5IMFA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f5
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
b'TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imfA00
2YANA 3FR6A 1SL2B 5B7CA 2ZCTA 4V2MA 1YJ6A 3IC4A 3KJYA 4PQIA 2CZ3A 4MH2A 4ML6A 4IN0A 1F2EA 1WE0A 4EF0A 4QL9A 1QQ2A 2MZCA 4L5LA 4OFNA 4TOPA 3F63A 5LD0A 2HZEB 1V2AA 2PU9C 2C0DA 2R2JA 2LNTA 3E0UA 3J7Yb 4BL7A 5ABRA 3A2WA 2H1GA 4ZBDA 2PVQA 2HZFA 2C8UA 1A0RP 1Z6MA 1XWAA 4MPGA 3D5JA 5A4VA 5AIVA 5DQSA 1NHYA 2FHEA 1U87A 4MZBA 4ZBBA 4GCIA 4TXVA 4G9HA 2PERA 4FYCA 3L9VA 5DCGA 4N0VA 3F4SA 4NMUA 5AISA 3QFAC 6GSWA 1ML6A 1SYRA 1XW5A 2HE3A 1F3BA 3DGQA 5D9TA 1CQGA 2M80A 1R7HA 3WD6A 4TW5A 3CSIA 1G7OA 4PUAA 4PX1A 5CRHA 4OD7A 4EUYA 2ALBA 1HNBA 1YF0A 1A2LA 3I6AA 3A5WA 3GHAA 2IMIA 1GTAA 2KLXA 1AUCA 1ZZYA 3ME7A 1TOFA 4FH8A 3IK9A 1SENA 4IELA 3WGEA 4OO4A 2DJKA 3M9KA 3EMXA 1ZCPA 2B6MA 2L5LA 4FO5A 3UARA 1GSFA 2EC4A 3D0ZA 3ZVJA 4EXJA 5HQPA 1M2BA 2H30A 1FB6A 1XPVA 4O5RA 3CMIA 4JRRA 5IIZA 1K0AA 3IAS2 4XS6A 1WP0A 4HJMA 5A4WA 4K7IA 4IJ3A 2C4JA 4JU5A 3GH6A 3TKPA 1R5AA 3KTLA 1Z7RA 4LA1A 1J9BA 3K8NA 3F4TA 3TRPA 4KX4A 2FCHA 1T00A 5F8BA 2CX3A 1AW9A 2DIYA 1Z9HA 4KE3A 2CT6A 2DMLA 1Z3EA 2KHPA 3WT2A 2WJUA 2JSZA 4I5QA 2IWTA 2LQOA 5IMVA 1TKDB 1X5EA 2A2RA 3G7YA 1NSWA 1ZOFA 1ZYEA 3RHBA 3GSTA 5J9BA 4NV2A 3TJBA 5HR0A 3I9V2 3O6TA 3NIVA 2RUFA 1GUHA 4J2FA 2F8AA 3TGZA 3MNGA 4I6XA 4WKWA 3ZFLA 1KEBA 4ISDA 1PD21 4XHMA 4I2UA 2VD1A 2H1AA 2JACA 4KUNA 2EIOA 3C71A 2WRTA 4X1UA 5HFKA 5EVOA 4QQ7A 2JZTA 3CSJA 4RUVA 10GSA 4YAPA 3HY2A 3TKQA 5ELGA 3PINA 4X0XA 3TCOA 1Y25A 4WXTA 2XPEA 1LJRA 5ECNB 4KH7A 2TRXA 1SD9A 2R6KA 4RI7A 4POBA 1B9YC 4TR1A 2PWJA 2MMAA 1GWCA 2B7JA 2MMOA 3QD9A 1W4VA 3R2QA 4ML1A 3NOFA 2HI7A 3IPZA 5HFIA 1GSDA 3IAM2 4ECJA 1ILOA 5C04A 2IMDA 2QC7A 1S3DA 3FK8A 4WBJA 1I5GA 2L5OA 2MMZA 1SL1B 4MDCA 4ZL9A 4IQAA 4LL1B 5ID2B 2H76A 3TOTA 2YJHA 3CXGA 2IL3A 1TRWA 5ECHB 4K7OA 3IK7A 1OC3A 3GYKA 1AQWA 1M9AA 1Y6EA 