The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVGDRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47G
rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
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| source organism |
Gallus gallus
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U06 A; 1PNJ A; 1PRL C; 1WLP B; 2K6D A; 1ABQ A; 1NEB A; 2LNH B; 1U3O A; 3THK A; 1X2Q A; 2O31 A; 3VS1 A; 1WI7 A; 3KFV A; 4RTW A; 4ORZ A; 1WA7 A; 4DEX A; 1BU1 A; 2KRS A; 2YUO A; 3GBQ A; 3H41 A; 2LQN A; 4IIM A; 5FWC A; 3LH5 A; 1FMK A; 1SRL A; 4F16 A; 2F2X A; 1NM7 A; 1NLO C; 3EHR A; 1Y57 A; 2O9V A; 3I9Q A; 3PVQ A; 2MOX A; 1QLY A; 2CSQ A; 2VWF A; 4J9H A; 3IQL A; 2KT8 A; 2LZ6 B; 1HD3 A; 1AWO A; 3SEM A; 1TUD A; 3NGP A; 3UAT A; 2RPN A; 2L3Q A; 2D8H A; 3NPF A; 1GBQ A; 1RLP C; 2OI3 A; 2HDA A; 1JXM A; 1OEB A; 2VVK A; 2RNA A; 2KYB A; 2MIO A; 2DA9 A; 3M0P A; 4J9E A; 3TVT A; 4OMP A; 2X3X D; 4J9C A; 2L0A A; 1PHT A; 5EC7 A; 1NG2 A; 4HXJ A; 2IIM A; 1RLQ C; 2ENM A; 1KFZ A; 1V1C A; 1OPK A; 4A63 B; 2D0N A; 4CC2 A; 4AG2 C; 1RI9 A; 2F2V A; 1QKX A; 1T3S A; 2CUD A; 4IIO A; 4OMO A; 1HSQ A; 4JZ3 A; 2FPD A; 2GBQ A; 1ZSG A; 3NMZ C; 2DM1 A; 1AWW A; 2LJ1 A; 1A0N B; 4CC7 A; 1WX6 A; 2I0N A; 4RTV A; 1J3T A; 4R0K A; 2DL5 A; 2ED0 A; 3EHQ A; 4JJC A; 3H0F A; 1YN8 A; 2YUP A; 2RQR A; 1VA7 A; 2VKN A; 2PNI A; 2KEA A; 2DL4 A; 1GCQ A; 4J9I A; 2JW4 A; 5L23 A; 2V1Q A; 2FPF A; 2KYM A; 2DLP A; 4J9G A; 5GJV B; 2L3P A; 2A36 A; 1X6B A; 1UDL A; 1E7O A; 5IHK A; 1RUW A; 2KXD A; 4HVW A; 1T0J A; 2C0I A; 1XOV A; 2DBK A; 2DIL A; 2CH4 W; 2LX7 A; 1X2K A; 1Z9Q A; 4ZNX A; 1ZUU A; 1QKW A; 2BZY A; 2F2W A; 3M0U A; 3I35 A; 1IO6 A; 2EYX A; 1UFF A; 4OMN A; 2HBW A; 1UG1 A; 2HCK A; 1GCQ C; 2A08 A; 2KRM A; 2EKH A; 1I0C A; 1PWT A; 2MCN A; 4F17 A; 2RQW A; 2J7I A; 3REA B; 2HEQ A; 1AZG B; 1U5S A; 1UUE A; 2J6O A; 1TG0 A; 2YDL A; 2K2M A; 2O88 A; 2O2O A; 1VYV A; 3RNJ A; 2C0O A; 2KR3 A; 4AFZ C; 4F14 A; 2DF6 A; 