The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
b'AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Binding Mechanism of the N-Terminal SH3 Domain of CrkII and Proline-Rich Motifs in cAbl.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
10
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ABL A; 1M3A A; 2JM8 A; 3KFV A; 1LCK A; 2EYX A; 2BTT A; 1GCP A; 2CT4 A; 3CQT A; 1BB9 A; 1QCF A; 1MV3 A; 3SHW A; 3VS7 A; 3C0C A; 2X3W D; 1B07 A; 1K4U S; 3VS6 A; 3I5R A; 2CH4 W; 1JQQ A; 1WFW A; 1X27 A; 3VS4 A; 2PTK A; 1YCS B; 1V1C A; 2RQW A; 2FO0 A; 1AVZ C; 4J9B A; 3M0S A; 3NPF A; 4HVV A; 1NYG A; 1B3Q A; 1GFC A; 1KSW A; 3A98 A; 2O9V A; 1AZE A; 2PNI A; 2ESW A; 2OI3 A; 1OPK A; 2GNC A; 1QWF A; 4IIO A; 4JJD A; 1SSH A; 2D1X A; 2HDA A; 4OMO A; 4E6R A; 2FPE A; 3RBB B; 4AFQ C; 2LNH B; 4RTV A; 4CC7 A; 1GBQ A; 1SHF A; 4J9E A; 1HJD A; 3PVL A; 1TG0 A; 1QWE A; 3EGU A; 2DMO A; 4Z89 A; 4Z8A A; 1WIE A; 3NMZ C; 1BU1 A; 2KRN A; 1WI7 A; 1KFZ A; 2KR3 A; 2AKL A; 3M0T A; 4D8D A; 2FG0 A; 2YDL A; 1MUZ A; 2EVR A; 5IH2 A; 1WA7 A; 2J05 A; 2JS2 A; 3UA7 A; 2LCS A; 1SHG A; 5IHN A; 2KRO A; 2CRE A; 1MV0 B; 2FPF A; 1YNZ A; 1ZUK A; 2DL3 A; 1Z9Z A; 4J9D A; 2DYB A; 2LJ3 A; 4GLM A; 2G6F X; 2DRK A; 3NGP A; 5I11 A; 2MOX A; 2VKN A; 2HEQ A; 1N5Z A; 1AWO A; 2GQI A; 1AD5 A; 1T0H A; 4WCI A; 2GTO A; 1T0J A; 4AFS C; 2ROL A; 5L23 A; 1RLP C; 2D8H A; 1GRI A; 2L3Q A; 2X3X D; 2O31 A; 1JO8 A; 1UJ0 A; 1ABO A; 2ED1 A; 2JMA A; 2K2M A; 3I5S A; 5IHI A; 3UF4 A; 1WXT A; 1SEM A; 2YT6 A; 4RTX A; 4HVW A; 1ZSG A; 2EYW A; 2LJ1 A; 3EHR A; 1JU5 C; 2EW3 A; 2K79 A; 1SPK A; 1AZG B; 1X43 A; 1M3C A; 1T3S A; 4F16 A; 1UG1 A; 1FMK A; 1JEG A; 2KT8 A; 1UJY A; 4ZNX A; 2SRC A; 1Z9Q A; 2K9G A; 2NUZ A; 3FJ5 A; 1S1N A; 4LN2 A; 3M0R A; 2LQN A; 2JMC A; 4OMM A; 1QKX A; 1I1J A; 2EGE A; 1OPL A; 1OOT A; 2M51 A; 3VS2 A; 2KYB A; 2A08 A; 1AOJ A; 1J3T A; 4QT7 A; 1K0X A; 2HSP A; 3H41 A; 2O88 A; 1G83 A; 2DIL A; 4AFZ C; 5HCK A; 3H0F A; 3EHQ A; 2PZ1 A; 3M0P A; 2RQV A; 2KNB B; 3H0H A; 2V1R A; 2I0N A; 2OJ2 A; 1X69 A; 2O2O A; 1UTI A; 1E6G A; 3VS1 A; 4CC3 A; 2FEI A; 4OMP A; 4CC2 A; 1CSK A; 4M4Z A; 3QWX X; 1BK2 A; 2D0N A; 