5IO0A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f9
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 45
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io0A00
1X5EA 1K0AA 4POKA 4ZL9A 3O6TA 1TRWA 4OO4A 3L78A 2OACA 4TKYA 2PU9C 1YJ6A 3DRNA 1XOAA 5D96A 4DEJA 4TR1A 3KJYA 3ERGA 2R4VA 3CSJA 5JCUA 3FZAA 3FY7A 3DEXA 4JR4A 5D9VA 3QAWA 1MDJA 4EDZA 1PX6A 2JZRA 2I9HA 4EE0A 1X5CA 2PUKC 1OKDA 1TXXA 5F0GA 3ISOA 4YAVA 1V57A 3GKMA 3HJMA 2IIYA 3ZVJA 1A0FA 3DWVA 1J0FA 4F03A 3GX8A 2K8SA 4MZCA 1OE8A 5IO2A 3TB2A 3NIVA 5EY6A 4QL9A 3TKQA 3H79A 3H1NA 2CAIA 2H1GA 3GFKA 2JSZA 1ERVA 2C8UA 5B7CA 5HR1A 1R7HA 3CYNA 5F05A 4BA7A 4L5LA 5G31A 1GRXA 2VLTA 2IJYA 2DLXA 1KEBA 2EC4A 3G7IA 5CP1A 3KD0A 2LTKA 2VD1A 1T4YA 4JZQA 1E6BA 1M2BA 3BCKA 3M0FA 3DYRA 10GSA 5ECNB 4GSNA 5D9WA 3RAZA 1M99A 1HNBA 11GSA 4PNGA 1AQVA 4FYUA 3APQA 1WIKA 5HQPA 1ZZYA 2C1YA 2RM6A 2YV7A 3VWUA 2IWTA 2L57A 2HZEA 4BPYA 4KNDA 1A23A 1SK2A 5G1LA 5G1KA 2YWMA 2C0DA 2YPMA 4OD7A 4NHZA 3GTUB 3LXZA 2LS5A 4DSSA 2H74A 4N0VA 2DJ2A 5GZZB 2L4CA 2B5XA 4NWYA 2B1KA 5A4UA 4L0UA 4JBBA 4ZB9A 1VF2A 1XWKA 2DMLA 1XIYA 2OE0A 1F6MC 3DVWA 2A2RA 4P3YB 4IKHA 2BMXA 5J3RA 4LL4B 2QSIA 4IP6A 2FHEA 1UN2A 4HQSA 3GX0A 4I8BA 1SL2B 3IAS2 4F9ZA 4IS0A 1A8LA 2EIRA 2E7PA 2C80A 5D73A 1SYRA 2DMMA 1PD21 3I69A 4CHSA 1FVKA 5J4UA 4OFTA 2DIZA 1A24A 4KGIA 3EU3A 1RW1A 1WRYA 2CZ2A 5HR0A 3M9KA 5JCGA 2IMIA 2XPDA 1PSQA 4K6XA 5B8AA 3IK9A 1H4OA 3CTFA 2GSQA 3I6AA 3RBTA 4EVMA 4IBPA 2YV9A 4KAEA 2YJ7A 4TXVA 3F8UA 4GSTA 1B8XA 1OC9B 1ON4A 5C04A 2N5BA 5HR2A 2G0FA 3CMIA 2FNOA 2H1DA 2HE3A 2FWGA 2IFQB 4ZB6A 1FAAA 5ECKB 4ISDA 3UVTA 3CXGA 2O8VB 4AJ8A 4GRFA 2VL2C 5CRWA 5B8BA 4F2IA 1YDKA 3P90A 2NTOA 1YQ1A 3ZL5A 3KEBA 2WFCA 1B9YC 5IMCA 2OBIA 1O8WA 1XVWA 1XXUA 4KA0A 3HJPA 4IW9A 4ECCA 1GUHA 3VLNA 1R4WA 3NOFA 2WJUA 2C3TA 3ZMKA 2H75A 4WBJA 1B4PA 2F9SA 3HVSA 2WZ9A 2VLUA 4K2DA 5HR3A 2JZTA 4Q5FA 3RPNA 2RIIA 4ECIA 5GAND 1X9SB 3GV1A 3HZ8A 3FYGA 1N8JA 