5IKBA

Crystal structure of the kainate receptor gluk4 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
TLVVTTILENPYLMLKGNHQDMEGNDRYEGFCVDMLKELAEILRFNYKIRLVGDGVYGVPEANGTWTGMVGELIARKADLAVAGLTITAEREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIESVDDLADQTAIEYGTIHGGSSMTFFQNSRYQTYQRMWNYMYSKQPSVFVKSTEEGIARVLNSNYAFLLESTMNEYYRQRNCNLTQIGGLLDTKGYGIGMPVGSVFRDEFDLAILQLQENNRLEILKRKWWEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Structure of a High-Affinity Kainate Receptor: GluK4 Ligand-Binding Domain Crystallized with Kainate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 4,Glutamate receptor
total genus 82
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA02
2DOJA 4LZ8A 1VFEA 1SQYA 2OK2A 2DWAA 3KOTA 3LR1A 5CBRA 1IXGA 3HV1A 5FHNA 5KDTA 1IIWA 1LB9A 3UK4A 4EF1A 5JK4A 1CE2A 1LFHA 1YAEA 4FORA 1GGGA 2F5XA 2I3WA 2Z8FA 1XHYA 2B3FA 2V84A 4LP2B 3DP6A 4YKJA 4PE5B 5H8NB 4X1BA 2XXRA 2D21A 2P0SA 2O6AA 2Y7PA 3IB1A 4RY1A 2VOZA 4YB5A 2XXWA 4KD5A 4ELRA 2Y7RA 1FQAA 3DP8A 4LZ7A 1SI1A 2ONKE 1N04A 1US4A 2UVIA 2ZYOA 4O3BA 1A55A 2XXVA 2Z8DA 3KN8A 4E0XA 3GLBA 3PMVA 4PQJA 1M5BA 2Y84A 3C35A 4MF3A 2NWJA 4IO4A 1Q35A 4I8CA 4THIA 4QSEA 1PDAA 1N7XA 1MY2A 4ZEKA 1BIYA 3VFJA 4H5GA 1Y3PA 3L6GA 2DQVA 3RTFB 3K01A 1A8FA 3HCQA 3O9PA 4QSCA 4OVJA 2ALUA 1DPEA 3PUVE 2ONSA 2F6PA 4OZ9A 4R73A 3K6UA 1URSA 3TYHA 1F9BA 5I57A 5DYHA 2CZLA 1I69A 3T9UA 3WAFA 4EXLA 4EQ7A 3VV5A 2UVGA 1MG1A 3V5AA 1DSNA 1NMUA 1QKBA 2AL5A 5I56A 1B3GA 4KR5A 4NWCA 5ITPA 3O66A 2BJJX 3S4UA 5H8HA 3PPRA 2PMSA 3PPPA 4FEDA 3S9MC 3KBRA 4IO2A 2ANJA 2GHAA 4RNSA 5TPAA 4FATA 4GFRA 1FQBA 1OQHA 2R9JA 3S9LC 1IZ1A 1SBPA 4Q8RA 1B7UA 1MQIA 4GL8A 3PPOA 2XX7A 4ONYA 4DXCA 3MVZA 1WDNA 2GHBA 4H8JA 4RPOA 2AL4A 1NNKA 2GH9A 3D4GA 1MXVA 3FXRA 4OYVA 