The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Binding Mechanism of the N-Terminal SH3 Domain of CrkII and Proline-Rich Motifs in cAbl.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
10
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFQ C; 1BK2 A; 2FO0 A; 1I0C A; 1ABQ A; 2DJQ A; 5HCK A; 1ZUU A; 2RQW A; 2EYW A; 1CSK A; 1VA7 A; 1W70 A; 1B3Q A; 4HVW A; 2LCS A; 2D0N A; 1WI7 A; 3TVT A; 1YN8 A; 4D8D A; 2C0I A; 1WLP B; 3NGP A; 2M0Y A; 2SRC A; 4IIO A; 1WDX A; 2CT4 A; 1S1N A; 1WX6 A; 1E6H A; 4AG1 C; 1KIK A; 2OJ2 A; 2OAW A; 3M0Q A; 1T3S A; 4E6R A; 1BB9 A; 4X1V A; 4CC3 A; 4OMM A; 2J6F A; 1UFF A; 1YP5 A; 2L2P A; 1AOJ A; 2LMJ A; 3ZL7 C; 5IHN A; 2AKK A; 1W6X A; 2LJ3 A; 4A63 B; 2ECZ A; 2DE0 X; 4HVU A; 3UA7 A; 1SPK A; 1KFZ A; 2D8H A; 3H0I A; 2EGA A; 1PNJ A; 2RQU A; 1AZE A; 2VVK A; 1AZG B; 4HVV A; 1RLP C; 2HCK A; 1M3C A; 2ABL A; 2C0T A; 4CC4 B; 2JM8 A; 2MCN A; 2YUN A; 4LUE A; 3M0R A; 1AD5 A; 5FWB A; 2MOX A; 2P4R A; 2M51 A; 4AFS C; 3SEM A; 3JV3 A; 1Y57 A; 2NWM A; 1QCF A; 1OPL A; 1SSH A; 2A28 A; 1WFW A; 1KJW A; 2KNB B; 2DX1 A; 1TG0 A; 3EG2 A; 2LQN A; 2KR3 A; 1RUW A; 4RTZ A; 1QKW A; 1HD3 A; 1K0X A; 1PKS A; 3M0S A; 2RPN A; 3CQT A; 1FMK A; 2KRN A; 2FRY A; 1UJY A; 1SEM A; 3VS5 A; 2JW4 A; 1UDL A; 5IHI A; 2H8H A; 2KXD A; 5GJV B; 3PVQ A; 1Y0M A; 3GBQ A; 2KGT A; 2K9G A; 3ULR B; 2IIM A; 3VRY A; 1JEG A; 4FSS A; 5IH2 A; 2G6F X; 1MV3 A; 1TUC A; 2DRM A; 4DEX A; 1A0N B; 2F2W A; 2C0O A; 2VWF A; 3VS4 A; 2AZS A; 5I22 A; 2MIO A; 1YWO A; 2JS2 A; 2KBT A; 2RN8 A; 2ENM A; 2CSQ A; 4R0K A; 4LN2 A; 5IXF A; 1UHC A; 2OI3 A; 3H41 A; 1AWX A; 1UE9 A; 1GL5 A; 4OMN A; 1PHT A; 1M27 C; 4LNP A; 2EGE A; 1BU1 A; 1GBQ A; 2LJ1 A; 2A37 A; 1JU5 C; 2KRS A; 2YUP A; 1NYF A; 3I35 A; 1HSQ A; 1X2Q A; 2EGC A; 2DA9 A; 3SHW A; 2CSI A; 2J6K A; 3RBB B; 4J9B A; 5I11 A; 2JTE A; 3REB B; 2EPD A; 1X27 A; 2ESW A; 2L3P A; 1X2K A; 2J05 A; 2YT6 A; 4GBQ A; 2K2M A; 1ZSG A; 1GBR A; 2FEI A; 2EYX A; 2O31 A; 2J7I A; 2PNI A; 4J9C A; 2GGR A; 2GTJ A; 4RTX A; 1ARK A; 1X43 A; 2NUZ A; 1T0J A; 1NM7 A; 2DL8 A; 2DL5 A; 1J3T A; 2ROT A; 4KRT A; 1T3L A; 1G2B A; 1PWT A; 1SRL A; 3C0C A; 4AFZ C; 2CUB A; 4OML A; 1WXT A; 2LNH B; 5FWC A; 1I1J A; 4OMO A; 2CH4 A; 3VS1 A; 1QWF A; 2D8J A; 4RTW A; 4J9E A; 1NLO C; 1LCK A; 1GCP A; 4JJC A; 3UAT A; 4IIM A; 3A98 A; 2LQW A; 1H8K A; 2GQI A; 2DF6 A; 3NPF A; 3M0P A; 1NG2 A; 5ECA A; 2EBP A; 2KE9 A; 2J06 A; 3M0U A; 1K4U S; 2KRM A; 1V1C A; 2F2X A; 1W1F A; 1OPK A; 1N5Z A; 1QLY A; 2RQR A; 3I9Q A; 2CUD A; 2X3X D; 2ROL A; 4ESR A; 3RNJ A; 1MV0 B; 2D1X A; 2K3B A; 4M4Z A; 2O9V A; 2GTO A; 1E6G A; 2A36 A; 1QKX A; 2DYB A; 2HDA A; 2F2V A; 2DLP A; 2FG0 A; 4WCI A; 2FPE A; 3VS0 A; 1UEC A; 1UJ0 A; 1SHF A; 2AZV A; 2DRK A; 1Z9Q A; 2RMO A; 2YSQ A; 1AWO A; 4J9D A; 1B07 A; 1GFC A; 3PVL A; 4CC2 A; 1MUZ A; 2CRE A; 2O2O A; 2EYY A; 4DEY A; 2EW3 A; 3H0F A; 4J9H A; 4RTV A; 2DBK A; 1UGV A; 2BZX A; 3VRZ A; 1NEG A; 4GLM A; 1M30 A; 1ZUY A; 1VYT A; 3THK A; 1GCQ C; 2KT8 A; 1U06 A; 2SEM A; 3UA6 A; 2E5K A; 1T0H A; 1WXU A; 2K7A A; 1E7O A; 3TSW A; 5EC7 A; 3NHN A; 2JMA A; 3NMZ C; 3PE0 A; 1M3A A; 2YDL A; 2HBW A; 4ORZ A; 4D8K A; 3KFV A; 1EFN A; 2AKL A; 4LUD A; 5L23 A; 2ED0 A; 2K79 A; 3VS2 A; 2LX7 A; 2JT4 A; 2QDL A; 2KT1 A; 2XMF A; 1OV3 A; 1VYU A; 2EYZ A; 2RNA A; 3VS6 A; 2DL7 A; 2HEQ A; 2JS0 A; 3H0H A; 4AG2 C; 5IXB A; 4Z8A A; 5IHK A; 1H92 A; 2DL4 A; 2FPD A; 2BZ8 A; 1UG1 A; 4RUG A; 1BBZ A; 2KRO A; 2L0A A; 4JPB W; 2DL3 A; 1K76 A; 1AWW A; 4F14 A; 1ZX6 A; 1YCS B; 2YUQ A; 4J9I A; 1UHF A; 3I5S A; 1NYG A; 1PRM C; 1YNZ A; 3REA B; 1QWE A; 2BTT A; 5GJW B; 2DIL A; 1K1Z A; 1JXM A; 3QWY A; 2B86 A; 3EG3 A; 1GCQ A; 3QWX X; 1X69 A; 3R6N A; 1WIE A; 3EGU A; 1RI9 A; 5FW9 A; 2CH4 W; 1AEY A; 4OMQ A; 1G83 A; 4Z89 A; 1M8M A; 1X6G A; 1AVZ C; 1FYN A; 4OMP A; 4HCK A; 2FRW A; 2PTK A; 2DVJ A; 1GRI A; 2LJ0 A; 1UUE A; 3EG1 A; 2ED1 A; 4Z88 A; 4AFU C; 3EHQ A; 4CC7 A; 2HSP A; 3TSZ A; 1RLQ C; 2LZ6 B; 3UF4 A; 1UTI A; 1X6B A; 2X3W D; 1PKT A; 4EIK A; 1CKA A; 2L3Q A; 1I07 A; 4J9F A; 4HXJ A; 1JQQ A; 1Z9Z A; 2EVR A; 1U5S A; 2EKH A; 2KXC A; 1NEB A; 4JJB A; 4Y92 A; 2EQI A; 1ZUK A; 1WA7 A; 2W0Z A; 3VS3 A; 2V1Q A; 2W10 A; 2GBQ A; 1PRL C; 3LH5 A; 1XOV A; 1K9A A; 3U23 A; 2CDT A; 2PZ1 A; 1SRM A; 2DBM A; 2DMO A; 1KSW A; 2DM1 A; 3EG0 A; 2DNU A; 2RF0 A; 2KYB A; 