5IIZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f0
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. raphani 756c
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iizA00
4PUFC 4MP4A 3O76A 4WF5A 3F4RA 2GSTA 2H6YA 6GSUA 1A23A 4GXZA 4EO3A 4MA9A 5AISA 4OO4A 2E2MA 4L0WA 5CAXA 4QL9A 2ZCTA 2OA7A 4D73B 4YQMA 1Z9HA 3PH9A 3TKRA 1ERUA 3G7JA 4EKZA 2CAIA 1A2JA 2B1KA 1RQMA 2GZZA 4I2UA 1FHEA 5E59A 3DWVA 1OC8A 4DSQA 2G0FA 1XWGA 4HOJA 5LD0A 1AUCA 4PQ1A 3WT2A 2DJJA 2HFDA 4JEDA 3UEMA 3N9JA 1T00A 1FB0A 3UMAA 2G2QA 4GF0A 1WPIA 3FR9A 4ECJA 5KEJA 2M46A 2GZPA 3IA1A 3M3MA 2M72A 5EPFA 4MF6A 2DJ3A 2MBTA 4WBRD 1TK8B 5JWRB 3D5JA 2GLRA 3F6FA 1XW6A 1TRSA 2L5OA 5ECKB 2I3YA 1JLVA 2NBSA 1V40A 3M8NA 2O7KA 1N2AA 1ZOFA 3J7Yk 4AJ8A 2LKUA 4JRRA 4JU5A 2RM6A 3H1NA 2HRNA 3E0UA 1ML6A 3IK7A 3GSTA 2H76A 3ERGA 5IMDA 4Q5FA 1QUWA 1PRXA 1Z6MA 4GQCA 4IELA 2PWJA 1A0RP 4ULXA 2F8AA 2R37A 2EIRA 5ELGA 1R5PA 1S3CA 4ZILA 1GSEA 4XS4B 2H72A 2H1DA 2DJ0A 1F2EA 2I1UA 1EGOA 2I81A 3CRTA 3FEUA 2AB6A 2XBIA 3GKNA 1XFLA 3QAVA 2K6VA 4N30A 5J4UA 1Z3EA 5EL8A 2GVPA 1V2AA 2B1LA 1GUMA 4X43A 4OO5A 5G5EA 1MTCA 4KCAA 3QFBC 4NMUA 2WGRA 4K7IA 1ZMAA 1FG4A 2DLXA 3KCMA 2WB9A 1K0OA 3SBCA 2KUCA 3LORA 3F8UA 5ECRB 4TN8A 5C00A 1GTBA 1YKCA 2GT6A 6GSXA 3F63A 1XW9A 5AIXA 1UC7A 5INYA 5G30A 1ZYQB 2LRNA 4WF4A 1GNWA 4ZL7A 2B6MA 4ZBDA 3LYKA 5HFKA 3HCZA 3TRQA 1N8JA 2DJKA 2I4AA 2NPBA 2D2ZA 1CQHA 2VLUA 4KH7A 2V1MA 5D9WA 3GV1A 3E9JB 3LXTA 5JCUA 5DALB 5IM9A 3A2WA 4RQXA 1OKTA 1A8LA 3CSHA 5G31A 1T7PB 4GRFA 1DE1A 5A4VA 2VD0A 2AJQB 2ES7A 3ZL5A 5AN1A 2AUVA 3UL3A 6GSYA 3FY7A 3PR8A 1EEMA 4HQSA 2V32A 4MZBA 3FR6A 3GN3A 4K8MA 1QQ2A 4ZB8A 5CREA 3CSIA 3R2QA 4EF0A 1F3BA 3HVSA 1TRWA 4EL1A 1W4VA 5KN2A 2HSHA 2EIOA 2V41A 2CAQA 3GKXA 1WP0A 3PGTA 3GSSA 4IW9A 2JZRA 2AAWA 1ON4A 4OD7A 2C0GA 1EV4A 2TRXA 2LRCA 4TKYA 2E0QA 1TRVA 1NHOA 5D8IA 1AW9A 4RUVA 2N5BA 3LJRA 2YJHA 4GLTA 5ID2B 2L5LA 2DMMA 4MABA 3IC4A 5FWGA 5F0GA 4WETA 