5I59A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 83
structure length 262
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A02
2G93A 4XKPA 1AIVA 4EF1A 1XVYA 4PE5B 3KJ7A 2DYXA 4F3BA 3RNNA 1JW4A 1WVJA 3EHSA 3H6TA 4DXUA 2O1LA 4JXIA 2Q2CA 3OOAA 2F6GA 3U93A 2DVZA 3E13X 3VLVA 5TU0A 4UA8A 5CMKA 3PPQA 4KPTA 3CSGA 1DMBA 1Q1KA 1QUIA 3KGCA 2QPQA 1BLFA 1UTBB 4G8NA 3O6IA 1B5HA 1JETA 4ZECA 2QSXA 1AOVA 2V3TA 3CFXA 5LOMA 3W9VA 3PD9A 3RN8A 4IY5A 1N84A 2DSFA 3FXQA 3MVZA 3MZBA 1PEBA 3H6UA 3N6UA 4GF8A 3N6TA 3KOTA 3TTNA 2Y7IA 4NF6B 4JDFA 4QF9A 2OJTA 1MXZA 3MPLA 2I49A 4OWDA 3FIRA 2DE3A 2GFEA 1MXWA 3H03A 4H8IA 3TPAA 4U4SA 1OIBA 3LR1A 2O7UA 1FQEA 1TXFA 4KQPA 2Q88A 4ZE9A 1FTKA 1BP5A 3PPNA 4ZEFA 4JB7A 3T22A 3SERA 3PPRA 4YB5A 3PUVE 4R9GA 5CBSA 1L5TA 2ZYKA 3TTLA 3B7DA 1FTMA 5AA2A 4AB6A 2ZNTA 3CIJA 3VXBA 4XXUA 4YAHX 3TTRA 2A5SA 1FQBA 1PC3A 3TODA 1A8EA 3Q28A 3SEUA 1B3FA 4OTEA 3S9LC 1URSA 3N5LA 4O3BA 4JWYA 2I6EA 4R6HA 4IY6A 3SDFA 1IXHA 2Q89A 3ZSFA 4Z7EA 4KHZE 4PETA 4ESWA 3E3KA 4U23A 2DVCA 4H1XA 2XXRA 2R9JA 3L6HA 5I2NB 1JW5A 4AQ4A 1RYOA 1LFGA 3MP1A 4R2FA 4JWXA 3RT8A 1QVSA 2VD2A 3QK6A 1N7WA 3TMGA 4FORA 4X1DA 5AA3A 3IR1A 3PU5A 3Q25A 4FJPA 5IKBA 2HAUA 4DXBA 5DTBA 2DOJA 4LP2B 4POXA 1BKAA 1GTKA 4Q5TA 4IB2A 1KWHA 3UP9A 3K6UA 1MDP1 4EUOA 5ITOA 4H0WA 1D9VA 4DIGA 3C34A 1USYH 5AA2D 2DXYA 2ONSA 4X9TA 3C35A 3C36A 3TFLA 4HCWA 4PFUA 2ONKE 4I9DA 2Z8DA 3N94A 2W7YA 2AIXA 3MZ1A 2FA7A 1B58A 4K3FA 1LBBA 2PBWA 3IO4A 1UIUA 2R71A 3MPKA 3IOVA 4KCCA 3OO8A 4N13A 3JV9A 2I4CA 1M5BA 2VOZA 4X1BA 4GXAA 1HSEA 5FHMA 3DP4A 1SI0A 3K1NA 4ZEDA 2H9BA 3K02A 4ZEBA 4ZE8A 4H65A 1PB7A 2I3WA 1JEVA 3VVEA 2DWJA 3GBAA 2DP8A 4OFOA 2QS1A 2Y7KA 3OO6A 5ELVA 4KI0E 2OLBA 4XKRA 1PB8A 2UYFA 4YZZA 4P0IA 4ISUA 1S9TA 3L6GA 4F2QA 5A5XB 1B7HA 2HFBA 4KR5A 4NTLA 3VLUA 4GD5A 4KFQA 3G3KA 3RUMA 2NVUB 2UVJA 3KSXA 5JEIA 2ANJA 3H3GA 4H67A 3HN0A 1MS7A 5CI5A 1MQDA 2Y7PA 4F3SA 3TQLA 2GHAA 4GL0A 4IO3A 2QJEA 3VV5A 1SW1A 2BJJX 5H8NB 2O84X 1LBCA 3PD8A 3OMBA 3HHFA 3ILUB 3B6TA 2HXWA 1VFDA 5EYFA 3FVKA 4C1UA 1N0TA 4XKNA 1QUKA 5B7DA 5I2KB 1ZMGA 