5IGLA

Crystal structure of the second bromodomain of human taf1l in complex with bromosporine (bsp)
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
139
structure length
139
Chain Sequence
LGTENLYFQSMQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKMIVNPVDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNICYQTITEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Promiscuous targeting of bromodomains by bromosporine identifies BET proteins as master regulators of primary transcription response in leukemia.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transcription initiation factor TFIID subunit 1-like
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 56
structure length 139
sequence length 139
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5iglA00
1EQFA 4HXRA 5D3TA 4QSWA 2D9EA 5CP5A 4UIZA 5C4QA 4CURA 5L99A 3MB4A 4J0SA 5E3GA 2YW5A 4HBYA 5A5QA 5A81A 5FH6A 5A85A 3TLPA 5EGUA 3LXJA 5CY9A 5CQ6A 4FLPA 5E73A 4TT2A 5CRZA 2GRCA 2DVRA 5ENJA 4J1PA 5D24A 4A9FA 4KV1A 5A7CA 4NR5A 4O7FA 5D25A 5FFWA 3P1CA 4QC3A 4LZRA 5CPEA 4IOOA 4LYIA 3SVGA 5EI4A 5AD3A 4OGIA 4HXLA 3O36A 2OSSA 2L84A 5CZGA 4TU6A 5CTLA 5D3NA 5AMEA 3LQHA 4HBVA 4NRAA 5DFDA 5G4RA 4CL9A 5JI8A 2RI7A 2DKWA 3O33A 4O77A 5CQAA 5EP7A 5ENBA 4UIWA 1F68A 4IR3A 5EICA 4YH3A 5E9IA 5CQ5A 4N4FA 2YELA 4ZQLA 3HMEA 3P5OA 2DVSA 5AMFA 5DKCA 4NYWA 5FE4A 2WP2A 4O75A 2YEMA 4YYGA 3UVWA 2YQDA 5L96A 5A82A 5I7XA 4A9IA 4QYDA 4QSTA 4O72A 4IR4A 5F61A 2R0YA 5F36A 5TCMA 4LZ2A 4QSUA 4QEVA 5EV9A 5EM3A 4PTBA 4QB3A 4O70A 5F62A 1N72A 5DKHA 5E3DA 5EU1A 4YYHA 5D7XA 4NR4A 5CUCA 5FDZA 5HQ7A 4TTEA 5I89A 4A9EA 5D26A 4TZ2A 3S92A 4MR5A 3U5LA 5I88A 4UIVA 4QSSA 4YC9A 2R10A 3QZSA 1JM4B 4O76A 5ENEA 2E7OA 4NYVA 3U5NA 5CUDA 4CUTA 5DYXA 5C89A 2RFJA 4XYAA 4WIVA 4Q0NA 4O7AA 4ALGA 4YYJA 5IIDA 5CQ3A 5DYAA 4HXMA 4YYKA 5FE2A 4UYEA 