3P7XA 2R37A 3ZIJA 3UIWA 1BJXA 1AXDA 2LJKA 9GSSA 2HT9A 3IRAA 2HNLA 1GUMA 3M9JA 3IXRA 2P5QA 3GTUA 2AUVA 4IP1A 1CQHA 1IYIA 3HVVA 5GSTA 3HHVA 2B3SA 1TK5B 4D73B 3H93A 6GSXA 2Z9SA 1SYXA 4HEA2 4MK3A 3P2AA 1PN9A 1B4QA 4MJAA 4WF5A 2X99A 1Z3EA 1T7PB 1THOA 5ECIB 4GCIA 5G30A 1SU9A 1MDIA 2IMDA 2ALBA 1JLVA 2V2GA 3HZ4A 3C1SA 1W89A 3BOAA 3F3RA 3LXTA 2GZZA 3WT1A 2WGRA 1AIUA 5G2ZA 3TJJA 1ERTA 2WB9A 1S3AA 3VFIA 4HU7A 2IPAA 2LSTA 4KH7A 4RQRA 4KB3A 1LBKA 3GKXA 1BEDA 4MZBA 2CX3A 3V1WA 4V2LA 4EF0A 1TOFA 2LNSA 1ZMAA 1SJIA 1F2EA 3VWVA 3WGDA 3EU4A 1FG4A 3U6VA 3Q74A 4Q5QA 1WWJA 4TOPA 2YCDA 2NBSA 2E0QA 3F4TA 17GSA 2K9FA 3LORA 3L4NA 3RPPA 2RM5A 2VIMA 3ZIVA 2KOKA 2LRCA 3HKRA 1JHBA 3LQ7A 4IJ3A 5IM9A 2FY6A 2I81A 2GQKA 1U3AA 3D0ZA 3L0HA 4XCSA 1OC9A 5H5RA 4GQCA 2HSHA 3ZRDA 2AV4A 1K0BA 4TR0A 22GSA 2IFQA 4V1Ap 4MMMA 1EP7A 3O3TA 3GRXA 2VD0A 1M2AA 2G2QA 1A2LA 1PRXA 14GSA 1SD9A 1TI1A 3FKFA 3LGCA 3ZREA 2A2SA 4I2TA 2CT6A 3F6DA 2HSYA 3MDKA 3IC4A 3FR3A 5AIVA 2X8CA 2B5YA 2FD3A 4ZILA 4F0BA 3SWLA 1DBYA 2O85A 2QGVA 2PMTA 2CQ9A 1UC7A 1NHOA 3FR6A 4PQIA 1V2AA 2VM2A 1EP8A 2O87A 1F9MA 2IN3A 4MDCA 2H66A 4PQ1A 3AY8A 5ECSA 1GWCA 2PN8A 1MDKA 2ZNMA 3D6IA 2CA8A 3TGZA 1E2YA 3H4KA 3GN3A 2LJRA 3L9VA 1GSDA 2XHFA 4K7NA 1C72A 3KMOA 1QK8A 5J9CA 5F07A 1SK0A 3BD2A 4NAXA 5DAKB 4D73A 4G2EA 4OCEA 2RLIA 3ZYWA 4HJMA 18GSA 1ILOA 5A4VA 2DJ3A 3KGKA 2EIQA 13GSA 4BWSA 4ECJA 4K7IA 1J9BA 3F3QA 3QFBC 1M2DA 1XCCA 5IQYA 4OMVA 4K7OA 5FHIA 4DVCA 4GWRA 1J08A 5JWRB 2NPBA 4X43A 4DSQA 2K18A 4ZB8A 4V2MA 3ZITA 3LYKA 3J7Yb 1V98A 2OE3A 3UBLA 1PL1A 2M72A 2H0HA 3W8SA 2H8LA 1EOHA 3QAGA 2TRXA 4ECBA 4BWQA 4EDYA 3D4MA 3M3MA 2WRTA 5CAXA 5F8BA 5EPFA 3ERWA 3ZVJD 3HJOA 1T4ZA 1K0CA 2K6VA 3GURA 2V32A 2GT6A 2NDOA 3ME7A 4TR3A 3KTBA 4KX4A 3EE2A 3J7Yk 1AQWA 1F37A 2KLXA 1SKSB 3FRCA 4CW9A 2QKEA 3F6FA 1GTBA 1TTZA 2H76A 4TN8A 4MF5A 3IBHA 1TW9A 5DQSA 3G7JA 1PKWA 2H6ZA 3LWAA 1EGOA 4J56E 4MJEA 2YOIA 3LYPA 3Q19A 1NW2A 2X64A 2N5AA 