5IOWA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure ffcumene (hyperoxidized by cumene hydroperoxide)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
156
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 155
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iowA00
2V6KA 2O8VB 1B9YC 3GL5A 4JZQA 1XFLA 3CSHA 4F82A 2AAWA 2X8HA 4HU7A 4Q5QA 2WULA 2VCQA 4EDYA 1RQMA 5CRHA 5IM9A 2F8AA 5KEJA 3PR8A 2VLTA 4JU5A 4LMWA 4MA9A 3D22A 3CBUA 4I2UA 1EV9A 1VF3A 4O7HA 4J2FA 4F9ZA 3U5RE 5EL8A 2V6OA 5G2ZA 1ZZYA 5B8AA 3ZITA 3GSSA 2CAQA 2XHFA 4L5LA 1K0MA 4MP4A 1SJ6A 5H5RA 5JCWA 16GSA 3LXTA 4MF7A 2YWIA 4E8HA 1Z7RA 2H1DA 22GSA 2R5GA 4GSNA 4Q5FA 2L6DA 3LJRA 4MMMA 3BBYA 3VPQA 4X1UA 1S3AA 3HA9A 1JZWA 4IN0A 5DVBA 2WJUA 5DCHA 1ACVA 3RHCA 4BPYA 2E0QA 1JZOA 10GSA 3IV4A 3E9JB 2V2GA 1QXHA 1GULA 2ES7A 4GQCA 3G7JA 2H30A 1K0AA 4WR4A 2H75A 4L0WA 8GSSA 1UVZA 1VRSD 5D8IA 2DC5A 2PN8A 3C73A 2X8GA 4K0NA 1T1VA 4OO5A 3EMXA 3C8EA 3TB2A 4BL7A 5J3RA 1Q4JA 5EPFA 4EXJA 1MD3A 3FZ5A 2GGTA 4ISDA 3ME7A 1HD2A 6GSXA 4K1FA 2LNSA 4CHSA 1RW1A 3MDKA 14GSA 2IFQA 2WCIA 3GA4A 5DQSA 2MBSA 3D4MA 1ZGNA 1TK5B 3R2QA 4GRFA 1MD4A 3CTGA 4GLTA 3EE2A 3UIWA 2VLUA 3HHVA 4TR3A 3UBLA 4MCUA 5G5FA 4GQFA 1U87A 1ZYQB 3FZ9A 4V2MA 1EWXA 1XPVA 2I9HA 3ZMLA 4ACSA 3KM6A 3I69A 2GQLA 1YEXA 1ON4A 4YQUA 2N5FA 1A0RP 1PKZA 1UA5A 5JWRB 1ERUA 2I4AA 4FIWA 5C00A 4MK3A 2PUKC 4WF4A 4ECIA 3DWVA 3M8NA 2YWOA 4PURA 5JCUA 1J0FA 2VCTA 3RAZA 1O8WA 5IPGA 1CQGA 1WJKA 1K0OA 2LJAA 3GSTA 4ML1A 2CA8A 5AGYA 1IYHA 1GP1A 3A2WA 1CQHA 1SD8A 2MBTA 3IPZA 2YJ7A 1O7UA 1S3DA 3ZVJD 1EOGA 1Z6MA 1V98A 4WR5A 1VF4A 2IMIA 5ECOB 3VFIA 1YF0A 2QSIA 1GSFA 4NV2A 4DSRA 1TI3A 1FB0A 4TR4A 4PUAA 4PUFC 2FD3A 2FA4A 5COHA 3D0ZA 5D9VA 3IA1A 2MMAA 4EF0A 3TRXA 1OC3A 2BJXA 2I3YA 2RLIA 18GSA 3FR6A 3TOTA 2CV4A 1K0DA 4L8EA 1UN2A 1SJZA 1SYRA 3A5WA 4KW6A 6GSVA 1OC8A 1FG4A 5ECNB 3ED3A 4ZILA 1PL1A 4IVFA 1U3AA 5F07A 2R3XA 1Z9HA 3BD2A 4J56E 5JWQB 1SJIA 4ILFA 4O5RA 3VI5A 