5IKBA

Crystal structure of the kainate receptor gluk4 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
TLVVTTILENPYLMLKGNHQDMEGNDRYEGFCVDMLKELAEILRFNYKIRLVGDGVYGVPEANGTWTGMVGELIARKADLAVAGLTITAEREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIESVDDLADQTAIEYGTIHGGSSMTFFQNSRYQTYQRMWNYMYSKQPSVFVKSTEEGIARVLNSNYAFLLESTMNEYYRQRNCNLTQIGGLLDTKGYGIGMPVGSVFRDEFDLAILQLQENNRLEILKRKWWEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 4,Glutamate receptor
publication title The Structure of a High-Affinity Kainate Receptor: GluK4 Ligand-Binding Domain Crystallized with Kainate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ikbA02
2F7CA 1JW1A 4XXUA 3O2AA 3IOUA 5TPAA 3S9MC 4QHQA 2HFBA 4G8MA 3K01A 2XD2A 1MXVA 3PPNA 5KCJB 2O1LA 2NXOA 1EZOA 1MDQA 4R6HA 1BP5A 5H8SA 1FCKA 1RYXA 4NF6B 2XX9A 2PYYA 4E0WA 5I59A 3MZBA 1IQ7A 4U4XA 1F9BA 1OVTA 4O3CA 3RTWB 1B5HA 4XTCQ 4FE8A 1VSOA 4ECFA 1H76A 4ZEFA 5BUUA 1QULA 2CZLA 3TPAA 1B0HA 3W15C 2DWAA 2Q9TA 3HN0A 1LAHE 3SEWA 1HSJA 1P1OA 1LAXA 4BDQA 4O3AA 1EZ9A 1NMUA 4NF5B 2GHBA 1QKBA 4H67A 4Q8RA 3FASA 5TP9A 3PMWA 2X7QA 3W9WA 5M2VA 4QFPA 1VFDA 1D3KA 3U72A 4BLAA 3L6HA 1OIBA 2VHAA 1FQEA 4GWOA 5FTHA 5AA1A 1URSA 4KCDA 3RPWA 2QPQA 2CMOA 1TFAA 4NF4B 3O9PA 1RKMA 4YB7A 4LZ5A 4GL0A 3WAFA 4H1XA 2QS4A 4DCXA 1AIVA 3H6WA 1P1QA 3USDA 3TTNA 4BDNA 4JWYA 5CBRA 1B32A 1A40A 1DTZA 1M5CA 3QIMA 4DXUA 4U23A 2R9JA 4UA8A 1FTKA 3VVFA 2V93A 5DVIA 3PUZE 3HPIA 4GL8A 3HCQA 2DXRA 3TZAA 4OVJA 3VXCA 4ZE8A 5A5XB 1OLCA 2DWJA 3PPRA 4KI0E 2IA4A 3GZGA 2I3WA 5I57B 1N3XA 1H3DA 1YPNA 3IB1A 3SERA 1J1NA 2ZYMA 4QFNA 4JSDA 4NE4A 4R2BA 5H8FB 5CMKA 2D3IA 4EDPA 1M5FA 4YMAA 5FHOA 1UTHA 2DE2A 5I84A 2QS1A 4N07A 3LR1A 3V83A 4PE5B 1SI1A 3MW0A 2QS3A 3SEXA 1NKXA 2O6AA 3HO7A 3UN6A 3S4UA 