3GKNA 4GXZA 3OR5A 2DC5A 5E59A 5KN0A 2DJJA 4G19A 4X1UA 3WT2A 2B5EA 1ZYEA 3QD9A 2R3XA 1AC1A 2DIYA 2H70A 3IK7A 3U5RE 4OCFA 3QAVA 4G10A 1F3BA 3Q18A 4MJBA 1Z7PA 4FIWA 2XPEA 2HRFA 2AAWA 2EIOA 2MMAA 2CZ3A 2AYTA 2I4AA 1GTAA 2FGXA 2X8GA 3A3TA 4IELA 4EL1A 2KHPA 1Q4JA 3TKSA 1WMJA 3LFLA 3DIEA 4XS1A 1DE2A 4HZ4A 5AISA 2V6OA 1HNAA 3TKSE 1EV9A 4PGTA 2GDRA 2CAQA 4YAPA 3QR6A 4AJ7A 2FA4A 4XS6A 3TRXA 3UOMA 5DAKA 4ID0A 1T3BA 2PGTA 5JWOB 1EEJA 2M80A 2C3QA 3D5JA 16GSA 5INYA 1V9WA 2E2GA 4IVFA 1S3CA 5G5EA 4MPFA 1DSBA 1FOVA 3UJ1A 4Q5RA 1X0RA 3HY2A 5GSSA 2JU5A 1QFNA 1TP9A 2IMKA 1ZOFA 1GSYA 3ED3A 2C3NA 3UVHA 1GUKA 6GSTA 1O6JA 7GSSA 4KDYA 3EURA 3RHCA 4MF7A 2IMFA 4PUFC 3C1RA 1ACVA 6GSUA 1ZYQB 1K3OA 4JE1A 4F82A 1MD3A 2MMZA 2LEGA 3FZ9A 3TKPA 3PGTA 3PINA 4TVEA 4TW5A 6GSWA 3R2QA 1YEPA 2GQMA 4TXOB 3ZFLA 2K8VA 1I5GA 3VK9A 1HD2A 1GTIA 4KDUA 2OE1A 2FWEA 1YY7A 5GAPD 1GNWA 2B1LA 2GTUA 3QMXA 5ENUA 1XWCA 2LQQA 4DSRA 4OFNA 3GL3A 2VCQA 1TRUA 1TDIA 1A2MA 3UEMA 4ZBBA 1K0NA 4K1FA 5IMFA 3NZNA 4ZXGA 5H5QA 4KDXA 2VCVA 2LRTA 2PVOC 3D22A 4WF4A 4YQUA 1R26A 1VF1A 1X5DA 2OA7A 4NPBA 1YZXA 2PBJA 1O8XA 4YQMA 2MMNA 3VI5A 3N5OA 2OKAA 2GS3A 3FW2A 3IA1A 3TCOA 3TRQA 1Q98A 2H19A 5FWGA 4MABA 2JACA 3VPQA 1GH2A 5ECHB 1V40A 4PXOA 1XWBA 4IJIA 1GP1A 4OFMA 3CRUA 3MNGA 3KCMA 2GZYA 5ECMB 5HFIA 3KZQA 1AUCA 5ELAA 1K0MA 5IIZA 1FO5A 5A5KA 1CQGA 3HDCA 4WEYA 5KEJA 2MBTA 3E9JB 1K3YA 2GSTA 3ZMLA 1MTCA 2BJXA 2GQLA 4J2FA 2L59A 3MSZA 5B6NA 3VWXA 2H0IA 4MA9A 1LJRA 1SJZA 4G9HA 3DGQA 20GSA 1OE7A 4MLYA 1FHEA 3HA9A 4POBA 3RHBA 4BL7A 1AQXA 3GUSA 3D21A 3GIXA 4HUAA 1ABAA 1TJDA 3FK8A 1XWGA 1WJKA 1N2AA 2OADA 4XTSA 4FYBA 2L4QA 3EVIA 5CYYA 1EEMA 4CDOA 1XW6A 2VCWA 4HU9A 4ZIJA 1YF0A 2VCTA 5FT3A 1A0RP 5AGYA 4WR5A 1T00A 1GTUA 2LRNA 5IO0A 2HFDA 3FZ4A 1URMA 2H1AA 1B9XC 4V2NA 2HXKA 4IQ1A 1O7UA 2VLVA 3N9JA 4I97A 1A8YA 1PKZA 1NHYA 4PUAA 1SD8A 1TRSA 4TXOA 2V6KA 3BCIA 2HI7A 3CTGA 2DSAA 3F4RA 2TRCP 4EO3A 3W8JA 5E4WA 1PMTA 