3KGKA 1ST9A 3L9UA 3ZYWA 4K7OA 2HSYA 4EDZA 1SD9A 2HNLA 1XWBA 2D2ZA 2CZ3A 3QR6A 1XOBA 5EY6A 4ZBBA 1JZRA 4POKA 2TRCP 3L9VA 3TGZA 4GF0A 2OADA 1USBA 2LNTA 2MMOA 3Q6OA 4I97A 1N2AA 4GCIA 1HNCA 1NHOA 1WPIA 3LWAA 2CVBA 3TJGA 4MJAA 2N5BA 3UVTA 2FLSA 3L0HA 5AN1A 2HYXA 1VGLA 2LRTA 1YDKA 2PMTA 2JZRA 3HKRA 4ZL9A 3ZMKA 2GZPA 4I8BA 5G1KA 1QGVA 3HJMA 3HVVA 5CRGA 5KN0A 1GNWA 1DBYA 3GIXA 3C1RA 4GSSA 4KSOA 1T00A 4XHMA 1BAYA 4MDCA 4OFTA 4WXTA 4RI7A 4ZL8A 4ULXA 1SL1B 3O76A 1SYXA 5HFIA 2GSSA 1SL2B 1X5DA 1XWKA 1K0CA 5J4UA 3C7MA 1M9BA 4EE0A 1XW5A 2H6XA 1PX7A 5J5NA 1BJXA 1U88A 4RI6A 2AV4A 3NZNA 4ID0A 1V9WA 3KZQA 5GZZB 4FYUA 1ML6A 2DIYA 1FHEA 1O73A 2IL3A 4HOJA 1V58A 4RUVA 2IMDA 3O3TA 2PBJA 4KCEA 1EP8A 4X43A 4AJ8A 4HQZA 2LS5A 2K9FA 2YZHA 1PSQA 4PXOA 2R2JA 3LG6A 1Z5YE 4K2DA 1DE2A 1MDJA 3F3RA 3Q18A 2PVQA 1O81A 3FEUA 1M0UA 4RQXA 5DALB 2NBSA 4HEA2 3TDGA 13GSA 2VO4A 3KEBA 4FYCA 3F6DA 2NVLA 1T4YA 3C1SA 3DD3A 2R37A 1G7EA 4XRAA 5B7CA 1Z6NA 2YOIA 3HD5A 2AYTA 3FRCA 1GSYA 3UL3A 1MTCA 5ECIB 4OFNA 5GSTA 1V40A 4LA1A 2IMFA 2X64A 1PN9A 2B1LA 5GSSA 3RBTA 2ON5A 11GSA 2C1YA 2ON7A 4FH8A 2VD1A 2OE3A 5ECKB 2JL4A 3ME8A 1FVJA 1ERTA 5ECLB 1OKDA 1SKRB 1I9DA 2WB9A 2O87A 2VUPA 2WFCA 2YP6A 4YAVA 3DEXA 2B5YA 1ZL9A 2KP1A 2NDOA 4I6XA 2EIQA 3EC3A 4IS0A 3VURA 1GH2A 1HNAA 3O6TA 1FAAA 5F0GA 2AB6A 3KXOA 2O7KA 2XPEA 6GSUA 3KP8A 2H1AA 3LORA 2CT6A 3GKKA 5CRWA 4N0ZA 4MF6A 3GHAA 2GVPA 1TK0B 3TKSC 3ERFA 1YZXA 4TR0A 1K3OA 3EU4A 3W8JA 5H5QA 3KTBA 5ELGA 1A24A 4DSQA 3GV1A 1Q98A 2YCDA 3J7Yk 3TJKA 1QQ2A 2CZ2A 1QK8A 3KCMA 3EVIA 5IMZA 3SWLA 4FO5A 1F3BA 1QUWA 3F3QA 1XWCA 2LQQA 4XIHA 1DUGA 1TRSA 2DLXA 3L4NA 2PU9C 3KH7A 3ZIVA 2VCZA 3QPMA 3GN3A 3CSIA 1EOHA 5ID2A 1KTEA 1PRXA 3CTFA 1THXA 2V32A 2F8FA 2LEGA 4DVCA 2FHEA 1A8LA 2QC7A 4LL4B 2H1BA 1PD21 3RHBA 4GSTA 1YEPA 2GS3A 1ERWA 3FKFA 5ENUA 3EINA 3EMPA 4KGIA 3LQ7A 1GTAA 3F0IA 5JWOB 3IE3A 2L6CA 2TIRA 3F6FA 1VF2A 4N10A 2J23A 4F0BA 5A4VA 1K0BA 5DALA 3PGTA 3IAS2 4TVEA 1T7PB 3UEMA 