5IOWA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure ffcumene (hyperoxidized by cumene hydroperoxide)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
156
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 155
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iowA00
2PGTA 2NDOA 2FWGA 1NM3A 5FWGA 1XWGA 1Z9HA 3WGXA 3FKFA 3LSZA 2GTUA 1B48A 1Q4JA 1GNEA 2QSIA 5J9BA 1TI3A 4FYUA 4K7NA 2IIYA 3HVXA 4ZILA 4NAXA 3G7IA 2H66A 5ELAA 1ZOFA 4K1FA 3M9JA 3GMFA 4OCEA 1A24A 3EURA 5HR2A 1GSDA 4V1Ag 2HE3A 4PNGA 1UVZA 3D5JA 4NMUA 2IN3A 1GWCA 3VPQA 3CSHA 3F0IA 4WETA 1X0RA 1B8XA 3EWLA 1ZMAA 5AIXA 4KX4A 3IAS2 3ZMKA 1R4WA 4HQZA 5AGYA 2VL2A 2CZ2A 2VCZA 2B5YA 1KBNA 4ECIA 4O7HA 1O85A 4YQMA 2MMAA 4BWQA 5G5EA 2KP1A 3EMPA 4MZCA 2YV7A 5DDLA 3CRUA 5G5FA 1RW1A 4MDCA 4HZ2A 4GCIA 5C04A 2VD1A 1E2YA 4PUAA 3BBYA 2MZCA 3KM6A 4EDYA 1HD2A 1URMA 3V1WA 3IE3A 1AQVA 1HQOA 2HT9A 3P7XA 3OR5A 4LL4B 1J0FA 3W8JA 3TGZA 2OE1A 4FH8A 3A2WA 1XPVA 4KSMA 2KOKA 11GSA 4N10A 3KTBA 4Q5RA 17GSA 2H76A 1A0RP 1EEJA 4RQXA 2L5LA 4K0GA 5ELGA 4IP6A 19GSA 3ERGA 4MH2A 2VL9A 3MSZA 4BL7A 3L78A 1G6WA 4IKHA 4OO5A 3UJ1A 4K8MA 5CNWA 4TN8A 1PKZA 4MK3A 4KCAA 1M2AA 3TDGA 1Z5YE 2LS5A 3EE2A 1XW9A 3IOSA 3ME7A 2JACA 3MNGA 4PURA 4KCEA 2LQOA 2RUEA 3M1GA 2PUKC 2X64A 3BOAA 3GKXA 1QGVA 3F4RA 2WGRA 4HOJA 5D9TA 1SD9A 2RLIA 5GAPD 2L6DA 3FHKA 4KW6A 2O89A 2AUVA 2HXKA 2I81A 4D73A 3VWUA 4NXIA 1TTZA 3CBUA 2GS3A 2FUG2 4POLA 4YH2A 1JHBA 3UMAA 2CVDA 4HQSA 3QAGA 3FYGA 1JLVA 1XBSA 2E7PA 2P0GA 1MD3A 3ZITA 4I2UA 3TB2A 2CV4A 2M80A 2ES7A 4XHMA 3DGQA 5IOWA 3GA4A 4XCSA 2YANA 5LD0A 2BTOT 2H0HA 5DQSA 2KUCA 2OADA 2WDUA 2YZUA 4EKZA 3J7Yk 4NWYA 1GSYA 10GSA 3WGDA 3F3QA 4ID0A 3G7JA 2YJHA 4EF0A 3DEXA 3KJYA 3GHAA 2HSHA 2OA7A 3GV1A 1O8XA 4X43A 5F8BA 3A5WA 4Z7XA 5DJMA 4IS0A 3U5RE 3HVVA 1TP9A 2KP2A 4MF5A 4ZB6A 4ECJA 2MYGA 4L0WA 1XFLA 1USBA 4IQAA 2K8VA 1N8JA 4QQ7A 2IMEA 4AGSA 4JR6A 3GX0A 4ZBBA 3QFBC 3LQ7A 1PN9A 2H70A 2HZEA 4KB3A 5EL8A 3UL3A 