3OEMA 5DEXA 5FHOA 5TPAB 2CMOA 5IAIA 2H9BA 4YB6A 5ISUA 3ZKLA 4YB7A 1LAXA 1A54A 3ZSFA 5AE4A 4RPNA 1Y1MA 2YJPA 1B05A 1JW5A 1XVXA 3OENA 5B7DA 4G68C 1QKAA 5I56B 1XT8A 1UTHA 2E1SA 2O84X 3M3LA 4M4GA 4O3CA 4QFLA 2QL3A 2HAVA 3N6UA 4ELQA 1DTGA 3DM0A 4IB2A 3MBPA 4DIGA 2HZKA 1RYXA 5KDTB 4NF5B 3Q28A 1H44A 4OMBA 3KJTA 4DCYA 4RA1A 1AMFA 4F19A 1UQWA 2V3TA 2A5SA 4LQ2A 3H3GA 4QSDA 2GRVA 3OO9A 3QSLA 4QFKA 3SEXA 1MQHA 3UN6A 4ZECA 5HM4B 5AA2D 3K00A 2IEEA 1FTKA 3B6TA 1NL5A 1GTKA 4U21A 1LAFE 3T66A 2NUVA 3HHGA 3OD7A 4F3GA 1B51A 3PV0E 4IO3A 4F2QA 2XXHA 4GXSB 4KCCA 3MZ9A 4FJPA 1MS7A 1DMBA 2UYEA 4FEBA 3CFZA 4OWDA 1ZBMA 3WAEA 2QS4A 3FV1A 3LBSA 1UIVA 3ODBA 4JSDA 1B3LA 1B52A 1HSLA 3FJ7A 3O6IA 4H8IA 2DWHA 2DYXA 2Z22A 4FECA 4OQOA 4ND9A 2GFEA 2I48A 3CSGA 3OXNA 4WKMA 2REJA 3EHTA 2O1LA 2RCBA 3LSLA 5CRYA 3RLFE 3TFLA 5CC2A 3OO8A 1R6ZA 3OMBA 3H6VA 2HXWA 2PT1A 4KHZE 4ZE9A 5ICTA 1IXCA 2YPNA 4BDOA 1RKMA 3KSJA 2XXXA 4G8HA 3S2VA 3KN3A 1OQGA 4X48A 3CIJA 3RQTA 2Q89A 3ILUB 4R72A 1OVTA 4F1UA 4YMAA 1A8EA 2O7IA 2DE3A 4G4PA 5ELVA 3U93A 5A5XB 2PVUA 2NVUB 3A3UA 4U4XA 1TWYA 3UORA 4NF4A 5F1QA 3CFLA 4MFIA 4QFPA 5I59A 2QJEA 5ICQA 3Q27A 4JWXA 3OSRA 3FV2A 4RK2A 1DOTA 4NF8A 2THIA 4G68A 4HCWA 3N6TA 3D4CA 2RKMA 4C0RA 4E0WA 1II5A 3DLNA 1VFDA 4LQ5A 2G93A 4NF6A 2UVJA 3O2AA 2M8CA 3V8XB 1TXFA 4TQUQ 3FJMA 4P0GA 3VXBA 4F18A 4OFJA 1RYOA 2XXTA 3LUYA 4QRZA 4OTEA 1L5TA 1CB6A 3R7XA 3SEVA 3TDJA 3U1OA 2I49A 1FQCA 3B6QA 4ZEBA 1I6QA 3EHUA 1LFGA 3MW0A 3VVDA 1OIBA 1ELJA 1ZIUA 4YKPA 1D4NA 1FW0A 1MPCA 3MAMA 2ESNA 5M2VA 4OHNA 3TUSA 4PETA 3FASA 1FCKA 1LGBC 1B3FA 1EZ9A 2F36A 3C31A 3C32A 1B5JA 2DS9A 2H5YA 2F7CA 3C34A 2FYIA 1MY4A 1AIVA 3FVOA 4LA9A 2I6EA 3O28A 2I58A 4IGTA 4KI0E 2X7QA 4H65A 4LUBA 2RCAA 4G68B 4MBPA 1D3KA 2ZYMA 1OLCA 3OELA 5FTHA 3RNNA 4FIMA 