2V1R A; 4JZ4 A; 1ABO A; 3VS7 A; 1CKB A; 3IQL A; 1SHG A; 1ZLM A; 2CT3 A; 4RTT A; 2I0N A; 2GNC A; 4JJD A; 4QT7 A; 1AWJ A; 1NLP C; 1OEB A; 2K6D A; 3I5R A; 1YWP A; 2JXB A; 2O9S A; 2LP5 A; 1H3H A; 2J6O A; 2VKN A; 2KEA A; 4K11 A; 3O5Z A; 1K0S A; 4J9G A; 1WXB A; 1GFD A; 4JZ3 A; 1TUD A; 2BZY A; 2JMC A; 4LE9 A; 2YUO A; 1JO8 A; 2O88 A; 1ZBJ A; 3FJ5 A; 4F16 A; 2JM9 A; 4RTU A; 1JXO A; 2RQV A; 3M0T A; 2RQT A; 4ZNX A; 2A08 A; 1U3O A; 1VYV A; 4F17 A; 2AK5 A; 4RTY A; 1WYX A; 1M3B A; 3EHR A; 1HJD A; 2L3S A; 1IO6 A; 1OOT A; 2FPF A; 2KYM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AFQ C; 1BK2 A; 2MPX C; 2VYT A; 2BE9 B; 1CSK A; 3EGX B; 3JB9 H; 2LCS A; 2H3J A; 2EQU A; 4OGC A; 1YN8 A; 1OYX A; 4L6V 5; 4D8D A; 5GAN 2; 3NGP A; 1VQ6 A; 2XDP A; 2SRC A; 1WDX A; 1S1N A; 4AG1 C; 2ZPF B; 4A4H A; 3OBY A; 4XTV A; 2K57 A; 3M0Q A; 4C8Q E; 3CPW A; 3LYI A; 4DBH A; 5CKB A; 1BB9 A; 3ASK A; 1BI1 A; 3R6O A; 3OYI A; 5HK0 A; 1UFF A; 2EQK A; 1G3Y A; 1M1F A; 2Y90 A; 1FX7 A; 2RHI A; 2L2P A; 3CMA T; 5CKH A; 2DTI A; 3UA7 A; 1SPK A; 3G6E A; 1KFZ A; 2CP7 A; 4KH1 B; 3H0I A; 2EGA A; 1PNJ A; 2EKO A; 1OUL A; 2COY A; 2PUK B; 1Q86 C; 4CRI A; 3GNF B; 2ABL A; 3VUB A; 3EH2 A; 4E7L A; 4ZTF A; 2QEX T; 2MCN A; 1UGR B; 2MOX A; 2P4R A; 1M2V B; 2M51 A; 4C8Q C; 2XDD A; 1Y57 A; 2Y4X A; 4ELY C; 3UPU A; 3CCR T; 4DA4 A; 1UB4 A; 1OPL A; 3V8K A; 3S3O A; 1K73 U; 2A28 A; 4ZTJ A; 1LNX A; 4IUV A; 1TG0 A; 4N0A C; 1RUW A; 3M9Q A; 1K0X A; 1WHG A; 3G4S A; 2CP6 A; 1PD0 A; 3G1J A; 1WJS A; 3CCQ T; 3CQT A; 3CCE Q; 1FMW A; 1X01 A; 3MEW A; 2KRN A; 2VAS A; 2M0O A; 2BIV A; 3CEY A; 2JW4 A; 1TS9 A; 1IHW A; 2H8H A; 5FRM A; 4MZT A; 2PVG B; 3PVQ A; 1Y0M A; 2L3R A; 1RAE B; 2DEU A; 3EGX A; 2VUB A; 2JZ2 A; 3QPH A; 1TUC A; 1IGQ A; 1FWZ A; 1KQ2 A; 2E3H A; 3JCM J; 1K8A U; 3OYJ A; 3FIF A; 1HYO A; 1YWO A; 2JS2 A; 2RN8 A; 2DET A; 1UHC A; 1AWX A; 1UE9 A; 1GL5 A; 4OMN A; 3CXC S; 2XK0 A; 5KYN A; 3JSC A; 3CCL Q; 1SKU B; 3CCV T; 1AHJ B; 5GAN h; 3CCS A; 4M75 E; 2ZPE B; 5FU7 C; 3L2W A; 2QGG A; 1X2Q A; 1TXQ A; 2J6K A; 1BIA A; 3RBB B; 2RH2 A; 1WHH A; 1X27 A; 3CCM T; 1YJ9 A; 2YT6 A; 2K2M A; 2EYX A; 4C0D C; 2VC8 A; 