1PD21 1TRVA 2X8GA 1A8LA 2GZZA 4ZBAA 4K7OA 1SK0A 1B9YC 1BX9A 4LLRA 2H1BA 5JWOB 4AJ6A 4GQFA 3RHBA 1TK5B 3VWWA 4ZB8A 3TJKA 4LL1B 1GUHA 2XHFA 2HFDA 4QL9A 2ZCTA 1M0UA 1U3IA 2H6ZA 2WJUA 8GSSA 2DBCA 2LRTA 4YAPA 5ENUA 1O73A 4FYBA 2VO4A 3O3TA 5J41A 3GRXA 1FW1A 1EGRA 3ZVJA 3I9V2 3LEFA 5JWQB 2XBIA 4ZXGA 3FZ5A 1WPIA 1EP7A 1RQMA 4POBA 5B6MA 2F51A 2ZUPA 4NPBA 5F0GA 2VAFA 5D9WA 3KIJA 1GTUA 5IPGA 1K0BA 2G2QA 2AJQB 1GUKA 2CT6A 5D96A 3O6TA 4TVEA 1ERUA 2DC5A 5HR1A 2P31A 1JZWA 1N2AA 4POMA 3N9JA 4OWYA 2GQLA 4YAVA 4OFTA 2JSYA 2H71A 2CAIA 2WULA 2DMMA 3TCOA 3WT2A 4L8EA 2H30A 4NHWA 4MCUA 3C1RA 2YWOA 3KMOA 5G2ZA 5HFGA 6GSXA 5ECPB 4GLTA 4XS4B 2DIYA 5GSTA 4EXJA 3DVWA 3GUSA 3TOTA 1WE0A 2FCHA 3HKRA 5CAXA 1GTAA 1YF0A 1XCCA 1PRXA 3KZQA 3P8WA 1MEKA 2AHEA 1U3AA 5HFIA 1QXHA 1S3CA 1SYRA 3KD0A 2L4CA 3HD5A 3RHCA 3GSSA 5D9XA 4J2FA 4PGTA 5DCGA 4OO4A 3TKSC 1Z7PA 2OBKA 1OC9B 1BJXA 1OC9A 1AQWA 1ZZYA 3GTUB 1VF4A 3IHQA 3ZREA 4MA9A 2DMLA 4PQIA 5EY6A 2D2ZA 4EC0A 3TJGA 3QMXA 5DALB 1SJIA 4BVYA 1SJZA 5DALA 13GSA 2GGTA 2K6VA 1F3BA 1TDIA 1OC8A 2VOCA 3QDNA 3CYNA 2GZYA 1GP1A 2ZNMA 5IQYA 5H5QA 3ZMLA 1ACVA 2FHEA 5GZZB 3H93A 4KUNA 5IMZA 2P5QA 1PGTA 1M9AA 2LJRA 1T8EB 2QKEA 2FNOA 4ZB9A 5FHIA 1TU8A 3H79A 1ZCPA 3L9SA 1PMTA 1HYUA 18GSA 3ZLPA 2I1UA 3UVTA 4OD7A 4E8HA 3QAWA 1W4VA 1AAZA 1M2DA 2VL3A 4GQCA 5IPHA 3L4NA 2DLXA 3FEUA 2K9FA 4JBBA 5G1LA 2IFQA 2M46A 2YP6A 1ZGNA 2CQ9A 4YQUA 2WS2A 2H0IA 2CA8A 2M72A 3ZRDA 4MPGA 4ULXA 2VD0A 2JZSA 5CYYA 1X5DA 3VWVA 2CX3A 1GRXA 2HZFA 2RM6A 2B1LA 2REMA 3C71A 1T00A 4JEDA 4V2LA 1TK0B 4V2MA 1ML6A 4WF5A 3L9UA 4AJ7A 1SL2B 4GSTA 3ZYWA 2J9HA 2OBIA 1DE1A 5C00A 2GLRA 3ED3A 4LMVA 2FA8A 4KDXA 1WJKA 2K8SA 4WKWA 3TKRA 4KDYA 1SK1A 2N5AA 3GURA 1ZYQB 2F3MA 5A4UA 1XOBA 3L9VA 1TJDA 1NSWA 1GULA 2LNSA 1ERVA 4ISDA 4KH7A 2VL2C 3IPZA 4E8EA 3QOUA 3DXBA 5GSSA 3Q19A 1K0CA 2HYXA 3ERWA 1YY7A 4IP1A 1OKDA 1GL8A 1QQ2A 1MD4A 3DRNA 2V6KA 3A2XA 1XWKA 1J08A 2XPEA 5ECIB 2G0FA 3EU3A 1M9BA 2VCXA 3D4TA 2H1DA 