5ILFA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme and compound 4, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ilfA00
1QUTA 4CFPA 1IOTA 1CJ8A 2DKVA 4J1AA 4LGKA 4NGLA 4P2EA 1IC7Y 1LSCA 4GN5C 2YBJA 2ZNXY 2H5ZA 2I6ZA 1J1XY 3B72A 3G3BB 2Z39A 3LYZA 3G3AB 1B7SA 193LA 1JIYA 1LMNA 3AB6A 1QSWA 1CKFA 4ETCA 2X0AA 1GB7A 1T6VL 4HJYA 1LZRA 3TXBA 4B4EA 1LZCA 4H9FA 1IO5A 1GDXA 1QUSA 1QTKA 3WXUA 1IP1A 2MECA 1IP5A 4R6CA 4U3XB 1HHLA 4WM1A 1CKCA 4QGZA 1OUFA 3A34A 5T3FA 4H94A 5FCPA 2BQDA 4X3BA 1WQNA 4N1EI 3WXTA 1F0WA 7LYZA 3WW6A 4WL6A 3WPLA 3WW5A 3A94A 5F16A 1LZ4A 2BQAA 4G4HA 4NHQA 3GXRA 2YBHA 5IHGA 2HECA 2BQGA 1HFYA 4NSHA 2ZILA 3AZ6A 4NG1A 1FLYA 4PGJB 3TMUA 4B0DA 1FKQA 3CT5A 1TBYA 3AYQA 1HERA 4XYYA 4YENA 1P2CC 1LHHA 4E3UA 4WM6A 4DD3A 1YROA 3CSRA 1LJHA 1RE2A 5FEKA 3TXJA 4HJVA 5LINA 1I1ZA 4NWHA 1KIQC 2N5ZA 4XN6A 1KIRC 1C7PA 1V7TA 2W1YA 2G4QA 4ETDA 1B2KA 1LJ3A 5DL9A 1WQPA 5KXYA 4ZEEA 5KY1A 1INUA 4Z98A 3T6UA 3ULRA 4IASA 1UIFA 4TTDA 1IP3A 1LSAA 3P68A 1ZV5L 9LYZA 1LSEA 4RLMA 3A91A 4LYCA 1LMTA 3VWOA 2F30A 8LYZA 4MCKA 1KIPC 1YKZX 5KJ9A 5B1FA 3FE0A 3WPJA 4KXIA 4NGKA 3SP3A 4G9SA 5LAGA 1GXV2 4NGWA 5LVJA 2DBTA 3HBHA 207LA 2YVBA 1OUIA 4PRUA 3QE8A 4HTKA 4OWHA 1B5ZA 1LCNA 1YAQA 1D6QA 5FSTA 5A3ZA 1PS5A 1IX0A 3IJUA 4LT0A 2LYOA 4D9ZA 4TSBA 1B5WA 3W6BA 1C45A 4LYOA 1UIHA 1LJ4A 4YEOA 3KAMA 1GFGA 4H1PA 4DWXA 1IWVA 3AZ4A 4XJIA 4FDYA 4RW2A 2MEBA 5DN4A 4CGEA 2MEGA 4LYBA 1GFUA 1IEEA 1A2YC 3WULA 4GLAA 2H9KA 4WM4A 1GBYA 4DDCA 1GF0A 1LSBA 1REXA 3CT1A 1B7RA 1QIOA 1TEWA 3AJNA 3WU7A 1CJ6A 1GFHA 4WO9A 4YOPA 5FELA 2DQGY 1LZGA 1GBSA 1IR9A 2ZYCA 1BHZA 5LVKA 1H6MA 2I25L 4H8ZA 4WM5A 4XJHA 4N8ZA 2FYDA 3TMWA 3J6KA 1B5YA 2MEDA 4G49A 1HELA 2LYZA 4B4IA 1RFPA 3TXDA 5HLLA 2BQNA 1QDTA 1LKSA 4UWVA 5KXWA 4ETAA 1IWTA 5DM9A 1LJJA 1LHMA 2YBNA 1LSZA 5HMJA 1VAUA 4H8YA 1LJEA 2W1XA 2DQDY 5KKJA 1LZBA 2DQEY 4QEQA 1GF3A 1LSFA 1IY3A 4GCDA 5C6JA 1LAAA 2FBBA 3LYOA 5F9UA 1BWJA 1GFAA 1MLCE 5APEA 1C43A 1BB6A 2Z2FA 1UIGA 1OQMA 1IP4A 1XEIA 2BQEA 2LHMA 2D4IA 3RZ4A 