1LB8A 3TODA 3TTLA 3QYTA 3PUWE 1URDA 1PBPA 1HSEA 1O63A 3FVNA 3C4MA 5TP9B 2VD2A 1SW5A 4P11A 4U2RA 5I2KB 5EHMA 1TFDA 3PGFA 4POWA 2ZYKA 3CG1A 4IO6A 4JB7A 5F7VA 2Q8JA 3RGYA 3MP8A 5H8FA 4X9TA 3T96B 4OXVA 4U23A 1POY1 4EF2A 3IB0A 4U22A 3IL1B 4KYEA 3CR9A 2QRYA 5H8QB 3IORA 3CG3A 3UGWA 2Q2AA 4JWYA 1LLSA 4JWOA 3S9EA 3FATA 3TPAA 2X26A 4NF4B 4TLMB 3A09A 2OLBA 1SDXA 3K6XA 4PFTA 1B9JA 4EQBA 4KYDA 3KN7A 3MPKA 3MZ1A 2NOOA 3G3FA 3HO7A 2UYFA 4U4SA 4Q30B 5DTBA 3G3GA 5JTYB 2H25A 3Q25A 4ELOA 1JEUA 4N13A 3H7MA 4JDFA 3M3KA 2F6GA 2OZZA 3UA8A 1URGA 1Y4TA 4R6YA 1MQGA 4BDMA 4R9GA 1JQFA 2RF1A 3PMXA 3R26A 4HS7A 3FZVA 1AH5A 4Z0IA 3VVEA 1WVJA 1IXIA 4F3PA 3VLWA 1JVXA 2PBWA 1B46A 4ZDMA 1B3HA 5I58A 3FGSA 2F34A 1ZJLA 3IOWA 4PFWA 1N0TA 2ZXTA 2V93A 2XD2A 3IOUA 5AA2A 3MC2A 1UTBA 3TEPA 1B1XA 1O64A 3H6UA 3FUZA 5H8HB 5EYFA 4H5FA 5FTIA 2E0SA 5L8DA 4DZ1A 2I3VA 2XHDA 4XKQA 1Z7ME 3EPEA 3OOAA 2IA4A 5EHSA 1USYE 4XKNA 1US5A 5AA2B 2VP1A 1BLFA 1ATGA 2V3UA 2HCAA 3OO7A 2RC7A 2XD3A 1FQEA 2HEUA 3IO6A 1XS5A 3KGCA 3MVWA 1SI0A 1PB9A 2Q88A 3QIMA 4I9DA 4UACA 4GVOA 2RINA 4HCYA 1PEBA 5DEXB 3K4UA 3RTWB 3E9XA 1XC1A 5CM6A 1S9TA 3FXQA 2XXUA 2XXYA 4GOTA 5I59B 1I6AA 4DXUA 4GD5A 3T9HB 4FE8A 3KSXA 3W15C 4BDRA 3TELA 4EQ9A 4M1VA 1FTOA 5H8FB 3TKDA 2PT2A 4QFNA 3TCGA 1A40A 1ZU0A 4JXIA 2R6GE 3V83A 3SETA 2UXAA 3H6TA 1R1NA 4LVQA 1PC3A 3MQ9A 4XKPA 5I2NB 1AL3A 1B7ZA 3B6WA 4ISUA 4U1OA 1GVCA 2F7AA 2OJTA 2RC8A 3K1PA 1N3WA 1QVSA 4HTGA 3G3KA 4IO7A 3MWBA 1BTJA 4HW8A 2F7BA 3FVKA 4I62A 4YICA 4YKKA 3IAZA 4YU0A 1N84A 3PD8A 4GXAA 3RT8A 3UP9A 1FTMA 4XTCQ 1P1WA 3I6VA 4K3FA 3GXAA 1OVBA 2AIXA 3I3VA 1Y1ZA 1HSJA 1LFIA 1JW4A 1LBCA 3QUFA 3FIRA 1EH3A 5DVFA 2A5TB 1B4HA 2I0BA 5CBSA 4JSOA 3T93B 1MH4A 3HHFA 3G3HA 1LCTA 4O3AA 1GV8A 5L9MA 1B6HA 2VGQA 3U94A 5BWJA 1FQDA 2PX1A 