1PDAA 2OWTA 1AMFA 3I6VA 1IXCA 1Q1KA 3Q25A 1QW0A 3EPEA 2PT2A 1Y4CA 4X9TA 3GLBA 1R1NA 2DOJA 3PUWE 4MBPA 2Q88A 2I4BA 3VLVA 5L9OA 2P0SA 3A3UA 4KQPA 5FTIA 1B5JA 1UIUA 1ZU0A 3N26A 2ONKE 4PETA 3FVNA 3KOSA 4PFTA 3K1MA 1Y3PA 3C36A 3U94A 3FXRA 1MH4A 2F7AA 3IAZA 2QRYA 3RUMA 4G68B 4N13A 3OXNA 3PU5A 2F7BA 3S9EA 3QYTA 2XX8A 4PQJA 2ESNA 5TU0A 2NUVA 3CIJA 3RQTA 2P2AA 4F1YA 1NH8A 2XX7A 2GHAA 1I69A 2YJPA 2ZMBA 3O6GA 3O97A 3VDFA 3RT8A 2H9BA 3IB0A 3LSXA 3PD8A 1MY3A 3LBSA 4XKNA 3K4UA 1ATGA 1ZMGA 3OSQA 1FTLA 4BDRA 1SDXA 3U93A 2XXPA 4H5FA 4HCYA 2OZZA 1D9VA 3PPOA 1NH7A 4F2QA 1MXZA 3MJNA 4KD5A 4F19A 5IKBA 2Z22A 4OENA 3QAXA 3SEYA 1SD3A 2DVZA 2X26A 1B7HA 1L5TA 3B6WA 1QUIA 3MZ1A 4OTEA 2F6GA 2THIA 4F18A 5FHMA 1QUKA 4PFYA 4O3BA 2D5WA 1UTBB 2Y7PA 4E0XA 1P99A 4YMBA 3A3CA 1B1XA 4GLIA 3KFMA 3HHFA 2F34A 2A5TB 4P0GA 1MY0A 2O69A 3DELB 3LC8A 1IITA 2DP8A 1A8EA 4I9DA 5I56B 3N6UA 1VFEA 4ZEDA 4DXBA 4NF8A 4QFLA 3C34A 4GIZA 1I6BA 1N7XA 1P1UA 2UXAA 3G3JA 3OO6A 1A7LA 3H06B 2BJJX 1XHYA 4H6DA 1B6HA 1JEVA 5L9SA 4HS7A 3M3KA 1ZLQA 3LSFB 4EF1A 1FQAA 2Z8DA 5H8NB 3Q28A 3E3KA 3F11A 1SVXB 4AQ4A 2RC7A 4LZ7A 4R6YA 3RLFE 2I58A 1FTOA 2QS2A 3TTRA 1NNPA 4X1DA 3ONMA 4YICA 4F39A 2ANJA 3C4MA 3P7IA 3O28A 4ZEIA 3FD3A 3Q29A 5DVFA 4F1VA 5JK4A 1O7TA 1EU8A 2RINA 3CR9A 2OJTA 1LFHA 4LP2B 1YAEA 3SESA 1LGBC 4LZ8A 3K6WA 5AA4A 1B3LA 1IXGA 1IXHA 4EUOA 1OQHA 3OO7A 3MVZA 4POXA 4QFKA 5EHMA 1PB7A 2VOZA 2ZNUA 2PT1A 1ZKBA 1MQGA 2F36A 2VGQA 5I2KA 2O1MA 1GGGA 5AA2A 1YCJA 3MZ9A 4IB2A 1N76A 1PB9A 5L9MA 1ELJA 1MDP1 4G2ZA 4C1UA 1D9YA 3FXQA 4ONYA 1B40A 4FIMA 2PX1A 2ZXTA 3T93B 5ITOA 2Q89A 1MG1A 2ABHA 1ZTYA 4IGTA 1MS7A 3KSXA 1I6QA 1B7ZA 4WEPA 3G7WA 3D4GA 3VLUA 3H03A 3UP9A 1OQGA 4OEVA 2I3VA 1BTJA 3TDJA 3TELA 1LCTA 2DXYA 3IK6B 3SETA 4RXLA 1PC3A 2PVUA 