1X6G A; 3UAT A; 2KEA A; 4J9C A; 2FRW A; 1X2Q A; 3RNJ A; 1GBR A; 5FW9 A; 2C0I A; 1NLP C; 2YSQ A; 4GBQ A; 2SEM A; 2OAW A; 4KRT A; 2LZ6 B; 2EGA A; 5GJV B; 2A37 A; 4LNP A; 1ZUY A; 3EG3 A; 1AWW A; 1KIK A; 5I22 A; 1K1Z A; 2DL4 A; 1XOV A; 4JJC A; 1PHT A; 3REB B; 2MCN A; 4OMQ A; 2DL8 A; 2YUN A; 2GGR A; 1RLQ C; 4RUG A; 4OMN A; 2K3B A; 1I07 A; 1E7O A; 2J6F A; 1UHC A; 1WDX A; 2F2W A; 2L3S A; 4LE9 A; 2DBK A; 3H0I A; 2FPD A; 2KBT A; 1NG2 A; 3VS0 A; 1TUC A; 2LMJ A; 1YWP A; 1HSQ A; 1GL5 A; 2BZ8 A; 2DNU A; 2JM9 A; 1EFN A; 1VYU A; 2RQT A; 3U23 A; 1A0N B; 2LP5 A; 4K11 A; 4FSS A; 1W70 A; 1ZUU A; 2A36 A; 4CC4 B; 3EG2 A; 2B86 A; 3PE0 A; 2F2X A; 2EYZ A; 2DF6 A; 1PKS A; 3R6N A; 2CSQ A; 4X1V A; 2KGT A; 1OV3 A; 1JXO A; 3VRY A; 4HXJ A; 2DRM A; 1GFD A; 2J6O A; 4RTT A; 4DEY A; 5FWB A; 3I35 A; 2YUP A; 1I0C A; 2L3P A; 2LX7 A; 3IQL A; 3ZL7 C; 4J9F A; 1VYV A; 1JXM A; 1YP5 A; 3LH5 A; 2JTE A; 2EQI A; 2BZY A; 2NWM A; 1W1F A; 3EG1 A; 2W0Z A; 4LUE A; 2YUQ A; 4HCK A; 1Y57 A; 2QDL A; 1UFF A; 2P4R A; 1NEB A; 1UHF A; 5IXB A; 1NYF A; 3SEM A; 4EIK A; 2E5K A; 1M8M A; 2J6K A; 1IO6 A; 2EGC A; 1FYN A; 1NM7 A; 2MIO A; 2GBQ A; 2DA9 A; 2CUD A; 1VA7 A; 1YN8 A; 2K7A A; 2DX1 A; 1PKT A; 1ABQ A; 1M27 C; 2HCK A; 1PRM C; 4Y92 A; 3M0Q A; 4AFU C; 1RUW A; 2RN8 A; 3GBQ A; 1UEC A; 1ARK A; 2KT1 A; 2DL5 A; 2ED0 A; 4ORZ A; 2EBP A; 1ZBJ A; 2KYM A; 4F14 A; 1ZX6 A; 2ROT A; 1SRM A; 5GJW B; 4RTY A; 2O9S A; 3VRZ A; 1GCQ C; 4ESR A; 2L0A A; 1TUD A; 2KRM A; 1HD3 A; 2JW4 A; 2XMF A; 1PWT A; 2DBM A; 2RQR A; 2A28 A; 4LUD A; 5ECA A; 2DE0 X; 3QWY A; 4RTW A; 2YUO A; 2V1Q A; 2KXD A; 1AWX A; 2EPD A; 1NEG A; 4R0K A; 2KXC A; 4J9I A; 1M3B A; 3TSW A; 2JS0 A; 2EKH A; 4D8K A; 4F17 A; 1PNJ A; 2RNA A; 3NHN A; 5FWC A; 1H92 A; 2ECZ A; 1K76 A; 4JPB W; 1GCQ A; 1WYX A; 2DL7 A; 4AG2 C; 5IHK A; 2VVK A; 2J06 A; 3VS3 A; 4DEX A; 2DLP A; 1NLO C; 1UUE A; 4JZ3 A; 2CSI A; 1KJW A; 2W10 A; 3PVQ A; 2CUB A; 1AEY A; 3REA B; 1G2B A; 3THK A; 1SRL A; 3O5Z A; 3UA6 A; 2CH4 A; 3ULR B; 1WX6 A; 3M0U A; 1WXB A; 5IXF A; 1U3O A; 2RF0 A; 2C0T A; 2JT4 A; 1M30 A; 1U5S A; 2LJ0 A; 1K9A A; 1H3H A; 2HBW A; 2J7I A; 1K0S A; 4HVU A; 2BZX A; 2KRS A; 2RQU