4G8NA 4OENA 4BLAA 1B4ZA 1B3EA 2Y7KA 5I58B 3FVGA 4RXLA 1LSTA 1IITA 1Y20A 3GBBA 4F31B 4RK9A 3LC8A 5AA3A 2VD3A 4LZ5A 2H98A 4ZEDA 3TCFA 2NXOA 1MY0A 4QF9A 3TCHA 5L9SA 1A99A 2KLFA 3IR1A 3K1MA 3KEIA 3MP6A 5TP9A 4AQ4A 1ANFA 1H43A 1Y4CA 3SERA 1O7TA 1TT1A 1VR5A 1A7LA 3RUMA 5KCJA 2Y7IA 4LONB 4RYAA 3K02A 3TTKA 3ZKKA 4BDNA 3C36A 2I0CA 3JV9A 4OFLA 4F2OA 4DCXA 4PP0A 3KOSA 4NTLA 1N3XA 2QPQA 4C1TA 1BKAA 3ONMA 2O51A 1UIUA 3K6VA 1JETA 2UVHA 4TOZA 4ZE8A 3TTNA 4G77A 3K0VA 1OLAA 3CI8A 3MVYA 1VSOA 4KCDA 4OETA 3IK6B 2W7YA 4P0IA 1SW2A 4F39A 2F35A 2XXQA 4F22A 3L6HA 5TU0A 4U1ZA 4LATA 3C9HA 1SW1A 4I1DA 2FNCA 3LSFB 1EU8A 3PUYE 3TAJA 4BDLA 4F29A 4EXKA 5I57B 4OEVA 3MP1A 3FXUA 3V89B 1ZKBA 3E3KA 1POTA 2HQ0A 1IQ7A 1B2HA 2OWTA 2Q9TA 2Z8EA 2DE4A 5I84A 1B0HA 1B58A 3OSQA 1WODA 3MVXA 3PUZE 3KJ7A 1QUJA 1JW1A 4X1DA 4C1UA 3A3CA 1MPBA 2O7UA 1B40A 4R9FA 1USYH 2XXIA 2P1SA 2O68A 3K2DA 3U8QA 4QHQA 4OEUA 3IOTA 4DXBA 1H3DA 1PBQA 3QUJA 1MM7A 2B3BA 1LBBA 2XX9A 3W9WA 4UA8A 1T0KA 1NKXA 2H99A 4YZZA 1NNPA 1ZMGA 3EN3A 3DP4A 3VDFA 3USDA 1S7YA 1VE4A 3FD3A 2ZYNA 2DWIA 1JEVA 2R71A 2YLNA 2AYSA 3CFXA 3EHSA 4NEDA 5CMBA 2QMXA 3BBRA 5ITOA 1MY1A 1EZPA 3IX1A 3GBAA 4KPTA 1YCJA 3UIFA 4BDQA 4F3BA 4YKIA 1NH8A 4NF5A 3T22A 3TZAA 1P1NA 4H1XA 1I6BA 3H06B 3T9XB 2QS1A 3QAXA 2HFBA 4IO5A 3U92A 4F1YA 3N5LA 4R75A 3MUQA 1Q1KA 3N26A 4KYSA 4MH5A 4N6PA 3TTMA 1B7HA 1DPPA 2DXYA 4GLIA 1MRPA 5DVIA 1MDP1 1MQJA 3RT6B 1TFAA 1Y3NA 4R2FA 2O69A 1Y9UA 1LAGE 3BKIB 1SD3A 3FJGA 5KCJB 2ZNSA 4ESWA 1QW0A 5JEIA 5CI5A 3VXCA 4YMBA 1MH3A 2I4BA 3H03A 4ZZEA 3RPWA 1MXWA 3R6UA 3TTRA 1B32A 3PD9A 1XOCA 2HZLA 1N76A 3IB2A 3SEUA 5JTYA 1MM6A 1SW4A 3Q29A 3M3FA 1JNFA 2DXRA 4ZS9A 1OMPA 3H4ZA 3MZBA 1KWHA 1SYHA 3HN0A 3LSXA 4GWOA 1D9YA 4KFQA 1UTHB 4OERA 2I4CA 4PFYA 5DVJA 2DSFA 4XKRA 5K2YA 