2OO1A 4A9LA 5DLZA 4Z6HA 5G4SA 5EA1A 5EWDA 5L98A 4HXKA 5FE1A 5KO4A 5BT3A 4YYIA 2DVVA 4QUTA 4QC1A 4UITA 5CGPA 5A5SA 5BT4A 4C67A 3K2JA 2I7KA 2MJVB 2RO1A 2D82A 5IG6A 5LKXA 4X2IA 1WUMA 5KHMA 4TZ8A 5A83A 3MQMA 5ENFA 4LR6A 5D3LA 3ZYUA 4MEQA 3U5MA 2H60A 5H1UA 5CS8A 5BT5A 5CRMA 4PKLA 5I80A 5IGNA 4A9OA 5DW1A 5II1A 3JVMA 4QY4A 5DLXA 4PCIA 3UV5A 5E0RA 4BHWA 2F6JA 3P1DA 4UIUA 5E9MA 5A5RA 4J0RA 4KCXA 5CU8A 4WHUA 4O7EA 4BW4A 4NUCA 4N4GA 4PCEA 4C66A 5CUEA 3Q2FA 4IR6A 4LZSA 4TYLA 5IGLA 4O71A 4BW3A 4Q0OA 4O7BA 5ETBA 4A9KA 3UVXA 5I40A 5ENGA 4UIYA 3UVDA 5H1TA 4CUQA 5LJ2A 4AKNA 4HBXA 4J3IA 4XUAA 3U5PA 5EQ1A 5C85A 4CLBA 5EPBA 3IU5A 5HRVA 4IORA 4IOQA 5LKZA 4YABA 3NXBA 1JSPB 4XY8A 4OUFA 4YATA 5EPSA 4UYDA 3MULA 4TQNA 1WUGA 4LDFA 4YBTA 4KV4A 4N3WA 5E74A 5C87A 4ZC9A 4NXJA 4QNSA 5ENIA 5HCLA 5E9LA 4QBMA 4UYFA 5E9KA 2WP1A 4LRGA 1ZS5A 5LVQA 5A5NA 3LQJA 4TU4A 3RCWA 5COIA 5HELA 4UYHA 5H85A 4NQNA 5FG4A 2R0VA 4F3IA 2KTBB 5D3SA 4A9NA 4HXNA 4HXPA 4MR3A 5HFQA 4CFKA 3G0LA 4A9JA 5L97A 3UV4A 5HRWA 3SVFA 5A5PA 4BJXA 5I83A 2R0SA 5FH7A 3MB3A 5CQ4A 4QSRA 5KTUA 4LYSA 4O7CA 5LJ1A 5LKTA 5DKDA 5K29A 5HJCA 2DWWA 5FE3A 4GPJA 2YEKA 5LUUA 4QEUA 4QR3A 5DFBA 5HFRA 3HMFA 4HXOA 5KTXA 3UV2A 4NUDA 2RS9B 4QR4A 2DATA 4NR6A 5EWCA 3I3JA 5ENHA 3SVHA 5C7NA 5CQ8A 4YADA 5HEMA 3GG3A 5DBMA 4XUBA 5F3AA 5HRXA 4HBWA 4MEOA 4CFLA 4NS5A 3O34A 2NXBA 4NR7A 4YYMA 4MR4A 5D0CA 3G0JA 1E6IA 3S91A 4Z1SA 5EPRA 2L85A 5FE9A 5FBXA 3QZTA 5IGMA 4YAXA 5EWHA 3P1FA 5FH8A 5IGKA 5ACYA 1X0JA 5LVRA 4RVRA 5FE6A 4O74A 4E96A 5AD2A 5JWMA 5F5ZA 5EISA 5ETDA 2LSPB 4Z6IA 4YY6A 4YY4A 4UIXA 4O78A 5KTWA 4MEPA 2YDWA 3DWYA 4CUPA 5DYUA 3O35A 3ONIA 4UYGA 4YK0A 4XY9A 5E9VA 4N4HA 5HENA 5DFCA 4NR8A 2N9GA 5F63A 4DONA 4LC2A 3FKMX 5C8GA 3JVKA 2E7NA 5D3HA 5LKUA 4QSPA 4TT4A 5EK9A 4NQMA 4YBSA 5A5OA 2G4AA 4NR9A 4NYXA 4A9HA 2RNYA 3LJWA 4IR5A 2OUOA 4PS5A 5E7DA 5L8TA 4HXSA 5II2A 