2LAOA 4U2RA 5KZTA 2V84A 2OK2A 1XVYA 4IO6A 3VVEA 3HHGA 3K6XA 3RTFB 3OD7A 4JBZA 3VLWA 4IO3A 2XXIA 1NNTA 2VP1A 4KR5A 3T66A 2RF1A 2I48A 2DVCA 3OO9A 4ELPA 1FTJA 2GRVA 2DWHA 4XKQA 1WODA 3THIA 4Q30B 4JB7A 5DEXB 2RC8A 1B4ZA 3FUZA 4EQ7A 4ZZAA 3IR1A 4F29A 3HSTA 4ELQA 1R9LA 1LBBA 1US5A 5K2YA 4PFUA 4OFJA 1P1WA 5L8DA 3T9UA 3RGYA 3MP1A 3TTKA 3D4CA 3CVGA 5CM6A 5IAIA 4OWDA 4ELOA 3JYRA 1IXIA 3KGCA 3SDFA 2QSXA 3RNNA 5TPAB 4LUBA 2ZYKA 1A55A 5DYHA 3DP4A 2A5SA 3KSJA 1URGA 5AA3A 1UIVA 2YPNA 1B52A 2NOOA 3TCHA 2AIXA 2HXWA 1B46A 4F3SA 4JSOA 4DLDA 3ODBA 5I59B 3QXMA 3KJTA 2Q2CA 3PPPA 3OELA 4ESXA 4RJZA 4Z0IA 5HM4B 3MPLA 2KLFA 4IO2A 4YKIA 3TCFA 3TUSA 4QRZA 1URDA 3OOAA 3DP8A 1DOTA 1M5BA 1A99A 4R75A 3V89B 1M5EA 1M5DA 2Z23A 2I0BA 4KPTA 5ICTA 3MBPA 3FJ7A 1LFGA 2I0CA 3FVKA 3B6QA 1BIYA 5TP9B 4OYVA 1LFIA 2H4IA 1NNKA 5AE4A 3K02A 3ZS6A 1B3FA 3S9NC 4R74A 1Y20A 5DTBA 3QUFA 1R9QA 4H0WA 4XKRA 3RY3A 3IX1A 3T96B 1JW4A 1I6AA 2B65A 3ZKLA 1MY1A 4QSCA 1N0TA 3TMGA 3MQ9A 4TOZA 3H6VA 4GD5A 4G4PA 4DDDA 4DE8A 4ESWA 4YZZA 2UYEA 5H8HB 1DPPA 4KYDA 3IL1B 2XXRA 4F3BA 2V3UA 1UTBA 5AA2D 3QSLA 4EQBA 1NNFA 3G3IA 2V25A 1IEJA 5H8QA 1II5A 4Q5TA 3MVXA 1GTKA 3EN3A 3BKIB 2XXWA 4I8CA 3KN7A 4U22A 3RT6B 1B7UA 3RN8A 5J1DA 2H99A 3E9XA 4R6KA 3N5LA 4C1TA 2Q2AA 2HZKA 4Q0CA 5JEIA 3IJXB 4JXIA 4KHZE 3EQ1A 4XKPA 5CC2A 2AL5A 3H4ZA 1MXUA 4YAHX 2RCBA 1Y1ZA 2O68A 1B05A 4FAJA 4M4GA 5HBCA 5KDTA 4AB6A 1JVXA 1IZ1A 1SBPA 3TQWA 3ECRA 2VD3A 4TQUQ 2Y7KA 4U21A 5I58B 1H44A 3PPQA 3N6TA 3VFJA 3M3LA 1A8FA 2GFEA 5ISUA 1DPEA 3MVWA 5JTYB 4H8JA 4U1ZA 1DSNA 5I2NA 4H8IA 2O84X 3KN8A 4F3GA 3EHTA 5CMMA 3TODA 4JWXA 4F3PA 3G3KA 2M8CA 1A54A 3IB2A 3MC2A 4I62A 2QMWA 5ITPA 3K6UA 4R73A 2Z8EA 4WXJA 1B9JA 1ZIUA 2D21A 4H5GA 3EHSA 2X7PA 3QK6A 5LOMA 3EHUA 1B2HA 3PUXE 1SYHA 4MF3A 