3HCZA 1Y25A 1Z6MA 4XRDA 1HNAA 4GSSA 5GAND 1ERWA 2I9HA 3DMLA 5ECMB 3LG6A 5HR3A 5JCGA 2O8VB 1U6TA 1AC1A 1R5PA 1A2JA 2O85A 3HVSA 3LWAA 4ZL8A 1HNCA 5ECQB 1BAYA 4G10A 4WR4A 5F05A 2C0DA 2JZTA 2PWJA 1WRYA 4PUFC 1JFUA 1JZOA 1QUWA 5ECLB 3TOUA 9GSSA 4O32A 2VCQA 1AIUA 1SJ6A 3KXOA 4K6XA 3HXSA 1YQ1A 2P5RA 2WFCA 3EC3A 5AIVA 3RDWA 2MMNA 2VCTA 4K2DA 4DVCA 3C73A 5H5RA 1FAAA 2B7KA 2YN1A 2JU5A 5A4WA 1K3LA 4GXZA 4HZ4A 5EPFA 2EIQA 4TR0A 3ZIVA 2IMFA 1SKWB 3FZ4A 4G19A 2B6MA 1F9MA 1YEPA 1TU7A 1MDIA 3IAM2 4MH3A 1GTIA 2X99A 3QPMA 4MP4A 4EVMA 3HHVA 3TUEA 1TXXA 2PMTA 1SYXA 3TRPA 1UA5A 4XRAA 2NVLA 1M99A 5J5NA 1TI1A 4I97A 3WT1A 4G9HA 3J7Yb 4KAEA 1K0NA 3US3A 5JCUA 1GTBA 4NV2A 2LRNA 1F37A 3GX8A 3F9UA 1ABAA 1M7TA 3E9JB 2FGXA 4X1UA 3ZIJA 1XXUA 5E59A 2OACA 5IO0A 2DSAA 4D73B 5ECOB 3FW2A 2NPBA 1OE8A 2IMDA 2I4AA 3I43A 1AXDA 2AV4A 3W8SA 1XW6A 3P90A 3VURA 5HQPA 2C8UA 1V57A 2WRTA 2FWFA 3IC4A 1TK8B 4ZL7A 3F4TA 1LU4A 1EV9A 2H74A 1A0FA 1JZRA 1YEXA 2B3SA 4ZIJA 1A2MA 1ILOA 3QFAC 2YWNA 1Z3EA 3EYTA 4BA7A 2OE3A 3LXTA 4HEA2 2FWEA 3IDVA 4F0CA 4N0ZA 1HNBA 3A3TA 2C0FA 1A8YA 3QAVA 4IHUA 4RUVA 4EL1A 3HYPA 1EOGA 2C1YA 1U88A 2J23A 4MF7A 4JU5A 2AAWA 4ZBDA 2HSYA 4HUAA 2IJYA 3UAPA 5CRHA 2XC2A 5HR0A 1AUCA 4K9ZA 1X9MB 2B5EA 1V98A 2HZEB 2DJJA 3HJOA 1A2LA 3I6AA 4HJMA 1PQNA 2LV3A 4I6XA 3HDCA 1EGOA 1XWCA 2V1MA 2O87A 2E2GA 3O76A 1G0TA 3VFIA 1YZXA 4DSRA 3N5OA 2R3XA 1OC3A 4BWSA 3FZ9A 1EEMA 3Q6OA 4MJBA 2FLSA 3LGCA 1XW5A 5DJLA 1LJRA 3GL5A 2IL3A 3D22A 3GIXA 1THXA 1TKDB 2MBSA 3M0FA 4DEJA 1Z7RA 5DVBA 4MF6A 2MMOA 5D9VA 4IJ3A 4GF0A 2HI7A 4HI7A 4KE3A 1WOUA 1SL1B 2HRNA 1B4QA 2VLVA 2TRXA 3SWLA 3VLNA 1JZDA 4Q5NA 4OMVA 2A2RA 2HRFA 3R2QA 14GSA 4TXVA 22GSA 2DJ2A 3FRCA 3CRTA 4XS1A 3BJ5A 3GNJA 2H1GA 4BPYA 1CQHA 3M3MA 2LKUA 4MABA 5CRDA 4RI7A 4ML1A 2R6KA 4BVXA 2C3QA 16GSA 5DBQA 1S3DA 1FB6A 1O7UA 1YJ6A 1GSFA 3QCPA 1FOVA 2WCIA 4ECCA 3KMNA 3LXZA 3FR6A 1AQXA 1G7OA 1U87A 3UOMA 2HLSA 2AYTA 4TR3A 4XIHA 3F63A 3FY7A 4KNDA 5KEJA 1TRSA 