4TT6A 4QSVA 5EVAA 5DYCA 3AADA 3U5JA 5EWWA 5FE7A 4QSQA 5CUAA 4QSXA 3Q2EA 3AQAA 4Z93A 5IBNA 3UW9A 3U5OA 3QZVA 4YYNA 3P1EA 5D3JA 5FG5A 5TB6A 4UYFB 4MENA 3IU6A 5F1LA 5FB0A 3JVLA 4YH4A 2L5EA 5HM0A 5ENCA 3DAIA 3JVJA 2RNWA 5LJ0A 4N4IA 5DY7A 5H1VA 4NUEA 4MR6A 4CUUA 2F6NA 5HQ6A 4BW2A 5F2PA 3MUKA 4Z1QA 5CQ7A 3O37A 5D3PA 4A9MA 4CUSA 3D7CA 4PY6A 5FE0A 5J0DA 5FB1A 2FSAA 5I86A 5E9YA 5CUGA 5I7YA 5D3RA 3LQIA 5I29A 5CQTA 3UVYA 2I8NA 5FFVA 4YYDA 2RNXA 4NRCA 5I1QA 4WHWA 2YYNA 5KU3A 2DVQA 5HLSA 4TS8A 5FFYA 4QEWA 4QUUA 4OGJA 3U5KA 5L8UA 4LYWA 5CUBA 5DX4A 5HQ5A 5FG6A 5FE8A 5F60A 5F1HA 4QZSA 4Y03A 5EWVA 4QYLA 5DW2A 4BW1A 4ZW1A 5CFWA 4ALHA 5FE5A 4NRBA 4QR5A 5F25A 3HMHA 2E3KA 3MXFA 4YBMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EQFA 4HXRA 5D3TA 4QSWA 2D9EA 5CP5A 4UIZA 5C4QA 4CURA 5L99A 3MB4A 4J0SA 5E3GA 2YW5A 4HBYA 5A5QA 5A81A 5FH6A 5A85A 3TLPA 5EGUA 3LXJA 5CY9A 5CQ6A 4FLPA 5E73A 4TT2A 5CRZA 2GRCA 2DVRA 5ENJA 4J1PA 5D24A 4A9FA 4KV1A 5A7CA 4NR5A 4O7FA 5D25A 5FFWA 3P1CA 4QC3A 4LZRA 5CPEA 4IOOA 4LYIA 3SVGA 5EI4A 1ZKRA 5AD3A 4OGIA 4HXLA 3O36A 2OSSA 2L84A 5CZGA 4TU6A 5CTLA 5D3NA 5AMEA 3LQHA 4HBVA 4NRAA 1PUOA 5DFDA 5G4RA 4CL9A 5JI8A 2RI7A 2DKWA 3O33A 4O77A 5CQAA 5EP7A 5ENBA 4UIWA 1F68A 4IR3A 5EICA 4YH3A 5E9IA 3D1DA 5CQ5A 4N4FA 2YELA 4ZQLA 3HMEA 3P5OA 2DVSA 5AMFA 5DKCA 4NYWA 5FE4A 2WP2A 4O75A 2YEMA 4YYGA 3UVWA 2YQDA 5L96A 5A82A 5I7XA 4A9IA 4QYDA 4QSTA 4O72A 4IR4A 5F61A 2R0YA 5F36A 5TCMA 4LZ2A 4QSUA 4QEVA 5EV9A 5EM3A 4PTBA 4QB3A 4O70A 5F62A 1N72A 5DKHA 5E3DA 5EU1A 4YYHA 5D7XA 4NR4A 5CUCA 5FDZA 5HQ7A 4TTEA 5I89A 4A9EA 5D26A 4TZ2A 3S92A 4MR5A 3U5LA 5I88A 4UIVA 4QSSA 4YC9A 2R10A 3QZSA 1JM4B 4O76A 5ENEA 2E7OA 4NYVA 3U5NA 5CUDA 4CUTA 5DYXA 4AKHA 5C89A 2RFJA 4XYAA 4WIVA 4Q0NA 4O7AA 4ALGA 4YYJA 5IIDA 5CQ3A 5DYAA 4HXMA 4YYKA 5FE2A 4UYEA 2OO1A 4A9LA 5DLZA 4Z6HA 5G4SA 5EA1A 5EWDA 5L98A 