5IIZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f0
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
b'DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. raphani 756c
molecule tags Oxidoreductase
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iizA00
2X64A 5CRHA 1AUCA 3APQA 4L5LA 5J9CA 2JU5A 5HR3A 3Q74A 4MPFA 2JADA 3KCMA 5CNWA 3ZTLA 4ECIA 4EC0A 1QFNA 2H0IA 2HE3A 3GH9A 4V1Ag 1YZXA 3GN3A 4KDUA 1LJRA 13GSA 3ZIVA 1SK0A 1ON4A 3L0HA 2AUVA 5FT3A 1GULA 2IMKA 1SYXA 2A4VA 2HZFA 1EWXA 2JZRA 1Z5YE 1G7OA 1R5AA 4JEDA 3LG6A 4AJ6A 3CXGA 3FYGA 1YEXA 2DJ0A 1M99A 3ZFBA 2REMA 3KTLA 4BA7A 3F63A 1X9MB 3Q6OA 3HJMA 3SBCA 3VLNA 1JZDA 1S3CA 4BL7A 1M0UA 1QQ2A 1Q4JA 2WGRA 2H1GA 5B7CA 4MF6A 3DXBA 2FD3A 1DE2A 5LCZA 5EVOA 1OC9B 1WP0A 2CAIA 2ZNMA 2OE0A 3UL3A 4E8EA 3UARA 1K3LA 2FLSA 4YH2A 2ZCTA 1EOHA 2KOKA 5F06A 4POMA 2YJHA 4XCSA 3KH9A 3UBKA 1M2BA 2MMNA 1FVJA 3ZZXA 1T00A 3GTUA 2LNSA 2PWJA 3M1GA 2YN1A 3TKSC 4F0BA 2IIYA 5FWGA 4OFTA 5A4WA 1AAZA 5HFIA 1ZYEA 2FWEA 1GNEA 2H71A 4GXZA 4EE0A 3BBYA 2H19A 4MCUA 3UJ1A 3CSIA 3FZ5A 2IJYA 1A23A 1SD9A 1GH2A 6GSTA 3FZAA 3ZRDA 4L5OA 1K0AA 1TRVA 1R5PA 1THOA 5F05A 5CAXA 1GTAA 4PURA 2DJJA 3DEXA 2K6VA 2VAFA 1M7TA 1WMJA 4IS0A 3MSZA 1TK8B 2I4AA 3IDVA 1YEPA 1OAZA 3TKRA 1ACVA 2XBIA 4GCIA 5HQPA 4N0ZA 3ZMKA 3HKRA 2HSHA 1JLWA 3GL5A 2FWFA 3LWAA 1WE0A 2V1MA 4IP6A 5LNKe 5HFGA 3CMIA 4FYBA 2DJ3A 2G0FA 5DJLA 4DVCA 1ABAA 4GWRA 1IYHA 1AXDA 2VL3A 2C0EA 2VUPA 5ECMB 4KCEA 1Q98A 5GSSA 2H0HA 4I8BA 5ABRA 2M72A 2C0FA 2GSRA 2DMLA 4E8HA 1W4VA 2FCHA 3LFLA 4V2LA 2TIRA 5ENUA 4IP1A 2P5QA 4RI6A 1K0MA 4WBJA 3EURA 2AAWA 1R26A 2AJQB 5GAND 2OA7A 1U87A 2C0GA 5J5NA 3HY2A 4QQ7A 2PUKC 4PNGA 3U5RE 1DSBA 1WOUA 1YJ6A 4HOJA 3GUSA 2OBIA 2VL9A 1B4QA 4OO4A 1FG4A 3M9JA 4MH2A 1OC9A 1NSWA 3TDGA 5ECHB 3V1WA 1A2JA 2XHFA 4I97A 4I2TA 1C72A 5G5EA 4GSTA 3G7YA 1TK0B 6GSXA 2WULA 4HI7A 4ZL9A 4KGIA 1YKAA 4I6XA 4GSSA 3D0ZA 2L5OA 3LYPA 4OMVA 2PU9C 3GRXA 3F4SA 4KA0A 3EWLA 4L0UA 