5ILFA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme and compound 4, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ilfA00
4XENA 2XBRA 1HELA 1EL1A 4Z98A 5FEKA 2Z38A 4WM5A 4C3WA 4H91A 1HC0A 1QIOA 5IDDA 1HHLA 4LT1A 4PRUA 5LVGA 3BKVA 1GFAA 1KIQC 1LJJA 1WQPA 1GF0A 2CWIA 4H8XA 2BQJA 3HBEX 5AMYA 1LZRA 1YAMA 1IOCA 1JKDA 1LZTA 1LMOA 3TXIA 5FSTA 1UICA 4LYOA 4OWEA 5D5CA 5I4YA 1GB3A 4H9FA 1IP4A 1LMAA 1NKHA 4GN4A 1LHKA 1W6ZA 1D9UA 2HU3A 4H1PA 3D9AC 2BQOA 1FKVA 2BPUA 2LYZA 5LXWA 5F81A 1NDGC 1GEZA 5APDA 1C46A 4ZIXA 1OUHA 1RE2A 1V7TA 3AGIA 4FJRA 4HSFA 4YM8A 3AZ5A 4XJIA 2DQCY 1IWVA 1ZVHL 4NFVA 1WVUA 3WU8A 4NGWA 3HFMY 1YKXX 1GFRA 1UUZC 3AB6A 2G4NA 3WPJA 1J1XY 4ETBA 1B7OA 1KXXA 1TAYA 1C7PA 2AUBA 1IX0A 2XTHA 1IEEA 4B4IA 5KXWA 3B72A 4DD2A 2F2NA 1AKIA 3WH1A 1D6QA 1YL1X 1GB9A 2YBLA 3AYQA 1H6MA 3M18B 4H9HA 9LYZA 1XFPL 1GFVA 1G7IC 5I4XA 1LCNA 1YAPA 1LYZA 4DDBA 3AZ7A 4EMNA 4Z46A 1QQYA 4OWBA 4WMGA 3RT5X 2I26L 2HEEA 154LA 2LZTA 1IP5A 3HBDA 4WM3A 1JHLA 4DDCA 1OUCA 1DI3A 3K3TA 5APFA 5L3IA 1JWRA 1NMMA 4PHIA 1UBZA 4YEOA 2Z2EA 5T3FA 4B1AA 4HTQA 1LSZA 1VAUA 4ANRA 5APCA 4NWEA 5C6JA 2BQMA 4MR1A 2DQJY 1CKGA 2FYCA 4H93A 1OUJA 5KXMA 4DD7A 2ZNXY 3A93A 4KL7A 4XJDA 5KJ9A 1H87A 3ULRA 4OWHA 8LYZA 4HPEA 1AM7A 4YEMA 2YSSC 1LZCA 2W1XA 3A95A 1IO5A 4J7VA 1FLUA 1WVVA 3EBAB 3RW8A 3B0IA 4J1AA 4NSJA 1GF5A 4TTDA 3TXKA 1VDQA 3MGWA 2W1LA 1YROA 1IOTA 1GB2A 5D5FA 1DZBX 4RW1A 3ATNA 5I53A 1IY4A 5LYMA 1CKFA 3W6BA 5B1GA 5LVKA 1LZDA 5KXYA 1REYA 2EIZC 3W6DA 4D9ZA 1QDRA 4DYGA 1YIKA 1LHMA 1BHZA 1QDTA 1UIBA 1NBZC 1YKYX 4H8ZA 1REMA 5DN5A 1J1PY 1IR7A 1TBYA 4G4BA 5FELA 4TUNA 1REZA 1AZFA 3WYHA 2MECA 5HNCA 1OUGA 2BQDA 5B07A 3GXRA 4HP0A 1DQJC 4N1CC 4ML7A 1GFKA 4A7DA 3WXTA 133LA 4AXTA 3A3RX 5LVJA 2H9JA 1GDXA 2HEBA 4NGVA 1REXA 1KIRC 5K7OA 1IY3A 4NGIA 2BAAA 1XGRC 4NSHA 4GN5C 4WG7A 2F4GA 1B5YA 1KIPC 1HF4A 1BB3A 1O23A 3B0KA 5I5QA 3W6FA 1GBYA 1LZAA 1LMTA 4TSBA 1GFUA 2ZQ3A 1B7SA 4TWSA 5HNLA 1HEMA 3WW5A 1XGPC 3A6BY 1FLWA 4I8SA 2DQIY 4HPIA 1LOZA 1T6VL 5LIOA 4G4CA 3ZVQB 