3M3MA 3P7XA 4G19A 3I43A 1OE7A 2FWFA 4ZB9A 1AC1A 4D73B 1EGOA 1F3AA 3EURA 5F06A 1X0RA 3GFKA 3WYWA 3KJYA 3IAM2 2R6KA 2YJHA 5G1LA 2HT9A 1W4VA 1GSQA 1TOFA 1V57A 1OVNA 1OAZA 3E0UA 3G9BA 1AQVA 2HLSA 3WT1A 1T3BA 4ML6A 2E2GA 2EC4A 4Z7XA 2JSYA 2YWNA 4KH7A 4ZB6A 5ECPB 1O8XA 2BTOT 2LV3A 1KBNA 1K0NA 1MDIA 2GT5A 1GNEA 3QFBC 3LEFA 3DYRA 2VL2C 2VCVA 4WBRD 1M99A 3VLNA 2YPMA 2I1UA 5J9CA 2IJYA 2DJKA 3QAGA 3APOA 2DIZA 4ZBDA 1FW1A 1JZDA 2FWEA 1OC9B 2RM6A 3DKSA 4BWSA 1XOAA 5L71A 2IMKA 4PGTA 1TP9A 1SK1A 4MZBA 5EVOA 3A2XA 1PQNA 2C8UA 3GMFA 2VOCA 3UJ1A 3ZVJA 4N11A 5B6NA 2OACA 1R26A 2H73A 2EIRA 3UAPA 2LJKA 4K7NA 2B3SA 1AQXA 4NXIA 2J9HA 3H4KA 5AIVA 5HR3A 5GAPD 3IHQA 4OMVA 5KN2A 3GTUB 2XBIA 1R4WA 4IQ1A 4JE1A 2K18A 3DMLA 5CNWA 2MMNA 1FO5A 2DJ2A 2WS2A 1B8XA 1XWAA 2EIOA 4LMVA 1RK4A 2REMA 4MLYA 3M9JA 4NHWA 4WEYA 5B6MA 2O89A 1WE0A 5FT3A 2YANA 1SK2A 3VWXA 3CXGA 5IMAA 2GSQA 2CVKA 2P5QA 1WIKA 2JU5A 1M9AA 1TJDA 1U3IA 2VM2A 4MPFA 2H0IA 2LRCA 5D73A 3EYTA 2KUCA 2XPDA 4HDEA 1GUMA 1KNGA 4OD7A 3HY2A 1XWGA 5LCZA 2G2QA 4EL1A 5F8BA 1PA3A 2IIYA 3APQA 6GSSA 2C3NA 2KOKA 1QFNA 4WETA 2FY6A 4MH2A 1TRVA 1TU8A 4GWRA 5IOWA 4NPBA 3LYPA 2C4JA 3GUSA 1O6JA 2C0EA 3P90A 5E4WA 4D73A 2OKAA 3MAKA 2M72A 4HQSA 2XC2A 5IMVA 3IBHA 2H70A 4N30A 5A4UA 1LJRA 3MWHA 2CX4A 3H93A 1YKCA 5IPHA 3FZAA 4QL7A 3F4RA 3UBKA 1R7HA 2FCHA 4RQRA 3BCKA 3QAWA 3Q19A 1WRYA 4F03A 1BYEA 3UMAA 1E6BA 3ZTLA 2DJ1A 2OE1A 2VL3A 1C72A 3F63A 4QL9A 2K8SA 3KMOA 3MSZA 4TRXA 1J9BA 5C04A 5IMDA 4TR1B 5CAXA 1LU4A 3KMNA 2DMMA 2VL9A 2R4VA 2L5OA 3IK7A 2WDUA 5CO3A 2VCWA 4OO4A 4MABA 5HFKA 2H0GA 3M0FA 3GKXA 1THOA 1H75A 1OC9A 2DJJA 3GX0A 4F2IA 2PVOC 2MMZA 2B7JA 5ID2B 2GSTA 5J9BA 5ECRB 3U6VA 1R5PA 2C0FA 2L59A 4XS4B 5CP1A 3VWUA 1SKWB 4LL1B 4G10A 4GXZA 1SK0A 5A5KA 4JR6A 4QQ7A 2B6MA 1X5CA 5HQPA 5KN3A 1TDIA 4WKWA 5CYYA 4JRRA 4KB3A 2LUSA 4OCEA 1YJ6A 3GYKA 4MH3A 4KDXA 5DJLA 1YKAA 3GTUA 2FWHA 3F8UA 2M80A 5DJMA 2WZ9A 4KCAA 1WMJA 3K8NA 2HI7A 4ZBAA 3H79A 2JZSA 4XS6A 