1AVZ C; 2B86 A; 4LE9 A; 3PE0 A; 1E6H A; 1GFD A; 4JZ4 A; 1JO8 A; 4QT7 A; 1LCK A; 1NYF A; 2GTJ A; 2OJ2 A; 2RF0 A; 5IH2 A; 1UGV A; 3QWY A; 1G2B A; 2L2P A; 2DX1 A; 3JV3 A; 3TSW A; 1GFC A; 2CSI A; 1M8M A; 2CT4 A; 2GTO A; 1X43 A; 1YWO A; 4Z89 A; 1H8K A; 1UEC A; 2BZ8 A; 2CH4 A; 2HSP A; 4EIK A; 2KNB B; 1KSW A; 2AKL A; 2L3S A; 1NLP C; 2KE9 A; 2DRK A; 2D1X A; 3M0S A; 2DBM A; 2AZS A; 4CC3 A; 2J6K A; 2EBP A; 1SRM A; 2O9S A; 1K76 A; 2ECZ A; 4JJD A; 1K0X A; 4RTZ A; 4KRT A; 2PZ1 A; 5IXB A; 1UTI A; 1S1N A; 1AWX A; 1JQQ A; 2YUN A; 2CT3 A; 2E5K A; 2NWM A; 1WXT A; 3EG1 A; 4FSS A; 3UA6 A; 2SRC A; 1ZUK A; 2AK5 A; 5HCK A; 1UJY A; 2FRY A; 2DL8 A; 2P4R A; 1N5Z A; 3REB B; 4RTY A; 2EVR A; 2KBT A; 1M30 A; 2KT1 A; 3VRZ A; 2EGE A; 3QWX X; 1H3H A; 3FJ5 A; 1B07 A; 2SEM A; 2GGR A; 2DL7 A; 5I22 A; 1X69 A; 4RUG A; 2X3W D; 1MV3 A; 1K1Z A; 2GQI A; 2LQW A; 2JT4 A; 2FEI A; 3PVL A; 2ESW A; 5IXF A; 1QWF A; 2J6F A; 2RQV A; 1NYG A; 2CUB A; 1K0S A; 1NEG A; 4Y92 A; 1ZBJ A; 1YWP A; 2ED1 A; 3TSZ A; 1T0H A; 2JS2 A; 2DL3 A; 1ZUY A; 2EW3 A; 1JU5 C; 2BTT A; 1GBR A; 2ABL A; 3A98 A; 1M27 C; 2FPE A; 3I5R A; 1BK2 A; 1CKB A; 3R6N A; 2KXC A; 1E6G A; 2RQT A; 3EG3 A; 2DRM A; 4WCI A; 1Z9Z A; 3VS6 A; 1M3B A; 5FWB A; 1ABO A; 1SSH A; 2EYW A; 4ESR A; 1K9A A; 3H0H A; 1Y0M A; 2J06 A; 4AFS C; 3VS7 A; 2LP5 A; 2YUQ A; 1ZX6 A; 1GCP A; 5IHI A; 3U23 A; 2KRN A; 3VS3 A; 4LN2 A; 3EG0 A; 1M3C A; 2FRW A; 1K4U S; 1KJW A; 1UE9 A; 3UA7 A; 4D8D A; 1OV3 A; 2GNC A; 2LMJ A; 3CQT A; 1JEG A; 5GJW B; 2RMO A; 2M0Y A; 2CRE A; 4DEY A; 2DJQ A; 1FYN A; 4LUD A; 1G83 A; 2RQU A; 2PTK A; 1PKT A; 1UHC A; 2DMO A; 2KRO A; 1AOJ A; 2A37 A; 4RTX A; 2FO0 A; 4OML A; 2G6F X; 4LNP A; 3VS2 A; 3RBB B; 1CSK A; 2JXB A; 1UHF A; 1UJ0 A; 2DE0 X; 2M51 A; 1KIK A; 3I5S A; 1W70 A; 1YNZ A; 1SEM A; 2XMF A; 2JM8 A; 1QCF A; 2YT6 A; 1WDX A; 2DYB A; 1T3L A; 3O5Z A; 4X1V A; 4RTT A; 1MV0 B; 4J9D A; 4AG1 C; 4GBQ A; 1GRI A; 4J9F A; 1W1F A; 4HVU A; 1AWJ A; 2LJ3 A; 