4JZQA 2R4VA 6GSSA 3GKNA 2L57A 3LGCA 5CYYA 1ZYQB 4OD7A 4LMVA 1XBSA 4ZB6A 1O8XA 2YANA 4K0GA 3BJ5A 5KN0A 1B4PA 2ES7A 3W8JA 1XOBA 5ECKB 2YWIA 1FB0A 1MEKA 1YQ1A 1OE7A 4GSNA 4O5RA 2IMFA 1X9SB 1YKCA 3AY8A 2MBTA 5CRGA 2C0DA 3IK9A 4LLRA 4CHSA 1F37A 4FO5A 1GTBA 3ERGA 2C3NA 3Q18A 3VI5A 2WRTA 3KEBA 4DSRA 4K0NA 2K9FA 4Q5QA 3A3TA 1TXXA 1TJDA 1KNGA 2LJKA 4PQ1A 4WXTA 4PX1A 1AIUA 2VCQA 3P90A 4OFMA 4MABA 3WD6A 4MP4A 1GLPA 2OADA 3KH7A 2R37A 5E59A 4I2UA 2KUCA 1JHBA 3IRAA 3L9VA 2VCWA 4POKA 4ILFA 4YAPA 1GTIA 1Z6NA 2ALBA 3HCZA 1HNBA 2X8HA 2R3XA 4LL4B 5COHA 1V2AA 3P8WA 5INYA 5J3RA 2GSTA 1O81A 1TKDB 5GSTA 2V2GA 5ID2B 2JSYA 1SJZA 1N8JA 1F3AA 5CRWA 2VCTA 4LMWA 5J4UA 2O8VB 1NW2A 3GH6A 3GIXA 3RAZA 1GNWA 2LQOA 4EUYA 1O85A 3DVXA 5LD0A 3UVTA 4J57E 4X43A 1ERUA 2H8LA 1XVWA 2EIRA 1SJIA 4EDYA 3BD2A 5E4WA 1TDIA 1E2YA 1F9MA 3QAVA 2V6OA 2PGTA 2GQMA 1XPVA 4RI7A 1ZZYA 3H93A 4TR1B 1CQGA 1GWCA 1A8LA 20GSA 2HRNA 5DJMA 2LUSA 1VGLA 2OKAA 2LRTA 2NTOA 2GLRA 3IK7A 2I1UA 5JCGA 1WRYA 1T4YA 3TB2A 3LYKA 3MNGA 3KGKA 2IMIA 1B8XA 1EP8A 3D4MA 3L4NA 4OFNA 1AW9A 3PH9A 17GSA 5C04A 4ZB8A 4HU9A 1HQOA 4ZBDA 1JZOA 3O3TA 1YDKA 2K8SA 1SJ6A 3F6FA 1K0OA 3KD0A 1Y6EA 4WR5A 2FWHA 1U3AA 1OC3A 4FIWA 4BVXA 3TKQA 3M3MA 2H6ZA 4MZBA 8GSSA 4TXOB 1EZKA 2I9HA 2P5RA 2DJ1A 1SL0B 2P0GA 4ML1A 4HUAA 1MDIA 3R2QA 2YCDA 3GX0A 16GSA 2GZYA 1KBNA 5DCHA 1G6YA 1THXA 5F8BA 1XZOA 3G7IA 1SL1B 1O7UA 5IOWA 3A2XA 2GSQA 2KP2A 5HR0A 4ACSA 5IMZA 1J9BA 4NMUA 1RW1A 2VCZA 1M2AA 1VF2A 3TJKA 1M2DA 1O6JA 3TRQA 2K18A 2ON7A 3DMLA 1BG5A 1HD2A 9GSSA 1GSUA 2E7PA 1GUHA 2I81A 2RLIA 4G10A 2H72A 1K3OA 1A2LA 1KTEA 1W89A 3O76A 5B6NA 1F6MC 3L78A 1XVQA 4OCFA 4OCEA 5G5FA 2H73A 1QXHA 4IELA 5ID2A 2F8AA 3ZIJA 4HQSA 3LQ7A 1BEDA 2F8FA 3EINA 4EXJA 5ECNB 4GF0A 4F2IA 4ZB9A 1B48A 2O87A 4POLA 5A4UA 3ZREA 3J7Yb 1X5CA 5IPHA 5IPGA 3N9JA 3J7Yk 1ERWA 4YQVA 4QL7A 4GTUA 3DGQA 2K8VA 1FVKA 10GSA 4NPBA 1V57A 4YQMA 1JZWA 2VLTA 22GSA 1I9DA 2F51A 3EU4A 1GSQA 3GX8A 3S9FA 2DJ2A 