1GE4A 3TXGA 3WUNA 1RJCB 2HECA 4LYZA 1UIFA 1OQMA 5KY1A 5LYTA 1LZNA 4NHSA 5KKIA 134LA 1GPQC 4WM2A 2VB1A 5ILFA 1LMNA 4ET9A 2EKSC 1GDWA 3TMXA 1FLQA 1LJKA 1LSYA 1GE1A 153LA 4NGLA 4BAPA 4H9BA 2EQLA 3GXKA 1IR9A 4WM4A 4L41A 4ETCA 1PS5A 3TMVA 3AZ4A 1QTKA 1A2YC 1D0KA 1DPXA 1JSFA 1UIEA 3AW7A 4H90A 1IOSA 1ZVYB 4LT0A 4M4OA 2N5ZA 2YBJA 3WU9A 2MEGA 1C08C 3W6EA 1GAYA 3WU7A 4N1EI 4J0LA 3A92A 1B0DA 1RCMA 2BQHA 1LSMA 1GB6A 2HEDA 2LHMA 1HERA 1GEVA 1LJFA 1VDSA 4WG1A 4WLDA 1EQ5A 1HSWA 4XJBA 1HENA 5KXTA 2DBTA 5B05A 1GFTA 2BQIA 1LSBA 4BS7A 3A96A 1IC5Y 4WL6A 5KKJA 5F9XA 4OOTA 5KXZA 3CSZA 1TDYA 1HMKA 5DLAA 1IWTA 1CKCA 3A94A 4CFOA 1B5WA 2F30A 4WO6A 5FCPA 4O34A 3CSQA 1GBZA 4PJ2C 2MEFA 4GCFA 1BWHA 1DPWA 4DT3A 6LYTA 1GB8A 4NWHA 4ETDA 1B9OA 4NIJA 4PPOA 1FKQA 4DD0A 1XGQC 2ZYPA 1LJEA 1WQRA 4CGEA 1BWJA 5L3HA 1OUIA 2FBDA 2BLYA 1LSFA 2ZNWY 1YAOA 4DDAA 1GD6A 1SQ2L 4RDSA 1W08A 5KXNA 1NHEA 1MLCE 1JTOL 4QEQA 1BB5A 4DD9A 3CT0A 1CKHA 1QSWA 1GBSA 2Z37A 4XJGA 2D4JA 5KXKA 3EMSA 3F6ZA 1GHLA 3TMWA 4OOOA 5KXSA 1GXXA 1GAZA 3LZTA 1F10A 4HTKA 1GE0A 3WUAA 2BQLA 4HJYA 1XEIA 1YILA 2W1MA 1LZGA 5KXOA 4XYYA 1IORA 1OUFA 1GBXA 1YQVY 4MCKA 4GCDA 1JTTL 1LHJA 1KXYA 2XBSA 4PGJB 4H92A 1GF9A 4IJ4A 1JJ3A 1IVMA 1JKCA 1CJ8A 1AT6A 1I20A 4HV2A 1QSAA 3ATOA 3LYTA 1UCOA 1OUAA 2BQGA 1WQMA 3BKHA 4H8YA 3TMUA 1LYSA 5B1FA 4B4JA 3TXFA 3WVXA 1ZV5L 5F14A 3WPLA 5E9RA 1UA6Y 2ZIJA 1CJ6A 1LZ6A 1LKSA 3OK0A 3B0OA 132LA 2PC2A 3AGGG 1B7MA 5M1YA 1B7NA 7LYZA 1LMQA 1GFJA 1HMLA 2CDSA 1GFEA 1JKAA 2D4IA 4U3XB 1LJIA 1LSAA 1XGTC 2YBNA 2Z12A 1SLYA 4GLAA 5LAGA 5DN4A 4E3UA 5HQ1A 1CJ7A 5JENB 1UIAA 1IOQA 3G3BB 4G49A 4H94A 4HJZA 4CFPA 1GE3A 1TEWA 3TXDA 1IWYA 5FDJA 1BQLY 3CB7A 4GCCA 4X3BA 1FN5A 3A67Y 3M3UA 3T6UA 2MEAA 1GF7A 2MEIA 1LKRA 1G7MC 1GB0A 4NHQA 4MSTA 4YENA 4LYTA 1LJNA 1YL0X 1LJGA 4H9AA 3W6AA 4DD1A 5LA5A 2D4KA 1GXV2 1NQIA 5LINA 4WLXA 1V7SA 1VFBC 2DQAA 3P66A 4N0JA 3A34A 135LA 1JIYA 3TXBA 1G7HC 1LZ1A 3CT5A 5DM9A 5L9JA 1LMCA 3QY4A 4QY9A 1DKKA 1RI8B 4NEBA 5LAFA 1DI4A 3WUMA 2ZILA 1F6SA 4N9RA 1JKBA 