3LYKA 1AIUA 1TK8B 5CREA 2R37A 1YZXA 1XVWA 3VWWA 2YZHA 1VF2A 1XZOA 1PL1A 4MP4A 4ZIJA 3UAPA 1R5PA 5FHIA 1NM3A 4MZCA 1EOGA 4PNFA 1XWKA 1OYJA 1AXDA 3HVSA 4LMVA 1EP8A 3GSSA 4MZWA 3GKMA 3FEUA 5KN3A 4ZB8A 1HYUA 1GTUA 4CHSA 4RQXA 3Q6OA 3RAZA 4TKYA 3EU4A 3KMNA 3M9JA 4EKZA 1GL8A 4K0GA 2DJ3A 1BYEA 1JLVA 2V2GA 3N5OA 1Z5YE 2VD0A 4BWSA 4GLTA 4HQZA 3RDWA 4V1Ap 1K0BA 3FRCA 4MA9A 1IYIA 4NHZA 4IHUA 3D22A 2F3MA 3H1NA 3LWAA 1PMTA 2AB6A 2OE0A 5B6NA 4HDEA 1AQVA 1K3YA 8GSSA 2QGVA 1FVKA 5IQYA 3I69A 5F05A 4N30A 4MF6A 2GSTA 2CVBA 5DDLA 1GUMA 1NW2A 2YP6A 5IMDA 3LEFA 1EGRA 1PA3A 3LGCA 2CA8A 2LRNA 4MPFA 2VO4A 5GAPD 2HZEA 4YH2A 3O3TA 3KP8A 5EPFA 1S3AA 2H0GA 5IOXA 3EC3A 5ENUA 1R26A 4FIWA 3APSA 2L57A 2LKUA 1EEJA 5JCWA 3CTGA 4GSNA 4NHWA 5CRWA 2X8CA 1BEDA 2VL3A 1XXUA 5F0GA 4KSMA 3F0IA 1O73A 4N10A 2HRFA 2FUG2 4F03A 4K6XA 1VF1A 1V57A 1SYXA 2NVLA 4DSRA 1T4YA 3TJJA 4RQRA 2HYXA 1LU4A 1K0CA 4IP1A 2CZ2A 4AGSA 3SWLA 3HKRA 3P90A 2XBIA 11GSA 2LV3A 1YY7A 2KUCA 3D4TA 3HZ8A 1Q4JA 4MF5A 2O85A 1XW9A 3GN3A 3RPPA 2LJAA 1GULA 2LQQA 3CRTA 2RM5A 4O32A 4L5OA 1NHOA 2B1LA 2X8HA 1YEPA 2B1KA 4V2NA 2C0EA 4F9ZA 3FZ5A 4K7NA 1M9BA 2FD3A 4DSSB 3UOMA 4KGIA 3IR4A 3DD3A 5GSSA 2H74A 3FZAA 4EVMA 1WIKA 1GNEA 3GIXA 3QFBC 2D2ZA 2G2QA 4OFMA 3QAVA 1M2DA 5IMCA 1TK5B 4I8BA 3HDCA 2V32A 3L78A 4OCFA 3E3EA 3IBHA 3QPMA 4ZBAA 4J57E 4JR6A 2GSQA 5D9VA 2VCXA 5D9XA 5IPHA 2FLSA 1IYHA 5J3RA 2E2GA 3F8UA 2F9SA 1ABAA 4BA7A 2VLTA 5HR1A 5CNWA 1GLPA 2DLXA 3UMAA 3ZTLA 1F9MA 1O8WA 2CVDA 3A3TA 3CYNA 5ECRB 1FG4A 5IMAA 2R5GA 5INYA 5DAKB 1K3LA 2CAIA 3WYWA 1XWCA 1B9XC 3FHKA 4XS4A 4LMWA 1SL0B 2HSYA 5DQYA 4WEYA 2OADA 3DWVA 1A0FA 2V6KA 1OE8A 1XWGA 4K2DA 2JU5A 5HR3A 3RBTA 3BJ5A 4TVEA 1F37A 4H86A 2VCTA 2DJ2A 2FGXA 2ES7A 2GT5A 1KTEA 1V58A 1EV4A 1FAAA 1PQNA 1RQMA 5HFGA 2I1UA 2CQ9A 2PVOC 1SK0A 3IA1A 4HOJA 4G2EA 1O7UA 5CRGA 3F4RA 3KH7A 1SKWB 18GSA 3FKFA 3HHVA 2LRTA 2B5XA 4MJEA 12GSA 5J9CA 2VLVA 2RIIA 2JSYA 3KH9A 4I97A 2DBCA 