4HS1A 3N5OA 4FYUA 1DUGA 1PL1A 3IC4A 3CBUA 1WJKA 3WT1A 3KJYA 2H74A 1F2EA 2CT6A 4LA1A 4TR1A 4L8EA 3ED3A 1YF0A 3CRTA 2H6XA 2YZUA 4K7IA 4KUNA 1TRWA 3UEMA 6GSWA 4JR4A 5J41A 1X9WB 2EIOA 1O73A 4FYCA 2B5XA 2C3TA 5DALB 4QL9A 2LV3A 2MBSA 5JWQB 3CTFA 4EO3A 2GGTA 2HXKA 3QAGA 3C7MA 1BAYA 3KIJA 1TRUA 3FRCA 3HXSA 1QUWA 3A5WA 5H5RA 4MF5A 2N5FA 1Y25A 2NDOA 5IMAA 3ZLPA 2H70A 2WB9A 2LS5A 4MJEA 1GSSA 4OWYA 4YAVA 3HZ4A 4V2MA 2DMMA 1TTZA 1K3YA 1RQMA 4MDCA 1XWGA 2B1KA 4TXOA 2IWTA 3FR3A 3PR8A 4F03A 4P3YB 4ZL8A 2VL2A 5G1KA 5JWRB 4BWQA 3G9BA 3DWVA 3IV4A 4PXOA 4GRFA 4XS6A 3LXZA 3TRPA 2YZHA 3KP8A 1VRSD 4CW9A 3W8SA 3FEUA 1GUMA 1J0FA 2VLVA 3GKMA 4IBPA 5DCGA 5CO3A 2B7JA 3QDNA 4JRRA 1IYIA 1EOGA 4IQAA 2H30A 3H1NA 1AQXA 2KHPA 4I5QA 3TKSE 2VCVA 3ERFA 4RUVA 3UAPA 3MAKA 1URMA 2WZ9A 1V40A 1GSEA 1PN9A 1SK1A 4TVEA 3TOTA 3HA9A 5JWOB 2J9HA 4WBRD 4XS4B 1MD4A 2VD0A 3QD9A 4MH3A 3PGTA 4EKZA 2DSAA 1TU7A 1TI1A 3EMPA 2C8UA 3TJFA 4NAXA 1OE8A 3O6TA 2GVPA 3F8UA 1EV9A 5FHIA 4G2EA 5IQYA 5KN3A 2YP6A 1SENA 2D2ZA 3RHBA 4WEYA 2HLSA 4K2DA 2X99A 2IFQB 1XW5A 1V58A 2C1YA 2LSTA 3CRUA 2L6DA 1A0FA 4XHMA 3WGXA 4PGTA 3GSTA 2HT9A 4YQUA 5KEJA 5KN2A 12GSA 4K8MA 2LQQA 2VO4A 3C71A 4L0WA 3BOAA 5D9VA 4ZILA 3P2AA 3FW2A 2LKUA 4AGSA 3TKPA 3TJBA 5HFKA 3H4KA 4X0XA 1GL8A 5DVBA 3F6DA 3F4RA 3QOUA 3RBTA 1SYRA 1VF3A 3FZ9A 1B9YC 2CVBA 2IL3A 2B7KA 2H75A 5DBQA 4WKWA 1M9AA 1GSFA 3EU3A 3RHCA 3UOMA 2R5GA 1I5GA 1VF1A 3M8NA 2GT6A 1A2MA 4XS1A 2E2GA 2WFCA 4V2NA 4MF7A 2DC5A 5JCUA 3ZVJA 5KN1A 1XWCA 1G6WA 2B5EA 3ME8A 5DALA 3A2VA 2NPBA 2MMAA 2CA8A 3HDCA 4MA9A 2DIYA 4O92A 4Q5FA 3QPMA 2KLXA 3QAWA 3TJGA 4JR6A 4HDEA 4NHWA 3ME7A 3E0UA 2IN3A 4PQIA 5G31A 1XWAA 5IMVA 2GTUA 4JBBA 3IAS2 3KMOA 5DDLA 5F07A 2OJLA 3GURA 1GSDA 1TOFA 2GZZA 2FHEA 1F3BA 1SK2A 2V41A 5C00A 1H75A 3GV1A 1AQWA 3HVSA 2NVLA 5H5QA 18GSA 2GT5A 4ML6A 2YWOA 3QFAC 5J9BA 4WETA 4HJMA 5GZZB 1SKSB 2C3QA 1PKWA 2CVDA 2N5BA 3KM6A 3D22A 1EEMA 5IIZA 3GYKA 2GSSA 1UC7A 1DE1A 3I9V2 1BJXA 4POBA 