208LA 5A3EA 1IWZA 3G3AB 1B7LA 1I56A 4R6CA 4KPMA 3WXUA 2MEBA 1IWUA 4OW1A 3ZEKA 5B59A 1GB7A 2BQAA 1B5VA 1PZYA 4LYMA 3SP3A 4OWAA 2MEDA 1FLYA 4ETAA 3P64A 1CNSA 1LSDA 1WQOA 4J1BA 1VEDA 4DC4A 2D6BA 4C5FA 2HEFA 4XJFA 4BADA 1B5ZA 1UC0A 3J6KA 4WL7A 4ZEEA 1IC7Y 4LYCA 3A90A 4GLVA 4NHPA 1E8LA 1B5UA 3QE8A 1LZBA 4P2EA 2GV0A 1MELL 2IHLA 4RLNA 1UACY 1QTEA 1WQNA 5I54A 3IJVA 4NGYA 1OUBA 2ZQ4A 3CT1A 3CQLA 3AW6A 1XEKA 1OUDA 1LZ4A 3W6CA 3A3QA 5EBHA 5II3A 3TXEA 3CSRA 5LVHA 4KXIA 1BB7A 4LFPA 1GF6A 3RZ4A 1IC4Y 1LYOA 1JEFA 4R0FA 4WLTA 1BWIA 3A91A 4H9CA 4H9IA 2G4PA 2MEEA 3E3DA 5C6IA 5E4PA 1JJ0A 1HEPA 1LHHA 1WTMA 5IELA 1VDTA 5LVIA 2YBIA 4QGZA 4KT3A 4NGZA 2A7FA 3WMKA 1GFGA 1FDLY 4G4HA 4HJVA 1IIZA 3EO5A 4XADA 3WULA 1G7LC 2A7DA 207LA 5LYZA 2H5ZA 1QUTA 1NF5A 1NBYC 4RLMA 2DKVA 3D3DA 1C45A 4CJ2A 1IWWA 1CJ9A 1Z55A 3AGHA 5HMVA 1LMPA 1BVXA 1ZMYL 1LZEA 3LYZA 2LYOA 4IATA 1HFZA 4OWCA 2BQNA 2CGIA 3IWRA 1IR8A 1GF8A 1LJ3A 2DQHY 1CKDA 2Q0MX 4XN6A 4YF2A 2YBMA 4LT2A 1GB5A 3QNGA 3A6CY 1IP2A 1IP7A 2YVBA 4NGKA 5ILCA 1LSEA 2DQEY 6LYZA 1GBOA 4GCEA 4DD3A 1LZ9A 2F4AA 4H9EA 1INUA 1HEWA 5B06A 5C6LA 4EOFA 1JSEA 1UIGA 4II8A 2Z18A 5APEA 1VATA 2I6ZA 3J4GA 1RFPA 1VDPA 4UWUA 1YANA 1AT5A 4WM6A 2DQFC 4NG8A 1B7RA 1WQQA 2FBBA 1JPOA 3WW6A 3N9EA 1JTPL 1D0MA 1LPIA 2XJWA 2BLXA 5DL9A 1ALCA 1D6PA 2EPEA 2HEAA 2X0AA 5HLLA 5IHGA 1LZSA 3B6LA 1P2CC 3A8ZA 4CHXA 1GWDA 1IP1A 1N4FA 4NG1A 3RNXA 4NSGA 1F0WA 3AJNA 1LAAA 1LJ4A 1GF3A 1LJHA 3VWOA 3TXJA 1BB6A 1HFYA 2DQDY 3AZ6A 4HTNA 4WLYA 4G9SA 4M6DA 5FHWA 3LYMA 3FE0A 1BVKC 1NDMC 1UIHA 3KAMA 2Z2FA 4NGOA 2DQGY 5KXLA 2HU1A 2BQEA 1TCYA 1OP9B 3RU5A 4ET8A 4TX7A 4N8ZA 4ETEA 4NHIA 1T3PA 2WARA 1LZ5A 4HV1A 1GE2A 1UIDA 2NWDX 4IASA 1WTNA 1EQ4A 1B5XA 1LZ8A 5F9UA 4NHTA 2BQKA 2RSCA 5KXXA 4ZFPA 2YDGA 4LFXA 1B7QA 4Z3MA 2G4QA 4NSIA 3P4ZA 1IP3A 1LSGA 4PRQA 4GCBA 1XSFA 3T36A 4B0DA 1JJ1A 3P68A 1QUSA 4LYBA 4RW2A 2C8PA 2HTXA 1HFXA 4I0CA 2BQCA 1HSXA 2ZIKA 3LZ2A 4LZTA 4XJHA 1EQEA 1JISA 1KXWA 2ZYCA 3N9CA 2H9KA 2I25L 4AGAA 1B7PA 2Z19A 3OJPA 4N5RA 2IFFY 2Z39A 