4Q5QA 2G0FA 5E59A 3ZREA 4IBPA 2N5BA 1MDIA 1OC8A 2GDRA 2X99A 3DIEA 3BCIA 1QUWA 2J9HA 4XIHA 1JZRA 6GSUA 2EIRA 1X5DA 2VOCA 4GRFA 1J08A 2H6ZA 3HD5A 1UC7A 4ZB9A 3GX0A 5G1KA 2B3SA 2FY6A 3O76A 1N8JA 3L9UA 3EMPA 2X8GA 3VPTA 4IVFA 1PX7A 4NV5A 1ERTA 1G6YA 2OE3A 2C3NA 5IO2A 4WR5A 5ECMB 3WGXA 1USBA 5JCUA 5KEJA 4KW6A 4MK3A 2VL2A 3ZMLA 3TJGA 3CTFA 1E6BA 2H1BA 3GKKA 3ED3A 5ID2A 1ZMAA 1K0NA 1A23A 4F0BA 3LXZA 5D73A 2E7PA 2L6CA 4TN8A 4XS4B 4E8HA 2P5QA 4AJ6A 4QL7A 4JR4A 3LJRA 4KDXA 3ERGA 3HVXA 3TDGA 2VLUA 5F06A 4BVXA 5JWQB 4EE0A 2B7KA 3D6IA 4IGJA 1O85A 3DVWA 4KCAA 3PGTA 1XOAA 6GSSA 4GTUA 2X64A 3A2VA 1M0UA 2GQKA 4FYBA 1XIYA 2H72A 2QKEA 1AC1A 4ILFA 1QMVA 5DJMA 2L4QA 5CYYA 2R3XA 1VRSD 1BJXA 1XCCA 3DYRA 3MWHA 1Q98A 1UA5A 3LXTA 5IMFA 4KNDA 4FYUA 4OCEA 1XVQA 2PGTA 3MDKA 5DVBA 1TRSA 1GSYA 4OFTA 3QAGA 3TJFA 2I4AA 3FYGA 2VCWA 1MTCA 4BPYA 4NAXA 4GQCA 5G5EA 3IDVA 1XOBA 3LSZA 4AJ7A 1QXHA 2N5FA 1PKZA 3GMFA 2GT6A 2I3YA 3C1RA 3EINA 3FY7A 4TXOA 2DJJA 3GRXA 4ZL8A 4IQ1A 1WMJA 4EL1A 3H8QA 4ECBA 5ECPB 2VL9A 2CV4A 2FWHA 2V1MA 5DBQA 3GKNA 3TRQA 4TRXA 4PGTA 2DJ0A 4YQUA 5J41A 4D73B 2K8VA 3ERFA 1WWJA 3BD2A 5KN1A 1HNAA 1TU8A 3ERWA 4G10A 2DIZA 2ON5A 3QMXA 4MLYA 2H0IA 1G7EA 2YWOA 1PRXA 2CAQA 3IE3A 4ID0A 3UBLA 2IMEA 7GSSA 2I9HA 1GP1A 3FR9A 3ZIJA 3BBYA 3HJPA 4GXZA 2GTUA 4V1Ag 5KN0A 20GSA 4NXIA 3ZLPA 5AIXA 3VPQA 3CSHA 2WB9A 3GX8A 4L8EA 5B8BA 2P0GA 3QAWA 4JEDA 1AQXA 3C7MA 3IXRA 2NPBA 1QGVA 1XW6A 2YOIA 3M8NA 1FB0A 2LS5A 1HD2A 3UEMA 3TKRA 1U3IA 3N9JA 3D21A 1U88A 4J56E 3G9BA 5G31A 2XBQA 5ECKB 2KP2A 2VM2A 4ULXA 2F51A 3UIWA 1G6WA 1OKDA 3WGDA 3U5RE 2A4VA 3CBUA 6GSYA 2A2SA 1ON4A 1TTZA 3FZ9A 5F07A 4MABA 2H0HA 4BVYA 1TRUA 4IJIA 5G1LA 5HR2A 3LFLA 4DSSA 1PL2A 4KB3A 4EDZA 4TXOB 1B48A 3IRAA 1A8LA 3LG6A 16GSA 1GSSA 5AGYA 5AN1A 1U6TA 1URMA 2IPAA 2JZRA 2VM1A 6GSXA 3IOSA 1GRXA 5IM9A 4Q5FA 1PGTA 3HZ4A 2GSSA 1GSUA 2H66A 1VGLA 2LJKA 4WETA 5D8IA 6GSVA 3F9UA 1OVNA 2CVKA 4K8MA 2PMTA 1O6JA 