4X0XA 4LA1A 1XVQA 4EXJA 2JSYA 5C00A 2AB6A 1FW1A 3IE3A 2YWOA 4ML1A 3Q6OA 1PA3A 1K0DA 2FCHA 2I1UA 2VOCA 1Z6MA 1BAYA 1O81A 4O32A 2VL2A 2P5RA 1XOBA 3L9UA 5DALB 1WOUA 4GSSA 1YKCA 2YJHA 1TKDB 3GMFA 3HVXA 2GZPA 2CVKA 1RQMA 4WR4A 5IOWA 2IMEA 2OJLA 5HFGA 2H30A 5ECPB 5CRHA 2FWHA 4FO5A 4POMA 4XHMA 1LU4A 3EWLA 1GSSA 1SL0B 2VL3A 1Y6EA 3GH9A 5D9TA 2H72A 2IL3A 3L9SA 1TU7A 4JU5A 1GLQA 2LNTA 3ERFA 1UA5A 2KUCA 1IYHA 3C7MA 1T8EB 2B7JA 2HLSA 3A2VA 4I6XA 1M9BA 2F3MA 3WYWA 1W4VA 4IHUA 2FUG2 2H01A 3CSHA 2N5FA 1YF1A 3JCML 3EMXA 1F3AA 4MCUA 4AJ6A 1RK4A 5AN1A 5LCZA 4JR6A 3HYPA 4N0ZA 5COHA 4DSSB 2C0GA 2XBQA 1SJ6A 3VPTA 3TUEA 4JRRA 1GSUA 2V41A 3GNJA 3KMNA 4MH3A 4EUYA 3IPZA 5DDLA 2GSSA 1DUGA 2PPTA 2PWJA 2L6CA 4I5QA 2A4VA 1Y25A 2JZSA 3QPMA 1BYEA 2C4JA 1VRSD 1ZCPA 1THXA 5A4WA 3DXBA 1G0TA 3A2XA 1SENA 3KP9A 5IMZA 1XPVA 1ST9A 4HZ2A 1FVJA 3E3EA 4MF6A 3RDWA 2XC2A 2RUFA 2H6XA 4O92A 1GNEA 3K8NA 3S9FA 2ES7A 1DE1A 3QCPA 2YNXA 2V1MA 6GSSA 3IDVA 5J5NA 1O73A 2VCXA 3F9UA 3CSIA 3KXOA 2DJ0A 5D93A 5KN2A 4RI6A 1G7OA 3BBYA 1QUWA 3W6GA 1EV4A 1VF3A 2O7KA 1TK8B 4K9ZA 5DCHA 5DALA 4NV5A 12GSA 1OC3A 3QDNA 1S3DA 2NVLA 4ML6A 5IPGA 2YZHA 1JZOA 3FZ5A 1FB6A 3WGEA 3CBUA 2ON5A 3KH9A 5IOXA 2ZCTA 4XRDA 5CRGA 2TIRA 4HDEA 3MWHA 5ID2B 3UMAA 2FWFA 2LKUA 4AF2A 3US3A 2KP2A 2F8AA 2H6YA 5HFKA 3GHAA 1MEKA 2OBKA 2VM1A 3G9BA 2WDUA 2LUSA 3TOTA 1OAZA 4KSOA 3BJ5A 5H5SA 1JZRA 4N11A 3VWWA 2YP6A 4F0CA 1MD4A 5L71A 3TJFA 3F63A 3C73A 4NXIA 6GSVA 3IOSA 5ELGA 3KH7A 2YZUA 4J57E 5DCGA 4EC0A 3GSTA 4GLTA 4XS4B 3HXSA 2HZFA 5CNWA 4OWYA 5CREA 1A2JA 1XFLA 3MAKA 4QQ7A 4LL1B 5KN1A 3UBKA 5JCWA 2MBSA 2HRNA 1USBA 3UARA 4IQAA 4WBRD 1HYUA 4WKWA 3KIJA 1GSQA 1U87A 4WXTA 2GGTA 5JWQB 3GYKA 1YEXA 3DKSA 4ILFA 4K0GA 4O5RA 3I9V2 3C8EA 1WPIA 2DBCA 1EOGA 3EC3A 5ECQB 2PVQA 2L6DA 3FEUA 1K3LA 1HQOA 1TU8A 2J23A 3I43A 2VO4A 4BVYA 2P0GA 2AJQB 1PL2A 3DD3A 1SKWB 2VL9A 3GKKA 1X9MB 1AAZA 3EINA 4KUNA 1GSFA 3KP8A 1Z6NA 5G5FA 5CRDA 3IV4A 