1OE8A 7GSSA 2XHFA 1CQGA 1RK4A 1XWAA 1H75A 2E7PA 2GQLA 2B7KA 3D4TA 2VCVA 2KP1A 2V6OA 4F0BA 1TRUA 5DQYA 1BEDA 3ZFBA 4MJEA 2KP2A 4FIWA 3RPNA 3TRXA 1LJRA 2HI7A 1MDJA 5COHA 2VLTA 4MK3A 2WS2A 3QOUA 2HRFA 2VM2A 1VF2A 1FVKA 3H4KA 1V57A 2YANA 2KLXA 4KCEA 3TB2A 4EDZA 2I9HA 4N10A 1E6BA 5F06A 1U3AA 1WIKA 1TU7A 4WR5A 5B8BA 2VM1A 2YJ7A 1LU4A 4DSRA 3P2AA 3ZYWA 2DIZA 1PKZA 2OBKA 1GUHA 3TJKA 3GL3A 5IPHA 3LG6A 2X8HA 1XZOA 2RUFA 3TOUA 4NV2A 3A2VA 2GSSA 1SYXA 1SENA 4KSMA 1F37A 2RLIA 3EMPA 2IMIA 2C8UA 4K7NA 3H79A 1K3OA 5LCZA 3FZ5A 1TJDA 1O73A 2YN1A 4ISDA 1PMTA 2AV4A 3RDWA 5AIVA 1B48A 4YH2A 2PUKC 4GQFA 2J9HA 1ZGNA 5J5NA 1XOBA 1SKWB 5F07A 4PURA 4ECIA 2JACA 4MMMA 5L71A 5G5FA 1AQWA 2LV3A 5ECNB 3ERFA 3C1SA 4YAPA 1M9BA 3KMNA 2H8LA 5F05A 4I97A 3BD2A 3C71A 3DIEA 1GLQA 1V9WA 4HUAA 1KNGA 1SKSB 5ECLB 3F3RA 1YQ1A 5IMAA 1QFNA 4POBA 3UARA 4Q5RA 3UBLA 2A4VA 3HHVA 2RIIA 1FOVA 2F9SA 1GSYA 5CNWA 4G9HA 2CVDA 2IIYA 4F9ZA 3APQA 2DSAA 3KP9A 1XW5A 3P7XA 1JZRA 1GTAA 2B5XA 4IVFA 4XIHA 3VPQA 1U6TA 4YQVA 5JWOB 2YV7A 3HJPA 2K8VA 4GSTA 2FWHA 2LNTA 3KMOA 4IJ3A 4KGIA 4FO5A 1KEBA 3ME8A 1EEJA 3F0IA 1USBA 4EC0A 5IMFA 2KOKA 2N5AA 3ZITA 5A4UA 4I5QA 3GX0A 4LA1A 4L0UA 2LQOA 3APOA 5HR1A 1DE2A 4BL7A 1SL1B 4HEA2 3VWXA 3QPMA 1M2DA 4PGTA 4ML1A 4X0XA 2FNOA 1OKDA 3FKFA 3I69A 2H30A 10GSA 3GTUA 4KDYA 4KX4A 1GSSA 3KP8A 5GAPD 4ZB6A 1SL0B 3PINA 2O87A 3UBKA 3MWHA 1M99A 4I8BA 4HU9A 2R2JA 4Z7XA 4KAEA 22GSA 3L9VA 4O7HA 5JCWA 3DRNA 2N5FA 4PNGA 2ON7A 2FY6A 4ZL8A 5J9BA 4FYBA 4G10A 13GSA 1SK1A 3HZ8A 1AQVA 1WJKA 4PQHA 3EU3A 4WR4A 3ZREA 4O92A 5KN1A 2E2GA 4HJ2A 5ELAA 2YP6A 4GTUA 3VURA 1BX9A 3EC3A 1YF0A 1FVJA 1GTUA 2X8CA 2LJRA 1O8WA 1J9BA 1XBSA 2L6DA 1X9SB 5GZZB 3MAKA 4IP1A 2YNXA 2BJXA 1LBKA 1PD21 1MEKA 2A2SA 3GX8A 1U3IA 4LLRA 2GQMA 3F4TA 3HA9A 1TK5B 4X1UA 2MMNA 2YPMA 4QQ7A 3QCPA 4OWYA 3GH6A 5GSTA 1T3BA 1JZDA 3KD0A 1GH2A 5HR2A 4F2IA 5CRDA 1E2YA 1H4OA 2H6XA 1A0FA 1WOUA 1IYIA 4TR3A 4BVXA 1ZL9A 2FA4A 4HZ2A 