4GLVA 1DPXA 2IFFY 3TMVA 1LTMA 4QY9A 1TAYA 2MEEA 2EQLA 2WARA 1DZBX 1JTOL 4DD9A 1JJ1A 4NWEA 2Z37A 1BWHA 2ZYPA 5HMVA 4HJZA 1GBZA 3LYMA 1VDTA 4GCFA 134LA 1GF8A 1JKCA 1LJFA 4BS7A 2HU1A 3RU5A 2CGIA 5HQ1A 1JSFA 1B7MA 3HFMY 3LN2A 3P66A 1GDWA 1JTPL 2DQHY 2XJWA 4BADA 2VB1A 1GE0A 1JPOA 5KXRA 1GPQC 2HEDA 1WQMA 1QTEA 4OOOA 5KXXA 1GF4A 3WMKA 3A92A 4LFXA 1OUHA 5F81A 5KXLA 1HC0A 4WLYA 1QSAA 5AMYA 1YAPA 1IWWA 1GE1A 4N5RA 1GB8A 4NHSA 5B05A 4OOTA 4ETBA 5I4WA 3E3DA 2Z38A 2CWIA 4M6DA 4H91A 6LYTA 1WQQA 3QY4A 2CDSA 1LZ5A 1XGUC 1CNSA 4DD0A 3A3RX 4G4CA 1IR7A 2BQCA 1F6SA 2BLYA 4OWAA 1REZA 3P65A 4DDAA 4J0LA 4PRQA 1B7PA 1VEDA 1XFPL 4NEBA 2C8OA 3A8ZA 4II8A 4NIJA 1NF5A 1GAZA 1VDQA 4I8SA 4OW1A 4TSCA 1OUBA 1LJKA 1WVVA 2HEFA 3BKVA 1IC4Y 1LZ8A 4WLTA 1BB4A 1XEJA 2BQHA 4HP0A 1HEPA 3AGIA 1GFRA 2DQCY 4RDSA 1GE4A 1FLUA 1GFVA 5A3EA 1OUJA 4J1BA 1GB0A 2D91A 2HUBA 1LKRA 1UA6Y 1FLQA 3AZ5A 3P4ZA 4GCEA 1J1PY 3RW8A 3WUNA 1LMQA 3WYHA 1WQRA 1UACY 4YEMA 5II3A 1G7LC 3WVXA 2IHLA 3FI7A 2D4KA 2BQIA 1GEZA 3MGWA 4XENA 5B1GA 5D5CA 1B7NA 4NHTA 1IWXA 5FHWA 1GAYA 1AM7A 3WH1A 1C46A 1G7HC 1GFJA 4KT3A 3P64A 4Z3MA 2RSCA 3J4GA 2BQJA 3CQLA 2BQKA 1JJ0A 1YL1X 6LYZA 1IORA 4NSIA 4GCBA 4XJFA 1LJNA 1EL1A 3WVYA 5LYMA 4OWEA 1GE3A 1OP9B 4LT3A 4XADA 4TX7A 1YQVY 4WMGA 4J7VA 4WLXA 1LSYA 4H92A 1CKGA 1FKVA 2F4AA 1B0DA 1CKDA 1XGTC 2FBDA 1IWZA 4C5FA 1GFTA 1UIDA 4R0FA 4CFOA 1G7JC 1LMOA 1V7SA 1F10A 2Z2EA 1GB6A 1WTMA 3EBAB 4WG7A 4HPIA 3QNGA 3WL2A 5I4YA 1VDPA 5L3HA 1GFEA 4AGAA 5F9XA 3A67Y 1YAOA 1NHEA 1I56A 5LAFA 2B5ZA 4IATA 4EMNA 1TCYA 2BQMA 2HTXA 2BQBA 5KKIA 135LA 1VFBC 4LT1A 4KPMA 3D3DA 1W08A 1GB5A 2Z12A 3N9AA 2Z19A 1JTTL 4L41A 4WG1A 4CHXA 1OUCA 1TDYA 208LA 1ALCA 1LZYA 1IOQA 1DQJC 5IELA 5LXWA 1IR8A 4YF2A 3HBDA 1LZ6A 1YIKA 3ATOA 3OJPA 4LZTA 4PHIA 1NWGA 3TMXA 3TXGA 3W6DA 1LYSA 3ZVQA 4M4OA 5LVIA 4WM3A 5KXSA 1IWYA 1FBIX 1B9OA 1IWUA 1GE2A 1O23A 5J7CA 5KXZA 5E9RA 1GXXA 1LOZA 5M1YA 1IC5Y 1GF5A 1WTNA 3B0KA 3AZ7A 3OK0A 1A4VA 1GFKA 4WOAA 1NKHA 5APDA 1GBXA 1UIAA 4B49A 3TXFA 4ZFPA 4NGIA 1BQLY 1JKBA 