A; 4Z88 A; 1BBZ A; 5EC7 A; 4JZ4 A; 4OML A; 1QLY A; 2C0O A; 2CT3 A; 2K6D A; 2FRY A; 1AWJ A; 4RTZ A; 3TVT A; 2DVJ A; 1WLP B; 1UDL A; 2GTJ A; 1YWO A; 2L2P A; 2RMO A; 2RPN A; 1UGV A; 2AK5 A; 1OEB A; 1E6H A; 2AZV A; 2EYY A; 2VWF A; 1VYT A; 1X6B A; 2H8H A; 1CKB A; 1PRL C; 1UE9 A; 1Y0M A; 2AKK A; 4A63 B; 2AZS A; 4IIM A; 2CDT A; 4RTU A; 3I9Q A; 1WXU A; 1ZLM A; 2DJQ A; 1U06 A; 2LQW A; 1RI9 A; 2KE9 A; 4JJB A; 2F2V A; 2D8J A; 3EG0 A; 1T3L A; 1CKA A; 1H8K A; 2M0Y A; 4J9G A; 4J9H A; 3VS5 A; 2ENM A; 1X2K A; 1W6X A; 2JXB A; 2IIM A; 3JV3 A; 3TSZ A; 2DM1 A; 1QKW A; 4AG1 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UDC A; 1KHC A; 2LT1 A; 2NUT B; 2RI2 A; 2BTT A; 3MEV A; 1LNX A; 3JB9 G; 1QCF A; 3CCJ A; 2DXC A; 3M9Q A; 5CKE A; 1JBM A; 4NS5 A; 1R8O B; 2X3W D; 4E7I A; 1B07 A; 1ZQ1 A; 2QEX A; 2BUD A; 2JJ9 A; 2ZZD A; 3RMS A; 1M1K C; 2E4H A; 3NTH A; 4M78 B; 2NYS A; 2R5A A; 4MDW A; 2DVE A; 1V1C A; 2DTH A; 4XK8 E; 1VUB A; 4J9B A; 4N4H A; 5IAY A; 1I5L A; 5KCO A; 1YI2 A; 2EJF A; 4HVV A; 2VGN A; 2RHU A; 2OX7 A; 3LGL A; 2XU8 A; 4LD9 K; 4N0A A; 2ZCF B; 2X4X A; 1EX4 A; 1OPK A; 1QWF A; 2KDS A; 2RHZ A; 1SSH A; 2HDA A; 4M78 F; 2WAC A; 1WPY A; 1JJ2 P; 1BI2 A; 5DM7 R; 4ANJ A; 4J6W A; 2KSS A; 2E3H A; 3EGU A; 2DMO A; 1XJW B; 2DER A; 4Z8A A; 5A0G A; 1WIE A; 3NMZ C; 4NL3 A; 1BU1 A; 1LPL A; 1VQ5 T; 2F1L A; 1RAD B; 3OY9 A; 1KFZ A; 3N5B B; 5GAN g; 2DEQ A; 3OB9 A; 2J05 A; 3UA7 A; 2LCS A; 2KRO A; 3M4Y A; 1YNZ A; 1ZUK A; 2DL3 A; 2HAX A; 1Z9Z A; 4RG2 A; 2G6F X; 2DRK A; 3QYG B; 1SG5 A; 2CP5 A; 2RB6 A; 1N6A A; 1OX9 A; 3QJ6 A; 1JJ2 S; 3DB4 A; 2GQI A; 1N8R U; 1IHW A; 1BKB A; 3JCM h; 1T0J A; 4ZGE B; 5GAO l; 4AFS C; 2AIR B; 5CAI A; 1I5O B; 2X3X D; 4PJO B; 1VQP A; 1VQL A; 5IHI A; 4BI4 A; 4PNO A; 5LJ5 h; 4RTX A; 2X35 A; 3OYL A; 4C5H A; 2XD0 A; 2EYW A; 2EQK A; 2LT4 A; 3EHR A; 2MMP A; 2K79 A; 2RJD A; 3LWI A; 3OMG A; 1AZG B; 1OQK A; 3OYK A; 4F16 A; 1JEG A; 3AT1 B; 2KT8 A; 4BY6 C; 3QBY A; 2XDD A; 4PJO F; 4NOY A; 2K9G A; 3FJ5 A; 4N0A C; 5CKD A; 1ZSZ C; 2E70 A; 4O5V A; 3OYN A; 5KH6 A; 1RAI B; 1AOJ A; 1K0X A; 3H41 A; 3GP8 A; 5HCK A; 3EHQ A; 2PZ1 A; 3CC4 T; 2KY9 A; 1VQ5 Q; 3LH0 A; 