4E6R A; 2W0Z A; 2D8J A; 1SPK A; 4LUE A; 4Z88 A; 1WIE A; 1X27 A; 2A28 A; 5FW9 A; 3M0R A; 4JPB W; 1YP5 A; 1X6G A; 1ZLM A; 2JMC A; 4CC4 B; 3M0Q A; 1I07 A; 3EG2 A; 1B3Q A; 2AZV A; 1WXU A; 1BBZ A; 5I11 A; 1EFN A; 1AZE A; 2DVJ A; 3VRY A; 2CDT A; 1OOT A; 3M0T A; 1AD5 A; 2EQI A; 2OAW A; 3VS0 A; 2FG0 A; 3EGU A; 1M3A A; 4M4Z A; 1BB9 A; 1QWE A; 2K79 A; 2JS0 A; 3VS4 A; 1OPL A; 1VYU A; 1YCS B; 2K7A A; 3H0I A; 2RN8 A; 1TUC A; 4OMM A; 2ROT A; 3C0C A; 2QDL A; 4D8K A; 1PKS A; 1I1J A; 2JMA A; 1CKA A; 4AFU C; 2BZX A; 2K9G A; 4Z8A A; 1GL5 A; 1WXB A; 2AKK A; 3ULR B; 2NUZ A; 3UF4 A; 1SHF A; 4HCK A; 2EPD A; 2KGT A; 2H8H A; 2JTE A; 1SHG A; 2W10 A; 1WYX A; 4HVV A; 4AFQ C; 4K11 A; 2LCS A; 1H92 A; 2V1R A; 2C0T A; 4J9B A; 3NHN A; 2YSQ A; 2EGC A; 1ARK A; 2EYY A; 1W6X A; 1MUZ A; 2DNU A; 2LJ0 A; 2ROL A; 4GLM A; 2JM9 A; 3SHW A; 1VYT A; 2K3B A; 1WFW A; 1PRM C; 1HJD A; 4RTU A; 2EGA A; 4JJB A; 5IHN A; 3ZL7 C; 4OMQ A; 1AEY A; 5ECA A; 1JXO A; 3VS5 A; 2EYZ A; 2J05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YJW Q; 2HAX A; 1M4Z A; 1PRL C; 1NPP A; 3G71 T; 4YTL A; 1NJI C; 5HK0 A; 2DFU A; 3CBM A; 2YXY A; 1I4K 1; 4ORZ A; 1VQ9 A; 3A5Z B; 5FWC A; 1F1B B; 4EMH A; 5C6S A; 1FMK A; 4C92 F; 2DAQ A; 5CCA A; 1ACM B; 2F2X A; 3EHR A; 1YIT A; 3I9Q A; 3LGL A; 1QLY A; 4ZGE B; 1VQ8 T; 1TU0 B; 1HK9 A; 1N8R C; 1D0Z A; 2PUK B; 2KT8 A; 5A0L A; 5LJ3 e; 4M7A F; 2CZ6 B; 4JS5 A; 2O01 E; 3MKD A; 3LLR A; 2L3Q A; 3S3N A; 3NPF A; 2OI3 A; 1RLP C; 2P0P A; 1EX4 A; 1OEB A; 2F5T X; 3QZ5 B; 3S3O A; 1D3B B; 4A4G A; 2MIO A; 4L5G A; 3OYA A; 1IRX A; 4MZP A; 2A3L A; 3JCM V; 4E7H A; 1VQ9 T; 1I5O B; 5EG2 A; 2ENM A; 1RLQ C; 3OS1 A; 1KG1 A; 2MAM A; 1YIT T; 2EYQ A; 3E2U A; 3M53 A; 5LJ5 j; 1VQ6 A; 2VYT A; 1QKX A; 4KGV B; 3JAM E; 1QVG A; 1Q81 C; 4C0D B; 4IIO A; 4OMO A; 1HSQ A; 4IUR A; 4EMK C; 1IZ6 A; 3MEU A; 4A4F A; 4C8Q A; 3M9Q A; 4FIB A; 4N4I A; 5CAI A; 4X34 A; 1M9S A; 1QMC A; 4JJC A; 4C8Q F; 1VQK Q; 1YN8 A; 1IGU A; 