4WF4A 4RQRA 1A24A 1TW9A 4JE1A 1K0CA 1A0RP 2A2RA 2GS3A 2FA4A 4MPGA 3UMAA 2HZEB 2BJXA 2HSYA 4KH7A 1WIKA 2HI7A 4CDOA 2DJKA 4K6XA 1E6BA 1XW9A 3LJRA 1O8WA 2RUEA 5F0GA 3IPZA 4MK3A 5ECIB 3WT2A 3DRNA 3TKSA 2RUFA 3IBHA 2LEGA 1BX9A 1WWJA 3L9UA 4MJBA 4BVYA 3VWVA 4XS4A 1T8EB 1TU8A 3ZMLA 3F0IA 4ID0A 3G7JA 2VD1A 3GL3A 3H79A 3SWLA 1USBA 4G19A 2IPAA 5DQSA 1G7EA 1PX7A 2H0GA 3WGDA 1PX6A 2E0QA 2BTOT 4MLYA 4K7NA 1T1VA 3LSZA 4ZL7A 1Z9HA 1B9XC 2H66A 1GTUA 2CV4A 3VWWA 2YWNA 3FKFA 4K1FA 3KXOA 3C1RA 5EY6A 3US3A 1ZGNA 2O85A 2IFQA 1ILOA 5DQYA 3KP9A 1EGRA 1GRXA 4NWYA 1X5DA 4PUFC 2IMDA 2R2JA 1HYUA 3QCPA 2V32A 2LJAA 3DD3A 1U88A 1XFLA 5EPFA 5IO0A 5ECQB 2L4QA 1FAAA 3FZ4A 4ECBA 5DAKB 1XWBA 2N5AA 4IQ1A 3EC3A 1FO5A 5D96A 2NBSA 4HJ2A 3F3RA 1UA5A 2O7KA 1JZRA 1LU4A 5IO2A 4H86A 4IJ3A 4NV5A 2GZPA 4ZXGA 3IHQA 3I43A 3VPQA 3U6VA 4D73B 4IKHA 2TRCP 5JCWA 4IHUA 4FH8A 4KCAA 3TJJA 4K7OA 3IXRA 1TI3A 1OC8A 1XCCA 5ECPB 1T4ZA 1XXUA 1MTCA 2JZSA 4IGJA 4NV2A 3ZYWA 4DSQA 3C73A 7GSSA 3W6GA 4JU5A 3HJPA 2H1AA 2JL4A 2RIIA 2P31A 2WS2A 4KX4A 4N0VA 1ML6A 1J08A 3VPTA 4XTSA 3WGEA 2AYTA 3TRXA 3CYNA 1T7PB 4TXVA 5D9XA 2CAQA 5D93A 2OACA 2X8CA 3PINA 2QKEA 4PUAA 5ECRB 2B6MA 5D73A 5G2ZA 3ZL5A 1MD3A 2B1LA 2XPEA 4Q5RA 3ZITA 1GSYA 4ZBAA 5CREA 2VIMA 3CSJA 1ERTA 3RDWA 3FR6A 4N10A 5G1LA 4MJCA 3MDKA 3HHVA 4DEJA 4DSSB 4N30A 1N2AA 3UIWA 2HNLA 4V1Ap 2HZEA 3C8EA 2JSZA 2DIZA 4KNDA 2LNTA 4EDZA 5A5KA 3ZFLA 2YJ7A 2QSIA 2XBQA 1OKDA 2QC7A 1Z6MA 1UN2A 3EYTA 4MZCA 3D21A 4TW5A 1Z7RA 5ELAA 2M46A 3APSA 1PL2A 1CQHA 3F4TA 3HVXA 2LJRA 2YNXA 3D4TA 2VOCA 5AN1A 4F82A 2VM2A 2GQKA 3GMFA 3M9KA 2CZ3A 2GQLA 2XC2A 3ERWA 1A8YA 1FB6A 3UVHA 1GP1A 2OBKA 4NXIA 2F3MA 1X0RA 4XRDA 4J56E 1PMTA 2MYGA 3QMXA 4KDYA 3OR5A 2F9SA 1SL2B 3BCKA 5AIXA 1XW6A 3P7XA 5DAKA 3HJOA 1SKRB 3TUEA 2H76A 3EMXA 3D6IA 2RM6A 2EIQA 1EV4A 5CP1A 3VK9A 3RPNA 1G0TA 2EC4A 5AIVA 4D73A 2YOIA 4F0CA 3VWUA 4HZ2A 2PN8A 1AC1A 3VFIA 1JLVA 1R7HA 3GFKA 1ST9A 3D5JA 3HYPA 1FW1A 4GQFA 4LL1B 