5I6VA

Structure of f285s, a cancer-associated mutation of the oncogenic phosphatase shp2
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
523
structure length
488
Chain Sequence
b'SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPSDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Structural and Functional Consequences of Three Cancer-Associated Mutations of the Oncogenic Phosphatase SHP2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 158
structure length 488
sequence length 523
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2016-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 5i6vA03
1G7GA 1ONYA 1YTWA 2CNEA 5DC0B 3QWXX 1WAXA 2HY3A 1BKLA 3BUOB 1XA6A 4WTYA 1O47A 1C87A 2FO0A 1Q6MA 3EB1A 3HCKA 4GWFA 4XZ1A 1PXHA 1X24A 4ICZA 1M3GA 2HMHA 2BGDA 3CM3A 4S0GA 3QCNA 3MOZA 3RGOA 1BFJA 2AZRA 1UURA 1X27A 3S3EA 3GXGA 3V0IA 3HIZB 2ETZA 2DLYA 2PA5A 2Q47A 4RH9A 4FL3A 1AAXA 1LQFA 1BZHA 1ZCLA 4JEGA 2B49A 1ONZA 2J16B 2I6OA 2NLKA 3V0GA 1G7FA 3AWEA 3QWYA 1YGRA 3MAZA 3TKZA 4KYQA 3ZMQA 2CNIA 1R1PA 5CDWA 1FU6A 2XP1A 2CIAA 2A3KA 1LYVA 1FU5A 2K79B 1OO4A 3QCCA 4U1PA 4GL9E 1NRVA 2CMAA 1OPLA 2QCJA 4JE4A 5HDEA 1NWEA 2CS0A 3OB1B 3S8LA 4XZ0A 3I7ZA 2DLZA 3F9AA 1GRIA 1BFIA 3D1HA 1LUKA 1U24A 2I4HA 3RZ2A 5KA0A 3RO1A 1KSWA 4WWQA 2EYYA 2G59A 1FPRA 3BUWB 3F41A 4L1BB 1C83A 2OOQA 2CM7A 2MRKA 2QBRA 4I8NA 1B47A 3CXLA 4TVVA 4ZN5A 2P4DA 2CMBA 1X0NA 2AHSA 1AOTF 3GXXA 2PNAA 1SPRA 3PJPA 2VEXA 1BHHA 3IMJA 2VEVA 3S3FA 4BPCA 4K44A 4F5BA 1LUIA 3BRHA 2MK2A 2B4PA 2ABLA 1Q6JA 2AOAA 3ZM0A 4BJOA 2DVJA 2Q05A 1PH0A 2OZOA 1A09A 5KA7A 1O4MA 2BBUA 2F70A 1AYAA 2EL8A 1IS0A 1O4HA 4QAPA 2HC1A 3C7IA 1FQ1A 1FBZA 5KAZA 1SKJA 1O42A 4GE2A 3OV1A 2FCIA 5DC9A 3QCFA 3D42A 2YDUA 4MBBA 5EHRA 1I3ZA 4HRFA 1AYDA 1IJRA 1XBOA 1D4WA 4WOHA 2FJNA 4D8KA 2RMXA 1C88A 5BZXA 2GP0A 4Y14A 1T48A 2EKXA 1LCJA 2MC1A 3MXCA 1I9TA 2HNPA 2DX0A 1WCHA 3EMUA 4D3RA 1OEOX 2I5XA 4Z6BA 3S4OA 1C86A 4GFUA 2I6MA 1HCTB 1R6HA 3A5JA 1A1BA 2B4UA 5KAAA 4A4BA 3O4UA 1NZVA 3VRQA 3N8MA 3VS5A 1A81A 2C0IA 1G4WR 4GS0A 2H46E 4RH5A 