1M2V A; 4C92 D; 3L1A A; 4FT2 A; 5GAN g; 3QYH B; 2KEA A; 2MK5 A; 2DL4 A; 1GCQ A; 3QBY A; 2FPF A; 2L3P A; 1E7O A; 2A36 A; 3URG A; 3X24 B; 5GAM g; 5GAN 5; 5CQY A; 2KXD A; 3BY7 A; 3CCV Q; 4M7A D; 1VQ6 T; 2XD0 A; 2KDS A; 2DIL A; 2R57 A; 4QKU A; 2LX7 A; 1JJ2 S; 3M57 A; 1I81 A; 3M0U A; 3NFC A; 1YCY A; 3GP8 A; 2RI3 A; 3I35 A; 3CXC P; 2EYX A; 3NTH A; 1H64 1; 3RER A; 2KRM A; 4OGE A; 3FB9 A; 2MCN A; 1LPL A; 3HRT A; 3T9N A; 4Q5W A; 1UUE A; 2FB7 A; 2X4Y A; 2DZ9 A; 4AMC A; 4J6Y A; 4AFZ C; 2B86 A; 4FSX A; 1D09 B; 4HCB A; 1GFD A; 1JO8 A; 1LCK A; 3JB9 H; 3G71 Q; 8AT1 B; 5LJ5 d; 2OJ2 A; 3JCM h; 2GFU A; 5IH2 A; 2HSE B; 1UGV A; 4C8Q D; 1VQL A; 1PM3 A; 2MMP A; 1M8M A; 2CT4 A; 1ZA2 B; 2GTO A; 4QQ6 A; 2XG8 D; 1YWO A; 4OB3 B; 2E70 A; 1UEC A; 2BZ8 A; 2CH4 A; 2HSP A; 2L3S A; 4PFP A; 1VQ8 Q; 2WSF E; 1NJI U; 3M0S A; 4EMK A; 1KQS P; 3JRZ A; 2LNV A; 3L2R A; 2RJF A; 3A8H B; 5DLQ E; 2HD0 A; 5GMK i; 2O9S A; 1K76 A; 4JJD A; 2ZPH B; 2LT4 A; 4KRT A; 1YIJ A; 2G3R A; 3RMS A; 4J7I A; 2JUF A; 1KHC A; 3JB9 F; 4FSS A; 5KE2 A; 2SRC A; 2AK5 A; 1N8R U; 1MMA A; 4PNO A; 1VQ9 Q; 4PJN A; 2KBT A; 1MNE A; 1M30 A; 2KT1 A; 2OX7 A; 2EGE A; 3QWX X; 2ZPI B; 1H3H A; 5HKC A; 1YIT Q; 1B07 A; 2AT1 B; 3EG9 B; 3C4S A; 3RES A; 4RUG A; 2X3W D; 4M77 B; 2DIG A; 2LQW A; 4BI4 A; 3QII A; 1BCM A; 2A7Y A; 1YIJ T; 3C12 A; 4IUQ A; 1NYG A; 2CUB A; 2EFI A; 3SDZ A; 4Y92 A; 1MMD A; 3JCM g; 3HSB A; 3CPF A; 4LDY A; 2ED1 A; 3TSZ A; 1T0H A; 2GQV A; 3V7R A; 5HK3 A; 1Q81 U; 4DBF A; 1ZUY A; 1WHG A; 1JU5 C; 2EW3 A; 4B9W A; 2PVO B; 4C92 G; 2FPE A; 4LDU A; 2EAY A; 2XHC A; 2KXC A; 3G4S A; 1ZSZ B; 4N4H A; 4WCI A; 1M3B A; 3OS5 A; 5LJ3 f; 1VQ6 Q; 2QA4 A; 1K9A A; 3QKJ A; 4M75 D; 1MHN A; 2X35 A; 2J06 A; 1WZO A; 4M7A G; 4OB2 B; 3VS7 A; 1ZX6 A; 1Q82 R; 4C5H A; 3CCU A; 2P84 A; 3WXM B; 1UE9 A; 1WHH A; 4OP0 A; 2LMJ A; 1JEG A; 1W2B S; 2RMO A; 5KYN A; 3HKS A; 3PMT A; 2DJQ A; 1FYN A; 2B8A A; 1G83 A; 2LVM A; 1RAG B; 2DMO A; 3RKW A; 3V8L A; 