1C43A 1JITA 3HBHA 3P65A 1B2KA 4W94A 1DI5A 4WO9A 1IWXA 3WPKA 1IP6A 2HUBA 4UWVA 1I1ZA 1XGUC 5KXPA 1DKJA 1LHLA 1BB4A 193LA 1HNLA 1A4VA 1FBIX 4FDYA 4WOAA 4B4EA 2W1YA 1DXJA 4YOPA 1NWGA 4NY5A 3W3EA 1GBWA 1YKZX 1J1OY 2LZ2A 5F16A 5A3ZA 3ZVQA 194LA 4BAFA 3IJUA 4LT3A 1GF4A 5I4WA 1LYYA 1F6RA 1LTMA 2CJLA 3LYOA 4TSCA 3WVYA 3LHMA 3FI7A 2ZWBA 2YBHA 4QDNA 1GFHA 1HEQA 3TXHA 4LGKA 5KXRA 5J7CA 5HMJA 4B49A 2D91A 4DWXA 4W96A 2Y8PA 3LN2A 1HEOA 4UWNA 2B5ZA 1JUGA 1OUEA 1LZYA 1LHIA 4NGJA 1XEJA 3N9AA 3WL2A 1YAQA 2BQBA 3EXDA 4GN3A 1LSCA 2LYMA 2MEHA 1BGIA 1LSNA 1G7JC 2BQFA 4Z41A 2FYDA 4WM1A 5LA8A 1C10A 1LSPA 2C8OA 1D0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
157LA 2OU8A 4I7KA 3SB7A 4C3WA 1HC0A 4H91A 5IDDA 1LJJA 3HBEX 1QUGA 1JKDA 1D3MA 5I4YA 5D5CA 1QS9A 4I7PA 1IP4A 5LXWA 5F81A 5APDA 1GEZA 141LA 205LA 3AZ5A 1L94A 1IWVA 1ZVHL 1WVUA 2B70A 180LA 1L26A 2AUBA 1C7PA 1IEEA 129LA 2B72A 1XFPL 1G7IC 5I4XA 254LA 4EKQA 3AZ7A 1QQYA 3GUJA 1OUCA 5APFA 2RBSA 4YEOA 2Z2EA 4B1AA 1C67A 4HTQA 1VAUA 4ANRA 177LA 175LA 161LA 1CKGA 1OUJA 2ZNXY 4XJDA 8LYZA 1AM7A 1FLUA 242LA 3B0IA 1GF5A 210LA 3MGWA 1LI6A 1LZDA 4D9ZA 1LHMA 1L14A 5DN5A 4H8ZA 1REMA 1IR7A 109LA 4TUNA 1REZA 1AZFA 2B6TA 103LA 1OUGA 3GXRA 4HP0A 3C7ZA 1DQJC 4N1CC 4ML7A 2LCBA 3WXTA 4AXTA 5K7OA 4NSHA 1B5YA 4PJZA 1BB3A 1L77A 120LA 4TWSA 1XGPC 4HPIA 160LA 1T6VL 3HUKA 3ZVQB 1RJCB 4LYZA 1L38A 134LA 4WM2A 3HDEA 4ET9A 3TMXA 1LJKA 4NGLA 4BAPA 4H9BA 3GXKA 3TMVA 1JSFA 1L62A 1L13A 1L07A 1LWKA 4W58A 1OWYA 108LA 1HENA 2DBTA 1GFTA 2Q9DA 219LA 3C8SA 3CSZA 3C81A 1TDYA 5DLAA 3A94A 1OVJA 244LA 1L27A 138LA 4O34A 3CSQA 1G07A 1L86A 6LYTA 1B9OA 1XJUA 4PPOA 1FKQA 1XGQC 2ZYPA 2FBDA 2BLYA 1SQ2L 1W08A 1JTOL 2B74A 2D4JA 2LZMA 3EMSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XEN A;  2XBR A;  1HEL A;  1EL1 A;  4Z98 A;  5FEK A;  2Z38 A;  4WM5 A;  4C3W A;  4H91 A;  1HC0 A;  1QIO A;  5IDD A;  1HHL A;  4LT1 A;  4PRU A;  5LVG A;  3BKV A;  1GFA A;  1KIQ C;  1LJJ A;  1WQP A;  1GF0 A;  2CWI A;  4H8X A;  2BQJ A;  3HBE