3D4GA 4DE8A 3M3FA 3BFTA 1Y20A 2DQVA 4GOTA 4QSDA 4YMBA 3G3GA 3TCHA 4F2OA 3CG3A 3FJ7A 2ZXTA 5TP9A 1XT8A 4RXLA 3AXFA 1Y1MA 5BUUA 2GRVA 3UGWA 2YJPA 5M2VA 4ELQA 5I56B 3SKPA 2QMWA 3EHUA 1ANFA 2D21A 3QAXA 1DOTA 2G29A 3I3VA 2V25A 3Q29A 1XC1A 4TQUQ 5J1DA 4GQOA 1HSJA 3O6GA 2XX8A 2H25A 4G8MA 2DWAA 3H6VA 4QHQA 3VVDA 2O51A 2I0CA 1QUJA 4F18A 2HAVA 3TQWA 1B46A 3USDA 2YPNA 4RJZA 3N26A 1ZIUA 3KJTA 1MY0A 5H8HB 3FJGA 3T9XB 1BIYA 2F97A 5L9MA 4DXCA 2Y7RA 1CE2A 3TAJA 2UYEA 4O3AA 4NF5A 4RK9A 3IJOB 4EF2A 4EQ7A 4M4GA 1QW0A 5DYHA 1WDNA 2I3VA 2F6PA 2Z8EA 1A55A 3T9UA 3S4UA 4WEDA 2D3IA 1A40A 2O6AA 2V84A 1HSLA 3T93B 3IO6A 2E0SA 2Q2AA 4OERA 3K6VA 2B65A 2ESNA 4ECFA 3C32A 4IO2A 3MQ9A 4ZZAA 1A54A 4HTGA 3K4UA 3Q27A 2RC8A 3KBRA 4WEPA 5JTYB 5KCJB 3H06B 1Y1ZA 4YKPA 2KLFA 3MVWA 3M3LA 1UQWA 3V8XB 3CI8A 4NMYA 4PFYA 1UTBA 1QJMA 1NH7A 3EHTA 1Y9UA 3VE1B 4U2RA 4RYAA 3HCQA 2RC9A 4GXSB 2GHBA 2XXPA 4OQOA 3TELA 1B0LA 1B3GA 1MG1A 2V3UA 3IOWA 4U4XA 4MBPA 3OELA 2Z22A 1JQFA 3RGYA 2CMOA 1B40A 4NF6A 4LVQA 4G2ZA 2Z8FA 4TLLB 1JVXA 2XXVA 1LAFE 3TTMA 5L8DA 4HCYA 5FTHA 2XX9A 2NUVA 1LGBC 4HW8A 1Y3QA 1PBQA 3A09A 2P0SA 4MH5A 2PT1A 3DM0A 1MQGA 3Q26A 5FHNA 5CC2A 3T96B 4QFLA 5H8FB 1SBPA 1D4NA 2UVHA 5CMBA 3ZKLA 3MP8A 4F1VA 4AB5A 3V89B 1B1HA 1DTZA 2Z23A 4NF4B 4GRKA 1H76A 1MQJA 4PFTA 4H5GA 5AA4A 4U1ZA 2Y84A 3OEMA 1MY3A 3K01A 2HCAA 3PGFA 4L17A 3LSFB 5HM4B 2XHDA 1M5CA 1LFIA 3VLWA 5AA4B 3V5AA 1N04A 4XKQA 1LB9A 1FTOA 1M5DA 1DSNA 2OWSA 3SESA 1N3XA 3C9HA 3TCFA 1QULA 5EHMA 1EZ9A 1NFTA 3MC2A 4QFKA 1P1QA 3A3CA 3OO9A 2RCBA 2I48A 1B5JA 3IJXB 5I2NA 1FW0A 1TFDA 3RT6B 5B70A 1MXUA 4F29A 3LC8A 1UTHB 1B3LA 1ZBMA 2NXOA 4R9FA 5IAIA 1MRPA 3RTFB 4GIZA 3IOUA 2F34A 2X7PA 2F7CA 3JZJA 3P7IA 4MF3A 1BTJA 1LSTA 1IXCA 4ZDMA 5ISUA 3IB1A 1RYXA 2QMXA 3SEWA 3DP8A 4YU0A 4OFJA 1MY2A 4F1YA 2B3BA 4BDMA 3C33A 4YKIA 2RKMA 4Z0IA 2H98A 2REJA 2F7BA 4KD5A 4OXVA 2RCAA 2CZLA 3S2VA 3QUJA 4E0WA 1QKBA 3OSQA 1NKXA 4YICA 3RTWB 1GV8A 4RA1A 4YMAA 1H3DA 5DT6A 4LZ7A 5KDTB 3G3IA 1US5A 1XHYA 1EH3A 4FEBA 2ZYMA 1MY4A 1R1NA 3H4ZA 5TPAB 2F35A 3GLBA 3KG2A 1B4HA 1N3WA 4Q0CA 2HZKA 