1EV9A 1XPVA 2K8SA 3ME7A 2B7JA 1T4YA 4HQZA 1PGTA 5D9TA 5H5SA 3ZFLA 2R4VA 4IGJA 4KDUA 3GYKA 1T1VA 2WFCA 1PQNA 1X5CA 2QSIA 2OE1A 2WCIA 5B6NA 3RHBA 2EC4A 1OC9A 4G19A 2VL2A 4K0NA 4WBJA 1T4ZA 1MDIA 3O3TA 1MD3A 4FH8A 4NPBA 4BPYA 2B3SA 1WMJA 2P5RA 2FGXA 1SJ6A 1R7HA 4MZCA 5ECHB 2O89A 2OBIA 5DDLA 3ZZXA 3KZQA 5DCHA 1EOHA 2CVKA 2XC2A 1O7UA 2L6CA 1QK8A 3EINA 4MLYA 1SL2B 5LNKe 1HNAA 4TXOA 1Z5YE 1HYUA 2YCDA 3A2XA 1S3AA 1K3YA 3S9FA 4MZWA 3IBHA 19GSA 4HZ4A 3BBYA 5A4WA 1HNCA 1K0MA 4F03A 4ID0A 3N5OA 3HZ4A 2EIQA 3KM6A 2CT6A 3HVXA 2CV4A 1DSBA 5IO0A 4L5OA 1EP7A 4K2DA 2JL4A 1GUKA 2TRCP 4PUAA 1JFUA 4TW5A 2XPDA 3D4MA 5HFIA 1UVZA 2LTKA 3FYGA 1K0BA 5DQSA 1SU9A 3KTLA 2OE0A 2LUSA 2FWGA 3ZVJD 4JBBA 3LXZA 4EE0A 3ZLPA 3LQ7A 4TR4A 2BMXA 3TJBA 14GSA 4V2MA 4N0VA 1TP9A 4AJ6A 2YV9A 4DVCA 4NWYA 4GCIA 1WRYA 3RHCA 1J08A 1S3DA 4V2LA 1GTIA 2NDOA 4PNFA 5IIZA 5FT3A 4IP6A 2ON5A 2XBQA 6GSWA 1AC1A 2GTUA 2H71A 4XS6A 1EOGA 2LNSA 1NHYA 1R4WA 4ZL9A 1YEXA 4KB3A 1GLPA 3DVXA 4FYCA 4GSNA 4AGSA 4IN0A 4Q5QA 1XCCA 3DYRA 4TXVA 1TW9A 3EYTA 2H0IA 2H1GA 3DVWA 4DSSA 1Z6NA 2OADA 4MF7A 3IRAA 3G9BA 1T8EB 1A2LA 5CRGA 3QMXA 3HJOA 4TR0A 2HE3A 5G1LA 4KW6A 5DVBA 4MCUA 2R3XA 4RQRA 4J56E 4KSOA 1GP1A 3ERWA 5IQYA 4NXIA 2L59A 4V2NA 1PL2A 5J9CA 4CHSA 2QGVA 4TR1A 2QC7A 1ERTA 1A24A 3VWUA 5HR0A 2VL2C 1ERWA 4HI7A 1TXXA 2LJAA 1SJZA 3IAM2 3FZ9A 2VCQA 2MMAA 2CZ3A 5J3RA 4MJBA 3DXBA 2MZCA 3WD6A 4N11A 2L4QA 2OJLA 1UA5A 3I9V2 2AYTA 3FW2A 3A5WA 4MPFA 1OE7A 5ECPB 1BAYA 2VOCA 3C7MA 3GKMA 3F3QA 1YZXA 1DUGA 3RAZA 2FWFA 2LJKA 2PGTA 3GA4A 1A2MA 3HY2A 2DC5A 3L0HA 3M1GA 1VRSD 3OR5A 2KHPA 1XWKA 5EY6A 5CO3A 2H73A 2OE3A 3L4NA 4O32A 2VL3A 4ILFA 2FLSA 1THOA 1X0RA 3ED3A 2FCHA 3QAWA 2DJ2A 2C1YA 2IFQA 4OFNA 3C1RA 4I6XA 5IOWA 3FK8A 1VF1A 2VD1A 1B4QA 4TOPA 1A8YA 5DAKA 2J23A 2IMFA 3G7YA 3FZAA 3CMIA 4IHUA 4IQ1A 4NHWA 3TDGA 2B5EA 4G2EA 17GSA 2LRTA 3DGQA 4QL7A 1YF1A 3SWLA 3U5RE 1FW1A 3IHQA 1M0UA 2FA8A 3KXOA 3ZIVA 4OFTA 3WYWA 