1BX9A 2AUVA 1F3AA 3KEBA 3TOUA 1PX6A 3VFIA 2REMA 1R4WA 1THXA 2ZUPA 2VIMA 1JZDA 5DAKA 1SK1A 2OKAA 4HS1A 1UVZA 2H75A 3GTUA 4KDUA 4YQVA 2LNSA 1A2MA 1F6MC 1TI1A 1YDKA 2Z9SA 2OBIA 2O87A 1JZOA 2AJQB 2LSTA 3VWVA 2P5RA 1JLWA 3TKSC 1SKSB 4OO5A 4ECIA 1FOVA 4XS1A 4IKHA 4K0NA 3G7JA 1TRVA 2DMMA 2L59A 1OC9B 3UJ1A 3SBCA 3L9SA 1OAZA 2IJYA 1SKRB 2K6VA 1MD3A 1QK8A 2GZYA 1DUGA 3QR6A 2PUKC 1THOA 4PURA 5FT3A 4ZL7A 5IOWA 4IP6A 3C1SA 1M2AA 3W6GA 1GH2A 3G7IA 5ELAA 2O89A 3UBKA 4PQHA 4JE1A 2TIRA 3KIJA 1BAYA 2H6XA 3J7Yk 1OKTA 1GLQA 1GTIA 1U3AA 5ECSA 3VWXA 3VI5A 2H1DA 2C3TA 5D9WA 3KM6A 4IW9A 4MJBA 3TUEA 5C00A 1SK2A 2XC2A 3W8JA 1BG5A 4F82A 4TR4A 4MF7A 3Q19A 3DRNA 2O8VB 2OJLA 2LJRA 3BCKA 4K1FA 1T4ZA 3GL3A 4N0ZA 1ZYQB 1SJZA 3FW2A 1EV9A 1TDIA 1ACVA 4N11A 2QSIA 2KOKA 4P3YB 5CAXA 3GFKA 2GZZA 2YJ7A 3F3RA 3DEXA 5IMZA 4NWYA 3L0HA 3ZZXA 1DE1A 3HVVA 1WRYA 4POMA 1KNGA 2GQLA 2WS2A 5CP1A 3RHCA 4DVCA 5J4UA 2LTKA 4HZ4A 5G5FA 3GTUB 4HEA2 5D93A 2AYTA 1XBSA 4YAVA 5ECIB 1B4PA 1H4OA 4XTSA 4WF4A 2WGRA 2FWGA 4LL4B 2MYGA 4GQFA 3ME8A 1TI3A 2R4VA 3M0FA 3JCML 2HSHA 4KDYA 1JFUA 2GZPA 5JCGA 4EC0A 1JZWA 3I43A 2GLRA 1RW1A 4AJ8A 1V40A 4GSTA 1A24A 3TB2A 5CRDA 3L4NA 1YF1A 2B5EA 4OWYA 1UN2A 2JL4A 4HJ2A 4YQMA 2YNXA 3HJMA 2I81A 1B4QA 5H5RA 4HUAA 2WZ9A 4GWRA 3DXBA 4L0WA 4MMMA 3ZMKA 4WR4A 1O81A 4ZXGA 2DC5A 3H93A 5GZZB 2IIYA 2AAWA 1TJDA 4XRAA 3BOAA 2K9FA 3GA4A 1SU9A 3KD0A 1O8XA 4PUFC 3EVIA 3HA9A 4LLRA 5A4UA 1C72A 2K18A 2HNLA 3KZQA 3FZ4A 1ZGNA 3F3QA 3GL5A 5LCZA 4NPBA 1RK4A 4TR3A 2BMXA 3HYPA 1WPIA 3AY8A 4ZB6A 3W8SA 3US3A 2FNOA 1LBKA 3TKSA 2L6DA 1EOHA 2F8FA 3WT1A 1X9MB 1DBYA 3ZITA 1GUKA 2C0FA 2HXKA 2IFQA 1GSEA 2WCIA 4JZQA 2VUPA 4O7HA 3LYPA 2IMKA 1VF4A 3KGKA 4D73A 5KN2A 4KA0A 1GTBA 4MJCA 2NDOA 2VCQA 1X9WB 4ECCA 1K3OA 5ECQB 2MBSA 2GS3A 3IHQA 2B5YA 2YN1A 1ZL9A 4K9ZA 1QFNA 3TKSE 5FWGA 3UVHA 2YV9A 2L4CA 1OE7A 3OR5A 2IN3A 2YCDA 1ERWA 3GKXA 2PN8A 1EZKA 1EGOA 1SJ6A 3PR8A 5DALA 2PBJA 2DSAA 1XWBA 