4IKCA 3EAXA 4U17A 3CWEA 2MBCA 3ZM2A 5EG3B 2OC3A 1BLKA 1Q1MA 4OHIA 1BZCA 2CNGA 1O4QA 2C46A 4ROJA 4JBCA 1OEVA 1O4BA 3IN7A 2CI9A 1OHCA 3PSKA 1A1AA 2BIJA 3NMEA 1LUNA 1PA1A 1NL9A 1O4DA 2QCTA 2EYVA 1I9SA 5KADA 2ECDA 4WU2A 3ZV2A 1SHBA 2GE9A 2PT0A 4TZIA 3VRPA 2HB1A 3K2MA 4YAAA 2K7AB 1EENA 1AYCA 2CM2A 4E93A 3VS3A 5EEQA 2B4OA 2L4KA 3F99A 2BGEA 2CI8A 1LKKA 2IUHA 1Y1UA 4QUMA 5BX1A 3GQIB 3VS7A 2DXPA 1HCSB 4R30A 3V0HA 4JGHA 1BMBA 1KA6A 2C0OA 3D1QA 4PVGA 2LQWA 5BUGA 1L8KA 2LNXA 1X6CA 4NWFA 1PTUA 1YTNA 4RKKA 2HNQA 1G1HA 5K22A 1SHDA 2DCRA 2B3OA 1YPTA 1O4FA 5K24A 2IZVA 2CM3A 3QCHA 1GHUA 2VIFA 1KAVA 1M27A 3EACA 4NX8A 1BHFA 2HCMA 2RORA 1CSYA 2B07A 5D0JA 2BZLA 2QEPA 3V0JA 5K25A 2EO3A 2HCKA 3VRYA 4HJPA 3PSJA 3UYOA 1RXDA 4GE6A 3S8OA 2PTKA 2OQ1A 2VEUA 3QCEA 4ERCA 3OLRA 2CRHA 4JMKA 1MW4A 5BO4A 1FPZA 1Y57A 4DGXA 1YTSA 1YN9A 1LARA 2B4SA 3EAZA 3BUXB 4GFVA 5KA4A 1QADA 1RJAA 5I6VA 2HXPA 5J3XA 1O4IA 4ZI4A 2ESBA 3BLTA 3VS2A 2QBPA 3O5XA 1VHRA 4H1OA 2VEYA 2C7SA 2H04A 3MXYA 1MKPA 2F6ZA 1XXVA 4PYHA 3S3HA 2MRJA 2F6TA 1ECVA 2KNOA 1O4NA 2F6VA 4K2RA 1AD5A 1R1QA 1BKMA 1BHHB 1O4OA 3M7FA 3H2XA 3ZMPA 4P9VA 1O4RA 1J4XA 3D1OA 3N0AA 5IBMA 2CNFA 2I6PA 5EHPA 1O4CA 2PSZA 2NT7A 3HHMB 5KABA 2F6FA 5DF6A 1O4EA 2G6ZA 1TCEA 3MMJA 4P9ZA 4J51A 2I4GA 2CR4A 2F6WA 4JMJA 1O4JA 1JLNA 5MMZB 5K9WA 1V3AA 1O43A 1ZC0A 1ZCKA 2CMCA 1A08A 4D3QA 4EIHA 1YVHA 1JU5A 3UF4A 1YGUA 4A4CA 4LUEA 3VRZA 1SPSA 1OEMX 5HKZA 5K23A 1BF5A 4E68A 2Y2FA 4GRZA 3PS5A 1D4TA 2CBLA 1FYRA 3N84A 1D5RA 2PLDA 3IN8A 1ZFPE 3IMDA 3CD3A 1SHAA 3KFJA 1PTYA 4EY0A 2PBNA 3N7YA 1K9AA 1GFYA 2I42A 3MOWA 4AZ1A 5BZZA 1CSZA 1EEOA 4OHLA 1A1CA 3VRRA 1R1SA 1KA7A 4RHGA 3T04A 1JYUA 3ZM3A 1JYRA 1LCKA 5GJHA 2JJDA 4B04A 3SR9A 1QG1E 2E0TA 2PI7A 1RPMA 4WU3A 2QDCA 5LXQB 2KK6A 4NYHA 1O4GA 2Y1MA 1H9OA 2FH7A 2GJTA 3VS0A 3GXHA 2QBQA 2RSYA 5M43A 1YVLA 1O4AA 2GSBA 3PQZA 4GE5A 1AYBA 4RI5A 4RI4A 1UUSA 2I3UA 3QCBA 2LQNA 1AOUF 1LKLA 5AXIA 5EELA 3WA4A 1KC2A 1O44A 4LUDA 5KA3A 2EOBA 1LUMA 1AB2A 2Y1NA 1WQUA 1NWLA 3S3KA 4K45A 3LJ8A 2HDVA 4NWGA 4DGPA 1O4PA 3QCDA 2HUWA 1XRIA 2NTAA 