X;  5AMY A;  1LZR A;  1YAM A;  1IOC A;  1JKD A;  1LZT A;  1LMO A;  3TXI A;  5FST A;  1UIC A;  4LYO A;  4OWE A;  5D5C A;  5I4Y A;  1GB3 A;  4H9F A;  1IP4 A;  1LMA A;  1NKH A;  4GN4 A;  1LHK A;  1W6Z A;  1D9U A;  2HU3 A;  4H1P A;  3D9A C;  2BQO A;  1FKV A;  2BPU A;  2LYZ A;  5LXW A;  5F81 A;  1NDG C;  1GEZ A;  5APD A;  1C46 A;  4ZIX A;  1OUH A;  1RE2 A;  1V7T A;  3AGI A;  4FJR A;  4HSF A;  4YM8 A;  3AZ5 A;  4XJI A;  2DQC Y;  1IWV A;  1ZVH L;  4NFV A;  1WVU A;  3WU8 A;  4NGW A;  3HFM Y;  1YKX X;  1GFR A;  1UUZ C;  3AB6 A;  2G4N A;  3WPJ A;  1J1X Y;  4ETB A;  1B7O A;  1KXX A;  1TAY A;  1C7P A;  2AUB A;  1IX0 A;  2XTH A;  1IEE A;  4B4I A;  5KXW A;  3B72 A;  4DD2 A;  2F2N A;  1AKI A;  3WH1 A;  1D6Q A;  1YL1 X;  1GB9 A;  2YBL A;  3AYQ A;  1H6M A;  3M18 B;  4H9H A; 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 4NHT A;  2BQK A;  2RSC A;  5KXX A;  4ZFP A;  2YDG A;  4LFX A;  1B7Q A;  4Z3M A;  2G4Q A;  4NSI A;  3P4Z A;  1IP3 A;  1LSG A;  4PRQ A;  4GCB A;  1XSF A;  3T36 A;  4B0D A;  1JJ1 A;  3P68 A;  1QUS A;  4LYB A;  4RW2 A;  2C8P A;  2HTX A;  1HFX A;  4I0C A;  2BQC A;  1HSX A;  2ZIK A;  3LZ2 A;  4LZT A;  4XJH A;  1EQE A;  1JIS A;  1KXW A;  2ZYC A;  3N9C A;  2H9K A;  2I25 L;  4AGA A;  1B7P A;  2Z19 A;  3OJP A;  4N5R A;  2IFF Y;  2Z39 A;  1C43 A;  1JIT A;  3HBH A;  3P65 A;  1B2K A;  4W94 A;  1DI5 A;  4WO9 A;  1IWX A;  3WPK A;  1IP6 A;  2HUB A;  4UWV A;  1I1Z A;  1XGU C;  5KXP A;  1DKJ A;  1LHL A;  1BB4 A;  193L A;  1HNL A;  1A4V A;  1FBI X;  4FDY A;  4WOA A;  4B4E A;  2W1Y A;  1DXJ A;  4YOP A;  1NWG A;  4NY5 A;  3W3E A;  1GBW A;  1YKZ X;  1J1O Y;  2LZ2 A;  5F16 A;  5A3Z A;  3ZVQ A;  194L A;  4BAF A;  3IJU A;  4LT3 A;  1GF4 A;  5I4W A;  1LYY A;  1F6R A;  1LTM A;  2CJL A;  3LYO A;  4TSC A;  3WVY A;  3LHM A;  3FI7 A;  2ZWB A;  2YBH A;  4QDN A;  1GFH A;  1HEQ A;  3TXH A;  4LGK A;  5KXR A;  5J7C A;  5HMJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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