4DLDA 1YTVA 3ZS6A 3K1NA 1H76A 2OWSA 3PPQA 3KG2A 4R6KA 4DDDA 5B70A 1B1HA 3SKPA 2ABHA 2XXPA 4XXUA 4IGRA 3HPIA 4TLLB 3SESA 3JZJA 4ZEIA 3RN8A 3PUXE 1Z7NE 5I2KA 1GR2A 4ECFA 3G3IA 5AA4A 3E4RA 1IXHA 5HPQA 1MPDA 3O6GA 4ELPA 2H4IA 5CMCA 1NFTA 2F97A 1MXYA 2V3QA 3F11A 4MLVA 4NMYA 2D5WA 3SDFA 1FQFA 5K2XA 3QXMA 4WXJA 1MQDA 1P99A 2OBGA 3TMGA 1NNTA 2HAUA 2P2AA 4AB6A 1FTLA 4R2BA 1BP5A 1DTZA 2QS2A 3SEYA 2O1MA 4RJZA 3VLVA 2LAOA 1P1UA 4POXA 4L17A 4GQOA 3I5OA 4Q0CA 1LCFA 3M8UA 1FTJA 2QS3A 2Y7WA 3CRBA 1ZLQA 3VE1B 5IKBA 5J1DA 1H45A 1QULA 2VHAA 4ESXA 4EUOA 3BFTA 3G7WA 3O97A 4OFOA 3EF7A 1Y3QA 4MLQA 3O6HA 1IUDA 4Q5TA 1NH7A 5CMKA 1AOVA 3PU5A 4EDPA 3PPNA 1XVYA 4JBZA 2Q2CA 2B65A 3IO4A 1ZTYA 3BFUA 3LSWA 4N07A 4OESA 3CVGA 2RC9A 1EZOA 4IY6A 1MXZA 3PMWA 2OCUA 1B5HA 1UTBB 5BUUA 3TQWA 4GIZA 2F8DA 5DT6A 1MDQA 3TQLA 1M5FA 4ZZAA 4F3SA 4H6DA 3HSTA 5FHMA 4WEPA 5L9OA 4G8MA 4H67A 1YPNA 3JYRA 3OEKA 1P1QA 1MXXA 3E13X 5KZTA 2DP8A 4R6HA 4H0WA 1MXUA 1R9LA 4YAHX 1LAHE 5LOMA 1B5IA 2REGA 3C33A 2G29A 3EQ1A 2ZNUA 3O29A 2FA7A 4PFUA 2DVZA 4DE8A 3ILTB 1D9VA 3Q26A 1SVXB 3H6WA 1P1OA 3RY3A 3SEWA 5CMMA 2QMWA 2XX8A 1PB7A 2WKYA 3G3JA 4KQPA 1QJMA 3MPLA 2ZMBA 3IJOB 4NF8B 1PB8A 2QSXA 2X7PA 3U72A 3IOVA 4GL0A 3W9VA 5I2NA 5H8QA 2ZNTA 4NWDA 4R74A 3QK6A 3T9VA 4XIGQ 3VVFA 4AB5A 4NF6B 3B7DA 4GRKA 3KFMA 1J1NA 2ONRA 4GF8A 3IJXB 3VLUA 2F78A 1M5CA 1MY3A 1QUKA 3ECRA 3N94A 4FAJA 4WEDA 3CSBA 3THIA 5AA4B 1QUIA 3DELB 1NNFA 3MJNA 3S9NC 2D3IA 2DVCA 2DWJA 3KZGA 3OO6A 1SYIA 1JVYA 1S50A 4Z7EA 1N7WA 2PYYA 2A5TA 4F1VA 4IY5A 5H8NA 3K6WA 3P7IA 4G2ZA 5A5XA 2DE2A 1M5DA 4ZEFA 1IEJA 3AXFA 1B0LA 2Z23A 5HBCA 5AA1A 1M5EA 1R9QA 3GZGA 4NE4A 4QFOA 5H8SA 2V25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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