1OKTA 2I3YA 2LQQA 2WZ9A 2VUPA 2GSSA 2OKAA 4P3YB 2GT6A 1O6JA 3WGEA 1TW9A 5IIZA 4KDUA 4EDZA 4FYCA 3GN3A 2JZRA 1VGLA 1V9WA 1EV4A 1H4OA 2C0GA 5JWRB 2H6XA 4F03A 2L59A 1K3OA 4QL7A 2IMIA 1VF2A 1VF1A 3DKSA 2DJ0A 2OE0A 1TRWA 2EIOA 4LMWA 5F06A 1SKSB 2V6OA 2LJAA 3CMIA 1ON4A 6GSWA 1F2EA 1DE2A 3MWHA 3DIEA 3KP9A 3KGKA 2V32A 3A2VA 3TJJA 3DD3A 3F6DA 4POKA 1F6MC 5EVOA 2H01A 4O92A 1R26A 1Y6EA 4MPFA 3VK9A 5CRWA 4EO3A 2F9SA 5DCHA 3VPTA 6GSVA 1YF1A 2B7JA 4RI6A 1QFNA 2GDRA 4FIWA 4MJCA 3TJBA 2PU9C 2FY6A 2DJ3A 3KTLA 5DAKA 1F3AA 1GLQA 4TR1B 2IPAA 2L4QA 2IFQB 1FHEA 3PH9A 3GSTA 2VCVA 5KN3A 4TR1A 4L5OA 4X0XA 4ZL9A 4CW9A 5AISA 2L6CA 2VIMA 1XZOA 1GSEA 3CTGA 1YDKA 3UARA 3ZZXA 4ILFA 5IMAA 2E2MA 2KLXA 3DVXA 3IA1A 3D4MA 3F3RA 3HJPA 1KNGA 5IM9A 1IYHA 2H0GA 5E4WA 5J3RA 4Q5FA 2TIRA 2YV9A 4PQHA 2NBSA 4PX1A 1PKWA 3ERFA 5F07A 2YZHA 4IBPA 2MBTA 1XVWA 5INYA 4GTUA 3ZFBA 5IO2A 2BMXA 2MMZA 3U6VA 1ST9A 4H86A 3C1SA 12GSA 1R7HA 1K0OA 4TRXA 5G31A 2ALBA 2YWMA 3BCKA 2ON5A 2FA4A 1V2AA 2RUFA 1G7EA 3FK8A 2E0QA 5IMDA 4GWRA 4IVFA 1T4YA 2R37A 2V41A 2N5BA 2GSRA 2GSQA 3I69A 1T3BA 3PR8A 1EP8A 3HZ4A 1XOAA 5ECSA 2H1AA 1DUGA 1BG5A 1WMJA 3F4SA 4J57E 1XVQA 4OFNA 4DSSB 2DIZA 4WXTA 4L0UA 5KN1A 3C7MA 1T7PB 4DSSA 1NHOA 3EMXA 4TR4A 1BYEA 1WP0A 4OCFA 4PQ1A 3L0HA 4EE0A 4ML6A 2FWHA 4PNFA 4IGJA 2RIIA 1JLWA 3GKNA 5G30A 4AJ8A 2VCWA 1XWAA 4DSQA 3APQA 2RM5A 5A5KA 20GSA 5IMVA 1WWJA 2DJKA 3PGTA 2IMKA 1YKCA 1GSUA 3CSJA 1SU9A 2LTKA 3GH6A 3HJMA 5JCWA 3G7YA 2QC7A 4IQ1A 1OYJA 3CSIA 1K0DA 4WBRD 4TW5A 3FR9A 2R2JA 2K18A 3D0ZA 4ECBA 4PXOA 1W89A 4JZQA 3IBHA 2PN8A 2YCDA 4MZWA 4I2TA 3D21A 3DYRA 1GNWA 2AB6A 5ID2B 2DJ1A 5ECKB 3RBTA 5B8BA 5ID2A 4XS6A 3GH9A 3GKMA 2TRCP 3TKSE 2Z9SA 1PX6A 3KEBA 5D93A 1DSBA 4EUYA 6GSYA 3Q74A 2LEGA 4WBJA 3VWXA 3D6IA 3P2AA 2VM1A 1ZL9A 2CVBA 4K0NA 5KN0A 3UBKA 2F8FA 1KEBA 1SKRB 3CXGA 1PSQA 5CREA 2H75A 2GQKA 2LUSA 3NZNA 3VI7A 3GYKA 6GSTA 2XPDA 4MJAA 3EINA 4IELA 1FVKA 4TKYA 1O81A 1WIKA 1FVJA 1V40A 2H19A 3E0UA 