1YZ4A 1OETA 3F9BA 2J16A 4OHEA 1O48A 3VRNA 1O4KA 1Z3KA 2PNBA 3AWFA 4KI9A 2H02A 1A1EA 2LCTA 1JWOA 2HC2A 1F2FA 3A5KA 4GRYA 4HJQA 3BM8A 4X6SA 3EZZA 2AOBA 2DM0A 3QCLA 3BKBA 4D3PA 3QKQA 5KA9A 1JF7A 3US4A 2Y3AB 3TL0A 1PYNA 1KAKA 1QZ0A 3PFVA 3QCJA 3S4EA 5KA8A 1QXKA 2AUGA 2I6JA 3V0EA 2CJZA 4FBNA 2L3TA 3I36A 5GJIA 1A07A 1FHSA 3OP0A 2LNWA 3CWGA 1BG1A 1BLJA 2QBSA 3SMEA 4FL2A 2WGPA 2RVFA 2PQ5A 5KA1A 2IUIA 4M4ZA 1Q6NA 1C84A 1G1FA 2R0BA 2C0TA 3U96A 1L8GA 1P13A 1OO3A 1YFOA 1SUGA 2F71A 2BV5A 1F1WA 2H4GA 1G83A 3OB2B 1CWDL 3OVEA 1TZEE 2GWOA 1Q6TA 2NV5A 5AWXA 2IUGA 3AWGA 3V0DA 1O45A 3V0FA 3S9KA 2QMSA 2OUDA 1XXPA 3VS6A 2P6XA 5AULA 1M61A 3S8NA 2L6KA 2EO6A 1OHEA 3QCMA 1NZ7A 2OZ5A 4QAHA 2I4EA 5DC4A 2HDXA 2I6IA 3ZM1A 3O4TA 2EU0A 1C85A 3F81A 4QBWA 1RQQC 2I75A 3QCIA 4NNDA 2H4KA 1YWFA 4QSYA 3VS1A 3EU0A 2A8BA 2VEWA 2YU7A 1NNYA 1G1GA 1QCFA 3D44A 2MQIA 2Y96A 4QUNA 2JYQA 4H34A 1WRMA 2YSXA 1P15A 1PTVA 3VS4A 2ZMMA 1A5YA 1ZZWA 2J17A 2F6YA 4OHDA 2IMGA 4OHHA 3CBLA 4GPLB 1I57A 1T49A 1U25A 2FJMA 2QDPA 1FMKA 1MILA 1T4JA 1GWZA 1O41A 2CFVA 3BUMB 2H03A 5J8RA 2H8HA 1O49A 1RPYA 1PICA 3PLFB 1BZJA 4R0SA 1PTTA 5HKWA 2NZ6A 2SRCA 3QCKA 2H5KA 2H4VA 3O3LA 5GTJA 1PA9A 3QCGA 1XM2A 3GXWA 1G4US 1JYQA 3BUNB 1O4LA 3VROA 3D9CA 2I1YA 1BM2A 2C9WA 1OPKA 2ZN7A 4F59A 4YR8B 3NHNA 2CM8A 2PLEA 3M4UA 1Q6SA 1FBVA 1U26A 4R0TA 2I3RA 3ZNIA 4KYRA 4K11A 5KACA 1NO6A 2HVLA 4QBEA 5KA2A 2SHPA 1NZLA 2M3VA 1D1ZA 2CNHA 2EYZA 1Q6PA 3OMHA 1CJ1A 1O46A 1OESA 3O4SA 4RDDA 4ZRTA 4F5AA 2F46A 3I80A 4JNBA 5IBSA 1CWEA 2QDMA 3VGOA 3QKPA 4Y2EA 2RF6A 3RGQA 5HKYA 5K9VA 2NT2A 3B7OA 1OEUA 1OHDA 3BLUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G7GA 1ONYA 1YTWA 2CNEA 5DC0B 3QWXX 1WAXA 2HY3A 4HV4A 1BKLA 3BUOB 1XA6A 4WTYA 1O47A 1C87A 2FO0A 1Q6MA 3EB1A 3HCKA 4GWFA 4XZ1A 1PXHA 1X24A 4ICZA 1M3GA 2HMHA 2BGDA 3CM3A 4S0GA 3QCNA 3MOZA 3RGOA 2GC5A 1BFJA 2AZRA 1UURA 1X27A 3S3EA 3GXGA 3V0IA 3HIZB 2ETZA 2DLYA 2PA5A 2Q47A 4RH9A 4FL3A 1AAXA 1LQFA 1BZHA 1ZCLA 4JEGA 2B49A 1ONZA 2J16B 2I6OA 2NLKA 3V0GA 1G7FA 3AWEA 3QWYA 1YGRA 3MAZA 3TKZA 4KYQA 3ZMQA 