2NBSA 2H19A 5B6MA 6GSTA 2YZUA 2YPMA 2KP1A 4HU7A 1MDKA 2H6YA 4WF5A 3APOA 4AF2A 1MDJA 2H70A 2LUSA 2RLIA 2WDUA 1YQ1A 5JWRB 3ZL5A 4ACSA 4POKA 1YEXA 2O7KA 2JADA 3VLNA 2BJXA 4I2TA 1G0TA 3APQA 2OE1A 2GSRA 1T3BA 1K0DA 2V41A 2AV4A 1PN9A 3P2AA 4F2IA 2EIQA 2WFCA 3MSZA 3P7XA 2XPDA 1TXXA 3A2XA 1PSQA 2RUEA 1S3CA 2H73A 2YWIA 2LRCA 3KCMA 3EU3A 4OMVA 3ZRDA 5A5KA 1T7PB 3H79A 4PNGA 4L0UA 3GURA 1HNCA 3Q74A 4E8EA 5GSTA 5EY6A 5H5SA 13GSA 1AAZA 3V1WA 2OBKA 3F6FA 1ERVA 1N2AA 2IFQB 4O92A 2M46A 2P31A 5JWOB 3ZVJD 2XHFA 1FHEA 3GNJA 2NTOA 1I9DA 4GF0A 4TR0A 2FWFA 1K0MA 1M99A 2GVPA 3RPNA 3HJOA 4HQSA 5DCHA 22GSA 2GGTA 2YV7A 5E4WA 2V6OA 3EE2A 2OA7A 4X43A 3LORA 4F0CA 4GSSA 4JBBA 3PH9A 5J5NA 2HFDA 2GQMA 4IS0A 2VCZA 4Q5RA 3H4KA 2ZNMA 3QOUA 1M7TA 3QDNA 4V2LA 3EYTA 2H01A 1JHBA 4PXOA 1KBNA 4POLA 5DALB 2RM6A 3VK9A 2BTOT 3P8WA 3S9FA 3TJKA 3KTBA 2N5AA 4PQ1A 3DMLA 1OC9A 4WBRD 3M1GA 4EO3A 3LQ7A 2YWNA 19GSA 1BQ7A 5ECLB 3TRXA 1B8XA 2H71A 1MD4A 4MH3A 3UL3A 1TW9A 1EEMA 1T1VA 2VAFA 3EURA 4Z7XA 4KCEA 1FVJA 2C0GA 2PPTA 3CRUA 1A2JA 3KMOA 4Q5NA 3DKSA 5G30A 3KXOA 2OACA 5LNKe 2M72A 3ZFBA 1A8YA 3VWUA 2WULA 3ISOA 1TU7A 2DJ1A 4KSOA 4HU9A 1T8EB 1X5CA 3GV1A 5CO3A 4BWQA 4ZILA 1HQOA 2C3QA 2H8LA 3UVTA 1VF3A 2YWMA 2CX4A 5GAND 4TR1B 3NZNA 2FA4A 2ON7A 3ZIVA 1X0RA 4EDYA 2LEGA 3EWLA 5COHA 2JZSA 2K8SA 3U6VA 3DVXA 3HXSA 3E9JB 2HRNA 2C80A 2TRCP 1W89A 17GSA 1K0OA 4CDOA 1H75A 1Z7PA 3D4MA 1XFLA 3GH9A 1GSQA 2HT9A 1J0FA 2FWEA 1SJIA 2VCVA 1FO5A 1V9WA 1YKCA 3GUSA 1V98A 1Z6NA 4HI7A 3MAKA 3M3MA 3ZYWA 5L71A 5ECOB 4G19A 4CW9A 1DSBA 1YKAA 3Q18A 2IMFA 3HCZA 3KP9A 5G2ZA 3QCPA 5H5QA 2E0QA 4KAEA 5EL8A 3C73A 4DEJA 4HZ2A 1ST9A 5IO0A 3VURA 1TP9A 1WOUA 1DE2A 2VL2C 5B8AA 1SD8A 3VI7A 1WJKA 1EWXA 2FA8A 2E2MA 1PKWA 9GSSA 1EP7A 4XCSA 4RI6A 4MJAA 5IPGA 2MMNA 4DSQA 5D96A 2HLSA 1E2YA 14GSA 3F6DA 1GNWA 4XRDA 3C8EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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