 4F1YA 1J1NA 2IA4A 3MP1A 1B5IA 4PFYA 3T9XB 4I8CA 3MZ1A 4IO7A 5JEIA 2I58A 3V5AA 1MXVA 1FTKA 4PE5B 4ZEDA 2Q8JA 1QUJA 4M4GA 2DQVA 3RUMA 1WVJA 1TT1A 3FVGA 1LFIA 4LATA 2HAVA 3AXFA 4KHZE 4XKRA 4U4SA 2P2AA 4XKNA 4LQ2A 5B7DA 4X9TA 3OO8A 2O51A 4FJPA 3CG3A 5DVFA 3JYRA 4WKMA 2LAOA 3FVKA 3HV1A 1LSTA 1URSA 2QMWA 3DP8A 3CRBA 1IIWA 4F29A 4PFWA 2PVUA 5KDTA 3IO4A 2DWJA 1LAFE 4KQPA 1OQHA 4NF5B 3RLFE 2I0BA 4OZ9A 4GLIA 2QMXA 1SYIA 1JVYA 5DVIA 2W7YA 1SI0A 3U93A 3W9WA 3K1PA 4OWDA 4KCCA 1GR2A 3G3JA 3HSTA 1ELJA 3OD7A 4OXVA 1MY0A 2O84X 1ZJLA 3FXRA 2F7BA 3PD8A 3JV9A 4RK2A 4HS7A 2DE2A 3IORA 4ZE8A 4F22A 4HW8A 1AH5A 2CMOA 5J1DA 2Q2AA 3FV2A 3TTLA 3TUSA 3MPLA 4P11A 1Z7ME 3BFUA 3K00A 4BDNA 5FHNA 1LGBC 4GVOA 2V3UA 1O63A 4QFKA 1EH3A 3IK6B 4Q8RA 3HCQA 1FCKA 3KN8A 3N94A 2XXIA 3IJXB 3FASA 2PT2A 4Q30B 3TAJA 2ONSA 4H6DA 3O6HA 1FTLA 4Z7EA 4KYDA 2AL5A 1LAHE 4OEVA 4KYSA 3K1MA 3K4UA 1JW1A 5CRYA 3TDJA 4L17A 3ECRA 2ONKE 2ESNA 4JDFA 4H1XA 4BDMA 2OJTA 2R9JA 1A8FA 1IXGA 4ZS9A 5H8HB 2ONRA 1II5A 1ZU0A 1NKXA 2XXTA 1P1UA 2R6GE 3E13X 2GH9A 1XOCA 3HHGA 4O3CA 5CBSA 3R6UA 4R2BA 1MM6A 2HFBA 1N76A 4NTLA 3G3KA 3CFZA 1PC3A 1QVSA 3OSRA 3C34A 5DEXB 1ANFA 4QSDA 3RT6B 3QYTA 3S4UA 2F35A 2GRVA 1IXIA 4ZEIA 4ECFA 4MH5A 1ZMGA 4WEPA 3G3HA 4YZZA 5ISUA 1IXCA 2YPNA 4U4XA 3CSBA 3O6IA 1USYH 5I59B 3DELB 3LSLA 3TTRA 2DS9A 1IXHA 3KN3A 5I59A 1MDP1 1MQHA 2Y84A 2HXWA 2DXRA 2GFEA 4IO4A 2HAUA 1SW5A 3SEUA 4ELPA 5DT6A 1OVBA 5TU0A 3VLVA 3PD9A 1FW0A 3IOTA 4AQ4A 1GTKA 2F36A 3ZKKA 3OENA 4UA8A 4JSOA 1US4A 4NMYA 4Q0CA 3MWBA 1Y3NA 1OIBA 1B4HA 3KGCA 2XD3A 3MP6A 2XX9A 4NE4A 3FIRA 3OXNA 4OETA 4K3FA 1AIVA 2X7QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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