2IVW A; 2OJ2 A; 1X69 A; 1E6G A; 3VS1 A; 2FEI A; 3QG1 A; 4OMP A; 4WTO B; 4DBF A; 1K73 R; 3QWX X; 4C0Z A; 5DLO A; 3S6W A; 3QPH A; 1HK9 A; 5GAN f; 1S72 T; 1IGQ A; 1GBR A; 3CME A; 4OGE A; 4EDU A; 3V7C A; 3M53 A; 1M90 C; 4HKE A; 2SEM A; 3QO3 A; 4KRT A; 2LZ6 B; 3FDR A; 3EG3 A; 4IUR A; 3NTI A; 1K1Z A; 4LDW A; 1VQ8 T; 3NFC A; 1WJR A; 1Q81 U; 3GF5 A; 3OSS C; 3REB B; 4OMQ A; 2DL8 A; 2YUN A; 4RUG A; 4BE0 A; 3RMQ A; 2K3B A; 5GAO q; 2FB7 A; 2F2W A; 3A8M B; 4XTY A; 5KYU A; 3HKS A; 4BB7 A; 4LE9 A; 4N4G A; 2FPD A; 5CKH A; 1TUC A; 3CCR Q; 2A0F B; 3CCS T; 2LMJ A; 1KHI A; 1HSQ A; 2EIF A; 2BKD N; 2CZ0 B; 2LP5 A; 3TQ7 P; 1VQM T; 4K11 A; 2P84 A; 4PLL A; 5GMK i; 2COY A; 2K3Y A; 2KQW A; 1ZUU A; 1UGP B; 2A36 A; 4B9X A; 4QVC A; 2YWW A; 3JAM E; 1IRX A; 3EG2 A; 2B86 A; 3PE0 A; 2EYZ A; 2VAS A; 1W4S A; 2PVD B; 1PKS A; 4X1V A; 2OTJ Q; 3TEE A; 2KGT A; 3CBM A; 3VRY A; 3CC4 Q; 3CXC P; 3OMC A; 3VKI A; 2K57 A; 1KC8 C; 4M7D A; 2PUK B; 1SF9 A; 3OYC A; 3H9N A; 1YJW T; 1MND A; 3EG1 A; 4XAX B; 2E41 A; 4XQ3 A; 2EQJ A; 1PSF A; 4J6Y A; 4RCC A; 1UFF A; 1Q81 R; 2X4Y A; 5IXB A; 1UHF A; 1RL2 A; 4LDV A; 4EIK A; 5LJ3 g; 3A8O B; 1M8M A; 2CZ7 B; 1WHL A; 2L5Q A; 1TXQ A; 1IO6 A; 2EGC A; 1EIF A; 3EFR A; 3V8K A; 4ZTJ A; 1M27 C; 1VQ8 Q; 3CCR A; 2HCK A; 2V8I A; 3CXC S; 4ZGD B; 1PRM C; 1ARK A; 4ORZ A; 5CKB A; 1IXD A; 2F5T X; 4FCY A; 2ROT A; 5GJW B; 4J83 A; 3PFS A; 2O9S A; 4RTY A; 3VRZ A; 1KK7 A; 1PM3 A; 2E64 A; 2PVO B; 3HL8 A; 2GCX A; 1KQS P; 1KG1 A; 2JW4 A; 2JOY A; 3HTR A; 1PWT A; 3X24 B; 2DBM A; 2RQR A; 4BDY A; 2A28 A; 4LUD A; 3EAE A; 2OTJ A; 3CCS Q; 2YUO A; 1UGR B; 1NEG A; 3CCQ T; 4OGC A; 3QDF A; 1VQM Q; 2KXC A; 1AHJ B; 3TSW A; 2XKO C; 5GAN 2; 5CO7 A; 4M7D E; 1KQ2 A; 3C94 A; 1PNJ A; 2NLU A; 1TOV A; 1H92 A; 2ECZ A; 1K76 A; 2K3X A; 4C8Q D; 2CS7 A; 1NLO C; 3JCM g; 3EGX B; 3EH2 A; 2M1H A; 1SSF A; 5GAN 5; 1QP2 A; 3PVQ A; 2CUB A; 2RK1 A; 3QYH B; 1Q82 U; 2P0K A; 2XK0 A; 1F1B B; 5DY9 A; 3THK A; 1KQS S; 4CI0 C; 5CK9 A; 1PD0 A; 3ULR B; 1WX6 A; 1M1G A; 5LJ5 g; 1YFN A; 1YJW Q; 1G8X A; 4ZN3 A; 2C0T A; 1M30 A; 1U5S A; 2LJ0 A; 4PL6 A; 3CPW P; 9ATC B; 1H3H A; 2J7I A; 2JVV A; 3M56 A; 4C8Q C; 4F7U A; 