3A09A 4FATA 4G8NA 3VV5A 1XC1A 2FYIA 5K2XA 4GXSB 4DCYA 3S9LC 4Z7EA 2DWIA 3DP6A 3CFXA 2XXTA 2B3BA 2R71A 3VE1B 3FVOA 1LB9A 3K0VA 5KCJA 4QFOA 3V5AA 1GR2A 1FQCA 4HTGA 2DE4A 1XOCA 4NF6A 4I1DA 2Y84A 3HV1A 1B3GA 3MP8A 2H98A 3MP6A 4TLMB 3MWBA 4YKPA 1UQWA 1QVSA 4RNSA 4G68C 1SYIA 3I5OA 1FQFA 1SW5A 4P0IA 4UACA 1B0LA 3O6HA 1N84A 4IO4A 4OESA 1JNFA 2NVUB 1OLAA 4LA9A 3KZGA 4PFWA 4NF5A 1Q35A 4QF9A 2Q8JA 2Y7WA 2UVHA 2I6EA 2OLBA 3C35A 2Y7IA 2QJEA 1SQYA 1N3WA 2HAUA 4THIA 2G93A 3T22A 5DEXA 4OETA 1O63A 2XXVA 1P1NA 4NF4A 2DYXA 4OQOA 4C0RA 4RY1A 1MQHA 1HSLA 4KYEA 3MVYA 1POTA 1PBQA 1KWHA 1S7YA 1AL3A 4L17A 4YKJA 2ZNSA 2RC9A 2DSFA 4R9GA 2R6GE 3ZSFA 1PBPA 3IOTA 4OZ9A 2Y7RA 5ICQA 2QMXA 2F97A 3OO8A 3W9VA 1POY1 4QSEA 1XVXA 3K00A 2OCUA 1GV8A 2REGA 2IEEA 3PV0E 1LCFA 3OENA 3PGFA 5A5XA 1TXFA 2HAVA 4GVOA 1IUDA 3CRBA 3BFTA 3O6IA 4AB5A 5I57A 5EYFA 3OSRA 2XHDA 4NTLA 4EQ9A 1MXYA 1QJMA 3WAEA 3BBRA 2VD2A 1TFDA 2UVGA 5H8FA 1NL5A 4MLQA 4F1UA 3FV2A 3FATA 4BDOA 3U8QA 4NEDA 4EF2A 3O29A 1B3HA 5B70A 3OEKA 3E4RA 4OEUA 1S50A 4QSDA 5ELVA 3IJOB 3IOVA 5AA4B 2E0SA 4RYAA 3EF7A 4JDFA 4ZZEA 4DIGA 3FV1A 1OMPA 4ND9A 5HPQA 3TEPA 3KEIA 3H3GA 1TWYA 1GVCA 4OMBA 3PD9A 4K3FA 1VE4A 4RPOA 1BLFA 2GH9A 4EXLA 5BWJA 3CSBA 3H6TA 5I2KB 1XT8A 5AA2B 1USYE 4LVQA 2XD3A 2W7YA 1EH3A 3K1NA 1Z7NE 4F31B 4DXCA 1SW1A 2Z8FA 1Y4TA 2P1SA 3ILUB 4FORA 4ZDMA 1H43A 3TTMA 2NWJA 2QL3A 4YKKA 5H8HA 4YB6A 2G29A 3M3FA 4U4SA 1N04A 4FEDA 3AXFA 3C33A 3OMBA 3BFUA 1LAGE 4H65A 1MH3A 2F6PA 5B7DA 1MQIA 2OWSA 3KBRA 3R6UA 4G68A 5FHNA 2OBGA 3IO4A 3C32A 3CFZA 3E13X 1IIWA 3KG2A 1S9TA 3LUYA 3UGWA 2XXYA 3FZVA 1SW4A 4M1VA 2XXUA 1JVYA 3CFLA 4R9FA 1RYOA 3SKPA 3FGSA 3MUQA 1Y1MA 1ZJLA 4JWOA 3C9HA 2FA7A 4ISUA 4FEBA 1JQFA 1TT1A 1B51A 2H5YA 5CBSA 3UIFA 4RK2A 1LBCA 1CE2A 3GBAA 