1Y3NA 3ZS6A 1R9QA 4ZEKA 5KZTA 5F7VA 3RLFE 2X7QA 1PDAA 1OMPA 5I59A 2FNCA 1T0KA 2E1SA 3PMXA 1MH3A 4KYSA 1LAGE 2H4IA 5A5XA 3G3FA 4HS7A 3TZAA 4R74A 5DVIA 3OD7A 3TCGA 5ICTA 4MFIA 2XXUA 4WKMA 5I59B 3T9VA 4XTCQ 4QFNA 1B7ZA 5FHOA 1B5IA 5CMCA 3BFUA 3IAZA 1SW2A 1AL3A 4LZ8A 2DWHA 4I62A 1SYHA 1P1OA 1I6AA 1WODA 3CG1A 2PYYA 4N07A 5H8NA 2WKYA 2ZYNA 1O63A 1JNFA 3U8QA 3QUFA 4LQ2A 1NNTA 4LQ5A 4F1UA 3ZKKA 1P1NA 3EF7A 2F8DA 1DPPA 5I2KA 4GWOA 2H5YA 2XXWA 4EXLA 2DS9A 3S9EA 1MPCA 3TTKA 2VHAA 1SW4A 4RPNA 4ELOA 5I58B 2Q9TA 1IUDA 3VXCA 1D3KA 1QKAA 1N7XA 3MWBA 2OBGA 4OYVA 1I6BA 4RK2A 3K00A 4MLVA 4JBZA 1XVXA 5I56A 2H99A 3LUYA 3IL1B 1I69A 3PUWE 4EDPA 3D4CA 1Z7ME 4DLDA 1SW5A 3T66A 2VGQA 2YLNA 4BDNA 4ZEIA 1MH4A 3PUYE 4F3PA 2QS4A 1D9YA 3MP6A 2UVGA 3WAFA 2AYSA 1Y3PA 3BKIB 1B3EA 3GZGA 5HBCA 3I5OA 2LAOA 3FV1A 2OZZA 4KYEA 4BDRA 3V83A 3PPOA 3CFZA 5H8HA 2FYIA 4JSDA 4MLQA 1OVBA 3ECRA 4FE8A 5H8QB 4BDQA 2B3FA 1TT1A 4LATA 4H5FA 5K2XA 3FJMA 1FQFA 3K0VA 1NNFA 1FTLA 3U94A 3MAMA 4IO6A 5L9SA 3O97A 4ESXA 2THIA 3MUQA 4ND9A 1DPEA 4DZ1A 4G68B 2PMSA 5H8SA 2QRYA 3TDJA 1NH8A 2F36A 4TOZA 1US4A 4R72A 1GVCA 4EQBA 1EZOA 3MVXA 1OQGA 2GH9A 1POY1 2A5TB 2ONRA 4YB6A 3UIFA 5DVFA 2I0BA 2F78A 3G7WA 4FIMA 3FVOA 3VDFA 2V93A 4FECA 2RINA 4H8JA 5JTYA 4QFPA 5KCJA 1VSOA 2AL4A 5K2YA 3DELB 2O69A 3M8UA 4OETA 2DE2A 3KOSA 3O6HA 4JSOA 4RPOA 1VFEA 4RY1A 3KN7A 4DDDA 3FVGA 2XXXA 4IO5A 5DEXB 3FATA 2DE4A 3O2AA 2QL3A 3KN8A 4UACA 3IB2A 3W9WA 3ILTB 2NWJA 1M5FA 3UA8A 1FCKA 2I4BA 5H8FA 1IZ1A 4O3CA 3EN3A 1IQ7A 3H6WA 2OK2A 2ZMBA 1YPNA 1F9BA 4NF4A 1IITA 3MJNA 5CRYA 3U1OA 3FVNA 5FTIA 3T9HB 2D5WA 1LAXA 4PFWA 4P0GA 2XXIA 1B7UA 2OWTA 2VP1A 1RKMA 4LUBA 1B51A 1VE4A 5ICQA 1POTA 3C31A 3DLNA 1A7LA 3K6WA 3IB0A 2XD3A 3QIMA 3HV1A 3IOTA 4ZS9A 2RF1A 3SEXA 1SQYA 3BBRA 5AA1A 2QS2A 3CR9A 3VFJA 4G68C 4JWOA 3OENA 1AMFA 1LLSA 3R6UA 4QFOA 1NNPA 1CB6A 4EQ9A 1UTHA 2PX1A 3SEYA 2DXRA 4R73A 4G4PA 3G3JA 4GLIA 3B6QA 4BDLA 3O9PA 3E4RA 5EHSA 2I58A 4THIA 1ZLQA 4NF8A 1B32A 1AH5A 4NEDA 3CRBA 4P11A 4YB7A 1IXIA 1NL5A 1USYE 3MW0A 2PVUA 1MQHA 3TKDA 1ELJA 5CM6A 2QS3A 5AA2B 1SD3A 