4M77 A; 5KE3 A; 2RQU A; 1WJS A; 4Z88 A; 8AT1 B; 4JZ4 A; 5LJ3 d; 2CT3 A; 2K6D A; 3J7A F; 3FEO A; 3QXE B; 2DVJ A; 4GLK A; 1VQN T; 1OEB A; 4EPC A; 2EYY A; 2VWF A; 3CCS A; 3MP8 A; 2LCL A; 5GAM h; 1VQ7 A; 2COZ A; 4C8Q G; 3OYJ A; 4RTU A; 1KD1 U; 3I9Q A; 2DD4 A; 1MHN A; 4BAC A; 3CCJ T; 2KE9 A; 4VUB A; 3CPW S; 3V7R A; 2QEX T; 2R57 A; 2AT1 B; 4XTX A; 4J9G A; 2ENM A; 1QVG A; 1TUG B; 1W6X A; 2JXB A; 1M2V A; 2DET A; 3PMI A; 3SWN A; 3JV3 A; 3CCQ Q; 1W2B P; 1QKW A; 2QA4 A; 1QVF P; 4OB1 B; 1YI2 T; 1U8R A; 2QQ9 A; 3MCA B; 1YJW A; 2QK0 A; 1BB9 A; 1BCM A; 1K73 C; 5CVI A; 3VS7 A; 3CCL A; 3C0C A; 4KUD K; 4KGZ B; 1M5Q 1; 3VS6 A; 4F7U E; 2D6F A; 5C0M A; 2HD0 A; 1X27 A; 5M9O A; 3VS4 A; 2DIQ A; 1YCS B; 2PTK A; 3JCM f; 3GOX A; 5KYW B; 1Q7Y U; 2MAM A; 2V8J A; 3VUB A; 3M0S A; 3X28 B; 1NYG A; 2ATC B; 4JLG A; 1W2B S; 2GFU A; 1QVF S; 3QJY A; 4ME7 A; 1YJ9 Q; 2QAZ A; 4ZTF A; 2OI3 A; 4IIO A; 3O8V A; 4JJD A; 4C92 B; 2FZK B; 1WGS A; 4OMO A; 1NJI C; 1SHF A; 5KYY A; 2IG0 A; 2NUT A; 1LOJ A; 1VQN Q; 1WHK A; 3R6O A; 1HJD A; 3JCM J; 3CC7 T; 1TG0 A; 1QWE A; 4RMO A; 3GPL A; 4Z89 A; 2ZPH B; 4PJJ A; 4JRK A; 3CCQ A; 1V29 B; 4D8D A; 1VQ4 Q; 4C92 F; 1TU0 B; 5GMK h; 3CCJ Q; 5IH2 A; 1N27 A; 2JS2 A; 4JS4 A; 1VQP T; 3DB3 A; 1VQL T; 2QEX Q; 1D1C A; 8ATC B; 2FPF A; 1UGQ B; 5EG2 A; 2OAU A; 4J9D A; 3FRN A; 3LX7 A; 3M59 A; 4C0F A; 3LWH A; 1G3Y A; 3OYG A; 2VKN A; 3G1J A; 1N5Z A; 5GAN 8; 2O4X B; 1AWO A; 2GFA A; 4IUP A; 5IN1 A; 3JCM V; 1JB0 E; 3EFS A; 3RUX A; 4WCI A; 4ELY C; 4CRI A; 4EMK C; 4QVD A; 3OYA A; 5GAN 7; 2MI6 A; 2D8H A; 2CP2 A; 2NUP B; 1GRI A; 2RM4 A; 1JO8 A; 3CCM A; 5GAN e; 1NPP A; 1WXT A; 4QQD A; 1YJ9 A; 4HVW A; 4OB2 B; 2B8A A; 2LDM A; 1JU5 C; 2EW3 A; 4HA8 A; 1IGU A; 1VQN A; 1UEB A; 1X43 A; 4ZGJ B; 3HSB A; 2XHC A; 4ZNX A; 3URG A; 1IRE B; 3QZ5 B; 5I2M A; 3JCM c; 4HT8 A; 3JB9 H; 1S1N A; 1Y07 A; 3M0R A; 4M78 D; 1VQ4 A; 1RAB B; 1M9S A; 1QKX A; 1I1J A; 1OPL A; 1TH7 A; 2EWN A; 2M51 A; 3OSV A; 4O6J A; 2FHD A; 2KYB A; 2A08 A; 4M75 B; 1Y71 A; 3CC7 Q; 3CME T; 4AFZ C; 3H0F A; 2EKO A; 4A4G A; 2KNB B; 2HL5 C; 5FRM A; 1RAF B; 1D0Z A; 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