5FHIA 1EGRA 4XCSA 9GSSA 3WGXA 2VCZA 2RM5A 3V1WA 1IYHA 2OACA 1YJ6A 1KTEA 3US3A 4LMWA 3GTUB 4KNDA 5E4WA 2JZTA 4EDYA 5ECMB 2DBCA 3CXGA 2CA8A 1TTZA 3MNGA 3EURA 3UVHA 4YQUA 3Q74A 1GSQA 4IQAA 1O6JA 4MJCA 2VLVA 2VCXA 1YKAA 2L4CA 1UN2A 1ZCPA 4NAXA 1ACVA 5A5KA 2QKEA 1Q4JA 5J41A 3NOFA 2PVOC 2VCWA 3AY8A 4OCEA 3IR4A 2YOIA 2YWOA 3VI5A 2GS3A 2CX4A 3A3TA 2IN3A 4K7OA 2K18A 1Q98A 1HD2A 2JSZA 1GRXA 4PX1A 1MD4A 2ZUPA 5HQPA 4TRXA 1PX6A 3DMLA 4AJ7A 1GWCA 1EZKA 1ZZYA 3TRPA 1AXDA 1THXA 1B9YC 3HXSA 1M9AA 1PN9A 4MPGA 1PSQA 1I5GA 2HNLA 1GL8A 1AAZA 4KUNA 5DBQA 2WJUA 2H01A 2YZUA 3CRUA 3GHAA 1TK0B 2IL3A 1XWBA 3UAPA 5ECSA 2RUEA 2K9FA 3G7IA 3HKRA 3M9KA 1AIUA 1G0TA 2H74A 4ZIJA 2FUG2 3W8JA 3TCOA 1C72A 3TKSC 1QGVA 3HYPA 4F82A 1FB6A 6GSSA 2YWIA 4K1FA 3U6VA 3W6GA 4RI6A 2VAFA 2JU5A 3TJGA 4MJAA 2H1BA 2XPEA 3TJFA 2HZEA 2Z9SA 3TUEA 5DJLA 3HD5A 4F0CA 1K0CA 3GKKA 3CSJA 5H5RA 1PA3A 3F4SA 5ENUA 3KGKA 3WT1A 3VLNA 3ZTLA 1XVQA 3BJ5A 3GURA 3GUSA 1K0AA 1OC9B 3O6TA 1TDIA 4POMA 12GSA 3VWWA 3RBTA 2CZ2A 2F51A 3CYNA 1B4PA 3C8EA 5AGYA 1TI1A 3IXRA 4I2TA 1X5DA 2VL9A 4JZQA 4J57E 3I6AA 3I43A 4GWRA 3EU4A 3E3EA 1JLWA 4EVMA 1M2AA 4TXOB 3EMXA 3FHKA 3D6IA 5D9XA 4L8EA 5DJMA 3TGZA 1O8XA 3BCIA 1SYRA 3F9UA 1W89A 4D73A 2PVQA 1SK0A 1G6WA 1ERVA 2LS5A 5C04A 1OVNA 3HVVA 4FYUA 4L5LA 3Q6OA 3CBUA 3VFIA 3HJMA 4HS1A 3LEFA 1XOAA 4K6XA 4HJMA 2H75A 2ZNMA 1G6YA 2F8FA 2M80A 4DEJA 1ABAA 1Y25A 2PMTA 1K3LA 3WGDA 3GH9A 5EVOA 1YY7A 1VF4A 4PQIA 5CRWA 5GSSA 3IPZA 3P90A 4IS0A 3M9JA 4KE3A 5IPGA 3BCKA 1B9XC 2IMDA 3JCML 1M2BA 5KN0A 3H8QA 4AF2A 4MH2A 4RI7A 2PBJA 5JWQB 3QR6A 4POLA 4JE1A 2MBSA 1X9WB 2MMZA 4V1Ap 4LL1B 5HFGA 1X5EA 2JADA 1VF3A 2F3MA 1V58A 1WE0A 1JHBA 1R26A 2VCTA 5CP1A 4KDXA 1G7EA 2X99A 1F6MC 2FWEA 4EUYA 4P3YB 3KEBA 3TOTA 5CRHA 1NM3A 4ZB9A 1OAZA 2CX3A 4LL4B 1X9MB 1VGLA 4DSSB 3IAS2 1K0DA 2R5GA 3M0FA 4POKA 3QD9A 2O85A 1XXUA 1B8XA 3EVIA 5KN3A 4XS4A 3J7Yb 2WZ9A 2L57A 5HR3A 3GMFA 2C3QA 1KBNA 1XWCA 4ML6A 4OCFA 