1B7OA 4DD1A 4UWUA 1HMLA 1KXWA 1YL0X 5APFA 4GCCA 4LYZA 1OUEA 4TWSA 1SLYA 5LA8A 4HTNA 2G4PA 1Z55A 2YSSC 5DN5A 2F2NA 2A7DA 4C3WA 4I0CA 1RI8B 2W1MA 1DKJA 5LYZA 1GF7A 4GN3A 4NHIA 1YAMA 3IWRA 2BLXA 2EPEA 3K3TA 4Z46A 1NDGC 3A6CY 4HPEA 1DKKA 2BQOA 1CJ7A 1HEOA 3B0OA 4MR1A 4MSTA 4YM8A 1D0MA 1IOSA 1GD6A 1HEQA 1UBZA 2LZTA 3W3EA 2ZQ4A 3GXKA 1BB5A 1LSDA 1LYYA 4HV2A 3ATNA 5ILFA 3EO5A 5C6LA 1H87A 1LMAA 2DQFC 4EOFA 2HEBA 4HTQA 2ZIKA 1DI5A 1DXJA 1UIEA 3ZVQB 2XBSA 1D0LA 1OUDA 1JKAA 1BVXA 1GF6A 1RJCB 1XGRC 1YKXX 2Y8PA 3AW6A 1LYOA 3D9AC 4H9HA 4PPOA 1SQ2L 1VATA 4B1AA 1G7MC 2HU3A 2BQFA 2EKSC 1DI4A 1D9UA 2LYMA 3LYTA 3CSQA 1NMMA 1XSFA 2DQIY 3BKHA 1BVKC 4AXTA 1LZ9A 1N4FA 3A3QA 1EQ5A 1MELL 4DYGA 1GF9A 2DQJY 2YBMA 1CKHA 1B7LA 1XGPC 5EBHA 4ML7A 1LYZA 3W6CA 1BWIA 2BPUA 1KXXA 132LA 4Z41A 1LSPA 5APCA 1AZFA 3W6AA 4N9RA 1I20A 1LMCA 4DC4A 1ZVYB 5ILCA 154LA 1E8LA 1FLWA 2MEFA 4N1CC 5KXPA 1GHLA 4IJ4A 4NGVA 1LZDA 1JUGA 2ZIJA 3AW7A 3CT0A 4WL7A 1FN5A 5E4PA 1AT6A 1HEWA 1LPIA 1NBYC 4HSFA 1IP7A 5KXNA 4OWCA 2C8PA 2I26L 1HEMA 1WVUA 4BAPA 1B5VA 3A96A 3M3UA 5C6IA 1B7QA 1UIBA 1LZSA 1J1OY 5D5FA 5LYTA 3EXDA 1EQ4A 2A7FA 3RNXA 3ZEKA 3N9CA 1IVMA 1DI3A 1AKIA 4UWNA 1LJIA 3TXKA 1LMPA 1NQIA 4DD7A 1YILA 3T36A 2Z18A 2ZQ3A 5B06A 5DLAA 1B5UA 2LZ2A 4NGJA 1HSWA 5I4XA 1BGIA 3A93A 1JKDA 4RLNA 4H90A 1OUAA 3CB7A 2XBRA 2BQLA 1D0KA 2YBLA 4W94A 4H9BA 4ET9A 4GN4A 1T3PA 1NBZC 1VDSA 4ETEA 3CSZA 1C10A 1FDLY 3TXEA 4LFPA 4TUNA 5K7OA 133LA 1HFXA 2ZNWY 2MEAA 3W6FA 1LZ1A 1B5XA 1JHLA 1G7IC 3B0IA 1RCMA 4OWBA 2EIZC 5I53A 3LZ2A 1EQEA 1D6PA 4ANRA 1HSXA 1LZTA 2HEAA 1LSGA 3AGGG 1IP6A 1LHLA 1QQYA 2XTHA 1BB7A 4N0JA 5LA5A 2H9JA 4WO6A 1DPWA 3EMSA 2HEEA 5B59A 1HFZA 1GEVA 1XGQC 4CJ2A 1GB3A 1AT5A 5HNLA 4H9IA 1JSEA 4NGOA 1OUGA 1PZYA 5JENB 1WQOA 4G4BA 5KXMA 1IY4A 1LHKA 5LIOA 1JEFA 4WM2A 2Q0MX 3F6ZA 3HBEX 4WLDA 1W6ZA 1IP2A 2W1LA 1HMKA 1GB2A 1LJGA 2YDGA 3WPKA 2F4GA 1IOCA 3B6LA 1F6RA 3A6BY 5LVHA 5B07A 4NFVA 3TXIA 4KL7A 1YKYX 2MEHA 3WUMA 4XJGA 1IIZA 5IDDA 1QDRA 2PC2A 4DDBA 4BAFA 1UICA 5LVGA 1LSNA 