4HXKA 5FE1A 5KO4A 5BT3A 4YYIA 2DVVA 4QUTA 2EJNA 4QC1A 4UITA 5CGPA 5A5SA 5BT4A 4C67A 3K2JA 2I7KA 2MJVB 2RO1A 2D82A 5IG6A 5LKXA 4X2IA 1WUMA 5KHMA 4TZ8A 5A83A 3MQMA 3ERRA 5ENFA 4LR6A 5D3LA 3ZYUA 4MEQA 3U5MA 2H60A 5H1UA 5CS8A 5BT5A 5CRMA 4PKLA 5I80A 5IGNA 4A9OA 5DW1A 5II1A 3JVMA 4QY4A 5DLXA 4PCIA 3UV5A 5E0RA 4BHWA 2F6JA 3P1DA 4UIUA 5E9MA 5A5RA 4AI6A 4J0RA 4KCXA 5CU8A 4WHUA 4O7EA 4BW4A 4NUCA 4N4GA 4PCEA 4C66A 5CUEA 3Q2FA 4IR6A 4LZSA 4TYLA 5IGLA 4O71A 4BW3A 4Q0OA 4O7BA 5ETBA 4A9KA 3UVXA 5I40A 5ENGA 4UIYA 3UVDA 5H1TA 4CUQA 5LJ2A 4AKNA 4HBXA 4J3IA 4XUAA 3U5PA 5EQ1A 5C85A 4CLBA 5EPBA 3IU5A 5HRVA 4IORA 4IOQA 5LKZA 4YABA 3NXBA 1JSPB 4XY8A 4OUFA 4YATA 5EPSA 4UYDA 3MULA 4TQNA 3D1BA 1WUGA 4LDFA 4YBTA 4KV4A 4N3WA 5E74A 5C87A 4ZC9A 4NXJA 4QNSA 4AKIA 5ENIA 5HCLA 5E9LA 4QBMA 4UYFA 5E9KA 2WP1A 4LRGA 1ZS5A 5LVQA 5A5NA 3LQJA 4TU4A 3RCWA 5COIA 5HELA 4UYHA 5H85A 4NQNA 5FG4A 2R0VA 4F3IA 2KTBB 5D3SA 4A9NA 4HXNA 4HXPA 4MR3A 5HFQA 4CFKA 3G0LA 4A9JA 5L97A 3UV4A 5HRWA 3SVFA 5A5PA 4BJXA 5I83A 2R0SA 5FH7A 3MB3A 5CQ4A 4QSRA 5KTUA 4LYSA 4O7CA 5LJ1A 5LKTA 5DKDA 5K29A 5HJCA 2DWWA 5FE3A 4GPJA 2YEKA 5LUUA 4QEUA 4QR3A 5DFBA 5HFRA 3HMFA 4HXOA 5KTXA 3UV2A 4NUDA 2RS9B 4QR4A 2DATA 4NR6A 5EWCA 3I3JA 5ENHA 3SVHA 5C7NA 5CQ8A 4YADA 5HEMA 3GG3A 5DBMA 4XUBA 5F3AA 5HRXA 4HBWA 4MEOA 4CFLA 4NS5A 3O34A 2NXBA 4NR7A 4YYMA 4MR4A 5D0CA 3G0JA 1E6IA 3S91A 4Z1SA 5EPRA 2L85A 5FE9A 5FBXA 3QZTA 5IGMA 4YAXA 5EWHA 3P1FA 5FH8A 5IGKA 5ACYA 1X0JA 5LVRA 4RVRA 5FE6A 4O74A 4E96A 5AD2A 3VKGA 5JWMA 5F5ZA 5EISA 5ETDA 2LSPB 4Z6IA 4YY6A 4YY4A 4UIXA 4O78A 5KTWA 4MEPA 2YDWA 3DWYA 4CUPA 5DYUA 3O35A 3ONIA 4UYGA 4YK0A 4XY9A 5E9VA 4N4HA 5HENA 5DFCA 4NR8A 2N9GA 5F63A 4DONA 3VKHA 4LC2A 3FKMX 5C8GA 3JVKA 2E7NA 5D3HA 5LKUA 4QSPA 4TT4A 5EK9A 4NQMA 4YBSA 5A5OA 2G4AA 4NR9A 4NYXA 4A9HA 2RNYA 3LJWA 4IR5A 2OUOA 4PS5A 5E7DA 5L8TA 4HXSA 5II2A 4TT6A 