2DQVA 3U92A 4RA1A 3VXBA 4BDMA 2B3FA 5CI5A 1QKAA 3R7XA 5I58A 1HSEA 3B7DA 3ILTB 4YU0A 3IO6A 2HQ0A 4NMYA 2ONRA 3PMXA 1SI0A 3G3FA 3U1OA 3ZKKA 5JTYA 1CB6A 4GFRA 5CRYA 3TAJA 1B3EA 1BKAA 2WKYA 2UVJA 4IO7A 4GRKA 4TLLB 2FNCA 3IOWA 2HZLA 4IGRA 1FQDA 4MH5A 1Y3QA 2A5TA 3TQLA 4OXVA 1D4NA 4BDLA 2ALUA 5I56A 2RKMA 3OEMA 1US4A 1MY4A 3DM0A 1FTMA 3PUVE 3G3GA 2I49A 1LSTA 1MPCA 1DTGA 4NWCA 3UORA 4R72A 2REJA 1VR5A 4P11A 2DE3A 4MFIA 1SW2A 3CG3A 1UTHB 3UA8A 3FJMA 5H8NA 1AOVA 4ZEBA 1WDNA 3C31A 4FECA 3CG1A 1MXWA 3T9HB 3TYHA 2H25A 2ONSA 3KN3A 3L6GA 1QUJA 1EZPA 1Y9UA 3FXUA 2F8DA 4DZ1A 3JV9A 1Z7ME 3MPKA 3G3HA 4FJPA 4OFLA 1MY2A 3GBBA 4LQ5A 2O7UA 4X48A 4YB5A 2HEUA 4GXAA 3TCGA 1T0KA 1XS5A 3SEUA 1ANFA 3I3VA 3Q26A 2UYFA 1MQJA 4R2FA 2V3TA 5F7VA 2ZNTA 2O7IA 3PUYE 3MAMA 4KCCA 3FVGA 3Q27A 4GF8A 1PEBA 1O64A 1B1HA 1AH5A 1MM7A 1MM6A 4PP0A 3V8XB 4IY5A 4ZE9A 1MPBA 1JETA 4OHNA 3S2VA 1N7WA 1NFTA 3KOTA 4KYSA 5H8QB 4WEDA 4OERA 4OFOA 3H7MA 3FJGA 4ZEKA 4RK9A 4ELRA 4KFQA 4U1OA 1B5IA 4EXKA 1JW5A 3N94A 3DLNA 1LLSA 4HW8A 4WKMA 1MQDA 3VVDA 1Y3NA 1DMBA 3K2DA 4F2OA 1WVJA 2HCAA 4IY6A 3PMVA 1ZBMA 3CSGA 2UVIA 4MLVA 5CMBA 1MXXA 3UK4A 4NWDA 3K1PA 3O66A 4LONB 2AL4A 5KDTB 2V3QA 3CI8A 2F35A 4N6PA 2F78A 2O51A 4POWA 2PMSA 3LSLA 2ZYNA 4LATA 3TTLA 1LB8A 4F22A 2RCAA 5CMCA 1PB8A 4GQOA 5DVJA 3IORA 4X1BA 2XXQA 3M8UA 1B4HA 1OVBA 2DS9A 2F5XA 5DT6A 2I4CA 1USYH 1MPDA 3H6UA 3K6VA 5I2NB 1B58A 4LQ2A 1FQBA 4G8HA 4IO5A 4ZECA 1H45A 5EHSA 2AYSA 2E1SA 3FIRA 1MRPA 3T9XB 3SEVA 4HCWA 1YTVA 3LSWA 3JZJA 2PBWA 2ZYOA 3QUJA 3TFLA 3T9VA 3KJ7A 1LAFE 3GXAA 4ZS9A 4G77A 4XIGQ 1JEUA 3R26A 4RPNA 1R6ZA 2YLNA 5F1QA 4GOTA 4NF8B 1FW0A 2XXHA 3B6TA 3TKDA 2XXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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