5CKF A; 2XD0 A; 3NTI A; 2GGR A; 2GTJ A; 1VQL T; 1M2V A; 1X43 A; 2E70 A; 2NUZ A; 1NM7 A; 1PWT A; 2CUB A; 4OML A; 1WXT A; 2LNH B; 3EFO B; 1I1J A; 4OMO A; 2CH4 A; 1QWF A; 3C12 A; 5GMK i; 3FEO A; 2E4H A; 4J6W A; 3VJP A; 1H8K A; 2FL7 A; 2QA4 T; 3NPF A; 1U8R A; 1W2B S; 2J06 A; 2QI2 A; 1K4U S; 2KRM A; 5AT1 B; 5KCH A; 3CD6 Q; 1B7T A; 3CCU Q; 1VQO T; 1N5Z A; 5D7U A; 2RI2 A; 4LXC A; 4X9D A; 2KDS A; 2X3X D; 3L1A A; 4R55 A; 5FU6 C; 3JCM Q; 2F5K A; 3RNJ A; 1MV0 B; 4VUB A; 5KE3 A; 2OTL T; 4XU1 A; 4C0G A; 4FU6 A; 3LGF A; 2FG0 A; 1M1K R; 1WPY A; 2ZCF B; 4BE1 A; 5KYX B; 2FPE A; 1UEC A; 1SHF A; 2PUO B; 3RKW A; 1KQS P; 4C0F A; 2DRK A; 2DIQ A; 2RMO A; 1NJI U; 1PSE A; 3HRU A; 2CRE A; 1ZBX A; 2O2O A; 3H0F A; 3LWH A; 5A0L A; 4GLM A; 4OB1 B; 4WTO B; 4Z02 A; 4JRI A; 2SEM A; 1WXU A; 4M78 E; 3OS1 A; 1WHL A; 2EJG A; 3PGG A; 3NMZ C; 4PKC C; 5HY6 A; 1YJN Q; 1G3T A; 1M3A A; 2YDL A; 2ZPB B; 1BI2 A; 4D8K A; 1N8R C; 2HKN A; 3QYG B; 5GAM j; 4FYX B; 2R5M A; 3VS2 A; 4RCB A; 4J83 A; 3CME A; 3EFO A; 2K2V A; 2KT1 A; 2XMF A; 2NYS A; 2QEX Q; 2YLB A; 4C5G A; 3E2U A; 1U1S A; 2RNA A; 3VS6 A; 3MJX A; 4E7J A; 2EJF A; 2HBP A; 3H0H A; 5GAN 5; 3A5Z B; 2DL4 A; 2KQW A; 2FPD A; 2BZ8 A; 3CCR Q; 4ELZ C; 1BBZ A; 2L0A A; 3OYM A; 2ZGW A; 1VQ5 Q; 1Q81 R; 3BY7 A; 3EFR A; 1ZX6 A; 3AHU A; 2MF2 A; 4E7K A; 1YCS B; 2YUQ A; 3OBW A; 3QZ9 B; 4J9I A; 1PRM C; 3REA B; 3CBO A; 4LD6 A; 4IUR A; 1Q86 U; 1JXM A; 2B86 A; 3R6N A; 1GCQ A; 3QII A; 8AT1 B; 4E7Z A; 4Z89 A; 1M8M A; 1M4Z A; 1QP2 A; 1I5L A; 5J26 A; 1D1A A; 5KYX A; 4HCK A; 3RKX A; 1G3S A; 2LJ0 A; 3OYF A; 4AFU C; 3ZFJ A; 5GMK j; 2KK4 A; 3EHQ A; 1YI2 A; 1RLQ C; 3EAE A; 3CBM A; 3OW2 S; 4V2S A; 4EIK A; 1KD1 C; 1M90 R; 2D9T A; 4FW2 A; 2EKH A; 4KGV B; 1I4K 1; 4JJB A; 4JUV A; 2EQI A; 4XTY A; 3SFM A; 1ZUK A; 4PLI A; 1WHM A; 4XQ3 A; 1OZ3 A; 2V1Q A; 3VS3 A; 1GXI E; 2IG0 A; 2P0Q A; 3NTH A; 3CCV Q; 1XOV A; 1BYM A; 4DQ2 A; 4B9X A; 3U23 A; 3V8J A; 3ZBD A; 4BDY A; 2PZ1 A; 2RK1 A; 1LVK A; 2DBM A; 2DMO A; 4BUG A; 1KSW A; 5KYY B; 1QVG S; 3I56 Q; 3MCA B; 2M16 A; 2RI5 A; 4FM4 B; 4JRQ A; 2V1R A; 3M55 A; 5FRO A; 4XK8 E; 1I81 A; 4IUQ A; 3M4G A; 2G3R A; 2XDB