4ACSA 5ABRA 4XTSA 2X8GA 2GT5A 3KH7A 5ECQB 3IOSA 5F8BA 5ECOB 8GSSA 3UOMA 1O85A 4MF5A 3IK9A 1RW1A 1FO5A 4E8HA 4TR1B 5B6MA 4XHMA 3LWAA 1GSUA 3QFAC 4LMVA 2HT9A 3LFLA 3IV4A 1SD9A 3TKSE 2H70A 1PKWA 2H19A 2VO4A 1WWJA 5DCGA 5IMZA 4OMVA 2JSYA 3BOAA 4V1Ag 3ISOA 2C4JA 1ILOA 3C73A 2TIRA 1BQ7A 2GZYA 1PL1A 1U88A 4CDOA 2ALBA 2HSYA 3W8SA 2DIYA 1JZWA 1Z7RA 2H1AA 4YAVA 3UVTA 3KTBA 2CQ9A 2HZFA 3GRXA 4MDCA 1HQOA 3FRCA 2HYXA 2H0HA 2FHEA 2YWMA 1SKRB 4XRAA 5DALA 3VPTA 1OC3A 3F6DA 4E8EA 1F3AA 5D73A 4XRDA 1O81A 1Z7PA 3ZMKA 1YDKA 1HNBA 5IOXA 1J0FA 1R5AA 1M7TA 1SJIA 3H93A 3KIJA 2WULA 2PERA 2NTOA 3TKPA 2WRTA 2C0DA 4K0GA 16GSA 4Q5NA 3GFKA 2X64A 2IFQB 3DD3A 1U87A 4WKWA 3UIWA 1EWXA 3KH9A 2V6KA 3VK9A 3LGCA 1GNEA 6GSVA 5DAKB 3TKSA 5D9VA 1SD8A 1Y6EA 20GSA 1TI3A 2NVLA 3D22A 2H6ZA 2LSTA 2IJYA 3GNJA 1BJXA 5D93A 3L9SA 4WXTA 3DKSA 2P31A 2LQQA 3L9UA 3FR3A 2DMLA 4BA7A 4H86A 2PPTA 5H5QA 2OKAA 1YEPA 2VIMA 2REMA 3TJJA 1NSWA 1URMA 4OFMA 5ID2A 3APSA 1GSDA 1AQXA 2IMKA 1V98A 1G7OA 4TVEA 5IO2A 3NZNA 1QXHA 2H0GA 3RPPA 3ZVJA 2YZHA 4WEYA 2IWTA 3MDKA 4N0ZA 2P5QA 4BWSA 4JR4A 3NIVA 4BWQA 4O5RA 3UJ1A 5IMVA 1SK2A 2C3TA 3P8WA 3EE2A 2HXKA 5CYYA 1MDKA 5GAND 1TKDB 4HDEA 2C3NA 1BYEA 2C0FA 1JZOA 2GDRA 3IDVA 3Q18A 3D21A 1ST9A 2MYGA 4K9ZA 3VI7A 2GSQA 2LEGA 2IMEA 18GSA 2MMOA 6GSTA 2GGTA 4IBPA 3CTFA 2VUPA 4EXJA 4GSSA 3MSZA 4KA0A 3ZIJA 4PXOA 2BTOT 11GSA 1BG5A 5G2ZA 2JZSA 1FAAA 4ECCA 3LSZA 5B8AA 3QAGA 5G1KA 2H66A 1QMVA 2B5YA 2C80A 2CVBA 4BVYA 3ZMLA 1TU8A 1NW2A 2IPAA 2O8VB 3IE3A 4HU7A 2P0GA 2WDUA 5JCGA 1DBYA 1PX7A 4NHZA 3KJYA 1XVWA 2R6KA 3VWVA 2GSRA 1ZYEA 4IJIA 5D96A 3K8NA 3WGEA 4MH3A 4NV5A 3Q19A 3EWLA 1XIYA 4ZBBA 2AHEA 2HZEB 1GSFA 3TKQA 3D0ZA 5IMCA 4ECBA 3FZ4A 2YWNA 4J2FA 3CTGA 1TOFA 5ECIB 2PN8A 5B7CA 1EP8A 1K0NA 2A2RA 3HDCA 3QDNA 3GIXA 1I9DA 1GULA 3L78A 4ZBAA 3DEXA 4XS1A 2HLSA 3GL5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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