4RQXA 2H73A 1GSEA 3CRTA 2F8FA 2YANA 4PNFA 3TDGA 2WS2A 1VF4A 3IR4A 2F51A 2JADA 1XZOA 1Z9HA 1JZDA 2LQOA 1FB0A 3H8QA 3TJBA 1R5AA 3TRPA 3IAM2 5D9XA 4KE3A 4L0WA 4HJ2A 2GLRA 2J9HA 2MZCA 1JZWA 3P8WA 3C71A 5EVOA 2YWIA 3GSSA 3TOUA 1Z7RA 5ECRB 1PQNA 5LNKe 1R5PA 1SL1B 3F0IA 1PX7A 3E0UA 1WP0A 2KP1A 2REMA 3FHKA 4NV2A 2VUPA 2VAFA 4N30A 5KN3A 5ID2A 3QOUA 1ERUA 2E2MA 2HYXA 3F4SA 3HD5A 4I2UA 2C0FA 2CVDA 3O76A 4HI7A 5IPHA 4MP4A 1X9WB 4PQHA 2ON7A 4Q5NA 2PERA 5LD0A 1XW9A 5B6MA 2WULA 1EGRA 1OVNA 3D4TA 5ECOB 2CVBA 3EMPA 2O89A 2H1BA 3DMLA 2H0GA 1ZL9A 4TR4A 5AIXA 1XBSA 1PGTA 1K0OA 2QC7A 1VGLA 3ZTLA 3WGXA 4N10A 1NM3A 4ULXA 3WD6A 3ME8A 2FLSA 1GL8A 2MMOA 4XS4A 4LMVA 1AW9A 4LLRA 4MPGA 1EWXA 1ML6A 2ZUPA 1QQ2A 4POLA 1QXHA 5EL8A 1TRVA 4IGJA 3G7YA 4TRXA 3KM6A 4ZL8A 8GSSA 4ZBDA 4HS1A 1U3IA 5ECLB 5DJLA 5DBQA 3LJRA 1HNCA 4ZL7A 6GSYA 4RUVA 3APOA 1T1VA 1QGVA 3IHQA 4TR1B 4ZBAA 2M46A 4Z7XA 4WETA 1BG5A 3PH9A 4MH2A 3TKRA 4EKZA 2B6MA 3M8NA 4GQFA 3UAPA 2H71A 4KW6A 1ERWA 3A2WA 4KCEA 4O7HA 1OC8A 2C0EA 2XBIA 4BVXA 4E8HA 2LV3A 2DJKA 5IMVA 1GLPA 4L8EA 3UL3A 3TJKA 4NMUA 2RUEA 2CV4A 1I9DA 2MYGA 2LJAA 1XW5A 1KTEA 2VCZA 4KSMA 3APSA 3GA4A 5DJMA 5J41A 3GL5A 1XWAA 4IN0A 1QMVA 3M1GA 1OKTA 4PURA 1NSWA 5ABRA 1M7TA 2GT5A 5J9BA 2L5OA 2L5LA 2R5GA 4PX1A 3A5WA 3EYTA 2BTOT 1O85A 3LSZA 2AHEA 2YWNA 4AGSA 3DVXA 4OO5A 1BX9A 1OYJA 2WCIA 4XIHA 4NHWA 4GF0A 4L5OA 4MZWA 3KTLA 1U88A 2FA8A 2JL4A 3HCZA 4JEDA 2GVPA 4LMWA 1G7EA 19GSA 2CX4A 3VI7A 5IMAA 1UVZA 1WE0A 3QFAC 4HOJA 4K0NA 1Z5YE 3ZFBA 4ACSA 1G6YA 1GULA 4K8MA 5D8IA 1TI3A 1G6WA 1H75A 3LG6A 5F06A 4E8EA 1M0UA 4V1Ag 4RI7A 1BQ7A 4H86A 2YN1A 4QL7A 4XRAA 2B7KA 1V58A 1U6TA 5IMDA 3TKSC 2R6KA 1SK1A 3SBCA 2R2JA 2I3YA 2HZEB 4FH8A 1SKRB 2DJ1A 1TK0B 3FR9A 4YH2A 3PR8A 3LEFA 3VURA 1ZGNA 3GH6A 2GSRA 1JLWA 4FYCA 4HQZA 4KCAA 5DVBA 1KNGA 4GTUA 5DQYA 1YKAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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