2GV0A 4ET8A 4LYMA 4RW1A 5I54A 4PJ2C 3W6EA 3N9EA 4FJRA 3WU8A 5KXKA 1XEKA 194LA 5L9JA 4NGZA 4XJBA 3LHMA 1HENA 1HF4A 4NY5A 3RT5X 1LZEA 4LT2A 4W96A 4B4JA 153LA 1BB3A 1UC0A 4QDNA 3A95A 1CJ9A 3IJVA 4H9EA 3TXHA 1JJ3A 4NHPA 2AUBA 2FYCA 2MEIA 5KXTA 1JISA 2DQAA 4H8XA 4XJDA 1LHIA 4NGYA 2D4JA 4LYTA 1KXYA 3M18B 4O34A 5FDJA 2NWDX 3A90A 1NDMC 3WUAA 1UUZC 2G4NA 4H9AA 4A7DA 1LZNA 1JWRA 3LZTA 1GBOA 2YBIA 1GB9A 1ZVHL 1C08C 2CJLA 2ZWBA 2D6BA 1LHJA 5I5QA 1YANA 4DD2A 1GBWA 5HNCA 5KXOA 3AGHA 4H9CA 4NSJA 4DT3A 4ZIXA 1HNLA 4NSGA 1LZAA 4H93A 1REYA 1REMA 1ZMYL 4HV1A 1GWDA 3WU9A 1JITA 4NG8A 5L3IA 1UCOA 1LSMA 5F14A 2BAAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUTA 2DKVA 1IC7Y 1L44A 1LSCA 4GN5C 2YBJA 2H5ZA 3HTDA 1C6TA 2Z39A 1JIYA 1CU3A 3FADA 1CKFA 1OV7A 239LA 1T6VL 4EKSA 4H9FA 2B74A 1QUSA 1QTKA 256LA 4QGZA 2BQDA 4X3BA 1WQNA 4N1EI 3WXTA 1F0WA 2OTZX 177LA 2NTGA 2O7AA 1PQIA 2BQAA 4I7LA 2YBHA 4B0DA 2ZILA 1L45A 1C6DA 1HERA 3CDTA 1LHHA 1YROA 1RE2A 1QTHA 3TXJA 5LINA 1G0GA 1C60A 229LA 2G4QA 4ETDA 1C6GA 5DL9A 2OE4X 1INUA 3T6UA 3ULRA 4LZMA 1LSAA 3P68A 226LA 3A91A 3VWOA 4MCKA 3K2RA 1L76A 3WPJA 169LA 1GXV2 5LVJA 2DBTA 2YVBA 4LDOA 4OWHA 1YAQA 1D6QA 1IX0A 1L00A 151LA 1OVKA 1C6FA 3W6BA 1LJ4A 1L15A 4ARQB 2RB2X 4DWXA 1IWVA 4RW2A 2B6TA 5DN4A 2A4TA 3WULA 4S0WA 4WM4A 1L40A 1DYBA 1REXA 1QIOA 1TEWA 4YOPA 1CX7A 1L02A 2IGCA 217LA 1C6HA 4H8ZA 1CU0A 4N8ZA 1QUGA 2RBNA 3J6KA 180LA 246LA 206LA 4G49A 2BQNA 4I7JA 157LA 1LHMA 2RAYX 5HMJA 1VAUA 4H8YA 4EKQA 2DQEY 4GCDA 1L27A 5C6JA 5F9UA 5APEA 1C6MA 1L08A 2LHMA 4GLVA 244LA 1WTHA 2MEEA 2EQLA 2WARA 4DD9A 4NWEA 1GBZA 137LA 260LA 1PQMA 1B7MA 1L51A 2ANVA 3HFMY 3LN2A 1GDWA 1JTPL 2DQHY 2XJWA 2VB1A 1WQMA 1QTEA 4DQ7A 3PBLA 5AMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QUT A;  4CFP A;  1IOT A;  1CJ8 A;  2DKV A;  4J1A A;  4LGK A;  4NGL A;  4P2E A;  1IC7 Y;  1LSC A;  4GN5 C;  2YBJ A;  2ZNX Y;  2H5Z A;  2I6Z A;  1J1X Y;  3B72 A;  3G3B B;  2Z39 A;  3LYZ A;  3G3A B;  1B7S A;  193L A;  1JIY A;  1LMN A;  3AB6 