5ECSA 4KSMA 2I3YA 2DLXA 5HR1A 2X8GA 2L59A 2YV9A 2PVQA 2AHEA 3DVWA 3VWXA 1ZOFA 4G9HA 2CX3A 2GDRA 1PA3A 4PQHA 2MMOA 1K0NA 2Z9SA 5L71A 2JACA 2MMZA 2WJUA 1R4WA 4HZ4A 5AISA 5B6MA 4KDXA 1JFUA 1NM3A 2LRCA 2H6YA 3FHKA 2FUG2 5D9TA 1PGTA 2HFDA 2M80A 2XPDA 4GLTA 3KZQA 5CRDA 2VLUA 1ZCPA 2PMTA 1BQ7A 4NHZA 2YPMA 3KTBA 5IM9A 3APOA 4HU7A 2L4CA 1OYJA 1ERVA 1PD21 4AJ8A 3TCOA 3HD5A 4EVMA 5G30A 5H5SA 3EE2A 3CSHA 1PQNA 2FGXA 2H1BA 3QFBC 2L6CA 1UVZA 2LRNA 4ECCA 1U6TA 3TOUA 3VURA 4OO5A 1OKTA 4O32A 2VCXA 1M9BA 1WPIA 2E2MA 4ZBBA 3GKKA 4DSSA 3I69A 3NZNA 1Z7PA 2PVOC 3LEFA 1V9WA 5EL8A 1QGVA 1OVNA 1H4OA 3TGZA 1YF1A 1SU9A 5A4VA 4HEA2 3E9JB 4IVFA 2IMEA 5D8IA 4GQCA 1XIYA 4ISDA 1XWKA 3LORA 2J23A 2MZCA 4KSOA 3WYWA 4EF0A 1EEJA 3FK8A 1GLQA 3A2WA 4X1UA 2B5YA 3M0FA 2CQ9A 1K0DA 19GSA 1NHYA 1MDKA 1DBYA 2DBCA 4Q5NA 3GNJA 4KAEA 4N11A 4XIHA 2HRFA 1VF4A 3FR9A 2CZ2A 4ZIJA 2B3SA 3NIVA 4TOPA 5B8BA 2BMXA 2JZTA 2YWMA 3IR4A 2VM1A 1GUKA 3FY7A 2RM5A 5IMFA 5IOXA 1BYEA 4ECJA 4IN0A 1U3IA 4KB3A 4TN8A 1PKZA 3CTGA 1XOAA 3GA4A 3MWHA 4K9ZA 2O89A 4TR4A 2FA8A 2HYXA 1TP9A 1LBKA 4Z7XA 1NHOA 1TK5B 3IOSA 1RK4A 5IMCA 2FWGA 4AF2A 4RQXA 1EGOA 2H1DA 4IW9A 4MJAA 14GSA 2KP1A 4MMMA 5GAPD 5D9WA 3KMNA 2VL2C 1SKWB 3DIEA 5IMDA 1S3DA 3QR6A 2CX4A 2FNOA 1AQVA 1TRSA 2OE3A 1FHEA 3DYRA 2FY6A 4PNFA 3I6AA 2R6KA 3GTUB 5B8AA 4IJIA 3HVVA 3L9SA 3UBLA 2ZUPA 2PERA 1MDJA 2YV7A 4HQZA 3VI7A 1KEBA 1Z3EA 2ON5A 11GSA 3EVIA 3BCIA 1ZMAA 2TRXA 4TRXA 3NOFA 2C80A 1K0BA 1SD8A 3HZ8A 2CVKA 1PRXA 1S3AA 4MZWA 3DKSA 3F3QA 4KW6A 1T3BA 4J2FA 3ISOA 5AGYA 1HNCA 3K8NA 1X5EA 2A2SA 2AB6A 3ZVJD 4WR4A 6GSVA 6GSUA 5ECLB 2G2QA 3H8QA 2QGVA 2LTKA 3IAM2 4O7HA 1PSQA 3RPPA 2PBJA 4BWSA 4EL1A 4KE3A 3GKXA 4TR0A 5HR2A 1QMVA 1FOVA 3LXTA 3Q19A 3GSSA 3E3EA 3GHAA 4WF5A 2WDUA 1EP7A 1V98A 2C4JA 4F9ZA 3IE3A 3IA1A 5ELGA 1QK8A 2H01A 3JCML 5ECOB 2L5LA 4TR3A 1ZL9A 2PPTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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