2CNIA 1R1PA 5CDWA 1FU6A 2XP1A 2CIAA 2A3KA 1LYVA 1FU5A 2K79B 1OO4A 3QCCA 4U1PA 4GL9E 1NRVA 2CMAA 1OPLA 2QCJA 1EEHA 4JE4A 5HDEA 1NWEA 2CS0A 3OB1B 3S8LA 2VORA 4XZ0A 3I7ZA 2DLZA 3F9AA 1GRIA 1BFIA 3D1HA 1E8CA 1LUKA 1U24A 2I4HA 3RZ2A 5KA0A 1FGSA 3RO1A 1KSWA 4WWQA 2Y68A 2EYYA 2G59A 1FPRA 3BUWB 2GCAA 3F41A 4L1BB 1C83A 2OOQA 2CM7A 2MRKA 2QBRA 2WTZA 4I8NA 1B47A 3CXLA 4TVVA 4ZN5A 2P4DA 2CMBA 1X0NA 2AHSA 1AOTF 3GXXA 2PNAA 1SPRA 3PJPA 2VEXA 1BHHA 3IMJA 2VEVA 3S3FA 4BPCA 4K44A 4F5BA 1LUIA 3BRHA 2MK2A 2B4PA 2ABLA 1Q6JA 2AOAA 3ZM0A 4BJOA 2DVJA 2Q05A 1PH0A 2OZOA 1A09A 2AM2A 5KA7A 1O4MA 2BBUA 2F70A 1AYAA 2EL8A 1IS0A 1O4HA 4QAPA 2HC1A 3C7IA 1FQ1A 1FBZA 5KAZA 1SKJA 1O42A 4GE2A 3OV1A 2FCIA 5DC9A 3QCFA 3D42A 2YDUA 4MBBA 3QCZA 5EHRA 2UAGA 3MVNA 1I3ZA 4HRFA 1AYDA 1IJRA 1XBOA 1D4WA 4WOHA 2FJNA 4D8KA 2RMXA 1C88A 1GQYA 5BZXA 2GP0A 4Y14A 1T48A 2EKXA 1LCJA 2MC1A 3MXCA 1I9TA 2HNPA 2DX0A 1WCHA 3EMUA 4D3RA 1OEOX 2I5XA 2Y1OA 4Z6BA 3S4OA 1C86A 4GFUA 2I6MA 2WJPA 1HCTB 1R6HA 3A5JA 1A1BA 2B4UA 5KAAA 4A4BA 3O4UA 1NZVA 3VRQA 1GQQA 3N8MA 3VS5A 1A81A 2C0IA 1G4WR 4GS0A 2H46E 4RH5A 4IKCA 3EAXA 4U17A 3CWEA 2MBCA 3ZM2A 5EG3B 2OC3A 1BLKA 1Q1MA 3K2TA 4OHIA 1BZCA 2CNGA 1O4QA 2C46A 4ROJA 4JBCA 1OEVA 1O4BA 3IN7A 2CI9A 1OHCA 3PSKA 1A1AA 2BIJA 3NMEA 1LUNA 1PA1A 1NL9A 1O4DA 2QCTA 2EYVA 1I9SA 5KADA 2ECDA 4WU2A 3ZV2A 1SHBA 2GE9A 2PT0A 4TZIA 3VRPA 2HB1A 3K2MA 4YAAA 2K7AB 1EENA 2X5OA 1AYCA 2CM2A 4E93A 3VS3A 5EEQA 2B4OA 2L4KA 3F99A 2BGEA 2CI8A 1LKKA 2IUHA 1Y1UA 4QUMA 5BX1A 3GQIB 3VS7A 2DXPA 1HCSB 4R30A 3V0HA 4JGHA 1BMBA 1KA6A 2C0OA 3D1QA 4PVGA 2LQWA 5BUGA 1L8KA 2LNXA 1X6CA 4NWFA 1PTUA 1YTNA 3ZM5A 4RKKA 2HNQA 1G1HA 5K22A 1SHDA 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 1CJ1 A;  1O46 A;  1OES A;  3O4S A;  4RDD A;  4ZRT A;  4F5A A;  2F46 A;  3I80 A;  4JNB A;  5IBS A;  1CWE A;  2QDM A;  3VGO A;  3QKP A;  4Y2E A;  2RF6 A;  3RGQ A;  5HKY A;  5K9V A;  2NT2 A;  3B7O A;  1OEU A;  1OHD A;  3BLU A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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