A;  1QSW A;  1CKF A;  4ETC A;  2X0A A;  1GB7 A;  1T6V L;  4HJY A;  1LZR A;  3TXB A;  4B4E A;  1LZC A;  4H9F A;  1IO5 A;  1GDX A;  1QUS A;  1QTK A;  3WXU A;  1IP1 A;  2MEC A;  1IP5 A;  4R6C A;  4U3X B;  1HHL A;  4WM1 A;  1CKC A;  4QGZ A;  1OUF A;  3A34 A;  5T3F A;  4H94 A;  5FCP A;  2BQD A;  4X3B A;  1WQN A;  4N1E I;  3WXT A;  1F0W A;  7LYZ A;  3WW6 A;  4WL6 A;  3WPL A;  3WW5 A;  3A94 A;  5F16 A;  1LZ4 A;  2BQA A;  4G4H A;  4NHQ A;  3GXR A;  2YBH A;  5IHG A;  2HEC A;  2BQG A;  1HFY A;  4NSH A;  2ZIL A;  3AZ6 A;  4NG1 A;  1FLY A;  4PGJ B;  3TMU A;  4B0D A;  1FKQ A;  3CT5 A;  1TBY A;  3AYQ A;  1HER A;  4XYY A;  4YEN A;  1P2C C;  1LHH A;  4E3U A;  4WM6 A;  4DD3 A;  1YRO A;  3CSR A;  1LJH A;  1RE2 A;  5FEK A;  3TXJ A;  4HJV A;  5LIN A;  1I1Z A;  4NWH A;  1KIQ C; 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 1JSE A;  4NGO A;  1OUG A;  1PZY A;  5JEN B;  1WQO A;  4G4B A;  5KXM A;  1IY4 A;  1LHK A;  5LIO A;  1JEF A;  4WM2 A;  2Q0M X;  3F6Z A;  3HBE X;  4WLD A;  1W6Z A;  1IP2 A;  2W1L A;  1HMK A;  1GB2 A;  1LJG A;  2YDG A;  3WPK A;  2F4G A;  1IOC A;  3B6L A;  1F6R A;  3A6B Y;  5LVH A;  5B07 A;  4NFV A;  3TXI A;  4KL7 A;  1YKY X;  2MEH A;  3WUM A;  4XJG A;  1IIZ A;  5IDD A;  1QDR A;  2PC2 A;  4DDB A;  4BAF A;  1UIC A;  5LVG A;  1LSN A;  2GV0 A;  4ET8 A;  4LYM A;  4RW1 A;  5I54 A;  4PJ2 C;  3W6E A;  3N9E A;  4FJR A;  3WU8 A;  5KXK A;  1XEK A;  194L A;  5L9J A;  4NGZ A;  4XJB A;  3LHM A;  1HEN A;  1HF4 A;  4NY5 A;  3RT5 X;  1LZE A;  4LT2 A;  4W96 A;  4B4J A;  153L A;  1BB3 A;  1UC0 A;  4QDN A;  3A95 A;  1CJ9 A;  3IJV A;  4H9E A;  3TXH A;  1JJ3 A;  4NHP A;  2AUB A;  2FYC A;  2MEI A;  5KXT A;  1JIS A;  2DQA A;  4H8X A;  4XJD A;  1LHI A;  4NGY A;  2D4J A;  4LYT A;  1KXY A;  3M18 B;  4O34 A;  5FDJ A;  2NWD X;  3A90 A;  1NDM C;  3WUA A;  1UUZ C;  2G4N A;  4H9A A;  4A7D A;  1LZN A;  1JWR A;  3LZT A;  1GBO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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