4KCDA 1URDA 2HEUA 3KZGA 1J1NA 3PUZE 4FATA 1MXXA 3FZVA 3VVFA 2XXTA 3K6XA 4NF8B 3FUZA 4ELRA 3FASA 1P1WA 2UXAA 4KYDA 2XXQA 2ZNSA 1MM7A 4EXKA 3U72A 4PQJA 1XS5A 1Y4TA 4NWDA 4IO7A 3M3KA 3K2DA 2ZYOA 3K1PA 2OCUA 3E9XA 2IEEA 3LSLA 2XXYA 4QSCA 3IK6B 4M1VA 1YTVA 3CVGA 3QSLA 3ODBA 1IIWA 1B9JA 1P99A 4F39A 3GXAA 1ZKBA 3UORA 5BWJA 5JK4A 1JEUA 2F7AA 2R6GE 1SVXB 4NE4A 4C0RA 2XX7A 5KDTA 4TLMB 5F1QA 3JYRA 3PUXE 1VR5A 4OVJA 4XIGQ 1ZJLA 5TPAA 1LCFA 3FXUA 3TUSA 1TWYA 1A8FA 1B3HA 5CBRA 1LFHA 3G3HA 4YKKA 4X48A 4U21A 4DCXA 4F19A 5CMMA 1ATGA 2ABHA 3PMWA 1MM6A 1GR2A 3W15C 4BDOA 1MXVA 3S9MC 2Y7WA 2HQ0A 3UN6A 2DWIA 4PP0A 4IGRA 1Z7NE 4LA9A 4WXJA 1S7YA 1UIVA 4GVOA 1LAHE 1NNKA 3PMVA 3QXMA 1B0HA 3H7MA 4OEVA 3EPEA 3CSBA 3OEKA 2ALUA 1ZTYA 3FD3A 4OHNA 1MXYA 3KN3A 1MDQA 3IX1A 1YAEA 4H6DA 1FQDA 3R26A 1N76A 3U92A 4LONB 2F5XA 4C1TA 3KFMA 3DP6A 3KSJA 2AL5A 1H44A 2O7IA 4G77A 1PBPA 3HHGA 4OZ9A 2V3QA 1URGA 3GBBA 4ONYA 4BLAA 3OSRA 4OESA 2ZNUA 1O7TA 4IGTA 4OFLA 3HSTA 1SI1A 1Q35A 4I8CA 3IORA 2XD2A 1MPDA 1FQAA 3RQTA 1H43A 5I58A 4F31B 1OVTA 3LSXA 1H45A 3UK4A 4R6KA 3K1MA 1II5A 3RY3A 4DCYA 2X26A 4U1OA 3MBPA 4QSEA 2HZLA 3OXNA 3PPPA 3EQ1A 3MVYA 3FXRA 2PT2A 3SEVA 1R9LA 1MY1A 3RPWA 4I1DA 3A3UA 5L9OA 1B52A 5I84A 1GGGA 2IA4A 5DVJA 4R6YA 3TEPA 4FAJA 1TFAA 1FQCA 2RC7A 1XOCA 2M8CA 2REGA 3WAEA 1LB8A 1JVYA 5ITPA 1OQHA 2Q8JA 3THIA 1MQIA 3QYTA 2VD3A 4GL8A 4OENA 4E0XA 5H8QA 1O64A 3S9NC 4Q30B 5I57A 3TYHA 3ONMA 1MPBA 1B6HA 1M5EA 1I6QA 2NOOA 1S50A 3HPIA 3LSWA 1OLAA 4FEDA 1ZU0A 5I57B 3I6VA 1EZPA 4R2BA 3LBSA 3OO7A 5TP9B 1DTGA 3O66A 2UVIA 2XXHA 4G68A 2P2AA 4OMBA 1SYIA 4RNSA 1B2HA 1A99A 1EU8A 4YKJA 4Q8RA 1FTJA 1LCTA 1OLCA 2A5TA 1YCJA 4QRZA 2O1MA 3CFLA 1P1UA 5AE4A 1NMUA 3B6WA 3F11A 3SETA 4N6PA 4U22A 2O68A 1R6ZA 4G8HA 4ELPA 1B1XA 4IO4A 3PV0E 5HPQA 1B05A 3FV2A 3FGSA 1JW1A 4ZZEA 4R75A 4GFRA 3C4MA 3O29A 4NWCA 3MZ9A 1PB9A 4F22A 4NF5B 4OEUA 1B4ZA 4POWA 4LZ5A 5DEXA 3R7XA 1IEJA 1IXGA 4F3GA 3O28A 1Y4CA 2P1SA 3KEIA 3HO7A 1SDXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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