A; 2O9S A; 1VQL Q; 1I5O B; 2E1H A; 1VQN T; 2HNI A; 1H3H A; 2HQX A; 1RAI B; 2DEQ A; 4K11 A; 4ATO A; 3VYG A; 4EMG A; 2ATC B; 2EQJ A; 2BZY A; 1GFD A; 4LE9 A; 1JO8 A; 2PVO B; 3FJ5 A; 4F7U B; 3JCM V; 4RTU A; 5LJ3 g; 2QAS A; 4ZNX A; 1JJ2 S; 2E3I A; 4RTY A; 4XTW A; 2L3S A; 1BIB A; 1WQW A; 3F70 A; 2QG9 B; 4A4G A; 3G71 T; 2RD1 A; 3GP8 A; 2QA4 Q; 1QCN A; 5LJ3 j; 2DJQ A; 3E19 A; 1QW1 A; 5D6Y A; 2RQW A; 3EGD B; 2EYW A; 1VQO Q; 1KC8 R; 2QDY B; 4DOV A; 1B3Q A; 4HVW A; 3RKY A; 2D0N A; 1WI7 A; 1U1T A; 5GAO l; 3QBY A; 3X20 B; 1WLP B; 2FZK B; 2K5L A; 5A0G A; 4YTL A; 2M0Y A; 4LDW A; 4F7U G; 3OYB A; 2CT4 A; 2AIR B; 4C5E A; 2FHD A; 3OMC A; 3UT1 A; 1Q86 R; 1JRI A; 2OAW A; 5HKC A; 3FRN A; 1YIT T; 1ZHI A; 4XTU A; 4CC3 A; 5DM7 R; 4N4H A; 4BI3 A; 4OMM A; 1O75 A; 1YP5 A; 2CZ6 B; 2HD0 A; 1BI0 A; 5IN1 A; 1Q81 C; 2LMJ A; 5IHN A; 2MMP A; 1VQK T; 4UC4 A; 4EMK B; 2F69 A; 1RL2 A; 5KYY A; 4BE0 A; 1YBY A; 2DE0 X; 4ME7 A; 1M9S A; 1VQM T; 1QP3 A; 1N9S A; 5KE2 A; 2OTJ T; 2RQU A; 2D6F A; 2OAU A; 4JRP A; 4ANJ A; 3CBP A; 2C0T A; 2X4Y A; 4ZGD B; 2MAM A; 2NLU A; 4CC4 B; 2JM8 A; 2YUN A; 3JCM g; 1AD5 A; 5J3B A; 1D0X A; 3SEM A; 3JV3 A; 3T9N A; 1QCF A; 3JB9 F; 3SWN B; 1VQ6 T; 1KJW A; 1VQ7 Q; 1WJQ A; 5GAN e; 5FRN A; 3URG A; 3CC2 A; 2KR3 A; 4QW2 A; 4F7U A; 2PVD B; 1LJO A; 1VQ4 Q; 1HD3 A; 4ZGE B; 2FVU A; 3M0S A; 3QXE B; 1FMK A; 4F7U F; 2FRY A; 3HL8 A; 4M7D B; 1UJY A; 1SEM A; 1BCO A; 1ZSZ B; 4XU0 A; 5GJV B; 1N8R U; 3GBQ A; 2KI7 A; 1PC0 A; 2K9G A; 3M56 A; 2IIM A; 3EGD A; 1JEG A; 3G6E T; 4M7A E; 5IH2 A; 1Y07 A; 1MV3 A; 5GAO q; 2O4X B; 3CXC P; 5LJ5 g; 3CPW P; 2A3L A; 2LNV A; 2F2W A; 2C0O A; 3E9G A; 2NUT B; 2AZS A; 4C92 E; 5I22 A; 2MIO A; 3VYH B; 3VKI A; 1IRE B; 2MI6 A; 2KBT A; 4IUT A; 2ENM A; 2CSQ A; 4FT4 A; 4OB2 B; 2I2L A; 3I55 Q; 2GCX A; 3H41 A; 4KBM B; 5LJ5 j; 4M7D G; 1RAD B; 2EGE A; 3OB9 A; 5GAN 4; 2KRS A; 3EG9 B; 1WNL A; 4OGE A; 3JB9 D; 4EMK A; 3CCL A; 4GY5 A; 3G4S T; 2QQB A; 3S3M A; 4M7A C; 4N4G A; 1C6V X; 4KGX B; 2JTE A; 3M59 A; 2L3P A; 4IUP A; 1X2K A; 3A8O B; 5CVI A; 2R58 A; 1D1B A; 4GBQ A; 1K9M C; 4C92 C; 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