2FZC B; 1VQ5 T; 2A37 A; 3LYI A; 4RTX A; 4JS4 A; 2DTH A; 3M59 A; 3VKI A; 2F69 A; 2RI2 A; 2VXE A; 4CRI A; 3G4S T; 1Y07 A; 1NJI R; 2QA4 T; 3CC4 A; 1FMV A; 2DEQ A; 3RIR A; 2LCL A; 1N27 A; 5FU7 B; 4XTV A; 2YT6 A; 1RAE B; 1KC8 C; 4HT9 A; 2WSE E; 4F7U G; 1WPY A; 3MEV A; 4J9D A; 4C8Q G; 4AG1 C; 5GAO l; 4FT4 A; 1RI0 A; 1GRI A; 3BDL A; 4PJO C; 1N8R R; 2DK3 A; 4O6J A; 2LJ3 A; 4TVR A; 1QCN A; 3CPW P; 4KUD K; 2VUB A; 3G1J A; 2JVV A; 2PUO B; 5LJ3 j; 1WNL A; 2HQX A; 2MF2 A; 3M0R A; 3KBG A; 1YP5 A; 4L6V 5; 3JCM e; 3HFO A; 4XTZ A; 4GY5 A; 2M1H A; 1WXU A; 4MZT A; 3TCJ A; 1EFN A; 3CC4 T; 5CO7 A; 5FLX E; 3DKM A; 3FJP A; 4PJJ A; 1O9S A; 1YJN A; 2K5L A; 2K4Y A; 1VQL Q; 3JCM Q; 3VS4 A; 2E4H A; 4M77 E; 1YCS B; 2K7A A; 3H0I A; 3CD6 A; 3DLL A; 3D7S B; 2OTL A; 2K57 A; 1I1J A; 1WQ7 A; 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1KC8 U; 1HXD A; 1RAD B; 4JUV A; 2PVG B; 3SFM A; 3CC4 Q; 3KUF A; 4A63 B; 3FEO A; 4NOY A; 2MI6 A; 5GAO p; 2F2V A; 2JOY A; 1JJ2 P; 2XDP A; 1T3S A; 2ZCF B; 3MCA B; 1K9M C; 1NBE B; 2RK1 A; 1D1C A; 2GBQ A; 1ZSG A; 2RA2 A; 4PJO D; 2DM1 A; 1AWW A; 2COY A; 2KQW A; 1TSF A; 4Z02 A; 1OX8 A; 2DL5 A; 4RG8 A; 1Y7X A; 3DLM A; 1QVP A; 3EHQ A; 3HRS A; 1QVG S; 4V2S A; 3OMG A; 2RQR A; 3CCV T; 3VUZ A; 2JW4 A; 1R8O B; 3X28 B; 1Y96 A; 2KYM A; 3RMQ A; 2DLP A; 4J9G A; 5GJV B; 1X6B A; 3OW2 A; 3I55 A; 4E7L A; 1RAC B; 1D3B A; 1Z9Q A; 3JB9 I; 2F2W A; 4XTU A; 5CK9 A; 5GMK e; 2KK4 A; 4FYY B; 5GAO m; 1XTD A; 4JJN K; 4JLG A; 4OMN A; 5IN1 A; 3CD6 Q; 2HCK A; 4FYX B; 1GCQ C; 4ELY C; 2OTL Q; 3JCM f; 2A08 A; 2EKH A; 1PWT A; 4PL6 A; 1OI1 A; 4F17 A; 2RQW A; 2NUP B; 4C0Z A; 1U5S A; 4LDW A; 2J6O A; 1YI2 Q; 2QAZ A; 1K73 U; 1TG0 A; 3BDU A; 3SD4 A; 2O2O A; 3I55 T; 4J6W A; 5GAN d; 2LDM A; 2DER A; 4F14 A; 2DF6 A; 5GAN h; 2HL3 A; 2XDB A; 2JJ9 A; 2OAU A; 2RF0 A; 3G7Z A; 5GAM h; 3PIO A; 2E10 A; 3CCM A; 1G2B A; 3JV3 A; 3TSW A; 3LWI A; 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