4YAPA 2C3TA 5AIXA 4AGSA 1IYIA 3D6IA 2B1KA 1JLWA 2H72A 1BG5A 1MEKA 3P8WA 4XCSA 4HZ4A 1OE8A 3L9SA 4TOPA 1AXDA 4MZCA 3LFLA 5D9TA 4DEJA 1GSSA 1K3LA 5IMCA 2DMLA 4ZB8A 4HUAA 4N0VA 3GH6A 4HS1A 4MJCA 3RDWA 2Z9SA 3QMXA 3HZ8A 2HSHA 4EUYA 4MF5A 1A2LA 2YV7A 5GAND 17GSA 4JEDA 4G2EA 3ISOA 1AIUA 1BQ7A 2FA8A 4KDUA 1S3CA 1GTIA 4MJEA 4TXVA 2DBCA 1X5EA 2HXKA 1B4PA 1X9SB 4AF2A 4ZL7A 2OBIA 4MZWA 4ZIJA 2GQMA 2VAFA 4X0XA 3GH9A 2JADA 3VPTA 3BJ5A 3DVWA 2X99A 1EEMA 4O92A 2RUFA 3IOSA 5ECHB 1SKSB 3JCML 4IHUA 1WOUA 1FVKA 3H1NA 2HZEB 1Z7PA 3L78A 3FY7A 2P5RA 3TUEA 2H01A 3VI7A 1A8YA 3LSZA 1O85A 4BA7A 3TJFA 6GSTA 4TR1A 1B4QA 3VWVA 5E59A 3TJBA 4OFMA 2FWGA 3QD9A 1R5AA 2M46A 3FK8A 1TK8B 1URMA 1TXXA 3DXBA 5DAKB 3GURA 5D9WA 2DSAA 2KHPA 4TXOB 3F4SA 2B5XA 2GLRA 3WGEA 4GTUA 1TRUA 2K8VA 3ERGA 3EWLA 1A2JA 5HR1A 4POBA 1B48A 3SBCA 1A2MA 1TU7A 2QKEA 1NM3A 5DCGA 4EO3A 3M1GA 4V2LA 2IN3A 2CAIA 4KNDA 5CREA 1ZYEA 4I5QA 4H86A 4XS4A 4MPGA 5LD0A 5AISA 5G31A 3ZFLA 4YQVA 3D21A 2OE0A 2E2MA 1GTBA 4F0CA 2C80A 5IMFA 3RPPA 2NTOA 4L5OA 5B8BA 1M2DA 3D5JA 1N8JA 4WF5A 2ZNMA 4V2NA 2WRTA 2H1GA 5G30A 3KTLA 1MDKA 4KDYA 1EEJA 4NHZA 4HJMA 1ABAA 4IP6A 3IK9A 4IKHA 1FB6A 1X9WB 3HJPA 1GWCA 2QGVA 3A3TA 5ABRA 2H0HA 2LKUA 3KP9A 1A0FA 1LBKA 4ECBA 5ECSA 3G7YA 2P31A 2H6ZA 5F05A 1Y6EA 3VWWA 1EV4A 1WWJA 2H71A 2GTUA 1PGTA 1NHYA 3VK9A 1HQOA 4JBBA 2L57A 3FW2A 5H5SA 3EU3A 2G0FA 4AJ6A 1SENA 3TKSA 1XVWA 2VM1A 4HZ2A 12GSA 1PKWA 1GLPA 2VLVA 1GSEA 2VCXA 3GNJA 1TTZA 1TKDB 2IMEA 2ALBA 3CSJA 1W89A 3ZZXA 1EP7A 2GT6A 3I9V2 4K8MA 1HNBA 2BMXA 1OYJA 5IO0A 1SU9A 3DIEA 3IXRA 3QDNA 4KX4A 3H8QA 4ECCA 3PH9A 2A2SA 3GKMA 2PWJA 1YY7A 4WBJA 4K0GA 2YN1A 5CRDA 4IELA 2CX3A 3PINA 1GUHA 1JHBA 4YH2A 3OR5A 4K7IA 2A4VA 2HZFA 1SL0B 5LNKe 2LQOA 1TI1A 2N5AA 3GL3A 4JR4A 4TKYA 2IPAA 2VIMA 4ECJA 1M2BA 3KH9A 3WT2A 3AY8A 2GDRA 3QOUA 1PL2A 4XRDA 3I6AA 5IO2A 2MYGA 1G7OA 1Z3EA 5KN1A 2HZEA 1M2AA 5HR0A 4IQAA 4TN8A 1ERVA 4KE3A 3WGDA 3NIVA 4CDOA 2O85A 2LJRA 4EC0A 2H66A 