5CP1A 4MMMA 3QR6A 3TRQA 1S3AA 3GFKA 1B4PA 5L71A 4CDOA 3TJFA 4HJ2A 2JADA 1DBYA 4Q5QA 1Q98A 3EU4A 1BEDA 1VF3A 1SENA 2A2SA 3Q18A 3F8UA 3NIVA 2YWIA 2YOIA 5HFKA 4J56E 3MDKA 4WF4A 4JE1A 1SD8A 1LBKA 2HNLA 3WD6A 5J9CA 3KP8A 2R4VA 5IMCA 3BD2A 2CZ3A 3LJRA 2KHPA 4N30A 3ZTLA 4TOPA 1TOFA 2GVPA 3E3EA 3RAZA 1EOHA 5LNKe 3W6GA 1EWXA 5FT3A 4OFMA 1Z6NA 2YPMA 1AW9A 1C72A 4GRFA 3ZFLA 1GH2A 1NW2A 2H6YA 2GZPA 4MZBA 4F82A 1PL1A 1G6YA 4V1Ap 4XTSA 5H5SA 4JR4A 1FB0A 1ZYEA 2PBJA 3APSA 4V2NA 2X8CA 3DWVA 2PVOC 1SK2A 3IK9A 3QD9A 3AY8A 3S9FA 2ON7A 3UVHA 1T4ZA 5CO3A 1T1VA 2QGVA 2YJ7A 2GT5A 4K7IA 1OE7A 2LRCA 5B8AA 1E6BA 3NOFA 3M9KA 3RPNA 1FO5A 5ECRB 5AN1A 1TRUA 3M8NA 1CQGA 2NTOA 3H1NA 2PERA 3KH9A 6GSSA 1X5CA 4TXOB 2C3TA 2PVQA 5DQYA 3F6FA 1MTCA 4TXOA 1ERTA 2L57A 3EVIA 2LNTA 4YQVA 2EC4A 1GSSA 1NHYA 2O7KA 3FZAA 2H73A 3VI5A 4HU9A 4MLYA 1RK4A 2VLUA 4FO5A 4JRRA 2V2GA 2F8AA 3H4KA 1I9DA 2YNXA 1SL0B 1K0AA 1XWBA 5IOXA 1K3YA 3HZ8A 4F9ZA 4WR5A 1EZKA 3TRXA 1H75A 4IJIA 2H72A 2VLTA 3ISOA 5ECNB 2R5GA 4HDEA 3C8EA 3LORA 5COHA 5ABRA 2LJKA 1MDKA 4HS1A 1MDJA 4N11A 4CHSA 3K8NA 3HY2A 4IN0A 3UIWA 3CTFA 1A23A 4AF2A 4XS4A 1PL2A 1X9WB 5G1KA 7GSSA 1M2BA 3TKPA 4I8BA 3JCML 5D73A 2L5OA 4NHZA 1PX7A 1V58A 3TKQA 2GSTA 1GUMA 3GL3A 4F2IA 2VM2A 4N0VA 2B1KA 3H8QA 2GQMA 4LA1A 4MJEA 1UN2A 2XBQA 4NV5A 1O8WA 4G2EA 1UC7A 3ME8A 3PINA 4HU7A 3KH7A 1GLPA 3SBCA 1B9XC 2CVKA 1J9BA 3ZVJD 2WB9A 4O5RA 3LYKA 3GTUA 3IK7A 2B5XA 2C0EA 4KA0A 5IMFA 5D8IA 4KGIA 3IV4A 1FG4A 3G9BA 4WEYA 3TKSA 2JL4A 1GSQA 1R5AA 6GSUA 1BQ7A 3IXRA 5DAKB 2LSTA 3APOA 5A4VA 4GSNA 1VRSD 2C3NA 1OVNA 1THOA 3IR4A 3LFLA 2CX4A 1KTEA 4KSOA 1I5GA 4L5LA 2A4VA 5B6NA 2IWTA 2OJLA 1YKAA 5ECHB 3UBLA 5J4UA 2C80A 2FD3A 2X8HA 2PPTA 4IW9A 2N5FA 3BCIA 1K0MA 2C4JA 3GKKA 5LCZA 2CAQA 1QMVA 1IYIA 3ZL5A 3WYWA 3RPPA 2EIRA 4I5QA 3IRAA 1OAZA 1QK8A 3KCMA 3UEMA 5KN2A 1X5EA 5B7CA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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