4QSVA 5EVAA 5DYCA 3AADA 3U5JA 5EWWA 5FE7A 4QSQA 5CUAA 4QSXA 3Q2EA 3AQAA 4Z93A 5IBNA 3UW9A 3U5OA 3QZVA 4YYNA 3P1EA 5D3JA 5FG5A 5TB6A 4UYFB 4MENA 3IU6A 5F1LA 5FB0A 3JVLA 4YH4A 2L5EA 5HM0A 5ENCA 3DAIA 3JVJA 2RNWA 5LJ0A 4N4IA 5DY7A 5H1VA 4NUEA 4MR6A 4CUUA 2F6NA 5HQ6A 4BW2A 5F2PA 3MUKA 4Z1QA 5CQ7A 3O37A 5D3PA 4A9MA 4CUSA 3D7CA 4PY6A 5FE0A 5J0DA 5FB1A 2FSAA 5I86A 5E9YA 5CUGA 5I7YA 5D3RA 3LQIA 5I29A 5CQTA 3UVYA 2I8NA 5FFVA 4YYDA 2RNXA 4NRCA 5I1QA 4WHWA 2YYNA 5KU3A 2DVQA 5HLSA 4TS8A 5FFYA 4AKGA 4QEWA 4QUUA 4OGJA 3U5KA 5L8UA 4LYWA 5CUBA 5DX4A 5HQ5A 5FG6A 5FE8A 5F60A 5F1HA 4QZSA 4Y03A 5EWVA 4QYLA 5DW2A 4BW1A 4ZW1A 5CFWA 4ALHA 5FE5A 4NRBA 4QR5A 5F25A 3HMHA 2E3KA 3MXFA 4YBMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 1EQF A;  4HXR A;  5D3T A;  4QSW A;  2D9E A;  5CP5 A;  4UIZ A;  5C4Q A;  4CUR A;  5L99 A;  3MB4 A;  4J0S A;  5E3G A;  2YW5 A;  4HBY A;  5A5Q A;  5A81 A;  5FH6 A;  5A85 A;  3TLP A;  5EGU A;  3LXJ A;  5CY9 A;  5CQ6 A;  4FLP A;  5E73 A;  4TT2 A;  5CRZ A;  2GRC A;  2DVR A;  5ENJ A;  4J1P A;  5D24 A;  4A9F A;  4KV1 A;  5A7C A;  4NR5 A;  4O7F A;  5D25 A;  5FFW A;  3P1C A;  4QC3 A;  4LZR A;  5CPE A;  4IOO A;  4LYI A;  3SVG A;  5EI4 A;  5AD3 A;  4OGI A;  4HXL A;  3O36 A;  2OSS A;  2L84 A;  5CZG A;  4TU6 A;  5CTL A;  5D3N A;  5AME A;  3LQH A;  4HBV A;  4NRA A;  5DFD A;  5G4R A;  4CL9 A;  5JI8 A;  2RI7 A;  2DKW A;  3O33 A;  4O77 A;  5CQA A;  5EP7 A;  5ENB A;  4UIW A;  1F68 A;  4IR3 A;  5EIC A;  4YH3 A;  5E9I A;  5CQ5 A;  4N4F A;  2YEL A;  4ZQL A;  3HME A;  3P5O A;  2DVS A;  5AMF A;  5DKC A;  4NYW A;  5FE4 A;  2WP2 A;  4O75 A;  2YEM A;  4YYG A;  3UVW A;  2YQD A;  5L96 A;  5A82 A;  5I7X A;  4A9I A;  4QYD A;  4QST A;  4O72 A;  4IR4 A;  5F61 A;  2R0Y A;  5F36 A;  5TCM A;  4LZ2 A;  4QSU A;  4QEV A;  5EV9 A; 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