2H6YA 1TW9A 2C3QA 2A2RA 3TCOA 4MJBA 1BEDA 1GSDA 2RUEA 2HRNA 1K3YA 2F3MA 3KD0A 1FOVA 2GSRA 3WD6A 5DAKA 1ILOA 3N5OA 3HVSA 4TXOA 1XCCA 2KP2A 1DSBA 1AUCA 2CVDA 3IC4A 1ZOFA 3D4TA 4PQIA 3ZIJA 2GZZA 2IWTA 1OKTA 5ELAA 1A23A 3ERWA 1GLQA 3HCZA 3HVXA 2PPTA 5ECQB 1KEBA 5INYA 3ZRDA 1H4OA 5IOXA 4L0UA 3LGCA 3US3A 3HYPA 2XBQA 1JLVA 4KAEA 2KLXA 4IJIA 2F51A 2OBKA 2YNXA 2NPBA 1F9MA 2JSZA 2VL2A 1AW9A 4KSMA 2JZTA 4IW9A 5DDLA 1G0TA 3IR4A 5JCGA 1TRWA 1F2EA 1GSUA 2GZYA 3FR3A 5G5EA 2YWMA 3FHKA 3ZLPA 1WP0A 1AAZA 2F9SA 4IGJA 3TJJA 3CYNA 2CQ9A 6GSWA 3HJOA 3W6GA 3BCIA 1ZCPA 1XZOA 3IDVA 5HFGA 2ZUPA 1V2AA 2GQKA 3FYGA 3N9JA 2JACA 3Q74A 3TKRA 1UC7A 4K9ZA 3TKSE 3APSA 1EGRA 3ZREA 2H19A 4TW5A 2FNOA 4HJ2A 4DSSB 3TRPA 3QFAC 4P3YB 2H74A 3CRTA 4PNFA 4NWYA 2HE3A 3ZL5A 4V1Ag 1I5GA 1EZKA 4HU9A 2FGXA 1GRXA 4POLA 1U6TA 3NOFA 5DBQA 1F37A 6GSYA 2L4CA 1DE1A 20GSA 3HXSA 3F9UA 1Y25A 3LXZA 1J08A 2B5EA 1YF1A 2LSTA 3FZ4A 4XTSA 2FUG2 2YV9A 5A4WA 4PQ1A 1M7TA 1GL8A 2PERA 2TRXA 1PX6A 4IJ3A 2AUVA 4HI7A 2ZCTA 3V1WA 1VF1A 3G7IA 2B7KA 2V1MA 3RPNA 2YZUA 3TOUA 1T8EB 3UVHA 1T4ZA 2V41A 1X9MB 2VD0A 4Q5NA 1XW6A 7GSSA 2DJ3A 19GSA 4AJ7A 1XIYA 2OJLA 2AJQB 2MZCA 4XS1A 5D9XA 4LLRA 4KA0A 3J7Yb 4IP1A 4NV5A 5J41A 3TRQA 2WGRA 3GRXA 2H8LA 3TKPA 4IBPA 5IIZA 1QMVA 2C0DA 1AQWA 3W8SA 2DJ0A 4KUNA 3WGXA 4BVYA 4K6XA 4ZXGA 1JFUA 1NW2A 4POMA 2C0GA 3UARA 2H76A 2RM5A 3GKNA 3BOAA 5ECMB 3E3EA 3TKQA 1XXUA 3HDCA 5FHIA 2RIIA 3QAVA 1GTUA 5IQYA 4E8EA 4J57E 5D96A 4PQHA 3GX8A 1G6YA 4I2TA 5HR2A 3FR9A 4V1Ap 4G9HA 9GSSA 3UOMA 3DGQA 3DVXA 3QCPA 1NSWA 3P2AA 2I81A 1G6WA 4CW9A 4NAXA 2IFQB 3DRNA 4PX1A 2PGTA 3M9KA 3HZ4A 4FYBA 4NMUA 4OCFA 5FWGA 3F4TA 1F6MC 2HRFA 1GUKA 2X8CA 2P0GA 3MNGA 1HYUA 3ZFBA 3LYKA 1BX9A 2OA7A 4BVXA 3S9FA 1XW9A 1ZMAA 3A2VA 1XBSA 2LTKA 1E2YA 3C71A 1B9XC 1PMTA 2HFDA 2E7PA 1XVQA 3IRAA 3CRUA 2LRNA 4YQMA 4Q5RA 2AHEA 4PNGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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